1L66A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAASELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l66A00
4EKRA 3DN6A 1L67A 1L47A 1G0KA 1XEPA 1LYIA 1L63A 230LA 147LA 1DYFA 2O79A 4EKPA 1L28A 225LA 218LA 245LA 175LA 3C80A 2B6TA 3C82A 1L40A 1SSYA 2B70A 1C6EA 1L92A 3C7ZA 3C8RA 168LA 1L95A 4W53A 1B6IA 1OVHA 182LA 4ARJA 1L31A 3C8QA 2RB2X 1L82A 1XJUA 3UONA 3HDEA 1L97A 3K2RA 4EXMA 4ARQA 1P6YA 142LA 1L21A 6LZMA 2RBPA 4E97A 256LA 1QTZA 1L75A 1LYHA 1QT5A 2B7XA 2RBSA 3NY9A 258LA 3CDQA 1P46A 1T8AA 1D3JA 1DYBA 169LA 5I14A 1I6SA 166LA 1EPYA 1LGXA 1L72A 4W51A 211LA 1D2WA 196LA 1L35A 2OTYX 1L48A 183LA 4PK0A 3DN8A 1QTCA 1LI6A 109LA 1L14A 1CU2A 235LA 3C8SA 3GUIA 233LA 1P7SA 212LA 236LA 1P64A 4AQNA 123LA 3SBAA 1L45A 111LA 158LA 3SB5A 3DN1A 3DN4A 1C6CA 220LA 1C6LA 1JTNA 126LA 2OU8A 1SX7A 259LA 3VW7A 4YXCA 1L65A 1T8GA 217LA 2O7AA 4GRVA 1L88A 3HUKA 1C6MA 3CDVA 2OEAX 1L38A 3DMVA 1L77A 1C61A 1SWYA 1L08A 1L22A 1L24A 3HU8A 1L51A 1L15A 1L05A 1CV1A 199LA 1CU0A 2HUKA 3HH4A 1OV7A 228LA 3LZMA 1L70A 2F2QA 247LA 257LA 102LA 3C81A 1QTVA 1G0QA 2RB0X 1LYGA 176LA 1PQIA 1L36A 1L56A 180LA 2LZMA 1L02A 1LGWA 2RAZX 1P3NA 4I7PA 3GULA 1L93A 129LA 1NHBA 2Q9DA 3OE9A 2OE4X 4EKSA 3FADA 1QT3A 3GUPA 1L73A 159LA 4ARQB 4ARLA 4I7MA 156LA 1L39A 222LA 4I7KA 1L98A 148LE 3C7WA 1DYEA 1L13A 3CDRA 191LA 251LA 1JTMA 3SB8A 1L04A 3V2YA 3F9LA 226LA 1L85A 1CV6A 1CV4A 2RBRA 164LA 1QUGA 1L68A 4DJHA 1DYAA 1L94A 1P5CA 3HUQA 3GUKA 1L0KA 209LA 170LA 1L90A 1LYFA 219LA 1QTDA 1QT4A 239LA 4W56A 221LA 3G3WA 1L30A 3OE8A 246LA 4EJ4A 3SBBC 1T6HA 1L62A 4ZPUA 248LA 2HULA 138LA 1C6FA 214LA 200LA 131LA 2B6YA 3C83A 216LA 2B6WA 4I7SA 3HDFA 1D2YA 149LA 161LA 2Q9EA 184LA 223LA 2RBNA 1C66A 1KY1A 167LA 4K5YA 1C69A 3SB6A 2A4TA 3QAKA 3DKEX 1C64A 1C60A 1OVKA 254LA 4W57A 3FI5A 4W55A 4W59A 2B72A 1L99A 3EMLA 1G0MA 1ZURA 3C7YA 3F8VA 177LA 197LA 234LA 1SSWA 3SB7A 1C6IA 1L42A 1KY0A 1LI2A 1CU5A 1C6QA 3RZEA 253LA 127LA 4PJZA 1CV5A 1QSBA 1CX6A 1KW5A 4ARMA 115LA 4I7LA 1QT7A 3HH5A 1G0GA 1L52A 2RBOA 1D3FA 1L09A 262LA 1L01A 4GBRB 3NY8A 4YX7C 229LA 241LA 3HWLA 