1L24A

Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNPKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Enhanced protein thermostability from site-directed mutations that decrease the entropy of unfolding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l24A00
3GUJA 1LI3A 187LA 3HTBA 130LA 3HTDA 119LA 1L04A 4PK0A 1P36A 4ARMB 1QT8A 1L87A 1C65A 1L32A 210LA 218LA 1L53A 3HWLA 131LA 1L50A 1DYFA 1SWZA 2CUUA 1L62A 104LA 3HUAA 1LYEA 3HH4A 222LA 144LA 1CV0A 3GULA 1ZYTA 1L89A 201LA 4DAJA 5I14A 3F8VA 195LA 199LA 209LA 224LA 2OE4X 3SB8A 227LA 3NY8A 164LA 235LA 4ARQB 3HU9A 1CUQA 1L35A 1K28A 1ZWNA 1DYDA 2OEAX 3HDEA 1QTVA 1L81A 1D3MA 261LA 2F47A 1QUOA 1LWKA 1KS3A 1L36A 1G06A 4ARMA 1OWZA 1CV6A 1CX6A 160LA 220LA 3DKEX 1L85A 1QT3A 1KW5A 1L63A 1L83A 1WTHA 1T6HA 3JR6A 140LA 1QS5A 1D2YA 3UONA 1L54A 1C62A 3V2YA 157LA 1P5CA 3HT7A 1C6MA 2B73A 147LA 2RBRA 2RBPA 1LYHA 2O7AA 4I7PA 1L21A 1L66A 2NTHA 3RZEA 165LA 1T8AA 113LA 221LA 257LA 3GUNA 2O79A 4ARQA 1LYFA 3HTGA 1L90A 4AQNA 189LA 1XJUA 1ZURA 1C6BA 1L84A 175LA 1L28A 200LA 239LA 108LA 234LA 1L08A 4EKPA 1LW9A 1L97A 3SBBC 1P56A 1L41A 4ZPUA 1EPYA 3G3XA 1XJTA 2O4WA 102LA 3DMZA 171LA 1OV5A 1L34A 1LGWA 4K5YA 1L01A 1C60A 3HT6A 3FI5A 123LA 1L74A 2LCBA 2RAYX 6LZMA 254LA 4EPIA 188LA 1DYGA 1L95A 3EMLA 155LA 196LA 4ARPA 1I6SA 149LA 2Q9EA 1OV7A 223LA 1CTWA 3L2XA 1L96A 2LZMA 3HTFA 228LA 1SWYA 214LA 3HH3A 4LDEA 161LA 1L11A 229LA 2RBSA 1CV3A 251LA 2B6YA 1CU0A 1L57A 2B6TA 1P2RA 120LA 1C6HA 3QAKA 128LA 2B6WA 1L42A 1QTCA 2HUKA 4I7SA 1QSQA 182LA 1CVKA 3OE0A 3HT9A 2LC9A 2RBNA 3C81A 3C82A 4DJHA 219LA 211LA 1QT4A 3DN3A 248LA 168LA 1L72A 1L03A 1LLHA 1L22A 1QUGA 1XEPA 3L64A 1C63A 163LA 1L09A 2Z6BA 1P64A 3HH5A 1P7SA 1DYAA 1C6JA 184LA 2HUMA 1PQDA 4W51A 4I7JA 1L68A 137LA 127LA 1C66A 1C6DA 2OU0X 2NTGA 115LA 1L80A 2RBOA 4W52A 259LA 1L39A 3G3VA 4I7KA 1L0KA 1C6NA 1C6CA 1L65A 241LA 2OU8A 103LA 3NY9A 3RUNA 138LA 1C68A 110LA 1C69A 1DYEA 4W58A 1LI6A 1L40A 4W54A 246LA 4YXCA 1CV1A 2B74A 1L99A 1L26A 180LA 4LDOA 181LA 172LA 4W53A 3C8RA 150LA 4GBRB 1G0PA 3C83A 3G3WA 1PQKA 2RB1X 1CU3A 1P6YA 217LA 2A4TA 