1LZBA

Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Gallus gallus
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lzbA00
2FYDA 1J1OY 2XBRA 1LHMA 4C5FA 1LSMA 2C8OA 1RCMA 1F6SA 1HEPA 5HLLA 4WL6A 4YEOA 4B4JA 1IC5Y 5DM9A 4M4OA 4E3UA 4NSIA 2ZYCA 3A8ZA 3WMKA 3WYHA 1GF9A 2VB1A 3CQLA 3WPKA 1IP1A 2ZNXY 2I6ZA 4XJBA 4O34A 193LA 4PGJB 1NDGC 5B1GA 1LJ4A 2W1XA 1WVVA 1B0DA 1B5VA 1AKIA 2ZYPA 3WU8A 4YEMA 1YIKA 5ILFA 4G4HA 3TXEA 4LZTA 5FELA 1CKFA 1D0LA 2HEDA 3WPLA 4OWAA 1LJKA 1CKGA 2BQMA 4NHTA 4C3WA 2DBTA 1JWRA 135LA 4CJ2A 1GF0A 1DKJA 1LJGA 1HMKA 3LZ2A 1E8LA 2Z19A 4KPMA 1NQIA 1REZA 5KKJA 4IASA 5LA5A 2BQHA 4OWCA 3CB7A 4ETDA 1C45A 5LVKA 3FI7A 4HPIA 1BGIA 3EO5A 1OUGA 1OQMA 1GFKA 1JJ1A 1HERA 4NGIA 1NKHA 5F16A 3TXIA 4EMNA 4GCEA 1WQQA 1INUA 3F6ZA 1WTNA 1A2YC 2BAAA 5FSTA 4P2EA 1N4FA 1GBYA 3LYMA 4HJZA 1LHKA 1VDTA 1I1ZA 4QY9A 1DXJA 4RW1A 1TCYA 1LSPA 1HF4A 4B4IA 4H8XA 1GBOA 1GEVA 5I4WA 1HEOA 2MEAA 2BQNA 5DN5A 1HC0A 4XYYA 3A95A 4WM1A 4ZEEA 1LZTA 5J7CA 1VFBC 1BB6A 4NWHA 1OUAA 4X3BA 2YBMA 1G7LC 4PJ2C 2BPUA 5IHGA 4CHXA 9LYZA 5HNLA 2ZIKA 1B7SA 1P2CC 1Z55A 1LKRA 1GE0A 4NGOA 1GBXA 4CFOA 3M3UA 1C46A 1LSFA 4MSTA 1GFJA 4R6CA 4BAPA 4WLYA 1LZ4A 2G4NA 5KXNA 1LSGA 2YSSC 4GCCA 4LYZA 2X0AA 4B1AA 1GF3A 4Z98A 2MECA 4H92A 3IJUA 1ALCA 2Z2EA 2BLXA 3IJVA 2Z12A 4H9FA 4NHPA 3TXGA 4ETCA 1F0WA 3FE0A 3BKHA 1XFPL 3HBDA 5F9UA 5AMYA 4B49A 4LT3A 1GB0A 1GFHA 4NSHA 4BADA 1LZ1A 2BQDA 4TX7A 2MEDA 4L41A 4NWEA 5KXPA 4IJ4A 3W6CA 3E3DA 1W08A 1WQOA 1IP2A 2D6BA 1GF8A 2H5ZA 3GXRA 1NBZC 1YANA 2HUBA 1LMPA 1FDLY 1GF6A 1G7IC 5L3HA 1GAZA 1OUHA 3VWOA 5LVJA 2Z18A 1C08C 3M18B 2BQGA 4WOAA 5EBHA 1GE4A 1PS5A 1SLYA 3B0OA 1LJIA 4ZFPA 1WQPA 2MEFA 1GF7A 1ZVHL 4WM4A 3RNXA 2WARA 1JIYA 5I4YA 1IWYA 4CFPA 1REMA 4LFXA 3RW8A 4DD1A 1JPOA 4WM5A 2DQEY 1GFRA 2CWIA 4OW1A 