1LZDA

Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRYWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Dissection of protein-carbohydrate interactions in mutant hen egg-white lysozyme complexes and their hydrolytic activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Gallus gallus
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lzdA00
3P66A 3A8ZA 3AGGG 4OW1A 2FBDA 1HFZA 5FDJA 1C45A 1UICA 3J4GA 4MCKA 1IWWA 1GEVA 1NQIA 4WM5A 5D5FA 5B1FA 2DQGY 4H9EA 4CGEA 1B7SA 1IWXA 2C8PA 5E4PA 1LJNA 5C6LA 3M18B 5ILCA 5HMVA 5LXWA 9LYZA 1LSAA 2DQDY 3WUNA 1FLUA 1RE2A 4ETEA 4ML7A 4OOOA 4LYOA 5E9RA 5FSTA 5II3A 2FYDA 2D4IA 1WQNA 1JKAA 1A4VA 2MEEA 2DQJY 4DDCA 1OUFA 1REZA 1QUSA 1D0KA 1CJ7A 2Z2FA 1HEQA 1LSDA 2GV0A 4HV2A 1IR9A 1QUTA 1YAOA 3GXKA 4KPMA 3RT5X 3TXJA 3QNGA 1DPXA 2HEAA 4FDYA 4CJ2A 1LZ8A 4IJ4A 5L3IA 5F16A 4XADA 1HSWA 1KIPC 5KXPA 4NSGA 4QEQA 2ZYPA 4LFPA 3TMUA 3A67Y 193LA 2ZILA 1IIZA 2NWDX 4EOFA 1XGQC 2FBBA 4B4JA 4H94A 3EXDA 2LYZA 1GBSA 1HMKA 3LN2A 1GFTA 4DD1A 1UACY 5L9JA 2HEDA 1KIQC 1TCYA 4NHPA 4X3BA 1IWYA 1LSFA 3TMWA 4J7VA 4LYBA 4NWHA 1Z55A 4TSCA 1P2CC 2YBMA 1EQEA 1GBYA 1YILA 1CJ9A 4GN4A 4NGJA 5KXZA 3QE8A 1WVUA 1XEJA 5C6JA 1TDYA 2YBNA 1LMPA 4TX7A 1ZVHL 3AW6A 1B2KA 1FLQA 2DQCY 3W6DA 3AJNA 2BAAA 5KXSA 3VWOA 3FI7A 5T3FA 4BADA 207LA 4TTDA 2D91A 5IELA 1F10A 4B4EA 1OUCA 4LGKA 1BWJA 3AGHA 3CSZA 1CKFA 6LYZA 4TWSA 1XGRC 1ZMYL 3LYTA 4H91A 1LOZA 1J1XY 1HEWA 1LYOA 3F6ZA 4TSBA 3EO5A 2MEAA 2XJWA 1VFBC 1OQMA 4WG7A 4HPEA 1FBIX 2LYOA 4W94A 3LZ2A 1HF4A 2BLYA 5LAGA 1JIYA 5C6IA 1LHJA 1QTEA 2BQIA 3M3UA 4GN3A 1GDXA 1AKIA 5DM9A 1J1PY 2N5ZA 2B5ZA 5J7CA 5F9UA 2DQHY 3HBHA 5LINA 1D6PA 5LYTA 5DN5A 4N8ZA 1B7MA 1IOSA 4NIJA 1OUEA 1IP1A 1GFUA 3HBDA 1QDRA 1B5VA 2HEEA 3HBEX 4NEBA 4NGLA 