1LZ4A

Enthalpic destabilization of a mutant human lysozyme lacking a disulfide bridge between cysteine-77 and cysteine-95
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNAAHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Enthalpic destabilization of a mutant human lysozyme lacking a disulfide bridge between cysteine-77 and cysteine-95.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Homo sapiens
total genus 49
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lz4A00
1CKHA 1GBZA 1GDXA 1JUGA 1RI8B 1WQOA 2BQIA 4PPOA 5KXYA 1DI3A 4LGKA 4ETCA 4G4BA 2ZIKA 5K7OA 5A3EA 1HEWA 1LCNA 2Y8PA 1REMA 2ZYPA 207LA 1I56A 4H91A 1JIYA 2VB1A 4OOTA 4TUNA 5KKIA 3LZTA 3AGHA 4LT3A 1NWGA 1TAYA 3LHMA 1VDPA 4BAFA 9LYZA 1GDWA 5LVIA 1GF6A 1LSGA 3P68A 4CJ2A 3TMUA 1UIHA 1D9UA 2BQBA 4LYMA 1BB7A 5FCPA 3WYHA 2YBJA 1GB9A 1XSFA 4TSCA 5EBHA 1HEOA 1OUBA 1YKZX 4H9AA 4RW2A 5FEKA 1JKBA 1O23A 4NFVA 1LMTA 1BWHA 3N9CA 3P4ZA 4LFXA 4DDAA 1GF7A 1YAQA 1JPOA 4DD3A 2I26L 3LYTA 1DXJA 3OJPA 1GB0A 1QTEA 1XFPL 1IOTA 2F30A 3GXRA 2EQLA 2RSCA 3F6ZA 3HFMY 1EQ5A 3QE8A 1C10A 1D6PA 1HENA 1UIEA 2ZILA 4GLVA 4W94A 1IP7A 3E3DA 4H9CA 5F81A 4WOAA 4YM8A 1YAPA 1B7RA 1D0MA 1GF3A 2Z2EA 1WVVA 5KXWA 4OWBA 4XADA 1KXYA 1LZRA 2HTXA 1GHLA 1LSNA 4NHPA 1GFVA 1LKSA 5LIOA 3A67Y 135LA 1LHJA 4HPEA 4OWCA 5HNCA 3WUNA 2D4KA 1B7NA 4DD0A 1LZSA 3LYMA 4GN3A 5F9XA 5I4WA 2EIZC 5KXXA 1VDSA 1OUGA 1REZA 2A7DA 4N8ZA 1BWIA 4H8YA 2F2NA 4WG7A 4PHIA 3TXEA 2HEBA 1LJNA 1KXWA 1IP1A 1LHHA 4HPIA 4DDCA 3W6AA 4J1AA 4HJVA 4KL7A 3ZVQB 4B1AA 2Z2FA 5I4YA 5IHGA 1GAYA 1LSZA 1C7PA 1YILA 5APCA 1NHEA 1JSEA 2CDSA 2CGIA 1GF9A 4HV1A 5DL9A 1GXV2 4DD2A 3IJVA 1ZVYB 3A93A 1V7TA 2BLYA 3W6EA 1GF8A 5JENB 3W6DA 1LYZA 3M18B 1IVMA 1TDYA 3D3DA 3W6FA 154LA 3HBHA 4BAPA 4H9BA 1IP6A 4HTNA 1LJFA 1GF5A 4J0LA 5B59A 4HTQA 5F16A 1LZ4A 1HELA 1JITA 4GCFA 1JWRA 4I0CA 1C45A 4CGEA 1HERA 1BVXA 2MEHA 1CJ9A 2GV0A 5APDA 1LHMA 1LSPA 1RJCB 3AGGG 3QY4A 4YOPA 4BS7A 1HMKA 3A94A 1B5ZA 1LMAA 1SLYA 4DD7A 1LMOA 5KXRA 1LMNA 1IWYA 1IC5Y 3WULA 3IJUA 2H5ZA 5APFA 5J7CA 1IP5A 1DKJA 1H6MA 1J1OY 3RW8A 3AZ7A 1JHLA 