1LMAA 2DQCY 4KT3A 5APCA 5KY1A 1D6PA 1LSYA 1LZYA 4NIJA 4NG1A 1LZAA 3CT0A 4WG1A 3TXFA 1WVUA 1GB5A 4GCFA 1CKHA 2W1MA 3WPJA 4ET9A 3AW6A 1LSDA 1REYA 4WO9A 2G4QA 2NWDX 4NHQA 5I5QA 3WW6A 3ZVQB 4XADA 1UIBA 1XGTC 1YAQA 3WU7A 1XEKA 1FN5A 1NMMA 4RLMA 1JSEA 4GCBA 1EQEA 3LN2A 5F14A 5E9RA 2YBHA 1IR9A 1RFPA 2Z37A 3G3BB 4H8YA 4HTQA 3WUAA 5KXXA 4LFPA 3A91A 5B05A 1LZ8A 1EQ5A 1IP6A 1IORA 1GFGA 4W94A 1B7PA 2BQCA 5A3EA 5JENB 1DQJC 4WLTA 4NGJA 1UA6Y 3WXTA 4GN3A 1CKDA 4H8ZA 5KXRA 3WXUA 1LJ3A 1LMNA 1WQRA 4A7DA 1IOSA 1AT5A 1LJFA 3A34A 3A93A 3B6LA 1YAPA 5B07A 2ZIJA 1BHZA 2EQLA 2MEGA 1XEIA 3N9AA 1YL0X 1UIGA 5KKIA 5KXOA 1HSWA 4N9RA 5B59A 1OUEA 1RI8B 1LSBA 2DQGY 2H9JA 1QDTA 4QGZA 1OUDA 1JJ0A 4YENA 1B7OA 4OOOA 4AGAA 1IC7Y 4WL7A 5C6LA 4XJGA 5M1YA 1IVMA 1GB2A 4DD9A 1GB6A 1H6MA 4LGKA 1LTMA 3CSZA 1H87A 1OUJA 1LJJA 2BQIA 3W6AA 1FKQA 2Z39A 4WM6A 1HFYA 1LZRA 1CJ7A 1QQYA 2B5ZA 1CJ9A 3CSRA 4G4BA 1LZ6A 1ZV5L 1BWIA 4N5RA 2YBJA 1IWUA 1XGRC 3HBEX 1UUZC 2BQLA 1GXXA 3OJPA 1C10A 1BVKC 1HEQA 1NDMC 1BWJA 2F4AA 4H91A 4H9EA 3A92A 4PHIA 1LMQA 1VDPA 4H9IA 5KXZA 1NWGA 1IP7A 208LA 5C6IA 2MEBA 3J4GA 4FJRA 5II3A 2YBLA 4DD3A 1KIPC 2N5ZA 1QSAA 4BS7A 4TUNA 4YOPA 2HU1A 3AW7A 1XEJA 4J1BA 4XJHA 4UWVA 1B7MA 1GF5A 1LMCA 1JKBA 5D5FA 4RW2A 207LA 4WO6A 1QSWA 2CGIA 3AZ6A 4HJVA 1B9OA 1CNSA 1DI5A 5APDA 1GE1A 1UC0A 1IWZA 2BQJA 1LSEA 2XTHA 4H90A 4HPEA 1LYZA 2HEFA 1D9UA 4XN6A 4YM8A 5KXWA 1GFVA 4UWUA 5DL9A 4RLNA 1GXV2 4GLVA 1GAYA 4LT1A 1IOQA 1LYOA 1HHLA 1BQLY 2YVBA 1OUFA 4N1CC 1OUIA 2EPEA 4RDSA 5IDDA 1LSCA 4XJIA 4OWEA 5I54A 5FCPA 2Q0MX 1YILA 1BB5A 1GB3A 1GFUA 1LSNA 2AUBA 2BQFA 2IFFY 4H1PA 3WH1A 4DD2A 5KXKA 2A7DA 1JUGA 1LPIA 5HNCA 1IP4A 2DQHY 1BWHA 1I56A 1GE3A 4ETBA 2HTXA 3OK0A 1YKZX 2BQKA 1UIHA 4H9HA 1HENA 5APFA 4PRUA 5F9XA 3B72A 1YAOA 3A94A 1YKYX 2H9KA 1XGUC 2YBNA 