4UWNA 1RCMA 3N9EA 1GFKA 3TXIA 1NWGA 1GF0A 5L3HA 4ZFPA 3A6BY 5I4XA 3ATOA 3B72A 1VAUA 4G4HA 4WG1A 4H8XA 2BLXA 1BB4A 2DBTA 1KXXA 4YOPA 4LYZA 4RDSA 3TXBA 1GBWA 1LJFA 1NHEA 1UIBA 2D4KA 4LYMA 4XJIA 1JUGA 194LA 1LAAA 4GCCA 1VDTA 1AT6A 3FE0A 1HERA 2BQCA 4H8YA 1G7LC 4LFXA 4YEOA 2H5ZA 3WH1A 4YEMA 3TMVA 1LJKA 3IJUA 4I8SA 3TMXA 5I4YA 2YDGA 2IFFY 1JKDA 2DQIY 1JTPL 8LYZA 1BVKC 1LPIA 1TBYA 1LZAA 1NBYC 1JWRA 1B9OA 3W6CA 1DI3A 5FCPA 4II8A 1IC4Y 4HJZA 1B7LA 2G4NA 1IC5Y 3CQLA 4WM3A 3J6KA 4LT2A 4RLNA 5F9XA 1IX0A 1O23A 2MEHA 3A94A 1LZNA 5FELA 5B59A 1DI4A 4G9SA 4N1EI 3ULRA 1LKSA 1F6RA 1V7SA 4BS7A 3GXRA 4M4OA 3IJVA 1BB5A 4NWEA 5K7OA 4E3UA 4HPIA 3A93A 1H87A 2I6ZA 5F81A 4U3XB 4FJRA 1V7TA 2HU1A 1DXJA 1LZBA 1YANA 2W1MA 1HEOA 3A95A 1TAYA 1H6MA 2W1YA 1HEPA 2ZYCA 4DDAA 1HC0A 1B5XA 4PPOA 5HMJA 1KXWA 2Z2EA 4UWVA 4DD2A 4DYGA 2D4JA 2DQAA 4H9IA 2BQKA 1B5ZA 2Z37A 1AT5A 1UIDA 1IVMA 1LSMA 3AW7A 3HFMY 1VATA 1B0DA 1YKZX 3A3RX 1GB7A 2VB1A 2DKVA 3RNXA 2EIZC 3WU7A 5B1GA 1OP9B 1IY4A 1LZSA 2HECA 2ZIJA 4ETDA 1UBZA 2H9KA 4NGOA 6LYTA 4WLXA 4Z98A 4H9FA 4OWHA 1IP3A 3LYZA 1LSCA 1RI8B 5KXYA 4OOTA 1LMQA 1GFJA 1HFXA 1JITA 1GDWA 1UIFA 1WQRA 1YAQA 2A7DA 2MEDA 4GCFA 1YKXX 4XJDA 1W08A 1LJJA 5LVKA 1I20A 3EMSA 3CB7A 1GF9A 1C08C 4R0FA 1LZEA 5FEKA 4B1AA 2YBJA 1BWIA 3AYQA 5LVJA 1LZ4A 4QGZA 1GB8A 1OUBA 4DD3A 3P68A 3P4ZA 1IC7Y 2W1LA 1D0LA 1GAZA 1MLCE 3W6BA 2XBSA 1GBZA 4W96A 3W6FA 4ET9A 3N9AA 4IATA 1JEFA 4XJHA 5I5QA 3TXHA 1ZVYB 1LSZA 1LHMA 4DWXA 2LZ2A 4H9BA 3WU9A 2F30A 5KXKA 1IR7A 4NGYA 1IP7A 1GFVA 4CFOA 3TXKA 1DKKA 1LZDA 2CWIA 3W6EA 1LZ1A 4WOAA 3T6UA 5LA8A 4UWUA 1ALCA 4H9HA 1CKDA 3WPKA 1GB9A 4DD9A 1FKQA 4GCDA 1JKCA 3CSQA 1EL1A 4NSIA 3WYHA 1LHLA 1YIKA 1E8LA 5B07A 1IOCA 1ZV5L 2HUBA 1LJGA 1LYSA 3P65A 5I4WA 3A34A 4NGZA 4WM4A 