1L44A

Cumulative site-directed charge-change replacements in bacteriophage t4 lysozyme suggest that long-range electrostatic interactions contribute little to protein stability
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLEMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Cumulative site-directed charge-change replacements in bacteriophage T4 lysozyme suggest that long-range electrostatic interactions contribute little to protein stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l44A00
4W57A 174LA 223LA 2RBNA 107LA 1L22A 242LA 183LA 165LA 1G0PA 1CU6A 3EMLA 1OWYA 3SB7A 1P36A 3GULA 4EKPA 1QTHA 1L09A 4I7JA 1L75A 1L35A 1PQKA 2IGCA 1L54A 4EPIA 1P2LA 1L89A 3GUIA 2Q9DA 2O7AA 189LA 239LA 2Q9EA 232LA 1L23A 1DYGA 1QTCA 1G06A 1L69A 255LA 1ZURA 3DN3A 1OWZA 1C6BA 1L80A 2RBRA 137LA 230LA 3HH3A 1LLHA 205LA 1OVHA 1L97A 3CDRA 4LDLA 4I7SA 4GBRB 1QTDA 1LGUA 2CUUA 3HUKA 3SB8A 1QT7A 212LA 1TLAA 3HTFA 2HUMA 130LA 1L81A 1G1VA 141LA 4ARJA 254LA 237LA 4ARQA 3HTBA 3F9LA 1SX2A 1L46A 2LZMA 228LA 1L36A 1L74A 1B6IA 7LZMA 1L26A 3SN6R 1L0JA 1L56A 1L37A 192LA 146LA 1CVKA 2B74A 1CUQA 147LA 182LA 3CDOA 151LA 3NY9A 1DYDA 160LA 4EPFA 3C7WA 4ZPUA 1OV5A 3FA0A 1L41A 1L90A 1LYIA 3HUAA 2F32A 1DYAA 1EPYA 1LI2A 1G0GA 187LA 3PBLA 2RBPA 1L98A 1L15A 3OE9A 3V2WA 2HULA 257LA 3SB6A 1L67A 1L53A 113LA 1L30A 253LA 150LA 1C6DA 1KW5A 1L17A 148LE 1QSBA 3L2XA 4LDEA 4S0WA 1L57A 178LA 1QT6A 3C7YA 3HU9A 1LYFA 2F2QA 2OU8A 1D3MA 201LA 1L21A 112LA 2RB0X 227LA 1LI3A 1QTBA 3DKEX 3C82A 3C80A 218LA 180LA 1XJTA 3DMVA 2B6ZA 175LA 1SWYA 2LCBA 5I14A 3GUMA 1XJUA 3DNAA 173LA 1CU2A 1CX6A 2RBQA 1CV6A 1C6PA 1CU5A 1CV1A 1QUGA 1C6MA 4I7QA 260LA 2B73A 3HUQA 143LA 1L76A 236LA 1D3JA 1LPYA 3HH6A 2QB0B 1L59A 217LA 222LA 114LA 1DYCA 1L48A 4W54A 3OE8A 3HT8A 1C6GA 3K2RA 1LGXA 195LA 197LA 1L62A 3SB5A 1L96A 1L47A 3HH5A 2HUKA 1L65A 2QARC 1C67A 1CV4A 1L49A 1T8GA 2A4TA 1L66A 1LW9A 1CV0A 1L14A 245LA 3C83A 1L13A 1LYDA 4AQNA 1QTVA 142LA 1L84A 123LA 221LA 2RAZX 2O4WA 1QS5A 185LA 4LDOA 1L44A 1L99A 1L08A 2NTHA 1PQJA 158LA 1P56A 229LA 3HH4A 2RB1X 4YX7C 162LA 2RBSA 3GUPA 4W52A 1L92A 3NY8A 2B6TA 170LA 1JTNA 127LA 1LI6A 2OU9A 244LA 1T8FA 4DAJA 1CUPA 