1IP1A

G37a human lysozyme
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESAYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Role of amino acid residues in left-handed helical conformation for the conformational stability of a protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ip1A00
3A94A 4KXIA 5LVIA 3P68A 3W6AA 1GB3A 1OUIA 2MEDA 3ULRA 1GFUA 2EQLA 1HFZA 1NQIA 1V7TA 3SP3A 5I54A 1GF6A 5IDDA 1AT5A 1GB5A 1INUA 5F9XA 1OUHA 1DPWA 2FBDA 2H9KA 4XJBA 4NGLA 1GXV2 3WUAA 1B7LA 3A3QA 4G4BA 4LYTA 3LYZA 2EKSC 2HTXA 1VATA 1E8LA 1BB7A 3A96A 4NGIA 1LZ4A 1KIQC 3W6DA 1CKGA 3AZ5A 4H93A 4WLDA 2D6BA 1DQJC 2DQJY 2Z39A 1QDRA 1JHLA 4GN3A 1GBZA 1LMAA 1FKQA 1VDSA 1YAMA 3CT1A 1B5ZA 4TWSA 9LYZA 4C3WA 3AB6A 1B5WA 3J6KA 5KXYA 1HEOA 4C5FA 4GLVA 4HJVA 1JITA 1GFTA 4LYZA 5JENB 2BQMA 1B5UA 2BQBA 3A92A 4CFPA 1HEPA 1OUAA 1IOTA 2FYCA 2ZQ3A 4H1PA 1TDYA 2D4KA 3QE8A 5B1GA 4XYYA 1FLYA 4PHIA 4DC4A 3KAMA 2DKVA 4J1AA 1D6PA 4NWEA 1OUEA 3P66A 1REZA 4UWNA 3F6ZA 4XJIA 1BGIA 2HU1A 3A6BY 1O23A 4PRUA 4YOPA 5APDA 4M4OA 3M18B 3VWOA 5KXRA 1IO5A 5HNCA 1WQQA 1KXWA 4WLXA 3A8ZA 1GF9A 1VDQA 3B0IA 1F0WA 1GDXA 2CJLA 1LJIA 3A3RX 3AZ4A 4DDCA 2RSCA 4WM2A 1I56A 4ML7A 1JSFA 1RJCB 1RCMA 4TSBA 5ILFA 4OWCA 4RDSA 2YBIA 4IJ4A 5B1FA 4DD7A 3IJUA 3B0KA 4WOAA 3TMWA 1IX0A 1LZNA 2W1MA 1OUDA 1IIZA 1AT6A 2HEAA 4GCBA 3TMXA 3W6BA 1GE0A 1GWDA 3LZTA 3CSRA 1T3PA 1WQMA 4G49A 2Z2EA 1B9OA 1GXXA 1J1XY 1IC7Y 1TEWA 1DPXA 1T6VL 2BQJA 2ZNXY 1JTTL 5II3A 5LINA 3ZEKA 4NY5A 4ETAA 1GE3A 2DQAA 8LYZA 4Z41A 1HF4A 1LZCA 1QQYA 2Q0MX 1LPIA 1IWTA 1SLYA 4I8SA 1XEIA 3D9AC 4WG7A 2YBMA 4BS7A 1B2KA 2PC2A 3TXGA 4E3UA 4NSJA 4O34A 3QNGA 1WQPA 5A3EA 3ZVQB 1HERA 3WVYA 1C45A 1NKHA 2BQOA 1GDWA 3P64A 3HBHA 1B5YA 5EBHA 4B4IA 5K7OA 1LHMA 1GF5A 5FHWA 4CHXA 1BWJA 1KXYA 1GAYA 3EBAB 1IEEA 1NWGA 4LYOA 1HSXA 2HEDA 2Z2FA 3TXEA 1NDMC 