1LZBA

Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Gallus gallus
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lzbA00
4Z41A 1REYA 3RZ4A 4CGEA 2DQFC 1YKXX 4NGZA 1F0WA 4NHSA 5LAFA 1PZYA 5APEA 3BKVA 4N9RA 1FN5A 2BQCA 1YAPA 4XN6A 4GCEA 1GB2A 4HTKA 1LMTA 4WM5A 4NGOA 4LFPA 4E3UA 1B7NA 1FLWA 1UIHA 154LA 1B7RA 4J1AA 2BAAA 1KIPC 4LYZA 3TMVA 3WXUA 4TUNA 5IELA 2HEAA 2XJWA 5LINA 4XJIA 4UWUA 1YKZX 2YBMA 2F4AA 4WO6A 1LSPA 1HEMA 1XSFA 3G3BB 1HMLA 1WVVA 2LZ2A 133LA 3AJNA 1IP3A 4RW2A 3W6CA 3WPLA 4CFOA 4NWHA 3CQLA 1LMPA 4J1BA 4Z46A 4H9FA 5LA8A 3IWRA 5KY1A 4H9EA 4H1PA 1CNSA 1LHKA 1NDGC 4ZEEA 3AZ4A 4I8SA 4OOTA 1WQMA 4XJDA 1INUA 2G4QA 3J6KA 3LZ2A 2DKVA 1WQQA 5FHWA 4YEOA 1JISA 3A90A 3WU8A 4A7DA 2BLXA 1B7LA 1T3PA 3AB6A 1OUEA 5KJ9A 5KKIA 207LA 2HEDA 1IO5A 3GXKA 4MR1A 2HEEA 4WLDA 4B4IA 1JHLA 3TMXA 5M1YA 1QUTA 3SP3A 4N0JA 2HTXA 1OUFA 1XEKA 2AUBA 3A3RX 5T3FA 5I4WA 1UBZA 3A92A 1GBZA 1LSYA 1D6PA 3B72A 5IDDA 1F10A 1OUHA 1IR8A 1JTPL 4QDNA 1C7PA 1B7PA 3CSZA 1IC7Y 3TXHA 2ZQ4A 4DDAA 2DQIY 3A95A 3T36A 1F6SA 1LZ4A 2BQEA 5I4XA 3B6LA 4HJVA 3WVXA 2ZYPA 1UIBA 3OK0A 5LVKA 3IJUA 2Q0MX 1LJNA 4NGYA 2GV0A 1DI3A 1LSBA 4XENA 3WULA 5B05A 1LSCA 4WMGA 1GE1A 2HU1A 1W6ZA 3J4GA 1KXYA 3MGWA 4NEBA 3TXEA 4GN4A 1QTEA 3W6FA 1GEVA 3CB7A 1CJ7A 4GLVA 3AGGG 1LZTA 1LJHA 1LHLA 4G4CA 2W1MA 3WU9A 1KIRC 1NF5A 1GE0A 4UWNA 3LHMA 1IWZA 5E4PA 4IJ4A 1LMCA 3HBDA 5LAGA 3WW6A 4C5FA 5E9RA 4XJHA 4BAPA 1LSAA 2BLYA 4KXIA 5LVGA 4D9ZA 5K7OA 4FDYA 1UICA 1DI5A 1XGRC 2D6BA 4WM4A 5DM9A 4BADA 1FKQA 4DDBA 1DKJA 2LYOA 1JKDA 1IP2A 1HEPA 2CWIA 4GN3A 1KXWA 1OUBA 2F4GA 1YL0X 4P2EA 1OUCA 4N1EI 5I5QA 1GFVA 1BB7A 3RT5X 1OUGA 2C8PA 2DQDY 2IFFY 5KXNA 1G7HC 1XFPL 1J1PY 1G7JC 1W08A 1YL1X 1LZ6A 1HENA 3WUMA 5KXOA 1BVXA 3HBHA 4H8YA 4Z98A 5F14A 1GB7A 2BQOA 1LJFA 1QSWA 4PRUA 