1LCNA

Monoclinic hen egg white lysozyme, thiocyanate complex
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural effects of monovalent anions on polymorphic lysozyme crystals.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lcnA00
1KIPC 4TWSA 4DDBA 3ZVQA 4CGEA 2BLXA 1GB2A 3W6DA 1QIOA 132LA 3WUNA 4BS7A 1QTKA 1E8LA 3W6BA 1HEMA 2MEDA 4MR1A 4N5RA 1WQRA 207LA 4NGZA 1LJJA 5I5QA 3LYMA 4ML7A 3IWRA 3ATNA 1IP1A 1D0LA 1HNLA 1H6MA 1RCMA 1B5YA 2ZYCA 1XGTC 4WM3A 3WU9A 3RZ4A 4H9CA 4XN6A 2HEAA 5M1YA 3ZVQB 1C46A 4WLYA 3QY4A 1LSNA 4YEOA 4H93A 3WXTA 1DPXA 4H92A 4OOOA 1GF8A 1GBWA 1GE2A 2G4PA 2Z2EA 1VDTA 1KIQC 5I53A 3WULA 4OWAA 1LZ1A 1VFBC 3WPLA 1DI4A 3A34A 4CFPA 2D6BA 2MEIA 1B5UA 5F9UA 4B0DA 1FN5A 2Z19A 1LSDA 3WW5A 1GB7A 2I25L 5LINA 1CKDA 2BPUA 1REYA 208LA 3AYQA 1XGUC 1DI3A 3A67Y 3A91A 2MEHA 4WL6A 3OK0A 2HEFA 2LYZA 1ZVYB 4UWVA 5HMVA 1LJGA 4TSBA 4EOFA 1IP5A 153LA 1BB3A 5B06A 1YQVY 3CT5A 1LJIA 2FBBA 1ZMYL 4WLDA 4PRUA 3CSQA 1FLWA 4NG1A 4DD1A 3CQLA 2F30A 5EBHA 8LYZA 4QEQA 1GFTA 3LYTA 1GXV2 4Z3MA 4NGWA 4PJ2C 4XJDA 1IEEA 4YOPA 1BVKC 3EBAB 3A95A 4YEMA 1YIKA 2HUBA 1JISA 1LCNA 4GCEA 1BWIA 1YANA 3WU7A 1OUCA 5LYMA 3AZ4A 3J4GA 1OUAA 1KIRC 3AJNA 3TMXA 1OUGA 1OQMA 1I1ZA 1GBZA 3N9AA 4OOTA 2Z12A 6LYZA 5KKJA 4ANRA 4HTQA 2X0AA 4HPEA 1DXJA 2MEGA 1BB5A 4GCCA 4MSTA 1LHHA 4XJHA 1ALCA 1NBZC 1B2KA 1NMMA 3QE8A 3A8ZA 3GXKA 5F81A 1FLYA 3EO5A 3B0OA 1HEOA 2YBJA 5KXXA 5L9JA 4OWCA 4NGIA 1YL1X 4WM2A 5F9XA 1JKDA 4M4OA 1B7NA 5APEA 3T6UA 4WM6A 1JKBA 3LZ2A 4KT3A 1LZCA 4H90A 1YILA 5D5FA 4ETCA 4GCBA 1LZYA 4ETDA 1GB3A 1WQOA 3AGGG 3E3DA 1CKFA 1J1XY 2ZIKA 1IORA 4I8SA 1LHLA 4J1AA 3RNXA 5FSTA 3RT5X 2DQDY 1GFEA 4HJVA 1IOTA 4NWHA 1HEWA 1NHEA 2YBLA 4LYBA 1LMTA 1TEWA 1NDGC 2LYMA 3WU8A 1LTMA 2GV0A 2D4KA 4NGOA 4WG1A 5APDA 1HERA 4DD0A 4HV1A 2DQEY 134LA 1ZV5L 4R0FA 5L3HA 4HP0A 4W96A 2BQJA 2W1MA 2F2NA 4QGZA 1LZRA 1LKRA 2DBTA 4HTKA 1JTTL 3FE0A 4NHQA 1OUHA 4FJRA 1LHJA 1UACY 4NSGA 3LHMA 5I4YA 1IWWA 4C5FA 3AZ7A 2BLYA 1MELL 4WO9A 5A3EA 4G4CA 2HTXA 1B5XA 5KXTA 1UBZA 4C3WA 2A7DA 1BVXA 