1L10A

Structural studies of mutants of the lysozyme of bacteriophage t4. the temperature-sensitive mutant protein thr157 (right arrow) ile
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGIWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of mutants of the lysozyme of bacteriophage T4. The temperature-sensitive mutant protein Thr157----Ile.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1988-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l10A00
4S0WA 216LA 1L50A 3C7ZA 1L06A 1LYHA 3CDRA 163LA 1LGXA 4GRVA 1L62A 1L04A 168LA 2B6ZA 210LA 1C67A 4DKLA 1L23A 1L39A 212LA 1T97A 3FI5A 2QARC 111LA 3DN8A 3C81A 3GUKA 192LA 1L0KA 1QTDA 3C83A 1NHBA 242LA 1OVHA 1SWYA 3NY9A 1L85A 1TLAA 255LA 3SBAA 4ARQB 1L18A 1LI2A 227LA 4PJZA 3SB8A 115LA 239LA 1P6YA 3CDTA 3V2WA 1CV0A 3JR6A 4EXMA 164LA 1L21A 1DYCA 1PQOA 3HDEA 4I7TA 1DYDA 4DJHA 1LYGA 1L07A 1CU3A 2B6YA 4LDEA 1C6LA 1LWGA 1I6SA 1L47A 4I7PA 249LA 1L29A 185LA 1T8GA 173LA 2LCBA 1L72A 177LA 1C60A 1SX7A 1SX2A 1C6IA 222LA 1K28A 2B73A 2HUKA 1G0LA 3PBLA 1XJUA 4I7JA 235LA 1JTNA 172LA 3QAKA 190LA 1KW5A 2OE7X 4PK0A 4ARJA 1LYDA 1CU5A 1L10A 3NY8A 1C6CA 1L53A 2B6WA 3DMZA 130LA 1P56A 1C6EA 3C8SA 3NYAA 3DN1A 4LDOA 1L49A 1XJTA 1L32A 2B72A 169LA 4I7LA 4EKRA 1L82A 3SB5A 1P64A 1OV5A 4EPFA 1G0QA 1C6BA 1CX7A 197LA 158LA 247LA 4LZMA 1PQKA 1DYFA 218LA 1G0MA 2B6XA 3SB7A 4ARMA 1L33A 3DN4A 213LA 152LA 1QT7A 4I7RA 1LI6A 155LA 180LA 3VW7A 1CV1A 1D3JA 4YX7C 1QS9A 3FADA 250LA 1LW9A 4I7QA 157LA 144LA 1C6TA 186LA 4ARLA 3HTGA 1C66A 3HUQA 1L44A 1QT6A 3SB6A 3HH4A 1L20A 1QUDA 3GUNA 259LA 1L67A 3HU9A 228LA 3HTBA 3ODUA 1LYJA 123LA 2RBOA 3DKEX 1QT5A 1L15A 3D4SA 1L71A 1L13A 126LA 1L91A 1QUOA 1L86A 1C6MA 1L74A 1L77A 1L81A 3HUKA 3HWLA 2OTZX 1CV6A 183LA 196LA 1LGUA 2B75A 1L61A 1L84A 2OU8A 3C82A 1C65A 1QT8A 1L48A 166LA 3HH6A 4W56A 1C6AA 241LA 1SWZA 150LA 1L70A 1JTMA 138LA 214LA 1L01A 1L35A 148LE 1QUHA 260LA 2OE4X 2RBSA 4W57A 2F32A 1ZURA 1OYUA 262LA 161LA 3PDSA 1T8FA 3DNAA 1L88A 243LA 3F9LA 1QS5A 1L42A 200LA 1LLHA 1PQMA 175LA 160LA 4ZPUA 1QTZA 3HH5A 4W59A 1KY1A 3GUPA 189LA 3HT9A 1CTWA 201LA 2NTGA 3RZEA 4EPIA 223LA 195LA 3HUAA 1L26A 3HU8A 1G0PA 1T8AA 2B74A 