4R0FA 1LMTA 3CSQA 1WTNA 1EQ4A 1HEMA 2HEEA 1CKHA 2I26L 2ZQ4A 4ETCA 1WVUA 4LYCA 3TXFA 1WTMA 1IOSA 1LZTA 2ZYPA 1UIAA 3AGGG 3LN2A 1YKZX 4NWHA 1CNSA 1GB7A 4HJZA 1IOCA 4J0LA 4W94A 3WL2A 1GB8A 4NIJA 1LZSA 5KJ9A 1LHJA 2BQKA 1IORA 1GE4A 4H94A 1TBYA 3WPKA 3B6LA 2Y8PA 4J7VA 4ZEEA 1GHLA 5APFA 2HU3A 3WVXA 4WO6A 2Z12A 1B7QA 1XGRC 4QDNA 1BHZA 1BQLY 2N5ZA 5M1YA 2XBSA 1GEZA 3W3EA 5L9JA 1C46A 4H90A 3WPLA 4Z3MA 4NGZA 1EQ5A 1LYYA 3W6FA 3TXBA 1QUSA 1IWWA 1LJ4A 208LA 2DQFC 2MEHA 1IR9A 2HUBA 2YDGA 3W6CA 1IY3A 4HPIA 1TAYA 1GPQC 2EPEA 1ZVHL 3A95A 1OUFA 4N1CC 4BADA 5B05A 1BWIA 4ETBA 4GN4A 3EO5A 3CQLA 1SQ2L 2FYDA 3A91A 1Z55A 1LZEA 1LZRA 3HBDA 2BPUA 4WLYA 4H8YA 4ANRA 1LSEA 4DD3A 1YKXX 5DLAA 4XJHA 5KKJA 2C8OA 2MEIA 1B7NA 4RW1A 1REMA 2Z18A 4RW2A 1OUGA 1JIYA 1JUGA 5LVGA 4GLAA 1IP6A 2Z38A 4DT3A 5HQ1A 1FN5A 1IP2A 1LAAA 1LZGA 2YBNA 4Z46A 5ILCA 3TMVA 4NGVA 1BB4A 3A67Y 1HELA 1YROA 4LT1A 5F14A 5KXSA 1IP7A 2X0AA 2W1XA 3EMSA 5LYZA 1UUZC 1GB6A 4WL7A 1LJNA 4R6CA 3WUNA 4H9IA 4YEOA 3A90A 154LA 1D0KA 4TX7A 1QTEA 2HECA 1GF0A 4B1AA 3BKVA 5LA5A 2W1LA 5HMJA 1PS5A 1V7SA 1KIRC 1WQRA 4WM3A 1AZFA 1MELL 2BQFA 4M6DA 1LSMA 2BQHA 5L3HA 1LJKA 1GB9A 4DD0A 5KXNA 1GFKA 1ZMYL 1D0MA 4BAFA 4QEQA 4ZIXA 1LJFA 1XGQC 1WQNA 1UICA 1GAZA 4H9CA 3T6UA 1LJHA 4YF2A 2DBTA 4BAPA 1EQEA 4XENA 2LZTA 4HV2A 4OWAA 2MEGA 4KPMA 5I4XA 4MSTA 2MEBA 2DQHY 1JWRA 4U3XB 1UIFA 5KY1A 2I25L 1OP9B 1LSGA 3AZ6A 1JKAA 1G7LC 4KL7A 2F4AA 4LT2A 5LA8A 1G7MC 5T3FA 3G3AB 1LJGA 4AXTA 1IP1A 1LKSA 2LYZA 4G4CA 2G4QA 4H9FA 5F81A 1LJEA 5F9UA 1ZV5L 4HTKA 4EMNA 1HEQA 1AM7A 1ALCA 3WU7A 5FDJA 1IOQA 5KXXA 1DKJA 1LSAA 1LCNA 5LIOA 207LA 1B7MA 1BWHA 1J1OY 1OQMA 1UA6Y 2BQCA 4GCFA 3LYOA 4AGAA 4NSIA 1CJ8A 1LMNA 2IHLA 1DKKA 2Z19A 4NHSA 1HENA 4OOTA 1IWZA 1NMMA 1UIBA 4OWBA 2YBLA 1REYA 1VAUA 2D91A 1JISA 2IFFY 5APEA 1IP5A 3HFMY 1GE2A 1CJ9A 3ZVQA 