1L19A

Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l19A00
1P64A 220LA 2B6TA 2F47A 1C67A 192LA 1L16A 1PQKA 3GUMA 3QAKA 3C81A 1OVHA 3HT9A 247LA 1LWKA 4ARJA 1L15A 159LA 1L29A 1L34A 1QSBA 3GUPA 1L14A 4YXAC 1L22A 1L82A 1G0JA 4I7JA 3SB9A 1L31A 3SBAA 4I7QA 1QT3A 3LZMA 3C8RA 1QS9A 3OE0A 1L43A 122LA 1L51A 1DYDA 3HDFA 216LA 3OE6A 242LA 2B6YA 1P46A 1L32A 1D3MA 1G0LA 4I7OA 4EPFA 1OVJA 214LA 158LA 3FADA 2QARC 231LA 3GUKA 1G1VA 258LA 172LA 2B7XA 4W58A 1L06A 1LPYA 3L64A 254LA 1P3NA 112LA 3CDTA 3SB6A 3GULA 1LI3A 185LA 161LA 1C6TA 1D9WA 3G3WA 218LA 2O79A 224LA 232LA 1QT5A 1CV0A 1I6SA 4YXCA 4LDLA 1L69A 1L03A 2OU0X 3CDVA 4ARMB 128LA 3ODUA 1C6BA 239LA 155LA 238LA 7LZMA 3F8VA 2O7AA 1L79A 4W57A 1L17A 3G3VA 4ARMA 1L53A 1OV7A 118LA 4DJHA 1CU0A 233LA 1T8AA 1QTHA 1C6JA 1QT7A 1T97A 2IGCA 1L58A 2B72A 1CU5A 3HWLA 4ARLA 1QTDA 1L56A 187LA 1ZURA 1L18A 3DN0A 1L39A 184LA 4IAPA 1EPYA 1C66A 1C65A 1G07A 1CX7A 2A4TA 1QTBA 1QT6A 3V2YA 1L99A 3C7YA 1G06A 1L76A 162LA 4K5YA 1LGXA 1L35A 1L37A 1L23A 178LA 1L0KA 196LA 227LA 215LA 3G3XA 240LA 1PQJA 234LA 129LA 3RUNA 1L57A 3JR6A 4I7MA 2B75A 1L60A 243LA 3OE8A 1L04A 142LA 3NY8A 1DYAA 1L92A 3K2RA 1B6IA 131LA 1KY1A 1D3JA 3DN8A 1XJUA 4ZPUA 1KW5A 3UONA 1C6NA 1DYGA 1L61A 4W55A 147LA 1L62A 107LA 2NTGA 1C6QA 1L26A 1G0KA 223LA 260LA 1CX6A 139LA 1L94A 2HULA 1LGUA 1LYHA 167LA 1T8GA 152LA 2B6ZA 3NY9A 211LA 3HU8A 171LA 246LA 1QT4A 4W53A 4EKSA 1LI2A 1QS5A 1CV1A 1L00A 257LA 2ANXA 169LA 1L27A 1L28A 168LA 3FI5A 1L65A 3HTGA 1CTWA 2F2QA 4I7RA 1SSWA 1L19A 4W56A 1L21A 2RH1A 165LA 1L80A 1L48A 182LA 3RZEA 1C6HA 111LA 3OE9A 198LA 3C8QA 1G0MA 1QTZA 1QUGA 110LA 1G0GA 1L49A 3DKEX 1JQUA 148LE 1CUQA 4I7SA 5I14A 1C61A 3HTBA 253LA 1WTHA 1C6DA 1CU6A 1D3NA 191LA 4LZMA 1C6LA 170LA 4I7LA 4OO9A 144LA 1L77A 209LA 1L24A 2LC9A 6LZMA 4E97A 1L33A 2RAYX 3HUQA 1L07A 3HT7A 252LA 230LA 109LA 1P5CA 104LA 2RBQA 125LA 1L20A 1NHBA 1G0QA 180LA 1L89A 2RB1X 3HUKA 213LA 1L36A 1L98A 1SWZA 1C6CA 2Q9DA 3DMVA 4I7PA 3C83A 2HUMA 1L83A 1XJTA 1L97A 2OE9X 115LA 3DN4A 2OU9A 1C6MA 1L41A 1L75A 259LA 120LA 3HH5A 