1LJNA

Crystal structure of tuekey egg lysozyme complex with di-n-acetylchitobiose at 1.19a resolution
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystallographic dissection of the thermal motion of protein-sugar complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ljnA00
1GFHA 3AGGG 2YBLA 2EQLA 5LVJA 4WO6A 5KY1A 194LA 5D5FA 1OUIA 1EL1A 1XGTC 1WTNA 4HV2A 2IHLA 4C3WA 5KXYA 1CJ9A 1J1PY 4UWUA 3GXRA 1JKDA 3RT5X 4OWHA 5KJ9A 1LHIA 4P2EA 1SQ2L 4ETAA 1LZRA 3W3EA 4GN3A 4NSIA 1XGPC 1FDLY 6LYZA 1LCNA 1LZGA 1KIQC 1G7LC 1D0MA 4N8ZA 4LT1A 3W6DA 5K7OA 2MEEA 3N9EA 3WMKA 1OUEA 1FKVA 4PGJB 5DN5A 1B5VA 4NHTA 1TCYA 3AW6A 1QUSA 3RW8A 1G7HC 2ZNWY 4C5FA 5ILFA 3AGIA 2BQHA 1LJ4A 1GXXA 2H9JA 2CWIA 5A3EA 5FELA 3CSQA 207LA 1REMA 1GFTA 1PZYA 4NGJA 134LA 1XSFA 4NGWA 5KXNA 2W1LA 4H8ZA 4LYMA 4QDNA 1GB2A 3WPLA 1YANA 4OOTA 1LMTA 4B1AA 1IP4A 1LHHA 3B0IA 1BWIA 3J6KA 4NIJA 4NY5A 1CKGA 2F4GA 1GF7A 5LVKA 5FSTA 4DDBA 3D3DA 2DQCY 4YOPA 4M6DA 1JJ1A 2HU1A 3A3QA 4XN6A 1YQVY 2BQDA 4Z41A 3TMWA 4TWSA 1FLYA 3LYMA 4KL7A 1CKFA 3B0KA 3HBHA 3A91A 1LZ4A 3A94A 3ZVQA 4NGOA 1BB6A 1GF0A 5L3IA 1HERA 4I0CA 1HFXA 1GXV2 4M4OA 2NWDX 2GV0A 2Y8PA 3LYOA 1GE4A 3CSZA 1JITA 5KKIA 1IO5A 1D6QA 1GF4A 4H9BA 4MSTA 153LA 1DI4A 2C8OA 3CB7A 5KXSA 1JTTL 1LJIA 4W96A 1B5WA 2BPUA 5KXXA 1LZ8A 4B4EA 1B9OA 1HEOA 1YL0X 3HBEX 4LYCA 5I4YA 2BQOA 8LYZA 2BQLA 4XYYA 1JKCA 3D9AC 1IY4A 3TXHA 1IIZA 1GBXA 2Z39A 4LT2A 1UIAA 3WU9A 4HTQA 3KAMA 1BB7A 2HEDA 1OUJA 1B7SA 4CFOA 1G7JC 1OP9B 1LZAA 4WM1A 1LMQA 4BADA 2MEGA 4WL6A 1IVMA 1HENA 1LSAA 1IC7Y 1C7PA 1JUGA 1Z55A 3B72A 1T3PA 3ZEKA 4YM8A 6LYTA 4DC4A 1H87A 5DLAA 1GE2A 1HF4A 1JWRA 4H1PA 2Q0MX 2YBHA 1CJ6A 2BQEA 3AGHA 5APCA 4QY9A 2F4AA 1LZBA 3FI7A 3TXJA 4CJ2A 4GLVA 2YVBA 2DQFC 3VWOA 5F81A 2HUBA 5T3FA 3LYZA 1GAYA 3P65A 4U3XB 2G4NA 1UC0A 3TXFA 4HJYA 5LA8A 3BKHA 1B5YA 4DT3A 5B59A 3M3UA 4H94A 3ULRA 5KXRA 1GFVA 1XFPL 1NBZC 5HMVA 1RCMA 1CKHA 1OUDA 1I20A 3OK0A 4QEQA 5AMYA 3OJPA 1B0DA 5I54A 1AT6A 3G3AB 3TXBA 1IC5Y 1LMPA 1LMOA 1LOZA 4IJ4A 1IP1A 5F9XA 1JPOA 3M18B 4HTNA 4ANRA 1IP7A 