1L24A

Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNPKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l24A00
4PJZA 1LWKA 1KW7A 3DMZA 1L00A 218LA 1C6MA 1QSBA 3VW7A 1T97A 1L84A 1QTVA 3RZEA 1SX2A 3DN3A 1C62A 166LA 3NY9A 144LA 247LA 1OVKA 1L23A 3GULA 1QT7A 1OYUA 1C6NA 1C6PA 1CX6A 3HTFA 251LA 1L60A 3CDQA 3NYAA 1LWGA 209LA 2OE7X 3DMXA 4LDLA 3GUJA 2Q9EA 2RH1A 3HH6A 1CV1A 1DYDA 244LA 3HDFA 3ODUA 211LA 6LZMA 104LA 1QT4A 1PQMA 1L03A 1L13A 1CU2A 240LA 1DYEA 2QB0B 2OEAX 1LI6A 3FI5A 1G1WA 250LA 3L64A 4EXMA 226LA 1P36A 3L2XA 3OE6A 4AQNA 2Z6BA 177LA 249LA 205LA 1C6GA 3G3VA 122LA 1G06A 2CUUA 161LA 1SWZA 1K28A 168LA 3C83A 103LA 1L45A 2B75A 1L98A 4I7OA 1L40A 162LA 127LA 1L26A 126LA 112LA 1CVKA 1LPYA 1C60A 4W57A 254LA 4I7PA 1P37A 3OE9A 246LA 1D3MA 1L63A 1G0LA 4W53A 3C7ZA 197LA 2RBQA 143LA 1LYEA 3PBLA 2B7XA 4ARMB 1C69A 241LA 257LA 1DYAA 1L90A 1QS9A 4EKSA 1L73A 199LA 1XJTA 1P6YA 119LA 3GUMA 4K5YA 1QTDA 3HU8A 3HUQA 4EKRA 108LA 178LA 1L76A 1KY0A 1OVHA 150LA 1L65A 1L17A 1QT8A 1L64A 1L02A 2RB0X 1LYFA 4I7TA 2RBSA 3SBAA 1LYHA 1L15A 239LA 1L69A 189LA 232LA 1L58A 3HUAA 2F47A 1C65A 3DN6A 2O4WA 1LGWA 233LA 1D3NA 2HUKA 147LA 188LA 1EPYA 3HT9A 151LA 259LA 181LA 167LA 1CV6A 1PQDA 3G3WA 137LA 1L43A 4ARQB 2RB2X 4EKQA 1DYFA 1C6DA 1C6FA 169LA 1L35A 1C68A 1SX7A 3GUPA 1SSWA 163LA 2ANXA 2B6WA 3HH3A 1L97A 1ZYTA 4I7SA 113LA 235LA 1QTHA 1P7SA 212LA 3DN4A 3EMLA 148LE 2O79A 4GRVA 187LA 2O7AA 1L96A 1QUDA 4IAPA 214LA 1L31A 4YX7C 206LA 1G0JA 1L79A 2A4TA 3HT7A 1C6KA 1C6BA 1L38A 1LI3A 3K2RA 3DKEX 1L82A 3CDRA 1P46A 1L72A 165LA 4EJ4A 1JTNA 1DYGA 1T8GA 1QUGA 2B74A 3HUKA 1LYDA 3V2WA 1OWZA 149LA 225LA 2F2QA 1LI2A 1C6IA 248LA 1OV7A 1QUHA 4W54A 5I14A 1KNIA 173LA 1L01A 4ARMA 1L30A 2LC9A 146LA 1P3NA 1CU0A 4LDOA 4W51A 102LA 4I7JA 1L0JA 1SSYA 1L66A 1L88A 1G0GA 213LA 2RBPA 7LZMA 4DKLA 1L93A 1CX7A 3DMVA 4W55A 1PQJA 3C8RA 1CTWA 1G0PA 4GBRB 1L07A 224LA 145LA 1LYJA 1CU6A 1C64A 182LA 1L87A 115LA 1C61A 1L44A 1T8FA 237LA 1G0MA 1QTZA 1JTMA 1L59A 1C63A 256LA 1L29A 2OE9X 4EPFA 130LA 1D3JA 3C7YA 1L12A 160LA 3CDTA 1CU3A 1G0QA 4ARQA 1CUPA 4W58A 1L41A 3JR6A 3CDOA 1C67A 172LA 1CU5A 128LA 138LA 1LLHA 3C8SA 1L80A 1L47A 4LDEA 1L56A 1C6EA 1L52A 1L36A 1L14A 1L99A 186LA 