1L34A

High-resolution structure of the temperature-sensitive mutant of phage lysozyme, arg 96 (right arrow) his
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRHCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution structure of the temperature-sensitive mutant of phage lysozyme, Arg 96----His.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l34A00
4EXMA 1SWZA 1L49A 1CV1A 1OYUA 1CV0A 3SN6R 3RUNA 130LA 1L09A 3HH5A 1D9WA 4W57A 1L41A 1L34A 230LA 3D4SA 5LZMA 1CU5A 1OVKA 1PQOA 1CUPA 1C65A 2B6ZA 2F32A 2RBSA 3DN6A 1C62A 2B7XA 195LA 1SWYA 119LA 4EPFA 1G1VA 1L74A 1L95A 146LA 1QS5A 1L29A 1P5CA 1SSWA 1B6IA 3UONA 1CU3A 3GULA 4YXAC 242LA 1L83A 3OE0A 1OVJA 1ZWNA 1L81A 1L56A 1L38A 1KW7A 1T8AA 1P64A 4W59A 3G3XA 251LA 3NY9A 166LA 1L35A 1L02A 125LA 206LA 168LA 1QT3A 1P46A 4PK0A 255LA 3C81A 5I14A 186LA 3DN0A 3SBBC 2CUUA 2OTYX 1CU6A 1L12A 183LA 1L59A 139LA 1XJUA 1L43A 1SSYA 1G0JA 3OE9A 1C69A 1OVHA 4W51A 4I7SA 1PQJA 216LA 1G0GA 3OE8A 138LA 1PQKA 3DN2A 2Q9EA 3HH6A 150LA 110LA 4DKLA 3NYAA 1C64A 2OU8A 1QTZA 3SB8A 1L15A 3HT7A 2NTGA 3HU8A 3HUKA 1QUGA 4EKSA 1G0MA 1C60A 1L53A 3GUIA 1T97A 1JTMA 178LA 1LI3A 2NTHA 1C6QA 1L82A 196LA 1PQDA 1QT8A 3K2RA 169LA 4ARQA 1JTNA 1QTCA 1L96A 6LZMA 3PDSA 1L75A 140LA 4I7MA 4EKRA 147LA 2OE7X 2RB0X 4YXCA 2RBQA 1QSQA 3CDRA 1QUOA 2OEAX 4AQNA 149LA 253LA 164LA 3CDOA 1D2YA 1QTHA 1K28A 3SB6A 1L01A 3PBLA 1QSBA 1D3MA 232LA 1T8GA 237LA 109LA 1LYGA 128LA 1CVKA 4ARLA 257LA 3DN8A 123LA 1L86A 256LA 1L92A 2O79A 2RBRA 1L46A 3FI5A 174LA 254LA 126LA 1DYGA 1LWKA 1QTVA 229LA 4EJ4A 217LA 200LA 1L26A 1C61A 3VW7A 155LA 1G07A 214LA 262LA 1L04A 2IGCA 148LE 1L91A 4DAJA 1ZYTA 224LA 4I7JA 1L39A 3C83A 4I7PA 3DN3A 1L89A 3HH3A 3SB7A 1DYFA 3HDEA 2L78A 220LA 1P7SA 7LZMA 260LA 221LA 240LA 162LA 171LA 1L88A 198LA 2O7AA 3DN4A 235LA 2RAYX 3QAKA 1T8FA 215LA 1C6HA 2A4TA 172LA 1G0LA 1L40A 4ARJA 180LA 4I7QA 1CU0A 1TLAA 1L54A 3CDTA 2F47A 103LA 1L76A 114LA 2HUKA 4OO9A 4IAPA 1QT7A 4LDLA 3V2YA 2LZMA 4I7KA 1QUDA 4I7TA 3L64A 201LA 3HWLA 4GBRB 1C6IA 1OV5A 1QT6A 4I7RA 1L94A 3LZMA 2B6XA 1LPYA 1L13A 4ARPA 1L87A 3HTFA 1DYEA 4W52A 1L73A 1L06A 104LA 