1LYOA 2H9JA 2BQDA 3A94A 1IWWA 1WQPA 5APCA 1DI4A 1GB8A 1TEWA 5A3ZA 3WUAA 4QY9A 1UA6Y 4BS7A 1XGPC 4NSIA 5APDA 4LYOA 4FJRA 4H94A 1UC0A 2WARA 5FDJA 1NKHA 1C45A 3WPKA 1JTOL 3LYZA 3A6CY 1VFBC 6LYZA 4OWCA 1NDMC 4DYGA 1DQJC 1B7OA 1JKCA 4DWXA 1ALCA 4G49A 1GEZA 1GHLA 1B5UA 1QDTA 4DC4A 1BQLY 1TBYA 1YROA 1LZ8A 1GAYA 2Z38A 2MEGA 4G9SA 4LYCA 4PGJB 5KXKA 3EBAB 1J1OY 3P64A 3P68A 1CJ6A 1RI8B 1YAMA 1IP1A 4IATA 1LMOA 1NBYC 1WTMA 1GWDA 5FSTA 2MEHA 4OW1A 5KKJA 1GBSA 1GPQC 5D5CA 4GCDA 4HTNA 3TXBA 1D6QA 1GB9A 1LSFA 1AT6A 2DQCY 1LHJA 1IP5A 4NGJA 3LYMA 4DD1A 1QIOA 5DLAA 1LJ4A 1LYZA 1OUJA 2FYCA 2ZIKA 3EMSA 1GFTA 4HTQA 1LYSA 4LZTA 1LZ9A 1OUDA 1DZBX 5HLLA 4J7VA 4GLAA 2XTHA 1HEOA 1JTTL 4DD7A 3CT5A 5DL9A 3TMUA 4ET8A 1VDTA 1IR9A 3TMWA 5EBHA 4ML7A 2HUBA 5C6LA 4HV1A 1REZA 2YBIA 4QGZA 4X3BA 4H9CA 3BKHA 1LZEA 1V7SA 3N9CA 1DKKA 1LSDA 1GF7A 1RJCB 5ILFA 1QDRA 1VDQA 1AKIA 5LYZA 1OQMA 2YBNA 1FBIX 1N4FA 2HECA 3AZ7A 2CJLA 1LZGA 2BQFA 1G7IC 2NWDX 1ZMYL 3WU7A 4LFXA 1IP6A 1WTNA 4OWBA 5LYTA 3N9AA 2BQJA 2Z2EA 1GB3A 5F81A 3A91A 5KXPA 3WW5A 2H9KA 4ETCA 1JJ0A 1GBOA 4H9HA 1MLCE 1BHZA 1YANA 1E8LA 3ZEKA 4TSCA 4R6CA 1BB3A 2F30A 5J7CA 1LZBA 4GCCA 1GBWA 1AZFA 193LA 1GDWA 1V7TA 1RE2A 1TCYA 3N9EA 4NGKA 4WM3A 5F9XA 3ULRA 1GE4A 1BGIA 4KPMA 2DQHY 3TXGA 1VEDA 1IR7A 194LA 1VATA 4XJBA 3D3DA 3LZTA 1IOSA 3B0IA 4NSJA 2MEFA 4J0LA 2ZILA 1D0LA 1LJIA 1LZRA 1NWGA 4NHIA 3RW8A 5B1FA 4DD9A 1LYYA 1EL1A 1LZNA 2W1LA 2Z18A 1IVMA 3TXFA 2RSCA 3GXRA 2EKSC 5L3IA 4NGVA 4NHTA 2DQJY 1T6VL 4WO9A 5JENB 3OJPA 2DQGY 1IWVA 1GFJA 1HNLA 1GF9A 1QUSA 2EQLA 2N5ZA 1OUIA 2CDSA 4G4HA 4LT2A 3QNGA 2XBSA 2Z37A 5B59A 5F16A 4LGKA 1A2YC 1FKVA 2G4PA 4XJGA 1SQ2L 3RU5A 4HV2A 1H6MA 4O34A 4NGLA 4NWEA 3TXIA 1LHHA 4TX7A 3AZ5A 5B06A 1JSFA 1GFHA 1UCOA 2HU3A 4HSFA 4CJ2A 1LZDA 1YAQA 3RNXA 1YQVY 2BQIA 5HNLA 