1L19A 140LA 185LA 245LA 2B6ZA 118LA 1L77A 1C6JA 1L68A 229LA 142LA 1L06A 1L34A 123LA 243LA 4PK0A 217LA 180LA 3GUNA 3QAKA 1L86A 2IGCA 1L46A 4S0WA 120LA 1L28A 3V2YA 1CUQA 1L67A 1OV5A 3DN8A 1KS3A 3DNAA 1DYCA 1NHBA 231LA 1L51A 261LA 156LA 200LA 2L78A 175LA 3GUOA 2RB1X 2RBRA 1D3FA 129LA 4EKPA 3GUKA 3F8VA 2RBNA 3LZMA 252LA 1PQOA 192LA 1XEPA 2RAZX 141LA 1D2WA 125LA 1L05A 2Q9DA 2OTYX 4EPIA 4I7QA 3SBBC 1L95A 1XJUA 171LA 3HT8A 4ARJA 201LA 1L20A 4DJHA 1L94A 1P2RA 2OU8A 1L11A 1LGUA 1L74A 1ZWNA 3HH5A 3HH4A 4YXCA 1L04A 195LA 1L42A 3OE8A 1PQKA 1QTBA 1B6IA 236LA 1C6HA 1LW9A 2B72A 1L10A 1L48A 1C6LA 228LA 1WTHA 4ARLA 2LCBA 4OO9A 3DN2A 4W59A 1KW5A 1C6AA 260LA 1L57A 1L53A 1G0KA 1L24A 2NTGA 222LA 1CV5A 190LA 1DYBA 1L08A 1C6QA 183LA 3C8QA 1L83A 1P64A 4E97A 176LA 1LGXA 1L18A 1L39A 1L09A 2B6TA 220LA 2OU9A 4I7RA 1C6CA 1L71A 155LA 1QS5A 110LA 238LA 1C66A 1T8AA 3G3XA 1L62A 2F32A 1PQIA 255LA 3SB9A 3OE0A 1P5CA 1LYGA 3FADA 3SN6R 1TLAA 107LA 2NTHA 1QTCA 4W56A 184LA 196LA 3HTGA 174LA 1L25A 4YXAC 109LA 1L92A 2B70A 2RBOA 3HTDA 3F9LA 262LA 2B6XA 3SB6A 1L27A 1QT6A 227LA 1L91A 2B73A 1L22A 1P2LA 4I7KA 3UONA 1L50A 1D9WA 3DN1A 223LA 1L32A 2QARC 1QUOA 3FA0A 230LA 152LA 1QT5A 159LA 2B6YA 5LZMA 1D2YA 1CV4A 1T6HA 3C7WA 139LA 2LZMA 3CDVA 111LA 3HT6A 3C81A 3NY8A 4DAJA 3C82A 191LA 215LA 2OTZX 170LA 1L33A 3PDSA 2ANVA 131LA 210LA 1L89A 2OE4X 4I7MA 3SB5A 1L16A 1CV0A 1LYIA 2HUMA 1SWYA 3GUIA 1QSQA 3HDEA 1QT3A 2RAYX 3HTBA 4ZPUA 1L70A 219LA 258LA 1L75A 3HWLA 1OVJA 1P56A 3D4SA 164LA 1L85A 216LA 1ZURA 1I6SA 2OU0X 4I7LA 158LA 242LA 1L49A 4W52A 4ARPA 1OWYA 3C80A 1CV3A 4LZMA 3SB7A 1C6TA 1L81A 1G07A 2HULA 234LA 1L54A 1G1VA 3SB8A 221LA 3HU9A 1L37A 4I7NA 3RUNA 114LA 1L61A 157LA 253LA 1L55A 198LA 1KY1A 1L21A 1JQUA 3DN0A 1L0KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0MX 1LWKA 1OUBA 5F81A 3DMZA 1GB5A 1C6MA 5B1GA 1UCOA 3CSZA 4H9CA 3DN3A 4XJIA 1LZTA 1B0DA 1F6RA 2F30A 3GULA 2WARA 3CDQA 1JISA 1XEIA 4OW1A 2OE7X 2FBDA 2Q9EA 2RH1A 3HH6A 1CV1A 2HEBA 211LA 6LZMA 104LA 1QT4A 1HNLA 240LA 1L13A 2QB0B 5DL9A 2OEAX 1LI6A 1BWHA 3FI5A 3L64A 1A4VA 1GF8A 4EXMA 1IP5A 3L2XA 2A7DA 1YAOA 2Z6BA 3TXDA 2MEEA 1T6VL 1IOTA 3A93A 249LA 1B5XA 1HEPA 3WW6A 1UIHA 4HP0A 4NHPA 1IOCA 132LA 