1H6MA 1GFJA 2F2NA 4XADA 4WG1A 1RFPA 1UC0A 4YM8A 1PZYA 1YANA 4GN5C 1CJ6A 2GV0A 5J7CA 1IC4Y 1GEVA 2YBHA 132LA 1YL1X 1QSWA 1C10A 3CT5A 2YVBA 1IWXA 4PRQA 3G3BB 4TUNA 4G9SA 5DN4A 1VDPA 2DQIY 5A3ZA 2BQIA 1HNLA 1LYZA 4HSFA 4MCKA 2H9JA 3TXHA 1B7RA 1DZBX 2DQGY 4OWHA 4LT0A 3J4GA 4KT3A 1D9UA 153LA 3LYMA 3P4ZA 1XSFA 2F4GA 4YEMA 1JEFA 5B07A 2BAAA 1B5VA 5KXMA 2CWIA 4EOFA 2G4PA 2CDSA 1LSCA 5LAFA 2WARA 2A7DA 1IR8A 4HTQA 2EIZC 2BLYA 3RU5A 3LHMA 4UWVA 1GFAA 5DN5A 1QUTA 1ZVYB 4GCCA 5DM9A 1JJ0A 194LA 2CGIA 1LZAA 1LTMA 1LZ6A 4NHPA 1G7IC 2ZNWY 3AJNA 1LSDA 3AW6A 4TSCA 1OUJA 1WQOA 3WW6A 1IY4A 193LA 2C8PA 5LXWA 2LYOA 1I20A 4LYBA 4WMGA 1CJ7A 5LYTA 3TXIA 3D3DA 1DI4A 5AMYA 4NGWA 4XN6A 3WPJA 1OUBA 2BQDA 1JJ3A 4HTNA 1GBSA 1FLQA 1XGPC 1UACY 4NHIA 4DD9A 4N1EI 5LYMA 4NSHA 1QSAA 1GBXA 1LZ9A 1LMCA 3N9EA 4ETDA 1B7OA 4FDYA 1JTOL 1LHIA 2F30A 4H91A 5HNLA 5IELA 1HMKA 2XJWA 3WULA 1GBYA 3AYQA 4B4EA 3AW7A 4IASA 5FELA 3TMUA 1GBWA 1F6RA 4P2EA 5IHGA 1G7JC 1A4VA 2H5ZA 3WU8A 1HFXA 4DWXA 1YAOA 4RLMA 1D6QA 5C6JA 1UCOA 5KXTA 4NGKA 3OJPA 3LYTA 1GF3A 3WUMA 4B49A 3GXRA 6LYTA 1QDTA 5HMVA 3N9AA 3K3TA 4L41A 5I4YA 4OOOA 3A6CY 3ATOA 1LZ1A 1GB0A 1REXA 3N9CA 4WM5A 1LSFA 4NG1A 4I0CA 1BB6A 1YILA 1LKRA 1LSBA 1CKCA 1HHLA 1LSNA 3E3DA 3WYHA 3EXDA 2YSSC 4WM1A 3IWRA 1HSWA 1VDTA 4DD2A 2ZIKA 3OK0A 1IWYA 1VEDA 4OW1A 4DDAA 4ET9A 2XTHA 4NHQA 1UIGA 2YBJA 1HMLA 1I1ZA 3ATNA 4QY9A 3RZ4A 4LFPA 1KIPC 3CB7A 4N8ZA 3TXJA 4LGKA 1LMPA 3TXKA 1XEKA 2MEAA 1GB2A 3RNXA 5D5CA 4DDBA 4YENA 1CKDA 4J1BA 3HBEX 1LYSA 2LYMA 2BQAA 4H9EA 4NSGA 3RT5X 4CGEA 2ZWBA 1QIOA 4N0JA 1LHHA 1B7SA 1YAQA 5F16A 4RLNA 1DI5A 5KXWA 1FLUA 2BQGA 2MECA 5L3IA 4LYMA 1C43A 1XGUC 5C6IA 1XFPL 4LT3A 1IP3A 3QY4A 1UIDA 2A7FA 1IVMA 3WU9A 1LSYA 3AGIA 2FBBA 7LYZA 4H8ZA 4X3BA 3CT0A 3WXTA 2HEBA 4XJGA 1IC5Y 4NHTA 2BQLA 1N4FA 2ZYCA 1IP4A 3FE0A 1LZYA 4DYGA 4II8A 