1L91A

Similar hydrophobic replacements of leu 99 and phe 153 within the core of t4 lysozyme have different structural and thermodynamic consequences
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAFINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Similar hydrophobic replacements of Leu99 and Phe153 within the core of T4 lysozyme have different structural and thermodynamic consequences.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l91A00
1SSYA 180LA 2RB1X 1LYDA 2OE7X 1WTHA 4W56A 2CUUA 205LA 1L42A 1D3JA 2OEAX 3PDSA 261LA 1OVHA 257LA 3HUQA 1L77A 114LA 1T97A 2HUMA 3DN0A 1QSBA 1QT4A 227LA 1JTNA 4I7MA 1P3NA 238LA 4ARQA 3OE0A 1QTDA 2RAYX 1D9WA 197LA 4W54A 1D3MA 2B6XA 3GUIA 1SWYA 2RAZX 1L35A 255LA 142LA 1C6MA 2LCBA 164LA 1LYIA 162LA 3HTGA 1CV6A 1L53A 2RBPA 177LA 1LYGA 1DYEA 1L21A 3HDFA 168LA 3OE8A 4S0WA 1P6YA 189LA 209LA 1QSQA 4IAPA 1L46A 1QUHA 1L43A 1PQOA 4EPIA 222LA 110LA 108LA 1CTWA 1LYFA 1QS9A 1L39A 3GUPA 1KW7A 1QS5A 1CV5A 1L90A 2O79A 1L83A 228LA 2O4WA 3FI5A 192LA 176LA 3FADA 3V2WA 3C81A 174LA 4ARMA 1OWYA 1P7SA 152LA 246LA 184LA 262LA 4LDOA 2B70A 1L07A 1L75A 1C6BA 3DMXA 254LA 1C6NA 2B6ZA 3DMZA 3HH5A 1CU0A 187LA 1KY0A 3C7WA 2RBNA 2A4TA 3OE6A 218LA 1G1VA 1I6SA 2OU0X 4EKSA 138LA 1C65A 1P46A 1C6LA 4YXAC 1CU5A 159LA 1XJTA 1L57A 4GRVA 1QTCA 1D3NA 1QT5A 3CDOA 1LWGA 4K5YA 1QUDA 4OO9A 1SWZA 2QARC 1PQIA 3DN6A 102LA 3F9LA 1L29A 1OVKA 139LA 140LA 4I7KA 1L13A 1LGXA 1L82A 1OYUA 2NTHA 125LA 1L93A 1L32A 1L80A 170LA 1P37A 3SB9A 235LA 2RB0X 3NYAA 1CX7A 1G06A 150LA 1L08A 2OU9A 1SX2A 3SBBC 3L2XA 1L74A 201LA 1L17A 6LZMA 2ANVA 210LA 1G0GA 120LA 3K2RA 1L10A 1T8AA 3SBAA 2Q9DA 1QT3A 3C7ZA 3GULA 1L64A 1CV4A 163LA 1DYFA 1P2RA 248LA 1EPYA 4I7OA 3HT6A 216LA 1L45A 3NY8A 137LA 182LA 1L71A 3DKEX 245LA 4W53A 3GUMA 2L78A 1LWKA 4W55A 3G3WA 220LA 3CDTA 3DN1A 3SN6R 118LA 2B6WA 160LA 1L65A 239LA 181LA 1K28A 3VW7A 1L31A 7LZMA 1LYHA 3SB6A 1JQUA 229LA 4I7TA 1NHBA 115LA 1G07A 1PQJA 1D2YA 1C6QA 4ARLA 111LA 2NTGA 211LA 3HT7A 214LA 3SB8A 3RUNA 2OTYX 3HUKA 195LA 1L85A 1L00A 1L06A 4I7QA 1L92A 3C7YA 130LA 2RB2X 1G0QA 1L54A 1LI6A 4W59A 230LA 4ARJA 1T8FA 252LA 107LA 165LA 1L79A 