1L19A

Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles
Total Genus 58
204060801001201401600102030405060
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
AH1 (3-11)AH5 (93-106)3H1 (159-161)EMPTYS1 (14-19)TI'1 (54-57)TI1 (20-23)AH9 (137-141)S2 (25-28)AH3 (60-80)S3 (31-34)AH2 (39-50)AH7 (115-123)AH8 (126-134)AH10 (143-155)AH4 (83-90)AH6 (108-113)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l19A00
1L30A 174LA 1LWKA 3C81A 3GUJA 3GUMA 1LI3A 1L18A 2LC9A 261LA 1L02A 2B70A 2B75A 131LA 1P46A 1C62A 1L92A 215LA 1CU5A 1QS9A 4I7MA 4LDOA 212LA 1OV7A 111LA 241LA 1L70A 1CU2A 123LA 2HUMA 1L75A 240LA 4I7PA 114LA 1SX7A 256LA 3G3WA 1LGWA 200LA 2IGCA 247LA 4W57A 2B6TA 1K28A 160LA 182LA 218LA 227LA 3DMXA 1C6JA 224LA 1L11A 1C6QA 1L40A 184LA 146LA 1L58A 3C7WA 2OU8A 239LA 1L0JA 3DN0A 4YXCA 1L94A 1LGXA 1DYBA 1L98A 103LA 2F47A 1L10A 1C6KA 242LA 1QT6A 1CV5A 1L44A 3D4SA 1L72A 1L61A 2CUUA 230LA 1L16A 1C64A 3HH4A 1G0KA 3GUKA 151LA 1L35A 205LA 156LA 1D2WA 2B7XA 2OEAX 3C83A 1L33A 3CDQA 1L96A 189LA 245LA 4I7NA 1L73A 3RZEA 1C6DA 257LA 140LA 125LA 3DKEX 177LA 190LA 4EKQA 1L27A 3NY9A 2B74A 178LA 188LA 1C67A 1L65A 1QUOA 1LLHA 2B73A 1L01A 1L87A 4LZMA 3DN6A 1L12A 1L53A 1QT4A 1P7SA 1L00A 1C6NA 1L07A 1NHBA 3DN3A 145LA 1L59A 150LA 3ODUA 107LA 2QB0B 1L93A 250LA 1PQMA 1C6FA 1L06A 3CDTA 2RBOA 1DYGA 4YXAC 1L22A 1DYCA 1CX7A 3SB6A 259LA 170LA 2HULA 1ZWNA 4I7QA 3PBLA 1C6EA 157LA 3HTBA 2ANVA 3HTGA 1QTZA 1L74A 254LA 4W54A 141LA 113LA 1L47A 2HUKA 232LA 1LWGA 1L14A 181LA 4ZPUA 3HDEA 187LA 1D3FA 1L26A 231LA 1L04A 3VW7A 1L49A 2RBRA 1L86A 128LA 3HH3A 3SN6R 161LA 4I7TA 191LA 1OVJA 3LZMA 1G0MA 2RBQA 1T6HA 1C6HA 4GBRB 172LA 223LA 1LYIA 1D9WA 1D3JA 4I7JA 4ARMB 164LA 1L29A 1CV3A 1L68A 1L84A 3CDOA 2RB2X 4I7LA 4ARPA 4W51A 1SWZA 2QARC 1QT8A 149LA 1QS5A 3C80A 1KY0A 1CVKA 225LA 2B6YA 147LA 1DYEA 201LA 1C65A 2RBSA 2NTGA 243LA 3V2WA 185LA 1PQIA 1CU0A 3DN8A 228LA 4LDLA 173LA 1EPYA 2O7AA 4DAJA 249LA 3OE8A 1G0PA 1L80A 2L78A 1PQDA 235LA 1L66A 1LYEA 4EPFA 2O4WA 1L76A 3F9LA 246LA 6LZMA 1L39A 1QT3A 7LZMA 251LA 3HTDA 165LA 2NTHA 1CUPA 2B6ZA 3HH5A 1DYFA 1G1WA 1JQUA 1QTBA 3HUQA 1L42A 