1LYIA 130LA 3F9LA 151LA 2LCBA 210LA 4EXMA 1D2YA 229LA 4EKPA 221LA 1L74A 3VW7A 3C80A 1XEPA 183LA 1C6FA 2QB0B 1L64A 1LYJA 1L01A 1P2RA 222LA 1C6IA 137LA 1LI6A 4EJ4A 1OWZA 1L85A 2Q9EA 1CV3A 2HUKA 2B73A 241LA 249LA 1L87A 1LYGA 1P36A 140LA 126LA 1L05A 2RAZX 4EKRA 1L63A 4ARQB 150LA 1LWGA 138LA 1L91A 1C6KA 3HH3A 1OV5A 250LA 4LDEA 3DMXA 2B6XA 3C82A 1SWYA 1L72A 4ARQA 3HTFA 1QUHA 4GBRB 2OTZX 4I7NA 2B70A 3HUAA 3DNAA 2OEAX 2L78A 2O4WA 4PJZA 4EPIA 1L93A 2F32A 1L86A 3SN6R 1L66A 156LA 103LA 1P7SA 255LA 186LA 1L44A 3GUOA 1JTNA 1L46A 1T6HA 261LA 1OYUA 119LA 3C7ZA 1G1WA 1L90A 201LA 251LA 4ARPA 3HT6A 4I7KA 2OTYX 1C6PA 2OE4X 1L10A 1P56A 1LYDA 2B74A 164LA 1L0JA 1QT8A 4EKQA 1C63A 1PQMA 2RBRA 176LA 143LA 3SBBC 157LA 1L70A 248LA 166LA 1L73A 1LLHA 1C62A 3DN6A 1L50A 206LA 244LA 1PQOA 236LA 3V2WA 4W59A 1ZWNA 1L09A 141LA 189LA 1L68A 1LW9A 146LA 256LA 2RBPA 102LA 1DYEA 3GUIA 114LA 200LA 1L11A 1LYEA 3HH6A 4I7TA 1D3FA 1QUOA 127LA 3SB5A 228LA 174LA 4GRVA 2ANVA 1L71A 3C8SA 1L38A 1OWYA 1C6GA 1ZYTA 212LA 219LA 4PK0A 1L42A 1L40A 2RBSA 3HTDA 1SSYA 237LA 173LA 1PQIA 1L08A 177LA 188LA 1JTMA 1C64A 262LA 225LA 1QSQA 3FA0A 2Z6BA 175LA 1L02A 3DMZA 195LA 226LA 4DAJA 3D4SA 205LA 1D2WA 1KW7A 197LA 1KY0A 2OE7X 3HT8A 1SX2A 3GUJA 3SB7A 1CV5A 1SX7A 3HU9A 1OVKA 4DKLA 1CU2A 1QTVA 2NTHA 3PBLA 1L52A 3L2XA 2RB2X 1KNIA 1C6AA 4S0WA 149LA 1T8FA 3GUNA 2CUUA 4W51A 160LA 1P2LA 163LA 108LA 1DYCA 1C68A 2OU8A 3DN3A 1L30A 1DYBA 3CDQA 1L55A 1KS3A 1P6YA 3HDEA 1L25A 1TLAA 3HH4A 1C6EA 1CVKA 2RB0X 3NYAA 2LZMA 2RBNA 1L54A 1L59A 1PQDA 2B6WA 3CDRA 1L47A 1CUPA 3SB8A 1QTCA 3DN1A 4AQNA 123LA 199LA 4W52A 1C69A 181LA 1C60A 245LA 113LA 3PDSA 1CV4A 1P37A 1L13A 1L12A 5LZMA 3EMLA 1LYFA 235LA 3C7WA 4YX7C 1LGWA 1L95A 1L84A 1K28A 4W54A 1L45A 4LDOA 2RBOA 1QUDA 1G0PA 1CU3A 1DYFA 1CV6A 1L81A 1L96A 1L67A 3DN2A 1L88A 3CDOA 217LA 190LA 145LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