1HMKA 3W6EA 1GF7A 1JWRA 1F0WA 4GLAA 1LZ6A 1LPIA 4TTDA 1F6SA 1VATA 2DKVA 3TXGA 1LOZA 3WH1A 3IJVA 5B1GA 3G3AB 1G7MC 1P2CC 5HMJA 3A6CY 1QQYA 2W1XA 4GCFA 4DD7A 5A3ZA 4NGKA 3ULRA 1NDMC 1GF5A 4PHIA 1GF3A 1A2YC 3D9AC 5FEKA 4LFXA 1LJKA 5E4PA 4KL7A 4NSJA 5C6IA 3WVXA 4X3BA 1UIAA 5KKIA 2BQCA 4LYOA 1W6ZA 3AB6A 5LVGA 1CJ7A 5LAFA 2BQEA 5FHWA 4YM8A 2G4NA 4LT3A 3A3RX 2AUBA 1LZEA 2H9JA 1AT6A 4KXIA 3LN2A 4ETEA 1XEJA 2IHLA 1G7LC 5LA5A 4IJ4A 4B4EA 1LAAA 1I20A 4NGYA 2YBHA 2YBMA 1XGPC 1YAOA 3FI7A 1UIGA 3A6BY 5LVJA 1IWTA 2BAAA 4EMNA 1LJNA 1HEPA 1YKYX 3EMSA 1LZAA 1IOCA 4OWEA 1VEDA 1B7OA 4HSFA 3VWOA 3TXIA 1JTOL 4XYYA 1ZVHL 5E9RA 3WMKA 1C7PA 1IR8A 1FBIX 2ZYPA 1C43A 2IFFY 4WM5A 3P65A 1GWDA 1LSCA 4M6DA 5KXNA 1AT5A 2MEAA 4H9AA 1LZ9A 5KXWA 4O34A 3IJUA 1OUIA 1TDYA 2ZQ4A 4NHIA 3TXKA 1FLUA 4H8YA 2RSCA 1IWVA 1UIEA 3B72A 1LMQA 4RW1A 3WYHA 2LHMA 1F6RA 1QUTA 5C6JA 2BQBA 1GF0A 2ZIJA 1O23A 1GF6A 2EIZC 4WOAA 5FDJA 4CJ2A 2XTHA 3A93A 3T36A 4YF2A 3ATOA 4WM4A 2D4IA 4H9BA 1HMLA 2N5ZA 2XBRA 1GB0A 4DDAA 5I54A 1LZTA 2LZ2A 3LYOA 5LYZA 2CWIA 4HJZA 5KJ9A 1NQIA 1IWXA 2G4QA 2MECA 4DYGA 1CJ8A 1JJ0A 4XJBA 3ZEKA 5L3IA 1GFHA 1LMCA 1MLCE 1C10A 1C45A 1DKKA 2ZNWY 4TX7A 5LA8A 2XJWA 4ETBA 1GF4A 2DQCY 1GFGA 1LJ3A 4B4IA 1GAZA 1KXYA 1UIBA 3A92A 3CT0A 1XGRC 4LYCA 1T3PA 1HFYA 4G49A 1HFXA 4NGLA 4RLMA 1UC0A 2Q0MX 4ZEEA 5K7OA 5J7CA 1GFKA 1HENA 1WQNA 1XEIA 1YAPA 4BAPA 1JUGA 5LYTA 1LSBA 1LSZA 1GEVA 1RE2A 2EKSC 2HU3A 4Z41A 1BWJA 4GLVA 3QNGA 4NY5A 1BB6A 4H9EA 1IIZA 5FELA 5KXRA 4WLXA 133LA 1QSWA 1OUEA 1FLQA 1REXA 1QTEA 3AGIA 3TXEA 4NHPA 4WLTA 2LYOA 4WL7A 4LGKA 1BB7A 1LSAA 4B4JA 1VDPA 5DN5A 1IR9A 2Z37A 3TXHA 1YAQA 1LZDA 1J1OY 1JKCA 1LZ4A 2D4JA 4HTNA 1IP2A 4NHSA 5LIOA 3CSZA 1UA6Y 2DQHY 135LA 1IC5Y 1F10A 4GCDA 4LT0A 1B0DA 3G3BB 1VAUA 5HNCA 1LJEA 4RDSA 1IWUA 1V7SA 1D0KA 1WQPA 1LJHA 2I6ZA 4NGVA 1CKCA 3WXUA 4B49A 4BADA 5B59A 2MEFA 4L41A 3HBDA 4GN5C 1UIHA 1BQLY 3CB7A 2BQIA 4H9HA 1JJ3A 1IP4A 2DQFC 3AGHA 4YENA 1JJ1A 2DQIY 2F4AA 1XFPL 5LVIA 2Z38A 1LKSA 4D9ZA 1LZ5A 1KXWA 3A96A 4XJGA 1REZA 4QY9A 1JITA 5F14A 