1KW7A

Methionine core mutant of t4 lysozyme
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Multiple methionine substitutions are tolerated in T4 lysozyme and have coupled effects on folding and stability
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1kw7A00
1C6MA 158LA 223LA 4DJHA 3HTFA 250LA 1CU5A 4I7JA 3PBLA 1D3FA 1QUDA 1G07A 1P2LA 3DN2A 1L26A 2B6ZA 1QTZA 141LA 1L93A 3NYAA 238LA 1CV6A 189LA 1LYHA 138LA 1G1VA 1L81A 2O7AA 2RBOA 3HT9A 1P64A 1G0KA 209LA 3GUOA 1L05A 1L49A 163LA 169LA 1L33A 3OE9A 4W54A 3SB9A 1L36A 4PK0A 1L02A 3V2WA 1LYIA 1CV1A 127LA 4OO9A 1C66A 240LA 1CUQA 1SX7A 2RH1A 4ARLA 1OVHA 4DAJA 197LA 4EKQA 157LA 1P46A 156LA 3OE0A 182LA 1L85A 253LA 1LI6A 1SWZA 262LA 4W59A 1PQIA 1QT7A 2OU0X 195LA 1L99A 1L63A 214LA 3LZMA 1C6EA 1T6HA 2OTZX 130LA 217LA 3DMVA 186LA 4W56A 259LA 1QTDA 1DYCA 174LA 1L40A 2OE4X 227LA 1L75A 1PQKA 1C64A 1DYDA 1QT4A 4ARJA 3C81A 1L91A 1D3MA 2IGCA 1C6QA 2NTHA 1L28A 1C6BA 244LA 1L32A 3D4SA 3F8VA 3DN1A 4GBRB 2B70A 1G0QA 254LA 4AQNA 261LA 3HH4A 1L97A 1L44A 1LYFA 1CU3A 6LZMA 228LA 4YXAC 1LW9A 1QT5A 2F32A 257LA 1KW7A 4LZMA 4EKPA 4ARPA 3HTDA 3C8SA 4PJZA 1P36A 1C6FA 1EPYA 1OWZA 1L61A 164LA 1P7SA 3HH6A 3L2XA 1CU0A 1QT8A 1L39A 2B7XA 1LGXA 2QB0B 1LGWA 1L09A 213LA 1L21A 1QTCA 1L37A 1C6AA 1C6HA 1JQUA 4ARQA 1L82A 2RBQA 3C7ZA 1P6YA 1C61A 1D3NA 3C8RA 103LA 2HUKA 1C65A 1L13A 126LA 1L84A 1OWYA 3DMXA 140LA 2B73A 2Q9DA 4I7RA 1T97A 2RB2X 3DNAA 245LA 3V2YA 1P56A 3DN6A 187LA 1B6IA 1LI2A 1QTBA 1ZURA 167LA 3HUQA 131LA 2F2QA 1PQJA 2B6YA 3GUKA 1TLAA 3DN8A 1L57A 150LA 4I7TA 1L11A 1C6NA 2B74A 1LI3A 2OTYX 4ARMB 2RAZX 2NTGA 146LA 1ZWNA 2OU8A 222LA 1NHBA 104LA 1L51A 1D2YA 1C6LA 1CX6A 1L54A 1L0JA 4YXCA 1OV5A 1C6IA 4EXMA 1L90A 5I14A 1L27A 1KY0A 3SB5A 3GUPA 1XEPA 110LA 1L30A 168LA 2A4TA 137LA 1C6DA 1CX7A 5LZMA 1L43A 112LA 2L78A 1DYGA 120LA 4EJ4A 142LA 1LLHA 2RBPA 260LA 3HH3A 1L14A 1L22A 2RBRA 3GUMA 248LA 1QTVA 3GULA 176LA 1LYGA 1ZYTA 1C6GA 4GRVA 3HUAA 1L16A 159LA 4I7QA 1G0JA 1DYFA 242LA 1DYAA 1QTHA 4S0WA 3HT6A 3C8QA 4W55A 1L67A 1D9WA 114LA 247LA 4I7SA 1G0PA 210LA 1L74A 3HH5A 107LA 1L15A 212LA 3G3VA 219LA 