1L05A 1L03A 213LA 1L24A 3C82A 4OO9A 159LA 186LA 1C6GA 221LA 3L64A 1L69A 1LYHA 3G3XA 1G0QA 209LA 1LI6A 3DMZA 3GULA 1L64A 3FI5A 4EKPA 1CU6A 2OU0X 1C66A 152LA 1P64A 219LA 3C7ZA 1JTMA 5LZMA 229LA 1C6LA 3SB7A 4ARLA 3HT7A 1L82A 1C6TA 1L0KA 137LA 1C6MA 1L81A 108LA 1OVHA 1C61A 1L31A 3JR6A 2OTZX 1L15A 2RH1A 1LYJA 2Q9EA 4I7RA 4ARQB 1P37A 1G0GA 226LA 1G0JA 1L57A 1P2RA 195LA 120LA 1L95A 3SB9A 253LA 199LA 1T97A 3DN4A 130LA 1ZYTA 2OE9X 4I7OA 171LA 4S0WA 1L32A 1LW9A 2RB1X 1L85A 3SB5A 1TLAA 255LA 122LA 1T8FA 162LA 2LCBA 1L20A 1OV5A 3FA0A 4W59A 1C6BA 211LA 127LA 166LA 1P2LA 1QTCA 1L71A 1L25A 1C6CA 1QT7A 4W52A 1KY1A 1LI2A 233LA 126LA 4W53A 1QTVA 180LA 1L77A 2B6XA 2F2QA 175LA 3SBAA 3HT6A 1D3NA 1ZURA 1L79A 1P3NA 102LA 3GUIA 3HU8A 1G0LA 1L60A 3V2YA 234LA 1QSBA 4LDEA 1L67A 3HT9A 252LA 163LA 238LA 1CU3A 1KW5A 1C68A 3CDVA 3FADA 3C8RA 1L23A 1JTNA 1P5CA 1PQOA 2ANXA 4I7SA 3RUNA 237LA 2RAYX 236LA 214LA 3HTFA 5I14A 1L38A 1CX6A 142LA 3G3VA 1L46A 1XJTA 2B72A 1T8GA 4EPIA 3NY8A 4DKLA 4AQNA 3F8VA 217LA 4GRVA 3NYAA 1PQKA 262LA 4EKRA 1QTHA 1LGUA 1QTDA 1I6SA 1C6AA 198LA 1L63A 4ARJA 3SB8A 1P6YA 1G06A 1CTWA 3C8SA 3GUNA 4ARMA 2O79A 3HDFA 1QSQA 1C69A 1L90A 248LA 119LA 4W58A 196LA 1L51A 1CV1A 1KNIA 3DN1A 1LYGA 1LYFA 1L17A 3HUKA 3OE9A 4W56A 1WTHA 112LA 3HU9A 3HT8A 1SWYA 1L09A 1SSYA 1KW7A 2Q9DA 1XJUA 3DN2A 1LPYA 3CDRA 3HH6A 1L88A 3SBBC 216LA 2F32A 183LA 1C6PA 1L21A 1CV4A 1DYAA 192LA 169LA 1CV0A 148LE 1XEPA 1L45A 1L48A 1OVKA 110LA 2LZMA 2OU9A 1L97A 1G07A 1L89A 258LA 1SX2A 4IAPA 4PK0A 1LYDA 1CUQA 143LA 1G1VA 4E97A 3HWLA 109LA 1C6IA 1QT5A 1D3MA 1KS3A 2RAZX 3GUPA 4EKSA 4K5YA 3HUAA 220LA 222LA 155LA 129LA 4EJ4A 3UONA 4DJHA 3DNAA 197LA 1OWZA 1T8AA 1L54A 1L08A 1L91A 1L56A 2B6WA 1QUGA 144LA 1OWYA 1P56A 260LA 2OE7X 2Z6BA 1L37A 1C63A 139LA 1L52A 4PJZA 1L43A 1PQJA 3PDSA 167LA 138LA 1L62A 2RBPA 115LA 4YX7C 1L99A 1QUDA 3DMVA 1B6IA 1P36A 2RBNA 176LA 206LA 168LA 3L2XA 1SSWA 1L41A 1L19A 1CV6A 1L13A 4ARQA 3C7YA 2OE4X 4EXMA 3OE6A 1QUHA 158LA 3GUOA 1C60A 4W55A 210LA 1L36A 1L28A 3OE0A 3EMLA 118LA 1D2YA 3QAKA 2RB0X 244LA 104LA 1DYDA 2A4TA 3K2RA 1OYUA 3C8QA 4I7KA 1L50A 1L55A 1L34A 1L83A 