4OO9A 1L12A 1C63A 1L73A 1L69A 3EMLA 2CUUA 1OWYA 2HULA 1L75A 2RBRA 3SBBC 1C6PA 3G3XA 1L0JA 1XEPA 1OV7A 113LA 1L55A 2ANXA 1QTVA 219LA 1L22A 3DN6A 2NTHA 1L80A 3GUIA 182LA 122LA 112LA 1SSWA 209LA 4W53A 1C64A 3GUOA 131LA 215LA 6LZMA 1C6GA 1C6HA 1P46A 1C6DA 1L34A 137LA 1C68A 1G0KA 2B6TA 2O4WA 246LA 4ARMB 1LPYA 1L40A 3GUJA 2OE9X 119LA 3F8VA 1LYIA 1L37A 149LA 4EKSA 1L11A 170LA 1CUQA 254LA 1P5CA 2QB0B 1L92A 3HH3A 3OE0A 1L65A 1SSYA 1L76A 1L28A 261LA 3HT7A 237LA 2B70A 238LA 2OTYX 3CDVA 1G0GA 176LA 1PQIA 1L30A 3HT8A 125LA 221LA 1L68A 232LA 1L97A 1L36A 2A4TA 1L27A 142LA 1C62A 159LA 2RB2X 1D9WA 248LA 1C6KA 143LA 231LA 4I7NA 4W58A 1OVJA 226LA 1G1WA 1D3FA 1L96A 1L98A 256LA 4I7SA 1L09A 225LA 4EKQA 1L46A 1L95A 2LZMA 217LA 1QUGA 1JQUA 4LDLA 1WTHA 167LA 236LA 7LZMA 2ANVA 257LA 2Q9EA 198LA 103LA 1G1VA 171LA 1L31A 211LA 2RBQA 187LA 5LZMA 4E97A 2RH1A 1LYFA 1L51A 1EPYA 245LA 2OU9A 104LA 1P2RA 2Q9DA 1L03A 1L08A 2O7AA 206LA 2HUMA 139LA 230LA 3L2XA 1G0JA 1KS3A 4W52A 1C6NA 1L24A 140LA 1D3NA 107LA 1T6HA 2LC9A 1QT3A 3C8QA 1LGWA 1CX6A 3C7YA 2RAZX 3HT6A 4W51A 191LA 2B7XA 1L64A 3C80A 1P2LA 1L45A 120LA 3SB9A 110LA 145LA 251LA 114LA 1CU0A 1L00A 1QSQA 1ZWNA 1CU6A 2Z6BA 244LA 2OEAX 3GUMA 4I7OA 1CU2A 3HDFA 1QSBA 3CDOA 1LYEA 3SN6R 1QT4A 128LA 4ARQA 2F47A 1L38A 1L52A 3OE6A 253LA 1L58A 165LA 1P3NA 4W54A 2RAYX 1QTCA 252LA 1KNIA 3K2RA 1B6IA 1KY0A 1L59A 1L66A 220LA 1D3MA 240LA 1G06A 1L63A 1C6JA 1L25A 1P37A 3DN0A 1CV5A 1L43A 3DMVA 5I14A 1L56A 1CV4A 4IAPA 3DN2A 1LWKA 156LA 151LA 1L54A 2RBPA 3UONA 4EKPA 199LA 224LA 4EJ4A 1C61A 1L99A 1OVKA 2IGCA 4DAJA 1L14A 1OWZA 3GULA 233LA 2RBNA 1L93A 1KW7A 3C8RA 1DYAA 3OE8A 3CDQA 2O79A 3HTFA 4K5YA 188LA 1L89A 1L60A 1CVKA 3L64A 178LA 174LA 1G07A 146LA 1L79A 118LA 234LA 1C6FA 4I7KA 205LA 1C69A 1C6QA 1L19A 4YXCA 1L83A 1PQDA 109LA 1DYGA 1DYBA 1L57A 1D2YA 147LA 1L41A 1L02A 2RB0X 184LA 129LA 4W55A 3OE9A 3DN3A 4GBRB 4ARPA 1L17A 2L78A 1CV3A 3RUNA 1ZYTA 2F2QA 1PQJA 4I7MA 2OU0X 3HTDA 162LA 1L94A 1QTBA 4YXAC 1CUPA 1QTHA 3C7WA 181LA 102LA 1P36A 1P7SA 3FA0A 1L87A 229LA 2RB1X 3V2YA 1L90A 127LA 1D2WA 3DMXA 1L16A 4AQNA 1DYEA 3LZMA 108LA 1LI3A 141LA 258LA 3G3VA 1L05A 