1L64A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLAAAAAAAAAAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 55
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l64A00
1L39A 1L44A 1LYGA 1L54A 112LA 1C6TA 2B7XA 4LDOA 181LA 2OTZX 1ZURA 1L10A 1L53A 1PQJA 1C6DA 1D3FA 1LI2A 1T97A 1DYAA 1QT8A 2F32A 1PQMA 3HTBA 1L90A 1LPYA 4W58A 103LA 3HUAA 1C6KA 1CUPA 3QAKA 126LA 1L05A 1DYFA 2RB0X 1C6JA 1L67A 1LW9A 109LA 1QT6A 1C68A 185LA 3DN3A 1L85A 139LA 1L21A 3DN0A 2OE7X 5I14A 218LA 198LA 120LA 1L33A 1LWKA 1P6YA 2OE4X 3CDRA 1L96A 1QTVA 4AQNA 151LA 1L07A 2NTGA 184LA 254LA 1LYJA 2QARC 149LA 1L29A 244LA 211LA 4I7TA 200LA 1PQIA 261LA 1QS9A 4I7QA 1KNIA 1CTWA 220LA 1L27A 182LA 3ODUA 1LYHA 1JQUA 1OWZA 1DYBA 180LA 175LA 3HU9A 222LA 3G3WA 205LA 1C60A 2O7AA 137LA 1QTHA 3C82A 3SN6R 1L72A 1C6EA 118LA 2RBPA 1PQOA 1L75A 1ZYTA 3V2YA 4LZMA 142LA 4W54A 1L08A 1L83A 250LA 1NHBA 1L32A 4ZPUA 1L19A 138LA 3HDFA 4I7NA 242LA 3C7YA 4DAJA 122LA 3HH5A 1L0JA 4EPIA 196LA 3K2RA 2B6XA 2O79A 209LA 2NTHA 2RAYX 3L2XA 3C8SA 2ANVA 197LA 3DN2A 146LA 2RB2X 1C67A 3SB8A 2RAZX 1DYGA 234LA 166LA 127LA 1L37A 1P3NA 3C7WA 1P5CA 1L81A 1LGWA 1EPYA 3DN4A 233LA 223LA 3GUNA 1L74A 3SB7A 4W57A 1LYFA 1QT7A 1L34A 3NY9A 1CU0A 4W56A 1OVKA 213LA 2LCBA 1XEPA 1PQDA 4ARQB 2RBNA 199LA 1L91A 4OO9A 3HWLA 1L11A 1L06A 257LA 148LE 1L02A 201LA 4I7JA 1G06A 160LA 1L45A 1L59A 1C6NA 231LA 3F9LA 3HUQA 4GRVA 4I7SA 1CV4A 2B75A 4I7RA 1K28A 2OU0X 163LA 1OVJA 1KY1A 1QUHA 1CUQA 1SWYA 1L16A 156LA 2OE9X 1L62A 4EKQA 1P46A 1LLHA 1L56A 155LA 1L13A 3C8QA 1L22A 1L47A 237LA 1CU6A 2OU9A 1L24A 2ANXA 4K5YA 1LWGA 164LA 191LA 107LA 1B6IA 1QTZA 3DKEX 192LA 1L89A 1QTBA 1L55A 1L77A 3OE0A 2QB0B 2OEAX 1L14A 1QUGA 195LA 1L43A 141LA 3LZMA 140LA 1G0GA 1L03A 1L57A 1C69A 1PQKA 2RBQA 3C80A 3SBBC 3OE8A 3SB9A 147LA 131LA 3HU8A 1L87A 3UONA 3HTFA 1L30A 3JR6A 168LA 4EXMA 1QTCA 1D2WA 1L79A 110LA 1C6AA 1L12A 212LA 1SWZA 3GULA 1WTHA 3L64A 1L17A 2F47A 161LA 3DMXA 1C66A 1L99A 1CV0A 4I7MA 3G3VA 1P56A 190LA 1D9WA 2B72A 3G3XA 165LA 1JTMA 3C81A 1D2YA 3PDSA 1L46A 1CV1A 2B6YA 4EJ4A 1CV5A 4YXAC 143LA 247LA 