1L20A

Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPDRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Enhanced protein thermostability from designed mutations that interact with alpha-helix dipoles.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l20A00
1C6FA 112LA 1L24A 2RB0X 4I7MA 215LA 190LA 3SN6R 5I14A 2HUKA 4ARMB 1KY0A 1DYDA 4ARQB 1DYCA 1L0KA 3V2YA 1C6LA 126LA 1G0KA 1L97A 1L11A 1L55A 253LA 2RAZX 4W52A 2HULA 4EPFA 1P46A 4I7NA 3HUKA 110LA 3SB9A 1C6GA 3L2XA 3GULA 1QUOA 1D2WA 1C6NA 172LA 1KW7A 146LA 142LA 1QTBA 1C6PA 1OV5A 3HT7A 4I7TA 2B74A 220LA 1L42A 118LA 251LA 1EPYA 1LI3A 3FI5A 1JTMA 111LA 1ZWNA 3HT9A 1L71A 1L49A 2RH1A 140LA 160LA 1L00A 2Q9EA 3F8VA 3CDQA 144LA 1L93A 1L37A 1LPYA 3HH3A 4OO9A 3G3XA 1XEPA 1L09A 255LA 2O4WA 1L91A 3G3VA 3C83A 195LA 159LA 1L58A 1CU5A 1C6BA 1QT3A 1QT6A 1L83A 3DNAA 1LYEA 1L64A 157LA 1P2LA 4LDLA 1L06A 3GUIA 115LA 1LW9A 1C63A 1C65A 1OWYA 122LA 1QTCA 1QT5A 1QTVA 131LA 3GUJA 197LA 166LA 1KY1A 3SBBC 1L03A 5LZMA 1C61A 210LA 1QT8A 147LA 109LA 1WTHA 128LA 1L07A 1SWZA 243LA 2Q9DA 3C8RA 4GRVA 2F2QA 1L74A 1OVKA 2O7AA 1L51A 3DKEX 2ANVA 1G0QA 162LA 1OWZA 1QTZA 249LA 1I6SA 1L05A 240LA 234LA 1SX7A 242LA 3DN4A 3C7ZA 1L32A 168LA 3C81A 229LA 2B75A 2OU9A 3SB6A 4W57A 2B6WA 1G0GA 1L99A 1CU3A 244LA 3CDRA 1JTNA 205LA 4ARLA 1KS3A 1LYFA 3PDSA 108LA 3SBAA 237LA 3SB8A 1CV4A 196LA 1XJTA 221LA 4W58A 1T8AA 1L92A 1CV3A 1LLHA 4W59A 155LA 3UONA 1L48A 3HT8A 1OV7A 191LA 1XJUA 4LDOA 1C69A 164LA 214LA 232LA 1QS9A 1P5CA 4W53A 2Z6BA 2B6YA 171LA 1JQUA 1QS5A 2RB1X 1LWGA 1ZYTA 3DN3A 7LZMA 183LA 1C64A 1L10A 247LA 1C6DA 4W54A 169LA 2QB0B 4I7PA 3RZEA 1G0LA 1PQKA 156LA 212LA 4LDEA 130LA 3GUMA 3SB5A 1L36A 3RUNA 1QTHA 2LCBA 4PK0A 1L45A 3HU8A 1L21A 177LA 1L26A 4W51A 6LZMA 4AQNA 1L04A 1QUDA 2RB2X 1L23A 1DYGA 1QSBA 181LA 1OVJA 2OE7X 1L19A 2F47A 187LA 257LA 178LA 1D3FA 1L22A 225LA 2B6ZA 102LA 1CV6A 261LA 1L81A 3OE9A 1C62A 3NYAA 1PQOA 201LA 1L79A 1L61A 1C6MA 1L17A 185LA 1L33A 1C60A 1KNIA 1L38A 1LGUA 1T8FA 1L63A 3GUNA 1PQJA 139LA 3HT6A 2O79A 2RBPA 150LA 170LA 227LA 1L50A 2F32A 1DYAA 3C7WA 1ZURA 252LA 1C68A 1LYJA 