1L19A

Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l19A00
4I7RA 1OWZA 1L0KA 1D2YA 140LA 172LA 222LA 126LA 4EPIA 1L15A 3HUQA 2B70A 2QB0B 1L85A 1OVHA 120LA 1L69A 215LA 3NY9A 3RZEA 1C63A 4W51A 1LI2A 1LWGA 2Z6BA 4EXMA 192LA 2B6TA 1L97A 1QT3A 3DN4A 2B74A 200LA 4ARQB 221LA 155LA 4DJHA 180LA 2B6YA 4I7NA 169LA 4IAPA 1L17A 1C62A 1T8FA 3CDVA 1CV1A 138LA 3L64A 2B72A 1PQKA 1TLAA 2RH1A 1C60A 3HTGA 1L16A 1CVKA 4LDLA 4ARMB 4ARJA 2OE9X 3GUNA 1L27A 1KY0A 1CU6A 3DN0A 1L79A 4DAJA 1L36A 1L29A 1P5CA 211LA 2RBOA 1DYDA 2LZMA 260LA 3F9LA 1P56A 1L35A 2LCBA 1L38A 148LE 2OTZX 1LGWA 219LA 3SN6R 1D3FA 1L98A 1QSBA 1CUPA 1L54A 3CDTA 4EKRA 253LA 4W54A 183LA 1L39A 2Q9EA 3G3VA 1L71A 1LYJA 2O4WA 170LA 1OVKA 3SB9A 3ODUA 1L30A 3F8VA 1L73A 144LA 1DYFA 176LA 1P6YA 1L55A 1QTCA 1WTHA 2OU9A 3HH4A 1C64A 1G0PA 198LA 111LA 1L52A 1L96A 1P64A 1G06A 1L25A 1G1VA 3LZMA 1D3MA 164LA 1KY1A 4OO9A 3CDOA 1OVJA 142LA 2QARC 1QUHA 3FADA 156LA 1G0KA 1LYFA 1QT6A 190LA 3G3XA 104LA 1SSYA 3SB8A 4YX7C 231LA 1DYGA 1LYIA 255LA 4GBRB 1P7SA 1CV4A 3SB7A 3OE0A 238LA 3HT7A 4DKLA 2OU0X 3DMZA 1L64A 1XJTA 112LA 188LA 223LA 1SX2A 1LPYA 1G0GA 1L37A 1C6NA 1K28A 4LZMA 2HUMA 1CX7A 7LZMA 1JTMA 249LA 2O79A 1L21A 1L94A 3C8QA 3NY8A 6LZMA 167LA 3HT8A 230LA 1C6IA 119LA 1C66A 1C6HA 1G0LA 1T6HA 1L47A 3GUKA 1D9WA 201LA 232LA 4LDEA 1L63A 2RB0X 1JTNA 3VW7A 1L44A 257LA 3SBAA 1OYUA 1P46A 3OE8A 1C6JA 4I7LA 2RBRA 1L80A 1L65A 174LA 141LA 196LA 2B6WA 1T8AA 3C7YA 4PK0A 1L99A 3GUIA 4GRVA 1L28A 1L90A 5LZMA 2LC9A 1L07A 160LA 1L42A 1L45A 125LA 1SWZA 2ANVA 1PQDA 1P3NA 1L62A 1L11A 1L06A 1C6EA 1KW7A 228LA 3L2XA 1L67A 4E97A 262LA 3K2RA 3GUMA 3C8RA 109LA 1L12A 1PQJA 4W55A 247LA 1L66A 3C81A 246LA 212LA 1QT7A 210LA 2L78A 1SX7A 252LA 1C6AA 4K5YA 186LA 1PQMA 3OE6A 114LA 1QT4A 1L48A 1CU2A 128LA 130LA 165LA 1L53A 3PBLA 2OU8A 175LA 4I7OA 1QS5A 1L23A 1C69A 1L82A 3DN2A 1I6SA 1LYEA 149LA 2RAZX 217LA 2RAYX 4EKSA 1QUOA 2OE4X 1ZURA 1C6FA 2HULA 123LA 185LA 4LDOA 1LYGA 3C83A 243LA 1QTZA 3SBBC 3HTFA 122LA 131LA 129LA 236LA 3DKEX 3HDEA 1L10A 2NTHA 1L31A 1L09A 1L50A 1P2LA 