1L16A

Structural analysis of the temperature-sensitive mutant of bacteriophage t4 lysozyme, glycine 156 (right arrow) aspartic acid
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTDTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the temperature-sensitive mutant of bacteriophage T4 lysozyme, glycine 156----aspartic acid.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1988-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l16A00
2LZMA 1LYJA 200LA 1D3NA 201LA 1XJTA 2OTYX 1JQUA 1L16A 1C6AA 1L90A 3GUJA 1D3MA 1L81A 1QT8A 1CTWA 1QSQA 128LA 3C7YA 3GUPA 2OE4X 1JTMA 4EKQA 1KNIA 129LA 4I7RA 187LA 1L48A 3RZEA 249LA 210LA 1G0MA 1OV7A 119LA 1L22A 4I7JA 1L65A 102LA 1L50A 1L41A 123LA 180LA 112LA 226LA 3C83A 1C6MA 3GUMA 143LA 1L93A 1CU2A 1L13A 1KY0A 3D4SA 1ZYTA 4W55A 1L69A 141LA 107LA 1C64A 2HUKA 3HH4A 4W59A 4AQNA 2Q9EA 234LA 1CV3A 1LWKA 1LYEA 2RAZX 1L08A 2B72A 3ODUA 1I6SA 1G0QA 3HU8A 1LYHA 3CDTA 1L57A 3C81A 233LA 2ANVA 1L19A 1L76A 1L56A 3OE8A 1T6HA 1L27A 1B6IA 1L89A 1CUQA 2NTHA 2RB2X 227LA 254LA 1CUPA 178LA 3OE6A 4DKLA 1L98A 1LW9A 146LA 1L37A 235LA 1L23A 1L61A 6LZMA 4YXCA 2B6TA 1C6DA 3RUNA 243LA 228LA 1L26A 1L47A 2ANXA 1L28A 3DNAA 1PQMA 190LA 1P6YA 3F8VA 1L12A 1C63A 122LA 1L73A 1L38A 1QT5A 3NY8A 126LA 4ARMB 4I7KA 4ARQA 1P5CA 111LA 3SN6R 1L02A 1OWYA 3CDVA 4I7PA 115LA 256LA 199LA 4ZPUA 4I7OA 1L17A 248LA 209LA 183LA 1L39A 1L54A 2RH1A 3HT8A 109LA 1PQKA 231LA 2RBQA 1C68A 157LA 173LA 213LA 239LA 3DKEX 1L55A 2OU9A 3HH3A 4GBRB 1C6HA 2OU8A 1L21A 1QS5A 211LA 4ARLA 2QB0B 3GULA 3HU9A 1LLHA 4I7LA 3PDSA 130LA 1P2LA 1L86A 3CDQA 3GUKA 1L44A 1L29A 1CU0A 2RB0X 1C6PA 151LA 3DMZA 175LA 3HH5A 4GRVA 219LA 170LA 1K28A 1C6QA 1L15A 185LA 1C66A 3EMLA 4W56A 3HTGA 156LA 232LA 217LA 1C62A 3DN4A 145LA 1KY1A 1L24A 1L33A 3OE0A 2Z6BA 1L11A 1L91A 1QTZA 1CU6A 3OE9A 250LA 196LA 2QARC 3L2XA 140LA 1QT7A 184LA 165LA 2CUUA 3LZMA 1OVKA 197LA 1DYEA 1L71A 127LA 138LA 1L46A 158LA 3UONA 1LPYA 1D9WA 1LI6A 3DN0A 1C6FA 1KS3A 2B70A 1L95A 2OE7X 103LA 4LDLA 3DN6A 1QTHA 3HT7A 1QTVA 3NYAA 1L79A 4EJ4A 1C67A 1P64A 1C6IA 216LA 1DYGA 3VW7A 1PQJA 163LA 237LA 1G06A 1L01A 1P46A 4W52A 4E97A 1SWZA 