1L23A

Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRAILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l23A00
1G07A 2B70A 1QS5A 1CUQA 159LA 3GUJA 1C6NA 1JQUA 1LW9A 4I7LA 165LA 1CUPA 1L48A 1L05A 130LA 1L37A 4IAPA 3HDEA 4E97A 2NTGA 1CV4A 3V2YA 1L24A 3DN3A 1L23A 1D3FA 226LA 2Q9DA 1SX2A 4W54A 1C6BA 189LA 3FA0A 1NHBA 125LA 1L56A 195LA 1L83A 1L10A 4EKPA 1L30A 252LA 1L49A 181LA 210LA 1C61A 4GBRB 1P36A 4YX7C 2B6YA 1KY0A 1SWYA 200LA 3HT9A 1L15A 1L90A 3DNAA 1P7SA 1L22A 4EPFA 1L68A 1P5CA 1L38A 244LA 1C6TA 2OEAX 3GUPA 2Z6BA 3QAKA 214LA 3SB7A 1DYAA 1P56A 4W55A 1T6HA 3LZMA 3GUOA 1L21A 1L96A 3DMVA 147LA 142LA 1CU6A 1L74A 160LA 1L0JA 3HDFA 1QUHA 3SB6A 3C7WA 1OWYA 1L36A 2RB0X 3L64A 239LA 4EJ4A 1L31A 2OTZX 1QT3A 1CU3A 3HH5A 4W57A 2B6XA 3DN6A 1CX6A 4I7TA 1L08A 4ARQB 1CU0A 3CDTA 1QT7A 2OE9X 2RAZX 1QT8A 155LA 1L18A 3C8RA 1CV3A 2Q9EA 1L09A 1D3NA 1JTMA 1L75A 1L01A 3PBLA 2O79A 4EPIA 1L57A 2RB2X 1C60A 1L39A 1L65A 3HH3A 1L14A 1OWZA 2RBRA 5LZMA 4EKRA 1L54A 1QTHA 1CX7A 3DKEX 1ZYTA 227LA 220LA 219LA 3DN4A 1L66A 1QT4A 2OE7X 3SB8A 3UONA 259LA 3DN1A 4ARLA 140LA 1C64A 167LA 2F2QA 4K5YA 3HU9A 2OE4X 3C7YA 187LA 1LYFA 126LA 3DMXA 1C6FA 1PQMA 190LA 1C68A 1L88A 1L06A 1QS9A 1LWKA 1DYBA 4S0WA 1L00A 2RH1A 4PK0A 3HT8A 1EPYA 241LA 1DYEA 2HUMA 1P64A 146LA 3ODUA 2OU8A 2O4WA 4I7SA 176LA 1P2RA 1I6SA 1P2LA 2B6WA 1DYCA 1QSQA 4EKQA 1JTNA 1L95A 212LA 157LA 1L62A 1SWZA 1C6LA 2NTHA 4I7JA 4W59A 3OE8A 1LGWA 4W53A 1T8FA 2QB0B 129LA 1SSWA 205LA 3CDOA 2QARC 192LA 2OTYX 1L94A 258LA 4W58A 4LZMA 148LE 172LA 1C6JA 4PJZA 231LA 1CU5A 2RB1X 251LA 253LA 3C82A 1L86A 3GUNA 232LA 103LA 2OU9A 3HTDA 1L20A 1XJUA 1L42A 3L2XA 3D4SA 4I7OA 4ARJA 215LA 1L47A 4ARPA 4LDEA 112LA 3C7ZA 1L07A 1QT5A 216LA 3GUKA 1C6EA 122LA 3HUQA 2RBSA 3SBBC 4LDLA 4I7NA 115LA 2RBPA 1L70A 221LA 1D2WA 1LYIA 3FADA 102LA 2F47A 2RAYX 1LYJA 2ANXA 3DN2A 158LA 1C6AA 1ZWNA 1G1VA 3C83A 1KY1A 1WTHA 131LA 222LA 174LA 257LA 3DMZA 1L99A 1L52A 1L58A 1QTVA 1L59A 1G06A 3RZEA 1L13A 1SSYA 107LA 4YXCA 2B7XA 2A4TA 4W56A 118LA 138LA 1QUOA 1L71A 1L17A 150LA 1C6MA 1P3NA 2B72A 1L69A 