156LA 4I7OA 152LA 1OWYA 3GUKA 222LA 1OV7A 1P37A 4ZPUA 3C8QA 2Q9DA 197LA 3C82A 225LA 1L52A 1LYEA 3OE6A 3DMZA 1L21A 1WTHA 1L77A 2LC9A 3GUPA 1QT4A 1DYBA 1L62A 1L33A 1C66A 1L57A 1L93A 2HUMA 3G3VA 2OU0X 188LA 1L85A 1L19A 182LA 2B6YA 3CDVA 3JR6A 118LA 1CV6A 1D3NA 1L60A 120LA 1KW5A 2QARC 1L69A 2OE9X 252LA 4LZMA 1C6AA 1QT5A 205LA 2ANXA 1L10A 2RBNA 1L50A 4ARMA 1LGWA 250LA 2RBOA 243LA 3CDQA 1C63A 131LA 3C8SA 1L36A 4W53A 1D3FA 1QTDA 3DN1A 129LA 1DYCA 1LYJA 3C80A 212LA 1D2WA 1PQMA 4YX7C 3HTBA 2RAZX 1L51A 261LA 1P2RA 219LA 247LA 2ANVA 163LA 3G3WA 199LA 1C6EA 1L0JA 2B75A 4DJHA 1LYHA 102LA 2B73A 111LA 2RB2X 108LA 213LA 4ARQB 1D3JA 3FADA 3SBAA 3HTGA 1P36A 1C6TA 2B6TA 1EPYA 1L63A 239LA 1LI6A 3F8VA 157LA 189LA 2HULA 1L68A 1L22A 234LA 1LLHA 151LA 1P6YA 3SB9A 185LA 2F2QA 2B6WA 4ARMB 1KNIA 2B72A 190LA 127LA 3GUJA 1L47A 1L11A 1C6MA 3HH4A 1L58A 3RZEA 1L31A 144LA 3HUQA 1C68A 3DMXA 1LYDA 3V2WA 223LA 3SB5A 176LA 1C6LA 4GRVA 4W54A 1L08A 218LA 258LA 1CV3A 4EPIA 4EKPA 1L16A 1ZURA 4E97A 3C8RA 3GUOA 1L64A 1PQIA 1QUHA 1L71A 1L17A 1L07A 1L65A 1OWZA 236LA 244LA 1L42A 4W56A 241LA 1L03A 165LA 2OTZX 2O4WA 3NY8A 175LA 4I7NA 2B74A 122LA 1C6NA 233LA 184LA 226LA 1L23A 137LA 2OE4X 3HDFA 1L70A 1CV4A 1LWGA 3GUNA 161LA 3HU9A 3HTDA 1C6FA 4S0WA 3FA0A 1L37A 1DYDA 1C6BA 3F9LA 1KY0A 1CX7A 1L20A 143LA 3HT9A 3DMVA 238LA 259LA 1L18A 1L28A 191LA 167LA 1L14A 4PJZA 115LA 160LA 112LA 1DYAA 3DNAA 1QS9A 158LA 1CV5A 3HT8A 1L44A 1C6PA 3HUAA 2LCBA 1G1WA 1JQUA 246LA 3C7WA 4W55A 4LDOA 181LA 3EMLA 1G06A 2B70A 209LA 1KY1A 1XJTA 4W58A 1KS3A 1C6GA 177LA 2Z6BA 1XEPA 145LA 1G0PA 1L30A 1L25A 1C6KA 3C7YA 1L27A 3L2XA 2QB0B 1L61A 1L80A 141LA 1L32A 1L98A 2RBPA 1C6DA 1L72A 1C6JA 231LA 1L79A 1NHBA 1P3NA 249LA 1L97A 1C6CA 3HT6A 210LA 1G0QA 1LGUA 2RB1X 1T6HA 245LA 1LGXA 1LW9A 1CX6A 173LA 1CU2A 1LYIA 227LA 2RH1A 3DKEX 192LA 1SX2A 1CTWA 1L24A 4K5YA 1L55A 1L67A 107LA 1G0KA 170LA 1C67A 3GUMA 1L05A 1L90A 248LA 4EKQA 211LA 142LA 1L84A 1L66A 1L00A 3ODUA 1L48A 159LA 1QTBA 2OU9A 113LA 1P2LA 228LA 1L45A 1P56A 1CUQA 4I7LA 1LYFA 3C7ZA 1I6SA 187LA 1L99A 1SX7A 1L0KA 1LI2A 4LDEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IFFY 