1IR9A

Im mutant of lysozyme
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKMVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tolerance of point substitution of methionine for isoleucine in hen egg white lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ir9A00
2DQEY 3SP3A 1NKHA 1CNSA 1LMOA 1FLQA 1YIKA 2CGIA 1IWXA 2MEFA 1LSPA 3A95A 4LT3A 1FLWA 2BQKA 3P68A 4YEOA 5FELA 3WU9A 4CHXA 2BQGA 4NGWA 1HEMA 4RDSA 4FDYA 3N9EA 1B7MA 3AGGG 1D9UA 4NHSA 3CSRA 1GXXA 2FYCA 3TMWA 1B7PA 1QTKA 3CT0A 5KJ9A 3OK0A 2BLYA 1VDPA 4W94A 1WQPA 4N9RA 1LZDA 1LKRA 1B7LA 4NGVA 1VFBC 4BAFA 1IR9A 2BQDA 2FBDA 3AB6A 4OWHA 5KXXA 1BVKC 3KAMA 2GV0A 5KXWA 5F14A 1B5XA 1REXA 1GAYA 1GB3A 1GBZA 1ZVYB 4YM8A 4ZEEA 4BS7A 194LA 3AZ6A 5I54A 5KXMA 2ZNWY 4J1BA 1B2KA 4NG1A 1F0WA 2Z12A 4XJIA 1Z55A 3M3UA 4LYBA 3WVXA 1WQNA 1JJ3A 3A8ZA 3BKVA 1IP2A 3LYOA 5L9JA 2BQFA 2W1LA 1UIFA 5LA5A 1GF8A 4NFVA 3A93A 2YSSC 3A67Y 2NWDX 3AGIA 1ZVHL 4EMNA 4NGYA 1CJ7A 4D9ZA 3ATNA 1YL1X 4HJYA 2HU3A 2MEAA 2I25L 4NHPA 4GN3A 4YOPA 1LZRA 4HV2A 4I0CA 1YKYX 1IWWA 4TSBA 5KXSA 3WW5A 5KKJA 1OUHA 3RNXA 2N5ZA 4UWUA 1YQVY 1ZMYL 2DQJY 2ZNXY 1IY4A 2D4IA 4NGZA 1NWGA 1GD6A 1QDTA 4HTKA 1LHHA 1KXXA 5C6JA 3QY4A 1LZ1A 2YBIA 1GFGA 3J6KA 4DD3A 1GBYA 1UIEA 4W96A 2BQHA 1B5VA 4PRQA 1EL1A 5DN5A 4PHIA 1DZBX 1G7IC 4UWNA 3WVYA 1B5WA 1LZAA 3VWOA 4OWCA 4MSTA 4WM5A 4DD1A 4QY9A 3OJPA 4O34A 5B07A 4WL7A 5IELA 2BQCA 1UBZA 1XGQC 1B7SA 1LKSA 4KT3A 5C6LA 4HSFA 4YEMA 5ILCA 2F30A 1N4FA 5B59A 2MEIA 5DM9A 1QSAA 1LZ4A 1LAAA 5J7CA 4HPEA 4ANRA 5A3ZA 1I1ZA 1TBYA 1YAMA 3TMXA 5AMYA 1LZYA 4HJZA 4LFPA 1UIAA 5LYMA 4LT1A 1GPQC 1GE1A 4H9AA 4PJ2C 4DD9A 2Y8PA 1F6SA 1QSWA 4Z3MA 4CJ2A 2BQEA 5DL9A 4N0JA 1LZGA 1REMA 2ZQ4A 3EO5A 2LYOA 1GB6A 4NWHA 1LOZA 2G4QA 3TXKA 3WMKA 3WUNA 1A2YC 1LJKA 5LA8A 1FLYA 1YKZX 4A7DA 1C46A 132LA 4WG1A 3CSQA 1FKVA 