1KW7A

Methionine core mutant of t4 lysozyme
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Multiple methionine substitutions are tolerated in T4 lysozyme and have coupled effects on folding and stability
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1kw7A00
3HUKA 1T8AA 162LA 1L37A 2B73A 1QTVA 3G3XA 187LA 1T6HA 1C63A 1L27A 1P6YA 2OEAX 1C6AA 2NTHA 130LA 1D3JA 1L45A 228LA 3OE9A 1OVKA 3FA0A 3DNAA 1QUHA 232LA 1C6QA 2IGCA 3NY8A 1P64A 1LI2A 119LA 243LA 2RBRA 1L17A 3DMXA 3HDEA 2OU8A 186LA 2HULA 3HTDA 1C6DA 1T8GA 3PBLA 4I7LA 2LC9A 3G3VA 3K2RA 3JR6A 1L67A 1G07A 1G0JA 1QUOA 3NYAA 1C6IA 4W59A 1L24A 173LA 2O7AA 146LA 2RBNA 2RAZX 3SB9A 167LA 1QS9A 190LA 1PQJA 1LYEA 1C6TA 169LA 1LW9A 4YXAC 3DN2A 262LA 1LPYA 1G0GA 1L71A 1LWKA 205LA 160LA 2B72A 2F47A 1QT3A 1B6IA 2OU0X 223LA 1G1VA 1L42A 139LA 4EXMA 143LA 2RB0X 110LA 1XEPA 3HH4A 3OE0A 122LA 3HUQA 4W52A 1L47A 1L64A 1T97A 256LA 163LA 4DJHA 1L04A 3D4SA 102LA 140LA 103LA 1L32A 4K5YA 219LA 3GUPA 3SN6R 1JTNA 1L40A 3HT6A 1DYBA 240LA 4YXCA 1C6PA 3SBAA 3PDSA 1ZURA 3HWLA 3GUJA 201LA 1C6GA 1ZWNA 3V2WA 4I7JA 4IAPA 1XJUA 1L30A 3NY9A 2OE4X 3CDTA 3FADA 3VW7A 1CU5A 1I6SA 1L14A 1L81A 1L20A 109LA 2B6WA 1LYIA 4ZPUA 155LA 1PQIA 1G0KA 3RUNA 1CVKA 4ARPA 181LA 2Z6BA 126LA 1CX6A 4PJZA 1L56A 1L96A 2HUMA 4I7PA 1C6KA 1QTZA 1LLHA 2B6TA 7LZMA 1L99A 2OE9X 1C6MA 1QSBA 1L55A 1L87A 1P46A 3DN8A 1CV3A 188LA 170LA 174LA 1L49A 1SSWA 4DAJA 1L35A 3DN1A 3SB7A 2OTZX 1L10A 3HDFA 4I7SA 1L01A 1L28A 108LA 1LI6A 1D9WA 156LA 1KY0A 1LYDA 147LA 198LA 158LA 1L06A 1C60A 1P7SA 1PQKA 1L89A 1L31A 3SB5A 1L60A 1OWYA 4W57A 3GUNA 1QTHA 250LA 196LA 3C7YA 131LA 1L07A 4GRVA 3SBBC 261LA 3GUOA 129LA 225LA 221LA 4PK0A 2ANXA 6LZMA 5LZMA 1L85A 1L13A 1L0JA 161LA 1CV4A 1KS3A 1L09A 3HUAA 185LA 1CV1A 1CX7A 239LA 1QSQA 1L93A 1D2YA 182LA 237LA 145LA 4LDEA 1L68A 1L08A 111LA 1DYDA 227LA 1SSYA 3RZEA 151LA 2RH1A 2B74A 1C6BA 1DYCA 2OE7X 2B6XA 1LWGA 