1JEFA 1QTKA 1B2KA 3T36A 2XJWA 1I20A 1GFEA 4HSFA 2RSCA 4YF2A 1LMOA 4G49A 4OWHA 1UBZA 3LHMA 2BQAA 1QTEA 2D4IA 1J1XY 1PZYA 2DQJY 2HEEA 5APEA 2EKSC 1JJ3A 5LYZA 3WVYA 2LYMA 2DKVA 3W3EA 5A3ZA 4U3XB 4II8A 1AT6A 1JISA 1LOZA 5FDJA 1VDSA 1IY4A 1GB7A 3LZTA 1FLYA 1G7JC 1OP9B 2W1LA 1LSZA 3P4ZA 3AZ4A 3EMSA 4WLXA 4W96A 2LYOA 4GLAA 2HEAA 3TMWA 3W6EA 3WULA 4AXTA 2XBSA 4WM2A 1IP3A 3KAMA 1O23A 5KXLA 2GV0A 1J1PY 1IP5A 2MEIA 1LYYA 4NGVA 3TXBA 1JKAA 3IWRA 4DT3A 1DPXA 1V7SA 3B0IA 3ZEKA 2FBBA 1JITA 1GB8A 2I26L 1LZNA 1QUSA 3QE8A 1LJNA 4LT0A 3AZ5A 1HNLA 4ETAA 3LYOA 1DPWA 1GBZA 3TXJA 3EBAB 2Y8PA 1AM7A 4NGYA 8LYZA 134LA 7LYZA 1UICA 4D9ZA 1DI4A 3TMVA 1FLWA 4GN5C 5KJ9A 2YBIA 3AGHA 4Z3MA 5LINA 4NGZA 1C7PA 1ZMYL 2G4PA 1YKXX 1DI3A 1CJ8A 4GN4A 2LYZA 5FEKA 5B06A 5LYMA 1VATA 3A90A 4TSCA 3G3AB 1HEWA 1HSXA 3TMUA 3W6BA 5LVHA 4LYMA 1RJCB 2ZQ4A 1D0KA 4DYGA 4ZIXA 1LZCA 2HECA 3A6BY 1IWTA 2A7FA 3W6FA 1KIQC 4I8SA 3RZ4A 1DKKA 2EIZC 2BLYA 1GD6A 1JKDA 1YL1X 3P66A 4G4CA 4G9SA 194LA 4NGWA 1BVXA 1GFTA 5I4XA 1XGQC 1LZEA 4HTKA 4LYTA 1BB4A 1VDQA 5LIOA 3TMXA 1IEEA 1JHLA 4DWXA 1OUCA 6LYTA 1LAAA 4HV1A 4I0CA 1HFXA 1LZSA 2F4GA 1LHIA 4NHIA 5LYTA 3ULRA 1B7LA 1JTTL 4HP0A 3BKVA 4NG8A 2ZWBA 1LSAA 1LZBA 1GDWA 3ATNA 4NY5A 4OWBA 5K7OA 3EXDA 1SQ2L 3A6CY 4FDYA 5LAGA 1YAMA 1UACY 2F30A 1OUBA 3QY4A 1V7TA 4WLDA 3LYZA 4CGEA 1TBYA 2LZTA 1GEZA 4EOFA 1UIEA 2DQAA 2ZQ3A 4ET8A 1IY3A 3K3TA 1IIZA 3AGGG 1FBIX 2MEHA 3SP3A 1RE2A 3AYQA 3A3QA 1IOTA 2LZ2A 3A3RX 1LZ9A 4Z41A 4LYOA 5HQ1A 1QIOA 1A4VA 4NGKA 1WQMA 4TWSA 3ZVQA 4DDAA 1IOCA 4J0LA 2MEEA 3N9CA 2BQEA 1NF5A 4ANRA 4XENA 5KXMA 153LA 3A96A 1TDYA 5C6JA 4H9AA 1CJ6A 3W6DA 4QEQA 3TXDA 4HJYA 1C43A 1LZGA 2DQDY 4MR1A 1LCNA 2DQIY 1KXWA 4KL7A 4B0DA 1KIRC 3ATOA 5FHWA 2D91A 3CT1A 2ZILA 4KXIA 1YROA 4DD7A 3WL2A 1JSFA 4NHSA 1IWVA 1NHEA 1F6RA 