1LZBA

Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Gallus gallus
publication title Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lzbA00
5AMYA 1WQMA 1LZRA 4A7DA 6LYZA 4YOPA 5C6JA 1IR8A 2D4KA 1LTMA 1YKXX 3MGWA 4E3UA 1LSPA 4NGJA 1REXA 4G9SA 4C5FA 1LZBA 2BLXA 4DYGA 5ILCA 5I54A 2Z19A 3B0IA 1ZVHL 1KXYA 4NSHA 2B5ZA 1LZDA 3GXRA 1IOQA 4IJ4A 4Z41A 1UIFA 1RJCB 3IWRA 3TXBA 1IOCA 3B0OA 4PRUA 4WLYA 4XJDA 4XENA 4AGAA 1D0KA 5LYZA 4M4OA 208LA 1IORA 1GB9A 1NHEA 1T6VL 1LHLA 1DQJC 4NSGA 4WG7A 1IWYA 2CWIA 2HEEA 4GCCA 4ML7A 4BAFA 3A92A 3AZ7A 4H9EA 5K7OA 2WARA 4GCFA 4XADA 3AZ4A 1LJJA 5F14A 1C43A 1GB5A 1IO5A 2Q0MX 2YBMA 2MEFA 4N5RA 4OWHA 3LHMA 2YBJA 5LIOA 1JEFA 1LJIA 4DD7A 1IP1A 1A4VA 4OWEA 1LSNA 3RNXA 1GFGA 4ET8A 2H9JA 2W1YA 5F16A 4MSTA 5FELA 5I4YA 1LSCA 1BWJA 3W6BA 135LA 3T36A 2MEGA 5B06A 2YBLA 1GEZA 5D5FA 1B7QA 2EPEA 4ETBA 1UUZC 4WLDA 1B5UA 1GHLA 4CFPA 1JISA 1JJ1A 1D6PA 2DBTA 5KXKA 5KKIA 1IP6A 1B7PA 1YAPA 4KXIA 1DXJA 1LSDA 2DQGY 1GFUA 4N1CC 5B1GA 5KKJA 134LA 1EL1A 1XFPL 1YAMA 3IJVA 3A91A 2ZQ4A 3N9EA 2MEEA 4LYOA 1IWVA 1D0MA 3QY4A 4GCDA 4R0FA 4WM6A 3N9AA 1HEMA 1J1XY 4MR1A 4II8A 4GCBA 1CNSA 3W6DA 5KJ9A 1WTNA 1GF6A 4ETAA 3WPLA 1LSEA 1H6MA 1VDPA 1LMCA 4G4CA 1OP9B 2GV0A 2LZTA 1DPWA 1HMLA 1JSFA 2RSCA 4HV1A 1VFBC 4DT3A 1IWWA 1RE2A 4DWXA 1HELA 4U3XB 3P64A 4LT2A 1FN5A 4NEBA 1GDXA 3B6LA 1WQRA 1LKRA 4I0CA 5LA5A 1B5XA 3LYOA 3P4ZA 3TXJA 1CJ6A 1LJKA 3CB7A 5HQ1A 4IATA 5KXZA 1YIKA 3WUAA 3WU7A 1GEVA 1LZEA 3WPKA 3OK0A 2NWDX 4HV2A 4HJVA 4H8ZA 207LA 2EQLA 1QQYA 4DD9A 3B72A 133LA 3A34A 2A7FA 2I26L 3CT5A 3LYTA 1LKSA 1OUIA 1HMKA 1REYA 4XN6A 5E4PA 1UC0A 4HPIA 5LA8A 3IJUA 3ZVQA 5LYMA 1LYSA 5KXMA 2YBIA 1LSBA 1GE0A 5F9UA 4NSJA 4WM4A 2FYCA 1EQEA 2CJLA 3D9AC 1J1PY 4PRQA 5L3HA 1LHMA 2HEBA 1HFZA 2HU1A 4GN3A 5IHGA 1JITA 1B7LA 1UACY 5KXTA 2XBSA 4LT0A 2C8PA 4WMGA 1WQNA 4OOTA 1LZTA 3WVXA 2ZYPA 1HF4A 2ZYCA 3LYMA 3EO5A 3ZEKA 3HBDA 1IOSA 5C6LA 5KXWA 2F2NA 2MEHA 1IWUA 1T3PA 2I6ZA 1GWDA 1LJ4A 1B7OA 4B0DA 3RU5A 3ZVQB 1HSWA 3RZ4A 1TDYA 4KT3A 3WW6A 1GF7A 