3P66A 1FLYA 3TXKA 1TDYA 2YBJA 1SLYA 4ETAA 5I54A 4NY5A 4PJ2C 5I4YA 2ZYCA 1HSWA 3F6ZA 1GDXA 2LZTA 4WG7A 1HEWA 1YILA 2W1YA 5DN5A 3B0OA 1HEQA 1B5YA 1IX0A 3KAMA 3TXJA 4B0DA 2XBRA 4H8XA 3A67Y 1XEJA 1CJ8A 5HMVA 1BB5A 2BQAA 2PC2A 1D0MA 4DD3A 2W1XA 4L41A 1JUGA 2BPUA 1OP9B 4NHPA 3WH1A 4ZFPA 132LA 1HF4A 2D4JA 7LYZA 4TSBA 4HJYA 1GB0A 1A4VA 1CKCA 1EQEA 1J1XY 5LA5A 1MELL 1RFPA 1GB5A 3ZVQA 1XGQC 4RDSA 5L9JA 1LJ3A 1CKGA 1CJ9A 1G7MC 2BQGA 4XADA 5ILCA 1REMA 1D9UA 2BQHA 3HBEX 4NG1A 1LHIA 4YOPA 4CFPA 5LYMA 1GAZA 1RCMA 1ZV5L 1NHEA 1AM7A 1IWYA 1LZSA 4OWHA 1GE3A 1JPOA 2DBTA 1P2CC 3AYQA 1HERA 1IWTA 4W94A 4WG1A 1LCNA 1GFAA 1LTMA 4HPEA 2MECA 4U3XB 4WM6A 5HMJA 2MEBA 4NGWA 2YVBA 2HEFA 1D0KA 3T6UA 1BB4A 1LSNA 1IP4A 4H9BA 1GFUA 1IOTA 1GF0A 4GN5C 1IOCA 4MCKA 4I0CA 3QE8A 4II8A 1C08C 2Y8PA 3ATOA 4MSTA 4YM8A 1EQ4A 8LYZA 3G3AB 1DXJA 6LYTA 2ZIJA 3W6DA 1GE2A 1HC0A 4N5RA 1LZ5A 1GFEA 1JJ1A 1YAOA 3P65A 4LYMA 1ZVHL 4WL7A 1GFGA 4YEMA 3CSRA 1UUZC 1B7MA 4OWAA 1XGUC 1JKBA 4H9IA 5KXSA 2YBLA 1BB6A 3LYTA 3W6EA 1FDLY 3A93A 2MEDA 5F9UA 5LVHA 5KXLA 4YENA 2X0AA 1C43A 4LYBA 4H90A 4DD2A 3W6AA 4LT3A 1UIGA 4H92A 4LYTA 5AMYA 1B9OA 1HFZA 1WVUA 2C8OA 2I25L 1IWXA 2YDGA 4TWSA 5APFA 5KXZA 4ETBA 1B0DA 1TAYA 1IY3A 208LA 5L3HA 1LSEA 3CT0A 5FEKA 4DDCA 2BQKA 1YKYX 4LT0A 3QY4A 5C6JA 2HEBA 3AW6A 4B1AA 1DPXA 4OOOA 2G4NA 4M4OA 1PS5A 4B49A 4ETEA 1CKFA 2MEAA 134LA 1GFKA 1FLQA 2D4IA 2DQEY 2YSSC 2EIZC 4PRQA 1GBYA 1GF4A 5C6IA 4B4EA 4OWEA 3M3UA 4EOFA 1LKRA 1ZVYB 3TXDA 1KXXA 1HFXA 3AW7A 2Z2FA 3E3DA 1HSXA 4DD0A 2ZNWY 3B0KA 2I6ZA 1QQYA 4NHQA 2MEIA 2B5ZA 4H8ZA 1JKAA 5DN4A 1CKDA 1LJEA 3AGIA 1VDSA 4G4BA 3D9AC 1IOQA 1DPWA 2CGIA 1UACY 3K3TA 1C46A 3A3QA 4H9AA 1HFYA 4KL7A 5B1GA 1IP7A 5LVJA 3IJVA 3A34A 1GXV2 1B7SA 5FCPA 2BQMA 4B4JA 2F2NA 2YBHA 2ZQ3A 1O23A 1LHMA 1XGTC 1GD6A 2IHLA 