1L00A 259LA 1T8FA 1L92A 4EKPA 255LA 1L88A 1L73A 1T8GA 3GUOA 4LDLA 1SSWA 239LA 1C61A 4DKLA 1P2LA 3DN6A 1LYDA 1P7SA 1L66A 1L97A 1LGUA 4YXCA 1DYEA 1KY0A 3DMZA 1L52A 1C62A 235LA 1L69A 252LA 1L60A 1L0KA 2HUMA 1LYIA 1CX7A 189LA 4E97A 1L80A 1CVKA 2A4TA 1XJTA 4I7KA 7LZMA 2RH1A 1L48A 3GUMA 227LA 4PK0A 256LA 2B6ZA 170LA 215LA 3FADA 1SX2A 224LA 1G0LA 1L64A 1C6CA 1D3JA 1L82A 1C6IA 3HUKA 1DYDA 1KS3A 3HDEA 219LA 3C7ZA 1G0JA 162LA 5LZMA 4W55A 1G0MA 2LZMA 3HT6A 2Q9EA 3NY8A 1L41A 1C6MA 1QTDA 221LA 1L50A 214LA 3DNAA 1L36A 1L42A 1L76A 177LA 3SB6A 3F8VA 3FI5A 1CU2A 4ARLA 3V2WA 2Z6BA 3OE9A 1QSBA 1CU3A 1L58A 1L63A 104LA 1LGXA 1OV5A 1SX7A 1ZWNA 129LA 3HT9A 1KW7A 4I7LA 113LA 1L15A 2B6WA 3DN1A 4LDEA 3HT7A 1L28A 3EMLA 159LA 187LA 1L04A 1T6HA 4W51A 238LA 183LA 258LA 102LA 1L94A 4YX7C 157LA 253LA 1P36A 2B73A 1CV3A 2B70A 152LA 1LI6A 260LA 1I6SA 4ARPA 3DMVA 249LA 1CV6A 246LA 1C6QA 3HH4A 3FA0A 4S0WA 2OU8A 144LA 1L38A 217LA 241LA 4I7PA 3SBAA 1C6PA 2RBSA 3RZEA 1C6HA 1L49A 1C63A 240LA 1L40A 128LA 1KW5A 3OE6A 3PBLA 1L65A 3HH6A 3CDOA 1QUOA 3HTDA 173LA 4ARMB 1L25A 4ARQA 1G1VA 158LA 3CDTA 1C6BA 1D3MA 1P2RA 230LA 4PJZA 2HUKA 169LA 3CDQA 3HT8A 119LA 1LI3A 2LC9A 1OV7A 145LA 171LA 4ARJA 1C64A 1QUDA 1L35A 174LA 4W52A 186LA 236LA 4EKSA 2RBRA 176LA 251LA 245LA 125LA 4EKRA 1L84A 3HH3A 1L93A 232LA 243LA 1C6LA 4W59A 226LA 248LA 6LZMA 111LA 3CDVA 1C65A 4DJHA 1C6FA 1QS5A 1DYCA 1L09A 1P64A 262LA 228LA 3C83A 4W53A 2OTYX 1L31A 108LA 3DN8A 3GUJA 4I7OA 1QSQA 3VW7A 2Q9DA 1TLAA 3C8RA 130LA 2F2QA 1XJUA 216LA 3SB5A 3NYAA 3D4SA 150LA 1SSYA 1L71A 1L70A 1L95A 1OWYA 4ARMA 1G0PA 1OVHA 2HULA 2O4WA 1QT5A 1QT4A 1LYEA 1T8AA 3RUNA 4EPFA 1G07A 123LA 2L78A 1JTNA 1L61A 1P37A 1L68A 1CU5A 1D3NA 2RBOA 1L18A 2IGCA 115LA 1L01A 3GUKA 167LA 1L23A 172LA 1G0QA 2CUUA 1L86A 206LA 3GUIA 1G1WA 210LA 3GUPA 178LA 3HTGA 188LA 1L26A 1L98A 1QT3A 4IAPA 1C6GA 2B74A 1L20A 229LA 1L51A 4GBRB 225LA 2B6TA 1G0KA 114LA 2RB1X 1OYUA 1CX6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LYGA 4HTNA 3A6CY 5FHWA 1ZURA 1L10A 1L53A 1JHLA 1QT8A 1LHIA 5D5CA 4DQ5A 1REXA 103LA 1EQ4A 126LA 5KXPA 