4WO6A 1YANA 1UIGA 1LMTA 1LYZA 1I56A 1TAYA 1HNLA 3F6ZA 4H9FA 4J7VA 5F81A 4RLMA 1IWTA 4H8ZA 1VDQA 2DQFC 2YBJA 4WMGA 2LYMA 1GWDA 1REZA 1IWVA 5HMJA 1TCYA 4XJDA 2HEBA 3CSZA 4H9IA 1LJGA 4NY5A 3W6CA 5LYTA 4ETAA 3A96A 1IO5A 1B5UA 4WM4A 4G9SA 1RCMA 4ZIXA 1GHLA 1JISA 1PS5A 2EPEA 2ZWBA 5KXZA 1JTOL 1KIQC 5LAFA 5ILFA 3HBHA 193LA 3WUAA 1UACY 1IVMA 4IATA 5IHGA 2LYZA 2XJWA 1OP9B 3WULA 2EQLA 3ATOA 4GLVA 1LSAA 4H8YA 4TSCA 4B4EA 4XENA 5C6IA 2CWIA 4DYGA 1IIZA 1GF9A 4CGEA 1DI5A 3LYZA 1XEJA 4TTDA 1LYSA 5LVGA 2A7DA 4NSIA 1FDLY 3G3BB 1JSEA 2CDSA 1TDYA 1GE3A 5HLLA 2BLXA 1GB5A 3M18B 4XJGA 1CKCA 4H1PA 1DI4A 1LZCA 1LJHA 2MEEA 2MECA 1IP1A 5HNLA 1W6ZA 1YKXX 1NDGC 1LSEA 4N8ZA 1BB6A 3FI7A 1T3PA 1WQQA 2PC2A 1HFZA 3TXEA 3A3QA 1QIOA 3TXIA 1LJEA 1LZ5A 1IP3A 2XBRA 5E9RA 3TXJA 4ET8A 1NHEA 1GFUA 4TWSA 2X0AA 1LSZA 1JITA 1QTEA 2I6ZA 4J0LA 5DN4A 1IP7A 1IX0A 4WM1A 3A6CY 1V7TA 1DQJC 1MLCE 3AZ4A 1LZTA 1HEPA 4GCCA 4ZFPA 1JSFA 1KIPC 2BQMA 5APCA 1JIYA 5B05A 3CT5A 1GFVA 1IP4A 2D4JA 2H9KA 4HTQA 1FN5A 4ETCA 4NHIA 1CKFA 1H6MA 4AXTA 1VDTA 2MEHA 3CQLA 1OUBA 1NBYC 1D0KA 1LJJA 1GBXA 2YBLA 1NMMA 4HPIA 3WH1A 2H9JA 4EOFA 1JWRA 4AGAA 2F2NA 4GN5C 5LVJA 4LYZA 1IOCA 4NWEA 3TXGA 1YAPA 1BGIA 1HFXA 1FLUA 1YILA 4XADA 5LAGA 5HMVA 5KY1A 2Z19A 4LYTA 1GB0A 4C5FA 1DKJA 4LFXA 1F6RA 3W6EA 2EIZC 1BWHA 3FE0A 5KKIA 1LSFA 3EBAB 3LYTA 208LA 1LSNA 2XTHA 3HBDA 4H9EA 1JEFA 4G49A 4LT0A 2MEGA 5D5FA 3WXTA 2DQCY 4M6DA 5APEA 4G4BA 2FYDA 1GBOA 1JPOA 1LZSA 1SLYA 3W6BA 3WPLA 1NQIA 1QDRA 1G7LC 1W08A 1GFTA 4B4IA 3LN2A 1OUDA 1VDSA 4G4HA 1IC7Y 4N1CC 1H87A 3LZ2A 3TXDA 2YBNA 1FKQA 1G7JC 4B49A 4ML7A 4WOAA 5KXKA 1IWYA 1BB4A 2C8OA 5LIOA 1LSMA 2G4NA 1PZYA 1O23A 2HU1A 1LMQA 4NHTA 4WO9A 2F4GA 133LA 3P64A 3A3RX 1GFAA 1HERA 4NHQA 1WQOA 4OOOA 4Z41A 1XGUC 1D6PA 4LT2A 5E4PA 3WXUA 1KXYA 1IWZA 1JKBA 1IC5Y 1LHMA 1XFPL 3LHMA 1LZ6A 