3SP3A 2MEFA 1LJIA 5LAGA 5KXLA 4LZTA 1HC0A 2AUBA 4OW1A 4DWXA 2W1MA 4IATA 5HMJA 5KXSA 2Z18A 1GB6A 1LHIA 1QDTA 2DQFC 3WU7A 1YAMA 3J6KA 1GBXA 2LZ2A 4H9EA 2LHMA 4J1BA 4B4JA 4C3WA 2YBIA 1JISA 3WMKA 1WTMA 4ZEEA 1IP3A 1HFZA 1ZVHL 4NGJA 1D6QA 1C43A 2ZNWY 5DLAA 4WM1A 4GCCA 2BQOA 1F6RA 1JTOL 2DBTA 3B0IA 1VEDA 3AZ4A 1XEJA 1LJ4A 5DN4A 1WQNA 193LA 1QTKA 4GN5C 1AT6A 134LA 1BB4A 4L41A 1DPWA 3WXTA 4RLMA 4TX7A 1GFTA 1F10A 1RFPA 3G3BB 4WLYA 1B7MA 2PC2A 3TXKA 5LA5A 1XEKA 3WUAA 4NWEA 4WMGA 2MEBA 2D91A 2HUBA 3WW6A 4D9ZA 1LSAA 2B5ZA 2BQLA 2YSSC 4A7DA 2DQGY 1BGIA 4PGJB 3WVYA 1REYA 1GE0A 4X3BA 5LYTA 2FBBA 1VDTA 2N5ZA 4H93A 4NGVA 1UCOA 3WH1A 1RE2A 1REXA 1QSAA 5II3A 3TXJA 1GE4A 2LZTA 3B0OA 5LAFA 1WQPA 1GBOA 1YANA 4ML7A 4IJ4A 1LTMA 5HLLA 1OUHA 1IWUA 4FJRA 1HEPA 5IELA 3M3UA 153LA 2Z39A 5FHWA 1UUZC 4WLXA 1WVUA 1YKXX 3WXUA 1WTNA 4WM6A 3WPJA 4ET9A 1ZMYL 2ZYCA 5A3ZA 5AMYA 1AKIA 4CFOA 2BQEA 3N9AA 4G49A 1UA6Y 1LMCA 5B05A 2MEGA 3A92A 4E3UA 4O34A 1IORA 3LYOA 3ULRA 4N1EI 1NMMA 4QDNA 1F0WA 4LYTA 1B9OA 1LJJA 2C8OA 4XYYA 5L3HA 3VWOA 1KIQC 1IWVA 4WM2A 1C08C 1IX0A 1GEZA 1GBWA 4N5RA 4BADA 1IY3A 1GF4A 2XTHA 4RLNA 3WPKA 3WPLA 3ZEKA 1VATA 4II8A 133LA 2HEFA 4P2EA 4QEQA 1BWJA 4WL7A 1HEMA 1YKYX 4OWHA 2Z37A 4UWNA 2MEDA 1IP4A 3TMVA 5HQ1A 1LZTA 4H9HA 4NG8A 3P66A 1HSWA 4G4HA 4H1PA 1DKKA 4M6DA 1TEWA 1AM7A 1HF4A 2I6ZA 3QNGA 5LA8A 1UIBA 4DT3A 1MLCE 1A2YC 1GXXA 1CJ7A 3IWRA 2MECA 5T3FA 1LSCA 1LSEA 3WVXA 3EBAB 1YL0X 1LAAA 1B7LA 1GBYA 5ILFA 5HNLA 3TXHA 1QDRA 5B1FA 3A6BY 1GB8A 4HJYA 2D6BA 3HBDA 3T36A 4ET8A 5HMVA 5I54A 4TSBA 3WUMA 1XEIA 4QGZA 6LYTA 1VFBC 1UACY 4PJ2C 1FLYA 1HMLA 4HJZA 1GPQC 5LVJA 3T6UA 1LJKA 1KIPC 3GXKA 4LT2A 1C46A 4H92A 4IASA 4WM5A 5KXKA 5F9UA 4H8XA 1FKQA 1IR7A 3BKHA 1UIGA 2BQAA 1UBZA 3WW5A 1GWDA 1EQ4A 2Z12A 1B5WA 2MEIA 1GE2A 1ZV5L 3A3QA 4LT1A 1G7JC 1XGRC 1CKDA 1D0KA 2I25L 5LINA 1YAOA 3CSZA 3AZ5A 1LSFA 5IDDA 1IOSA 1IY4A 4W96A 5APEA 1GFJA 2W1XA 1GFGA 3ATNA 1BVKC 1HNLA 1G7LC 1EQEA 4G4CA 5I53A 1GB3A 4NGWA 4NGIA 5KJ9A 1GB5A 1GFKA 4B4IA 2HEDA 3A8ZA 3EXDA 5L9JA 2YBHA 2BQCA 3CSQA 2MEEA 5B07A 1CJ8A 1NF5A 2MEAA 3BKVA 1Z55A 