1G0QA 1L31A 191LA 181LA 5LZMA 4PJZA 246LA 3G3VA 4YXCA 3PDSA 1P46A 1JQUA 4ARQB 1G07A 128LA 139LA 4YXAC 3GUKA 1C63A 1QT4A 1L28A 1PQIA 1L61A 3HT9A 1LWKA 3DN0A 1L87A 161LA 3LZMA 1G1WA 1JTMA 3DN1A 4W56A 4EXMA 1OV7A 125LA 3HTDA 1DYEA 224LA 1ZYTA 1WTHA 2B6WA 3UONA 225LA 1L42A 1C6IA 3RUNA 1CU3A 1LYGA 1KS3A 1L03A 1L33A 238LA 169LA 3D4SA 1L06A 200LA 1P7SA 108LA 3C8SA 152LA 1SWZA 1LYEA 1L68A 166LA 2B6XA 4EKQA 4DJHA 3DN2A 3DN4A 3FADA 1C6KA 226LA 1KY1A 2B7XA 4I7OA 1L07A 4I7RA 1C6EA 103LA 129LA 1DYFA 1QUOA 149LA 3FI5A 4ARMA 1QS9A 1L51A 247LA 1C68A 1QUHA 211LA 4IAPA 1L12A 3CDQA 110LA 2OTZX 111LA 104LA 3DN6A 3JR6A 2OTYX 1L40A 1OYUA 1C64A 1NHBA 2RH1A 1C65A 1C6FA 3HWLA 1G0KA 4W53A 3CDTA 1KW7A 220LA 1P37A 126LA 3SB9A 1C6LA 1C6NA 1C6QA 1CU0A 1ZWNA 2O79A 1L88A 3OE6A 216LA 1LYJA 2B70A 4PK0A 1L52A 2ANXA 1C6JA 1SSWA 3HT6A 1KNIA 4I7NA 4I7MA 1P6YA 4W58A 1L63A 1QT3A 1L32A 1L45A 1P64A 3QAKA 3DMZA 4W55A 6LZMA 4I7KA 2OE4X 4LZMA 1L70A 3C81A 168LA 3C7ZA 1L00A 258LA 2Z6BA 4I7LA 2ANVA 4OO9A 1L82A 249LA 1L86A 4W59A 1D3FA 176LA 259LA 3V2YA 157LA 1T6HA 3HTGA 219LA 3GUNA 122LA 1C69A 2OEAX 1L04A 118LA 3C8RA 3DN8A 1I6SA 1C6CA 102LA 4W51A 1C61A 1L10A 3L64A 2OE9X 1PQMA 1LWGA 1C66A 4ARPA 1L50A 198LA 2RBOA 1PQOA 1L38A 1G0LA 1L11A 4I7TA 4EJ4A 190LA 3G3XA 1L01A 1L0KA 1XEPA 145LA 1L91A 1QTZA 1L24A 184LA 1L20A 2OU0X 3G3WA 2F47A 215LA 1DYBA 2RB2X 1SX7A 1D3NA 1P2RA 131LA 3ODUA 1L39A 140LA 1QUDA 3HDFA 3CDVA 109LA 1LYHA 252LA 3SBAA 2B6YA 1L77A 138LA 3GUOA 206LA 167LA 119LA 4DKLA 1SSYA 1L29A 1L95A 2OE7X 1QT5A 1T97A 1C62A 1L85A 177LA 3NYAA 156LA 1G0JA 1QT8A 1L19A 1L55A 1P3NA 1L94A 262LA 4K5YA 1QSQA 1L27A 2NTGA 188LA 1L43A 250LA 3DMXA 171LA 164LA 1L16A 213LA 2L78A 214LA 243LA 1G0MA 241LA 1L34A 186LA 1L02A 1L25A 256LA 3HT7A 240LA 1L71A 2B72A 1C6TA 1L73A 1L83A 233LA 115LA 210LA 231LA 3F8VA 1L58A 2RAYX 3VW7A 1D2WA 4ARMB 3RZEA 234LA 3OE0A 209LA 1CV3A 196LA 3HU8A 1CV5A 4GRVA 1L05A 251LA 3GUJA 1C6HA 1L18A 235LA 1L93A 1L64A 172LA 1D2YA 1C6AA 155LA 3C8QA 1L72A 1C60A 144LA 4E97A 199LA 4I7PA 1PQDA 120LA 4EKSA 163LA 1K28A 1OVKA 159LA 3SBBC 1P5CA 1L60A 1LGWA 3HDEA 1D9WA 1OVJA 248LA 2LC9A 1CX7A 1CTWA 2B75A 4EKRA 1KY0A 1T8AA 261LA 