1L66A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAASELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l66A00
2OE7X 1P56A 1L72A 2NTGA 2Z6BA 107LA 3L2XA 150LA 1EPYA 1CUQA 170LA 113LA 1L80A 1L08A 4I7KA 4W59A 1L14A 5I14A 165LA 1KY0A 1L49A 151LA 114LA 1T97A 1T8FA 3NYAA 4GRVA 123LA 1L48A 1DYAA 233LA 1L98A 226LA 1C69A 137LA 167LA 1QUDA 236LA 4ARPA 1L05A 109LA 219LA 218LA 1DYCA 3C80A 1C6NA 210LA 2B73A 2Q9EA 144LA 4I7SA 3GULA 1L46A 130LA 4ZPUA 1ZYTA 3HH5A 1CV0A 1KY1A 1L85A 162LA 3SB5A 4YXCA 1L86A 1C68A 1G0LA 4AQNA 222LA 3DMVA 1L74A 1L03A 1L40A 2RB2X 4W53A 2F2QA 189LA 2NTHA 1G06A 1L95A 1LLHA 1L37A 1LYEA 103LA 1C62A 128LA 2RAZX 260LA 1WTHA 250LA 3DNAA 4ARJA 1L56A 1CX7A 1KW5A 1D3MA 111LA 3DN3A 1L30A 1L57A 1L58A 1D2WA 1C6DA 1L94A 2RBOA 1C6TA 3C81A 1L92A 1L39A 1L73A 1PQJA 1PQKA 3OE8A 1QUHA 1L35A 1L93A 1KW7A 1P46A 1CU0A 1G07A 1D2YA 108LA 158LA 1LYDA 126LA 1JTMA 2B6WA 4S0WA 3F8VA 1KNIA 1L43A 1LGWA 1L16A 1SWYA 183LA 3DN1A 1L53A 3GUOA 4LDOA 255LA 2B70A 4I7NA 2B72A 212LA 173LA 168LA 180LA 141LA 175LA 3HT6A 2O79A 1C6BA 1L02A 3FI5A 1L77A 2OU8A 177LA 1L84A 1L81A 232LA 1L09A 3C82A 1L64A 1C61A 1JQUA 1L42A 2RAYX 4YXAC 1L87A 2B6TA 247LA 1L17A 1SWZA 3FADA 1L38A 127LA 3C8QA 1SX7A 4DKLA 4ARQB 3HDEA 1CU6A 3SB9A 3CDRA 4EKPA 256LA 1L83A 1PQIA 1P3NA 1DYGA 120LA 223LA 1SSWA 3GUIA 1L65A 1C6FA 220LA 3CDVA 4ARQA 1P2LA 2QB0B 3C8RA 1QUGA 1QS9A 224LA 155LA 1P6YA 2B6XA 259LA 3CDQA 209LA 182LA 1L69A 2RBSA 4IAPA 1L13A 4LDEA 245LA 149LA 125LA 1C63A 3NY8A 2O7AA 171LA 178LA 157LA 2HUMA 3GUKA 4W58A 1CU5A 1L68A 1G0PA 4ARLA 4LDLA 160LA 1DYDA 1C6KA 3DN6A 3OE0A 1QT8A 1XJTA 1L76A 1QTCA 211LA 2RB1X 3GUJA 3HTBA 3DN8A 161LA 3K2RA 185LA 1P36A 1C6AA 3DKEX 1L99A 2CUUA 4I7MA 119LA 2RH1A 1L22A 241LA 1L82A 1SSYA 4W57A 3V2WA 4YX7C 1L33A 1QT6A 248LA 2RBQA 1G1WA 3HUKA 110LA 262LA 1L51A 2RBNA 1C64A 261LA 3SB6A 1L28A 1QSBA 1T8GA 1L62A 3HDFA 1C6LA 3HTGA 1LYGA 3G3XA 1L01A 159LA 1QT4A 1L0JA 1G0KA 4ARMB 164LA 201LA 3LZMA 2B6YA 205LA 1CV3A 1CV5A 235LA 3DN2A 190LA 1G0MA 1P37A 2L78A 3VW7A 1QUOA 4OO9A 1QSQA 1G1VA 1DYBA 243LA 1OWYA 