4NSGA 1IO5A 2F4AA 4KXIA 3P64A 1CJ6A 4H8ZA 1LKRA 2H9KA 4N1CC 1CKFA 1RCMA 1IOCA 2ZQ4A 4RW1A 1B5YA 1ALCA 1T6VL 1LSDA 4NY5A 3TXFA 4ZFPA 4Z3MA 4M4OA 5B1GA 4N0JA 1FLUA 1UIFA 2BQNA 2FBDA 4WM3A 2ZQ3A 1LSYA 1B7PA 1DQJC 1DI5A 5C6LA 1LZ5A 1TCYA 1IWTA 4NSIA 3A91A 4UWVA 1INUA 4WL6A 4AXTA 1DPXA 4ETBA 4Z41A 4LT0A 4CFPA 4EOFA 1IOQA 2W1LA 4H90A 4NHQA 4GCEA 1NBYC 4UWUA 5ILCA 3A6CY 1OUCA 1JJ3A 1D0LA 1GBSA 4B4EA 3CT5A 2DQEY 3EMSA 1LZBA 3WU8A 4NHTA 4OOOA 4YF2A 2D4IA 4NGZA 1G7HC 4NGKA 5C6JA 4NEBA 1BB5A 2D4JA 2G4PA 1JTTL 1B5VA 2EKSC 2FYDA 4XJDA 1IR9A 4NHSA 1AZFA 4HV2A 2BQGA 4PRUA 5LVHA 1JKDA 3LZ2A 4FDYA 4LYZA 4NHIA 4ANRA 2H9JA 1FBIX 4RDSA 4G9SA 132LA 3W6CA 3FI7A 1LJEA 2CWIA 5DM9A 1DZBX 3CQLA 5FSTA 4C5FA 1OUDA 1IIZA 4MR1A 4NIJA 1I20A 1LYOA 4I8SA 1LJGA 4XJFA 1FKVA 1GB7A 3AJNA 1KIRC 2IFFY 2YDGA 4H94A 4WLTA 5LVKA 4GLAA 3TXBA 2DQHY 1B7QA 1LOZA 1XGQC 4XJIA 3FE0A 2YBMA 2X0AA 1LZYA 5L3IA 1LZ6A 1LYYA 1LZDA 2ZNXY 1BB3A 1G7MC 5I5QA 5D5CA 3TMXA 2XBSA 1BB6A 3EO5A 3K3TA 1YL1X 4DDBA 1NQIA 1LZCA 1YIKA 4N9RA 4OWAA 4YENA 1CKGA 1XGTC 1OUEA 1YROA 1CKCA 6LYZA 5LXWA 3TXIA 1LZAA 3TXGA 3B0KA 1MELL 3CT0A 1CNSA 2C8PA 1LZ9A 2YBNA 2G4QA 2Z19A 4NGOA 4WO9A 3D9AC 2BLXA 5E9RA 2HECA 4HSFA 3RU5A 1OQMA 2YBLA 2DKVA 3TXDA 1B7SA 4NSJA 3TMWA 2HU1A 5KXOA 1FLQA 1A4VA 1G7IC 2FYCA 5KXMA 2CJLA 4J7VA 5LYMA 5B06A 2ZWBA 1OP9B 5KXPA 2NWDX 2ZIJA 5LVGA 1B0DA 1GB2A 1OUFA 4R0FA 1LZEA 2W1YA 4H9FA 3AGIA 1N4FA 1UIAA 1QUSA 194LA 4YEMA 1GD6A 1JEFA 4NWHA 1LZ1A 1T3PA 1JTPL 1LMQA 1GFAA 3J4GA 4YEOA 1GFUA 5M1YA 1DI4A 1GEVA 4ETDA 4AGAA 4U3XB 1B5UA 3ATOA 3N9EA 4LYBA 1GAZA 4Z46A 1WQRA 4R6CA 3LYZA 3RT5X 4B0DA 1LZNA 1QIOA 1J1PY 1HFXA 2BQFA 3LN2A 3RNXA 3A90A 1OUAA 1XGUC 1IC7Y 1OUIA 4NGYA 1KXXA 3AYQA 1GFRA 1LHLA 2HEEA 3W3EA 4Z98A 4XENA 4DYGA 1LZ8A 1UC0A 1HFYA 3B6LA 4TTDA 1B7OA 3CB7A 1H87A 5KY1A 2DQDY 2LYMA 1IP2A 1OUJA 1SQ2L 2LYOA 2A7FA 3AB6A 3CSRA 1PS5A 1IC4Y 1QQYA 5FELA 1AT5A 2BQDA 1LYSA 1F6SA 4WG1A 3P65A 2DQJY 3AZ6A 1IWXA 1TBYA 2BQJA 4ETEA 1J1XY 1PZYA 3OK0A 5DN5A 3RZ4A 1FLWA 4CHXA 1VDQA 3WU9A 4OWEA 2BQMA 1GFEA 1GFHA 1W6ZA 1IWZA 1QUTA 1LSMA 4LYOA 1FDLY 1WQQA 