1YKZX 1GFAA 2Z2FA 1JPOA 1GB8A 3AW7A 1B5ZA 1EQ4A 1PS5A 2ZWBA 1LYOA 1LYYA 4XJFA 5B07A 2F4GA 4II8A 4Z98A 4RW2A 4CFOA 1JIYA 1WVUA 1B7SA 3N9CA 1GB9A 3KAMA 1LSPA 1HSWA 3BKHA 1NF5A 4J0LA 4PRQA 1B7PA 1PZYA 1REMA 4LFPA 4N0JA 2HU1A 1GE0A 1LJFA 3HBEX 3P4ZA 4LZTA 5IHGA 1IP7A 1WVVA 1OP9B 1FDLY 1QDTA 1YAMA 2B5ZA 2BQGA 2BQAA 4R6CA 2WARA 1JTPL 3MGWA 4XADA 4DWXA 6LYTA 2BQDA 4DC4A 1BWHA 1XGQC 3LYZA 1I56A 2BQOA 4ETAA 1D6QA 2A7FA 1CKHA 1YKXX 2HEBA 1INUA 3HBHA 1D9UA 1DQJC 4LYMA 5B05A 5HNLA 1IY4A 1GE3A 2Z18A 1HF4A 3P68A 4OWBA 1GBYA 2YDGA 1GPQC 1LHKA 1LMAA 4H8ZA 4NFVA 1GEZA 3RU5A 1GFVA 4A7DA 5DLAA 1LYZA 1LMPA 3AZ5A 1LHMA 1GFUA 3TMVA 1IY3A 1LSGA 2MEEA 1B7RA 4N1CC 3P66A 1UICA 4NG8A 3EXDA 1CJ9A 1IOSA 1SLYA 4DDCA 3OJPA 4LT1A 1EQ5A 1OUJA 1YL0X 3WPKA 1GFRA 5KXZA 3J6KA 2YBIA 1HEQA 5FCPA 1B7QA 1JSFA 1LZ8A 1WQQA 2Y8PA 4B1AA 2FBDA 1QSAA 1GFJA 1HFZA 3K3TA 1IP3A 4NSIA 3WW6A 1LJ4A 2PC2A 5HLLA 1J1PY 1GAYA 1T6VL 4P2EA 5LVKA 1HELA 1NKHA 3WUMA 2CDSA 2BQNA 5APFA 3BKVA 3A90A 3TXFA 4TUNA 5KXPA 4E3UA 3AZ6A 5KXMA 2BQHA 4OW1A 1DZBX 4WMGA 1KXXA 1VDQA 3A94A 1IWZA 4H91A 5KXKA 1IX0A 2I26L 2Z39A 1W08A 1WTMA 4W94A 1B5VA 2ZILA 1A4VA 5DL9A 1GDWA 5IDDA 2FYDA 1NBYC 2C8PA 2NWDX 1IO5A 3F6ZA 3SP3A 193LA 1OUDA 2DQGY 3CT1A 3TMUA 4LYTA 1JKAA 2FYCA 4G4HA 1GE4A 2YVBA 4H1PA 4QDNA 5D5CA 3TMWA 4BAFA 4UWNA 4CHXA 1C08C 1RJCB 5AMYA 2ZQ3A 1OUFA 1G7IC 1GHLA 1LSFA 3P64A 1BGIA 1H87A 2YBNA 1B9OA 1GF9A 154LA 2XBSA 5LXWA 2HEDA 2MEBA 7LYZA 1FKQA 3CSRA 1LSEA 1UUZC 3WL2A 4HV2A 3A3QA 2DQAA 4J7VA 1B7MA 5KXSA 1RI8B 3TXJA 4Z46A 1B7LA 1JSEA 4N9RA 4AXTA 1IR7A 3W3EA 2W1YA 1CNSA 2D91A 1GB5A 1GE1A 3W6FA 2HEEA 4DT3A 3TXBA 1YROA 4NEBA 4UWUA 4LT2A 4U3XB 3M18B 4XJIA 1LSYA 3WVYA 1TCYA 1RFPA 4WM1A 5APCA 3HFMY 5KY1A 4DD9A 2ZNXY 4FDYA 5LAGA 4NWEA 1LZNA 4ET8A 1LHIA 1DKJA 1LMNA 4H8XA 1LZBA 1D0MA 4RLNA 3N9EA 1TAYA 1IC4Y 5C6LA 4NHTA 3WPJA 1CJ6A 3B6LA 1IWYA 1JEFA 1TBYA 5KXLA 1IVMA 5ILCA 4ZFPA 3W6AA 2H9KA 2C8OA 4HPIA 1AZFA 4WG7A 2EPEA 2VB1A 2LZTA 1V7TA 2HECA 1BB4A 2YSSC 4IATA 4N1EI 1LSMA 1XSFA 2BQFA 4AGAA 4WO6A 1BHZA 4TSCA 