227LA 1D2WA 2IGCA 1CV5A 250LA 1CV3A 166LA 1DYEA 1L72A 1QTBA 1QTVA 1L89A 1QTDA 235LA 4PJZA 1C6CA 1QT8A 152LA 1LGUA 1QT5A 242LA 1QSQA 191LA 1L83A 261LA 4W59A 2RBSA 4W58A 1CU0A 3HH5A 3HUAA 1L60A 1ZYTA 1C6MA 1DYAA 4YXCA 2B6ZA 4ARLA 1L84A 4I7SA 1L14A 1L41A 237LA 4ZPUA 1XEPA 3DN1A 145LA 3DMVA 256LA 2RBPA 197LA 1L20A 206LA 3D4SA 102LA 214LA 1L22A 2B6XA 1L76A 1LGXA 1CU3A 1DYCA 173LA 2F47A 4ARQA 1QS9A 3RUNA 1L56A 177LA 2NTGA 1D3JA 2ANXA 254LA 2Q9DA 2OE7X 118LA 1L74A 2HUKA 4ARPA 4ARMA 1L43A 1CUQA 3HUKA 5I14A 1L26A 1CU5A 1L13A 1L05A 3V2WA 224LA 3UONA 3OE9A 1L46A 147LA 1C6LA 4I7JA 1SSWA 1ZWNA 3GULA 1L19A 3C80A 251LA 1L68A 225LA 241LA 3HT9A 258LA 2RB2X 110LA 137LA 1C6GA 4W52A 1SWYA 248LA 1C6QA 220LA 4S0WA 103LA 2B7XA 3QAKA 1JQUA 2B73A 143LA 1LI3A 1CX6A 1L87A 1QTHA 3JR6A 1OWYA 127LA 1L86A 189LA 1C61A 1G0QA 1KNIA 259LA 4AQNA 139LA 216LA 240LA 113LA 1QUDA 3DMXA 209LA 3HDFA 4EKPA 1PQIA 3GUPA 1P36A 3C8SA 239LA 3SB5A 1L57A 171LA 187LA 1C67A 226LA 1L24A 1OV7A 218LA 4EPFA 1XJUA 1C65A 1DYBA 158LA 4I7QA 157LA 1L02A 3HU8A 2B75A 3HWLA 3HH6A 1OV5A 107LA 4EJ4A 1L75A 234LA 162LA 3GUOA 146LA 151LA 195LA 1LW9A 181LA 1L61A 1KW5A 4W53A 3HT6A 3DNAA 3GUJA 1L81A 1LI6A 3DN3A 1L92A 1L40A 1L00A 3HU9A 3C82A 1L77A 1T8GA 3G3WA 1LYHA 1L59A 1G0MA 1LLHA 4EKQA 1G1WA 1D3NA 4I7TA 108LA 182LA 1L18A 4W56A 1L49A 159LA 1L33A 3HH3A 1L51A 1L01A 3HTBA 184LA 1L95A 3SB6A 1L91A 4I7PA 2F32A 244LA 1L32A 1CV6A 1G0JA 2CUUA 233LA 3FI5A 1L0JA 163LA 4YXAC 2OEAX 178LA 3NYAA 150LA 2F2QA 168LA 3DN6A 1L88A 3FA0A 3DN8A 2RB1X 4W57A 1LWKA 1PQOA 1P2RA 4I7KA 245LA 115LA 1L70A 1KS3A 1L08A 1C6KA 1C6TA 1C6BA 3CDRA 2O7AA 3CDQA 2OTYX 1P37A 1LYDA 2RBNA 1CV0A 1G07A 3HTDA 1L58A 3EMLA 1L34A 1CTWA 213LA 1L93A 205LA 3PDSA 161LA 2RBQA 4I7MA 1EPYA 1L03A 1C6PA 3C7WA 1C68A 2A4TA 1B6IA 1L04A 1C6DA 1NHBA 3C7ZA 199LA 1T97A 229LA 3V2YA 1QUGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TUNA 4I7RA 1D0KA 2ZILA 5F16A 4LYZA 1L15A 4YEOA 2A7DA 2QB0B 3A96A 215LA 1UACY 1LHIA 3AGHA 1LI2A 1L97A 1IP2A 1WQRA 4WM3A 2B74A 3VWOA 4LZTA 1VDTA 4DJHA 4I7NA 3K3TA 