192LA 3EMLA 224LA 1LYGA 211LA 2RBQA 188LA 1LI6A 3DMXA 119LA 1DYEA 1L02A 1G1WA 1C6CA 1QT4A 1L77A 1G1VA 1C6TA 175LA 1G07A 1L66A 2ANXA 223LA 3HTFA 1CUQA 186LA 1L84A 231LA 1C66A 219LA 1OVHA 1D9WA 3FA0A 3DN1A 1L89A 1L41A 1L57A 4GBRB 4ARJA 259LA 239LA 2B6TA 3DN2A 1DYBA 3NY8A 3QAKA 1C6IA 4LZMA 3GUPA 3HH4A 127LA 1L54A 1P36A 3HTBA 1L73A 236LA 2B70A 145LA 1L25A 1L31A 3OE8A 1L34A 180LA 4YXAC 2OTZX 125LA 3C8QA 238LA 4EXMA 4YXCA 1L69A 4EKRA 2IGCA 137LA 4DKLA 1L01A 3LZMA 1L39A 104LA 3NY9A 141LA 1L59A 2RBSA 2LZMA 1CV1A 3G3WA 2LC9A 1G0MA 1L0JA 1C6HA 3DMVA 152LA 1L80A 1SWYA 1LYIA 1DYFA 1L67A 217LA 2RBRA 246LA 245LA 3HDEA 1CX6A 4IAPA 3HH5A 174LA 1D3JA 1L95A 176LA 1G06A 1L62A 3OE0A 3GUOA 1L47A 3OE6A 2B7XA 199LA 2NTHA 3HU9A 1L46A 120LA 1C6KA 1CU2A 3DN0A 248LA 1OYUA 1L88A 4PJZA 1T6HA 3CDTA 4I7KA 4YX7C 149LA 1PQMA 2RBOA 1L98A 1L29A 2B72A 3C82A 1PQIA 4EKQA 1P56A 3FADA 3HDFA 1T8GA 1PQDA 1QTDA 3SB7A 2A4TA 1P7SA 222LA 114LA 4I7JA 1QSQA 3CDOA 1SX2A 1L52A 4E97A 1KW5A 184LA 1P37A 103LA 1L44A 189LA 1L86A 1K28A 254LA 1C6EA 3DN6A 113LA 241LA 1L12A 235LA 1LWKA 3PBLA 216LA 1L30A 4ZPUA 228LA 1CVKA 3HWLA 1L90A 1L18A 2QARC 2OEAX 167LA 4I7LA 2OU0X 200LA 3F9LA 3HTGA 182LA 2B6XA 2OU8A 1L96A 1SSWA 262LA 4I7SA 4EKPA 151LA 4EPIA 3HUQA 3VW7A 138LA 1L40A 3V2WA 4ARMA 4ARQA 1CUPA 4I7RA 4K5YA 1L13A 1QUGA 1L65A 1CV5A 1L16A 3HH6A 1C6AA 2CUUA 1L82A 4W56A 1L76A 3HTDA 4EJ4A 1L15A 198LA 3L64A 2OTYX 4I7QA 1L87A 1SSYA 213LA 1LYDA 233LA 1L43A 2B73A 1QT7A 107LA 163LA 3C8SA 1D3MA 218LA 2NTGA 4W55A 1G0PA 3K2RA 1CV0A 1CTWA 1P64A 3DN8A 173LA 4S0WA 2RBNA 1L85A 1L08A 1C67A 1L53A 1L94A 123LA 3HUAA 3CDVA 4DJHA 148LE 4I7OA 2RAYX 258LA 1D3NA 1L14A 3ODUA 1L35A 1L70A 3DMZA 1NHBA 3D4SA 3JR6A 1C6JA 1P2RA 250LA 161LA 2L78A 1L75A 256LA 129LA 1LYHA 1P6YA 209LA 1QUHA 1B6IA 1T97A 260LA 2OE9X 165LA 3C80A 4DAJA 1L20A 1CX7A 4ARPA 226LA 1LGWA 1L56A 4EKSA 1G0JA 2HUMA 3GUKA 3C7YA 1L60A 1L72A 230LA 158LA 1L68A 1TLAA 1L27A 206LA 1CU6A 1LGXA 2OE4X 1CU0A 1LI2A 143LA 1C6QA 1L28A 1P3NA 1D2YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IO5A 1LMOA 1L24A 4I7MA 5I14A 1GPQC 4G49A 1IWYA 3TMWA 2HEAA 