1L97A

Structure of a hinge-bending bacteriophage t4 lysozyme mutant, ile3-> pro
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNPFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a hinge-bending bacteriophage T4 lysozyme mutant, Ile3-->Pro.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 53
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l97A00
148LE 3SN6R 7LZMA 3DN4A 1CV3A 2RBSA 4ARLA 2B7XA 4W56A 3PDSA 2RB2X 1L05A 3HH5A 1L01A 1LGXA 158LA 1D3JA 1KW5A 2B75A 1CV5A 1L80A 6LZMA 1LPYA 3GUOA 1B6IA 1LYEA 1QT3A 206LA 1L79A 160LA 2F32A 248LA 1L73A 1T8GA 3NYAA 2RB1X 3HWLA 1JTNA 259LA 3L2XA 1C6JA 1XJTA 1L08A 1L50A 1L76A 1CX6A 3ODUA 107LA 1L07A 1CU3A 1L36A 227LA 261LA 2RBNA 3FADA 3JR6A 4S0WA 4EPIA 3C8SA 256LA 1L86A 3CDRA 1C63A 1C6DA 1L03A 1QT7A 3DN2A 126LA 3C8RA 3C82A 192LA 4W59A 149LA 1OV5A 1CV6A 240LA 1L93A 241LA 1SWYA 4EKSA 1QUDA 230LA 3EMLA 184LA 1G07A 225LA 1C6LA 1C67A 1KY1A 1L32A 236LA 2RH1A 4W53A 1C68A 200LA 3HTBA 108LA 171LA 4EKPA 1D2WA 3LZMA 147LA 1L58A 1L57A 1QTBA 2O4WA 120LA 1CV0A 3C7WA 1T8AA 130LA 4I7NA 2A4TA 2RBOA 4W51A 2Q9DA 1DYAA 1OV7A 104LA 1L14A 1LYFA 1CU5A 3HT8A 1C6MA 1CU0A 3D4SA 231LA 215LA 1P2RA 110LA 162LA 3CDTA 1L15A 1L18A 1LYHA 239LA 3HT6A 4GRVA 5I14A 242LA 2NTHA 1PQKA 2B6YA 1L02A 1L92A 1PQMA 1L21A 1QUOA 4DAJA 1L56A 223LA 114LA 3DNAA 4K5YA 237LA 2Q9EA 2B6ZA 122LA 1KNIA 246LA 3HTGA 3HUQA 1L06A 234LA 3C81A 1LW9A 211LA 1L88A 222LA 2OU9A 1L39A 1C6EA 167LA 129LA 3FI5A 1C6BA 3C83A 4IAPA 1L45A 152LA 3V2YA 4EPFA 1C6GA 3SBAA 4W55A 4GBRB 1C61A 189LA 1G1WA 3HU8A 190LA 2OU8A 1LYJA 2HUMA 1CV1A 1ZURA 1DYCA 3C7ZA 1C6QA 1CVKA 3HDEA 2LC9A 1OVJA 3VW7A 1LYDA 128LA 3C8QA 262LA 1PQDA 1LI2A 1L53A 109LA 2CUUA 113LA 3HT9A 233LA 1C6TA 3GUKA 1G0JA 2IGCA 2B73A 1L17A 201LA 1SSWA 3GUJA 1LYGA 1ZYTA 131LA 1KW7A 1LWKA 4ARJA 3HDFA 3DMXA 125LA 2F2QA 178LA 4PJZA 1L49A 127LA 255LA 228LA 1L75A 4YXCA 1L24A 1OYUA 188LA 1QT8A 1CU2A 1L31A 3HTFA 3DMVA 3SB9A 253LA 1D3NA 3PBLA 1G0QA 1L68A 2O7AA 111LA 243LA 3QAKA 244LA 199LA 3GUPA 2HULA 1L69A 1SX7A 1G0MA 4DJHA 1L89A 1L96A 2OTZX 3L64A 1PQOA 2B70A 4W54A 1L52A 3HUKA 115LA 209LA 4W52A 