1L72A 1PQKA 110LA 1L64A 3G3XA 1L89A 1LYDA 2B6TA 1G0QA 1LWGA 1QTZA 3EMLA 1PQIA 1C67A 3VW7A 206LA 1P46A 3HUKA 3HWLA 3C81A 197LA 224LA 4EXMA 1D3MA 173LA 104LA 2O7AA 1OVJA 217LA 2RBNA 182LA 111LA 1OV5A 250LA 2HULA 1LI6A 254LA 2OU0X 1L50A 2RBQA 1CV6A 1L97A 1DYDA 1L43A 2L78A 2B75A 2LC9A 3CDVA 1C6DA 3HUAA 1L51A 1L33A 123LA 249LA 3HH4A 228LA 1T8GA 1G0GA 1L28A 188LA 261LA 156LA 1D3JA 1OYUA 145LA 7LZMA 119LA 248LA 3C8SA 1KW7A 1C6CA 191LA 1XJTA 1OV7A 4DKLA 151LA 3HT7A 1SX7A 1OVHA 4W52A 4EKSA 229LA 245LA 178LA 256LA 1G0LA 234LA 1LGXA 1L25A 128LA 3DN0A 1L0KA 1L12A 1LGUA 3JR6A 1CTWA 177LA 1L44A 1L29A 1KS3A 1L11A 168LA 1C6IA 3HT6A 225LA 1L04A 1LI2A 1PQJA 3HTFA 4AQNA 1L61A 3GUIA 1QTCA 1L87A 1C6QA 2ANVA 183LA 1C6HA 1QTDA 139LA 4YXAC 3OE6A 143LA 175LA 238LA 209LA 127LA 255LA 1DYGA 144LA 1B6IA 141LA 1CU2A 2LZMA 1C6PA 1L16A 1PQOA 235LA 4ARMB 1QT6A 170LA 1XEPA 3PDSA 4I7PA 1L91A 1L93A 2LCBA 1L53A 1QUGA 184LA 1L77A 162LA 1LI3A 2RBOA 2B6ZA 1L03A 3RUNA 3HU8A 166LA 1ZURA 1QUDA 1K28A 3V2WA 109LA 242LA 3SB5A 3NY8A 2HUKA 1L35A 1G0PA 262LA 1CV0A 1L02A 198LA 1L76A 1G1WA 4LDOA 120LA 1L63A 108LA 1C65A 3OE9A 1L19A 4ARMA 3F8VA 3OE0A 1CVKA 211LA 1KW5A 243LA 6LZMA 164LA 1TLAA 1CV5A 1QSBA 1L45A 1G0MA 2B74A 1L32A 218LA 1C69A 4I7RA 2B73A 1L67A 3HTBA 3K2RA 1L73A 1C62A 3NY9A 3G3WA 201LA 1LLHA 3DN8A 3F9LA 186LA 4DJHA 1L41A 4ZPUA 1QTBA 2CUUA 1D9WA 185LA 230LA 1CV1A 1LYEA 113LA 1LPYA 3HTGA 1L40A 149LA 3NYAA 2F32A 1L92A 4I7KA 1C66A 3C8QA 196LA 3SN6R 1LYHA 1C63A 5I14A 4W51A 152LA 1L79A 1L81A 1L84A 233LA 1C6GA 2IGCA 1L85A 180LA 1L55A 236LA 1P37A 171LA 1PQDA 1LYGA 3CDRA 3FI5A 1DYFA 137LA 1KNIA 3SB9A 1L46A 1L80A 3GUMA 163LA 1D2YA 4I7MA 3G3VA 240LA 161LA 3HH6A 213LA 3GULA 1G0KA 4ARQA 1L34A 1L27A 4OO9A 169LA 3C80A 1P6YA 199LA 4DAJA 1L60A 247LA 4I7QA 223LA 114LA 1C6KA 1G0JA 1T8AA 260LA 3SBAA 237LA 1L82A 1L98A 4GRVA 1OVKA 1T97A 246LA 3CDQA 1L26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G07A 2B70A 4NHTA 1IWZA 4Z3MA 3GUJA 1GBXA 4ETBA 1L37A 2FBBA 1HNLA 3QY4A 2BPUA 4N1EI 3V2YA 2BQLA 1LZGA 5E4PA 4W54A 1GXXA 3FA0A 4OOOA 