160LA 188LA 3SB7A 1L60A 1LYDA 155LA 7LZMA 152LA 4W53A 195LA 1C6TA 240LA 1L00A 4DAJA 1L18A 1L42A 3JR6A 3GUIA 1T8AA 259LA 245LA 3HTBA 4W58A 1L30A 3DN2A 3C8RA 1G0KA 1DYBA 3GUNA 1SWYA 4PK0A 1QSBA 1DYCA 1L36A 4PJZA 1CX6A 1QUOA 3V2WA 164LA 114LA 4I7QA 1CV6A 1L92A 241LA 1L88A 3GUOA 3G3WA 1PQOA 1L43A 1L31A 3K2RA 1CV4A 3HDEA 1L10A 1JTNA 1QT4A 253LA 3FI5A 246LA 215LA 1QTBA 1LWGA 1C6GA 262LA 3V2YA 1L32A 1C69A 176LA 1L58A 1D2YA 1KW5A 1L53A 1SX2A 2OTZX 1ZWNA 1LI2A 3C7ZA 221LA 3HUAA 1C6BA 3CDOA 144LA 1CV1A 1CV0A 1L94A 212LA 230LA 1SSWA 3C82A 238LA 125LA 1P37A 2RB1X 1L35A 1L82A 3SBBC 1L64A 1OYUA 3DN8A 4LZMA 1D2WA 4EXMA 2RBPA 3NY9A 1L20A 1L04A 1C6LA 1L87A 1ZURA 224LA 3F9LA 1G0JA 1L75A 1OWZA 4K5YA 1KW7A 1T97A 205LA 108LA 1QT6A 218LA 3CDRA 1L52A 149LA 4I7SA 3HT6A 247LA 2NTGA 1CU5A 4EPFA 244LA 1L0KA 1QTDA 4S0WA 1WTHA 4ARQB 1L05A 1L03A 1L97A 4OO9A 1L67A 1LGWA 3G3XA 2RBRA 2HULA 3HT9A 1SSYA 1L66A 257LA 1C61A 1L68A 4I7TA 182LA 222LA 1G0LA 4EPIA 1OV5A 168LA 3HUKA 4IAPA 1QUGA 113LA 255LA 4W54A 1C6KA 1XJUA 1PQIA 1C65A 1LGUA 242LA 171LA 2B6WA 4YX7C 1L70A 3HTDA 2IGCA 131LA 3SB6A 1D3JA 1QUDA 159LA 1L77A 1G1WA 4I7NA 1L14A 1L74A 3G3VA 1TLAA 1P7SA 3DN1A 4EKPA 260LA 2RBOA 4ARMA 1L59A 2LC9A 1OVHA 1EPYA 1L34A 3L64A 189LA 2B7XA 1L49A 1P3NA 137LA 1L09A 261LA 104LA 1LYIA 186LA 120LA 3DN3A 1L51A 1LYFA 1P56A 206LA 3DMXA 1LGXA 1L80A 1DYAA 169LA 2F2QA 2HUMA 3SBAA 181LA 252LA 2OU0X 2B75A 3SB9A 1L99A 2F32A 1CU3A 1G0PA 2B6YA 2B6ZA 1LI3A 1CVKA 4EKSA 1G0GA 2B74A 3HUQA 3HWLA 1G1VA 3HDFA 1P36A 229LA 3C8QA 1L96A 1QT3A 4EKRA 1L72A 223LA 1SX7A 3C8SA 166LA 191LA 1C6EA 5I14A 1C6JA 4W57A 1NHBA 147LA 174LA 1D3FA 251LA 139LA 148LE 3SB8A 4ARPA 3C7WA 2Q9DA 4YXAC 1C60A 2RBNA 1P2RA 236LA 1L63A 1LYGA 4W51A 2O4WA 4LDEA 1QUHA 1DYDA 3FADA 2O79A 214LA 4ARJA 142LA 1L0JA 2OEAX 1QTCA 1L06A 2OE9X 1C6CA 225LA 1L83A 1L85A 1XEPA 5LZMA 2F47A 162LA 161LA 4DJHA 110LA 3QAKA 1L25A 4LDOA 3SB5A 1DYFA 1QS9A 177LA 3C80A 3HH6A 1CV5A 2B6XA 2RAYX 1CX7A 1G07A 1L07A 2L78A 2RBSA 150LA 2B73A 2A4TA 3DMVA 1T8GA 3HTFA 118LA 2LCBA 3FA0A 1T8FA 172LA 1L84A 1C6NA 1L40A 2O7AA 167LA 1PQDA 1L45A 198LA 220LA 258LA 192LA 1OVJA 3PBLA 1L62A 4I7MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