2BQGA 2YDGA 168LA 5KXZA 1LSFA 1L45A 2LZ2A 1XFPL 5I4XA 2BPUA 1L26A 126LA 1LPYA 3CT5A 1LSEA 5ILFA 1LCNA 1P37A 1CKDA 5LYZA 2W1XA 1GF5A 3EBAB 1G0LA 197LA 2RBQA 1LYEA 2B7XA 2MEGA 1GFVA 1QS9A 1JTTL 1GB2A 1GDWA 1LSBA 119LA 5KXSA 1TCYA 3HU8A 1GE2A 3A92A 5I5QA 1L17A 1L02A 1WQNA 2RBSA 1INUA 3SBAA 1LYHA 3J6KA 1L15A 239LA 5F14A 189LA 1C7PA 232LA 1L58A 2HUKA 1I56A 2NWDX 4J1AA 1OUJA 4EOFA 1JWRA 1PQDA 3G3WA 1OQMA 4EKQA 1GB3A 5KXTA 1L35A 1C68A 163LA 4NGOA 1HEQA 235LA 1CJ7A 2F2NA 3A90A 1HMKA 5B06A 1C10A 1IWUA 3E3DA 4GRVA 3ATOA 1IC4Y 3W6CA 1QUDA 4IAPA 4DD2A 1L31A 2ZNWY 1LZ6A 1G0JA 5IDDA 1C6KA 4N1CC 3A3QA 1YANA 1L82A 4OOTA 1L72A 4M6DA 4DD9A 1ALCA 2MEFA 3AW7A 4LYZA 1GBZA 2H9KA 225LA 1LI2A 2HU3A 1OV7A 5LVHA 5I14A 1KNIA 3P66A 4ARMA 7LZMA 1L0JA 1G0GA 5I4WA 3DMVA 3C8RA 2MEDA 224LA 5C6IA 4NIJA 1REXA 2YBIA 1LJGA 208LA 1C61A 1FKQA 1L44A 1G0MA 5F9XA 1VAUA 1C63A 4EPFA 130LA 5J7CA 4ZEEA 160LA 3AYQA 1CU3A 4ARQA 4W58A 3AGIA 1IC5Y 2CDSA 3JR6A 2LZTA 4H9AA 1OP9B 3CDOA 172LA 4B4JA 3WL2A 133LA 3C8SA 6LYZA 1LHMA 3TMWA 1L56A 1D0LA 3T36A 1NBZC 1BB4A 1L36A 140LA 185LA 245LA 4LYCA 4B49A 2F4GA 1DKJA 2HEDA 2ZYPA 3GUNA 4ETCA 1L46A 5APFA 5HMVA 1EL1A 4TSBA 2C8OA 1NHBA 1L51A 1GXV2 156LA 1LMQA 200LA 2G4PA 3P64A 1YKXX 3WW5A 1XEPA 2W1MA 141LA 125LA 3SBBC 3TMXA 5L3HA 3HT8A 201LA 4DJHA 1LMNA 2OU8A 1L11A 1LGUA 3HH4A 1CJ8A 1L04A 1SQ2L 1XGUC 1B7PA 5IELA 5IHGA 1HFZA 1LW9A 4ZIXA 1WTHA 4ARLA 1XEJA 1GEVA 1WVUA 3ATNA 3RZ4A 5L9JA 1LMPA 4FJRA 1LJIA 222LA 1CV5A 4ETBA 4ET9A 4E97A 1KXYA 1DQJC 1L18A 1GDXA 3LYZA 1B5YA 1DPXA 4ANRA 1OUEA 4OWHA 1SLYA 1HSWA 4BS7A 1B7LA 1L71A 1BB3A 110LA 1YIKA 1JTPL 1PQIA 255LA 2XQOA 1LYGA 3SN6R 1GBOA 1TLAA 2NTHA 3W6BA 4W56A 184LA 196LA 3HTGA 1LJ4A 4YXAC 2B70A 2RBOA 1E8LA 4HPIA 3SB6A 4WM3A 3A67Y 1L91A 3UONA 1L50A 1QUOA 1LZRA 3WMKA 2B6YA 1IR7A 2LZMA 4DT3A 3IJVA 1LMAA 1LJNA 4J7VA 4B1AA 1I20A 1YL1X 1LSGA 2D6BA 131LA 2W1LA 1LYIA 5KKJA 3P4ZA 4DD7A 4WG7A 4UWUA 2HTXA 1P56A 2ZQ3A 1YAQA 2OU0X 242LA 3WULA 4ARPA 1JJ1A 2YBNA 1LZDA 1C6TA 1D0KA 2BQOA 3B72A 153LA 1XGTC 1IP7A 2YVBA 4XJDA 1GB7A 1IEEA 1G1VA 3SB8A 3HU9A 1L37A 4XN6A 253LA 4GLAA 1YL0X 4LYMA 4DD3A 1JKCA 4N1EI 1L0KA 3AZ5A 1PZYA 3F6ZA 4BADA 1XGPC 1NQIA 3A96A 1KW7A 4GCFA 2D4JA 1IX0A 1L00A 4DDBA 