1L83A 2DBTA 2LYMA 4EMNA 2MEEA 2XJWA 4GBRB 4YX7C 1KY0A 1SWYA 1YQVY 2Z19A 4E3UA 153LA 2LZTA 4WLTA 1OUGA 3SB7A 3GUPA 2Z6BA 1ZVHL 1HELA 1DYAA 2DQDY 1DI3A 3LZMA 4HJYA 5APEA 1L96A 1RE2A 1VDPA 1SQ2L 4FDYA 5C6LA 4NGZA 3SB6A 1L36A 4ETCA 1LZTA 1L31A 1QT3A 1CU3A 4W57A 1LZ1A 1C45A 3DN6A 4GLVA 1A4VA 1BWJA 1CX6A 1UUZC 1EQ4A 1RFPA 3CDTA 1F6SA 2RAZX 1DZBX 3LZ2A 1LJ3A 2Q9EA 3ZEKA 1D3NA 3ZVQA 1TBYA 1LZDA 3PBLA 4B4EA 2F2NA 1GB9A 1VDSA 1L65A 4DDAA 1UIGA 3FE0A 1L54A 2LHMA 1LSCA 1LJJA 4I0CA 4DD0A 3AZ7A 1QT4A 3SB8A 1UIAA 2F2QA 5KJ9A 4M6DA 4K5YA 1RJCB 187LA 3WU7A 1C6FA 1O23A 1JSFA 3T36A 4XJGA 190LA 1L00A 4H9EA 2RH1A 4PK0A 3HT8A 1IEEA 2HUMA 1P64A 146LA 4BADA 2DQGY 8LYZA 1IWYA 2B6WA 1LZ6A 1L95A 2XBRA 212LA 4NGWA 1KIRC 4W59A 2QB0B 5DM9A 1SSWA 1WQPA 2GV0A 4W94A 4W58A 4DD9A 148LE 1IIZA 3WW5A 4WM4A 2CGIA 1GPQC 1L86A 3GUNA 1LHLA 232LA 4X3BA 2OU9A 5B07A 1LHMA 1HHLA 3D4SA 1UCOA 4I7OA 1D0LA 215LA 3AZ6A 1BVKC 1L07A 4B1AA 122LA 1XFPL 4P2EA 4ETEA 2MEBA 4AGAA 4NHQA 221LA 1TDYA 5KXOA 2BQAA 2RAYX 2IHLA 1J1OY 1G1VA 1KY1A 2YDGA 1B5UA 174LA 4DDBA 257LA 1ZV5L 3AGIA 1L99A 1L59A 1L13A 1SSYA 2B7XA 4NHPA 1BWHA 118LA 138LA 1C6MA 3WYHA 2A7FA 1HEWA 1LMOA 1L89A 3G3XA 1C10A 1G0QA 1NF5A 3EMLA 1PQIA 1UIBA 1C67A 3VW7A 4WL7A 5LYTA 5I4XA 224LA 4EXMA 2MEFA 1AKIA 3A34A 1OVJA 111LA 4WL6A 1L50A 2HTXA 1L97A 3CDVA 5IDDA 119LA 3LYZA 3RNXA 3AW6A 3LYMA 4ET9A 193LA 2ZWBA 1GF7A 1VAUA 4GN5C 1V7SA 1OV7A 4DC4A 1KIQC 3HT7A 4RW1A 1OVHA 4DYGA 1IP4A 2NWDX 1JIYA 1L25A 1LZ9A 1L0KA 3VWOA 1L12A 177LA 4ZEEA 1L44A 1LMCA 1HMLA 4ET8A 3A92A 5HMJA 5KXPA 1IWUA 3HTFA 4AQNA 3N9AA 2A7DA 3WH1A 4WM5A 2DQHY 1JITA 209LA 127LA 1CU2A 4CFOA 1QT6A 1CJ8A 2IFFY 4DD3A 1L53A 1GB0A 1GFRA 4N1CC 166LA 5LYMA 1K28A 5HQ1A 3T6UA 5ILCA 242LA 1LZRA 1B5XA 3EO5A 1GBYA 1OUBA 4DDCA 262LA 4HV2A 4QY9A 1L76A 1LMPA 120LA 1C65A 3CT1A 3ULRA 1LMNA 211LA 2D6BA 5L3IA 3K3TA 2X0AA 3TXFA 1UIFA 4Z98A 4B4JA 1IP7A 4OWEA 2B74A 1INUA 3K2RA 4NG1A 1OP9B 5A3EA 4YM8A 4G4CA 4ZPUA 1D9WA 3TXBA 2MEGA 113LA 1WQRA 4QDNA 5KXMA 2FYCA 4I7KA 1HENA 1IOSA 152LA 1L79A 1L81A 1YILA 1OUHA 1SLYA 5FEKA 180LA 1L55A 4NGIA 4MR1A 