1LPYA 1L27A 4W56A 3CDRA 213LA 1L44A 1QSBA 170LA 148LE 185LA 1L37A 1DYCA 1L98A 1G0GA 2ANVA 177LA 2RBQA 3SB9A 169LA 1L58A 2F2QA 4W55A 4EKRA 1L71A 243LA 1C6AA 1L46A 1L91A 1LI2A 3K2RA 1L56A 1L55A 1PQIA 3F9LA 1LYJA 1P3NA 1L30A 158LA 1L82A 2B70A 159LA 192LA 225LA 1SX7A 1CU5A 1JQUA 1QTBA 2L78A 1JTNA 3PDSA 2B75A 2IGCA 1C6PA 1LWGA 3C7YA 3DN0A 4YXAC 1L16A 1G0QA 3V2WA 3DN4A 3DNAA 1KW7A 2RB2X 1LGXA 236LA 3CDOA 1L25A 231LA 1L73A 2F32A 3C8SA 250LA 1L47A 1OVHA 4EKQA 1G0LA 3DMVA 238LA 174LA 186LA 1QS9A 3GUOA 1L0JA 247LA 3HDFA 1L92A 1B6IA 1L69A 3VW7A 4I7MA 143LA 1L43A 1L12A 114LA 215LA 4I7OA 4OO9A 1C6QA 2B7XA 4LDLA 4I7QA 3GUKA 5LZMA 1L51A 1OYUA 4W59A 3C7WA 1LYIA 1D2WA 2B72A 4I7RA 1QTDA 3DN6A 2HULA 183LA 1TLAA 176LA 1LYDA 1QUHA 253LA 3CDQA 3FADA 4LZMA 1NHBA 1OVKA 129LA 1CU2A 178LA 3SN6R 3DN8A 3NYAA 1L86A 1CUPA 1L75A 1OWYA 3CDVA 126LA 256LA 1T8FA 1G1WA 151LA 1KNIA 1L45A 2B6ZA 4I7NA 242LA 118LA 3HH6A 1L52A 1L59A 1L76A 230LA 4W57A 1G0KA 206LA 1L70A 4I7TA 1CX7A 262LA 152LA 3SB7A 1C6KA 1KY0A 3SBAA 4EKSA 1L19A 3LZMA 1L93A 255LA 3OE9A 1L48A 4ARLA 1P2LA 1L07A 1CU6A 1C61A 145LA 3C80A 1JTMA 1L94A 1QTHA 139LA 1T97A 1G1VA 1C6LA 3D4SA 1CV4A 3DN2A 1L49A 7LZMA 142LA 1QUDA 1L00A 2B6XA 3GUPA 1C6IA 1L02A 4E97A 216LA 1C6EA 1QT5A 3FA0A 1LYGA 1OVJA 1G0JA 1L13A 2QARC 1C6TA 1D3JA 156LA 1PQMA 3DMXA 1G07A 3ODUA 4EPFA 122LA 4EJ4A 1L24A 1C64A 1KY1A 4IAPA 112LA 1L06A 1LGUA 1L61A 1L60A 1PQJA 1L15A 1L29A 1C6GA 2OE7X 2OTZX 3OE6A 198LA 3PBLA 249LA 167LA 1L33A 1QT6A 1CV5A 233LA 2ANXA 173LA 3GUIA 260LA 4PJZA 1P46A 1L20A 2RAZX 1L17A 191LA 4S0WA 1C6FA 111LA 226LA 1SX2A 3GUMA 245LA 2QB0B 3C7ZA 205LA 1D3NA 232LA 1L64A 1T8GA 146LA 3HUKA 4YX7C 1L10A 1QT7A 1QTZA 1SSYA 1L23A 2OU9A 237LA 141LA 125LA 1PQOA 1D3FA 1L77A 1G0MA 3HU8A 1L14A 166LA 1L79A 3DN1A 2RH1A 244LA 3HUQA 1L88A 197LA 4EXMA 109LA 1L67A 4GRVA 1C67A 1L31A 4DKLA 107LA 1DYBA 4ARJA 1L18A 212LA 1P37A 2RB0X 3SB6A 1SSWA 2Q9DA 2OE9X 252LA 3HT8A 1L05A 3SB5A 2OTYX 3C8QA 190LA 240LA 3OE8A 3CDTA 4I7LA 162LA 258LA 1D9WA 1L38A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5L3IA 187LA 4KXIA 4TSCA 4Z41A 