197LA 1L40A 1L64A 1LI6A 1L35A 1L87A 4E97A 2F47A 1L83A 2LCBA 3OE9A 1C6KA 138LA 3RZEA 1L28A 168LA 1L0JA 2HUKA 3GULA 4ARQB 4EXMA 257LA 1KS3A 245LA 4I7SA 1L91A 1L70A 3SB7A 249LA 1D9WA 3HH3A 182LA 1L97A 218LA 2RBRA 1C6IA 4I7JA 3RUNA 1L46A 1C6CA 1LI3A 1JQUA 3FA0A 3OE6A 143LA 1QT5A 1P2LA 1L20A 1DYFA 1QT4A 1L61A 3DN0A 1SX2A 1L72A 1L44A 235LA 1L67A 1L34A 1LGWA 142LA 3C7YA 3CDQA 1C66A 1K28A 3F8VA 4LZMA 1L54A 1TLAA 1G1VA 195LA 4ARQA 4W58A 2NTGA 251LA 1XEPA 1L95A 1ZWNA 2B72A 1P3NA 4I7TA 3G3VA 1L59A 1PQIA 3CDVA 174LA 1EPYA 1L98A 1LWGA 1WTHA 3DN3A 2Z6BA 1G06A 2B6XA 1L38A 216LA 229LA 2ANVA 2B74A 4ZPUA 1P36A 2O79A 4I7OA 3GUIA 1L19A 2OTYX 4YXAC 3HUAA 232LA 247LA 2QARC 1P46A 1L00A 4AQNA 1C6NA 3NY9A 198LA 4W57A 3HH4A 1C60A 212LA 1DYDA 1L29A 3DN6A 1C6AA 3HTDA 1QS9A 238LA 1C64A 2L78A 2OEAX 1NHBA 4I7KA 165LA 3OE8A 4I7LA 3SB8A 1L12A 226LA 3SBBC 191LA 260LA 3HH6A 1PQJA 1L60A 3SB5A 1QT6A 3G3XA 3CDOA 1QTHA 139LA 1L51A 1L10A 169LA 2B6TA 1QTZA 3GUNA 4I7RA 3DN8A 1L62A 4YX7C 175LA 164LA 2LZMA 173LA 1LGUA 1L13A 2OE9X 1T97A 3C80A 1CUQA 4ARMB 1L81A 1L23A 1L94A 1P6YA 1L63A 4LDOA 1C65A 1L77A 1L90A 1P64A 1CU6A 219LA 1T8FA 163LA 217LA 1LLHA 1C6FA 186LA 1DYGA 2OE7X 1DYBA 1P5CA 176LA 3V2WA 177LA 1L99A 1JTMA 214LA 1L71A 252LA 1L74A 1L27A 2RB0X 4OO9A 1L25A 1G0KA 118LA 141LA 2RBPA 123LA 4ARMA 3UONA 146LA 3OE0A 213LA 150LA 155LA 3DN1A 3DMZA 220LA 4I7QA 1DYEA 1L30A 3SB6A 1L11A 1OVKA 4ARPA 2RAZX 172LA 1G0GA 112LA 1SSYA 221LA 1L04A 1L85A 2OU0X 1QSBA 2RBQA 4I7PA 3G3WA 1L65A 1D3FA 119LA 210LA 2OE4X 205LA 1OVHA 1L41A 1QTDA 1G0LA 1SWZA 258LA 3DKEX 183LA 4PK0A 156LA 145LA 187LA 1L09A 1CTWA 2B6WA 1T6HA 3HT7A 1CUPA 1QS5A 2ANXA 1I6SA 144LA 1L37A 1C62A 157LA 140LA 1L26A 1QUGA 1OWZA 254LA 3GUMA 181LA 4EKRA 1L42A 1C6HA 1L82A 1QUHA 1L0KA 3F9LA 196LA 1CX7A 1L48A 3K2RA 1L16A 4I7MA 1D2YA 250LA 1P56A 161LA 1QTVA 4LDLA 1CV4A 1G0PA 4EKQA 4EJ4A 1P37A 1L33A 2RAYX 1XJUA 103LA 3NY8A 4LDEA 1L84A 170LA 2QB0B 1QTCA 4DKLA 1OWYA 180LA 166LA 151LA 1QSQA 1L66A 185LA 1L55A 102LA 3HU9A 5LZMA 1LYIA 1L22A 1P7SA 1C69A 137LA 1L47A 1D3MA 1C6PA 1KY0A 1L43A 224LA 159LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