1C62A 1Z55A 1GB5A 1GAYA 1CKDA 1TLAA 4XJHA 4ARMB 1BHZA 2OE9X 5KXLA 1IWVA 2MEDA 1ZV5L 1EQ5A 3GUNA 1L27A 1CU6A 3DN0A 1I1ZA 3HFMY 2ZQ4A 1IOQA 1L29A 3IWRA 1IP6A 5KXRA 1G7JC 1D0LA 2OTZX 219LA 3TXKA 1AKIA 1CUPA 1GPQC 3CDTA 4EKRA 253LA 4W54A 4H8ZA 4NGZA 5I5QA 4XJBA 3AZ6A 1L71A 4P2EA 1JITA 2O4WA 1HFZA 3SB9A 1LZCA 5II3A 4X3BA 1LHKA 176LA 1WTHA 4TWSA 1KIRC 3AW7A 1C64A 4TTDA 1G7IC 1L52A 1VEDA 1G1VA 1IOCA 2G4PA 1D3MA 3TXFA 1GFJA 3CDOA 2BQBA 2BLXA 1REZA 2QARC 1QT6A 7LYZA 1GBZA 1D9UA 1JIYA 1BWJA 1DYGA 6LYZA 4XJDA 3SB7A 3OE0A 4DD1A 3EO5A 1JTPL 1EQEA 1C43A 4WMGA 5D5FA 1XJTA 1MLCE 4NHIA 1JTMA 1L94A 5LVJA 3NY8A 5LINA 4N9RA 167LA 230LA 2VB1A 1C6IA 1T6HA 2HUBA 232LA 2G4QA 4LDEA 1JTNA 5L9JA 1L44A 3CT0A 1BB5A 2BQKA 2Z2EA 1LZBA 4I7LA 4ANRA 4NG1A 1L65A 4OWBA 4KPMA 2D4IA 5KJ9A 3GUIA 4GRVA 1L90A 5DLAA 1L07A 1L45A 1SWZA 2ANVA 1PQDA 1L11A 1YILA 3B0KA 3WULA 1CJ6A 3LHMA 5I4WA 2CJLA 1LYOA 109LA 4WLYA 3TXHA 3TXBA 212LA 2ZIKA 186LA 4NSGA 1GBSA 1I20A 1CU2A 1FKVA 1B5UA 1J1XY 1LKSA 1C69A 1L82A 3DN2A 2BQEA 1H6MA 1LZTA 1DXJA 3LYOA 1QUOA 4WOAA 1ZURA 4IATA 1LYGA 5KXXA 4XN6A 4HTNA 153LA 3SBBC 3HTFA 131LA 1AT5A 1VDPA 1GFEA 1DI3A 1L31A 1L09A 1GFVA 1J1OY 1P2LA 1D2WA 1CKFA 5HNCA 5FDJA 3WVYA 2HEAA 1IIZA 250LA 4CHXA 1DYEA 1L72A 1KXYA 235LA 1C6CA 191LA 4W59A 1N4FA 5KXZA 2FBDA 1UIBA 3TMVA 4WM5A 145LA 256LA 206LA 2ZWBA 2F2NA 4I8SA 3LN2A 214LA 2HECA 1GFUA 2BQLA 4DD9A 1CU3A 5FEKA 1C10A 5JENB 1FBIX 1QS9A 2NTGA 2ANXA 5A3ZA 2Q9DA 1L74A 3WMKA 2HUKA 4ARPA 1L43A 1CUQA 3HUKA 5I14A 3P65A 4EMNA 1L13A 3V2WA 4H8XA 2XBRA 2WARA 1C6LA 1RE2A 1CJ7A 1LSMA 1ZWNA 4NY5A 1JUGA 4GCCA 258LA 2RB2X 4KT3A 5I4YA 1SWYA 4S0WA 1C6QA 4QGZA 2ZYCA 1B5ZA 2B73A 2LYOA 143LA 1LI3A 1OUFA 3JR6A 2W1XA 4NWHA 1JKCA 2D6BA 5DM9A 1QUDA 5DL9A 6LYTA 4TSCA 4EKPA 2W1LA 3C8SA 5LIOA 239LA 4R0FA 1A4VA 1BB7A 1KIPC 187LA 1OV7A 1IP3A 4DWXA 4RW2A 1C65A 1JKBA 157LA 3HU8A 4ETBA 1B7SA 3RW8A 1LMNA 146LA 1LSEA 2DQIY 3HT6A 3DNAA 154LA 1UIAA 1TCYA 1IOSA 3CQLA 4J7VA 4XADA 3HU9A 1DI5A 3F6ZA 1L77A 4WLDA 1D3NA 4CFPA 4I7TA 1XEKA 182LA 1B7NA 1EL1A 1L33A 3HH3A 4YM8A 1QSAA 1XSFA 