200LA 2DBTA 1B5ZA 5E4PA 1VDQA 1L90A 1QSQA 1KNIA 129LA 3WW5A 1XGQC 249LA 4C5FA 1B7QA 1L65A 2PC2A 1CKGA 1L41A 180LA 3W6BA 5DN4A 1C6MA 143LA 1L93A 2A7FA 1OUHA 3ATOA 1CJ6A 1IWVA 2GV0A 2D91A 1C64A 3WUNA 4CHXA 4LYBA 4TTDA 3CQLA 5J7CA 1G7MC 4YENA 234LA 4R0FA 4WLXA 3TXHA 4WO6A 2CJLA 2BLXA 3ODUA 2W1XA 1FBIX 1VFBC 2ANVA 1BB6A 1L76A 1FKQA 1WTMA 1H87A 5LVJA 1VEDA 1L27A 3EO5A 1BGIA 4B4JA 1LW9A 1L37A 1O23A 235LA 3F6ZA 4YXCA 228LA 3WL2A 1LZ5A 4WG1A 1LZTA 1YQVY 2HU1A 2LYZA 4PPOA 1L73A 1QT5A 3NY8A 1TDYA 4NGZA 2AUBA 4I7KA 3TXFA 111LA 3TMWA 1P2CC 3CDVA 1VATA 4ML7A 4DQ7A 1MELL 256LA 4EOFA 4NIJA 2ZQ4A 1OUFA 1PQKA 231LA 2RBQA 1L55A 1JTPL 2OU9A 1OUBA 3W3EA 4MR1A 1OUDA 1LSDA 135LA 3HU9A 1GF3A 3CDQA 1LMQA 1LAAA 4OW1A 4NG1A 5KXXA 2XTHA 3HH5A 1LZ8A 219LA 2YBLA 4HPEA 1JISA 3EMLA 4W56A 3HTGA 5DL9A 217LA 1G7JC 3A95A 4Z41A 1GFUA 4DD1A 3T36A 3L2XA 140LA 184LA 2CUUA 4J0LA 1LZAA 1DYEA 5JENB 127LA 1JITA 2FBDA 1D9WA 1HEPA 3DN0A 1KS3A 2B70A 4ZEEA 1AM7A 2OE7X 4O34A 1YL1X 1FLQA 1P64A 216LA 1VDSA 3VW7A 1BB3A 3LZ2A 1L01A 4W52A 1SWZA 1XFPL 5KXLA 4N8ZA 4RW1A 4LYCA 4ZFPA 3ZVQA 1XGUC 1KXYA 1C6TA 4DAJA 3AGIA 3JR6A 5KXKA 3GUIA 1LZEA 1L30A 3DN2A 1G0KA 1IIZA 1SWYA 1QSBA 3ULRA 4PJZA 1CX6A 1BWIA 164LA 1WTNA 1XGTC 208LA 2DQHY 1T6VL 5LVGA 1L88A 1BB7A 3ATNA 4X3BA 1AT5A 1BQLY 1FKVA 4ETAA 1JJ3A 1QTBA 1LWGA 4HV2A 262LA 2HEDA 5KJ9A 3V2YA 4DDCA 1ZWNA 1YIKA 1HERA 1LHHA 1IP6A 1IP3A 1VAUA 144LA 3BKVA 3TMXA 5M1YA 1AT6A 4BS7A 1IOTA 2EPEA 4LZMA 1BB5A 5B05A 4ET9A 1B9OA 4GCCA 1CJ8A 1L04A 1C6LA 2LZTA 4DDBA 224LA 1L75A 1OWZA 1KW7A 4GN4A 1IWYA 4GN3A 4XJFA 205LA 4H9BA 218LA 4IATA 2YSSC 1REZA 244LA 3EBAB 1W08A 1C46A 1TEWA 1WTHA 2MECA 4ARQB 3G3XA 3WXUA 4NSGA 1NQIA 1JJ1A 1LJIA 1FLWA 5APFA 2FBBA 2MEIA 2DKVA 257LA 4EPIA 1G0LA 1OV5A 1QUGA 2XQOA 1C6KA 1C65A 3LYZA 3M18B 1REMA 2B6WA 3TXBA 3HTDA 3LYOA 1D3JA 1G1WA 4HPIA 3G3VA 1TLAA 3W6AA 260LA 4WM4A 1D0LA 1LYOA 2LC9A 4LGKA 189LA 2B7XA 4H9HA 1G7IC 5KKJA 1L09A 261LA 1IOSA 1UIGA 3WULA 1LYIA 120LA 1B7RA 4H91A 4HJYA 206LA 3DMXA 1DYAA 169LA 1GFKA 1QDRA 3CT5A 2B75A 1L99A 2F32A 1QUSA 3K3TA 5KXRA 4B49A 2B6ZA 5LA5A 3HUQA 4YF2A 