1UIFA 4WG7A 4XJDA 4HTNA 4DDBA 4UWNA 5D5CA 5IELA 1GWDA 1JTOL 1VEDA 3AGIA 4ML7A 4NSGA 2F2NA 4H9BA 2CDSA 2D4JA 3HFMY 1FLUA 4N1EI 4ETEA 1FLQA 1HELA 3P68A 1DZBX 4B4EA 4HV2A 4LYCA 5E4PA 1JKCA 4NGLA 4M6DA 5L9JA 2DQFC 3WUMA 3A67Y 2BQBA 5DLAA 5DN4A 3GXKA 4LYBA 3RU5A 2BQOA 2ZNWY 5LVIA 1LZDA 1UIAA 5T3FA 1AZFA 1LYSA 1LJEA 1IC4Y 1B7QA 2CJLA 4BAFA 5LVGA 5HMJA 3LYTA 4H9CA 1B5YA 2I25L 3AB6A 4WM3A 4DD0A 1GFAA 1LHJA 5LA8A 5KXTA 3MGWA 1BB7A 4Z46A 3D9AC 3B0KA 1JTPL 5KXSA 1T3PA 4TSBA 1D0MA 1KXYA 1MLCE 3TXHA 4PPOA 133LA 3N9EA 4R0FA 5L3IA 3RT5X 1QUTA 1YQVY 3WU9A 1IWXA 4J1AA 1GB9A 1IR7A 1GPQC 4OOTA 4TTDA 3WVXA 2HEBA 1B5WA 1EL1A 1IX0A 5KXYA 1IO5A 1HFZA 4NEBA 1HEMA 1KXXA 1LKSA 5HMVA 3CSQA 1IWWA 2D4KA 1B7RA 2PC2A 1GHLA 1WQNA 1B7NA 1LHHA 2W1YA 1LHLA 4GCDA 3WW5A 5ILCA 4N0JA 1GBWA 2C8PA 1UIDA 2Z2FA 3HBHA 3QNGA 1XSFA 2Z38A 1LJHA 132LA 1NBYC 1XGPC 4IATA 3P64A 1LMTA 4N8ZA 1MELL 5LAFA 1LZ5A 4J7VA 1B5UA 3D3DA 4NSJA 1CKCA 3P65A 4QDNA 4DDCA 1T6VL 4XJFA 1G7HC 3TXKA 1BB3A 4NFVA 5LXWA 1UCOA 4MCKA 1GBSA 1WTMA 1EQ4A 1TAYA 3AZ7A 2FYCA 2FBDA 2LHMA 154LA 5B1FA 1GE2A 5F81A 1F10A 1FKVA 1G7MC 1HMLA 1IR8A 1D6QA 1REXA 3AJNA 4H93A 1TEWA 1GF4A 2IHLA 4PRQA 1VAUA 2YDGA 4LT2A 1QDRA 4WMGA 3CT5A 6LYZA 1W6ZA 3J6KA 1GDXA 2HU3A 4H94A 3T6UA 4DC4A 3WUNA 5I53A 1B5XA 1ZVYB 1B5ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C5FA 2F32A 2C8OA 5HLLA 1F6SA 5DM9A 4M4OA 2VB1A 3CQLA 2I6ZA 1C65A 2ZYPA 4YEMA 5ILFA 1D3NA 4G4HA 3GUKA 1SX2A 3WPLA 4NHTA 2DBTA 1L92A 3LZ2A 1L91A 2Z19A 4KPMA 1JJ1A 4NGIA 2RB1X 4GCEA 1WQQA 3F6ZA 1WTNA 3HDEA 1A2YC 1C6BA 4P2EA 1N4FA 1LYDA 214LA 212LA 1L0KA 252LA 3DN4A 1TCYA 2BQNA 1HC0A 3A95A 2BPUA 1SSYA 4CHXA 5HNLA 1P2CC 4I7PA 1LKRA 1GBXA 3M3UA 4DQJA 3HTFA 4WLYA 2G4NA 3C8SA 5KXNA 249LA 4B1AA 4Z98A 3JR6A 4H92A 233LA 2BLXA 4NHPA 1F0WA 3RUNA 