1JEFA 3A96A 1UIEA 1OUAA 4NFVA 1B5ZA 4HPIA 5HQ1A 153LA 1LSMA 3AZ6A 3CT1A 1GF6A 1LMNA 4RW1A 2MEEA 1FLUA 5I53A 2A7DA 3A6BY 1WQOA 3ATNA 3A8ZA 2LHMA 3FI7A 4WLXA 3VWOA 1I20A 1BVKC 4NG8A 1LAAA 5D5FA 1NQIA 4TTDA 4GCFA 1I1ZA 2D91A 2FBBA 1IORA 4R0FA 5II3A 1LZYA 1F6RA 1LJKA 4WOAA 1IY4A 1G7LC 1LSZA 2H5ZA 3AGHA 4KT3A 4YF2A 1I56A 1B5XA 1C10A 2A7FA 2BQLA 4Z3MA 1JITA 1QSAA 2Z19A 1HELA 1GXXA 4ET9A 1IC4Y 4PPOA 4XJFA 5LXWA 1LSGA 1LJGA 1LJJA 4HP0A 1UIDA 4C3WA 5KXWA 1BWJA 1VAUA 4LT1A 4NSGA 4WL6A 4WLYA 5KXYA 3WPJA 1JJ3A 4QEQA 4WM1A 1LPIA 9LYZA 1BWIA 2ZWBA 1KIQC 2Z39A 4N8ZA 1REXA 1VDPA 4NSHA 4IASA 4DT3A 1GF5A 3HFMY 4PHIA 4ZIXA 1NBZC 5KXTA 1QTKA 4NGIA 1WQNA 2LYZA 1GF3A 2BQBA 2DQAA 4XYYA 1B7QA 1XEIA 2I26L 1YIKA 3EXDA 1LMQA 2BQNA 3FE0A 3P4ZA 4AXTA 1UIFA 1UIAA 4ANRA 4M6DA 1HMKA 4H93A 4UWVA 1AT5A 5HNCA 3LN2A 4HJZA 1IIZA 4NIJA 4W96A 4WLTA 1LOZA 1JIYA 2LYMA 3WYHA 1CKHA 1EQ5A 2ZNXY 4H91A 2FBDA 3WMKA 1NMMA 3WXTA 1HHLA 2FYDA 4WM2A 1IEEA 1Z55A 2D4KA 1LKSA 3EO5A 1LMAA 5B07A 1GBXA 4BAFA 1GFRA 4ETDA 1IC5Y 3W6BA 1GF8A 4AGAA 2EPEA 3M18B 1WQRA 2VB1A 5LVIA 1LZAA 4RLNA 3WVYA 5KXMA 3LYOA 2Z12A 1B5VA 3WUNA 1B5WA 3WL2A 1BWHA 5IHGA 4CHXA 1IWUA 1B2KA 1H87A 1JWRA 5A3EA 3CSQA 1LZ1A 4N1CC 4RLMA 1LZCA 5FELA 4GCBA 135LA 3W3EA 3ZVQB 5LIOA 5KXXA 1GB6A 5KXRA 4EMNA 1JSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Z41A 3RZ4A 1C6AA 2DQFC 4NGZA 5APEA 1L22A 3BKVA 3HWLA 1L67A 4GCEA 4NGOA 1B7RA 2F2QA 5LINA 1G1VA 1YKZX 3RUNA 1C6KA 1HMLA 1WVVA 2LZ2A 1L94A 3WPLA 1L17A 4Z46A 4H9FA 2RBOA 5I14A 5KY1A 1P37A 1CNSA 1T8FA 1INUA 3J6KA 2DKVA 1JISA 4A7DA 1B7LA 1OUEA 5KKIA 1QS9A 3GXKA 1OYUA 3TMXA 1OUFA 1XEKA 5I4WA 1UBZA 3A92A 1CU6A 1GBZA 1JTPL 1C7PA 1B7PA 2B6ZA 4DDAA 1L10A 1QT6A 2BQEA 4PJZA 3OK0A 1QS5A 1PQKA 146LA 3WULA 3SBBC 1KXYA 4NEBA 4GN4A 1QTEA 3CB7A 199LA 