2OTYX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D0MA 2XJWA 1KXYA 2XQOA 1LAAA 1LWKA 4WLXA 4TSCA 1GEVA 4H9AA 1IEEA 1GAZA 4DD1A 4ETAA 2B70A 1V7SA 1BQLY 1L92A 215LA 4ML7A 1JPOA 2YBLA 212LA 1L70A 1LSPA 5L9JA 2HUMA 240LA 2LYMA 1SX7A 2YSSC 4O34A 4N9RA 2IGCA 1B7NA 1QQYA 3TXGA 4Z41A 4W57A 160LA 1DI5A 1GFJA 3DMXA 1C6JA 4GCBA 4RDSA 1L11A 1L58A 5LVKA 3P64A 5D5FA 1WQMA 1GE2A 1DYBA 1L98A 1GBYA 2N5ZA 2G4PA 1QT6A 5M1YA 1L72A 2CUUA 4H8ZA 5F81A 4Z3MA 1G0KA 3A67Y 3GUKA 151LA 1IP4A 156LA 1VFBC 1D2WA 2B7XA 2OEAX 1GWDA 1L96A 4I7NA 1L73A 3P66A 3RZEA 1C6DA 177LA 190LA 1L27A 2Z19A 2B74A 3BKHA 1GB2A 4TTDA 1GXXA 1JISA 1LCNA 4LZMA 1QT4A 1P7SA 1L00A 1MELL 2BAAA 1L07A 1NHBA 3DN3A 145LA 150LA 4PRQA 107LA 3WL2A 1PQMA 1G7IC 1DYGA 3B0IA 1L22A 1CX7A 259LA 4I7QA 4WL7A 1QTZA 4NHQA 4DDBA 1B5UA 1L74A 254LA 2BQKA 113LA 3TXBA 1LMQA 3LZTA 1LWGA 3WU7A 1LSBA 187LA 1L26A 5B07A 3J4GA 3WPKA 4GLVA 3HH3A 161LA 1YANA 1LZ4A 4B4EA 1TDYA 4II8A 2ZYPA 5KXSA 1C6HA 3TMXA 1D9WA 1D3JA 2MEFA 1JTTL 1OP9B 4I7LA 1GHLA 4ARPA 4W51A 149LA 1KY0A 2B6YA 3MGWA 3V2WA 4ZFPA 2DQJY 4WMGA 4RW1A 4LDLA 1EPYA 1OUEA 4DAJA 1LZBA 3W6DA 4WG7A 1YILA 4DD7A 1C45A 1PQDA 235LA 1LYEA 1ZMYL 1LJNA 3F9LA 1EL1A 7LZMA 251LA 1CKFA 4N8ZA 1CUPA 4NHSA 1JJ0A 3CB7A 1G1WA 1IR9A 1JQUA 1QTBA 1HEOA 1L69A 3G3XA 1G0QA 209LA 3D3DA 1EQ4A 1GE3A 3IJUA 3GULA 1L64A 3FI5A 4HV2A 9LYZA 1LHJA 2Z37A 4DQJA 219LA 1FN5A 3WULA 229LA 1C6LA 1L82A 5LINA 2Q0MX 1HEWA 1KIPC 1LZTA 1YKZX 108LA 3SP3A 4KT3A 1JJ1A 1IWUA 3JR6A 2RH1A 2Q9EA 3A8ZA 4I7RA 4ARQB 5HNCA 1P37A 226LA 1L57A 4PRUA 2BQEA 1FKQA 3TXKA 3IJVA 1IVMA 253LA 1IO5A 4I7OA 171LA 4S0WA 4DT3A 1LZSA 1VATA 3P4ZA 1T8FA 1GFEA 1L20A 4YOPA 1C6BA 2I6ZA 2MEAA 127LA 5LAGA 2ZNWY 1CJ8A 1NDGC 2C8OA 1L25A 5KXMA 3HBHA 1QT7A 1W6ZA 1LI2A 126LA 4H94A 1L77A 2BQAA 3SBAA 4B4IA 4H1PA 1L79A 1UA6Y 1P3NA 1GFKA 1XGRC 1L60A 1GB5A 2HEBA 234LA 1GBXA 4NWEA 1L67A 1V7TA 163LA 1CU3A 1O23A 4QDNA 4NHPA 3CDVA 1XSFA 1JTNA 2BQNA 4XENA 1RJCB 4NGZA 4LGKA 1C43A 4KPMA 3HTFA 2B5ZA 1XJTA 2B72A 2EQLA 217LA 4GRVA 1WTMA 1LZ9A 5I4YA 2F4AA 1L63A 4ARJA 3SB8A 1AT6A 1G06A 1LZNA 3W6BA 1C69A 1UUZC 3A93A 5B05A 5FDJA 4W58A 1CV1A 2CDSA 1GF7A 4H9HA 1GB0A 