4ARLA 1L79A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YVBA 4W57A 1B7OA 3RW8A 107LA 1L22A 2BAAA 242LA 2ZWBA 4H9EA 1P36A 2FYCA 4CFOA 4NGJA 1B5YA 1AKIA 1BGIA 4WO9A 4HTKA 2YBMA 1CJ8A 1L54A 2BQIA 2PC2A 1D0KA 1L89A 5KKJA 2Q9EA 1OWZA 4NHPA 1C6BA 2RBRA 1LZCA 205LA 5F9XA 1QT7A 1TLAA 1GF5A 1FLQA 130LA 1G1VA 5KXYA 4ARJA 1CKGA 4TX7A 2Z18A 4XADA 228LA 5LVHA 146LA 1CVKA 1ZMYL 147LA 1W08A 3NY9A 4EPFA 5E4PA 1HC0A 1OV5A 1BWIA 5I53A 3HUAA 2XQOA 4NGOA 4RW1A 4LYTA 2I25L 3P64A 3PBLA 1LHHA 1IOQA 2CWIA 4P2EA 1RFPA 2W1LA 1L53A 4GLAA 1LMAA 5B06A 3WXUA 1XGUC 4S0WA 2ZYCA 3HU9A 1GBSA 1LJ3A 112LA 1LSPA 5L3HA 227LA 1QTBA 3C82A 1GBOA 1B5ZA 1LZBA 1HENA 175LA 4NHTA 4PJ2C 5I5QA 5LXWA 1SQ2L 4N1CC 2EPEA 3AYQA 3CT5A 2ZNXY 4XJFA 3KAMA 1C6PA 1CU5A 1TAYA 5C6JA 143LA 1LYOA 5B1GA 2YBHA 1JSFA 1XEIA 1HSWA 1L59A 1REZA 1L48A 4W54A 1C6GA 3K2RA 195LA 1L47A 4LT1A 4E3UA 1HHLA 1CV4A 1J1PY 5APDA 4GCCA 3C83A 1L13A 1OUFA 4WM2A 4AQNA 1IWXA 4GN4A 3WULA 2BQDA 2D4IA 4LDOA 1L99A 1LAAA 1HEMA 4LYCA 5M1YA 1GB7A 3RU5A 4WLXA 1UIEA 1PQJA 1D6QA 158LA 1P56A 3LYOA 5IELA 1IC4Y 4DWXA 1LHMA 4M4OA 1OP9B 4WG1A 244LA 246LA 3G3VA 1JTPL 1GAYA 1P46A 5I4WA 1IP5A 1LWKA 3DN0A 2ZNWY 5HMVA 4XJHA 1LSAA 3A96A 1JTMA 1FLUA 1CJ7A 1KXYA 3A93A 224LA 1LMTA 2B6WA 1UCOA 1B2KA 3UONA 1GE0A 1DXJA 2BQFA 1G7LC 1KS3A 1L33A 3QNGA 5LINA 4ETCA 2X0AA 4DJHA 3FADA 3DN4A 3VWOA 5KXWA 103LA 3N9CA 1C68A 3A67Y 2DQHY 4H93A 1BB5A 5LA8A 1L12A 5C6LA 1IWYA 1HEQA 2OTZX 4G9SA 1LZTA 5LA5A 3DN6A 3JR6A 1LJHA 5J7CA 1TCYA 4ET8A 4H9IA 1GFGA 2MEDA 1LHKA 2AUBA 1VDSA 3D9AC 1C45A 4NGLA 126LA 1IVMA 3AGGG 1C6LA 1C6NA 1C6QA 1IP1A 216LA 3B0OA 4PK0A 1IWTA 3HT6A 4H9FA 2D4JA 2DBTA 4I7NA 1BVKC 2Z39A 1P6YA 4BADA 1L63A 1L45A 1Z55A 1P64A 4W55A 4LZMA 4GLVA 3T36A 1L00A 1YL1X 2RSCA 3E3DA 1UBZA 2A7FA 4EOFA 5L3IA 2IFFY 1LZNA 4IATA 176LA 259LA 4J1BA 193LA 1IR7A 4WM5A 3C8RA 5FEKA 1I6SA 1LZ9A 102LA 2HU1A 1L10A 3L64A 1D9UA 1LWGA 2RBOA 3G3AB 3TMUA 208LA 4XJGA 4EMNA 4I7TA 4H91A 1L01A 1LZ8A 3A92A 2YSSC 1L0KA 1LJNA 1XEPA 4CGEA 7LYZA 3G3WA 1DYBA 1LSGA 2RB2X 1SX7A 1LKRA 131LA 1LCNA 3WW6A 1BWJA 4CFPA 109LA 1YAQA 3D3DA 2DQCY 1GXV2 4RW2A 2OE7X 1C10A 3N9EA 1B5XA 1LSEA 1C62A 4NHQA 3IJVA 1CKCA 5I4YA 1JUGA 132LA 1XEKA 