133LA 1NBYC 1JKDA 1LZ8A 4N9RA 1GFHA 2G4NA 3MGWA 4LFXA 5APCA 5LVKA 4H9HA 2W1YA 1BVKC 4D9ZA 1YL0X 2MEEA 4WL6A 3AGHA 1YAPA 1YQVY 3WH1A 4IATA 2AUBA 5LAGA 3T36A 5FCPA 1HC0A 1CKFA 1B0DA 2Z37A 3RW8A 5KXPA 4H92A 4B4JA 5LVJA 2ZIJA 4N5RA 5B59A 1LJJA 1W6ZA 4PPOA 1IWUA 5DL9A 5FSTA 5KXOA 5C6LA 1DXJA 4HPEA 1GFVA 3LZ2A 2BLXA 5E9RA 5D5FA 1J1PY 2VB1A 1GFGA 1FBIX 5KKIA 135LA 1BB3A 1JKCA 5KXZA 1LMQA 3A93A 4WLTA 4A7DA 4WO9A 4NFVA 1C7PA 3FI7A 2NWDX 4H9BA 3A34A 3W6EA 4H8XA 1MLCE 6LYZA 1YKYX 1JPOA 1LZ5A 2D4JA 5LVHA 4UWUA 1GF7A 4GCDA 4WM6A 3P65A 1A2YC 1FKVA 4QGZA 1LOZA 1F6SA 4H9AA 1GF4A 1B5XA 1QTKA 1HEWA 4NG8A 1GE1A 2XBRA 4W96A 3AZ7A 1LJ3A 1GF8A 4GCEA 4PGJB 1W08A 1RE2A 4OWEA 4G4HA 1GFEA 1LHKA 4MR1A 1P2CC 4ETEA 1LSZA 1XGTC 5HLLA 1XEJA 2LZ2A 1D0LA 2DQEY 1G7HC 1FLWA 1VFBC 5E4PA 2DQDY 4TTDA 2ZILA 1H87A 3M3UA 4WM4A 1RI8B 1LZDA 4NGJA 5KXLA 1C08C 1BB5A 4XJFA 1NBZC 3WMKA 2BQEA 2I6ZA 4Z98A 2B5ZA 1HFYA 4CFOA 1JSEA 3IJVA 3B72A 1LZBA 4ZFPA 4NGOA 1YIKA 1LSPA 4LZTA 1DI3A 3WW5A 1GFRA 2HEFA 4HP0A 3TXDA 3BKHA 1GBOA 134LA 4HV1A 5I53A 4CJ2A 1KXXA 3CSZA 4PJ2C 2BQNA 1UIEA 1LMOA 1UIHA 5I4WA 1JKBA 1OUCA 1JJ1A 4B0DA 1AKIA 1IWVA 1WVVA 2LHMA 3WXUA 1NHEA 4NEBA 1UBZA 4NGYA 4HJYA 2MEFA 4ET8A 1B7PA 2DQCY 1LHLA 1NF5A 1IR7A 5KXKA 3GXKA 4FJRA 1EL1A 3B0OA 1LYOA 1FDLY 4XJDA 2D4IA 1BVXA 1GD6A 1F10A 4DD1A 5FEKA 5I5QA 1JTPL 5B06A 1NDGC 1TCYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A94A 4KXIA 5LVIA 3W6AA 1GB3A 248LA 5I54A 1GF6A 1GB5A 2FBDA 4XJBA 1GXV2 1B7LA 4YX7C 1LYIA 4G4BA 3HT8A 1DYFA 1VATA 1E8LA 4NGIA 1KIQC 1CKGA 1L09A 130LA 2Z39A 4TWSA 4C3WA 3J6KA 1HEOA 4GLVA 4IAPA 1SSWA 2FYCA 3QE8A 1G0QA 3KAMA 3P66A 1REZA 245LA 4UWNA 4XJIA 2HU1A 3VWOA 1IO5A 1WQQA 1KXWA 1G0LA 1VDQA 1C6GA 1LJIA 3AZ4A 4DDCA 2O4WA 1I56A 1RJCB 1CU3A 1KW5A 182LA 1OUDA 1IIZA 1GE0A 3LZTA 3CSRA 1WQMA 4G49A 2OTYX 