1LJNA

Crystal structure of tuekey egg lysozyme complex with di-n-acetylchitobiose at 1.19a resolution
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystallographic dissection of the thermal motion of protein-sugar complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ljnA00
3AZ6A 5DLAA 2ZNWY 1IOQA 4WL6A 4AXTA 4YOPA 1GFAA 4H9EA 1XSFA 1GEVA 1IP3A 1O23A 1TAYA 2MEEA 5LYMA 1YKXX 4KL7A 4NSIA 2MEIA 2X0AA 4N1EI 5KXTA 1HSXA 1JIYA 1LZYA 1LZSA 5FSTA 2G4NA 1LZAA 1CJ9A 4KPMA 1BB7A 1EQ5A 2BQDA 5DM9A 4LYBA 5LXWA 1WQQA 3P4ZA 1CKHA 2BQNA 1OQMA 1B5XA 4WM2A 1REYA 4BAFA 1NWGA 1LSPA 1GB2A 5LINA 1GF8A 4LT3A 4NHIA 1LCNA 1BB5A 2D4KA 4TX7A 3RU5A 4DYGA 3A3QA 2PC2A 5KXXA 3TMWA 1NQIA 1QIOA 4GCCA 4MCKA 1GE2A 1VFBC 1KIRC 3AGIA 1XGRC 4HJYA 5M1YA 1B7QA 4HV1A 1A4VA 1IWXA 3WVYA 1J1XY 4GLVA 1HHLA 2HTXA 2YSSC 4H9BA 1LSFA 4GCBA 3RZ4A 1GDXA 1LOZA 4X3BA 1GE4A 4OWAA 5FDJA 1LMPA 1RJCB 1WTNA 1IP1A 2ZYCA 4H90A 2BQAA 3P68A 3AGGG 5APFA 4ET9A 4XN6A 3A93A 4WOAA 5KXLA 3CT5A 4LYOA 1LHJA 1GXV2 2MEFA 3HFMY 2I6ZA 1UIBA 3K3TA 4NSGA 1HSWA 3AW7A 4KT3A 3A90A 4NGWA 4P2EA 4NGLA 1UA6Y 1GF3A 1OUGA 5HQ1A 1IP5A 3IJVA 1OUFA 3A96A 1NBYC 5APEA 3EO5A 3W6CA 5HLLA 5APDA 1IY3A 1IWVA 3HBDA 5KXZA 4NHTA 5IHGA 1LZEA 4J1AA 1GFEA 1DKKA 1IC4Y 3ATOA 2DQFC 5LAFA 1C08C 1OP9B 1GFJA 4WLYA 4DDAA 3TXIA 1F10A 3WW6A 1LMCA 1LMTA 3CT0A 2NWDX 4J1BA 5B1GA 4NSJA 4H9FA 2AUBA 1FLUA 1BB3A 5HNLA 3G3AB 4G4BA 4NGYA 5L9JA 5LIOA 1MELL 1F6SA 2DQGY 4IASA 5KJ9A 1KIQC 1E8LA 3N9AA 3CSQA 4H92A 1GE1A 5C6JA 1B7PA 4LYTA 3GXKA 1DI4A 1NKHA 2EIZC 2YBHA 1JEFA 4H9AA 1BVKC 1IP4A 3LYZA 2LYOA 4TWSA 2BLXA 3CT1A 1GPQC 2DQAA 1B7MA 1PZYA 5HNCA 2W1MA 1WVUA 4LYMA 4HP0A 3TMUA 1LJ3A 1CKGA 1REXA 1YROA 3HBEX 3WPJA 1GFKA 1GWDA 1LYOA 1IR9A 1IOTA 1LZ8A 1IEEA 1IOCA 2LZ2A 3CSZA 3P64A 4M4OA 4CFPA 4Z41A 1CNSA 4ETCA 4NGZA 1F6RA 1IWYA 1UIGA 3AW6A 1FBIX 1HF4A 4NEBA 2YBIA 1LJEA 2ZIKA 3TXHA 5ILFA 1LZDA 4NIJA 1B5YA 4ET8A 3M3UA 1QTKA 1SQ2L 1LZTA 1IWUA 3IJUA 1ZVYB 2BQEA 1GB8A 4OWHA 1LJFA 4UWNA 3TMVA 1LSGA 1GE3A 4YF2A 1C10A 4O34A 2BPUA 3OK0A 1NBZC 1LJIA 4G9SA 