9LYZA 2HULA 4EPFA 3BKHA 2BQAA 1BVKC 3L2XA 1QUOA 1GFUA 1IOQA 1C6NA 172LA 3HBEX 1WVVA 1BWIA 1C6PA 4CGEA 2LYOA 2LZ2A 4I7TA 1GAYA 3B6LA 2B74A 4DDBA 1UIGA 111LA 4XJIA 1GFVA 1L71A 1L49A 4BAPA 1L00A 5HNCA 3RT5X 3CDQA 1XGQC 4NGWA 4B4IA 1L09A 4WM4A 3CT0A 4EOFA 195LA 1ZMYL 4NHSA 2F2NA 1CU5A 4WLYA 5E9RA 1OUAA 2BQIA 4Z3MA 1L64A 1P2LA 4LDLA 4QEQA 5APFA 3WW6A 1L06A 1HNLA 3GUIA 4KPMA 1I1ZA 1Z55A 2LHMA 1QT5A 3SBBC 1C61A 1G7IC 4HPEA 1OQMA 2RSCA 1OUCA 109LA 1HMLA 1WTHA 5ILFA 4WLXA 3C8RA 3RZ4A 3MGWA 2F2QA 4CFPA 2ANVA 2ZYCA 162LA 2MEEA 240LA 4WO6A 1JJ1A 3WUNA 3C7ZA 1IP6A 3M18B 168LA 3C81A 1HEOA 2F4AA 1DQJC 1IOCA 4GCEA 205LA 3N9AA 4ARLA 4QDNA 1JPOA 1LYFA 1REMA 3SB8A 196LA 1XJTA 1YAOA 3CSQA 1GEZA 1RJCB 1XGPC 3HT8A 1BB4A 4LDOA 1FLWA 1C69A 1LZ1A 214LA 4J7VA 2Z6BA 2B6YA 1JQUA 1QS5A 2RB1X 1JISA 1LJEA 1LWGA 183LA 3WUMA 3B0OA 1CKFA 1C6DA 4HP0A 4W54A 4NHIA 5KXRA 1I56A 3RZEA 1PQKA 2BQLA 2H9JA 4NY5A 1LMPA 5FEKA 1G7HC 4DD9A 1REZA 3HU8A 3W6AA 1NWGA 1CJ6A 4AQNA 2RB2X 1L23A 1B2KA 1QSBA 2DQAA 1LHIA 3TXKA 3E3DA 4LYCA 4ZIXA 2BQGA 1BB7A 1L22A 225LA 1G7LC 4OWHA 1LYYA 2EQLA 2W1YA 1PQOA 1LCNA 4HV1A 2CGIA 1XEIA 2YBNA 1IWVA 201LA 4H9BA 4XADA 1L33A 1T8FA 1J1OY 1LPIA 1GF3A 1PQJA 1GE1A 2O79A 2RBPA 1RFPA 1OUEA 1FLYA 1L50A 4OWBA 2F32A 1D0LA 1ZURA 1LZGA 1OUDA 1LYJA 192LA 3EMLA 188LA 3AW6A 1JHLA 1DYEA 4GLVA 1HERA 1LSDA 1D6PA 1L66A 1CUQA 1W6ZA 1GE3A 1KIQC 1L89A 3ZVQB 1B5WA 1YIKA 1QSWA 1DYBA 3NY8A 3QAKA 5KXOA 4H8XA 4HTQA 1C6IA 3GUPA 3HH4A 1P36A 1J1PY 3HTBA 2G4NA 3A92A 236LA 2BQEA 4G4HA 3A91A 1B7NA 3IJVA 2XBRA 4YXAC 2OTZX 4NSGA 125LA 4EKRA 4KL7A 137LA 1BWHA 2Z2EA 3LZTA 1BB3A 153LA 1NBYC 2BQNA 2LZMA 1HHLA 1CV1A 2LC9A 4ZEEA 1G0MA 1L80A 4LT0A 1IWWA 4I0CA 4IAPA 4I8SA 1OUHA 4GN4A 3GUOA 1GFAA 1WQRA 3TMXA 2B7XA 120LA 4XJGA 4DT3A 1T6HA 1LHJA 3CDTA 1L29A 1LZYA 1PQIA 4EKQA 3FADA 3A95A 3HDFA 4NGLA 1T8GA 2A4TA 1YL1X 1QTKA 4NSHA 3AGIA 4NHPA 4I7JA 4NGOA 1KW5A 184LA 3CQLA 1GD6A 1MELL 113LA 235LA 1CKDA 6LYTA 1UIDA 1LWKA 3T6UA 3PBLA 1NQIA 4ETAA 2N5ZA 4ZPUA 4NWHA 2HTXA 1L90A 1GEVA 194LA 167LA 2OU0X 200LA 3F6ZA 5LVJA 4GCFA 1LZNA 1GBYA 5KXNA 5C6IA 2DQCY 1YILA 1VEDA 1T6VL 5D5FA 1NF5A 