148LE 7LZMA 5KXKA 4NSIA 3W6FA 3QY4A 2B7XA 3PDSA 3HH5A 1GFJA 1LGXA 1LJIA 4D9ZA 1D3JA 5K7OA 4NGWA 1LPYA 2Z12A 3GUOA 4MR1A 1REYA 2MEIA 2F32A 1L73A 3WPLA 1T8GA 1YL1X 5KXTA 1JTNA 259LA 1QDRA 4NGIA 5LAGA 1L08A 4YENA 3ODUA 1CX6A 107LA 261LA 3CSRA 1L36A 227LA 3FADA 1REZA 2BAAA 5HNLA 2YBHA 3CDRA 2G4NA 4RLNA 1DI4A 2MEAA 4DC4A 4NSGA 1TEWA 4TX7A 1SWYA 4EKSA 3GXKA 4NGYA 4H8XA 3IJUA 4CJ2A 5HMVA 1L32A 1TDYA 5B59A 1C68A 108LA 4H9AA 4HJYA 3D9AC 4EKPA 1D2WA 1YAPA 3RNXA 1GFVA 1QTBA 1CV0A 1T8AA 1EQEA 2XBRA 1J1OY 1RCMA 1DYAA 3CSQA 1LYFA 5F9UA 1D0KA 3HT8A 1JIYA 1IOQA 4DYGA 1RJCB 1P2RA 110LA 3E3DA 1IWZA 1NDGC 1L18A 1B7SA 242LA 2NTHA 4RLMA 2FYCA 2DQEY 1D0MA 1LSNA 1L21A 2BQLA 1QUOA 5DN4A 1QSWA 237LA 1GFAA 246LA 3LYMA 2ZIKA 3WU9A 222LA 4NHPA 3TXBA 2BQEA 1BVKC 167LA 1C6BA 5L9JA 1L45A 1UUZC 1GXXA 2WARA 2DQHY 3HU8A 190LA 1D6QA 1ZURA 1C10A 1LYZA 4WLYA 4HTKA 1GAYA 1LHIA 3P4ZA 1OVJA 3TXFA 1LYDA 128LA 1GBZA 2EIZC 4XJHA 4KPMA 4YEOA 233LA 1BVXA 1FDLY 4HP0A 1L17A 3GUJA 1LCNA 4LT3A 3A6BY 1LWKA 125LA 2F2QA 2F2NA 2D6BA 1OYUA 4NEBA 3HTFA 4XADA 1NQIA 253LA 4WM4A 1IP1A 1VDQA 4WM1A 3GUPA 2HULA 3A93A 4DJHA 2H5ZA 1L96A 1LSDA 5F9XA 2B70A 4W54A 3EMSA 2C8OA 1L40A 3WXTA 3N9EA 4XJBA 3WUAA 4E97A 4ET8A 5KY1A 1GWDA 3RT5X 2LCBA 3OE9A 1C6KA 2ZQ4A 1E8LA 1OUBA 3RZEA 168LA 1KS3A 3SB7A 2HEFA 1LMNA 218LA 1BWIA 1C6CA 1JQUA 1QT5A 3AZ6A 4WM3A 4LYBA 3DN0A 1GF7A 1L72A 194LA 1IR7A 1L34A 1DPWA 1HSXA 4R6CA 1L54A 4ARQA 2NTGA 3TMUA 1ZWNA 5FDJA 1G06A 1JITA 5KKIA 229LA 2ANVA 2Z38A 2O79A 1C7PA 1GHLA 2NWDX 232LA 247LA 198LA 3HH4A 5KXNA 1L29A 4B4JA 5LVIA 1VDTA 1LYOA 1LPIA 1NF5A 4OWEA 1JKCA 1LZGA 4BAFA 3F6ZA 1PQJA 1GFHA 3SB5A 139LA 3GUNA 1LJNA 175LA 4H90A 1T97A 1HFXA 5LA5A 1GF5A 1L81A 4NHSA 1P2CC 1L23A 3TXHA 1OUJA 3A94A 1LJHA 1CU6A 217LA 163LA 4G49A 186LA 1DYGA 4G4CA 4M6DA 1DZBX 1LZ5A 1GF3A 2W1MA 3TXJA 4FDYA 2BLYA 1QIOA 252LA 1L74A 1L27A 2RB0X 1L25A 118LA 1XEIA 3LYZA 1GFRA 4OW1A 3J6KA 1GE1A 4ARMA 1FKVA 2FYDA 4LYCA 4N5RA 4C3WA 4I7QA 1FLUA 2XJWA 1L30A 1GF4A 1UIDA 221LA 1L85A 5FCPA 4HTNA 1HNLA 119LA 1LMTA 1WQMA 2PC2A 3DKEX 183LA 1CJ9A 187LA 2BQKA 4CHXA 4PHIA 134LA 1T6HA 3HT7A 4WLXA 