5EBHA 2F4AA 3B0OA 4ET8A 4I0CA 1SLYA 1YROA 4NSJA 2YBIA 4NG8A 5LYZA 4C3WA 1LJ4A 5IHGA 3QY4A 2BQMA 2HU3A 1JHLA 1LJHA 2MEFA 2BQGA 4WLDA 4M6DA 1QSAA 1YAMA 3W3EA 1XEKA 1HMLA 1TEWA 5LAFA 3G3BB 4WL6A 1IORA 1IWVA 4GLVA 4HJYA 4C5FA 4DC4A 5LVGA 1GF6A 1HEMA 4D9ZA 2MEIA 3SP3A 2A7FA 4CFPA 4RW1A 1QDTA 3WVXA 4LZTA 2BQFA 1IEEA 1INUA 4HP0A 2X0AA 4WM2A 4QDNA 1DKJA 1BGIA 1GB0A 1OUIA 1XGPC 1HHLA 5ILFA 5B05A 2C8OA 1WQOA 1HELA 1GF5A 5KXTA 1RFPA 3CT0A 2DQFC 1LTMA 4OWCA 1LZYA 1JSEA 3WMKA 1D6QA 4YM8A 4ZIXA 2HTXA 4ETAA 1GFHA 5HQ1A 1VDQA 5FHWA 3A96A 4NHTA 1UIHA 3MGWA 1NBZC 2EPEA 4PHIA 4GCBA 4TUNA 1B5YA 5LIOA 4NGIA 4YF2A 1FLYA 1BQLY 1IR8A 1GE1A 3CT5A 3G3AB 4NG1A 208LA 2MEBA 3CSRA 4NGWA 5A3ZA 3AZ4A 4WMGA 1HENA 3LHMA 3D3DA 1LZCA 1JPOA 1UIGA 4L41A 1JJ0A 2CGIA 1T3PA 2Z38A 3OJPA 3TXGA 1OUAA 1CJ8A 1WQMA 1HSXA 1YAPA 1B7PA 3ZVQA 1W6ZA 1NDMC 5KXRA 3IWRA 1BHZA 2BQHA 5IDDA 1BB6A 1KXYA 1UCOA 2IHLA 4XJBA 4H8ZA 3ZEKA 1WTNA 1LSNA 1LSYA 153LA 1GEZA 3LYMA 2ZNXY 4KXIA 4WO6A 1EQ5A 4LT3A 5HNLA 2BPUA 1J1OY 1PS5A 1GBOA 1GF3A 1LZ5A 4A7DA 3WW5A 3LZTA 4NSHA 1DZBX 2DQEY 4XJGA 4DD7A 5KKIA 3A90A 4DT3A 1EQ4A 1PZYA 4XN6A 1KIRC 5B06A 1HFYA 1IWZA 1LMNA 1BB3A 3WXTA 4NGVA 1GB5A 4GCEA 1GFEA 1OUGA 1OUHA 1IP6A 4OWEA 4YENA 3TXDA 5I54A 1G7JC 1IP4A 3AB6A 1LSPA 3P64A 4RLMA 1D0MA 4DDBA 1B7RA 1OUJA 2PC2A 3TXEA 1B7OA 1B7NA 5KXNA 1WVVA 2H9JA 2ZWBA 2Z12A 1BWHA 2AUBA 3T36A 4GN5C 4WL7A 1NDGC 2G4PA 5JENB 1LZRA 3CT1A 1JTTL 4NGKA 1GF8A 1FLWA 4HTQA 2BQDA 3LYOA 154LA 5AMYA 1CNSA 1AM7A 2CDSA 2Z18A 2Q0MX 2Y8PA 4G4CA 4J1BA 1DQJC 2ZQ3A 4IASA 3ZVQB 5KY1A 2LZTA 2W1XA 1B5UA 1I1ZA 1D9UA 2FYCA 3RU5A 4B0DA 1B5WA 4MR1A 1UUZC 4LT0A 4G4BA 3AZ7A 1UIEA 3B0IA 4O34A 3WUAA 1LSBA 3E3DA 3WL2A 1LMTA 4HJVA 4P2EA 1N4FA 5KXXA 4PRUA 4WO9A 5D5CA 4R6CA 1JISA 