1L00A 4I7PA 1CU6A 161LA 1L0KA 1KNIA 175LA 102LA 235LA 3CDTA 3C82A 1L66A 1QS9A 2OEAX 1L08A 4ARMA 1QUHA 1K28A 1LPYA 4IAPA 3DN0A 165LA 3C80A 108LA 170LA 160LA 185LA 1L12A 1L20A 2B6WA 1QSBA 1PQOA 1L58A 1L31A 2RB0X 3G3WA 4ZPUA 1L47A 4EPFA 1L79A 180LA 251LA 3HUKA 1L94A 1CV5A 1L25A 1OVJA 1C67A 4I7KA 1L17A 2LCBA 184LA 3F9LA 123LA 3G3XA 220LA 1L53A 1L92A 231LA 3HT8A 1JTMA 3OE6A 3ODUA 2Q9EA 4I7MA 1I6SA 3HTGA 1L86A 171LA 143LA 3C7WA 1CU2A 2OE7X 113LA 1L62A 4I7OA 230LA 3VW7A 2B75A 128LA 173LA 1D3JA 1L46A 1SX2A 229LA 191LA 226LA 1G0GA 2B72A 4EKRA 1C6CA 1KY1A 1QUGA 246LA 255LA 1CV0A 1C69A 1L10A 1L45A 1L96A 149LA 4W58A 1OVKA 2O79A 1T8AA 3C83A 1CTWA 2OE9X 3EMLA 1DYBA 1L18A 241LA 3FI5A 3HU8A 3HDEA 1L71A 3GUNA 4K5YA 234LA 1KW5A 1L56A 1L07A 236LA 1L52A 233LA 1L19A 3DN4A 3HWLA 3DN3A 4YX7C 147LA 215LA 1L88A 3SBBC 122LA 1CUPA 211LA 1P37A 221LA 1QS5A 1L06A 3NY9A 1L24A 205LA 139LA 3SB6A 2RBSA 1L60A 1OV7A 239LA 3SB8A 3OE8A 7LZMA 1LYDA 1L50A 1C6TA 1L89A 2B6XA 4EKSA 199LA 2RBNA 118LA 1LYJA 1L64A 206LA 1L35A 3DMZA 3L64A 1L41A 4W51A 1SWYA 151LA 190LA 1L38A 3HTBA 3SBAA 1PQDA 1QT6A 3K2RA 1P2RA 125LA 1L65A 162LA 2CUUA 1JTNA 1L77A 148LE 1C63A 243LA 1G06A 1L95A 1C6KA 1L48A 1OYUA 1L83A 1G0LA 152LA 1G1WA 1C68A 3HDFA 4E97A 2LC9A 1L42A 1QSQA 1LGUA 1G0MA 2RAYX 145LA 4LDLA 2B6TA 111LA 181LA 3C7YA 1C6JA 1L76A 2O4WA 1L68A 3GUJA 4DKLA 198LA 1CV4A 172LA 2LZMA 1D2WA 4ARQB 225LA 3DKEX 4LDEA 216LA 1L01A 2Z6BA 1CVKA 2QARC 1L72A 178LA 2OU9A 129LA 3FADA 3RZEA 3SB7A 1T8FA 192LA 1WTHA 2HUMA 3JR6A 1C62A 1XJTA 4W53A 3CDVA 4W57A 1L80A 3CDOA 3SN6R 224LA 177LA 1DYEA 1L73A 1L69A 3FA0A 1QT3A 166LA 249LA 3CDQA 1L59A 3RUNA 1L04A 3HU9A 1QUOA 2HULA 4I7LA 218LA 3GUIA 256LA 155LA 232LA 188LA 2RB1X 1KS3A 4LDOA 200LA 4I7NA 1L55A 252LA 2F47A 1PQMA 3HT7A 1L23A 3CDRA 109LA 3UONA 1P3NA 119LA 1L98A 2ANXA 144LA 1LYEA 1L70A 1P5CA 1T8GA 237LA 1L34A 1C60A 3PDSA 1L03A 4W52A 2ANVA 3QAKA 1CV3A 1C6PA 1LWKA 1SSYA 201LA 258LA 1XJUA 196LA 115LA 1SSWA 1L87A 4EPIA 3NY8A 183LA 1L29A 1LWGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6MA 1LHJA 4CFOA 4M4OA 4I7JA 1CU5A 1VAUA 2F2NA 1WQPA 3PBLA 