1YL1X 2W1LA 3WULA 2G4PA 4ETEA 1GXV2 2ZIJA 2MEDA 5APEA 5A3ZA 1LAAA 4H92A 5KXLA 153LA 2MEIA 4DDCA 3FE0A 1LZ6A 1GPQC 4NGIA 4J7VA 1G7JC 2BQEA 1IX0A 4PGJB 4ZIXA 5L3IA 1FLWA 1GBSA 3RW8A 4B4IA 4G4BA 4NY5A 5LVKA 1NBZC 3G3AB 2HEAA 4OOOA 1YQVY 4BADA 1IR7A 4DD2A 1G7MC 1HERA 3W6CA 4GN4A 1JUGA 5DM9A 2DQAA 5FDJA 1BVXA 1WQPA 5LINA 1BHZA 2I25L 1IP4A 1LMTA 2BQCA 5DLAA 4RW1A 4NWEA 2W1XA 3EBAB 1LCNA 2LYMA 1TAYA 4ZEEA 1DI3A 1BVKC 1CKCA 1IC4Y 1GBXA 1UBZA 3AW6A 3D3DA 3E3DA 4N0JA 1JKBA 1B7RA 1GD6A 1GF4A 1NMMA 1VEDA 4WLXA 1GE4A 1JSEA 6LYTA 1FKQA 1CKFA 1DI5A 5ILFA 3WU9A 3EXDA 3J4GA 4RLMA 5KXXA 2HTXA 1GXXA 5LAFA 1YKYX 1GFAA 1P2CC 1CJ9A 5LVJA 1LMQA 3BKHA 1KIQC 1UA6Y 3TXKA 1BB3A 1HNLA 1JTOL 1XGUC 3LYZA 2IFFY 4MCKA 1LZ5A 1D6QA 1LSZA 1OUJA 1LSGA 2DQIY 3A67Y 1IP7A 4UWVA 1FDLY 4DD1A 4NHQA 132LA 4B49A 4LYZA 1OUCA 1LSFA 1IC5Y 1NDGC 1DZBX 4LGKA 1LZ8A 1LZYA 2PC2A 1G7IC 4CJ2A 1LHHA 3CSRA 4WL7A 4DD0A 1A2YC 1QSAA 2BLYA 1OUFA 4HJZA 1GF8A 1IY4A 3A93A 1IVMA 1OUGA 1IC7Y 1GB3A 1LJNA 1YROA 1FKVA 1ZMYL 2H5ZA 4NWHA 3WVYA 1UIGA 4IASA 3TXHA 1LPIA 2BQAA 1IIZA 1BGIA 4HJYA 1OQMA 4WL6A 1YAQA 1XEJA 1WQOA 2BQNA 4GCEA 3ULRA 4NHPA 4UWUA 1OUAA 1LOZA 3ATNA 1IWZA 1JTPL 2G4QA 1UCOA 2BQJA 4NHIA 5KY1A 1HHLA 3A3RX 1EQ5A 4N9RA 2X0AA 4NIJA 3WYHA 2MEAA 1JKAA 4GLVA 3EMSA 1XGPC 154LA 4OWCA 3A8ZA 2EIZC 1XGQC 1LZGA 3SP3A 1BWHA 4WOAA 2DKVA 5B1FA 1GF3A 1BB5A 3AGIA 1F6SA 4XJHA 1LSAA 1VDTA 4OWBA 3TXGA 1JKDA 1MLCE 1UIAA 5I4XA 5HMVA 3TMXA 3TXEA 4WO9A 1IR9A 4HTQA 1LSYA 2VB1A 3AYQA 3HBHA 4HTNA 2MECA 4WM1A 5APCA 3WXTA 8LYZA 4J1BA 4NFVA 1HC0A 1QUTA 1XEIA 5APDA 2ZNWY 5KXSA 1IP2A 3AZ5A 2BQHA 1KIRC 1REZA 5HMJA 1QDRA 1B2KA 1GFKA 2F4AA 5II3A 1B0DA 3T6UA 4CHXA 4EOFA 1QUSA 3A90A 4TTDA 1B5VA 1LYOA 2LYZA 5IDDA 3WW5A 1B5WA 1IWXA 1NDMC 3KAMA 5LAGA 3W6FA 5HLLA 4PHIA 2DQJY 4NHSA 1DKJA 1XEKA 5FEKA 1IY3A 4PPOA 4YEOA 1GB6A 5B07A 4H8YA 5KXOA 3N9CA 1JHLA 1GBWA 1ZV5L 1LMOA 1DI4A 1OUBA 3B0KA 1LMNA 1GE1A 1PZYA 2DQFC 3BKVA 1JJ3A 2ZQ3A 5JENB 1B7NA 1IP3A 1BB6A 1WQQA 3AZ6A 3P66A 1NKHA 193LA 4HSFA 4XJFA 