1G7MC 1LJ3A 2EKSC 2RSCA 1LZ9A 1C7PA 1GWDA 4ZEEA 1NMMA 1XGUC 1LYZA 3WW6A 4CHXA 3RZ4A 5KXLA 1DPWA 2I26L 2ZNWY 3WXUA 1JJ1A 3D9AC 133LA 1C46A 1LKRA 2G4QA 1IP5A 3TXFA 4BAFA 5A3EA 3A92A 3AZ5A 4HTNA 4KT3A 1GB3A 5LYMA 1CKHA 4J1AA 1G7HC 2D6BA 5KXMA 4Z46A 4LT1A 1LSEA 2MECA 1SQ2L 1LMAA 4GLAA 5KXWA 1GAYA 2BQJA 1RJCB 1LYYA 4B4IA 2YVBA 4HSFA 4WLYA 1T6VL 3B0KA 4DD0A 1UA6Y 1QQYA 1QTKA 4NHSA 1GE0A 3A91A 132LA 5KXOA 5APCA 4NFVA 1GFAA 4QY9A 1IWUA 1IOQA 1GFRA 4HV1A 134LA 2Z39A 1BVXA 4LYCA 4HTKA 5HLLA 1GE2A 2YSSC 4NHIA 4XJFA 2LHMA 5LVIA 4H93A 1CKGA 1LMOA 4ANRA 1GE4A 1AZFA 4LYTA 1FDLY 4H9AA 3WPLA 3W6AA 1WQPA 2ZIKA 2I25L 4NHQA 3WPJA 1B7QA 1GB2A 1GFGA 4OWAA 1VDPA 2XBRA 5APDA 4WM1A 1YQVY 3AGIA 3RW8A 135LA 1JSFA 1CKCA 1WQQA 3BKHA 1IWTA 1LJIA 3WUMA 5M1YA 1LSGA 1YL0X 1JJ3A 3A3QA 1VEDA 2MEGA 3OK0A 1C10A 2HEBA 2WARA 4N5RA 1GE3A 1GPQC 4J0LA 1GD6A 1LCNA 1QIOA 2BQOA 7LYZA 4PRQA 1LHKA 1FKVA 1GHLA 2EQLA 4BAPA 4OWBA 1NKHA 4EMNA 1IP2A 3WULA 1GF7A 4ETCA 1GXV2 4H1PA 5HNCA 1LZGA 1JTOL 1IY3A 4PGJB 1REYA 1XEIA 1LZ6A 1F0WA 1OUDA 1QSWA 5APEA 1GB6A 4AXTA 1LJEA 4B49A 4ETBA 5LVHA 2HEFA 2BQBA 5I53A 5DLAA 5KJ9A 1LHHA 3N9CA 4XENA 4N0JA 5F14A 4PJ2C 4H9CA 2BQAA 1GF4A 4MSTA 4AGAA 1GBXA 4G49A 4Z41A 1YKYX 1I56A 2ZQ4A 2BQNA 1NF5A 5APFA 4N9RA 1REXA 2LYMA 1A2YC 2YBHA 1YL1X 5DL9A 2XTHA 4XYYA 1BB7A 2F2NA 1VDSA 2F4GA 3A6CY 4NY5A 4RW2A 3BKVA 4WM6A 1CJ6A 5DN4A 2YBLA 3WU8A 3EBAB 1G7IC 5KKJA 1WTMA 1F6SA 4WLTA 1REMA 1HNLA 1IO5A 1LMCA 3B6LA 1MELL 1C43A 4H92A 1IOTA 3AZ6A 4H90A 5LA5A 1JKBA 1XSFA 1XFPL 2Z19A 1LHIA 4Z3MA 4KL7A 1DI5A 2CJLA 3K3TA 3KAMA 3ATNA 2BQEA 1XGTC 3WVYA 1GXXA 1UC0A 4N1CC 1UIAA 1LZTA 2BQLA 1FN5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