2ZQ4A 1P2LA 1JTPL 5B1FA 2B6ZA 1QTZA 3A96A 1IORA 3NYAA 4R0FA 2ZNWY 2LHMA 189LA 1L81A 2RBOA 1JPOA 3LYZA 163LA 3TMXA 1QTEA 3SB9A 1E8LA 1YANA 1CV1A 4OO9A 1CUQA 1W6ZA 1LYOA 1UIHA 4G4BA 197LA 1LHHA 1L85A 1I1ZA 2D4IA 2OU0X 3WH1A 3LZMA 1D9UA 1T6HA 4D9ZA 3CT1A 2OTZX 4BAPA 3DMVA 2Z19A 1QTDA 2C8OA 174LA 1L40A 1PQKA 2D6BA 1C64A 1IVMA 3QE8A 5LA8A 1L91A 1D3MA 1RE2A 5LA5A 4OOTA 4EMNA 4NWEA 5M1YA 4GBRB 1D6QA 261LA 1V7SA 4LT1A 1L97A 2BQOA 1LYFA 4IJ4A 2CJLA 4LZMA 5I4YA 1UICA 1D0KA 3HTDA 1GE4A 1P36A 2BQCA 4G4CA 164LA 4N5RA 4DD3A 3L2XA 1QT8A 2BQEA 4TTDA 5KXYA 4WO9A 1B5YA 2H9JA 4DD2A 1KXWA 1HF4A 2Y8PA 1LKRA 2F4GA 1IC7Y 1GF3A 1GBZA 1NBZC 1HFYA 3A34A 3TXFA 1HEMA 5APCA 9LYZA 1B5UA 3V2YA 1B6IA 5KXMA 2DQJY 4ETEA 1PQJA 2B6YA 4A7DA 1AZFA 2B74A 1UUZC 2BQLA 2NTGA 1B5ZA 3A8ZA 222LA 1B2KA 1B7RA 8LYZA 1L0JA 5LVHA 1GBSA 4WM6A 4B4EA 4WLDA 4U3XB 1L27A 4KT3A 3SB5A 1ZV5L 3GUPA 1XEPA 1L30A 168LA 137LA 5KXWA 1CX7A 1QQYA 112LA 4H94A 1IOSA 4ZEEA 260LA 5B07A 4XJGA 1HEQA 248LA 5KXNA 1QUTA 1GE3A 3GULA 1LYGA 4GRVA 4WL7A 1OUFA 2BAAA 1IEEA 1G0JA 1DYFA 1J1XY 5C6IA 4ZIXA 3ZEKA 3SP3A 4XN6A 2ZIKA 2G4QA 5C6LA 219LA 4I7PA 4NIJA 3QNGA 175LA 3CDTA 3C82A 3AJNA 1HC0A 1LJHA 1YQVY 1GB8A 1GFTA 1BWJA 2RSCA 4WM2A 4HJYA 185LA 1LSAA 4LT0A 1QSBA 1L58A 1LJFA 1L31A 4NG8A 2NWDX 1RCMA 4NHPA 3HUKA 1CV5A 1GB6A 1HERA 3HT8A 193LA 3ODUA 2Q9EA 1JJ0A 1YKXX 4KPMA 1LHIA 4GCFA 3C7WA 2OE7X 1L62A 230LA 2B75A 3QY4A 4QEQA 229LA 1TEWA 1QUGA 255LA 2D4KA 1C69A 2YBHA 5APDA 3C83A 1LZBA 1YAPA 4M6DA 241LA 1GFHA 3LYMA 1CKDA 3GUNA 4K5YA 4UWUA 4RLNA 233LA 3M3UA 1EQEA 4N1CC 3TMUA 1B7QA 4YX7C 215LA 2WARA 211LA 1KIPC 1P37A 1EQ4A 1GB9A 3IJVA 1L24A 3SB6A 2DQHY 5LVKA 239LA 5E4PA 3OE8A 1SQ2L 3G3BB 1LJNA 1C6TA 4N9RA 1YKYX 1TAYA 1LTMA 1JKBA 4WLTA 5APEA 1AKIA 206LA 4HV1A 1L35A 151LA 2BQNA 1GF8A 1P2RA 4XJBA 1JTNA 148LE 1C63A 4R6CA 1L48A 1CJ8A 2W1YA 3AGGG 1G7MC 1L83A 1OYUA 5FSTA 5B59A 1GFAA 4E97A 2LC9A 1L42A 4ETBA 1BGIA 1QSQA 1G0MA 1FKQA 2B6TA 181LA 3ZVQB 4RDSA 1LZDA 3WU7A 2Z39A 4BADA 2LZ2A 172LA 3WU8A 3A67Y 1LZNA 3DKEX 4LDEA 3T6UA 1XSFA 4H9FA 1YKZX 1LZ1A 1OUDA 3SB7A 1T8FA 1C08C 5FELA 3RW8A 1NDMC 2LYMA 4W57A 2GV0A 