1L14A

Contributions of hydrogen bonds of thr 157 to the thermodynamic stability of phage t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGSWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Contributions of hydrogen bonds of Thr 157 to the thermodynamic stability of phage T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1988-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l14A00
4ARLA 2B72A 4PK0A 3HWLA 240LA 1L11A 1D2YA 3NY9A 3C8RA 1P3NA 209LA 4GBRB 7LZMA 1DYFA 1LI2A 1KY1A 3SB5A 4EKQA 261LA 4I7TA 1CVKA 1C6HA 236LA 4EKPA 213LA 2RAZX 3C82A 125LA 1C66A 129LA 1L79A 1PQOA 148LE 222LA 237LA 1DYCA 3C8SA 1L40A 151LA 2HUMA 1L19A 1CX6A 1KNIA 1C6CA 1EPYA 1KY0A 1L34A 1L87A 3FADA 1C6IA 1LYIA 1L43A 1DYAA 4W57A 1L52A 108LA 2ANVA 3QAKA 249LA 1C6BA 2RB0X 2OTYX 262LA 138LA 1C6JA 190LA 1L22A 1LYJA 1DYBA 1LYGA 1L48A 3V2WA 1QS9A 235LA 4I7JA 256LA 3OE0A 1C62A 1L20A 142LA 254LA 1ZWNA 1L31A 4I7KA 1G0JA 3JR6A 1L63A 225LA 3VW7A 2RBQA 260LA 3DMZA 243LA 114LA 1PQKA 155LA 3HTDA 1DYGA 1L26A 223LA 1DYEA 1LI6A 1L29A 2B75A 3HUQA 1L36A 3CDTA 1LYEA 224LA 3EMLA 1CV5A 2RBPA 250LA 1G0MA 3UONA 1L06A 2RBRA 1L89A 4I7MA 1SSWA 1XEPA 3FI5A 4EJ4A 2Z6BA 4GRVA 197LA 1D3NA 4LDEA 3SBBC 1P6YA 2NTHA 1L07A 110LA 1QTHA 1T6HA 2RBOA 242LA 1L15A 3HU8A 3CDRA 241LA 252LA 251LA 1C6NA 1G1WA 1L13A 1P64A 1P56A 3G3VA 177LA 130LA 1QUGA 187LA 1C6GA 1P36A 3SB7A 1L59A 1C68A 1PQMA 2O79A 3HTBA 3CDOA 233LA 3C7YA 4LDLA 196LA 6LZMA 115LA 2B73A 1QS5A 3DN6A 1G0KA 3ODUA 3DMVA 1L66A 1CV3A 126LA 1L27A 123LA 1LI3A 1OVKA 198LA 1SX2A 1KS3A 3SB8A 1XJTA 3C80A 1C6EA 1L05A 1QTVA 1CU3A 165LA 3DN2A 1L71A 1L55A 4W54A 220LA 1L64A 1P7SA 145LA 2F47A 186LA 4E97A 3PDSA 159LA 1PQDA 4DAJA 239LA 216LA 4ZPUA 3SN6R 1QSQA 173LA 1C6MA 253LA 147LA 1SX7A 1CV6A 1CU6A 1TLAA 3C83A 1CU2A 1L65A 1L03A 4PJZA 1C67A 1L45A 1QUDA 140LA 180LA 1L99A 3GUPA 1L51A 2HUKA 3GUKA 1OWYA 2Q9DA 1C6QA 4I7QA 2OU0X 122LA 1G06A 1T8AA 2OEAX 3HH4A 2B6WA 246LA 1L37A 181LA 1C6AA 4ARMB 156LA 1P2RA 128LA 174LA 1L25A 2LZMA 4EPFA 1D3FA 3HTGA 4DJHA 149LA 2B7XA 4ARQB 1QTDA 1JTNA 3D4SA 259LA 1L28A 1L60A 5LZMA 3CDVA 1L72A 146LA 1QT6A 3DN3A 1L16A 