1ALCA 1TEWA 3WPKA 2H5ZA 2LYZA 4NWHA 3AZ6A 1LZYA 4WG1A 5DM9A 4DD9A 1IR7A 1LSGA 3CT0A 1AZFA 4OW1A 1IOQA 1BQLY 1GDXA 4CFPA 4II8A 3T6UA 1O23A 1WQMA 1LJJA 1LYYA 1LSPA 3FE0A 1LSYA 1LYZA 1IWZA 4ETEA 1GFAA 1QIOA 1QSAA 1B7OA 1NBYC 4WMGA 5IELA 2I25L 4XJGA 2D4KA 1GBOA 5B06A 5LIOA 1IWVA 3EXDA 1UIFA 1VFBC 3LYTA 3P64A 1HSXA 1UUZC 4ETCA 1LKSA 3G3BB 1LMNA 1RFPA 4DYGA 1GBYA 4DDCA 2DQIY 1JEFA 1LJGA 4LZTA 5IDDA 1HFYA 2BQFA 1JSFA 4NGKA 2D6BA 4FDYA 1JIYA 5C6JA 1C43A 1KIPC 1LZDA 1GF8A 4NHSA 4HSFA 1LSMA 4H8YA 1GB0A 3QY4A 1OUGA 4O34A 5M1YA 1FLUA 3W6AA 1IOSA 1LSZA 1C46A 4TUNA 5I5QA 3RU5A 4ETBA 2HEFA 4AGAA 4WM2A 1VDPA 1LZNA 1N4FA 5LVGA 3B0OA 1FN5A 5KKJA 1VDSA 1XGUC 1LSNA 1GD6A 5LVHA 1LZ1A 1GF6A 4NGVA 4GCFA 1LZTA 4KPMA 4H9IA 5KXLA 1LMCA 4GLAA 3CQLA 4HPEA 5DL9A 2MEIA 1UIDA 3A6CY 1LTMA 5ILCA 3AYQA 3SP3A 3A67Y 1VEDA 1RE2A 4D9ZA 1NDMC 4H8XA 4LGKA 5E4PA 2ZIJA 3EO5A 1GDWA 1GF5A 1WVUA 1CKCA 5J7CA 2W1MA 5I53A 1GAZA 1I56A 1JSEA 3A6BY 2YBJA 4E3UA 1C45A 1LYSA 4H92A 5LAGA 2WARA 4GN5C 3A93A 4OWBA 4WM3A 1IOCA 4NGZA 4GCBA 5B1FA 4EOFA 1YAOA 3W6CA 1IWYA 4TTDA 3WU8A 4ZEEA 1LHMA 4WL7A 5C6IA 1IP6A 3A8ZA 3IJVA 2N5ZA 3LZTA 4NSGA 5HNCA 1NQIA 1GEZA 1LZ5A 2VB1A 2X0AA 1NF5A 1G7IC 1BWHA 4BAPA 5FHWA 1VAUA 4HJZA 2Z18A 4NSHA 5KXMA 1GWDA 2MECA 1J1OY 4DDAA 1JJ0A 1LZ6A 2F2NA 1GEVA 1GF9A 4NGLA 4J7VA 1EQEA 4RLNA 5APDA 4H9CA 4PHIA 2MEBA 4TSCA 3WULA 2D4JA 4Z46A 1GF3A 2ZYCA 2FYCA 3RZ4A 1GE3A 2H9KA 4GCDA 1IR9A 4H9FA 1B5ZA 4KXIA 4X3BA 1YILA 2BQGA 2LZTA 1JJ3A 4TX7A 5EBHA 1LHKA 4G9SA 1LSDA 1UICA 4I8SA 154LA 4ML7A 1OUAA 2BQCA 4UWVA 3LN2A 1LHJA 4PRUA 1BVKC 132LA 3CT1A 5LYZA 4DD2A 1C10A 2XJWA 3CT5A 2HEAA 5F14A 1HSWA 2I26L 2HEEA 4YENA 3WYHA 2LYMA 1QQYA 4DWXA 1IC4Y 1HHLA 1B7LA 1YL1X 4LFPA 1LJFA 4NGYA 4RLMA 1AM7A 2W1XA 3WXTA 2HEBA 4G4BA 1TDYA 4WO9A 4Z98A 4TSBA 1A4VA 3J4GA 4BS7A 4NHIA 1TBYA 1LMAA 1XEJA 2CGIA 133LA 1QDTA 3CSRA 1JISA 3WVYA 2PC2A 4NFVA 5A3ZA 1WQRA 2ZWBA 1GB3A 135LA 1GE1A 1WQQA 1UIHA 4A7DA 4AXTA 1IP2A 3ATNA 1HFZA 4FJRA 4XJHA 1GBSA 2W1YA 1JHLA 4MR1A 2ZYPA 4NG8A 4RW2A 1KXXA 1MLCE 2DQEY 2FBBA 