220LA 2X0AA 1D0MA 1GB9A 2HEAA 5KXTA 3C81A 1LZAA 4WM2A 1L15A 3GUPA 1L14A 3P68A 1IWXA 1KXWA 1IEEA 1IOTA 1LMCA 4BS7A 1JKDA 1GBSA 1QT3A 4O34A 5I4YA 3ATOA 1L43A 1L51A 1DYDA 3OE6A 2GV0A 1P46A 1D3MA 1G0LA 5LA5A 214LA 5LVJA 2QARC 3P65A 2YSSC 1QUSA 1IWTA 4GCEA 4DDAA 1LPYA 254LA 1P3NA 2LYMA 1W6ZA 3GULA 1LSFA 185LA 2EQLA 1XGTC 161LA 3G3WA 5DM9A 1WVVA 1LMTA 3FI7A 1QT5A 4PGJB 1BB7A 4YXCA 1L03A 3CDVA 1ZVHL 4H90A 4H9AA 4TSCA 2DQFC 3F8VA 4ZIXA 1C10A 1LMOA 118LA 1NQIA 3N9AA 3P64A 3ULRA 1QT7A 2IGCA 3HWLA 1IP1A 187LA 1LSGA 1L18A 184LA 4LT0A 1C66A 3G3BB 5L9JA 1LZYA 4LYCA 162LA 4K5YA 1B5WA 1L35A 1L37A 178LA 1LZ1A 129LA 2B75A 3J6KA 243LA 1MELL 3NY8A 1L92A 4ETDA 1GFEA 1B6IA 3EMSA 1LJIA 1D3JA 1LZCA 1W08A 1KW5A 1MLCE 5KXMA 1DYGA 1I56A 1C6QA 1G0KA 260LA 1CX6A 1LGUA 1JSFA 1LYOA 1LYHA 2Z2EA 1T8GA 1IC5Y 3IJUA 4H8ZA 2IHLA 4EKSA 1QT4A 1QDRA 1L00A 2DQEY 1GB6A 3WYHA 169LA 3HTGA 1L65A 2F2QA 4I7RA 1SSWA 5KXPA 1XGUC 4HPEA 4B4JA 1LSPA 1L21A 2RH1A 3M3UA 182LA 4KT3A 4BAPA 111LA 2Z12A 2LYZA 4I0CA 1QUGA 3DKEX 4NFVA 1CUQA 4TUNA 4GLVA 1GF6A 1C61A 1LSMA 2FYDA 1DQJC 1GFKA 4H8YA 191LA 4HTKA 1G7JC 5KXLA 170LA 4G4BA 1IO5A 1QSWA 2LC9A 1XFPL 4WM4A 4E97A 1L33A 3WW6A 2MEAA 5B59A 1DI5A 3CQLA 1JKAA 1LZDA 252LA 4HPIA 4ZFPA 5F14A 2BQCA 2RBQA 1C7PA 2W1MA 1NHBA 1J1PY 1L89A 1LHJA 2EPEA 3G3AB 1L98A 5IDDA 3LYOA 1LHKA 3C83A 2HUMA 1L83A 115LA 1GFUA 4MSTA 1LSBA 1OP9B 5KKJA 259LA 2H9JA 1LYIA 1JJ0A 1I1ZA 1D2YA 4EKPA 3VW7A 4DDBA 4B4EA 183LA 1LJ4A 1L64A 5HQ1A 4G4CA 4NGVA 3T6UA 222LA 5L3HA 1E8LA 4J1BA 4C3WA 3P66A 4I8SA 2Q9EA 249LA 4M4OA 1T6VL 5KXKA 4D9ZA 126LA 2RAZX 1L63A 3RU5A 138LA 1L91A 1C6KA 3HH3A 1B7LA 1L72A 3ZVQB 4PRQA 1RCMA 2B70A 2O4WA 1L86A 3SN6R 1L66A 4WLXA 3CT1A 156LA 103LA 4NG8A 255LA 3GUOA 1JTNA 4DD3A 4UWUA 4N8ZA 1OYUA 3C7ZA 1G1WA 1L90A 251LA 4ARPA 5KY1A 2OTYX 1C6PA 4DD2A 1RE2A 1GF4A 1LYDA 1YAOA 1JSEA 1GBXA 4ETBA 1C63A 4XYYA 1FKVA 5I4XA 1LLHA 3WPKA 2BQNA 1PQOA 2BQBA 4W59A 1H6MA 1DPXA 3EBAB 2RBPA 189LA 4NY5A 4HV1A 102LA 1G7IC 1AZFA 3TMWA 3HH6A 1LYEA 4I7TA 5F16A 3SB5A 1BQLY 5LVHA 1D0KA 174LA 4HSFA 5HLLA 5KXNA 4C5FA 1L38A 4X3BA 1IP5A 1L40A 2RBSA 3TXHA 1SSYA 4XJIA 5LAGA 4NSGA 1PQIA 1AT6A 177LA 193LA 4OWEA 3FA0A 1L02A 4CJ2A 4DAJA 1CJ8A 5B1FA 1IR8A 5LINA 1KW7A 4LYTA 4UWNA 3D9AC 