1L17A 1PQOA 2ANXA 231LA 4LDOA 1KNIA 1LLHA 4ARPA 2L78A 178LA 252LA 4DAJA 255LA 4W58A 2RH1A 1L69A 1OWZA 1QUHA 3RUNA 205LA 1C65A 1DYGA 1SX2A 1D3NA 1L66A 1L16A 3HTFA 1ZWNA 4I7RA 128LA 1L03A 1L71A 1OVJA 1P2RA 2B6XA 113LA 108LA 2LCBA 1P56A 1PQKA 1C6GA 1L54A 1DYCA 1L53A 1P37A 3HH3A 2QB0B 112LA 144LA 1C6JA 2OE9X 140LA 122LA 1G06A 1LYDA 3JR6A 107LA 150LA 260LA 2LC9A 125LA 152LA 1C6DA 3DN2A 4YXAC 104LA 2OE7X 1QUDA 232LA 1TLAA 1C63A 5LZMA 2Z6BA 174LA 1L41A 3OE6A 195LA 137LA 1KW7A 1L89A 206LA 1C67A 261LA 118LA 3HU9A 1XJTA 3DNAA 1G1VA 1L80A 1L57A 1LWKA 1L37A 227LA 4S0WA 1L32A 3CDTA 1L06A 4LZMA 1P2LA 1PQJA 1L23A 4I7OA 3GUMA 157LA 1C6BA 1L46A 243LA 4OO9A 1L10A 1QT8A 1QTBA 1L61A 4ARMB 130LA 3HH6A 1C6TA 1CUPA 143LA 1D9WA 1L18A 187LA 3HTGA 1L76A 1G1WA 1L86A 4LDLA 2B75A 1L50A 1T8FA 192LA 2NTHA 2OTZX 1CV0A 7LZMA 1CX7A 1C68A 240LA 3SB9A 3HT6A 244LA 3DN3A 186LA 3CDOA 3NYAA 1L74A 1JQUA 224LA 1QTHA 1OYUA 3G3VA 1OV5A 3PBLA 1PQDA 242LA 2ANVA 1L44A 1L25A 1C6AA 1L87A 1L64A 190LA 1L07A 2RAYX 201LA 4DKLA 1L84A 4EPFA 1QS9A 250LA 171LA 2O4WA 1L55A 1WTHA 1L34A 1L20A 1LYEA 4EKQA 162LA 185LA 4I7QA 1QT6A 1L60A 4EPIA 160LA 2B74A 3HT8A 3ODUA 1CV3A 141LA 2HUMA 2F47A 3GUJA 165LA 139LA 155LA 2RBQA 3L64A 1C6HA 2RB1X 3FA0A 3GUOA 1QSQA 1L27A 237LA 1L91A 213LA 1CU3A 1LGUA 1QS5A 1G0PA 1L49A 172LA 1C6PA 189LA 1C6KA 119LA 1L59A 1K28A 1L79A 3HUAA 1L26A 1L00A 2OU0X 1L43A 1L19A 4IAPA 3PDSA 103LA 4LDEA 1KS3A 151LA 1CUQA 1C6NA 3DN0A 1LWGA 1CVKA 188LA 1CU6A 1G0JA 1OWYA 210LA 1ZYTA 238LA 3D4SA 1CTWA 4W54A 110LA 1SWZA 1L33A 2IGCA 215LA 114LA 1G07A 3SN6R 2OU9A 4I7JA 2NTGA 3OE0A 3DMZA 4W52A 1L11A 3HT7A 2B73A 2QARC 1L12A 1LPYA 145LA 2CUUA 3V2WA 3DMXA 1PQMA 1L81A 1L58A 1LI3A 1LW9A 1LYJA 1DYDA 3G3XA 198LA 173LA 1T97A 3HTBA 249LA 2B6ZA 3GUNA 4I7NA 1L29A 3L2XA 1L96A 146LA 3HTDA 1P36A 181LA 3HT9A 4I7TA 1D3MA 163LA 1L83A 1C62A 1QUOA 120LA 2F32A 1G0LA 1L0JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H9AA 1L47A 1LJNA 2YSSC 4HJYA 230LA 147LA 2O79A 4HSFA 1NF5A 218LA 4IASA 175LA 4L41A 3C80A 3A94A 1L40A 2B70A 2Z2FA 4B4IA 5HMJA 3RW8A 