200LA 214LA 1C6KA 1PQJA 3OE6A 3RUNA 1L67A 1L90A 3RZEA 1L00A 1L62A 1LYDA 215LA 1CV1A 2Q9EA 1KW5A 4W55A 164LA 104LA 178LA 1L21A 1L54A 1G0PA 3HT7A 4I7RA 1L35A 1P2LA 3SB6A 1L49A 2LCBA 3CDQA 1OV5A 157LA 1CU0A 1QT7A 175LA 3HT8A 3HT9A 1L57A 1L74A 4W58A 3C7WA 2IGCA 1L61A 1OVJA 3C8QA 206LA 166LA 1G0GA 4W53A 4YX7C 2RB2X 182LA 1L0KA 2RBSA 4I7NA 4IAPA 1L09A 3DN4A 1QUHA 2OE7X 1ZYTA 1K28A 109LA 1L81A 1SWYA 4I7LA 4W51A 1OV7A 3GUOA 2OU8A 1G0QA 4ARPA 150LA 229LA 1L50A 1L32A 1L53A 127LA 1L42A 3GUIA 1C64A 141LA 1D2WA 1CU5A 1SWZA 1L76A 1OVHA 4W59A 2RBNA 4S0WA 1L33A 3NY8A 4ARJA 1G1VA 1L24A 131LA 218LA 2RH1A 258LA 1I6SA 1T8GA 3L64A 112LA 226LA 245LA 2RAYX 192LA 2O7AA 4AQNA 2OU9A 171LA 1T97A 1L30A 169LA 1C61A 1L08A 4YXAC 2B6TA 1L12A 3GUNA 1QTZA 199LA 1CUQA 4I7PA 1L68A 1LPYA 1G07A 2B70A 161LA 1KW7A 4OO9A 1G0LA 3HTFA 2CUUA 1L17A 1L56A 107LA 232LA 1QSBA 3HH3A 3K2RA 257LA 4LZMA 4YXCA 1L88A 4W56A 1L93A 1DYDA 1QTBA 1L18A 1L02A 162LA 2QB0B 3HUAA 3HH6A 4EKSA 4I7SA 3F9LA 1L39A 170LA 1D3JA 3HU9A 1JTMA 3OE9A 3L2XA 1CV4A 163LA 2RB1X 211LA 1LLHA 103LA 119LA 2O4WA 3G3WA 1P46A 3OE8A 4ARMA 2F2QA 1LYFA 1LWGA 3DNAA 3DMXA 1L75A 3NYAA 191LA 1L86A 1P37A 1L41A 4ARQA 1L83A 1QUOA 1L97A 3DN1A 1JQUA 160LA 1L04A 231LA 1L47A 1C6DA 212LA 2HULA 205LA 172LA 4I7OA 3HH5A 255LA 247LA 248LA 2LC9A 1CV0A 168LA 118LA 1QT4A 4LDOA 1QT8A 4EKRA 188LA 2NTGA 2OE9X 143LA 234LA 3GUJA 139LA 158LA 1L69A 1D9WA 1ZURA 4K5YA 1L85A 1CX7A 1NHBA 1C60A 1QTCA 201LA 3C81A 238LA 176LA 167LA 1L23A 5I14A 1WTHA 4DKLA 3DN8A 1CTWA 1L91A 1L98A 1D3MA 1L44A 189LA 230LA 4EPIA 1L38A 3GULA 195LA 2QARC 228LA 1C6PA 1C6TA 3G3XA 1OWZA 1C63A 120LA 3DN0A 1XJUA 1QT3A 3GUMA 2A4TA 4W52A 2B6YA 3HUKA 1LGWA 3HDFA 244LA 2ANXA 4EXMA 221LA 3FA0A 3HT6A 1PQIA 1CUPA 144LA 1L0JA 184LA 2OE4X 113LA 210LA 3LZMA 152LA 1OYUA 1C69A 2B6ZA 1L10A 3V2YA 185LA 1T8FA 2OTZX 1L95A 1L77A 2B74A 111LA 2B6XA 102LA 1L14A 219LA 183LA 1L73A 1L96A 137LA 1L58A 1L82A 2L78A 227LA 1L46A 1C6LA 2F32A 1LGUA 1SSYA 1L92A 1P5CA 3DKEX 3HDEA 217LA 3C7ZA 1L01A 1C6FA 3SBAA 1L84A 1QT5A 3F8VA 1LGXA 3PBLA 1L80A 1B6IA 1LW9A 1L94A 1LWKA 1C65A 1L70A 1LYHA 