2LYOA 4DD3A 4YENA 4CGEA 1FLUA 1FLYA 1LYZA 1IEEA 3W6AA 1QSWA 1JJ0A 4NGOA 4WM5A 3P65A 5LVIA 2FYDA 1HFYA 4DC4A 2F30A 1LZ4A 1GAZA 1DKKA 3G3BB 2BQBA 4DDAA 5C6IA 5L9JA 2Y8PA 4XYYA 3TMVA 4AXTA 3A6BY 1LHIA 1TBYA 3AGHA 1YILA 2Z18A 5LVGA 4B1AA 3AGGG 4LFPA 1CKGA 2MEBA 1XGRC 1V7TA 4H9BA 1JKCA 1G7HC 4KL7A 1F0WA 2A7DA 1DPXA 1B7MA 5FSTA 2DQDY 3WH1A 1F6RA 5I53A 2D4JA 4H90A 2HUBA 4LYBA 4N8ZA 1C46A 1ALCA 2DQEY 194LA 1FBIX 2CDSA 4I8SA 4LYCA 4W94A 5FHWA 4H93A 5B05A 4FJRA 2HECA 4O34A 3A6CY 1MELL 2ZNXY 3WUNA 4WO6A 2BQGA 2XJWA 4WM2A 1GB7A 1HEQA 1PS5A 1LJHA 1ZVYB 2YBNA 4OWAA 4NG1A 4H9HA 1GF0A 3OJPA 1D9UA 2FBBA 1UIHA 1OUHA 4P2EA 2EKSC 4H9AA 1NBYC 4RW2A 4LZTA 5F9XA 1BB4A 2G4NA 1KIPC 1BQLY 3W6EA 4R6CA 4B4JA 1QDTA 1VATA 3AW7A 3W3EA 1NF5A 2BAAA 4PJ2C 4ZFPA 1C7PA 1SQ2L 1GDWA 1INUA 1KXWA 4H9FA 1JPOA 2XBRA 1YANA 5LYTA 4Z46A 4YF2A 1LZCA 4H9IA 1GFTA 5LXWA 1C10A 2H9KA 2Z2EA 2BQDA 4RLNA 1VAUA 4TUNA 1E8LA 1REMA 5J7CA 1VDQA 5APFA 4LYMA 2D91A 2IHLA 2Z2FA 1G7LC 1LJFA 1NWGA 1I1ZA 2N5ZA 1YL0X 1GFEA 4LT1A 1GF5A 4G49A 4GN5C 1LSMA 2HEFA 1B5ZA 1CJ8A 1H87A 1YAOA 2BQIA 1GFJA 1LZ9A 2BQFA 1HENA 4H9CA 2BQMA 4H94A 3QE8A 1LYYA 1EQ4A 1J1OY 4WG1A 4DDBA 5FCPA 1RCMA 1CKDA 2Z38A 5T3FA 4C3WA 5IELA 2Z37A 1UIBA 2FBDA 3TXFA 4QGZA 2Z12A 3CSZA 2DQCY 3CQLA 3WL2A 1KXXA 4TSBA 1WVUA 1HEPA 2Z39A 3RT5X 1GE2A 3ATOA 5DN5A 1W6ZA 1UIDA 1C08C 4L41A 1GB8A 1AKIA 5D5CA 1Z55A 4LYTA 4NSIA 3A3QA 2ZWBA 1B7SA 5KXYA 1VDSA 4NGKA 1V7SA 2XTHA 4NGZA 4HPEA 4W96A 3TXIA 3J6KA 1N4FA 1RI8B 1IWTA 4BAPA 5B59A 4BS7A 1HEOA 4GLAA 4J0LA 4CFOA 3A96A 3K3TA 1JTTL 3WU8A 2HU3A 4NGLA 2BQKA 1QTKA 2YBHA 4UWNA 2AUBA 1GF9A 3GXKA 5A3EA 4ETDA 4EMNA 1LZNA 1AT5A 1XGTC 2ZIKA 1GAYA 4NGWA 1BB7A 1B9OA 1YKZX 4LFXA 1GFHA 4QDNA 4QY9A 3WMKA 1C45A 1FLQA 1GE3A 1QTEA 1WTMA 1GFRA 3WXUA 4ET9A 5LVHA 1AM7A 1LHKA 4H8XA 3A95A 4TWSA 1CKHA 1LZAA 1TCYA 1LJGA 1OUEA 2YDGA 1QIOA 4G4HA 9LYZA 1AT6A 5HNCA 3A94A 1HSXA 2BQOA 1IP5A 4FDYA 3TXDA 1GB0A 1HFXA 1LJ3A 3HBEX 2D4IA 3P68A 3WUMA 3AJNA 4XJGA 5M1YA 1O23A 2YVBA 3LZTA 2LHMA 1LMPA 3LZ2A 4TSCA 