1LHIA 1B5ZA 1BVXA 4ETEA 4WL6A 2IFFY 2ZILA 4GCFA 4QDNA 4MR1A 3A90A 1VATA 1LSBA 1AT6A 1GF5A 3P4ZA 4RW2A 1XSFA 4PRUA 5APFA 3TMVA 2HEDA 4NGLA 3B0IA 3B0OA 4WLXA 1JJ0A 2C8PA 4C3WA 6LYZA 1JKDA 2B5ZA 4XJHA 4XN6A 5I53A 5F9XA 4WLYA 1LZNA 1OUFA 3J4GA 4NIJA 4DDBA 1C10A 135LA 4IJ4A 2YDGA 4B1AA 2MEBA 4HTNA 2AUBA 3AGHA 4CFPA 1GEVA 1C45A 1ALCA 1OUJA 1B7OA 1KIRC 2DBTA 1YAQA 1YROA 5DLAA 2LHMA 1AZFA 5HNCA 1CJ8A 1WVVA 5LVHA 1XGRC 1MELL 3ZVQA 1KXWA 1SQ2L 2DQDY 5I4WA 1RJCB 1V7SA 2DKVA 1HMKA 1QUSA 4HJVA 4IASA 4WM6A 3A91A 5KXNA 1NDMC 1WTMA 2DQHY 1BWJA 1VAUA 1GF4A 1B7NA 3AYQA 4RW1A 1GFRA 1LHJA 5FCPA 2W1YA 3AZ7A 1JTPL 1CJ9A 1HEQA 1UCOA 1GB7A 4WM2A 1JTTL 4Z46A 1A4VA 1IEEA 1YL0X 3AJNA 4J1AA 4KXIA 1YAOA 3T36A 3K3TA 4LYMA 3AW6A 4GN4A 4YF2A 2BQOA 1LYYA 3TXHA 1EQ4A 3TXFA 1HFYA 1XGPC 2BQNA 2BQAA 3N9CA 1GE4A 1DPXA 5IDDA 5KXPA 154LA 4NGOA 1HSXA 1UIBA 2Z38A 1HENA 2XBSA 153LA 1LZBA 4BAPA 4H92A 4OWAA 4ETDA 4LGKA 1LZ9A 5HQ1A 1BQLY 1GDXA 1GDWA 1CJ6A 2DQIY 4N5RA 9LYZA 3LZTA 4RLNA 1OUAA 1DI3A 5KXTA 1JJ1A 1GF0A 1HELA 2A7FA 1WVUA 2HEAA 3WL2A 4YENA 4Z98A 5KXOA 4WLDA 3WUMA 2Q0MX 1G7HC 1CKDA 4H94A 5KXRA 7LYZA 3QNGA 2ZIKA 4QEQA 4DD0A 1HF4A 1B5YA 3N9AA 5FEKA 3RT5X 1D0LA 1B0DA 3MGWA 1F10A 5A3EA 4NEBA 1B7RA 3P65A 1IOQA 4I8SA 1HHLA 1GFEA 1WTNA 2BAAA 1DKKA 2HTXA 2BQIA 3IWRA 1IP5A 1IY3A 1HC0A 1C08C 4WG7A 3B72A 4H90A 4OWBA 1AT5A 2HUBA 4R0FA 4LYCA 1REYA 1RFPA 4WM3A 1QUTA 2Z2FA 5LYZA 1GE2A 3RU5A 4L41A 4DDCA 1JHLA 3TMUA 4ET9A 2MEDA 1HEWA 5M1YA 2LZTA 3B0KA 1LMNA 2Z2EA 4N1EI 4PPOA 3B6LA 4MCKA 1IR8A 1HSWA 5JENB 1LPIA 1XEKA 4H8XA 2EKSC 2DQGY 4GCEA 5I5QA 1UC0A 1UA6Y 1B9OA 4H9HA 1T6VL 1GF6A 3D9AC 4KL7A 3EXDA 4GCBA 2YBHA 5KXYA 3W3EA 1LMPA 4PGJB 2BQJA 5I4YA 1GEZA 1HMLA 2BQBA 1GFJA 1JKCA 1J1XY 5L3IA 4OW1A 1UIHA 4OWEA 4KPMA 5I4XA 1JKAA 1LSCA 2BPUA 4NGKA 3W6AA 4CFOA 4NGIA 5EBHA 5APDA 