1CJ7A 1LJHA 1LHLA 4G4CA 3WU9A 3EMLA 1NF5A 5LAGA 3VW7A 3WW6A 249LA 1LSAA 1XGRC 5DM9A 2D6BA 1L21A 162LA 1IP2A 4GN3A 1L40A 1OUCA 5I5QA 1GFVA 4I7QA 251LA 2C8PA 3RZEA 1LZ6A 1HENA 2OU9A 1IWWA 1GB8A 4QY9A 1UA6Y 4BS7A 4LYOA 4I7MA 1C45A 1L74A 118LA 1JTOL 3HH3A 1VFBC 1NDMC 1DQJC 4DWXA 1ALCA 4I7SA 1B5UA 4DC4A 1LZ8A 2Z38A 4G9SA 4LYCA 3EBAB 3P64A 3P68A 1TLAA 1L30A 4IATA 2MEHA 5KKJA 5D5CA 1L69A 4HTNA 3TXBA 1GB9A 2DQCY 2ANXA 1LHJA 1QIOA 228LA 3EMSA 4LZTA 1LZ9A 1KS3A 1HEOA 1JTTL 3CT5A 5DL9A 234LA 4ML7A 1L38A 3GUOA 2YBIA 1CU5A 1V7SA 5ILFA 5LYZA 1L86A 1N4FA 1C64A 1G06A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4Z41 A;  1REY A;  3RZ4 A;  4CGE A;  2DQF C;  1YKX X;  4NGZ A;  1F0W A;  4NHS A;  5LAF A;  1PZY A;  5APE A;  3BKV A;  4N9R A;  1FN5 A;  2BQC A;  1YAP A;  4XN6 A;  4GCE A;  1GB2 A;  4HTK A;  1LMT A;  4WM5 A;  4NGO A;  4LFP A;  4E3U A;  1B7N A;  1FLW A;  1UIH A;  154L A;  1B7R A;  4J1A A;  2BAA A;  1KIP C;  4LYZ A;  3TMV A;  3WXU A;  4TUN A;  5IEL A;  2HEA A;  2XJW A;  5LIN A;  4XJI A;  4UWU A;  1YKZ X;  2YBM A;  2F4A A;  4WO6 A;  1LSP A;  1HEM A;  1XSF A;  3G3B B;  1HML A;  1WVV A;  2LZ2 A;  133L A;  3AJN A;  1IP3 A;  4RW2 A;  3W6C A;  3WPL A;  4CFO A;  4NWH A;  3CQL A;  1LMP A;  4J1B A;  4Z46 A;  4H9F A;  5LA8 A;  3IWR A;  5KY1 A;  4H9E A;  4H1P A;  1CNS A;  1LHK A;  1NDG C;  4ZEE A;  3AZ4 A;  4I8S A;  4OOT A;  1WQM A;  4XJD A;  1INU A;  2G4Q A;  3J6K A;  3LZ2 A;  2DKV A;  1WQQ A;  5FHW A;  4YEO A;  1JIS A;  3A90 A;  3WU8 A;  4A7D A;  2BLX A;  1B7L A;  1T3P A;  3AB6 A;  1OUE A;  5KJ9 A;  5KKI A;  207L A;  2HED A;  1IO5 A;  3GXK A;  4MR1 A;  2HEE A;  4WLD A;  4B4I A;  1JHL A;  3TMX A;  5M1Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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