1L64A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLAAAAAAAAAAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 55
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l64A00
114LA 1L58A 2ANVA 1DYFA 1QUOA 128LA 2F47A 1G0MA 3RZEA 2RBSA 3CDTA 174LA 166LA 1K28A 2NTHA 1L99A 1L50A 1L53A 254LA 212LA 1CV5A 4EPIA 3FA0A 1L73A 1L40A 1OWYA 160LA 1C6CA 3V2YA 1OV7A 4I7JA 177LA 195LA 1L10A 2OEAX 1C6NA 1L48A 3GUMA 4K5YA 216LA 1LYJA 103LA 1OVHA 227LA 1L19A 1P37A 3GUKA 3SB9A 127LA 1QTHA 225LA 169LA 3DMXA 3HT7A 3OE6A 3OE9A 3V2WA 3F9LA 3HU9A 2HUKA 1C68A 238LA 2RBOA 4YX7C 1C6LA 3PBLA 108LA 1C65A 1L17A 129LA 1L84A 1XJTA 1G1WA 2ANXA 1G1VA 217LA 1QSQA 223LA 1L74A 4I7SA 1L45A 188LA 3HH5A 1OWZA 1C64A 3FI5A 1QUGA 1T97A 220LA 1PQJA 144LA 3HT8A 255LA 2L78A 246LA 175LA 4EKRA 1L46A 2F2QA 4LDLA 248LA 3SBBC 1L11A 3C8SA 5LZMA 1P3NA 1SWZA 189LA 126LA 1L77A 1L97A 1QUHA 4W53A 4GBRB 206LA 3FADA 3HU8A 1L91A 2RBRA 214LA 231LA 2Z6BA 3D4SA 3NY9A 4I7OA 4ARMA 3JR6A 1C60A 184LA 4EJ4A 1SX2A 3SBAA 4PJZA 1L79A 1PQKA 1ZWNA 259LA 191LA 1CV6A 4I7TA 1L86A 3HH4A 251LA 2F32A 3C81A 2QB0B 1NHBA 1L55A 1L29A 1C6DA 1L52A 209LA 4W54A 1QS5A 3CDVA 239LA 1WTHA 2B70A 4W57A 1LI3A 245LA 241LA 1LWGA 3SB6A 2HUMA 2B6ZA 180LA 4I7MA 171LA 2B6YA 247LA 151LA 176LA 213LA 257LA 3GUIA 4I7LA 1CU6A 1KS3A 2LZMA 258LA 2QARC 2HULA 1L56A 1QT4A 3CDOA 3HT9A 2A4TA 149LA 141LA 4ARMB 156LA 1L21A 1T8AA 1QS9A 242LA 3G3VA 249LA 3DN0A 2RB1X 230LA 139LA 196LA 1SWYA 1L69A 3EMLA 1L88A 1L80A 130LA 2OTYX 2RBPA 3HTBA 1L09A 1L31A 2LC9A 102LA 1CX6A 1L01A 256LA 1T6HA 1L37A 1PQDA 224LA 1D3FA 4W59A 1TLAA 3C7ZA 1XJUA 3HDEA 1PQOA 172LA 1L76A 1G0PA 1CV1A 4W56A 3DMZA 1T8FA 2RH1A 3OE0A 3CDQA 1L61A 1KW5A 4OO9A 1LYIA 4W58A 2IGCA 1L59A 1P6YA 200LA 1QUDA 1I6SA 148LE 1D3NA 1QT6A 3C83A 1C6MA 4W55A 2B6WA 1DYBA 3VW7A 3SB7A 201LA 1L12A 1L39A 2RBNA 2NTGA 3GUOA 3NY8A 4EKSA 3DN4A 1KY0A 1L43A 3RUNA 1L47A 1C6EA 1L00A 187LA 1L0KA 1L85A 1L28A 1G0GA 4I7RA 3PDSA 4YXAC 1LYEA 123LA 1T8GA 4GRVA 185LA 1L23A 6LZMA 1G0QA 2RB2X 1LYFA 1C6KA 1SSWA 4LDEA 3C8RA 157LA 3HUAA 4W52A 1G0JA 1L20A 1L70A 1L68A 260LA 