1HEMA 1L05A 4XENA 4H9IA 1HEWA 1C68A 3WW5A 3DN3A 4DYGA 1GF8A 2AUBA 1LMNA 4B0DA 120LA 207LA 1QTVA 5KXNA 4H9BA 184LA 2QARC 3CT1A 149LA 211LA 1NHEA 1B5ZA 1KNIA 1LHMA 220LA 3TXGA 4ETAA 1JQUA 3F6ZA 1VDTA 222LA 1NWGA 3G3WA 1ALCA 1UACY 1QDRA 1QIOA 118LA 2BQKA 5FSTA 4J1AA 1PQOA 1L75A 3V2YA 1EQ5A 4W54A 4H8ZA 2BQIA 5KKIA 1I20A 1LSBA 4UWUA 1B5UA 1CJ8A 194LA 242LA 1LJFA 153LA 122LA 1LKSA 196LA 4OWBA 2O79A 209LA 3CSQA 4XYYA 3BKHA 1JJ3A 197LA 1P2CC 1C67A 2H9KA 3SB8A 1AZFA 4BAPA 5LVIA 3LYZA 3DN4A 1WQQA 1L74A 1L34A 3NY9A 3WH1A 4H9AA 1LZSA 3A34A 1HEPA 4OO9A 2YBJA 1L06A 1BWIA 1YILA 3P64A 2C8PA 1TBYA 4WO9A 231LA 4GRVA 1IP4A 1CV4A 2B75A 5JENB 3WVXA 4DD3A 5B07A 3G3BB 4WG1A 3RU5A 1IOTA 1L24A 4CJ2A 1UIDA 164LA 107LA 1L89A 1QDTA 1AM7A 2QB0B 2OEAX 1V7SA 5KXWA 1IP2A 3HFMY 3LZMA 195LA 1JKAA 1PQKA 2BLYA 3C80A 3SBBC 147LA 3UONA 3HTFA 4BS7A 2I26L 3CQLA 1IEEA 1JISA 3A8ZA 1D2WA 2FBBA 1EQEA 4HTKA 110LA 4IASA 1UIBA 1LZ4A 1RCMA 3GULA 4DC4A 3DMXA 1UUZC 1C66A 1REYA 3CT5A 1GF3A 3G3VA 190LA 1D9WA 3G3XA 1IOQA 1QSAA 1W08A 1H6MA 2G4QA 1HMLA 5LA5A 5KXXA 1CV1A 2B6YA 1CV5A 5F16A 133LA 2ZQ3A 1L00A 2EIZC 4EKPA 4LDLA 2Y8PA 1SSWA 239LA 5KJ9A 4DKLA 3DN6A 1CJ9A 2NWDX 1L66A 4B4JA 4HV2A 1DYEA 1KY0A 1IWZA 2IFFY 1L0KA 1F0WA 1KIQC 4WM3A 1CX7A 2WARA 4E97A 1L80A 1XJTA 4FDYA 2Z2EA 1LZTA 4OWAA 4CFPA 4HPIA 2BQMA 2FYCA 4U3XB 3LN2A 1SX2A 224LA 1HFZA 1CKCA 3WUNA 1C6CA 5I5QA 1L82A 1C6IA 3QNGA 3WXTA 1LHLA 3C7ZA 1JKDA 1LMPA 2BQOA 1YL0X 2ZIJA 5DLAA 1L41A 221LA 1L50A 4B4IA 3SB6A 3F8VA 3TXHA 1GXXA 1QSWA 1L58A 1L63A 104LA 1LGXA 1A2YC 193LA 1OV5A 4GCEA 208LA 4AGAA 3EMLA 4W51A 1YAOA 258LA 3A95A 102LA 5KXKA 1B0DA 1LAAA 1C45A 157LA 6LYTA 4NSHA 3W6CA 253LA 2B73A 1UBZA 1CV3A 2CJLA 3A90A 1LSGA 1VFBC 4ARPA 1OUGA 4H91A 2XJWA 4NGVA 1FN5A 4XJBA 1NKHA 5LA8A 1L40A 3HH6A 1FDLY 3P4ZA 3CDOA 1QUOA 3WUMA 4ARMB 2W1MA 1VEDA 3N9AA 158LA 3CDTA 1LJNA 1P2RA 4WM2A 2HU3A 2A7DA 119LA 1YAMA 145LA 2HEDA 4ETEA 1QUDA 4W52A 4EKSA 1LZ5A 2RBRA 3A94A 176LA 1GE1A 4WLDA 125LA 4EKRA 1C6LA 2BQGA 4DD2A 5LVJA 3CDVA 4DJHA 1GB0A 2DBTA 1L09A 1B7NA 1GBXA 1VATA 1GE4A 1L31A 1WVVA 1VAUA 5I4XA 1QSQA 2Q9DA 