1L95A 2F32A 244LA 1DI4A 3TXEA 2CUUA 1LZGA 4YXAC 178LA 3WW6A 3CB7A 3WL2A 2F2QA 3RZ4A 3DN6A 1L88A 4Z98A 3DN8A 1V7SA 4H9EA 4W57A 3AW6A 1PQOA 3SP3A 1L08A 1LJGA 1WQOA 3D3DA 4RW1A 1C6BA 1WQNA 4HSFA 4NIJA 1LYDA 4AGAA 2EQLA 1L58A 3EMLA 205LA 3KAMA 1GXV2 1EPYA 1L03A 1VFBC 1C68A 1LZ1A 1B6IA 4CJ2A 1C6DA 1GFAA 1YAMA 199LA 1T97A 1QTKA 1GFGA 1MELL 4G9SA 1LZNA 1HSXA 1D2YA 4WL7A 4B4IA 1BWIA 1P2CC 4YENA 5APEA 1G7HC 1OVHA 1LWGA 1HFXA 1HELA 2N5ZA 192LA 1IY3A 3DN4A 4IASA 2EPEA 1GB9A 1NQIA 4ARQB 5KKJA 4B4JA 1PQKA 4J1BA 1CVKA 1GBOA 3WYHA 1KY0A 3GXKA 1YAPA 1H87A 2HTXA 1L79A 4DAJA 1IVMA 2LZMA 1OUJA 260LA 3F9LA 4OOOA 1LGWA 4Z41A 4DD7A 1WTNA 1LZ5A 1RI8B 4H94A 1JKDA 1L98A 2MEIA 4RDSA 1B5WA 1IWZA 1C46A 2Q9EA 1IOTA 1LYJA 1OVKA 3ODUA 1HEWA 1L30A 3F8VA 4G4BA 4BAPA 1P6YA 1B5VA 1QTCA 1JPOA 3ZEKA 9LYZA 1G0PA 1GHLA 4XYYA 4GLAA 1G06A 1L25A 4A7DA 1LJKA 1JTTL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4TUN A;  4I7R A;  1D0K A;  2ZIL A;  5F16 A;  4LYZ A;  1L15 A;  4YEO A;  2A7D A;  2QB0 B;  3A96 A;  215L A;  1UAC Y;  1LHI A;  3AGH A;  1LI2 A;  1L97 A;  1IP2 A;  1WQR A;  4WM3 A;  2B74 A;  3VWO A;  4LZT A;  1VDT A;  4DJH A;  4I7N A;  3K3T A;  1C62 A;  1Z55 A;  1GB5 A;  1GAY A;  1CKD A;  1TLA A;  4XJH A;  4ARM B;  1BHZ A;  2OE9 X;  5KXL A;  1IWV A;  2MED A;  1ZV5 L;  1EQ5 A;  3GUN A;  1L27 A;  1CU6 A;  3DN0 A;  1I1Z A;  3HFM Y;  2ZQ4 A;  1IOQ A;  1L29 A;  3IWR A;  1IP6 A;  5KXR A;  1G7J C;  1D0L A;  2OTZ X;  219L A;  3TXK A;  1AKI A;  1CUP A;  1GPQ C;  3CDT A;  4EKR A;  253L A;  4W54 A;  4H8Z A;  4NGZ A;  5I5Q A;  4XJB A;  3AZ6 A;  1L71 A;  4P2E A;  1JIT A;  2O4W A;  1HFZ A;  3SB9 A;  1LZC A;  5II3 A;  4X3B A;  1LHK A;  176L A;  1WTH A;  4TWS A;  1KIR C;  3AW7 A;  1C64 A;  4TTD A;  1G7I C;  1L52 A;  1VED A;  1G1V A;  1IOC A;  2G4P A;  1D3M A;  3TXF A;  1GFJ A;  3CDO A;  2BQB A;  2BLX A;  1REZ A;  2QAR C;  1QT6 A;  7LYZ A;  1GBZ A;  1D9U A;  1JIY A;  1BWJ A;  1DYG A;  6LYZ A;  4XJD A;  3SB7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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