5FELA 3ULRA 1YKYX 1B5VA 3B0IA 4XJIA 1FLWA 1JSEA 1LZ9A 1LSDA 4PJ2C 4B4IA 1JJ3A 4XJHA 1JITA 2C8PA 1P2CC 3T6UA 5K7OA 4PRQA 1BWJA 2YDGA 1B0DA 5F81A 1OUCA 1UIHA 6LYTA 1LMQA 2C8OA 1D9UA 2YVBA 3QE8A 4H91A 1VAUA 3ZVQA 4Z46A 5B07A 3AGHA 6LYZA 1LHHA 2LZTA 1LMAA 1YIKA 1LSAA 2D4IA 1OUJA 3ATNA 4H93A 3J4GA 4WM4A 154LA 1HMLA 1YL0X 1A2YC 3KAMA 4Z98A 4PPOA 2EQLA 1D0KA 1XGQC 5HMVA 2HECA 1H6MA 4XENA 1CJ6A 3LHMA 1GF0A 1HFZA 3A34A 4NGIA 4XYYA 4H94A 4H8XA 4J0LA 2ZQ4A 2YBJA 3B0KA 2Z19A 2BQOA 1LHIA 4H1PA 1LJ4A 5KXPA 4DDCA 1LKRA 1VDTA 4TSBA 2ZQ3A 1WQNA 2I25L 3AZ5A 2BQCA 4I8SA 1WQMA 1DI5A 4LYCA 3WYHA 1JKBA 4XJBA 1BHZA 3ZVQB 1F0WA 1LSEA 1JKCA 1LKSA 1LZNA 5IELA 5KXYA 4ZIXA 2HUBA 1GB5A 1EQ4A 5E9RA 4B0DA 1HENA 5A3EA 1BWHA 2Z18A 5FHWA 4XJGA 2B5ZA 5D5FA 1GB9A 4OWBA 3W6BA 3WU8A 2H5ZA 4GLAA 5I54A 2Z37A 4DDBA 2Z2FA 3IWRA 1GB0A 3LYOA 1JJ1A 1IP6A 5KKJA 4UWVA 3CQLA 5KXKA 4E3UA 5I4WA 4ETAA 1QUSA 1BB6A 4DD3A 5FCPA 1IWWA 1LJKA 2ZNXY 3AYQA 1C43A 2ZWBA 3FE0A 4HJVA 4ZFPA 2FBDA 4RW2A 5C6IA 1IOSA 5T3FA 4B4JA 4TTDA 1EQEA 2DQHY 1DZBX 4NFVA 3P65A 5F14A 8LYZA 1T6VL 5LVGA 1LHMA 2BLYA 1UC0A 3WW5A 1GF9A 1OUBA 3D9AC 1IWTA 1DQJC 2W1YA 1QTEA 5B05A 2N5ZA 4CGEA 2W1XA 1FLQA 4H8ZA 4RLNA 1IC5Y 3A91A 3A92A 3QY4A 4NY5A 4MR1A 4RW1A 4G4HA 3TXBA 4WM1A 3RW8A 135LA 5APCA 2MEAA 1AM7A 1GE0A 1BWIA 1LZ5A 3WVXA 4KXIA 5LA5A 4W96A 1FKQA 1YAQA 2Q0MX 1UIDA 1HEMA 2FYDA 4HPEA 5KKIA 5KXOA 1C46A 1QUTA 4WLDA 3WU9A 1FLYA 1LHLA 1B7SA 3A3RX 3WU7A 5KY1A 4NG1A 1DKJA 3W3EA 5LVKA 4QY9A 1JKAA 1CKFA 2Z38A 3LZTA 1RI8B 4CFOA 3W6FA 3LN2A 1B7LA 4M6DA 2FBBA 1G7MC 3D3DA 2HU3A 3VWOA 1HEWA 1JPOA 1MLCE 4A7DA 4BS7A 4B1AA 5I4YA 1GFGA 2CJLA 2Y8PA 1I20A 3FI7A 4YM8A 1LHKA 1C7PA 4WO9A 1GBOA 4OOTA 5F9XA 4B4EA 1JWRA 1GFVA 4N9RA 4LT2A 1SLYA 4II8A 1GAZA 2IHLA 1IWZA 3M18B 1XFPL 1JUGA 2Z12A 3E3DA 1GXXA 1LZ6A 4YEOA 1TCYA 1UICA 2A7DA 2I26L 2ZIJA 3W6EA 5KXRA 1W6ZA 1IVMA 4ZEEA 5LAGA 2XBSA 1IP2A 4N8ZA 1YAPA 3TXJA 1KXWA 2CGIA 134LA 5KXWA 2XBRA 1LYSA 1G7HC 2Z2EA 2H9KA 1GBZA 3BKVA 1B7OA 5B06A 1YL1X 1UUZC 3EMSA 4NGJA 4L41A 4D9ZA 2BQGA 4OW1A 1UIFA 