1YQVY 5E4PA 1BQLY 5FDJA 4ETAA 3B72A 5C6IA 1LPIA 1E8LA 5F14A 1NDGC 4HTKA 7LYZA 2Q0MX 3ZVQA 4WLDA 4WM4A 1LJHA 2XBRA 1JJ1A 3AW6A 3CT1A 4QY9A 4NSHA 4ZIXA 1IR8A 5KXZA 4LFPA 4MCKA 1JJ0A 208LA 3G3AB 4EMNA 1LJ3A 2DQCY 4DD9A 1GE1A 1GF0A 2IHLA 5D5FA 1NDMC 4HP0A 5KXNA 1B2KA 4H9IA 2G4NA 1JKAA 2EPEA 1I1ZA 4KPMA 1P2CC 3AW7A 5LYZA 4GCDA 2BQKA 4NGLA 4XJGA 5I4XA 1FN5A 1LZGA 1NBZC 1NKHA 2LYZA 1WQMA 1LMPA 2XJWA 5KXTA 8LYZA 1LSBA 4WO6A 4MSTA 2DQIY 1W08A 2DQAA 1HSXA 2HU3A 4DC4A 4DD1A 1JKCA 1IEEA 1HHLA 1UIDA 1V7SA 2BQHA 3KAMA 3MGWA 4GCBA 3WL2A 4GN4A 1XGPC 4LYCA 5KKJA 3W6BA 3A96A 3A34A 1EL1A 1QSWA 1GE3A 4PRQA 1LHKA 1BHZA 4KT3A 2Z38A 2HEAA 1B5XA 3A3RX 2BAAA 4XJBA 2BPUA 1HEQA 2F4GA 4NG1A 1IWWA 2WARA 1JSFA 4XJHA 2YVBA 4TWSA 4B49A 1UICA 3A95A 1VAUA 3HBEX 4XN6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E97A 1GBZA 1L28A 1L90A 1C62A 5K7OA 3NYAA 4LDOA 1HEWA 2ZYPA 3HWLA 1I56A 1JIYA 5KKIA 1L10A 9LYZA 239LA 1LSGA 2B6TA 2HUKA 1UIHA 2BQBA 4LYMA 2YBJA 1OUBA 4H9AA 1JKBA 1LMTA 3P4ZA 240LA 2I26L 1OVHA 1L01A 1L32A 3LYTA 1DXJA 3OJPA 3F6ZA 1EQ5A 1C10A 1D6PA 1HENA 4GLVA 4H9CA 3E3DA 1L44A 2O7AA 199LA 1QSQA 5KXWA 1L04A 4XADA 115LA 1GFVA 1LKSA 1LLHA 1B7NA 3LYMA 253LA 5I4WA 1C67A 1L89A 107LA 1OV5A 1L62A 3W6AA 4HJVA 1CU0A 1C7PA 1L83A 3SN6R 1NHEA 1JSEA 2CGIA 1GF9A 4HV1A 3A93A 176LA 3W6DA 3GUIA 3M18B 3GUPA 148LE 4BAPA 3PBLA 1D3JA 159LA 1GF5A 1LZ4A 3UONA 4I0CA 1HERA 2MEHA 5APDA 1LHMA 1L21A 1B5ZA 3RZEA 4DD7A 5KXRA 3G3VA 2H5ZA 1DYEA 5J7CA 3V2WA 1H6MA 102LA 2MEFA 1LJIA 197LA 5KXLA 4ARPA 1HC0A 4DWXA 2W1MA 5HMJA 3G3XA 5KXSA 2Z6BA 1YAMA 2LHMA 4J1BA 4ARQB 4EPFA 1L11A 1WTMA 1ZVHL 2BQOA 2DBTA 1LYIA 1WQNA 1QTKA 4GN5C 4L41A 4TX7A 3GULA 4NWEA 1LGXA 2BQLA 1P36A 1L34A 1REYA 2F32A 4H93A 3WH1A 1L37A 1REXA 2F47A 1GE4A 2LZTA 4I7QA 4ML7A 4I7MA 1IWUA 1QTBA 5IELA 2Z39A 1PQMA 1KY0A 4WLXA 110LA 4WM6A 3WPJA 1ZMYL 2ZYCA 4CFOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CKH A;  1GBZ A;  1GDX A;  1JUG A;  1RI8 B;  1WQO A;  2BQI A;  4PPO A;  5KXY A;  1DI3 A;  4LGK A;  4ETC A;  4G4B A;  2ZIK A;  5K7O A;  5A3E A;  1HEW A;  1LCN A;  2Y8P