3SB9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WVYA 4NIJA 1FKQA 4HJZA 1UBZA 2ZIKA 3WUAA 4WO6A 7LZMA 1O23A 4EKQA 2RAZX 1OUDA 1B9OA 4DD3A 1LMAA 1CX6A 4BADA 4DDCA 3FADA 1LYIA 1HNLA 1L43A 1JJ1A 2F30A 2W1YA 1NMMA 1DYAA 1CKCA 4H93A 2ANVA 249LA 4DQ5A 4R0FA 1L22A 1EL1A 3TXBA 1LYGA 1L48A 1C62A 1L31A 1PS5A 3JR6A 1JSFA 3K3TA 3DMZA 1BVXA 5FHWA 155LA 223LA 1NKHA 1L29A 2B75A 2BLXA 4DD1A 1IY4A 4ETEA 3HUQA 1LYEA 1LSZA 3EMLA 1G7LC 2Z39A 4ETDA 250LA 3LYZA 3N9EA 1LZSA 1JTTL 1XGQC 194LA 2RBRA 1BB3A 1I20A 1BB4A 5DN5A 3FI5A 3IJVA 197LA 3ZVQB 4LDEA 3SBBC 5APCA 2HU1A 1LJ4A 1ALCA 2NTHA 1QTHA 1T6HA 4MCKA 1C6NA 5IHGA 4J1AA 1YAPA 1QIOA 3MGWA 1HEQA 177LA 4GN4A 3WULA 3EO5A 1C6GA 2LZ2A 4H9EA 1L59A 2MEDA 2MECA 3AB6A 3C7YA 3WH1A 196LA 1V7SA 1HEOA 1L66A 1REXA 2A7FA 1J1XY 5IELA 4B4EA 1XEJA 3TXEA 3TMVA 1T6VL 1KS3A 1XJTA 1LHHA 3P68A 3C80A 1QTVA 3DN2A 1L71A 4DYGA 2F47A 5KXMA 1NWGA 4DAJA 239LA 2DQFC 4LYTA 1G7HC 4OOOA 2LYOA 1DI5A 1GB2A 3TXHA 1SX7A 2HEDA 1TLAA 5KKIA 2CGIA 4PJZA 4B49A 5KXNA 1C6QA 2OU0X 2BQEA 3P64A 1LZTA 1GF9A 2YBNA 5L3HA 246LA 1L37A 2BQOA 156LA 128LA 1B7OA 5DN4A 2LZMA 1OQMA 4DJHA 1JWRA 1D9UA 4ARQB 1B5XA 3B6LA 4H9BA 2EPEA 1L28A 1KIRC 5LZMA 3CDVA 1FN5A 1LSGA 4G4BA 4H8XA 4NHSA 214LA 1PQJA 1L90A 3RZEA 1L00A 2YVBA 1CV1A 2I6ZA 5LYMA 1KW5A 1XGTC 1FBIX 1WTNA 2H5ZA 3G3BB 2BQHA 1L21A 2EIZC 1IOQA 5HNCA 2LCBA 1AT6A 3TXDA 1DI4A 3P65A 157LA 2YBMA 4YEOA 5K7OA 1QT7A 175LA 3HT8A 4DT3A 3HT9A 1L57A 5C6IA 1IO5A 2XBSA 3C7WA 1GB0A 3C8QA 166LA 5F16A 1H87A 4YX7C 2RB2X 4GCBA 5FELA 3IWRA 182LA 5KY1A 1JJ3A 3ZVQA 1GBZA 4ANRA 2OE7X 4I7LA 1KXXA 4W51A 1LZ5A 4ZIXA 1UIBA 4ARPA 1RI8B 229LA 1IWVA 4B0DA 127LA 1L42A 1XEKA 2RBNA 1VATA 1G1VA 1WVUA 1GFUA 1L24A 131LA 218LA 1T3PA 2RH1A 3EMSA 3L64A 3RU5A 245LA 2RAYX 4PRUA 1GDWA 3BKHA 2O7AA 1XSFA 3WPKA 1L08A 1GWDA 3LYMA 1L68A 1GB9A 2Q0MX 1B7NA 1G0LA 3EBAB 1L56A 107LA 4RLNA 3TXFA 3K2RA 1IP3A 1B7RA 3W6BA 2MEEA 4G49A 1L88A 1TDYA 1N4FA 1DI3A 2QB0B 3HH6A 1D3JA 1C43A 2YBJA 4XENA 2RB1X 119LA 3SP3A 1YAQA 3OE8A 5KXZA 3W6CA 1LWGA 5APEA 3WMKA 3NYAA 191LA 1L86A 5APDA 1WQQA 1LSBA 3D9AC 4J1BA 3B0KA 4ARQA 1L83A 1GE4A 135LA 1L04A 1B2KA 4GN3A 1KXYA 205LA 1GDXA 3TXGA 248LA 168LA 