2BQJA 1CJ7A 1WTMA 1NDGC 1GDWA 2XTHA 2F30A 1QDTA 2YBMA 4RDSA 1RCMA 4ML7A 4R6CA 1REZA 1GHLA 4QDNA 3A6BY 3W6DA 1I56A 4DC4A 4YENA 1YAOA 2MEHA 5C6LA 3WUNA 1AKIA 5J7CA 4UWUA 3AJNA 132LA 1LJHA 2BQKA 1RE2A 1GBXA 1DPWA 1G7IC 1LSBA 2G4QA 1LYYA 1HNLA 2YBLA 4AGAA 5E4PA 4HJZA 3F6ZA 5ILCA 2MEGA 1GFRA 1BQLY 1GEZA 1WQPA 1BB4A 1YAMA 5B1FA 1IC7Y 4YEMA 1REMA 5B59A 5DL9A 4ETDA 1OUIA 2FYCA 2DBTA 2MEBA 3MGWA 3N9CA 2BQIA 1ALCA 4N0JA 1HERA 4NWEA 3T36A 3WXTA 3B72A 1D0LA 4G4CA 1LZCA 2BQMA 3SP3A 2WARA 1HELA 5HMJA 1NDMC 1QSAA 1VDQA 1GFTA 2F4AA 1JISA 3B0OA 2IFFY 4XADA 2BQFA 2W1LA 2F2NA 4ETBA 3AZ4A 1GAYA 5I53A 2EKSC 5L3IA 1NF5A 1LTMA 4DD1A 1LJNA 4HTQA 5EBHA 1LZ4A 4H9HA 1LZBA 1BGIA 1KXYA 194LA 3OJPA 4WMGA 1QQYA 1WQRA 4NGOA 5FEKA 1B7NA 4ANRA 1XEKA 1GB3A 4LT0A 3A95A 1D6PA 1EL1A 1LSYA 1VDPA 2CWIA 4NHPA 1Z55A 1GBWA 2LYMA 1JTTL 4DD0A 4QGZA 3WUMA 3AZ7A 1N4FA 1YILA 1HC0A 4LFXA 4GCEA 3RNXA 1LMOA 2D91A 1UBZA 3A67Y 1IY4A 1KIPC 1B2KA 2Z39A 1LSZA 4FDYA 1W08A 3BKHA 193LA 1QSWA 1LZ1A 2DQEY 3TMXA 4BADA 1HMKA 5KXSA 5JENB 4J7VA 4WO6A 1KXXA 4WM5A 1LSMA 1UIEA 1CKCA 4NGKA 3WMKA 1B9OA 1XGTC 3QNGA 2ZILA 1PS5A 4LZTA 3A6CY 5D5CA 5KXMA 2LYZA 1LMNA 2G4PA 4Z3MA 1GD6A 1LZGA 3ZEKA 4FJRA 1FDLY 2DQJY 4TSCA 4GCFA 5LYTA 2DKVA 1OUEA 2CDSA 4OOOA 5II3A 1B5WA 1OUHA 1AT6A 1T3PA 2DQDY 3WPKA 1V7SA 4NHSA 1GF4A 4MSTA 3A8ZA 2BAAA 2BQLA 2H9JA 1IP7A 4HSFA 4WLXA 1G7LC 2BQBA 1VEDA 2YBNA 1GFHA 1LJGA 3RT5X 3G3BB 4WL7A 4EMNA 1GB6A 1B5UA 1I1ZA 1HEOA 2MECA 1ZV5L 3CSRA 1LAAA 1AT5A 2HEBA 3EXDA 3GXRA 1YKZX 2HEEA 4H9CA 2DQIY 1XGUC 4I0CA 4LGKA 4R0FA 5DN4A 1ZMYL 2DQCY 1BVXA 1LSNA 4WM6A 1IR8A 1OUDA 1JSFA 3J6KA 5LYZA 3P66A 1UACY 133LA 3WPLA 2HEAA 1UIAA 2XJWA 3WH1A 4NG8A 4QEQA 4DD9A 4NHQA 2EPEA 4EOFA 1DPXA 1D0MA 1DXJA 1AZFA 1GF6A 2F4GA 2ZYPA 4G49A 3EBAB 4NWHA 4TUNA 1GF5A 2D4JA 4PHIA 1J1OY 1JHLA 2HEFA 1INUA 3B6LA 3LYTA 5F16A 3TXKA 5LVJA 3TXDA 4U3XB 1LJJA 1FN5A 4N5RA 4IATA 153LA 1YQVY 4LFPA 1B5ZA 3WUAA 1CKDA 2BQHA 5LVIA 1GF7A 4N1CC 4NGVA 1GB7A 1XEIA 2A7FA 3LYMA 4HTKA 1NMMA 1TBYA 3AB6A 1NHEA 3TXFA 1JTPL 1G7JC 4OWEA 5DN5A 