1LYGA 1LYFA 3HUKA 5A3ZA 5E4PA 4DDCA 112LA 3HT8A 1L09A 1BB3A 1JITA 1SSYA 4HTKA 1LPYA 1L88A 4MCKA 3EBAB 1C08C 1IORA 216LA 3F6ZA 4WO6A 1DYAA 1NKHA 148LE 4NGLA 2LZMA 5J7CA 2FYDA 1IP7A 1L97A 1G07A 1LOZA 1WQRA 3TXIA 1CUQA 1IWYA 4BAPA 3AGGG 2F30A 1GFVA 1GAYA 1KS3A 1LSZA 4XJGA 220LA 155LA 1HMLA 1GBOA 4I8SA 1L54A 1QUGA 2DQFC 2OE7X 5ILCA 5HMJA 1B9OA 1L43A 1PQJA 1EQEA 1HC0A 1HNLA 4G4BA 2HU1A 3WU8A 2Z12A 1B0DA 134LA 5KXRA 3AYQA 2BQJA 4ARQA 3C7YA 1XGQC 158LA 2W1LA 4C3WA 4W55A 4HPEA 3WXUA 5IDDA 1D2YA 1GB6A 104LA 1LJ3A 6LYTA 1L50A 1L55A 1JHLA 5II3A 1L83A 1IY4A 4N1EI 3EMSA 3GUJA 3GUMA 1B5YA 261LA 2B75A 1GFGA 2Z18A 1P46A 1KXXA 1LZ1A 1OUCA 1CU5A 1LJEA 2DBTA 1HMKA 1UIBA 1J1PY 241LA 1FLQA 1GE4A 1T3PA 1LSMA 4I7PA 114LA 5B1GA 1KIRC 3FI7A 247LA 4TX7A 4WO9A 1K28A 218LA 182LA 1GFRA 1HFZA 227LA 4NIJA 1C6QA 4NEBA 3CSRA 3C7WA 3DN0A 1L0JA 4YXCA 4WM1A 4PPOA 1OUAA 1L10A 4NY5A 1C6KA 242LA 3WPJA 2HECA 5JENB 1B7QA 1C64A 1NBZC 4GLAA 3CDQA 189LA 1IOCA 4B0DA 3DKEX 257LA 125LA 2D4IA 3TMVA 2BQDA 3N9AA 1CJ6A 3NY9A 178LA 1L65A 1QUOA 1LMCA 1JKAA 4UWNA 1LLHA 4H92A 1L01A 3DN6A 1L12A 2A7FA 2NWDX 2YDGA 1GDWA 1VDTA 1I56A 1BVXA 1INUA 1L59A 3ODUA 2QB0B 250LA 3TMUA 5F14A 4GN4A 1DI3A 3WUMA 1DYCA 2VB1A 170LA 3PBLA 3LYOA 1IC5Y 3AJNA 4W54A 141LA 2XBSA 5LVJA 1D3FA 1L04A 2Y8PA 1B7RA 128LA 2BLYA 3SN6R 1EQ5A 4UWVA 3LZMA 4XJFA 1OUIA 4DQ7A 2RBQA 4AXTA 1DPWA 1WQNA 1FLWA 1L68A 1JTPL 1FDLY 3CDOA 4ETBA 2BQHA 5DN5A 3C80A 225LA 4TWSA 2WARA 201LA 1C65A 2CWIA 2HU3A 4QEQA 185LA 1PQIA 1CU0A 1GF0A 1GXV2 2YBIA 228LA 4WM2A 1UIHA 5LAFA 2O7AA 249LA 3G3BB 2RSCA 1XGUC 2CGIA 2LZTA 1QT3A 3A95A 3HTDA 165LA 2NTHA 3J6KA 3HUQA 1L05A 1L03A 4OO9A 159LA 1C6GA 4H9CA 5APDA 1CNSA 2H5ZA 5DM9A 1VDPA 3DMZA 1A4VA 5IHGA 1E8LA 2YBMA 5LZMA 1JSEA 3A34A 4NGVA 1C6TA 4WLDA 137LA 5L3IA 5KXNA 1LZ5A 1L81A 1HF4A 4OWHA 1OVHA 3OK0A 4LYMA 1LHHA 4DD2A 1QTEA 1ZV5L 3WXTA 2ZYCA 1JJ3A 1G0JA 1OUJA 195LA 1JUGA 4H91A 120LA 4HP0A 1LSDA 1T97A 1IC7Y 1ZYTA 3TXEA 7LYZA 4OWAA 5LYTA 1LW9A 3AZ5A 3W6AA 162LA 3FA0A 4W59A 4Z98A 2DQAA 1XEIA 166LA 1P2LA 1L71A 4YEMA 4TUNA 1UCOA 1JEFA 180LA 1YKXX 2F2QA 3OJPA 175LA 3HT6A 4EOFA 1D3NA 1FKVA 1BVKC 3N9EA 1UIFA 