2Z37A 4OOOA 5LA5A 1HC0A 1NMMA 1D9UA 3A96A 4HTKA 4R6CA 2IFFY 2LZ2A 1DQJC 9LYZA 5I4XA 3TXKA 4DD7A 1D6PA 5APEA 1B7QA 3TXGA 1GB6A 4H91A 1QUTA 1BHZA 2YSSC 4XJFA 1LYOA 2DKVA 2HU3A 3RNXA 2D91A 4B0DA 1A2YC 5HQ1A 1BB5A 4NEBA 2YBNA 4WLYA 1YAPA 4DD0A 5L9JA 1MELL 2RSCA 5KXTA 1DPXA 3AZ4A 5C6LA 4RW1A 1BGIA 4ZFPA 1OQMA 4UWNA 1DPWA 1JKAA 1GHLA 4GCEA 4H9AA 4PJ2C 2YDGA 1IWXA 3WXUA 1G7MC 1B7RA 4J1BA 1GB5A 3WW6A 1JTOL 3K3TA 4ET9A 2Z12A 3HFMY 1BB4A 4H9HA 3TMUA 4KT3A 1HMKA 4G49A 4OWCA 1I1ZA 1IWTA 2BQAA 3F6ZA 1LZCA 2CDSA 1W6ZA 3HBDA 4GN4A 2C8PA 4XJBA 3A34A 1GBZA 2BAAA 1AKIA 1DKKA 1VDTA 3TXIA 3WUMA 3IWRA 1REZA 1IY3A 1XGQC 1ZVHL 5IHGA 1IX0A 1D0LA 1REXA 1YKZX 5B1GA 5KXZA 4B49A 1V7TA 4NHPA 1OUHA 4L41A 4LYTA 1ZVYB 4N5RA 2ZQ4A 2AUBA 4WM4A 3WVXA 1F10A 1LSEA 1BVXA 2XBSA 1ZV5L 3TMXA 2EIZC 3AB6A 5HLLA 1C08C 2LHMA 1HEWA 4ET8A 4B4JA 1J1XY 5LYTA 5F16A 1WQNA 2EPEA 1UBZA 3W6BA 4EMNA 1HMLA 1GE0A 2YBIA 2I6ZA 4HV1A 5APFA 3WW5A 4YEMA 1LJKA 1HEMA 3B6LA 1B7PA 3QNGA 1QDRA 4DD3A 4H9EA 2FBDA 4LT3A 1YAMA 1CJ8A 2ZILA 4LYBA 4XJDA 3WL2A 1B7MA 4PPOA 5KXWA 1WVVA 1INUA 4WOAA 2BQIA 4WLTA 2D4IA 1REYA 1YKYX 4LYZA 1UIEA 2XBRA 1XEIA 2ZQ3A 1YAQA 3GXKA 3AW7A 1IWWA 1RI8B 1T6VL 2ZNXY 4WG7A 3EMSA 2MEHA 1EQ5A 1V7SA 2B5ZA 7LYZA 4N1CC 2DQJY 5I4WA 1CKDA 4H93A 3T36A 4RDSA 1FLWA 1EQ4A 2A7FA 2MEAA 4WM5A 1XGRC 1B2KA 1LKRA 1OUCA 1CJ7A 2BQNA 4QGZA 3IJUA 1WTMA 5HMJA 1LJEA 2Z38A 5L3HA 4Z3MA 1DKJA 2CJLA 1LSFA 4J1AA 5LAFA 3TXEA 3ZVQB 1LZ9A 1VATA 4LT0A 4B4IA 3A90A 4IASA 2Z2EA 1YROA 1LZSA 1LAAA 1HEPA 2F30A 4WLXA 4CGEA 1DI5A 5FCPA 4MCKA 1GBWA 1GB9A 2Z2FA 5KXPA 1IP5A 2LYOA 2HTXA 2MEDA 1IOTA 2ZIKA 1FBIX 1UA6Y 4YF2A 1LSCA 4XADA 4N0JA 1CNSA 2EKSC 3ATOA 4IATA 5KXOA 3WUAA 4N1EI 5E9RA 4OWAA 4GCCA 1JTPL 1GPQC 1UIGA 4ETDA 4WLDA 4NGIA 5LXWA 1QTKA 1D0KA 5FEKA 1OUBA 1GFKA 4OWEA 4NHQA 3WU7A 4ZIXA 3TXDA 193LA 3W6FA 2HECA 4LFXA 1BB3A 3N9AA 4BAFA 5LVIA 4J0LA 3P66A 2FYDA 4XENA 1LZEA 3P4ZA 1QTEA 1GFJA 1SLYA 1DZBX 1KXYA 3QE8A 3LHMA 4NWEA 1RJCB 3A3RX 3AZ5A 1GB8A 2MEFA 4WM6A 4NSJA 5KXKA 5FDJA 1H6MA 4XJIA 2DQHY 1NWGA 5LYMA 1W08A 