1JWRA 2BPUA 3M18B 4M6DA 1SLYA 4WM3A 4KPMA 4XJBA 1GBZA 3LN2A 4YM8A 4XJIA 1LMAA 1D0LA 1GFVA 2HEDA 1BWIA 1CJ7A 1LHJA 4QEQA 5E9RA 5I4WA 1GBYA 5KXRA 1B5YA 4NGVA 5KXNA 4LT3A 1LJEA 1GB2A 1LZSA 4H91A 1W08A 3QNGA 2CGIA 3CT1A 1JIYA 4Z98A 3TMUA 1F10A 1HEWA 1OUDA 2C8OA 5DN4A 2LZ2A 5KXPA 4D9ZA 7LYZA 1LZ1A 2DQHY 3F6ZA 4HP0A 4B4EA 1IOTA 4ETCA 4NHTA 4ANRA 2W1MA 4X3BA 2BQLA 4N1EI 4J1AA 5I5QA 1GBOA 3VWOA 4OW1A 3HFMY 3M3UA 4WLTA 1XSFA 1TEWA 2F4GA 2YSSC 2ZILA 2D6BA 3TMWA 3CSQA 4TX7A 4H1PA 5DL9A 1AZFA 1RFPA 1I56A 4NGYA 1I20A 5EBHA 3CT0A 4HTKA 3WPJA 5F81A 1NQIA 3AB6A 4Z3MA 4RDSA 4NG8A 5HNLA 1WVVA 4YEMA 1UICA 3FI7A 1UIEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WQMA 1QT6A 2QARC 4NGJA 1L81A 2BLXA 2RAYX 3GUPA 1ZVHL 1CV1A 3GXRA 3TXBA 2HULA 2L78A 3B0OA 5LYZA 4NSGA 4GCCA 3AZ7A 3SB6A 253LA 2B6ZA 2OU8A 4XADA 1C43A 1L98A 1PQMA 4EKRA 1L69A 1LJIA 102LA 4ET8A 2W1YA 4MSTA 1LSCA 3HH6A 135LA 1C6BA 1C6DA 4E97A 2YBLA 1L75A 3GUJA 1B5UA 1ZWNA 1L74A 1IP6A 1L02A 231LA 4KXIA 1XFPL 151LA 3A91A 3N9EA 2MEEA 1L57A 4GCDA 1D0MA 4WM6A 4MR1A 4ETAA 1L47A 1QSQA 2GV0A 1DPWA 1JSFA 1VFBC 1RE2A 4DWXA 1HELA 3P64A 4NEBA 5LA5A 3CB7A 4IATA 1YIKA 3WU7A 225LA 2NWDX 3GUIA 207LA 2EQLA 3B72A 133LA 1L18A 3A34A 2A7FA 3LYTA 1K28A 3HWLA 4HPIA 3SB7A 1G0LA 5F9UA 1OV7A 2CJLA 3D9AC 4GN3A 1PQJA 159LA 1C63A 1L76A 3SBBC 1DYDA 3LYMA 3EO5A 3HBDA 5C6LA 5KXWA 4B0DA 1HSWA 3RZ4A 4W59A 2W1LA 4ETEA 5A3ZA 1LAAA 4H92A 4ARMA 183LA 4PGJB 2RB0X 4I7TA 1C64A 5LVKA 4NY5A 1QT8A 1L60A 4W52A 4DD2A 1G7MC 2DQAA 1BHZA 1LMTA 1XEPA 1ZYTA 2W1XA 3EBAB 1TAYA 4EJ4A 1IC4Y 1GBXA 1C6IA 3AW6A 1L39A 4WLXA 6LYTA 4ARMB 3WU9A 4RLMA 3F8VA 1CJ9A 5LVJA 1C6PA 1JTOL 2DQIY 2O4WA 4NHQA 4B49A 4LYZA 4WL7A 1A2YC 1QSAA 1OUFA 1IY4A 3LZMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5AMY A;  1WQM A;  1LZR A;  4A7D A;  6LYZ A;  4YOP A;  5C6J A;  1IR8 A;  2D4K A;  1LTM A;  1YKX X;  3MGW A;  4E3U A;  1LSP A;  4NGJ A;  1REX A;  4G9S A;  4C5F A;  1LZB A;  2BLX A;  4DYG A;  5ILC A;  5I54 A;  2Z19 A;  3B0I A;  1ZVH L;  