2B5ZA 4UWUA 4PJ2C 4EXMA 1VDQA 4WMGA 4GCFA 4NIJA 3WULA 5HNCA 3T36A 130LA 4R0FA 230LA 2G4NA 2MEDA 1OVKA 6LYZA 1PQOA 1CUPA 4DD0A 2G4PA 2RBSA 4ETBA 195LA 1JITA 1SWYA 119LA 5T3FA 3M18B 4EPFA 4NGJA 1DPXA 1G1VA 146LA 1P5CA 1SSWA 4LYZA 3W6FA 2DQCY 5FSTA 4XJBA 1L81A 1T8AA 1V7TA 1P64A 4FJRA 4W59A 1XGQC 1LKRA 4TSBA 206LA 1B7SA 1LZ6A 1GFRA 4B49A 5I14A 4HTQA 2CUUA 1CU6A 1GE3A 1LJIA 2EKSC 2DQAA 139LA 1L43A 3OE9A 3RZ4A 1D0MA 1G0GA 4RLNA 1B7NA 1LSNA 3TMUA 2DBTA 2OU8A 5B59A 3SB8A 5K7OA 4EKSA 3W6CA 1GDXA 2ZNWY 1RJCB 4X3BA 4DQ5A 3G3AB 1G7IC 5L9JA 2YDGA 3A6BY 4WOAA 2G4QA 5HQ1A 2MEGA 2BLXA 2RB0X 1B5UA 2OEAX 3TXJA 1GE4A 3WU8A 4RW1A 5F9XA 1G7JC 1D2YA 1QTHA 3WH1A 1LSBA 5KKIA 1GB9A 5KXZA 4ETEA 1BGIA 3VWOA 4WL6A 1CVKA 1B7LA 257LA 3AGGG 4GLVA 123LA 1LZ5A 2DQEY 3FI5A 3OJPA 4C5FA 4WO9A 2BQKA 5LAGA 4WM2A 1VEDA 1LWKA 1KXWA 3W6EA 5I5QA 262LA 1BB3A 1HMKA 4DAJA 1ZYTA 3HH3A 1DYFA 2L78A 4W96A 1P7SA 7LZMA 260LA 1LZYA 1JTOL 4PRUA 2F4AA 1LSDA 4E3UA 1IOCA 1VDPA 2RAYX 1G7HC 2H9KA 1WVVA 1IOTA 1B5ZA 1GE2A 4ARJA 4I7QA 4O34A 1L54A 1HFYA 1L76A 3HBHA 1UIHA 4A7DA 2LYZA 5KXNA 1QT7A 4XYYA 2HEEA 1UBZA 1GF8A 2DQFC 1B7MA 3L64A 2BQBA 3HWLA 1C6IA 1OV5A 3TMVA 4I7RA 1LHKA 1LPYA 1B9OA 2BQNA 1L87A 4Z41A 1HMLA 4MCKA 5C6IA 5EBHA 1J1PY 1OUDA 1OWYA 1DI4A 4ZPUA 2Z39A 1G7LC 4EMNA 4J7VA 1B5YA 225LA 2BAAA 1LYEA 3DMZA 1L21A 1WTHA 1C66A 2HUMA 1W08A 2OU0X 1L85A 1FBIX 208LA 1CV6A 5FHWA 1KW5A 2QARC 2OE9X 2BQHA 2D4IA 1C6AA 2XBSA 6LYTA 3CT0A 3WU9A 1FN5A 134LA 1RCMA 4NGOA 2RBOA 243LA 4NSJA 5APFA 131LA 2HEBA 3C8SA 1QTDA 1DYCA 1LYJA 4DYGA 2LZTA 4LT1A 1JKAA 2RAZX 2YBMA 1OUAA 2H5ZA 247LA 2DQJY 4DWXA 5KY1A 5KXMA 163LA 4RDSA 1LJ4A 3ZVQA 1C6EA 1BWIA 1L0JA 2B75A 8LYZA 1LYHA 4R6CA 2B73A 1BB6A 1IX0A 1XGPC 4ARQB 1BB5A 1D3JA 2DKVA 2YBIA 1C6TA 1LCNA 4NGVA 1RI8B 189LA 3J6KA 3AGIA 1OUEA 1LLHA 151LA 5F81A 4NSHA 3HH4A 1C68A 3DMXA 1OUCA 3V2WA 4WM6A 1IWUA 1W6ZA 1L08A 4HV1A 4EKPA 1IP6A 3P4ZA 4OWBA 2D91A 4ZIXA 1WQMA 4NHSA 2ZILA 4OOTA 1ZV5L 1GFJA 1L03A 2OTZX 5DLAA 2O4WA 175LA 2B74A 1C6NA 4AGAA 3A67Y 1LZ4A 4Z46A 1HF4A 4H8XA 4HTKA 3HT9A 3DMVA 259LA 3HBEX 2HECA 191LA 1DI5A 1JTPL 4HP0A 5J7CA 5KXKA 