2BLYA 5JENB 1IORA 1IR8A 1E8LA 4H90A 1HNLA 1HEQA 5B07A 3AZ7A 2G4QA 2DQAA 1NKHA 1BWJA 1GB7A 4W94A 1IWUA 3A95A 1GFGA 1DXJA 3MGWA 1PS5A 5LINA 1YKXX 1FKQA 1P2CC 4G4HA 1KIRC 1NDGC 1NHEA 4CHXA 1YIKA 2A7DA 1WQOA 3WH1A 1GFEA 1ZMYL 3WPJA 4HPIA 1F6RA 1GFRA 1F0WA 3EBAB 4G4CA 4R0FA 2BQKA 3BKVA 5D5CA 1KXWA 1WQPA 1B5XA 1FLQA 1UCOA 1GFUA 3A92A 3TMVA 3WUNA 1OUFA 208LA 2BQJA 4YEOA 1LSBA 2XTHA 4HP0A 2BQBA 1LHLA 2DQGY 2G4PA 2DBTA 5B05A 1DI3A 1QSWA 3N9CA 4PRQA 5F9UA 1B5UA 1LJHA 3E3DA 2BQMA 1F6SA 1IP3A 1HELA 1LJ3A 3LZ2A 3P68A 1JKBA 1LPIA 2DQDY 4N9RA 1XEKA 1UACY 1VDQA 1TAYA 5DN4A 4DD1A 4LYOA 3W6EA 1UIBA 1AT5A 2YBMA 1B7NA 4NG1A 5HNLA 3AJNA 4HJVA 1IEEA 2Z19A 5II3A 1LJNA 2BLXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
250LA 194LA 4I7NA 1DYGA 4W58A 2IHLA 1J1PY 1LHIA 4P2EA 1SQ2L 4ETAA 4NSIA 1FDLY 3G3WA 6LYZA 5K7OA 1WTHA 2MEEA 3G3XA 1OUEA 3N9EA 190LA 241LA 1TCYA 3AW6A 1G7HC 2H9JA 4DKLA 3CSQA 3CDVA 1QUOA 5KXNA 1XSFA 4NGWA 2W1LA 4LYMA 1LMTA 1IP4A 2RAZX 1CKGA 1OVHA 4DDBA 4YOPA 1JJ1A 2HU1A 4XN6A 1YQVY 1OV5A 3TMWA 1CKFA 1JQUA 3B0KA 3A91A 4NGOA 1GXV2 2NWDX 2GV0A 2Y8PA 1IO5A 1D6QA 4H9BA 1L29A 4E97A 150LA 1CU0A 4W96A 1L94A 149LA 246LA 1QT6A 5I4YA 2BQOA 3GUIA 4XYYA 4LT2A 2OE4X 3WU9A 170LA 1OUJA 4ARPA 1OP9B 1LMQA 1PQKA 2B6XA 1IVMA 3C7YA 3B72A 3ZEKA 5DLAA 1KY1A 1L23A 4LZMA 5APCA 2RBPA 4CJ2A 3LYZA 4U3XB 2G4NA 1L84A 1G1WA 5B59A 5KXRA 1XFPL 258LA 5AMYA 1T8AA 4W55A 3TXBA 5F9XA 1LMPA 1C6JA 1IP7A 1L83A 5DM9A 4NWHA 178LA 180LA 1LSGA 1AZFA 4II8A 3T6UA 1QIOA 1NBYC 2I25L 4XJGA 2D4KA 3V2YA 1L0KA 1CU6A 238LA 1VFBC 3P64A 2B7XA 1CV5A 4DJHA 1L69A 1RFPA 4DYGA 4DDCA 1EPYA 3DNAA 2BQFA 1L99A 173LA 1GF8A 4H8YA 1OUGA 1ZYTA 1FLUA 1LSZA 1CUQA 3RU5A 3EMLA 4WM2A 1LZNA 1N4FA 1XGUC 2IGCA 4EKSA 1GD6A 4HPEA 3RUNA 3CQLA 2MEIA 171LA 4W59A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GFH A;  3AGG G;  2YBL A;  2EQL A;  5LVJ A;  4WO6 A;  5KY1 A;  194L A;  5D5F A;  1OUI A;  1EL1 A;  1XGT C;  1WTN A;  4HV2 A;  2IHL A;  4C3W A;  5KXY A;  1CJ9 A;  1J1P Y;  4UWU A;  3GXR A;  1JKD A;  3RT5 X;  