1KXY A;  4NSH A;  2B5Z A;  1LZD A;  3GXR A;  1IOQ A;  4IJ4 A;  4Z41 A;  1UIF A;  1RJC B;  3IWR A;  3TXB A;  1IOC A;  3B0O A;  4PRU A;  4WLY A;  4XJD A;  4XEN A;  4AGA A;  1D0K A;  5LYZ A;  4M4O A;  208L A;  1IOR A;  1GB9 A;  1NHE A;  1T6V L;  1LHL A;  1DQJ C;  4NSG A;  4WG7 A;  1IWY A;  2CWI A;  2HEE A;  4GCC A;  4ML7 A;  4BAF A;  3A92 A;  3AZ7 A;  4H9E A;  5K7O A;  2WAR A;  4GCF A;  4XAD A;  3AZ4 A;  1LJJ A;  5F14 A;  1C43 A;  1GB5 A;  1IO5 A;  2Q0M X;  2YBM A;  2MEF A;  4N5R A;  4OWH A;  3LHM A;  2YBJ A;  5LIO A;  1JEF A;  1LJI A;  4DD7 A;  1IP1 A;  1A4V A;  4OWE A;  1LSN A;  3RNX A;  1GFG A;  4ET8 A;  2H9J A;  2W1Y A;  5F16 A;  4MST A;  5FEL A;  5I4Y A;  1LSC A;  1BWJ A;  3W6B A;  135L A;  3T36 A;  2MEG A;  5B06 A;  2YBL A;  1GEZ A;  5D5F A;  1B7Q A;  2EPE A; 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 1FLQ A;  1GE3 A;  1QTE A;  1WTM A;  1GFR A;  3WXU A;  4ET9 A;  5LVH A;  1AM7 A;  1LHK A;  4H8X A;  3A95 A;  4TWS A;  1CKH A;  1LZA A;  1TCY A;  1LJG A;  1OUE A;  2YDG A;  1QIO A;  4G4H A;  9LYZ A;  1AT6 A;  5HNC A;  3A94 A;  1HSX A;  2BQO A;  1IP5 A;  4FDY A;  3TXD A;  1GB0 A;  1HFX A;  1LJ3 A;  3HBE X;  2D4I A;  3P68 A;  3WUM A;  3AJN A;  4XJG A;  5M1Y A;  1O23 A;  2YVB A;  3LZT A;  2LHM A;  1LMP A;  3LZ2 A;  4TSC A;  1JWR A;  2BPU A;  3M18 B;  4M6D A;  1SLY A;  4WM3 A;  4KPM A;  4XJB A;  1GBZ A;  3LN2 A;  4YM8 A;  4XJI A;  1LMA A;  1D0L A;  1GFV A;  2HED A;  1BWI A;  1CJ7 A;  1LHJ A;  4QEQ A;  5E9R A;  5I4W A;  1GBY A;  5KXR A;  1B5Y A;  4NGV A;  5KXN A;  4LT3 A;  1LJE A;  1GB2 A;  1LZS A;  4H91 A;  1W08 A;  3QNG A;  2CGI A;  3CT1 A;  1JIY A;  4Z98 A;  3TMU A;  1F10 A;  1HEW A;  1OUD A;  2C8O A;  5DN4 A;  2LZ2 A;  5KXP A;  4D9Z A;  7LYZ A;  1LZ1 A;  2DQH Y;  3F6Z A;  4HP0 A;  4B4E A;  1IOT A;  4ETC A;  4NHT A;  4ANR A;  2W1M A;  4X3B A;  2BQL A;  4N1E I;  4J1A A;  5I5Q A;  1GBO A;  3VWO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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