4DJHA 1L94A 1C6QA 1KW7A 181LA 1JTMA 1LWKA 2B7XA 1C6PA 4ARJA 173LA 252LA 5I14A 1L08A 4EKQA 122LA 107LA 1LW9A 3K2RA 4ARQA 4LDOA 1LGXA 2O7AA 1L82A 1L07A 186LA 4I7NA 147LA 234LA 3DN6A 1JQUA 3ODUA 192LA 1QTZA 109LA 1QSBA 219LA 1D3JA 3HTFA 2B74A 1L98A 215LA 1L65A 1C6IA 243LA 1L60A 140LA 1G0LA 3HH6A 1L02A 1C61A 1C67A 228LA 1P7SA 1P64A 159LA 2B75A 1L38A 199LA 162LA 1L90A 1CX7A 3SB8A 1C6BA 1QT8A 1L32A 3G3WA 1QTDA 4DAJA 1DYAA 222LA 168LA 2B72A 4S0WA 1C6GA 1L95A 1ZYTA 183LA 1OVJA 1P56A 4ARQB 1OYUA 1LI6A 2Q9DA 1L62A 2LCBA 1C62A 1L30A 1LYHA 1G07A 2RBQA 1LYGA 3HT6A 145LA 2B6XA 3HTDA 178LA 155LA 1L49A 210LA 1L54A 2OTZX 3QAKA 131LA 3HTGA 4ARPA 2RAYX 3NYAA 1L93A 146LA 1L71A 1L51A 3DN3A 1L81A 1L18A 2O79A 1DYGA 1L14A 1C63A 221LA 1L26A 125LA 233LA 2O4WA 3HDFA 4I7PA 182LA 1C6JA 4IAPA 7LZMA 161LA 118LA 158LA 1XEPA 1C6HA 3CDRA 1G06A 1L72A 3HUKA 1L92A 2RAZX 3LZMA 3OE8A 240LA 235LA 1LYDA 4AQNA 1C69A 3DN8A 1P46A 1CV4A 1DYCA 232LA 1OV5A 1CUQA 1D2WA 1P2RA 3C82A 1L04A 1KY1A 4ZPUA 3DNAA 1PQMA 1L96A 137LA 1CU5A 253LA 205LA 4EXMA 1CV0A 163LA 1L27A 3SB5A 3DMVA 3C7YA 4I7QA 1B6IA 1LGWA 1QTBA 115LA 1LPYA 2OU8A 4LZMA 244LA 3DN1A 1SSYA 226LA 1JTNA 1KNIA 4E97A 1D9WA 1L36A 2B6TA 1L34A 1L16A 104LA 1D3MA 2CUUA 1L05A 2OU9A 1L87A 1CTWA 3DKEX 3GULA 1CVKA 1L24A 1LI2A 164LA 236LA 1L64A 1C66A 4DKLA 218LA 1L13A 2RB0X 4EPFA 1L42A 198LA 1QT5A 3SN6R 1LGUA 111LA 142LA 150LA 4YXCA 1L89A 2Q9EA 3GUJA 1CU3A 1CU0A 1QT3A 167LA 1L06A 4W51A 1L57A 2OE7X 2OU0X 1L35A 1L33A 4ARLA 1C6AA 1L41A 1L15A 1LLHA 3HWLA 119LA 3L64A 237LA 1D2YA 211LA 165LA 3C8QA 2OE4X 1L67A 3C80A 261LA 1P2LA 1DYEA 1P36A 250LA 1PQIA 3G3XA 1L0JA 197LA 190LA 1CU2A 229LA 4PK0A 262LA 170LA 3DN2A 3HUQA 3F8VA 1OVKA 1QTCA 1C6FA 1QT7A 138LA 120LA 2OE9X 4I7KA 1L75A 1L63A 110LA 113LA 1EPYA 3GUNA 1P5CA 3UONA 2B73A 152LA 112LA 1L44A 1QTVA 1L66A 3C7WA 1L83A 1CV3A 3HH3A 3L2XA 1L25A 1G0KA 143LA 1CUPA 1DYDA 1SX7A 1L22A 3GUPA 1ZURA 1C6TA 1L03A 4EKPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GDWA 3WUNA 1OUCA 1B5YA 1CNSA 1QUOA 128LA 1UBZA 1IC7Y 4WM5A 2XJWA 1XGPC 3CDTA 1GEVA 193LA 4XJDA 1CV5A 