5F9UA 5AMYA 131LA 1GFHA 4NSHA 4TX7A 3W6CA 2QB0B 1IP2A 256LA 1NBZC 1YANA 1LMPA 4EPIA 2OU0X 103LA 1P56A 5EBHA 4I7QA 1T6HA 4WM4A 158LA 1LYEA 3SBBC 4LFXA 3OE8A 1JPOA 1XJUA 1LMAA 4KT3A 4GCFA 118LA 111LA 4WO9A 3WW6A 2NWDX 1L26A 1L05A 3WU7A 1C6TA 4RLMA 4H8YA 1CU5A 3DNAA 5B05A 3C7YA 1IP6A 1CVKA 2BQCA 114LA 3WXTA 1LMNA 4A7DA 3A34A 1TLAA 1YL0X 5KKIA 5B59A 1C6MA 1RI8B 2DQGY 1QDTA 1OUDA 2OTYX 1JJ0A 160LA 2XQOA 5M1YA 4DD9A 4LGKA 1H87A 4WM6A 1QQYA 2B5ZA 1CJ9A 4G4BA 171LA 3OJPA 3HBEX 1XGRC 1HEQA 1LGXA 4H9EA 3GULA 1LMQA 1VDPA 2OU8A 3CDVA 1NWGA 5C6IA 3J4GA 4BS7A 4YOPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2FYD A;  1J1O Y;  2XBR A;  1LHM A;  4C5F A;  1LSM A;  2C8O A;  1RCM A;  1F6S A;  1HEP A;  5HLL A;  4WL6 A;  4YEO A;  4B4J A;  1IC5 Y;  5DM9 A;  4M4O A;  4E3U A;  4NSI A;  2ZYC A;  3A8Z A;  3WMK A;  3WYH A;  1GF9 A;  2VB1 A;  3CQL A;  3WPK A;  1IP1 A;  2ZNX Y;  2I6Z A;  4XJB A;  4O34 A;  193L A;  4PGJ B;  1NDG C;  5B1G A;  1LJ4 A;  2W1X A;  1WVV A;  1B0D A;  1B5V A;  1AKI A;  2ZYP A;  3WU8 A;  4YEM A;  1YIK A;  5ILF A;  4G4H A;  3TXE A;  4LZT A;  5FEL A;  1CKF A;  1D0L A;  2HED A;  3WPL A;  4OWA A;  1LJK A;  1CKG A;  2BQM A;  4NHT A;  4C3W A;  2DBT A;  1JWR A;  135L A;  4CJ2 A;  1GF0 A;  1DKJ A;  1LJG A;  1HMK A;  3LZ2 A;  1E8L A;  2Z19 A;  4KPM A;  1NQI A;  1REZ A;  5KKJ A;  4IAS A;  5LA5 A;  2BQH A;  4OWC A;  3CB7 A;  4ETD A;  1C45 A;  5LVK A;  3FI7 A;  4HPI A;  1BGI A;  3EO5 A;  1OUG A;  1OQM A;  1GFK A;  1JJ1 A;  1HER A;  4NGI A;  1NKH A;  5F16 A;  3TXI A;  4EMN A;  4GCE A;  1WQQ A;  1INU A;  3F6Z A;  1WTN A;  1A2Y C;  2BAA A;  5FST A;  4P2E A;  1N4F A;  1GBY A;  3LYM A;  4HJZ A;  1LHK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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