4OWH A;  5KJ9 A;  1LHI A;  4P2E A;  1SQ2 L;  4ETA A;  1LZR A;  3W3E A;  4GN3 A;  4NSI A;  1XGP C;  1FDL Y;  6LYZ A;  1LCN A;  1LZG A;  1KIQ C;  1G7L C;  1D0M A;  4N8Z A;  4LT1 A;  3W6D A;  5K7O A;  2MEE A;  3N9E A;  3WMK A;  1OUE A;  1FKV A;  4PGJ B;  5DN5 A;  1B5V A;  4NHT A;  1TCY A;  3AW6 A;  1QUS A;  3RW8 A;  1G7H C;  2ZNW Y;  4C5F A;  5ILF A;  3AGI A;  2BQH A;  1LJ4 A;  1GXX A;  2H9J A;  2CWI A;  5A3E A;  5FEL A;  3CSQ A;  207L A;  1REM A;  1GFT A;  1PZY A;  4NGJ A;  134L A;  1XSF A;  4NGW A;  5KXN A;  2W1L A;  4H8Z A;  4LYM A;  4QDN A;  1GB2 A;  3WPL A;  1YAN A;  4OOT A;  1LMT A;  4B1A A;  1IP4 A;  1LHH A;  3B0I A;  1BWI A;  3J6K A;  4NIJ A;  4NY5 A;  1CKG A;  2F4G A;  1GF7 A;  5LVK A;  5FST A;  4DDB A;  3D3D A;  2DQC Y;  4YOP A;  4M6D A;  1JJ1 A;  2HU1 A;  3A3Q A;  4XN6 A;  1YQV Y; 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 3TXD A;  193L A;  3W6F A;  2HEC A;  4LFX A;  1BB3 A;  3N9A A;  4BAF A;  5LVI A;  4J0L A;  3P66 A;  2FYD A;  4XEN A;  1LZE A;  3P4Z A;  1QTE A;  1GFJ A;  1SLY A;  1DZB X;  1KXY A;  3QE8 A;  3LHM A;  4NWE A;  1RJC B;  3A3R X;  3AZ5 A;  1GB8 A;  2MEF A;  4WM6 A;  4NSJ A;  5KXK A;  5FDJ A;  1H6M A;  4XJI A;  2DQH Y;  1NWG A;  5LYM A;  1W08 A;  2BLY A;  5JEN B;  1IOR A;  1IR8 A;  1E8L A;  4H90 A;  1HNL A;  1HEQ A;  5B07 A;  3AZ7 A;  2G4Q A;  2DQA A;  1NKH A;  1BWJ A;  1GB7 A;  4W94 A;  1IWU A;  3A95 A;  1GFG A;  1DXJ A;  3MGW A;  1PS5 A;  5LIN A;  1YKX X;  1FKQ A;  1P2C C;  4G4H A;  1KIR C;  1NDG C;  1NHE A;  4CHX A;  1YIK A;  2A7D A;  1WQO A;  3WH1 A;  1GFE A;  1ZMY L;  3WPJ A;  4HPI A;  1F6R A;  1GFR A;  1F0W A;  3EBA B;  4G4C A;  4R0F A;  2BQK A;  3BKV A;  5D5C A;  1KXW A;  1WQP A;  1B5X A;  1FLQ A;  1UCO A;  1GFU A;  3A92 A;  3TMV A;  3WUN A;  1OUF A;  208L A;  2BQJ A;  4YEO A;  1LSB A;  2XTH A;  4HP0 A;  2BQB A;  1LHL A;  2DQG Y;  2G4P A;  2DBT A;  5B05 A;  1DI3 A;  1QSW A;  3N9C A;  4PRQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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