4I7NA 4W58A 4YXCA 223LA 1C6AA 3C82A 2OE4X 3DMVA 3L64A 1L49A 3HTDA 1C68A 1T8GA 4I7SA 3SB7A 119LA 1C60A 1L70A 3DN8A 4EJ4A 1L72A 2F32A 1L37A 1C6TA 1P2LA 1G1WA 1C69A 1LI2A 2LZMA 237LA 183LA 1QT8A 123LA 1L41A 1KNIA 2B74A 1L52A 3QAKA 1L18A 242LA 2HULA 196LA 1C6GA 234LA 1L26A 1G0JA 1QT7A 224LA 1L69A 1L38A 244LA 172LA 191LA 1G0KA 1L95A 1L76A 2B6YA 3C8RA 4AQNA 3HU9A 2HUKA 1KW5A 4W52A 2Z6BA 128LA 1L61A 1CVKA 226LA 113LA 1CUPA 1L02A 3G3VA 4GBRB 4I7JA 1L33A 1ZYTA 3HTBA 1LGUA 247LA 3ODUA 1C6DA 1L89A 2OE9X 1L47A 2QB0B 4PJZA 3G3XA 1CV1A 4EKPA 1LGWA 253LA 2B72A 4W51A 1CU2A 1L81A 155LA 3SB5A 129LA 175LA 1L34A 4I7RA 2B6TA 4PK0A 243LA 148LE 1QTZA 1T6HA 1L96A 225LA 2LC9A 3DN2A 4ARPA 1QT6A 4EXMA 1C62A 1PQMA 251LA 1ZWNA 1L11A 1LYJA 141LA 143LA 1L88A 256LA 1L20A 1LLHA 1L24A 4E97A 1C6HA 1L73A 3HUAA 3OE9A 259LA 1L04A 1L0JA 1CV3A 1C6KA 1CV0A 1CX6A 232LA 1C61A 1L51A 1C6PA 213LA 1OWZA 131LA 4LDEA 4DKLA 1KS3A 144LA 3F8VA 2IGCA 2O7AA 1L22A 1DYCA 3CDQA 1P56A 2OTZX 2RBSA 167LA 250LA 258LA 1L12A 1OVJA 1L67A 4DJHA 200LA 151LA 3C80A 149LA 2F47A 186LA 1L40A 122LA 145LA 1L48A 1L58A 1XJUA 3HT9A 1DYDA 1D2WA 166LA 1CUQA 127LA 1L27A 1XEPA 206LA 4LZMA 1C63A 3CDVA 1SX7A 103LA 1L03A 3NY9A 157LA 1C6IA 1D3FA 3HTFA 2RBOA 3DN4A 212LA 1L0KA 1L50A 1OV7A 1P36A 2RBQA 188LA 1L19A 158LA 1LW9A 1JTMA 1L63A 104LA 3RZEA 126LA 1L25A 1C6CA 178LA 161LA 1LPYA 2ANXA 1L56A 4I7LA 2F2QA 1L86A 4ARQB 3HU8A 1L28A 1CU6A 3EMLA 5I14A 1C6JA 240LA 198LA 4EKQA 1C66A 236LA 1SSWA 1L16A 2B75A 1L98A 3HH3A 4I7PA 1QTBA 4LDLA 1L23A 171LA 3HH6A 1L68A 215LA 5LZMA 4DAJA 1DYAA 1B6IA 1L91A 1C6FA 1G0LA 2B73A 3PBLA 260LA 1L59A 1L62A 146LA 1G0PA 1PQKA 1L60A 190LA 1L36A 2RBRA 185LA 1OV5A 1C67A 219LA 2OU8A 3CDRA 1L05A 3GUNA 4EKRA 3HT8A 1TLAA 1L15A 221LA 2B7XA 3V2YA 1G0MA 199LA 1L84A 1L55A 1QTVA 3D4SA 1KY1A 3GUKA 1L09A 233LA 1L14A 4ARMB 112LA 1ZURA 1PQDA 1DYGA 1DYBA 1L44A 249LA 1L97A 3DN3A 3LZMA 3FA0A 1QUOA 169LA 3HDEA 173LA 156LA 3C8SA 4ZPUA 4YX7C 1LYEA 3HH4A 1L01A 4EPFA 1LI3A 3C83A 3GUJA 1C64A 1L66A 3C8QA 1QTHA 2Q9EA 3HWLA 1L94A 1P5CA 2RH1A 1L87A 231LA 3JR6A 3DNAA 1C6EA 4W57A 3GUOA 1L99A 1QUGA 1P64A 147LA 109LA 1CU3A 3UONA 1L30A 