4W51A 3QAKA 3L2XA 3GUIA 1P5CA 1L59A 1P3NA 3C8SA 165LA 1SWZA 231LA 1L26A 150LA 4I7NA 2RBOA 1G0QA 128LA 1OYUA 1L43A 1LYFA 3OE6A 1C69A 1CU6A 213LA 1L73A 1P36A 210LA 3DN4A 3DMZA 1CU2A 1OV7A 1L38A 1L03A 1XJTA 1KNIA 1L22A 2B70A 1CV6A 4AQNA 2HUKA 1G0LA 3HTFA 2RB1X 235LA 4W53A 1L41A 1L54A 1JQUA 1CUQA 244LA 4YX7C 1QT5A 2B6ZA 1L91A 1K28A 249LA 3DN0A 1EPYA 2Q9DA 1L86A 114LA 1L18A 3HTBA 2RB2X 1L88A 3DN6A 233LA 1LYHA 3C7WA 2LZMA 3HT9A 1L39A 1L44A 178LA 1L94A 1LYGA 1PQOA 1L83A 3GULA 4I7OA 216LA 3CDVA 166LA 1C6NA 1WTHA 214LA 4ARQA 1LGWA 1L98A 159LA 3HU9A 141LA 3SB8A 241LA 3V2YA 1L05A 252LA 177LA 4I7QA 1L57A 123LA 2O4WA 3DN3A 1C6EA 4W55A 164LA 2B6YA 2F2QA 4LZMA 1L84A 1PQMA 2CUUA 1C61A 1L74A 1QTBA 2RBPA 245LA 1L69A 255LA 1OV5A 3HT7A 1CU0A 3SB6A 1G0PA 1DYFA 4W58A 242LA 1L21A 1L25A 3CDOA 1C6LA 1D3NA 3C8RA 2OU9A 4OO9A 4EPFA 1CUPA 1L79A 1L61A 1L36A 1C65A 4I7KA 4EPIA 1QUDA 197LA 3C8QA 1QTCA 184LA 1C67A 258LA 1C6HA 1L00A 234LA 217LA 148LE 192LA 4E97A 1L80A 1L72A 247LA 5I14A 1L95A 2L78A 1C64A 1L48A 3C80A 1L0KA 259LA 1DYAA 183LA 112LA 171LA 230LA 3HH6A 4EKSA 1L02A 4I7RA 224LA 1NHBA 1L46A 2NTGA 4W54A 4I7MA 4EKRA 3F8VA 1KW5A 220LA 1L16A 1DYEA 4GBRB 191LA 176LA 1DYGA 1QS5A 4ARQB 215LA 1L15A 3GUKA 3HU8A 1L82A 3HTGA 1L63A 3DMVA 172LA 3C82A 1L92A 1C6FA 251LA 1CTWA 1G06A 1D3MA 1SX7A 248LA 189LA 1QT7A 4EKQA 211LA 3C7ZA 1L29A 3UONA 2RAYX 257LA 1LGXA 4ARMB 1QT6A 127LA 3C83A 1L58A 206LA 260LA 218LA 3LZMA 115LA 2RBSA 1L62A 1JTMA 3F9LA 1L65A 226LA 1L23A 3CDQA 1C6CA 175LA 180LA 1L11A 3HH3A 4DKLA 1D2WA 120LA 1OWZA 3DKEX 238LA 1D3FA 1L70A 137LA 1L51A 1CV0A 1L52A 3EMLA 1QTDA 2ANVA 1L50A 1L75A 195LA 2F32A 4ARLA 2B75A 157LA 1QUGA 3HT8A 1L34A 1KY1A 254LA 1CV5A 3ODUA 3G3WA 1P2RA 4I7TA 4LDLA 212LA 3OE8A 4EKPA 3CDRA 107LA 2OTYX 2LCBA 199LA 1CU3A 1SX2A 1L33A 236LA 1C62A 125LA 1C6JA 1LYJA 1TLAA 209LA 1C68A 1L76A 1L90A 104LA 1OVHA 1OVJA 246LA 1L19A 1P2LA 1T8FA 2RBQA 