2NTHA 2Z2EA 1GXXA 1TEWA 2BQJA 1T6VL 2ZNXY 4I8SA 1L57A 1XEIA 1QTBA 1B2KA 2PC2A 3TXGA 1WQPA 1QT8A 258LA 196LA 1L77A 1D9WA 1GDWA 5EBHA 161LA 183LA 1D2WA 1GF5A 1KXYA 1GAYA 1G07A 1NWGA 4LYOA 4R0FA 1EQ4A 1L99A 4LYCA 1WTMA 1QT5A 1L0KA 2ZYPA 1UIAA 1G0PA 4NWHA 4HJZA 1L54A 1L25A 1GB8A 4PK0A 112LA 1L73A 5APFA 1L47A 3WVXA 1L85A 1BQLY 2N5ZA 1GEZA 3C80A 3W3EA 4H90A 3G3WA 4NGZA 3SBBC 1L64A 1QUSA 2MEHA 3W6CA 4K5YA 1TAYA 4W51A 1LYDA 1T97A 1BWIA 4W52A 4GN4A 1P5CA 1Z55A 2BPUA 4XJHA 1L38A 2C8OA 1QT6A 1L05A 1B7NA 3GUJA 4RW1A 1L56A 1REMA 1P56A 1JUGA 1IP6A 4DT3A 2YBNA 1KW7A 1IP7A 2X0AA 2W1XA 5LYZA 1LJNA 4YEOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A94 A;  4KXI A;  5LVI A;  3P68 A;  3W6A A;  1GB3 A;  1OUI A;  2MED A;  3ULR A;  1GFU A;  2EQL A;  1HFZ A;  1NQI A;  1V7T A;  3SP3 A;  5I54 A;  1GF6 A;  5IDD A;  1AT5 A;  1GB5 A;  1INU A;  5F9X A;  1OUH A;  1DPW A;  2FBD A;  2H9K A;  4XJB A;  4NGL A;  1GXV 2;  3WUA A;  1B7L A;  3A3Q A;  4G4B A;  4LYT A;  3LYZ A;  2EKS C;  2HTX A;  1VAT A;  1E8L A;  1BB7 A;  3A96 A;  4NGI A;  1LZ4 A;  1KIQ C;  3W6D A;  1CKG A;  3AZ5 A;  4H93 A;  4WLD A;  2D6B A;  1DQJ C;  2DQJ Y;  2Z39 A;  1QDR A;  1JHL A;  4GN3 A;  1GBZ A;  1LMA A;  1FKQ A;  1VDS A;  1YAM A;  3CT1 A;  1B5Z A;  4TWS A;  9LYZ A;  4C3W A;  3AB6 A;  1B5W A;  3J6K A;  5KXY A;  1HEO A;  4C5F A;  4GLV A;  4HJV A;  1JIT A;  1GFT A;  4LYZ A;  5JEN B;  2BQM A;  1B5U A;  2BQB A;  3A92 A;  4CFP A;  1HEP A;  1OUA A;  1IOT A;  2FYC A;  2ZQ3 A;  4H1P A;  1TDY A;  2D4K A;  3QE8 A;  5B1G A;  4XYY A;  1FLY A;  4PHI A;  4DC4 A;  3KAM A;  2DKV A;  4J1A A;  1D6P A;  4NWE A;  1OUE A;  3P66 A;  1REZ A;  4UWN A;  3F6Z A;  4XJI A;  1BGI A;  2HU1 A;  3A6B Y;  1O23 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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