1UIBA 4ARJA 4XJBA 4HP0A 4WM2A 1IVMA 3HDEA 5LVKA 5KXWA 1L21A 1QT5A 1EQ4A 1GHLA 258LA 1VEDA 1P46A 1XFPL 169LA 5I14A 2Z18A 1I6SA 166LA 1TCYA 211LA 1H6MA 1CKGA 2OTYX 1L48A 1D0LA 1TEWA 3WPJA 1IOQA 2X0AA 3C8SA 1LHIA 1QDRA 233LA 1HF4A 8LYZA 2HU3A 135LA 5FHWA 123LA 3SBAA 3SB5A 3DN1A 1V7TA 1C6CA 1C6LA 1LJFA 2OU8A 2HTXA 4GCCA 1QUTA 217LA 2O7AA 4H8XA 5KXMA 4H9FA 4WM5A 3ZVQB 2XTHA 3LN2A 3CDVA 1L38A 2F4AA 4N8ZA 3A96A 1L08A 1L22A 1L05A 1KIQC 4ZEEA 2HUKA 4PGJB 2F2QA 2ZIKA 3C81A 2YBNA 4HPIA 1WVUA 176LA 1L36A 1UUZC 1L02A 1IR8A 1GWDA 2RAZX 3W6DA 3WVXA 129LA 2Q9DA 3OE9A 5T3FA 1LZAA 1IOCA 1BB7A 1I1ZA 132LA 1L73A 159LA 4I7MA 1BB4A 1PS5A 1LJIA 1L39A 5LA8A 1LJ3A 1LSNA 3C7WA 3BKHA 1IR7A 3CDRA 191LA 1LJKA 1JWRA 4NHIA 1L04A 1LSEA 1JJ1A 3V2YA 1WVVA 4NSJA 4C3WA 1IC5Y 2HECA 1LOZA 3HBEX 4DJHA 1JHLA 1L0KA 3F6ZA 1L90A 1OUJA 1LKRA 4LFPA 2Z2EA 4W56A 1JKAA 3G3WA 4LGKA 3OE8A 4UWUA 1T6HA 1GFKA 1L62A 4GN5C 248LA 1C6FA 1CNSA 5LVIA 1I20A 4NWHA 1KY1A 167LA 3A6CY 1C69A 1GEZA 3SB6A 1CKFA 1C60A 3IWRA 1FKQA 1LSPA 5D5CA 3IJUA 3F8VA 177LA 197LA 1LZGA 1C6IA 1NDGC 1IO5A 127LA 1CV5A 1QSBA 4ARMA 4H9CA 5I54A 1LSZA 3AW6A 4E3UA 3HFMY 4TTDA 1L01A 1XSFA 1LHMA 229LA 3HWLA 1Z55A 4YF2A 1LLHA 4Z46A 2YBJA 178LA 1CJ8A 4W58A 1L69A 1C65A 1DYGA 1SX2A 5DLAA 1GF4A 1LJEA 3AJNA 3HTFA 1L16A 5L3IA 4H9IA 2H9KA 1YKZX 3D3DA 1LHLA 113LA 5LAFA 108LA 3ULRA 1GFRA 1CKHA 2A7FA 1P37A 4ETEA 1CJ9A 3TMWA 144LA 1LSGA 4N0JA 2HEFA 3CQLA 2OE7X 1LZTA 4DD1A 5LZMA 4HTQA 1LHKA 4DQJA 1L41A 195LA 137LA 1REYA 4PHIA 261LA 1LHHA 3DNAA 3WUAA 2FYCA 3A93A 1L57A 4S0WA 4WOAA 3LZTA 4I7OA 157LA 1GFGA 4OO9A 1QT8A 1QIOA 1JKDA 4ARMB 1UIDA 3A90A 2N5ZA 1YIKA 3HH6A 1L76A 5APDA 2B75A 192LA 2NTHA 2OTZX 1GF9A 4NFVA 4LYCA 240LA 2H9JA 4MSTA 3HT6A 244LA 1NQIA 4AXTA 186LA 2HEDA 2BQGA 1DKJA 224LA 1OV5A 1YILA 4TWSA 1D6PA 1IC7Y 5IDDA 201LA 1DI5A 1HEOA 1GBSA 5ILCA 1LYEA 162LA 2DQDY 185LA 4W96A 4H94A 1GD6A 1QT6A 160LA 3RNXA 1GFJA 3N9AA 3D9AC 2HUMA 1GB6A 165LA 1C6HA 3FA0A 4H90A 3GUOA 237LA 1L91A 1LZ6A 3OK0A 4GN4A 1QS5A 4IJ4A 5FSTA 172LA 1C6PA 4BS7A 1FLYA 3HBHA 1L26A 1BQLY 1L43A 1BWHA 3P66A 3PDSA 