1QT4A 1L53A 1G0MA 4ARMA 1KW7A 2B7XA 2Q9EA 3GUMA 113LA 1LGUA 144LA 138LA 1QT8A 2O79A 2QB0B 253LA 1L66A 1G1WA 4S0WA 142LA 1C66A 149LA 3L64A 1LI3A 4EJ4A 2QARC 229LA 1L77A 3FI5A 168LA 1L12A 152LA 118LA 1P37A 4ARJA 1L97A 1ZYTA 1PQDA 2A4TA 3HH5A 4LDOA 200LA 4W56A 1SWYA 1P56A 3C81A 222LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HUKA 2W1MA 1L37A 1GFHA 1B5WA 3G3XA 2Z2EA 4BAFA 3D9AC 1P6YA 2OEAX 4NHPA 4H8YA 1OVKA 3A3RX 2YBIA 4QY9A 1QUHA 3IJVA 232LA 133LA 1AT5A 1V7TA 3DMXA 2OU8A 2CDSA 1GF4A 1IC7Y 1LZDA 1KIRC 4NGLA 2YBMA 5C6LA 4LT3A 3G3VA 207LA 1C6IA 3WW6A 4W59A 173LA 1LMCA 2RBNA 2RAZX 3SB9A 4XYYA 2BQBA 190LA 3A94A 1PQJA 1C6TA 169LA 1CKCA 262LA 4N5RA 1OP9B 1WQQA 5J7CA 1L71A 1LWKA 5T3FA 160LA 2B72A 1IWYA 2F47A 4OOOA 1B6IA 1L42A 4QGZA 1GE2A 1GD6A 1WQOA 1XEPA 5EBHA 1EL1A 1GEVA 256LA 2EQLA 4DJHA 1GF7A 3D4SA 5KXWA 103LA 4K5YA 1QSAA 4FJRA 1LHLA 240LA 4YXCA 6LYTA 3OJPA 3GUJA 1DKKA 3ULRA 4GLAA 1F6RA 2OE4X 2DQEY 1QTKA 4EMNA 1IOCA 1L14A 1VFBC 4IASA 5E4PA 1GBZA 2B6WA 1LYIA 1LYSA 1HF4A 2FBBA 1GF5A 1UIAA 2Z6BA 4I7PA 4TUNA 3QY4A 1KIQC 4XENA 1IOSA 3A91A 1C6MA 3WUNA 8LYZA 1L55A 4NGVA 3HBHA 3LHMA 1CV3A 188LA 170LA 3HBEX 1LMTA 1YL1X 1L10A 1L01A 156LA 1BWIA 3A90A 1L06A 1C60A 5LINA 4BADA 4NSGA 2Z12A 1TCYA 1EQ5A 3SB5A 1L60A 4IJ4A 196LA 2ZQ3A 5B06A 4LZTA 4H9FA 1GF3A 261LA 3GUOA 1GE0A 3CB7A 1L85A 3HBDA 1L0JA 185LA 1CV1A 1CX7A 4HSFA 4WLYA 182LA 111LA 1DYDA 3WVYA 4H9IA 2B74A 1C6BA 2B6XA 1VEDA 3QAKA 3GUIA 3QNGA 3C8SA 231LA 1L26A 4UWVA 1G0QA 1HFYA 128LA 1FKQA 1OYUA 1LSNA 1L43A 1C69A 213LA 1L73A 3E3DA 5ILCA 1OV7A 1L38A 4CFPA 1CJ7A 1B5ZA 1HEOA 4YM8A 1AKIA 4OWAA 1GDWA 1IP5A 5IDDA 1KNIA 1LJIA 1LHHA 1L22A 2RSCA 4DDAA 4LYBA 1JUGA 1G0LA 2MEFA 5KY1A 3ATOA 1OUJA 3DN0A 1TEWA 4NHSA 2RB2X 3DN6A 1LZ6A 5C6JA 1WQPA 1LJNA 2C8PA 3C7WA 1RJCB 1UACY 1GB9A 4DT3A 1GE4A 216LA 1WTNA 1W08A 1C6NA 159LA 3HU9A 1GFTA 1GF8A 2DQIY 141LA 3SB8A 4CFOA 1L05A 5APFA 252LA 3DN3A 