4PGJB 5B1FA 5KXYA 1UCOA 1IP6A 1B5WA 1GD6A 1UIFA 3B0KA 3TXDA 1EQEA 1WQMA 4H94A 1WTNA 1G7JC 4OWHA 2W1LA 4MCKA 1NWGA 1XEKA 2BQKA 4DD2A 1DPWA 1G7HC 1GBSA 1LZSA 4LYZA 1LYSA 4DD3A 4PPOA 3AW6A 5DN4A 3D3DA 1GBXA 4H9FA 1HC0A 4N8ZA 3WUAA 1UIDA 4ZIXA 1HHLA 2EQLA 5IELA 3W6CA 4NGJA 1VDSA 4IASA 4G4BA 9LYZA 4KPMA 4ET9A 1HSXA 4XENA 4I0CA 1OUBA 3M3UA 5II3A 1AM7A 4J1BA 1GXXA 1LZGA 5T3FA 1DI5A 3B0IA 1LMOA 2BQLA 4HJYA 1QUSA 1GBOA 2DQJY 5LVHA 1EL1A 5ILFA 1IOQA 4GN4A 1D6PA 4H9IA 5I4XA 1GB6A 2CGIA 3LZTA 2H5ZA 1FKVA 2BQMA 1GDXA 3RW8A 4NIJA 1CKGA 1N4FA 1QDRA 1SQ2L 1AKIA 194LA 1IC7Y 4G9SA 5HQ1A 5DM9A 1JHLA 5F16A 5JENB 5I4WA 3GXRA 1Z55A 4GN3A 4NSHA 5KXOA 2CJLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1E8LA 1WQRA 206LA 4ML7A 3IWRA 3ATNA 1HNLA 1RCMA 2HEAA 249LA 3QY4A 1GF8A 1GBWA 2G4PA 1VDTA 3WULA 4OWAA 1D9WA 1C62A 2B6ZA 1CKDA 3AYQA 3A91A 4UWVA 4TSBA 1C6DA 1G1WA 1BB3A 233LA 2FBBA 1FLWA 4NG1A 4DD1A 165LA 3CQLA 8LYZA 4QEQA 3CDTA 3V2WA 4YOPA 3SB5A 1JISA 1LCNA 4GCEA 3WU7A 4ARPA 3J4GA 2LC9A 1P5CA 1OQMA 1L97A 1I1ZA 4OOTA 4HPEA 1DXJA 2O7AA 4W52A 4XJHA 1SWZA 1NMMA 3QE8A 3A8ZA 3GXKA 3EO5A 3HH3A 2YBJA 1YL1X 4WM2A 1JKDA 5APEA 4I7LA 1JKBA 4KT3A 1LZCA 1YILA 1LZYA 4ETDA 3AGGG 1CKFA 1IORA 4J1AA 3RT5X 125LA 1L10A 1IOTA 1HEWA 2YBLA 4LYBA 1TEWA 4EJ4A 1L0JA 2GV0A 3C8SA 5APDA 1HERA 4HV1A 2F2NA 1C6BA 2RBOA 2RBSA 1LHJA 1IWWA 2NTHA 186LA 1L25A 1B5XA 1L29A 2OEAX 2B6YA 3W6EA 4GLAA 1L47A 2F2QA 2OE9X 3IJVA 6LZMA 3G3AB 1QQYA 1QT3A 1NDMC 219LA 1A2YC 2LCBA 1C6MA 4LFXA 4KL7A 5C6IA 4AQNA 4X3BA 4LYOA 1W6ZA 1CJ7A 1T8AA 2A4TA 1OVKA 119LA 2AUBA 1LZEA 3HDEA 4KXIA 4B4EA 1L42A 1LI3A 4EMNA 3EMSA 1IOCA 4OWEA 1DYDA 3VWOA 1JTOL 2OU0X 232LA 2QB0B 1T8GA 2Q9EA 4WM5A 1CV4A 4M6DA 1AT5A 1LZ9A 4H8YA 1L55A 111LA 3WYHA 1QUTA 1C66A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1KIP C;  4TWS A;  4DDB A;  3ZVQ A;  4CGE A;  2BLX A;  1GB2 A;  3W6D A;  1QIO A;  132L A;  3WUN A;  4BS7 A;  1QTK A;  1E8L A;  3W6B A;  1HEM A;  2MED A;  4MR1 A;  4N5R A;  1WQR A;  207L A;  4NGZ A;  1LJJ A;  5I5Q A;  