3ULRA 8LYZA 2G4PA 1E8LA 3A34A 1GBWA 1GBSA 4GCDA 1NF5A 1G7MC 2D4KA 2F4AA 1IOSA 2W1XA 3BKHA 4NGJA 5F9UA 1RI8B 3HBEX 3WPKA 6LYTA 1EQEA 1INUA 1LJ3A 4H9CA 1LYOA 1BHZA 4HV1A 2YBMA 1GB2A 4QGZA 4DDAA 1GFKA 3RZ4A 1VEDA 1ZV5L 5FHWA 5LINA 134LA 1LTMA 1GB9A 2HEFA 1AM7A 1RE2A 1LMCA 1LCNA 2HEEA 2I26L 5II3A 3A92A 3P66A 4XJBA 3ZEKA 3HFMY 4XYYA 4B4JA 2ZQ3A 1DPWA 3E3DA 2WARA 1GE0A 4U3XB 1GF7A 4H9BA 2CJLA 1LJNA 3A94A 5T3FA 1IP6A 1NBZC 2Z18A 5L3HA 4H93A 1IOTA 1GXV2 4NSJA 2BQLA 4B0DA 4DWXA 1D0MA 1LSYA 1IR7A 1GAZA 3CT1A 1BWIA 3AW7A 1OUEA 1IORA 1BB5A 1IC4Y 3RW8A 4DD2A 1LHLA 2LZ2A 1GFHA 1LJ4A 4NSHA 4WLTA 4XJFA 4M4OA 1OUIA 1XGTC 3QE8A 3IJVA 3WU7A 1BB7A 1EQ5A 1LZ8A 2D6BA 2HECA 4UWVA 2ZYPA 1GB8A 3WYHA 1P2CC 1WQMA 1UIDA 2VB1A 3WW6A 1AKIA 2H5ZA 1LJFA 4X3BA 2ZYCA 2Z39A 5FDJA 1LMAA 4P2EA 1FBIX 1GF3A 4TX7A 3GXKA 1LSGA 4NSGA 1OUGA 5D5CA 1C43A 5B1FA 1C7PA 1OQMA 3GXRA 3CB7A 3A6BY 2W1MA 4DC4A 1BB3A 3D3DA 4GLAA 1UUZC 4LZTA 4R6CA 4E3UA 4H91A 4OOTA 5LVKA 1J1OY 2RSCA 1LJIA 2YVBA 1I20A 1J1PY 1HEOA 3EMSA 4FJRA 1XEIA 3LYMA 5B06A 1IWUA 1D6QA 4LYOA 3TXBA 3W6DA 4ETBA 1B7QA 3T6UA 4DD7A 4NG8A 1TEWA 3IJUA 4DT3A 1WQRA 5LVIA 1QQYA 5F16A 4G4CA 3ZVQB 1OUCA 1LHKA 3G3AB 4TUNA 4BADA 3WPJA 2IHLA 2D91A 4II8A 1JUGA 1LSDA 4HP0A 1LZEA 5B1GA 3W6FA 5LXWA 207LA 2DQAA 5FSTA 3AZ5A 1CKHA 2ZIJA 1DXJA 2FBBA 5KXLA 1CKGA 1UICA 2Z37A 5K7OA 3WU8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CNSA 2MEFA 1LSPA 3A95A 1C61A 1FLWA 1L82A 2BQGA 4NGWA 4I7OA 4RDSA 1L23A 222LA 1GXXA 3CT0A 3OK0A 1WQPA 2BQDA 5KXXA 1REXA 143LA 1L77A 1C62A 1B2KA 1KS3A 1C6IA 1F0WA 1Z55A 159LA 4DKLA 1WQNA 3LYOA 1UIFA 4AQNA 1P5CA 1G06A 1L00A 1CX7A 4D9ZA 4HJYA 180LA 1CX6A 115LA 1QS5A 2MEAA 1L12A 1LYDA 5KKJA 1ZMYL 3HTBA 2D4IA 4NGZA 1C6NA 1QDTA 4HTKA 186LA 5C6JA 211LA 1L53A 1GFGA 3J6KA 1GBYA 1UIEA 2RAZX 5DN5A 4UWNA 1B5WA 1LI2A 