1JKBA 118LA 1QT4A 188LA 1BVKC 234LA 3GUJA 3WU8A 1C7PA 3A96A 1C46A 3EXDA 4N1EI 1LZBA 1CX7A 4WM6A 2BQGA 1QTCA 201LA 2LYMA 2D91A 4BS7A 3A3QA 176LA 3CT0A 3D3DA 1L23A 4A7DA 5I14A 4N5RA 5C6JA 4LT2A 1L91A 1D3MA 4H9FA 1L44A 3GULA 1C45A 1YKZX 4MSTA 2HEFA 228LA 4NG8A 1VAUA 1LZNA 1BWHA 1XJUA 3RT5X 1QT3A 1DQJC 2B6YA 4TSBA 1LGWA 1DKJA 3B0IA 1BGIA 1CUPA 2OE4X 2CDSA 2PC2A 3LZMA 4J0LA 2W1XA 1OYUA 4WLDA 3TXIA 2BQIA 4HPEA 3V2YA 185LA 1WTMA 1L95A 4U3XB 219LA 4NEBA 1L96A 1L58A 1AZFA 227LA 1L46A 2ZYCA 4NGYA 1LJEA 1TEWA 3N9CA 3HDEA 1WVVA 4G9SA 1L84A 3QNGA 1UA6Y 3AZ4A 2YSSC 1LYHA 3SB9A 4NGWA 1GXV2 3A34A 4UWVA 4PK0A 240LA 1D2YA 4NGIA 209LA 1VEDA 4YF2A 1DYFA 1IOTA 3SB5A 261LA 1LJNA 1CVKA 4X3BA 4ETAA 236LA 2FBDA 4EKPA 4KT3A 4DD0A 125LA 1C66A 5HQ1A 1L79A 2MEIA 222LA 1CKDA 3C8SA 4B4JA 1L40A 1HEWA 2HUMA 2ZQ3A 1LJIA 1GPQC 1L34A 1L87A 1GF7A 3LN2A 6LYZA 3B72A 4LFXA 4WL6A 4TSCA 4W57A 1GF5A 4WM5A 3QAKA 1HFXA 1LSYA 2RB0X 2OTYX 4WO9A 4HV2A 1LYJA 235LA 4EOFA 1HSWA 4I7KA 3CSQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WVY A;  4NIJ A;  1FKQ A;  4HJZ A;  1UBZ A;  2ZIK A;  3WUA A;  4WO6 A;  7LZM A;  1O23 A;  4EKQ A;  2RAZ X;  1OUD A;  1B9O A;  4DD3 A;  1LMA A;  1CX6 A;  4BAD A;  4DDC A;  3FAD A;  1LYI A;  1HNL A;  1L43 A;  1JJ1 A;  2F30 A;  2W1Y A;  1NMM A;  1DYA A;  1CKC A;  4H93 A;  2ANV A;  249L A;  4DQ5 A;  4R0F A;  1L22 A;  1EL1 A;  3TXB A;  1LYG A;  1L48 A;  1C62 A;  1L31 A;  1PS5 A;  3JR6 A;  1JSF A;  3K3T A;  3DMZ A;  1BVX A;  5FHW A;  155L A;  223L A;  1NKH A;  1L29 A;  2B75 A;  2BLX A;  4DD1 A;  1IY4 A;  4ETE A;  3HUQ A;  1LYE A;  1LSZ A;  3EML A;  1G7L C;  2Z39 A;  4ETD A;  250L A;  3LYZ A;  3N9E A;  1LZS A;  1JTT L;  1XGQ C;  194L A;  2RBR A;  1BB3 A;  1I20 A;  1BB4 A;  5DN5 A;  3FI5 A;  3IJV A;  197L A;  3ZVQ B;  4LDE A;  3SBB C;  5APC A;  2HU1 A;  1LJ4 A;  1ALC A;  2NTH A;  1QTH A;  1T6H A;  4MCK A;  1C6N A;  5IHG A;  4J1A A;  1YAP A;  1QIO A;  3MGW A;  1HEQ A;  177L A;  4GN4 A;  3WUL A;  3EO5 A;  1C6G A;  2LZ2 A;  4H9E A;  1L59 A;  2MED A;  2MEC A;  3AB6 A;  3C7Y A;  3WH1 A;  196L A;  1V7S A; 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