242LA 229LA 3UONA 1L10A 1L60A 1LYHA 1XJUA 3G3VA 3HTDA 1CV4A 2LZMA 1C66A 1G0GA 3ODUA 2F32A 195LA 4I7PA 138LA 2HUKA 152LA 1L45A 140LA 4EXMA 1L0KA 181LA 3HT8A 2LCBA 1L75A 3SBAA 214LA 3DN4A 104LA 1L11A 238LA 3SN6R 3SBBC 1L91A 1LWGA 257LA 2A4TA 230LA 3V2YA 1L27A 1L67A 3QAKA 200LA 1L63A 2OEAX 174LA 1L89A 3HT7A 1L04A 225LA 2OE4X 3OE6A 4I7RA 244LA 1OVJA 2ANVA 3FA0A 4W55A 2OE9X 213LA 3C7WA 197LA 1LYFA 1CU3A 1L34A 166LA 1L31A 1CX6A 122LA 249LA 1L23A 4EKSA 3SB8A 2F47A 258LA 1D3NA 234LA 2RB0X 1L36A 1L47A 1OV5A 2Q9DA 3SB7A 3L64A 1T8AA 1D3JA 240LA 1G0QA 206LA 1DYFA 1C6PA 251LA 3JR6A 4EPFA 192LA 1C6HA 1L96A 3PBLA 115LA 2RBPA 176LA 1QT7A 1QTBA 3HUAA 1L20A 1C60A 3PDSA 3CDTA 1L61A 1L71A 1OV7A 1QT3A 2HULA 1OVKA 186LA 3EMLA 112LA 1PQDA 3DN0A 4I7QA 142LA 1L55A 1G0JA 143LA 198LA 4LZMA 4W54A 3HWLA 1L54A 3HH6A 3DMXA 4W56A 1LW9A 129LA 1L19A 231LA 146LA 191LA 246LA 3HT9A 163LA 169LA 139LA 1L79A 1LPYA 1QTHA 1OVHA 2RBRA 4W52A 1KS3A 3G3WA 1TLAA 4PK0A 1L25A 1L90A 6LZMA 1L32A 1ZURA 1DYEA 4EPIA 1L59A 5LZMA 188LA 3HTFA 4I7LA 1CV1A 253LA 1CVKA 2O4WA 1OYUA 1QTZA 4E97A 147LA 1LGUA 1PQOA 1SX2A 1NHBA 3HH3A 1C6JA 4I7OA 2OU0X 221LA 1L44A 2QARC 1D9WA 1L97A 227LA 2OU9A 1C6MA 1L50A 1L12A 3RZEA 1CUPA 4PJZA 1OWZA 1P7SA 1LI3A 131LA 4I7JA 2LC9A 156LA 3HU9A 228LA 1L88A 3RUNA 4I7TA 3F9LA 4ARMA 1L70A 3GUPA 1LYIA 199LA 1P64A 1L00A 1QTVA 239LA 2B74A 4GBRB 252LA 1L06A 254LA 1C6CA 7LZMA 1XEPA 1L66A 1T6HA 1L52A 4K5YA 1C6EA 1JTNA 3OE9A 196LA 1LWKA 1P5CA 1C67A 1LI2A 1PQMA 118LA 2ANXA 237LA 217LA 1C6QA 1L18A 3C7ZA 4DJHA 1LI6A 1QT5A 1QTDA 1L15A 172LA 4W51A 1C6IA 1K28A 1L29A 3DMZA 102LA 145LA 2OTZX 4EJ4A 1QS5A 1ZWNA 1D3FA 1CV6A 1L21A 1L26A 215LA 3HUQA 3C8SA 1B6IA 4EKRA 1L07A 3C7YA 3GUNA 3NY9A 1C65A 1P2RA 2B6ZA 184LA 216LA 2OTYX 1CTWA 187LA 2B75A 3HU8A 3D4SA 4EKQA 4DAJA 148LE 1LYJA 3C83A 2B7XA 1L24A 1CU2A 3GUMA 2IGCA 3CDOA 1I6SA 1LGXA 3HH4A 1L41A 1C6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OE7X 1P56A 2HTXA 1VDPA 2G4QA 135LA 2CJLA 1EPYA 1CUQA 170LA 1C45A 5ILCA 4I7KA 1WQPA 1L14A 4DD0A 5I14A 151LA 1T8FA 5I4YA 2YBHA 1GBYA 1DYAA 