3G3WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HEAA 4S0WA 1DPXA 163LA 5F9XA 5II3A 4GRVA 4BAPA 5HQ1A 1GDWA 168LA 4C3WA 2B6ZA 3IJVA 3E3DA 1IOCA 1GFVA 1T97A 1L0KA 1YAPA 1QTDA 4NSGA 5B59A 4H8ZA 1NHBA 1OVHA 1IWTA 3NY9A 1IORA 4KT3A 255LA 3SBAA 4ARQB 1L18A 227LA 239LA 4KXIA 1LHLA 1VDPA 1DYCA 1PQOA 4B4EA 4OWBA 1JKCA 1LYGA 1L07A 1LZBA 1C6LA 1LHIA 2DQAA 1LWGA 1L29A 185LA 5FDJA 4DT3A 5C6JA 5KXSA 4I8SA 1K28A 1BWIA 1BGIA 1XJUA 1C43A 3QAKA 4PK0A 3WU9A 1C6CA 5DN4A 1L53A 2B6WA 3DMZA 1P56A 3DN1A 1GBWA 3P64A 3EMSA 1XGTC 1B5UA 1OUIA 4EPFA 1G0QA 2XJWA 1JTTL 1C6BA 1JKBA 158LA 1TCYA 4DDAA 1VDSA 247LA 1IWUA 1F0WA 1QUTA 1G0MA 1IP3A 2B6XA 3SB7A 1L33A 152LA 4I7RA 3VW7A 1YROA 1VEDA 1D3JA 4LZTA 3FADA 3LYZA 4XYYA 2YBHA 1JJ0A 1GB3A 2DQFC 5LVGA 3HTGA 3P66A 3B0KA 5LAFA 4BS7A 1QT6A 1B5VA 1L20A 3A96A 1EQ5A 2BQOA 2LYMA 1L67A 3HU9A 4WG7A 2C8OA 2RBOA 3DKEX 1B7RA 2HEFA 126LA 5KXMA 3HUKA 4HPIA 183LA 196LA 1LMCA 2MEIA 4Z98A 4NHIA 1HSXA 4FDYA 2B75A 5M1YA 1NHEA 1L84A 3C82A 1QSWA 3WW5A 2ZQ3A 241LA 138LA 214LA 4ETEA 260LA 2B5ZA 1GB6A 1W6ZA 4W57A 2F32A 4O34A 3D9AC 3DNAA 1D9UA 3F9LA 2W1YA 1LSNA 4HTKA 1L42A 1XSFA 1QTZA 1LSCA 1INUA 3HH5A 1WQOA 4WM2A 1J1XY 2ZYCA 4RW2A 3WL2A 201LA 3TXFA 1LJ4A 5B1FA 2HEDA 5FELA 4NHTA 1LYSA 1B0DA 4OO9A 1HEWA 1L12A 1C63A 1L73A 3EO5A 3EMLA 2LYZA 3T6UA 1B2KA 1KIRC 1H87A 1L0JA 1HC0A 1XEPA 2BLXA 2BQAA 4NY5A 1OUEA 1F6SA 4NEBA 219LA 1L80A 1W08A 5FSTA 122LA 1SSWA 209LA 1LSYA 1GB2A 2HUBA 1C6HA 1LJIA 1P46A 2O4WA 137LA 1G0KA 6LYZA 1YQVY 2MEAA 4RDSA 1LPYA 3GUJA 2OE9X 3F8VA 2C8PA 1LYIA 1L37A 1LZ5A 4HTNA 3CB7A 1CKGA 3D3DA 170LA 1P5CA 1L92A 4ET8A 3OE0A 4E3UA 261LA 2CJLA 3RU5A 2BQHA 1LMQA 4DDCA 1L68A 4DQ7A 232LA 1L97A 1L36A 8LYZA 1B7SA 2DQHY 159LA 1C6KA 4I7NA 2LZTA 226LA 1IEEA 1L98A 4QEQA 1L09A 2MEGA 1L46A 1ALCA 2LZMA 2F2NA 1QUGA 4NWEA 1QUSA 236LA 1WQNA 1BQLY 257LA 5KXZA 198LA 3AB6A 1WQPA 4IATA 1YIKA 3A8ZA 2RH1A 3CQLA 1EQ4A 1EPYA 245LA 4LT2A 4TSCA 1OP9B 1BHZA 4QY9A 1ZVHL 2ZILA 1LZAA 206LA 2HUMA 5KXRA 1B9OA 1D6PA 3L2XA 1G0JA 1RE2A 3A94A 4NHQA 4B1AA 2LC9A 2DQJY 3A6BY 3BKVA 3G3BB 1KIPC 4OWEA 5L3HA 3C7YA 191LA 1L64A 2XQOA 3W3EA 1P2LA 1L45A 120LA 110LA 145LA 251LA 114LA 1IR8A 1QSQA 1WQQA 1ZWNA 4DDBA 244LA 