3TMWA 1C65A 4LZTA 4B49A 3HWLA 2F4AA 1L62A 3J4GA 4WO6A 3GULA 1ALCA 1OUCA 1L89A 4LFPA 4DAJA 2DQFC 3F8VA 3LZTA 209LA 1LZRA 4DD3A 1IP4A 164LA 235LA 1VDPA 4NWEA 2MEDA 2BQGA 1IP2A 1JTTL 4TSBA 1ZWNA 1OUHA 2G4QA 2OEAX 4J1BA 1QTVA 1L81A 1GB0A 1L36A 4ARMA 3WU8A 1IVMA 1CV6A 2F4GA 1CX6A 160LA 1L85A 1QT3A 1KW5A 1P2CC 1G7MC 193LA 5J7CA 1LJEA 1IOSA 140LA 1YKZX 3TMXA 1D2YA 1VDSA 1LMQA 4UWVA 3V2YA 132LA 4HJYA 3WVYA 2RBRA 5KXRA 1GB5A 2NTHA 1D0MA 1LMPA 1T8AA 3A6BY 113LA 4MCKA 1UICA 4ARQA 1LYFA 4HV2A 1ZURA 1L84A 200LA 175LA 108LA 4NGZA 2W1XA 5B1FA 1LW9A 3E3DA 1GDWA 1EQ5A 1B0DA 2G4PA 102LA 3DMZA 3A90A 1L34A 1LGWA 1B5YA 3HT6A 4NGJA 3MGWA 2FBDA 2RAYX 2LCBA 3ZVQA 4C5FA 3W6EA 188LA 1J1PY 3CT1A 5C6JA 3EMLA 3WU7A 4ARPA 5I5QA 3CT5A 2Q9EA 4WG1A 1CTWA 1L96A 2LZMA 4RLMA 4NGIA 3FE0A 3KAMA 161LA 3WULA 1UIEA 1L11A 2RBSA 1CV3A 1DKJA 2XBRA 1EQ4A 2B6TA 120LA 1C6HA 2CGIA 4DYGA 1B7QA 1L42A 1LZCA 4I7SA 2Z19A 182LA 1CVKA 3WXTA 2LC9A 3WUNA 4NSGA 1F6RA 2HEDA 248LA 5KXZA 1L09A 1NHEA 1C6JA 1PQDA 1D0KA 1C66A 4WM3A 2RBOA 259LA 4H91A 3WU9A 3A34A 1B7SA 2D4JA 3G3VA 5APDA 2ZNWY 1C6CA 1YQVY 3A6CY 4WOAA 1DYEA 4XJGA 1L40A 3A3QA 5KKIA 2B74A 2HU3A 3VWOA 2D4IA 4H9BA 3C83A 1BB6A 1PQKA 2RB1X 3CSQA 5F9UA 1TEWA 4DWXA 1J1XY 213LA 148LE 4J0LA 1L98A 1XGRC 1DI5A 1G0GA 4NSHA 177LA 5B59A 1UC0A 1L71A 4UWNA 1L56A 4OWBA 1LZ9A 1HSWA 1LYJA 5I4WA 2YDGA 1IX0A 1JSFA 3CQLA 3M3UA 192LA 225LA 1JKBA 1SX7A 3D9AC 1JTNA 3WPLA 2IGCA 3DN0A 1GB9A 1UACY 4YXAC 1G0QA 1G7HC 3AW6A 3F6ZA 2HTXA 1LGXA 2F32A 2DQJY 3C8SA 2VB1A 1L47A 1YL0X 1EQEA 3W6AA 3AGHA 4NG8A 5FCPA 5K7OA 2D91A 1V7SA 1LPIA 3VW7A 143LA 1B9OA 114LA 1FN5A 3RT5X 4OO9A 1C6QA 3OK0A 4G4HA 4H9AA 1OYUA 3C7WA 2MEHA 4NSIA 1UIFA 1D2WA 183LA 3P4ZA 1TLAA 2BPUA 1JJ3A 5D5FA 129LA 4DC4A 3DN8A 3P68A 2YVBA 1NDMC 1LZYA 4YM8A 3ATOA 1DPWA 1T8FA 3EO5A 1H87A 151LA 1KNIA 1LJ4A 118LA 1L52A 1L59A 4XN6A 4W57A 2I26L 3RU5A 1XGQC 1CX7A 1LZ5A 4FDYA 4EKSA 1HEWA 3WVXA 3OE9A 1GF8A 2BQOA 3C80A 1C46A 1QTHA 5E9RA 3TXBA 5KXTA 3A95A 1AT5A 1JKAA 3DN2A 7LZMA 142LA 133LA 1NF5A 1NBYC 1C6EA 1QT5A 1LYGA 4YOPA 1OVJA 1G0JA 1C6TA 3DMXA 4UWUA 1G07A 2BQDA 5HNCA 1L24A 1KY1A 