A;  1REM A;  2ZYP A;  207L A;  1I56 A;  4H91 A;  1JIY A;  2VB1 A;  4OOT A;  4TUN A;  5KKI A;  3LZT A;  3AGH A;  4LT3 A;  1NWG A;  1TAY A;  3LHM A;  1VDP A;  4BAF A;  9LYZ A;  1GDW A;  5LVI A;  1GF6 A;  1LSG A;  3P68 A;  4CJ2 A;  3TMU A;  1UIH A;  1D9U A;  2BQB A;  4LYM A;  1BB7 A;  5FCP A;  3WYH A;  2YBJ A;  1GB9 A;  1XSF A;  4TSC A;  5EBH A;  1HEO A;  1OUB A;  1YKZ X;  4H9A A;  4RW2 A;  5FEK A;  1JKB A;  1O23 A;  4NFV A;  1LMT A;  1BWH A;  3N9C A;  3P4Z A;  4LFX A;  4DDA A;  1GF7 A;  1YAQ A;  1JPO A;  4DD3 A;  2I26 L;  3LYT A;  1DXJ A;  3OJP A;  1GB0 A;  1QTE A;  1XFP L;  1IOT A;  2F30 A;  3GXR A;  2EQL A;  2RSC A;  3F6Z A;  3HFM Y;  1EQ5 A;  3QE8 A;  1C10 A;  1D6P A;  1HEN A;  1UIE A;  2ZIL A;  4GLV A;  4W94 A;  1IP7 A;  3E3D A;  4H9C A;  5F81 A;  4WOA A;  4YM8 A;  1YAP A;  1B7R A;  1D0M A;  1GF3 A;  2Z2E A;  1WVV A;  5KXW A; 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 1IWX A;  1TBY A;  2BQJ A;  4ETE A;  1J1X Y;  1PZY A;  3OK0 A;  5DN5 A;  3RZ4 A;  1FLW A;  4CHX A;  1VDQ A;  3WU9 A;  4OWE A;  2BQM A;  1GFE A;  1GFH A;  1W6Z A;  1IWZ A;  1QUT A;  1LSM A;  4LYO A;  1FDL Y;  1WQQ A;  1YQV Y;  5E4P A;  1BQL Y;  5FDJ A;  4ETA A;  3B72 A;  5C6I A;  1LPI A;  1E8L A;  5F14 A;  1NDG C;  4HTK A;  7LYZ A;  2Q0M X;  3ZVQ A;  4WLD A;  4WM4 A;  1LJH A;  2XBR A;  1JJ1 A;  3AW6 A;  3CT1 A;  4QY9 A;  4NSH A;  4ZIX A;  1IR8 A;  5KXZ A;  4LFP A;  4MCK A;  1JJ0 A;  208L A;  3G3A B;  4EMN A;  1LJ3 A;  2DQC Y;  4DD9 A;  1GE1 A;  1GF0 A;  2IHL A;  5D5F A;  1NDM C;  4HP0 A;  5KXN A;  1B2K A;  4H9I A;  2G4N A;  1JKA A;  2EPE A;  1I1Z A;  4KPM A;  1P2C C;  3AW7 A;  5LYZ A;  4GCD A;  2BQK A;  4NGL A;  4XJG A;  5I4X A;  1FN5 A;  1LZG A;  1NBZ C;  1NKH A;  2LYZ A;  1WQM A;  1LMP A;  2XJW A;  5KXT A;  8LYZ A;  1LSB A;  4WO6 A;  4MST A;  2DQI Y;  1W08 A;  2DQA A;  1HSX A;  2HU3 A;  4DC4 A;  4DD1 A;  1JKC A;  1IEE A;  1HHL A;  1UID A;  1V7S A;  2BQH A;  3KAM A;  3MGW A;  4GCB A;  3WL2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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