4N0JA 2F2NA 4W55A 1NBZC 1WQNA 1LCNA 4DQ7A 1C61A 3WUAA 2RBPA 5LVGA 3TXJA 1OV5A 1CU0A 1GF0A 1DYFA 4RLMA 4W58A 1B7QA 1L21A 1GAZA 4EPFA 1HEPA 1CUPA 1LZEA 4RW2A 197LA 1QUDA 3C8QA 4W96A 1QTCA 1BWHA 2ZNXY 4DYGA 1C6HA 1L00A 1IWXA 3LZTA 4IATA 3WYHA 4J1BA 4E97A 5LAFA 1L72A 3GXRA 5FELA 2L78A 5DM9A 1HSXA 1B5XA 259LA 1DYAA 183LA 4H9HA 4C3WA 2MECA 4KXIA 1QSWA 5DN5A 1BHZA 1GHLA 1LZBA 220LA 1L16A 1DYEA 3T6UA 4ARQB 2B5ZA 1YAOA 1IEEA 2C8OA 1LMQA 1L82A 4NY5A 5L3IA 1UIEA 1B7RA 172LA 1IOQA 1BB7A 1B0DA 1L92A 2D4IA 3C82A 4PJ2C 1NQIA 1QDRA 1NDMC 5HNLA 1QT7A 1GB3A 211LA 5HMJA 4NGKA 4ARMB 1QT6A 1LZCA 2MEBA 2D4JA 1WVVA 3N9EA 1VATA 5LA8A 115LA 2F4AA 3QE8A 1L62A 2DQDY 1JTMA 2Q0MX 226LA 2ZWBA 4NHTA 4DDBA 5F9UA 1JWRA 2BQCA 3HH3A 1D2WA 120LA 1OWZA 4WG1A 1BB4A 238LA 2ZQ4A 1OUBA 4WOAA 1CV0A 1L52A 3EMLA 3G3BB 1P2CC 1KY1A 5LYTA 3GXKA 2W1YA 3RZ4A 1L33A 1YAMA 1Z55A 1PS5A 1YIKA 2BQKA 1LSAA 209LA 1C68A 1JKDA 1JITA 1IWTA 246LA 1LSMA 4UWNA 4XJGA 1QT4A 3LN2A 1HNLA 4ARMA 1KW7A 4I0CA 113LA 1QT8A 253LA 1LYOA 1L66A 1G1WA 2QARC 1L77A 4H8ZA 5F14A 1YANA 3FI5A 4OOTA 152LA 4N8ZA 2EIZC 1PQDA 1OUCA 4LDOA 1BWJA 4W52A 2B73A 4H91A 1LMNA 1L27A 1FLWA 5KKJA 1D0KA 130LA 4KT3A 228LA 3OE9A 3FA0A 5L9JA 2YVBA 5II3A 1C6QA 3NY8A 1KXYA 5FDJA 3P64A 4H90A 1VDQA 4XJFA 3HTDA 4LYCA 1LHJA 1QQYA 1T8GA 4PGJB 1REXA 1L24A 1KXXA 2O7AA 1B7PA 1IIZA 2YBNA 3P68A 3LYTA 167LA 3T36A 1LYEA 1XFPL 4WLTA 1JSEA 3DN2A 205LA 1XGQC 3P65A 1QT3A 2PC2A 1OUAA 110LA 3HH4A 3HUQA 4EOFA 1L64A 4ET8A 4YEOA 4H8XA 2G4NA 2Z39A 3GUPA 1VDPA 1L40A 3AYQA 1D0MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HUK A;  2W1M A;  1L37 A;  1GFH A;  1B5W A;  3G3X A;  2Z2E A;  4BAF A;  3D9A C;  1P6Y A;  2OEA X;  4NHP A;  4H8Y A;  1OVK A;  3A3R X;  2YBI A;  4QY9 A;  1QUH A;  3IJV A;  232L A;  133L A;  1AT5 A;  1V7T A;  3DMX A;  2OU8 A;  2CDS A;  1GF4 A;  1IC7 Y;  1LZD A;  1KIR C;  4NGL A;  2YBM A;  5C6L A;  4LT3 A;  3G3V A;  207L A;  