4AGAA 1IIZA 1GB3A 1JUGA 5KXMA 4H94A 1L29A 2OE7X 3OE6A 3PBLA 249LA 1L33A 5FELA 1CV5A 1YIKA 233LA 173LA 260LA 4WG7A 1TDYA 1EL1A 1L20A 1OUBA 2HEFA 3WUMA 1GAZA 3TXFA 1GDXA 245LA 4TX7A 1YAOA 1D3NA 1L64A 1OUGA 3HUKA 1DPXA 4PRUA 4YX7C 2EKSC 1QT7A 5IHGA 1LZGA 3ATNA 4LYOA 1L77A 1GBOA 135LA 4HJZA 1L79A 1LYOA 1QDTA 244LA 5HLLA 1L88A 1HELA 1L67A 1VEDA 1GEZA 107LA 1P37A 1HSXA 2RB0X 4NY5A 1SSWA 2Q9DA 1H6MA 1PS5A 2OE9X 252LA 1L05A 3SB5A 2OTYX 3C8QA 190LA 3TMUA 3OJPA 4I7LA 1BWJA 5IDDA 4XENA 3LN2A 4ARMB 3LYZA 4DD2A 1LI3A 1WQOA 3HTBA 3HTDA 1OUFA 1L04A 2F30A 4NHQA 1P36A 1TCYA 4WL7A 1L87A 1HHLA 218LA 1L50A 4N1CC 1IP6A 5HMJA 2MECA 4I8SA 4OOOA 201LA 5I14A 1JTPL 1O23A 1CNSA 4XJDA 4I0CA 4ARQB 3EBAB 1G7LC 2BLXA 1IC7Y 1KXWA 1WVUA 1K28A 2Z2EA 1GFGA 261LA 5LVIA 1KS3A 1OWZA 1DQJC 4KL7A 220LA 3DKEX 1LSEA 3ZVQB 1LSBA 3JR6A 3AZ6A 5D5CA 3LHMA 1AKIA 4ANRA 194LA 1WTNA 1TBYA 5FSTA 1P5CA 2B73A 4N9RA 147LA 1INUA 4I7PA 1L21A 1L66A 3A91A 3AW7A 4ETDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5L3I A;  187L A;  4KXI A;  4TSC A;  4Z41 A;  3TMW A;  1C65 A;  4LZT A;  4B49 A;  3HWL A;  2F4A A;  1L62 A;  3J4G A;  4WO6 A;  3GUL A;  1ALC A;  1OUC A;  1L89 A;  4LFP A;  4DAJ A;  2DQF C;  3F8V A;  3LZT A;  209L A;  1LZR A;  4DD3 A;  1IP4 A;  164L A;  235L A;  1VDP A;  4NWE A;  2MED A;  2BQG A;  1IP2 A;  1JTT L;  4TSB A;  1ZWN A;  1OUH A;  2G4Q A;  2OEA X;  4J1B A;  1QTV A;  1L81 A;  1GB0 A;  1L36 A;  4ARM A;  3WU8 A;  1IVM A;  1CV6 A;  2F4G A;  1CX6 A;  160L A;  1L85 A;  1QT3 A;  1KW5 A;  1P2C C;  1G7M C;  193L A;  5J7C A;  1LJE A;  1IOS A;  140L A;  1YKZ X;  3TMX A;  1D2Y A;  1VDS A;  1LMQ A;  4UWV A;  3V2Y A;  132L A;  4HJY A;  3WVY A;  2RBR A;  5KXR A;  1GB5 A;  2NTH A;  1D0M A;  1LMP A;  1T8A A;  3A6B Y;  113L A;  4MCK A;  1UIC A;  4ARQ A;  1LYF A;  4HV2 A;  1ZUR A;  1L84 A;  200L A;  175L A;  108L A;  4NGZ A;  2W1X A;  5B1F A;  1LW9 A;  3E3D A;  1GDW A;  1EQ5 A;  1B0D A;  2G4P A;  102L A;  3DMZ A;  3A90 A;  1L34 A;  1LGW A;  1B5Y A;  3HT6 A;  4NGJ A;  3MGW A;  2FBD A;  2RAY X;  2LCB A; 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