1TDYA 1YANA 1LYZA 2VB1A 4W94A 4DD2A 4PRUA 9LYZA 5LVHA 5I4XA 2RSCA 4GN4A 4ETEA 1LZRA 1IORA 4GN5C 4HTNA 4OWCA 1FKVA 1HEPA 4DD7A 4CJ2A 4BAPA 1JJ0A 3N9EA 1RFPA 3A94A 5LA8A 4DT3A 1ZVHL 4WM3A 207LA 1VDSA 3CB7A 1HEQA 4GN3A 4XJFA 2MEDA 1DI3A 3TXEA 1H87A 1TEWA 1C45A 1CJ8A 4HV2A 7LYZA 5F9UA 5KXNA 4RLMA 1GBSA 4LT1A 1JTOL 2HEDA 1WQOA 1J1PY 1XGPC 4HPIA 1V7TA 5IDDA 3WXUA 1IR7A 5L3HA 4DWXA 4H9IA 1D6QA 1HFYA 1LSCA 3W6AA 1IX0A 1GFUA 4H8YA 1OUAA 4PGJB 1IO5A 1B7RA 1XEJA 2D6BA 3WULA 1JKDA 5I5QA 3TXGA 4WLTA 4CHXA 1HFXA 4C3WA 4B49A 1LPIA 1UCOA 4XJDA 2GV0A 2HU1A 4GCDA 1IIZA 2LHMA 3WL2A 4NSHA 5AMYA 4WG7A 4LYZA 208LA 4WG1A 1GBYA 1QDRA 1WVVA 4C5FA 3LZ2A 4IJ4A 5A3ZA 1VATA 3HBHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CUQA 2ZNWY 1IOQA 1I6SA 120LA 1XSFA 1O23A 2MEEA 1YKXX 205LA 4N1EI 5KXTA 4KPMA 152LA 169LA 247LA 3P4ZA 1LSPA 1GB2A 5LINA 217LA 4LT3A 3RU5A 1BB5A 1T8FA 2D4KA 4TX7A 1CV5A 1P2LA 3TMWA 1LYJA 1GE2A 1C6EA 5M1YA 1G0GA 4HV1A 1J1XY 4GLVA 184LA 3EMLA 4H9BA 3HUKA 177LA 1L93A 4OWAA 5FDJA 1WTNA 1IP1A 3V2WA 4LDOA 4XN6A 1L0JA 4WOAA 4LYOA 1GXV2 1C65A 3HTFA 4KT3A 4NGWA 1UA6Y 1GF3A 5HQ1A 3CDRA 1G07A 5APDA 3HBDA 1GFEA 3ATOA 1IC4Y 2DQFC 1C08C 1GFJA 3TXIA 1F10A 219LA 1LMTA 1C6QA 209LA 3G3AB 1CX7A 164LA 5LIOA 1MELL 3N9AA 249LA 111LA 5C6JA 1B7PA 4I7KA 2YBHA 1JEFA 4I7SA 1BVKC 2LYOA 4W56A 1L73A 1PZYA 239LA 4LYMA 3TMUA 4ARQA 1LJ3A 1YROA 3HBEX 1LYOA 1L25A 237LA 1IEEA 4Z41A 4NGZA 1F6RA 144LA 1FBIX 4NEBA 1LJEA 1L74A 5ILFA 2HUKA 4NIJA 1B5YA 3M3UA 1ZVYB 4OWHA 1L00A 1LJFA 2B6ZA 3TMVA 1C10A 4O34A 2BPUA 3OK0A 1NBZC 5FELA 1YKYX 1JSEA 3CDTA 1LSDA 3SB8A 1G0LA 4IAPA 1OV5A 1P2CC 2B73A 1L47A 4PRQA 1PQDA 2RH1A 192LA 1B0DA 2YDGA 5F81A 1P46A 123LA 180LA 2C8OA 2YVBA 1D9UA 4H91A 1YIKA 1L56A 2D4IA 3ATNA 3HH6A 3J4GA 1QTDA 4DKLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AZ6 A;  5DLA A;  2ZNW Y;  1IOQ A;  4WL6 A;  4AXT A;  4YOP A;  1GFA A;  4H9E A;  1XSF A;  1GEV A;  1IP3 A;  1O23 A;  1TAY A;  2MEE A;  5LYM A;  1YKX X;  4KL7 A;  4NSI A;  2MEI A;  2X0A A;  4N1E I;  5KXT A;  