1G1VA 1QT3A 1DQJC 1YKZX 1B7SA 223LA 5LIOA 1HFZA 2H5ZA 1SX7A 4GN5C 1GF7A 1JJ0A 2BQLA 2MEFA 1C6JA 1IOCA 4NGKA 4OOOA 4W96A 4YEMA 1OUCA 1YAOA 3CSQA 4LFXA 2D4IA 1LSPA 5KXOA 4ARPA 4XN6A 4QY9A 2Q9DA 1C60A 1LYGA 4W51A 4ETBA 1B5UA 3FADA 4MCKA 4ARJA 1L0JA 2OEAX 2OE9X 1C6CA 1GAZA 5LINA 1XEPA 1L85A 4H8XA 161LA 4G4HA 5F16A 1LSAA 3QAKA 1L25A 4H94A 5EBHA 2DQFC 1JEFA 5LVIA 1CV5A 1GFHA 2B6XA 1GFTA 1G07A 2L78A 150LA 1HEOA 1PS5A 3DMVA 1T8GA 2LCBA 153LA 1DI4A 3WMKA 1L40A 1GFEA 1PQDA 1L45A 3CB7A 4FJRA 220LA 3B0KA 192LA 1F0WA 4XJGA 1DPXA 4H8ZA 2IHLA 3MGWA 2D4KA 2N5ZA 1XJTA 4ET8A 1I56A 1IO5A 4LYOA 4GLAA 3WUAA 8LYZA 2OE4X 1JTMA 4WM3A 3CSZA 187LA 3RZEA 210LA 1B5XA 3G3BB 123LA 4AGAA 4TSCA 3RW8A 3GUMA 3SP3A 1GFRA 1YKYX 1CU2A 1L13A 1KY0A 3D4SA 1ZYTA 3LHMA 4W55A 141LA 3HH4A 5KXZA 3LN2A 1JTOL 4XJIA 5A3EA 1LWKA 2RAZX 1YL0X 5HMVA 1LYHA 3HBDA 1C45A 3A3RX 1L56A 3OE8A 4NHTA 1JSFA 1TCYA 5KKIA 1A4VA 2D6BA 1GB6A 5B1FA 2Z2FA 254LA 1CUPA 1ALCA 6LZMA 1IP4A 1PQMA 1XGPC 1GEVA 1BVKC 190LA 1C63A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 200L A;  2DBT A;  1B5Z A;  5E4P A;  1VDQ A;  1L90 A;  1QSQ A;  1KNI A;  129L A;  3WW5 A;  1XGQ C;  249L A;  4C5F A;  1B7Q A;  1L65 A;  2PC2 A;  1CKG A;  1L41 A;  180L A;  3W6B A;  5DN4 A;  1C6M A;  143L A;  1L93 A;  2A7F A;  1OUH A;  3ATO A;  1CJ6 A;  1IWV A;  2GV0 A;  2D91 A;  1C64 A;  3WUN A;  4CHX A;  4LYB A;  4TTD A;  3CQL A;  5J7C A;  1G7M C;  4YEN A;  234L A;  4R0F A;  4WLX A;  3TXH A;  4WO6 A;  2CJL A;  2BLX A;  3ODU A;  2W1X A;  1FBI X;  1VFB C;  2ANV A;  1BB6 A;  1L76 A;  1FKQ A;  1WTM A;  1H87 A;  5LVJ A;  1VED A;  1L27 A;  3EO5 A;  1BGI A;  4B4J A;  1LW9 A;  1L37 A;  1O23 A;  235L A;  3F6Z A;  4YXC A;  228L A;  3WL2 A;  1LZ5 A;  4WG1 A;  1LZT A;  1YQV Y;  2HU1 A;  2LYZ A;  4PPO A;  1L73 A;  1QT5 A;  3NY8 A;  1TDY A;  4NGZ A;  2AUB A;  4I7K A;  3TXF A;  111L A;  3TMW A;  1P2C C;  3CDV A;  1VAT A;  4ML7 A;  4DQ7 A;  1MEL L;  256L A;  4EOF A;  4NIJ A;  2ZQ4 A;  1OUF A;  1PQK A;  231L A;  2RBQ A;  1L55 A;  1JTP L;  2OU9 A;  1OUB A;  3W3E A;  4MR1 A;  1OUD A;  1LSD A;  135L A;  3HU9 A; 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