3GUIA 4DYGA 5FSTA 1LKSA 1NHEA 4H9IA 1IR7A 2DQHY 4XN6A 3D9AC 3C8RA 1L23A 1LYSA 1P5CA 1H6MA 237LA 2MEIA 236LA 3G3VA 3NY8A 4AQNA 4LYCA 5E9RA 3F8VA 3NYAA 1JTOL 1VDQA 1PQKA 4EKRA 8LYZA 5EBHA 4GN3A 1DQJC 1LGUA 1UIGA 4BS7A 4GCEA 198LA 4NSJA 1CTWA 3GUNA 2O79A 119LA 3K3TA 1LZCA 1GPQC 4H9EA 5KXXA 1WQPA 4W96A 2ZNXY 4W56A 5KKJA 4C5FA 1GBSA 2Q9DA 3DN2A 3CDRA 3HFMY 1OQMA 1C6PA 1L21A 1AM7A 1CV4A 4XJIA 1YROA 1XEPA 2OU9A 1UACY 4NHTA 1QUTA 1IY3A 4YEOA 1NBYC 5I5QA 4E97A 4CHXA 4H93A 1C6IA 1LJGA 4TSBA 1LSGA 4EKSA 4OOTA 2DQGY 129LA 4X3BA 2D91A 5A3EA 1KXWA 1L91A 1MLCE 144LA 260LA 2EIZC 1L37A 1C63A 139LA 4WM6A 3PDSA 2RBPA 1LZGA 4WOAA 1L99A 2DQDY 3DMVA 1LZ8A 3WYHA 1P36A 1CJ7A 1REZA 3L2XA 3TXDA 4WM5A 4CFPA 1CV6A 1L13A 1GB8A 3LYZA 4XYYA 3WPLA 1L36A 1L28A 2MEHA 3OE0A 1TCYA 2YBJA 3EMLA 118LA 2RB0X 1JKDA 1XEKA 1LJIA 1T6VL 1IWWA 3M3UA 4WG1A 174LA 3AZ6A 4LYTA 3C81A 3G3AB 3WH1A 1LI3A 4ETCA 5KXTA 1L18A 1L02A 1NQIA 131LA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1D0M A;  2XJW A;  1KXY A;  2XQO A;  1LAA A;  1LWK A;  4WLX A;  4TSC A;  1GEV A;  4H9A A;  1IEE A;  1GAZ A;  4DD1 A;  4ETA A;  2B70 A;  1V7S A;  1BQL Y;  1L92 A;  215L A;  4ML7 A;  1JPO A;  2YBL A;  212L A;  1L70 A;  1LSP A;  5L9J A;  2HUM A;  240L A;  2LYM A;  1SX7 A;  2YSS C;  4O34 A;  4N9R A;  2IGC A;  1B7N A;  1QQY A;  3TXG A;  4Z41 A;  4W57 A;  160L A;  1DI5 A;  1GFJ A;  3DMX A;  1C6J A;  4GCB A;  4RDS A;  1L11 A;  1L58 A;  5LVK A;  3P64 A;  5D5F A;  1WQM A;  1GE2 A;  1DYB A;  1L98 A;  1GBY A;  2N5Z A;  2G4P A;  1QT6 A;  5M1Y A;  1L72 A;  2CUU A;  4H8Z A;  5F81 A;  4Z3M A;  1G0K A;  3A67 Y;  3GUK A;  151L A;  1IP4 A;  156L A;  1VFB C;  1D2W A;  2B7X A;  2OEA X;  1GWD A;  1L96 A;  4I7N A;  1L73 A;  3P66 A;  3RZE A;  1C6D A;  177L A;  190L A;  1L27 A;  2Z19 A;  2B74 A;  3BKH A;  1GB2 A;  4TTD A;  1GXX A;  1JIS A;  1LCN A;  4LZM A;  1QT4 A;  1P7S A;  1L00 A;  1MEL L;  2BAA A;  1L07 A;  1NHB A;  3DN3 A;  145L A;  150L A;  4PRQ A;  107L A;  3WL2 A;  1PQM A;  1G7I C;  1DYG A;  3B0I A;  1L22 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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