1C6I A;  3WW6 A;  4W59 A;  173L A;  1LMC A;  2RBN A;  2RAZ X;  3SB9 A;  4XYY A;  2BQB A;  190L A;  3A94 A;  1PQJ A;  1C6T A;  169L A;  1CKC A;  262L A;  4N5R A;  1OP9 B;  1WQQ A;  5J7C A;  1L71 A;  1LWK A;  5T3F A;  160L A;  2B72 A;  1IWY A;  2F47 A;  4OOO A;  1B6I A;  1L42 A;  4QGZ A;  1GE2 A;  1GD6 A;  1WQO A;  1XEP A;  5EBH A;  1EL1 A;  1GEV A;  256L A;  2EQL A;  4DJH A;  1GF7 A;  3D4S A;  5KXW A;  103L A;  4K5Y A;  1QSA A;  4FJR A;  1LHL A;  240L A;  4YXC A;  6LYT A;  3OJP A;  3GUJ A;  1DKK A;  3ULR A;  4GLA A;  1F6R A;  2OE4 X;  2DQE Y;  1QTK A;  4EMN A;  1IOC A;  1L14 A;  1VFB C;  4IAS A;  5E4P A;  1GBZ A;  2B6W A;  1LYI A;  1LYS A;  1HF4 A;  2FBB A;  1GF5 A;  1UIA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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 2Z6B A;  4I7P A;  4TUN A;  3QY4 A;  1KIQ C;  4XEN A;  1IOS A;  3A91 A;  1C6M A;  3WUN A;  8LYZ A;  1L55 A;  4NGV A;  3HBH A;  3LHM A;  1CV3 A;  188L A;  170L A;  3HBE X;  1LMT A;  1YL1 X;  1L10 A;  1L01 A;  156L A;  1BWI A;  3A90 A;  1L06 A;  1C60 A;  5LIN A;  4BAD A;  4NSG A;  2Z12 A;  1TCY A;  1EQ5 A;  3SB5 A;  1L60 A;  4IJ4 A;  196L A;  2ZQ3 A;  5B06 A;  4LZT A;  4H9F A;  1GF3 A;  261L A;  3GUO A;  1GE0 A;  3CB7 A;  1L85 A;  3HBD A;  1L0J A;  185L A;  1CV1 A;  1CX7 A;  4HSF A;  4WLY A;  182L A;  111L A;  1DYD A;  3WVY A;  4H9I A;  2B74 A;  1C6B A;  2B6X A;  1VED A;  3QAK A;  3GUI A;  3QNG A;  3C8S A;  231L A;  1L26 A;  4UWV A;  1G0Q A;  1HFY A;  128L A;  1FKQ A;  1OYU A;  1LSN A;  1L43 A;  1C69 A;  213L A;  1L73 A;  3E3D A;  5ILC A;  1OV7 A;  1L38 A;  4CFP A;  1CJ7 A;  1B5Z A;  1HEO A;  4YM8 A;  1AKI A;  4OWA A;  1GDW A;  1IP5 A;  5IDD A;  1KNI A;  1LJI A;  1LHH A;  1L22 A;  2RSC A;  4DDA A;  4LYB A;  1JUG A;  1G0L A;  2MEF A;  5KY1 A;  3ATO A;  1OUJ A;  3DN0 A;  1TEW A;  4NHS A;  2RB2 X; 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