217LA 241LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BVKC 1LZGA 4NHSA 4W56A 1XSFA 1UIFA 1D3JA 1ZV5L 4H93A 5L9JA 1YAPA 3HFMY 1TEWA 1B5YA 4B4IA 1LSGA 3OE0A 4QEQA 4NGLA 5APFA 1LSAA 4W54A 2BQAA 4B0DA 1SWYA 1KXYA 3SP3A 1C6MA 5A3ZA 1D0KA 1SQ2L 3RZ4A 1HEQA 1J1XY 5FEKA 1L21A 168LA 1GF0A 3W6BA 1LHMA 1QUHA 4Z98A 1CTWA 1LYFA 1L39A 3GUPA 3ATNA 1CV5A 1D0MA 2O4WA 4UWVA 5DM9A 4N9RA 4GN5C 3FADA 3V2WA 4NFVA 1GB7A 3C81A 3WXUA 174LA 1OWYA 1JJ0A 2HU3A 1IR7A 3B0OA 5DL9A 4LDOA 1WQNA 2B70A 3N9AA 3BKHA 4DQ7A 1C6BA 5LA8A 1W6ZA 2ZQ3A 2BQOA 5KXZA 3DMZA 2Z37A 3WW6A 3WXTA 1LKRA 1G7HC 2RBNA 2A4TA 3FE0A 1UBZA 1G1VA 4YEOA 1C6LA 5HNLA 4DD1A 159LA 4GRVA 3CDOA 4R0FA 1B0DA 1CJ7A 1QUDA 3DN6A 4DYGA 1IP6A 139LA 1GE2A 1LGXA 1OYUA 125LA 1L93A 3TMXA 2RB0X 2OU9A 3L2XA 1LJGA 2ANVA 120LA 1QTKA 3GXRA 1L10A 3A94A 2Q9DA 2D4JA 3C7ZA 3TXJA 1DYFA 5D5CA 4GCBA 4HV2A 133LA 3LYZA 216LA 1L45A 3AW6A 1REYA 4W55A 4NGVA 1GF4A 1DI5A 2B6WA 1L65A 1SLYA 5LINA 1OUDA 239LA 4H9CA 3SB6A 229LA 3OK0A 111LA 1UIDA 214LA 3RUNA 4Z41A 2MEAA 1GB5A 1F6RA 195LA 1LZTA 1UA6Y 1L92A 1C43A 1G0QA 1JSEA 4W59A 4WOAA 2I25L 2YBIA 3CT5A 1LJJA 1L49A 4OWHA 119LA 1LZ8A 3A3RX 4EJ4A 1L37A 1C6TA 1XGQC 4M6DA 237LA 1QT8A 1TAYA 1L41A 5C6IA 1ZVHL 1L18A 1LSEA 1GFKA 234LA 1QT7A 224LA 1REZA 172LA 1L95A 4DD3A 4W52A 128LA 113LA 5F9XA 1VATA 135LA 1L33A 2DQAA 1B7MA 4TUNA 3F6ZA 4KXIA 247LA 1L89A 4HV1A 1YAOA 1OUHA 4TTDA 2B72A 1LZ9A 4W51A 1I56A 2W1YA 1L81A 1DPWA 129LA 1IWUA 3P66A 4PK0A 2LZTA 1JKCA 2HEBA 1T6HA 225LA 1L96A 4DD0A 1JIYA 1LSNA 1UC0A 4EXMA 2BQDA 3A93A 1GBSA 1NBYC 1L11A 1LYJA 5KXKA 1LYSA 1DI4A 4DDCA 1C7PA 4W96A 1L73A 1JUGA 1CV3A 2HEFA 3B72A 1C6PA 3B0KA 4N1CC 4LDEA 1WQQA 2BAAA 1LCNA 2MEEA 1DYCA 3CDQA 2EQLA 5KXYA 2RBSA 4HPIA 4LT3A 250LA 1LHJA 2DQCY 200LA 149LA 208LA 2BQBA 1L40A 1XJUA 1L58A 1GE1A 1D0LA 5HMVA 4J1BA 1GPQC 2B5ZA 1BB6A 1L27A 1XEPA 1L03A 4PRUA 4G4HA 1EQ4A 4WLYA 1JKAA 2IFFY 4IJ4A 2MEIA 5EBHA 4CHXA 1HENA 1F6SA 3LZ2A 1W08A 1LSCA 104LA 1JISA 126LA 1L25A 5B59A 5KXXA 5HQ1A 4WG1A 1AKIA 1B5VA 2YSSC 2A7FA 5LVGA 4HTKA 1L28A 2FBDA 3ZEKA 1INUA 1NDGC 240LA 2LZ2A 1C66A 2B75A 1UIEA 4N1EI 3HH3A 1LJIA 171LA 1JTOL 3OJPA 3AZ4A 1G0LA 1TBYA 