3LYM A;  4ML7 A;  3IWR A;  3ATN A;  1IP1 A;  1D0L A;  1HNL A;  1H6M A;  1RCM A;  1B5Y A;  2ZYC A;  1XGT C;  4WM3 A;  3WU9 A;  3RZ4 A;  4H9C A;  4XN6 A;  2HEA A;  5M1Y A;  3ZVQ B;  1C46 A;  4WLY A;  3QY4 A;  1LSN A;  4YEO A;  4H93 A;  3WXT A;  1DPX A;  4H92 A;  4OOO A;  1GF8 A;  1GBW A;  1GE2 A;  2G4P A;  2Z2E A;  1VDT A;  1KIQ C;  5I53 A;  3WUL A;  4OWA A;  1LZ1 A;  1VFB C;  3WPL A;  1DI4 A;  3A34 A;  4CFP A;  2D6B A;  2MEI A;  1B5U A;  5F9U A;  4B0D A;  1FN5 A;  2Z19 A;  1LSD A;  3WW5 A;  1GB7 A;  2I25 L;  5LIN A;  1CKD A;  2BPU A;  1REY A;  208L A;  3AYQ A;  1XGU C;  1DI3 A;  3A67 Y;  3A91 A;  2MEH A;  4WL6 A;  3OK0 A;  2HEF A;  2LYZ A;  1ZVY B;  4UWV A;  5HMV A;  1LJG A;  4TSB A;  4EOF A;  1IP5 A;  153L A;  1BB3 A;  5B06 A;  1YQV Y;  3CT5 A;  1LJI A;  2FBB A;  1ZMY L;  4WLD A; 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 4H8X A;  1LZB A;  1D0M A;  4RLN A;  3N9E A;  1TAY A;  1IC4 Y;  5C6L A;  4NHT A;  3WPJ A;  1CJ6 A;  3B6L A;  1IWY A;  1JEF A;  1TBY A;  5KXL A;  1IVM A;  5ILC A;  4ZFP A;  3W6A A;  2H9K A;  2C8O A;  4HPI A;  1AZF A;  4WG7 A;  2EPE A;  2VB1 A;  2LZT A;  1V7T A;  2HEC A;  1BB4 A;  2YSS C;  4IAT A;  4N1E I;  1LSM A;  1XSF A;  2BQF A;  4AGA A;  4WO6 A;  1BHZ A;  4TSC A;  4PGJ B;  5B1F A;  5KXY A;  1UCO A;  1IP6 A;  1B5W A;  1GD6 A;  1UIF A;  3B0K A;  3TXD A;  1EQE A;  1WQM A;  4H94 A;  1WTN A;  1G7J C;  4OWH A;  2W1L A;  4MCK A;  1NWG A;  1XEK A;  2BQK A;  4DD2 A;  1DPW A;  1G7H C;  1GBS A;  1LZS A;  4LYZ A;  1LYS A;  4DD3 A;  4PPO A;  3AW6 A;  5DN4 A;  3D3D A;  1GBX A;  4H9F A;  1HC0 A;  4N8Z A;  3WUA A;  1UID A;  4ZIX A;  1HHL A;  2EQL A;  5IEL A;  3W6C A;  4NGJ A;  1VDS A;  4IAS A;  4G4B A;  9LYZ A;  4KPM A;  4ET9 A;  1HSX A;  4XEN A;  4I0C A;  1OUB A;  3M3U A;  5II3 A;  1AM7 A;  4J1B A;  1GXX A;  1LZG A;  5T3F A;  1DI5 A;  3B0I A;  1LMO A;  2BQL A;  4HJY A;  1QUS A;  1GBO A;  2DQJ Y;  5LVH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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