1HEWA 4WM4A 4XN6A 2BLYA 5F9UA 5I4WA 3QNGA 3HUAA 1IR9A 4IASA 5IDDA 3AYQA 1G06A 1C10A 1KY1A 3OK0A 5LINA 1GF5A 1OQMA 1IP4A 1VAUA 1TDYA 1JTTL 1C6KA 4GCDA 1AKIA 4WLXA 1JKCA 1A4VA 1GAZA 1GF0A 1LHLA 1GFAA 1CKGA 4LFXA 249LA 3A96A 4QGZA 1QTKA 1LSZA 3LN2A 2ZYPA 2RB1X 5C6LA 1LHMA 1LW9A 1CX6A 1EQEA 1SLYA 1CU2A 3A8ZA 3DKEX 1D6QA 4K5YA 1T6VL 1L55A 1PS5A 5LVKA 3SP3A 1YAMA 5LAFA 5LVGA 1L05A 4QDNA 1GBZA 5I53A 1L66A 1L00A 1L48A 113LA 1P2LA 228LA 1P56A 1LMNA 2HUBA 4I7LA 1HHLA 3ATNA 3RT5X 1L80A 1HELA 1CV1A 5JENB 1OYUA 9LYZA 1GF7A 1IP2A 1AT6A 1L34A 5LZMA 4L41A 5IELA 4ML7A 4CFOA 1LJHA 1L29A 3UONA 242LA 4LFPA 1YKYX 1L56A 5L3IA 4G9SA 3G3XA 1IWVA 1YIKA 251LA 3NY9A 1TBYA 1IP3A 166LA 3CB7A 1QT3A 1P46A 3C81A 3DN0A 2F30A 1L12A 1L59A 1XJUA 1SSYA 1G0JA 4W51A 1QTEA 1JJ1A 4I7SA 216LA 3OE8A 4DQ7A 3DN2A 2Q9EA 4DKLA 150LA 1JKDA 3NYAA 5KXTA 1QTZA 4H9AA 1IY3A 2W1XA 2NTGA 1D0LA 1LZ8A 1QUGA 3M3UA 3FE0A 1L53A 1LSCA 1QDRA 2LZ2A 1LSAA 178LA 3A94A 1LSGA 2NTHA 3CQLA 1B5WA 196LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2IFF Y;  2B5Z A;  4UWU A;  4PJ2 C;  4EXM A;  1VDQ A;  4WMG A;  4GCF A;  4NIJ A;  3WUL A;  5HNC A;  3T36 A;  130L A;  4R0F A;  230L A;  2G4N A;  2MED A;  1OVK A;  6LYZ A;  1PQO A;  1CUP A;  4DD0 A;  2G4P A;  2RBS A;  4ETB A;  195L A;  1JIT A;  1SWY A;  119L A;  5T3F A;  3M18 B;  4EPF A;  4NGJ A;  1DPX A;  1G1V A;  146L A;  1P5C A;  1SSW A;  4LYZ A;  3W6F A;  2DQC Y;  5FST A;  4XJB A;  1L81 A;  1T8A A;  1V7T A;  1P64 A;  4FJR A;  4W59 A;  1XGQ C;  1LKR A;  4TSB A;  206L A;  1B7S A;  1LZ6 A;  1GFR A;  4B49 A;  5I14 A;  4HTQ A;  2CUU A;  1CU6 A;  1GE3 A;  1LJI A;  2EKS C;  2DQA A;  139L A;  1L43 A;  3OE9 A;  3RZ4 A;  1D0M A;  1G0G A;  4RLN A;  1B7N A;  1LSN A;  3TMU A;  2DBT A;  2OU8 A;  5B59 A;  3SB8 A;  5K7O A;  4EKS A;  3W6C A;  1GDX A;  2ZNW Y;  1RJC B;  4X3B A;  4DQ5 A;  3G3A B;  1G7I C;  5L9J A;  2YDG A;  3A6B Y;  4WOA A;  2G4Q A;  5HQ1 A;  2MEG A;  2BLX A;  2RB0 X;  1B5U A;  2OEA X;  3TXJ A;  1GE4 A;  3WU8 A;  4RW1 A;  5F9X A;  1G7J C;  1D2Y A;  1QTH A;  3WH1 A;  1LSB A;  5KKI A;  1GB9 A; 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