3AGIA 4G4CA 2I26L 171LA 1L16A 2L78A 2BQGA 1NHEA 5F9UA 1HFZA 5DN5A 1L25A 240LA 1L71A 2YDGA 4DD1A 1BVXA 115LA 231LA 3RZEA 4L41A 2LYZA 1OUIA 196LA 1CV5A 3TXKA 1P2CC 235LA 5LIOA 1GFEA 3A6BY 1B7PA 4NFVA 199LA 4EKSA 1PQDA 163LA 3LHMA 1AZFA 1BB7A 1D0LA 1LGWA 1D9WA 2CJLA 248LA 1CTWA 1GF3A 4N8ZA 2ZQ4A 1V7SA 2HEEA 1FLYA 3LYMA 1JTOL 223LA 2RBNA 1C08C 4NY5A 2Z19A 4WM1A 3WU8A 3A3RX 1H87A 4EKPA 1QTHA 3RZ4A 1L35A 1PQKA 1YKZX 4IASA 4J7VA 3GUIA 2MEEA 1T6VL 4XJDA 4W94A 3A90A 4UWVA 1LLHA 3CDRA 1L97A 1GHLA 4GBRB 4LYMA 4QDNA 153LA 212LA 2LZ2A 1GF7A 1HF4A 3HTFA 2HUMA 2XTHA 1GB6A 1JEFA 4DD0A 1L46A 1IC7Y 1LZRA 1KIRC 4XYYA 1ZV5L 1LJFA 7LZMA 1L26A 4YOPA 151LA 160LA 3WU7A 1UIBA 2Z2EA 4ZPUA 1DZBX 3WMKA 4B0DA 2FYDA 1EPYA 5LVJA 2G4QA 5B05A 1XGQC 2RBPA 1ZVYB 3OE9A 1T3PA 3SB6A 4YF2A 3CQLA 5LYMA 2I6ZA 2BQJA 3L2XA 1L57A 3C7YA 2OU8A 4H9BA 1AT6A 2LHMA 5KXXA 1IIZA 5C6IA 1FBIX 1LZDA 218LA 1HMLA 180LA 1YKYX 1XJTA 2BQHA 4OWEA 3GUMA 1XJUA 1YILA 3DNAA 173LA 1LJKA 1CU2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2YVB A;  4W57 A;  1B7O A;  3RW8 A;  107L A;  1L22 A;  2BAA A;  242L A;  2ZWB A;  4H9E A;  1P36 A;  2FYC A;  4CFO A;  4NGJ A;  1B5Y A;  1AKI A;  1BGI A;  4WO9 A;  4HTK A;  2YBM A;  1CJ8 A;  1L54 A;  2BQI A;  2PC2 A;  1D0K A;  1L89 A;  5KKJ A;  2Q9E A;  1OWZ A;  4NHP A;  1C6B A;  2RBR A;  1LZC A;  205L A;  5F9X A;  1QT7 A;  1TLA A;  1GF5 A;  1FLQ A;  130L A;  1G1V A;  5KXY A;  4ARJ A;  1CKG A;  4TX7 A;  2Z18 A;  4XAD A;  228L A;  5LVH A;  146L A;  1CVK A;  1ZMY L;  147L A;  1W08 A;  3NY9 A;  4EPF A;  5E4P A;  1HC0 A;  1OV5 A;  1BWI A;  5I53 A;  3HUA A;  2XQO A;  4NGO A;  4RW1 A;  4LYT A;  2I25 L;  3P64 A;  3PBL A;  1LHH A;  1IOQ A;  2CWI A;  4P2E A;  1RFP A;  2W1L A;  1L53 A;  4GLA A;  1LMA A;  5B06 A;  3WXU A;  1XGU C;  4S0W A;  2ZYC A;  3HU9 A;  1GBS A;  1LJ3 A;  112L A;  1LSP A;  5L3H A;  227L A;  1QTB A;  3C82 A;  1GBO A;  1B5Z A;  1LZB A;  1HEN A;  175L A;  4NHT A;  4PJ2 C;  5I5Q A;  5LXW A;  1SQ2 L;  4N1C C;  2EPE A;  3AYQ A;  3CT5 A;  2ZNX Y;  4XJF A;  3KAM A;  1C6P A;  1CU5 A;  1TAY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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