3CDOA 134LA 3SN6R 177LA 1DYEA 5F9XA 3FA0A 3CDQA 1L59A 1L04A 4UWVA 2BQFA 4YM8A 1CJ9A 1NQIA 4WL6A 1FLWA 232LA 1JJ1A 200LA 4NGZA 4ET9A 3HT7A 1PQMA 4YEOA 4PJ2C 1OUHA 2ZYPA 1L98A 2FYDA 3CSRA 3CT5A 1L03A 5HMJA 2MEFA 3QAKA 1LWKA 258LA 201LA 2H5ZA 1QUSA 2MEAA 1SSWA 4LFPA 2BQMA 1GBOA 3BKVA 4H90A 1GEVA 3LYOA 3J4GA 158LA 3HTFA 1QSWA 1QUDA 2HECA 1C46A 1GFRA 4RW1A 4NGIA 1F6SA 1GF5A 1G7JC 4H8YA 3E3DA 1WVVA 1GE0A 1IWTA 1CV6A 1HEOA 2DQDY 1G1VA 2O7AA 2YBNA 209LA 1B7MA 3A93A 1UIBA 1LSNA 169LA 1OQMA 1IIZA 1Z55A 1B5VA 1HEWA 2BLXA 4W54A 1L36A 3AW7A 1L02A 1LYIA 2W1LA 1KIQC 4B0DA 1C66A 240LA 4H91A 1SX7A 1P2CC 4ARLA 4G9SA 157LA 3W3EA 5F9UA 156LA 3OE0A 182LA 4DDAA 262LA 4W59A 195LA 1C6EA 4OWHA 217LA 4NSJA 4W56A 259LA 2XTHA 4DD0A 5F81A 1IP3A 1AM7A 1QT4A 3C81A 1C6QA 2NTHA 1L28A 3RZ4A 244LA 5LVIA 2IHLA 1G0QA 4AQNA 3HH4A 4H93A 3TXKA 1L44A 3A6BY 1CU3A 1H6MA 7LYZA 228LA 154LA 4YXAC 1BHZA 1HHLA 5KJ9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1C6M A;  1LHJ A;  4CFO A;  4M4O A;  4I7J A;  1CU5 A;  1VAU A;  2F2N A;  1WQP A;  3PBL A;  2ZQ4 A;  1P2L A;  1JTP L;  5B1F A;  2B6Z A;  1QTZ A;  3A96 A;  1IOR A;  3NYA A;  4R0F A;  2ZNW Y;  2LHM A;  189L A;  1L81 A;  2RBO A;  1JPO A;  3LYZ A;  163L A;  3TMX A;  1QTE A;  3SB9 A;  1E8L A;  1YAN A;  1CV1 A;  4OO9 A;  1CUQ A;  1W6Z A;  1LYO A;  1UIH A;  4G4B A;  197L A;  1LHH A;  1L85 A;  1I1Z A;  2D4I A;  2OU0 X;  3WH1 A;  3LZM A;  1D9U A;  1T6H A;  4D9Z A;  3CT1 A;  2OTZ X;  4BAP A;  3DMV A;  2Z19 A;  1QTD A;  2C8O A;  174L A;  1L40 A;  1PQK A;  2D6B A;  1C64 A;  1IVM A;  3QE8 A;  5LA8 A;  1L91 A;  1D3M A;  1RE2 A;  5LA5 A;  4OOT A;  4EMN A;  4NWE A;  5M1Y A;  4GBR B;  1D6Q A;  261L A;  1V7S A;  4LT1 A;  1L97 A;  2BQO A;  1LYF A;  4IJ4 A;  2CJL A;  4LZM A;  5I4Y A;  1UIC A;  1D0K A;  3HTD A;  1GE4 A;  1P36 A;  2BQC A;  4G4C A;  164L A;  4N5R A;  4DD3 A;  3L2X A;  1QT8 A;  2BQE A;  4TTD A;  5KXY A;  4WO9 A;  1B5Y A;  2H9J A;  4DD2 A;  1KXW A;  1HF4 A;  2Y8P A;  1LKR A;  2F4G A;  1IC7 Y;  1GF3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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