2OEAX 4I7OA 1CU2A 1LYEA 1UIBA 3SN6R 1QT4A 4GCFA 4ARQA 1L38A 1L52A 3OE6A 253LA 165LA 2RAYX 252LA 1KNIA 3K2RA 1B6IA 1KY0A 1L59A 154LA 4BADA 1GD6A 240LA 1L63A 1TBYA 208LA 3N9EA 2LZ2A 3A3QA 1P37A 5F14A 1L43A 156LA 1L54A 4NWHA 4DD1A 1C61A 3WYHA 4DAJA 4WLDA 1F6RA 1AKIA 233LA 2RBNA 1J1OY 1IWZA 4N1EI 4OWHA 4A7DA 1L60A 4I0CA 178LA 1IWVA 118LA 1C6FA 4DC4A 205LA 1C69A 1JITA 3ULRA 2BQBA 109LA 1DYGA 4H92A 4MCKA 147LA 1L02A 2D4JA 129LA 4YEMA 2Z38A 4J1BA 1L17A 2L78A 5C6LA 3LYMA 3P68A 1PQJA 2MEBA 4ZIXA 1GFKA 5APFA 162LA 4WMGA 4YXAC 2BQMA 2MEDA 1QTHA 3FE0A 4YEOA 1GHLA 2XTHA 102LA 5KXNA 1L90A 4Z3MA 3DMXA 1L16A 4GN4A 5LVKA 108LA 132LA 2BQLA 4N9RA 3T36A 1LJFA 4LYBA 4M4OA 5HNCA 1L06A 2EKSC 1GFTA 1L04A 2VB1A 1C67A 5A3ZA 1GFGA 2Z39A 1L39A 3DN8A 2DQEY 3C81A 1TAYA 4GN3A 3C83A 1GDXA 242LA 1SWYA 1LHKA 1TLAA 1YILA 1JSFA 2X0AA 3K3TA 1LI2A 4PJZA 3SB8A 115LA 7LYZA 1P6YA 3CDTA 3A6CY 4EXMA 4WLTA 2YBMA 3B0OA 4I7TA 3BKHA 2B6YA 4GCCA 1L47A 4I7PA 4C5FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HEA A;  4S0W A;  1DPX A;  163L A;  5F9X A;  5II3 A;  4GRV A;  4BAP A;  5HQ1 A;  1GDW A;  168L A;  4C3W A;  2B6Z A;  3IJV A;  3E3D A;  1IOC A;  1GFV A;  1T97 A;  1L0K A;  1YAP A;  1QTD A;  4NSG A;  5B59 A;  4H8Z A;  1NHB A;  1OVH A;  1IWT A;  3NY9 A;  1IOR A;  4KT3 A;  255L A;  3SBA A;  4ARQ B;  1L18 A;  227L A;  239L A;  4KXI A;  1LHL A;  1VDP A;  1DYC A;  1PQO A;  4B4E A;  4OWB A;  1JKC A;  1LYG A;  1L07 A;  1LZB A;  1C6L A;  1LHI A;  2DQA A;  1LWG A;  1L29 A;  185L A;  5FDJ A;  4DT3 A;  5C6J A;  5KXS A;  4I8S A;  1K28 A;  1BWI A;  1BGI A;  1XJU A;  1C43 A;  3QAK A;  4PK0 A;  3WU9 A;  1C6C A;  5DN4 A;  1L53 A;  2B6W A;  3DMZ A;  1P56 A;  3DN1 A;  1GBW A;  3P64 A;  3EMS A;  1XGT C;  1B5U A;  1OUI A;  4EPF A;  1G0Q A;  2XJW A;  1JTT L;  1C6B A;  1JKB A;  158L A;  1TCY A;  4DDA A;  1VDS A;  247L A;  1IWU A;  1F0W A;  1QUT A;  1G0M A;  1IP3 A;  2B6X A;  3SB7 A;  1L33 A;  152L A;  4I7R A;  3VW7 A;  1YRO A;  1VED A;  1D3J A;  4LZT A;  3FAD A;  3LYZ A;  4XYY A;  2YBH A;  1JJ0 A;  1GB3 A;  2DQF C; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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