1L73A 5KJ9A 3WU7A 177LA 195LA 5L3IA 1L10A 4H90A 2LHMA 1GB5A 1LZ4A 1LSCA 1LJKA 1P37A 3A91A 1QTHA 1LCNA 1JSFA 3V2WA 3HU9A 2HUKA 1QTEA 238LA 1C6LA 3EBAB 1MLCE 2LYOA 4I7SA 2BLYA 5L9JA 1HSWA 1IC4Y 6LYTA 2AUBA 1JKDA 1IOQA 1GE3A 3HT8A 1DQJC 2L78A 175LA 1VDTA 2F2QA 1DKKA 4YM8A 1F10A 5LZMA 1RCMA 4YENA 3W6CA 1LMNA 4NHQA 4XJGA 1LTMA 206LA 3T6UA 3HU8A 5HQ1A 3IJUA 214LA 231LA 3D4SA 5KXOA 1G7LC 3A3QA 1LJIA 4IJ4A 4M6DA 3JR6A 1F0WA 5B05A 2MEEA 3SBAA 3HBDA 1LZAA 251LA 2F32A 3OJPA 2QB0B 4CJ2A 194LA 1IIZA 1AKIA 1C6DA 1L52A 3AW6A 1LZNA 4W54A 2XBSA 239LA 1IO5A 2B70A 241LA 4J7VA 4OWHA 2HUMA 2B6ZA 2B6YA 4ETAA 247LA 151LA 176LA 257LA 2BQLA 2RSCA 1CU6A 2LZMA 2Z12A 1LZDA 258LA 2QARC 5KXWA 2HULA 3HT9A 149LA 156LA 1JSEA 1QS9A 1C45A 2HEEA 1P2CC 2RB1X 1ALCA 230LA 139LA 196LA 4UWNA 2MEIA 1LZ6A 5HMJA 2OTYX 3HTBA 3OK0A 5FSTA 1GB6A 1LZGA 256LA 1IP4A 1D3FA 1V7SA 4WMGA 3C7ZA 4LZTA 3GXKA 1PQOA 172LA 4NG8A 4HTNA 3AZ7A 1L76A 5I4YA 1BB6A 1T8FA 2ZIKA 1WQPA 1KW5A 1GF9A 4OO9A 1IX0A 1L59A 1QUDA 3WW6A 148LE 2C8OA 1IORA 2BQHA 3G3AB 2BQIA 4NHIA 1L12A 1L39A 2BQGA 2NTGA 3ULRA 1GBYA 4QY9A 1JTTL 3W3EA 5LAGA 154LA 1L43A 3B0OA 4NWHA 1EQ4A 187LA 1L0KA 1XEJA 3TMXA 2ZIJA 3LZ2A 1REMA 5I4XA 4G4CA 2N5ZA 5LVIA 1IR9A 3FI7A 4GRVA 4D9ZA 1HEOA 1LHKA 1IP2A 4DQJA 1G0QA 1JTOL 1D9UA 3HUAA 4W52A 1G0JA 1OUEA 4DJHA 1L94A 5F16A 1KW7A 181LA 2B7XA 4MR1A 1VAUA 4HPIA 3AW7A 5D5FA 4WG7A 2CJLA 3AGIA 133LA 3WW5A 3ODUA 1RJCB 192LA 1D3JA 1QUSA 3HTFA 2BQAA 1OUIA 1L98A 1L65A 1C6IA 4AGAA 1FBIX 1G7HC 2EQLA 3HH6A 4LFPA 2B75A 162LA 3SB8A 1QT8A 1VDPA 1QTDA 2HU1A 4NIJA 1LSNA 168LA 2B72A 4S0WA 3E3DA 1TDYA 1GXXA 2DBTA 4LT2A 1LI6A 5II3A 1LYHA 1C10A 2RBQA 4CHXA 4HP0A 178LA 155LA 1JHLA 1XSFA 1L93A 1L71A 4GCDA 5KXMA 3WPKA 3DN3A 1L81A 2O79A 1VFBC 4I7PA 5F14A 1L26A 125LA 1OUAA 1QDRA 4DD0A 3J6KA 161LA 1B7RA 1C6HA 4NY5A 1LZ1A 1G06A 1L72A 132LA 1B7SA 4ETDA 5KKJA 1LYDA 4AQNA 5K7OA 1C69A 3DN8A 1LJ3A 4X3BA 232LA 1OV5A 4NGKA 1HNLA 1P2RA 1KY1A 3ZEKA 1NQIA 3DNAA 3G3BB 1IOCA 1LJEA 3A94A 4P2EA 1NF5A 3DMVA 1QTBA 1JJ3A 4LZMA 3RT5X 1B7LA 226LA 1JTNA 1VDQA 3WULA 2Z19A 2B6TA 5I4WA 1HHLA 1L05A 3D3DA 