1LHHA 1YL0X 2G4PA 1LMCA 2ZNWY 1QS5A 3FE0A 1C62A 1G7IC 5B06A 3GUMA 4EKRA 1IVMA 1PZYA 1CKFA 1XGRC 3WU8A 6LYZA 1CX7A 5LYZA 2Z39A 1D2YA 250LA 4YOPA 161LA 4NG1A 4ANRA 1CV4A 1G0PA 4EKQA 1IOTA 4ZIXA 103LA 3LN2A 3NY8A 170LA 1YIKA 1OWYA 180LA 1L66A 3WW6A 1LYIA 1QUSA 137LA 2DKVA 1D3MA 1C6PA 1HEQA 1L43A 3W6BA 3CT5A 2I26L 4LT1A 4W56A 4N1CC 3IWRA 1L05A 3CT0A 1YANA 3TMVA 1L01A 1B5WA 2XQOA 1GXV2 1KXXA 1GFUA 2RB1X 1IWUA 3AGIA 4PRQA 1L07A 3JR6A 3C8SA 256LA 3BKVA 4ETAA 1LJJA 1QT7A 4Z3MA 3DN2A 4ETEA 3C8RA 3C82A 4NSJA 192LA 4W59A 149LA 1B7OA 1CV6A 5LVJA 4Z46A 1YQVY 1L93A 2ZNXY 1NWGA 1GBOA 230LA 1GEZA 2EPEA 4WL7A 3AZ7A 1HHLA 4UWVA 2RH1A 200LA 4E3UA 3LYOA 1MELL 4HPIA 1L58A 1LMPA 4GLVA 5HNCA 1RFPA 1IP7A 1SQ2L 4ETBA 2A4TA 2RBOA 4W51A 4XYYA 1ZV5L 1OV7A 2VB1A 4HJZA 1CU5A 1RE2A 3J4GA 9LYZA 1HEMA 1HENA 231LA 2N5ZA 4HJVA 2BQFA 3WH1A 3HT6A 2D4KA 4GRVA 5I14A 3LYTA 4NY5A 5C6IA 4XJIA 1L02A 1D6PA 3TXIA 223LA 114LA 4K5YA 2Q9EA 4DD3A 1L06A 3MGWA 211LA 1L88A 5I4WA 2Z2EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 148L E;  7LZM A;  5KXK A;  4NSI A;  3W6F A;  3QY4 A;  2B7X A;  3PDS A;  3HH5 A;  1GFJ A;  1LGX A;  1LJI A;  4D9Z A;  1D3J A;  5K7O A;  4NGW A;  1LPY A;  2Z12 A;  3GUO A;  4MR1 A;  1REY A;  2MEI A;  2F32 A;  1L73 A;  3WPL A;  1T8G A;  1YL1 X;  5KXT A;  1JTN A;  259L A;  1QDR A;  4NGI A;  5LAG A;  1L08 A;  4YEN A;  3ODU A;  1CX6 A;  107L A;  261L A;  3CSR A;  1L36 A;  227L A;  3FAD A;  1REZ A;  2BAA A;  5HNL A;  2YBH A;  3CDR A;  2G4N A;  4RLN A;  1DI4 A;  2MEA A;  4DC4 A;  4NSG A;  1TEW A;  4TX7 A;  1SWY A;  4EKS A;  3GXK A;  4NGY A;  4H8X A;  3IJU A;  4CJ2 A;  5HMV A;  1L32 A;  1TDY A;  5B59 A;  1C68 A;  108L A;  4H9A A;  4HJY A;  3D9A C;  4EKP A;  1D2W A;  1YAP A;  3RNX A;  1GFV A;  1QTB A;  1CV0 A;  1T8A A;  1EQE A;  2XBR A;  1J1O Y;  1RCM A;  1DYA A;  3CSQ A;  1LYF A;  5F9U A;  1D0K A;  3HT8 A;  1JIY A;  1IOQ A;  4DYG A;  1RJC B;  1P2R A;  110L A;  3E3D A;  1IWZ A;  1NDG C;  1L18 A;  1B7S A;  242L A;  2NTH A;  4RLM A;  2FYC A;  2DQE Y;  1D0M A;  1LSN A;  1L21 A;  2BQL A;  1QUO A;  5DN4 A; 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