3SB7A 1OUAA 1YROA 1ZVYB 4NSJA 1L52A 4CHXA 3WU7A 1YKZX 2HU1A 4H9FA 1P2LA 1LZGA 108LA 2OU8A 1B2KA 3CDQA 1L55A 4TWSA 1L25A 1LKSA 1TLAA 1C6EA 3AW6A 4IASA 4WG1A 153LA 3TMUA 3SB8A 3DN1A 4AQNA 199LA 1LZNA 2FBBA 245LA 2Z39A 1JTOL 207LA 4YX7C 3A6CY 1L84A 1LJJA 2CDSA 4LDOA 2AUBA 1QUDA 1CU3A 1L81A 217LA 1ZMYL 3DN3A 1VEDA 4HJYA 1D9UA 2B6TA 1C67A 192LA 1L16A 1UICA 1PQKA 3HT9A 1KIRC 5HMVA 247LA 1JHLA 1G7LC 159LA 1QSBA 4TSBA 3SB9A 3WVYA 3SBAA 1QS9A 2I6ZA 3OE0A 1BGIA 3HDFA 2B6YA 1B0DA 1QDTA 1FLUA 2DQAA 4I7OA 5F81A 3FADA 4GLAA 231LA 3GUKA 1G1VA 1KXYA 4DT3A 4XJDA 1L06A 1EQ5A 4ETCA 4OW1A 6LYZA 3SB6A 1IWYA 1Z55A 1NKHA 1C6TA 1EL1A 218LA 2O79A 232LA 1GAYA 1ZV5L 4ARMB 3ODUA 2BAAA 2XBRA 238LA 7LZMA 4WL7A 2BQHA 1D0LA 1L79A 1L17A 3G3VA 4W57A 4LYBA 3HFMY 5LVKA 1C6JA 1GE4A 1L58A 3J4GA 4YM8A 1CU5A 1YAPA 1REYA 4HJZA 1GFVA 1B5XA 4L41A 1GDXA 1LZ9A 1EPYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 220L A;  2X0A A;  1D0M A;  1GB9 A;  2HEA A;  5KXT A;  3C81 A;  1LZA A;  4WM2 A;  1L15 A;  3GUP A;  1L14 A;  3P68 A;  1IWX A;  1KXW A;  1IEE A;  1IOT A;  1LMC A;  4BS7 A;  1JKD A;  1GBS A;  1QT3 A;  4O34 A;  5I4Y A;  3ATO A;  1L43 A;  1L51 A;  1DYD A;  3OE6 A;  2GV0 A;  1P46 A;  1D3M A;  1G0L A;  5LA5 A;  214L A;  5LVJ A;  2QAR C;  3P65 A;  2YSS C;  1QUS A;  1IWT A;  4GCE A;  4DDA A;  1LPY A;  254L A;  1P3N A;  2LYM A;  1W6Z A;  3GUL A;  1LSF A;  185L A;  2EQL A;  1XGT C;  161L A;  3G3W A;  5DM9 A;  1WVV A;  1LMT A;  3FI7 A;  1QT5 A;  4PGJ B;  1BB7 A;  4YXC A;  1L03 A;  3CDV A;  1ZVH L;  4H90 A;  4H9A A;  4TSC A;  2DQF C;  3F8V A;  4ZIX A;  1C10 A;  1LMO A;  118L A;  1NQI A;  3N9A A;  3P64 A;  3ULR A;  1QT7 A;  2IGC A;  3HWL A;  1IP1 A;  187L A;  1LSG A;  1L18 A;  184L A;  4LT0 A;  1C66 A;  3G3B B;  5L9J A;  1LZY A;  4LYC A;  162L A;  4K5Y A;  1B5W A;  1L35 A;  1L37 A;  178L A;  1LZ1 A;  129L A;  2B75 A;  3J6K A;  243L A;  1MEL L;  3NY8 A;  1L92 A;  4ETD A;  1GFE A;  1B6I A;  3EMS A;  1LJI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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