1NBYC 2BQNA 1L87A 1CTWA 5T3FA 2ZILA 3GULA 4RDSA 4GCEA 4PPOA 4FDYA 4HJZA 1C66A 1B0DA 5F81A 2BQMA 1GB8A 1LKSA 1TBYA 198LA 1GB9A 4H9CA 3SN6R 5LVKA 150LA 4YXCA 1IP7A 1CU3A 5IDDA 1HFXA 4W51A 1BQLY 3P64A 4CFPA 4ARLA 1L15A 2D91A 4GCCA 1GBSA 119LA 1CJ9A 1J1PY 1FKQA 211LA 3L64A 1LJHA 3C8QA 2OE4X 1L67A 4DDAA 1YROA 1B7NA 4I8SA 1P36A 2W1LA 3RZ4A 229LA 4PK0A 3CSRA 4H9AA 3HUQA 1OVKA 1QT7A 3B72A 1L75A 1BVXA 1YAQA 1W08A 113LA 1EPYA 1LJNA 3GUNA 3HBEX 3TMVA 3UONA 112LA 1L44A 3C7WA 1L83A 3CSQA 1G0KA 1C6TA 1L03A 4EKPA 2Z38A 3M3UA 1JPOA 1L58A 2ANVA 2F47A 1G0MA 3RZEA 2RBSA 2NTHA 1YAOA 2I26L 4OOOA 4DD3A 4H8ZA 5HNCA 1LKRA 4GN4A 4QEQA 1LSMA 1A4VA 5HNLA 4I7JA 4H93A 2OEAX 3P4ZA 4K5YA 2FYDA 1OUBA 1LYJA 1OUDA 4Z41A 3GUKA 127LA 1REXA 3DMXA 3CT5A 5C6LA 3HT7A 3OE9A 1LOZA 3F9LA 1C68A 4YX7C 1L84A 1VATA 1G1WA 2ANXA 5D5CA 1G1VA 217LA 1QSQA 1GFUA 223LA 1XFPL 1L74A 4BS7A 3HH5A 1OWZA 2D6BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GDW A;  3WUN A;  1OUC A;  1B5Y A;  1CNS A;  1QUO A;  128L A;  1UBZ A;  1IC7 Y;  4WM5 A;  2XJW A;  1XGP C;  3CDT A;  1GEV A;  193L A;  4XJD A;  1CV5 A;  1L73 A;  5KJ9 A;  3WU7 A;  177L A;  195L A;  5L3I A;  1L10 A;  4H90 A;  2LHM A;  1GB5 A;  1LZ4 A;  1LSC A;  1LJK A;  1P37 A;  3A91 A;  1QTH A;  1LCN A;  1JSF A;  3V2W A;  3HU9 A;  2HUK A;  1QTE A;  238L A;  1C6L A;  3EBA B;  1MLC E;  2LYO A;  4I7S A;  2BLY A;  5L9J A;  1HSW A;  1IC4 Y;  6LYT A;  2AUB A;  1JKD A;  1IOQ A;  1GE3 A;  3HT8 A;  1DQJ C;  2L78 A;  175L A;  1VDT A;  2F2Q A;  1DKK A;  4YM8 A;  1F10 A;  5LZM A;  1RCM A;  4YEN A;  3W6C A;  1LMN A;  4NHQ A;  4XJG A;  1LTM A;  206L A;  3T6U A;  3HU8 A;  5HQ1 A;  3IJU A;  214L A;  231L A;  3D4S A;  5KXO A;  1G7L C;  3A3Q A;  1LJI A;  4IJ4 A;  4M6D A;  3JR6 A;  1F0W A;  5B05 A;  2MEE A;  3SBA A;  3HBD A;  1LZA A;  251L A;  2F32 A;  3OJP A;  2QB0 B;  4CJ2 A;  194L A;  1IIZ A;  1AKI A;  1C6D A;  1L52 A;  3AW6 A;  1LZN A;  4W54 A;  2XBS A;  239L A;  1IO5 A;  2B70 A;  241L A;  4J7V A;  4OWH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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