1QS9A 4O34A 4WL7A 2BQCA 1UBZA 1LKSA 4KT3A 5C6LA 2F30A 5DM9A 3HTDA 1LAAA 5J7CA 2B6WA 1I1ZA 1L55A 3TMXA 2F32A 5AMYA 4HJZA 5LYMA 1L22A 4DD9A 2Y8PA 4Z3MA 104LA 3GUPA 1LZGA 3WMKA 1PQJA 3TXKA 1A2YC 5LA8A 1YKZX 254LA 123LA 1C46A 3SN6R 1FKVA 1TAYA 3F6ZA 4EKPA 5F81A 1IWTA 4H8ZA 2LYMA 1IWVA 5HMJA 1TCYA 4XJDA 3CSZA 4WM4A 1JTOL 1KIQC 1UACY 1OP9B 4I7LA 4B4EA 251LA 2CWIA 1L36A 4CGEA 1DI5A 1XEJA 4TTDA 1LYSA 5LVGA 4NSIA 140LA 1TDYA 1DI4A 2ANXA 184LA 1W6ZA 4LDLA 1NDGC 1LSEA 3TXIA 4ET8A 2B75A 1NHEA 1GFUA 2I6ZA 1C6CA 2OU9A 1P46A 250LA 3AZ4A 1L11A 1JIYA 4HTQA 4EKRA 223LA 191LA 2MEHA 157LA 4LDOA 3OE8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DQE Y;  3SP3 A;  1NKH A;  1CNS A;  1LMO A;  1FLQ A;  1YIK A;  2CGI A;  1IWX A;  2MEF A;  1LSP A;  3A95 A;  4LT3 A;  1FLW A;  2BQK A;  3P68 A;  4YEO A;  5FEL A;  3WU9 A;  4CHX A;  2BQG A;  4NGW A;  1HEM A;  4RDS A;  4FDY A;  3N9E A;  1B7M A;  3AGG G;  1D9U A;  4NHS A;  3CSR A;  1GXX A;  2FYC A;  3TMW A;  1B7P A;  1QTK A;  3CT0 A;  5KJ9 A;  3OK0 A;  2BLY A;  1VDP A;  4W94 A;  1WQP A;  4N9R A;  1LZD A;  1LKR A;  1B7L A;  4NGV A;  1VFB C;  4BAF A;  1IR9 A;  2BQD A;  2FBD A;  3AB6 A;  4OWH A;  5KXX A;  1BVK C;  3KAM A;  2GV0 A;  5KXW A;  5F14 A;  1B5X A;  1REX A;  1GAY A;  1GB3 A;  1GBZ A;  1ZVY B;  4YM8 A;  4ZEE A;  4BS7 A;  194L A;  3AZ6 A;  5I54 A;  5KXM A;  2ZNW Y;  4J1B A;  1B2K A;  4NG1 A;  1F0W A;  2Z12 A;  4XJI A;  1Z55 A;  3M3U A;  4LYB A;  3WVX A;  1WQN A;  1JJ3 A;  3A8Z A;  3BKV A;  1IP2 A;  3LYO A;  5L9J A;  2BQF A;  2W1L A;  1UIF A;  5LA5 A;  1GF8 A;  4NFV A;  3A93 A;  2YSS C;  3A67 Y;  2NWD X;  3AGI A;  1ZVH L;  4EMN A;  4NGY A;  1CJ7 A;  4D9Z A;  3ATN A;  1YL1 X;  4HJY A;  2HU3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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