233LA 226LA 3B0KA 4ETDA 167LA 1QUDA 1GFGA 4J0LA 1LZ9A 4IATA 8LYZA 219LA 3C80A 3AW7A 2B73A 3P64A 2Q9EA 144LA 4NSHA 3GULA 1JITA 1ZYTA 3TXBA 1CV0A 1KY1A 4YXCA 1G0LA 2F4AA 1DI3A 4XJFA 1L74A 1B7PA 4WLDA 2PC2A 4N1EI 1LZDA 1G06A 2YBIA 1L95A 4KXIA 1JTOL 3IJVA 260LA 1BWHA 1B7MA 250LA 4NSJA 3AYQA 1B0DA 1LSPA 1CX7A 1AKIA 2BQAA 4ET9A 4W94A 1B7LA 1L94A 2CGIA 1GFTA 2XTHA 1C6TA 3J6KA 3C81A 4G9SA 4LFPA 1H6MA 3OE8A 1LSZA 1QUHA 1L35A 1P46A 2DQCY 1WQRA 158LA 1LZGA 4C5FA 1JTPL 2DQEY 4XN6A 1L16A 183LA 3GUOA 5F81A 212LA 168LA 180LA 141LA 4OOOA 1C6BA 1P2CC 1REYA 2OU8A 1LJIA 1DI5A 1G7HC 1L81A 2BLXA 3HBEX 3C82A 1L09A 1LOZA 2DQHY 1L42A 1CJ6A 1L87A 2B6TA 3FADA 1JSFA 4H1PA 2ZNXY 3HDEA 1CU6A 207LA 1QTKA 4EKPA 1JKBA 1REMA 1FLWA 2ZNWY 3A90A 3GUIA 4PPOA 1UICA 1L65A 3CDVA 2Z19A 3D9AC 3C8RA 1IR9A 1QUGA 224LA 3QE8A 1YAQA 155LA 4MCKA 1UIBA 259LA 3CDQA 1LZRA 4HJYA 4WG1A 1L69A 2RBSA 4IAPA 1L13A 4AGAA 2XQOA 1IOTA 4NHPA 125LA 1HEWA 2O7AA 5B05A 4NGZA 2HUMA 1L68A 3EXDA 1G0PA 1LZTA 4LDLA 3CSZA 4D9ZA 3DN6A 2ZYPA 4TTDA 3AGHA 3B72A 2I25L 1P36A 1L99A 2CUUA 1QTEA 1HEQA 1LJNA 1L82A 1SSYA 4W57A 2RBQA 1ZMYL 3A3RX 1IWWA 4WLYA 1C64A 1BHZA 1XGTC 1JIYA 2D4JA 1L01A 4HTNA 4KT3A 4DQJA 1L0JA 7LYZA 4R6CA 2B6YA 3TXDA 190LA 5DN5A 3LHMA 1QSQA 1GBXA 2WARA 2IHLA 1L60A 1XJUA 3WUNA 3HTDA 1CV4A 1C66A 1LSYA 5DM9A 1IP5A 4I7PA 1L0KA 3HT8A 1LJHA 4XJBA 2HU1A 1L11A 1LZ4A 1W6ZA 238LA 3SN6R 1IC7Y 1L91A 1LWGA 257LA 4B4IA 1GF5A 1L67A 2LYZA 5D5FA 1L63A 2DQDY 3HT7A 1L04A 1B5VA 1JEFA 2OE4X 4I7RA 4ZIXA 1WTNA 3IWRA 3FA0A 4J1BA 4W55A 3FE0A 197LA 1LYFA 1IOSA 1ZVYB 1CU3A 1L31A 166LA 1L23A 4EKSA 3A6CY 1D3NA 2RB0X 1GB2A 2Q9DA 3SB7A 1TEWA 1N4FA 2EKSC 1T8AA 1G0QA 206LA 2ZILA 1GB5A 251LA 3JR6A 2DQFC 2W1LA 1L96A 1OUJA 1B5UA 2XBRA 4NHTA 2RBPA 1QUTA 176LA 1LMOA 1QT7A 1QTBA 3HUAA 3SP3A 4HPEA 1L20A 3PDSA 3CDTA 1NWGA 1L61A 1L71A 3N9AA 4C3WA 1JTTL 3WVYA 3WXUA 4XJHA 112LA 1PQDA 1JHLA 5KKJA 1KXWA 3HH6A 4LGKA 129LA 1L19A 3TMWA 3WPLA 191LA 246LA 3HT9A 3A91A 1BQLY 4CFOA 2EQLA 1L79A 2RBRA 1F0WA 1LZYA 1TLAA 4NIJA 1IR8A 1L32A 1LSBA 1LJFA 1ZURA 4EPIA 1L59A 1EQ5A 3HTFA 253LA 