1T97A 1QTVA 3RZEA 1C62A 144LA 1OUFA 247LA 5A3ZA 1LHHA 2HEEA 1OYUA 1C6NA 1C08C 3EMSA 4N8ZA 3ZVQA 1LWGA 1GD6A 1KIPC 3N9CA 3N9AA 4B0DA 3OK0A 4B4IA 244LA 3ODUA 3W3EA 1Z55A 4NSIA 1WQMA 1PQMA 1CU2A 4I0CA 1RJCB 2Z2FA 1JPOA 1GF3A 4AQNA 1OUCA 4PRQA 2I25L 1C6GA 2AUBA 122LA 3G3VA 1SWZA 1IIZA 1LMOA 2DQJY 1I1ZA 3ZEKA 2B75A 1LSMA 162LA 3WYHA 1UUZC 1MELL 3A34A 1C60A 1LOZA 4I7PA 3OE9A 1GE4A 1BGIA 1QSAA 4H1PA 4IASA 1C69A 1OUAA 1VFBC 1V7SA 241LA 4J0LA 257LA 1DYAA 1LYOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2HUM A;  1SWY A;  3GUI A;  1QSQ A;  3HDE A;  1QT3 A;  2RAY X;  3HTB A;  4ZPU A;  1L70 A;  219L A;  258L A;  1L75 A;  3HWL A;  1OVJ A;  1P56 A;  3D4S A;  164L A;  1L85 A;  216L A;  1ZUR A;  1I6S A;  2OU0 X;  4I7L A;  158L A;  242L A;  1L49 A;  4W52 A;  4ARP A;  1OWY A;  3C80 A;  1CV3 A;  4LZM A;  3SB7 A;  1C6T A;  1L81 A;  1G07 A;  2HUL A;  234L A;  1L54 A;  1G1V A;  3SB8 A;  221L A;  3HU9 A;  1L37 A;  4I7N A;  3RUN A;  114L A;  1L61 A;  157L A;  253L A;  1L55 A;  198L A;  1KY1 A;  1L21 A;  1JQU A;  3DN0 A;  1L0K A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Q0M X;  1LWK A;  1OUB A;  5F81 A;  3DMZ A;  1GB5 A;  1C6M A;  5B1G A;  1UCO A;  3CSZ A;  4H9C A;  3DN3 A;  4XJI A;  1LZT A;  1B0D A;  1F6R A;  2F30 A;  3GUL A;  2WAR A;  3CDQ A;  1JIS A;  1XEI A;  4OW1 A;  2OE7 X;  2FBD A;  2Q9E A;  2RH1 A;  3HH6 A;  1CV1 A;  2HEB A;  211L A;  6LZM A;  104L A;  1QT4 A;  1HNL A;  240L A;  1L13 A;  2QB0 B;  5DL9 A;  2OEA X;  1LI6 A;  1BWH A;  3FI5 A;  3L64 A;  1A4V A;  1GF8 A;  4EXM A;  1IP5 A;  3L2X A;  2A7D A;  1YAO A;  2Z6B A;  3TXD A;  2MEE A;  1T6V L;  1IOT A;  3A93 A;  249L A;  1B5X A;  1HEP A;  3WW6 A;  1UIH A;  4HP0 A;  4NHP A;  1IOC A;  132L A;  2BQG A;  2YDG A;  168L A;  5KXZ A;  1LSF A;  1L45 A;  2LZ2 A;  1XFP L;  5I4X A;  2BPU A;  1L26 A;  126L A;  1LPY A;  3CT5 A;  1LSE A;  5ILF A;  1LCN A;  1P37 A;  1CKD A;  5LYZ A;  2W1X A;  1GF5 A;  3EBA B;  1G0L A;  197L A;  2RBQ A;  1LYE A;  2B7X A;  2MEG A;  1GFV A;  1QS9 A;  1JTT L;  1GB2 A;  1GDW A;  1LSB A;  119L A;  5KXS A;  1TCY A;  3HU8 A;  1GE2 A;  3A92 A;  5I5Q A;  1L17 A;  1L02 A;  1WQN A;  2RBS A; 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