2B73A 2D91A 260LA 1G0PA 4H9IA 4R6CA 5AMYA 3G3AB 1L36A 4NGIA 1OV5A 4I0CA 4NSHA 1C67A 1L05A 2FYCA 2W1LA 3WUMA 1L15A 3W3EA 1QTVA 4RLMA 4OWCA 1WVVA 3WPLA 1P2CC 2BQMA 112LA 3P65A 1PQDA 1DYGA 2PC2A 1CJ6A 3LZMA 169LA 2DKVA 173LA 156LA 4ZPUA 3HH4A 3ZVQB 4EPFA 1LZDA 4H91A 1OQMA 4B49A 1UIHA 5F81A 231LA 1HEMA 2MECA 4LT0A 3JR6A 4W57A 3GUOA 4LYBA 1LSFA 2LYMA 1DI3A 1C10A 2RB1X 1HMLA 1GB0A 4CGEA 1LYDA 5IHGA 132LA 1L42A 1G7LC 2OEAX 4WLXA 1OVHA 1WQMA 1L77A 1T97A 2HUMA 3DN0A 1QT4A 227LA 1JTNA 3TXFA 1P3NA 238LA 1IO5A 4DWXA 3TXKA 1A4VA 1WTMA 1LJ4A 1B5ZA 3J4GA 2B6XA 3GUIA 2A7DA 142LA 2LCBA 1UUZC 1CKGA 3WL2A 2HU1A 2RBPA 3EXDA 4LZTA 1J1PY 1DYEA 3OE8A 1QDRA 4S0WA 1HEPA 4H9EA 5DN5A 3WPJA 4GLVA 209LA 4DD9A 1BB5A 1L43A 4EPIA 1REXA 1KW7A 1QS5A 1IWVA 1B5XA 1BQLY 1GFRA 176LA 5I4XA 1B5WA 4ARMA 1P7SA 152LA 2D4IA 4CFPA 4H90A 4H8YA 1B9OA 5FCPA 3WU8A 1L75A 6LYTA 2C8PA 5B07A 5B06A 2G4QA 4N8ZA 5LVIA 5F14A 187LA 4QY9A 1LMAA 1YILA 3ATOA 218LA 1GF8A 5I4YA 2ZNXY 4EKSA 138LA 1GBOA 3RNXA 4IATA 1D3NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BVK C;  1LZG A;  4NHS A;  4W56 A;  1XSF A;  1UIF A;  1D3J A;  1ZV5 L;  4H93 A;  5L9J A;  1YAP A;  3HFM Y;  1TEW A;  1B5Y A;  4B4I A;  1LSG A;  3OE0 A;  4QEQ A;  4NGL A;  5APF A;  1LSA A;  4W54 A;  2BQA A;  4B0D A;  1SWY A;  1KXY A;  3SP3 A;  1C6M A;  5A3Z A;  1D0K A;  1SQ2 L;  3RZ4 A;  1HEQ A;  1J1X Y;  5FEK A;  1L21 A;  168L A;  1GF0 A;  3W6B A;  1LHM A;  1QUH A;  4Z98 A;  1CTW A;  1LYF A;  1L39 A;  3GUP A;  3ATN A;  1CV5 A;  1D0M A;  2O4W A;  4UWV A;  5DM9 A;  4N9R A;  4GN5 C;  3FAD A;  3V2W A;  4NFV A;  1GB7 A;  3C81 A;  3WXU A;  174L A;  1OWY A;  1JJ0 A;  2HU3 A;  1IR7 A;  3B0O A;  5DL9 A;  4LDO A;  1WQN A;  2B70 A;  3N9A A;  3BKH A;  4DQ7 A;  1C6B A;  5LA8 A;  1W6Z A;  2ZQ3 A;  2BQO A;  5KXZ A;  3DMZ A;  2Z37 A;  3WW6 A;  3WXT A;  1LKR A;  1G7H C;  2RBN A;  2A4T A;  3FE0 A;  1UBZ A;  1G1V A;  4YEO A;  1C6L A;  5HNL A;  4DD1 A;  159L A;  4GRV A;  3CDO A;  4R0F A;  1B0D A;  1CJ7 A;  1QUD A;  3DN6 A;  4DYG A;  1IP6 A;  139L A;  1GE2 A;  1LGX A;  1OYU A;  125L A;  1L93 A;  3TMX A;  2RB0 X; 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