2O4WA 1J1OY 2BQGA 1PQOA 1IEEA 1IIZA 1C6JA 4TWSA 1AT5A 2QARC 1D9WA 3W6EA 1L97A 2OU9A 2ZYCA 1C6MA 2LYMA 4BAFA 1NF5A 1BB5A 1GF0A 1OWZA 1P7SA 2D4IA 4PGJB 4AXTA 3ZVQB 1HFZA 4RLNA 1I56A 4TUNA 3RUNA 1LYIA 3WPKA 1P64A 1HF4A 1QTVA 1IWUA 4GBRB 1KIQC 4YF2A 1C43A 1XEPA 2C8OA 1L66A 2Y8PA 1L52A 4K5YA 4LT0A 1C6EA 1QIOA 1LWKA 1BB6A 1LI2A 4ETAA 4N0JA 2Z12A 3KAMA 1I20A 2F30A 4DJHA 1ALCA 1PS5A 1BWJA 172LA 1L29A 3DMZA 102LA 1UA6Y 4WLXA 4FJRA 1ZWNA 4H92A 215LA 5FCPA 2BQHA 4GCEA 1L07A 3GUNA 4GCCA 3NY9A 1GFJA 2B6ZA 5E9RA 5T3FA 1LSDA 1FBIX 4EKQA 1AM7A 4DAJA 5HNLA 1I1ZA 3C83A 5KKIA 4Z98A 4WMGA 2D6BA 1CJ7A 1REZA 2Z6BA 107LA 4GN4A 4MR1A 5B07A 1L80A 1G7MC 1EQEA 1TCYA 4GRVA 3T6UA 1JUGA 1NBZC 1LJGA 1B5ZA 4MSTA 1LJEA 1L05A 218LA 3WW5A 1DI4A 5II3A 1DYCA 4I7SA 1GFKA 1GD6A 130LA 1O23A 3HH5A 2AUBA 1YAMA 1HSXA 3SB5A 1JJ1A 1L86A 3CSQA 4GN3A 4L41A 1GE1A 1L03A 2F2QA 1XFPL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2OE7 X;  1P56 A;  2HTX A;  1VDP A;  2G4Q A;  135L A;  2CJL A;  1EPY A;  1CUQ A;  170L A;  1C45 A;  5ILC A;  4I7K A;  1WQP A;  1L14 A;  4DD0 A;  5I14 A;  151L A;  1T8F A;  5I4Y A;  2YBH A;  1GBY A;  1DYA A;  233L A;  226L A;  3B0K A;  4ETD A;  167L A;  1QUD A;  1GFG A;  4J0L A;  1LZ9 A;  4IAT A;  8LYZ A;  219L A;  3C80 A;  3AW7 A;  2B73 A;  3P64 A;  2Q9E A;  144L A;  4NSH A;  3GUL A;  1JIT A;  1ZYT A;  3TXB A;  1CV0 A;  1KY1 A;  4YXC A;  1G0L A;  2F4A A;  1DI3 A;  4XJF A;  1L74 A;  1B7P A;  4WLD A;  2PC2 A;  4N1E I;  1LZD A;  1G06 A;  2YBI A;  1L95 A;  4KXI A;  1JTO L;  3IJV A;  260L A;  1BWH A;  1B7M A;  250L A;  4NSJ A;  3AYQ A;  1B0D A;  1LSP A;  1CX7 A;  1AKI A;  2BQA A;  4ET9 A;  4W94 A;  1B7L A;  1L94 A;  2CGI A;  1GFT A;  2XTH A;  1C6T A;  3J6K A;  3C81 A;  4G9S A;  4LFP A;  1H6M A;  3OE8 A;  1LSZ A;  1QUH A;  1L35 A;  1P46 A;  2DQC Y;  1WQR A;  158L A;  1LZG A;  4C5F A;  1JTP L;  2DQE Y;  4XN6 A;  1L16 A;  183L A;  3GUO A;  5F81 A;  212L A;  168L A;  180L A;  141L A;  4OOO A;  1C6B A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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