5KKIA 3HH6A 1ZVYB 1L82A 4W56A 1L76A 3HTDA 4EJ4A 198LA 2OTYX 4UWUA 1L87A 1DKKA 233LA 1DI3A 2XTHA 4G4CA 1XSFA 2VB1A 4W55A 1P64A 4LYTA 1I20A 1E8LA 2YBJA 2Q0MX 1L08A 1L53A 1L94A 5EBHA 1HEQA 3HUAA 2C8PA 4DJHA 148LE 4I7OA 2BAAA 2RAYX 3W6FA 4J1BA 1L14A 1GE0A 1KXYA 1L35A 1DXJA 1L70A 5DL9A 2PC2A 3D4SA 2F30A 256LA 1P6YA 4R0FA 1B6IA 260LA 165LA 1CX7A 1DKJA 5APDA 1GFRA 1VDTA 226LA 1LGWA 4NWEA 1G0JA 3W6EA 1LGXA 2F4GA 3WH1A 1C6QA 1L28A 2Z12A 5KXLA 1D2YA 2D91A 1LZCA 4XJHA 4YF2A 2RB0X 2DBTA 3SN6R 1GFGA 2DQEY 4ARMB 1KY0A 1DYDA 4ARQB 1L0KA 4TWSA 126LA 1L97A 3WVXA 2FBBA 253LA 1P46A 3CT5A 1C6GA 4CHXA 4WG1A 3TXGA 4IASA 4XN6A 4ETCA 1OV5A 2Z19A 4QGZA 1EL1A 5KXYA 3A3RX 220LA 4PGJB 1L42A 4ETEA 5B06A 3HBHA 2IFFY 1GB5A 4M6DA 4MCKA 1JTMA 3HT9A 5A3ZA 160LA 2Q9EA 1L93A 1LSZA 1EQ5A 3G3VA 1L91A 2YBIA 1LZ6A 159LA 3P4ZA 1LYZA 4Z41A 1C6BA 1C43A 4MR1A 1UIAA 4GCBA 1GB3A 4OOOA 3N9CA 1WQQA 5HLLA 4U3XB 2Z37A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IO5 A;  1LMO A;  1L24 A;  4I7M A;  5I14 A;  1GPQ C;  4G49 A;  1IWY A;  3TMW A;  2HEA A;  9LYZ A;  2HUL A;  4EPF A;  3BKH A;  2BQA A;  1BVK C;  3L2X A;  1QUO A;  1GFU A;  1IOQ A;  1C6N A;  172L A;  3HBE X;  1WVV A;  1BWI A;  1C6P A;  4CGE A;  2LYO A;  2LZ2 A;  4I7T A;  1GAY A;  3B6L A;  2B74 A;  4DDB A;  1UIG A;  111L A;  4XJI A;  1GFV A;  1L71 A;  1L49 A;  4BAP A;  1L00 A;  5HNC A;  3RT5 X;  3CDQ A;  1XGQ C;  4NGW A;  4B4I A;  1L09 A;  4WM4 A;  3CT0 A;  4EOF A;  195L A;  1ZMY L;  4NHS A;  2F2N A;  1CU5 A;  4WLY A;  5E9R A;  1OUA A;  2BQI A;  4Z3M A;  1L64 A;  1P2L A;  4LDL A;  4QEQ A;  5APF A;  3WW6 A;  1L06 A;  1HNL A;  3GUI A;  4KPM A;  1I1Z A;  1Z55 A;  2LHM A;  1QT5 A;  3SBB C;  1C61 A;  1G7I C;  4HPE A;  1OQM A;  2RSC A;  1OUC A;  109L A;  1HML A;  1WTH A;  5ILF A;  4WLX A;  3C8R A;  3RZ4 A;  3MGW A;  2F2Q A;  4CFP A;  2ANV A;  2ZYC A;  162L A;  2MEE A;  240L A;  4WO6 A;  1JJ1 A;  3WUN A;  3C7Z A;  1IP6 A;  3M18 B;  168L A;  3C81 A;  1HEO A;  2F4A A;  1DQJ C;  1IOC A;  4GCE A;  205L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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