1JPOA 1ZVYB 3CDRA 1IC4Y 137LA 1NDGC 2BQOA 2MECA 4H9CA 4NIJA 1D2YA 4I7MA 4C3WA 4WMGA 240LA 3GULA 3A90A 4ARQA 1L34A 1L27A 4OO9A 3TXKA 169LA 1TCYA 2CWIA 2W1XA 1L60A 5KXZA 4HJVA 4J7VA 114LA 237LA 1MELL 1L82A 1OVKA 1YAOA 1YAPA 3CDQA 4IAPA 4WO9A 4DQJA 5LVGA 1CUQA 1GF0A 1JQUA 1CUPA 4DD1A 1JTPL 1L05A 2BQFA 130LA 4HPIA 2Z38A 2NTGA 2MEAA 1CV4A 3P66A 3TMXA 1IY4A 3DN3A 1L23A 1B2KA 5AMYA 1D3FA 3WPJA 1C6BA 4OOTA 1NHBA 4J1AA 1J1XY 2ZILA 5KXXA 1L56A 4H92A 3IWRA 210LA 2HECA 1REYA 1HEMA 1GE2A 1LYSA 1GHLA 3AZ4A 1YANA 1VFBC 3HT9A 1L15A 4DD2A 6LYZA 3DNAA 2DQJY 4R6CA 1FN5A 1VEDA 3QAKA 1GF6A 1TAYA 1WQMA 1JEFA 1T6HA 1UBZA 3WUNA 3A67Y 3CT0A 1L21A 1CU6A 3CT5A 4TX7A 1JKAA 1L74A 1AT6A 160LA 3HDFA 1QUHA 1GBOA 3C7WA 4EJ4A 239LA 1QDTA 3GXKA 3HH5A 1LPIA 3D9AC 1IY3A 1GFEA 2B6XA 4NG8A 1CU0A 1IR9A 1OUIA 2OE9X 2YSSC 4O34A 2ZNXY 3C8RA 1CV3A 1L09A 1L75A 4WG1A 2O79A 1L57A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1G07 A;  2B70 A;  4NHT A;  1IWZ A;  4Z3M A;  3GUJ A;  1GBX A;  4ETB A;  1L37 A;  2FBB A;  1HNL A;  3QY4 A;  2BPU A;  4N1E I;  3V2Y A;  2BQL A;  1LZG A;  5E4P A;  4W54 A;  1GXX A;  3FA0 A;  4OOO A;  1L83 A;  2DBT A;  2LYM A;  4EMN A;  2MEE A;  2XJW A;  4GBR B;  4YX7 C;  1KY0 A;  1SWY A;  1YQV Y;  2Z19 A;  4E3U A;  153L A;  2LZT A;  4WLT A;  1OUG A;  3SB7 A;  3GUP A;  2Z6B A;  1ZVH L;  1HEL A;  1DYA A;  2DQD Y;  1DI3 A;  3LZM A;  4HJY A;  5APE A;  1L96 A;  1RE2 A;  1VDP A;  1SQ2 L;  4FDY A;  5C6L A;  4NGZ A;  3SB6 A;  1L36 A;  4ETC A;  1LZT A;  1L31 A;  1QT3 A;  1CU3 A;  4W57 A;  1LZ1 A;  1C45 A;  3DN6 A;  4GLV A;  1A4V A;  1BWJ A;  1CX6 A;  1UUZ C;  1EQ4 A;  1RFP A;  3CDT A;  1F6S A;  2RAZ X;  1DZB X;  3LZ2 A;  1LJ3 A;  2Q9E A;  3ZEK A;  1D3N A;  3ZVQ A;  1TBY A;  1LZD A;  3PBL A;  4B4E A;  2F2N A;  1GB9 A;  1VDS A;  1L65 A;  4DDA A;  1UIG A;  3FE0 A;  1L54 A;  2LHM A;  1LSC A;  1LJJ A;  4I0C A;  4DD0 A;  3AZ7 A;  1QT4 A;  3SB8 A;  1UIA A;  2F2Q A;  5KJ9 A;  4M6D A;  4K5Y A;  1RJC B;  187L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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