1HSX A;  1JIY A;  1LZY A;  1LZS A;  5FST A;  2G4N A;  1LZA A;  1CJ9 A;  4KPM A;  1BB7 A;  1EQ5 A;  2BQD A;  5DM9 A;  4LYB A;  5LXW A;  1WQQ A;  3P4Z A;  1CKH A;  2BQN A;  1OQM A;  1B5X A;  4WM2 A;  1REY A;  4BAF A;  1NWG A;  1LSP A;  1GB2 A;  5LIN A;  1GF8 A;  4LT3 A;  4NHI A;  1LCN A;  1BB5 A;  2D4K A;  4TX7 A;  3RU5 A;  4DYG A;  3A3Q A;  2PC2 A;  5KXX A;  3TMW A;  1NQI A;  1QIO A;  4GCC A;  4MCK A;  1GE2 A;  1VFB C;  1KIR C;  3AGI A;  1XGR C;  4HJY A;  5M1Y A;  1B7Q A;  4HV1 A;  1A4V A;  1IWX A;  3WVY A;  1J1X Y;  4GLV A;  1HHL A;  2HTX A;  2YSS C;  4H9B A;  1LSF A;  4GCB A;  3RZ4 A;  1GDX A;  1LOZ A;  4X3B A;  1GE4 A;  4OWA A;  5FDJ A;  1LMP A;  1RJC B;  1WTN A;  1IP1 A;  2ZYC A;  4H90 A;  2BQA A;  3P68 A;  3AGG G;  5APF A;  4ET9 A;  4XN6 A;  3A93 A;  4WOA A;  5KXL A;  3CT5 A;  4LYO A; 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 2HEF A;  1INU A;  3B6L A;  3LYT A;  5F16 A;  3TXK A;  5LVJ A;  3TXD A;  4U3X B;  1LJJ A;  1FN5 A;  4N5R A;  4IAT A;  153L A;  1YQV Y;  4LFP A;  1B5Z A;  3WUA A;  1CKD A;  2BQH A;  5LVI A;  1GF7 A;  4N1C C;  4NGV A;  1GB7 A;  1XEI A;  2A7F A;  3LYM A;  4HTK A;  1NMM A;  1TBY A;  3AB6 A;  1NHE A;  3TXF A;  1JTP L;  1G7J C;  4OWE A;  5DN5 A;  1TDY A;  1YAN A;  1LYZ A;  2VB1 A;  4W94 A;  4DD2 A;  4PRU A;  9LYZ A;  5LVH A;  5I4X A;  2RSC A;  4GN4 A;  4ETE A;  1LZR A;  1IOR A;  4GN5 C;  4HTN A;  4OWC A;  1FKV A;  1HEP A;  4DD7 A;  4CJ2 A;  4BAP A;  1JJ0 A;  3N9E A;  1RFP A;  3A94 A;  5LA8 A;  4DT3 A;  1ZVH L;  4WM3 A;  207L A;  1VDS A;  3CB7 A;  1HEQ A;  4GN3 A;  4XJF A;  2MED A;  1DI3 A;  3TXE A;  1H87 A;  1TEW A;  1C45 A;  1CJ8 A;  4HV2 A;  7LYZ A;  5F9U A;  5KXN A;  4RLM A;  1GBS A;  4LT1 A;  1JTO L;  2HED A;  1WQO A;  1J1P Y;  1XGP C;  4HPI A;  1V7T A;  5IDD A;  3WXU A;  1IR7 A;  5L3H A;  4DWX A;  4H9I A;  1D6Q A;  1HFY A;  1LSC A;  3W6A A;  1IX0 A;  1GFU A;  4H8Y A;  1OUA A;  4PGJ B;  1IO5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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