1VDPA 3C8RA 130LA 5APDA 216LA 1F6SA 1YROA 3ZVQB 1LSEA 1L71A 1LSMA 5KXMA 3W6DA 2HULA 2Q0MX 2MEGA 1GFHA 1JTNA 1LMTA 1L68A 1GPQC 1CU5A 1DZBX 2RBOA 1GE0A 1LSCA 1UIHA 1LZAA 5ILFA 4NHSA 167LA 1WTMA 1XGUC 1LZNA 3GUIA 5D5FA 1C6GA 1GBYA 1FKVA 1JUGA 4NIJA 1L44A 1C6TA 1PQJA 1C6DA 1D3FA 5APEA 1T97A 1PQMA 1XGTC 2ZIKA 1LPYA 1CUPA 2RB0X 1C6JA 1LW9A 109LA 1XSFA 139LA 1L21A 4NHPA 2OE7X 4YEOA 4EMNA 5I14A 1LYSA 4NSGA 1L33A 2YBLA 2OE4X 2X0AA 3CDRA 3N9CA 2NTGA 1HNLA 3A3QA 1L29A 3HBEX 1W6ZA 4I7TA 200LA 1PQIA 1QS9A 5I53A 5L3HA 3OK0A 5KY1A 2LYMA 1L27A 1LJ3A 1OWZA 4Z46A 1DYBA 1N4FA 3HU9A 1CKHA 1SLYA 137LA 3C82A 2W1XA 3SN6R 1C46A 2HEEA 1L72A 1HHLA 4NWEA 4LT1A 4UWVA 142LA 1L08A 1L83A 250LA 1D6PA 5HMJA 2N5ZA 138LA 1MLCE 1LMAA 4I7NA 1IR9A 1IWYA 1CKFA 1HELA 1VDSA 3C7YA 4DAJA 3B72A 2XTHA 3HH5A 1L0JA 1OUBA 4ZEEA 3W6FA 5C6JA 2BQAA 2MEAA 2RAYX 3L2XA 4E3UA 1DQJC 2RB2X 4WO6A 2YVBA 1DYGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1LYG A;  4HTN A;  3A6C Y;  5FHW A;  1ZUR A;  1L10 A;  1L53 A;  1JHL A;  1QT8 A;  1LHI A;  5D5C A;  4DQ5 A;  1REX A;  103L A;  1EQ4 A;  126L A;  5KXP A;  1HEM A;  1L05 A;  4XEN A;  4H9I A;  1HEW A;  1C68 A;  3WW5 A;  3DN3 A;  4DYG A;  1GF8 A;  2AUB A;  1LMN A;  4B0D A;  120L A;  207L A;  1QTV A;  5KXN A;  4H9B A;  184L A;  2QAR C;  3CT1 A;  149L A;  211L A;  1NHE A;  1B5Z A;  1KNI A;  1LHM A;  220L A;  3TXG A;  4ETA A;  1JQU A;  3F6Z A;  1VDT A;  222L A;  1NWG A;  3G3W A;  1ALC A;  1UAC Y;  1QDR A;  1QIO A;  118L A;  2BQK A;  5FST A;  4J1A A;  1PQO A;  1L75 A;  3V2Y A;  1EQ5 A;  4W54 A;  4H8Z A;  2BQI A;  5KKI A;  1I20 A;  1LSB A;  4UWU A;  1B5U A;  1CJ8 A;  194L A;  242L A;  1LJF A;  153L A;  122L A;  1LKS A;  196L A;  4OWB A;  2O79 A;  209L A;  3CSQ A;  4XYY A;  3BKH A;  1JJ3 A;  197L A;  1P2C C;  1C67 A;  2H9K A;  3SB8 A;  1AZF A;  4BAP A;  5LVI A;  3LYZ A;  3DN4 A;  1WQQ A;  1L74 A;  1L34 A;  3NY9 A;  3WH1 A;  4H9A A;  1LZS A;  3A34 A;  1HEP A;  4OO9 A;  2YBJ A;  1L06 A;  1BWI A;  1YIL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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