1NKHA 1CUQA 1C6NA 1XEKA 3DN0A 1LWGA 1CVKA 4WLXA 1LZ9A 1OWYA 1HELA 1ZYTA 5C6IA 2FBBA 2RSCA 5LVJA 2Z39A 1DPWA 1SWZA 1L33A 3WULA 5C6JA 1BWIA 2BQFA 4I7JA 4XJHA 1B5WA 1L11A 1NBZC 2B73A 2QARC 1L12A 145LA 5KJ9A 3DMXA 1PQMA 2BQBA 9LYZA 1L58A 2ZNXY 1LW9A 2BPUA 2ZYPA 4NSHA 4C5FA 173LA 3HTBA 249LA 1IWZA 2B6ZA 3GUNA 1L96A 4AGAA 1NHEA 3T6UA 3CT1A 4LT0A 3TMVA 2BQLA 1HEMA 1QUOA 5KXPA 2Z12A 3AGHA 1JISA 4J7VA 1G0KA 4TSBA 1VAUA 5JENB 1QDTA 2ZYCA 1L63A 5LYMA 1MLCE 1DYFA 1L28A 2XBRA 4HJZA 3B0IA 2PC2A 1VATA 1QQYA 1SSYA 2A7DA 2MEFA 1GDXA 1L95A 1BB6A 1IY4A 1KXXA 1B6IA 1OVHA 2VB1A 4KPMA 3UONA 2HEBA 1B7OA 3A8ZA 4WLYA 1L97A 3K2RA 4WLDA 4ARQA 1P6YA 1XGUC 4E97A 1QTZA 1L75A 1LYHA 2RBSA 134LA 3CDQA 1T8AA 3CT0A 5D5FA 1HHLA 1LYSA 3TXIA 5II3A 4W51A 1HNLA 196LA 4R0FA 1IP3A 1LMTA 1B5VA 1QTCA 1ZV5L 1IY3A 1P7SA 1RCMA 212LA 1LPIA 1JUGA 1J1OY 1BHZA 111LA 1GB8A 4O34A 193LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4H9A A;  1L47 A;  1LJN A;  2YSS C;  4HJY A;  230L A;  147L A;  2O79 A;  4HSF A;  1NF5 A;  218L A;  4IAS A;  175L A;  4L41 A;  3C80 A;  3A94 A;  1L40 A;  2B70 A;  2Z2F A;  4B4I A;  5HMJ A;  3RW8 A;  1UIB A;  4ARJ A;  4XJB A;  4HP0 A;  4WM2 A;  1IVM A;  3HDE A;  5LVK A;  5KXW A;  1L21 A;  1QT5 A;  1EQ4 A;  1GHL A;  258L A;  1VED A;  1P46 A;  1XFP L;  169L A;  5I14 A;  2Z18 A;  1I6S A;  166L A;  1TCY A;  211L A;  1H6M A;  1CKG A;  2OTY X;  1L48 A;  1D0L A;  1TEW A;  3WPJ A;  1IOQ A;  2X0A A;  3C8S A;  1LHI A;  1QDR A;  233L A;  1HF4 A;  8LYZ A;  2HU3 A;  135L A;  5FHW A;  123L A;  3SBA A;  3SB5 A;  3DN1 A;  1V7T A;  1C6C A;  1C6L A;  1LJF A;  2OU8 A;  2HTX A;  4GCC A;  1QUT A;  217L A;  2O7A A;  4H8X A;  5KXM A;  4H9F A;  4WM5 A;  3ZVQ B;  2XTH A;  3LN2 A;  3CDV A;  1L38 A;  2F4A A;  4N8Z A;  3A96 A;  1L08 A;  1L22 A;  1L05 A;  1KIQ C;  4ZEE A;  2HUK A;  4PGJ B;  2F2Q A;  2ZIK A;  3C81 A;  2YBN A;  4HPI A;  1WVU A;  176L A;  1L36 A;  1UUZ C;  1L02 A;  1IR8 A;  1GWD A;  2RAZ X;  3W6D A;  3WVX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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