221LA 3P66A 2B6TA 1HFZA 1UICA 3J4GA 4WM5A 1ZWNA 5ILCA 2C8PA 3M18B 2DQDY 3WUNA 195LA 1L82A 4OOOA 4LYOA 2HULA 1CVKA 1A4VA 112LA 1LGUA 1OUFA 1CJ7A 1HEQA 1QUDA 2F32A 4CJ2A 177LA 3DMVA 1L74A 1HSWA 5KXPA 4NSGA 4QEQA 1L86A 2ZILA 4EOFA 1XGQC 2FBBA 127LA 3GUMA 1GBSA 3LN2A 1UACY 1TCYA 114LA 1C6EA 1IWYA 1OVHA 1L46A 3HU9A 4NGJA 4GN4A 1KY0A 5C6JA 3AW6A 3VWOA 211LA 246LA 238LA 1BWJA 2LZMA 6LYZA 4TWSA 1QS5A 3LYTA 1LYOA 3K2RA 214LA 2LYOA 1L67A 1LHJA 3GULA 256LA 217LA 5F9UA 190LA 3HBHA 1D6PA 4N8ZA 1GFKA 1GF0A 5L3HA 3ATOA 3B72A 4LYZA 151LA 1LWGA 4RDSA 1LJFA 3SBAA 1L01A 1G7LC 4LFXA 2H5ZA 4YEMA 3CDOA 3FA0A 171LA 1L20A 1C67A 1JKDA 1L16A 2DQIY 3L64A 1BVKC 1DI3A 2G4NA 4ARLA 2F2QA 4WM3A 4LT2A 1IX0A 2MEHA 3ULRA 1L07A 1F6RA 1V7SA 4M4OA 1BB5A 198LA 4I7JA 1HEOA 1KS3A 165LA 1L97A 1KXWA 4UWVA 1T8FA 3DKEX 3HFMY 1GB7A 2VB1A 2B7XA 2EIZC 5B1GA 1L00A 1C6TA 1UBZA 4NGOA 3HT8A 4Z98A 3HUKA 3HDFA 1L71A 209LA 5KXYA 111LA 3DN6A 1HFXA 1JITA 2MEDA 1UIFA 205LA 1L61A 249LA 218LA 3HH6A 4XJDA 235LA 1C08C 5FEKA 3AYQA 1BWIA 5LVJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3P66 A;  3A8Z A;  3AGG G;  4OW1 A;  2FBD A;  1HFZ A;  5FDJ A;  1C45 A;  1UIC A;  3J4G A;  4MCK A;  1IWW A;  1GEV A;  1NQI A;  4WM5 A;  5D5F A;  5B1F A;  2DQG Y;  4H9E A;  4CGE A;  1B7S A;  1IWX A;  2C8P A;  5E4P A;  1LJN A;  5C6L A;  3M18 B;  5ILC A;  5HMV A;  5LXW A;  9LYZ A;  1LSA A;  2DQD Y;  3WUN A;  1FLU A;  1RE2 A;  4ETE A;  4ML7 A;  4OOO A;  4LYO A;  5E9R A;  5FST A;  5II3 A;  2FYD A;  2D4I A;  1WQN A;  1JKA A;  1A4V A;  2MEE A;  2DQJ Y;  4DDC A;  1OUF A;  1REZ A;  1QUS A;  1D0K A;  1CJ7 A;  2Z2F A;  1HEQ A;  1LSD A;  2GV0 A;  4HV2 A;  1IR9 A;  1QUT A;  1YAO A;  3GXK A;  4KPM A;  3RT5 X;  3TXJ A;  3QNG A;  1DPX A;  2HEA A;  4FDY A;  4CJ2 A;  1LZ8 A;  4IJ4 A;  5L3I A;  5F16 A;  4XAD A;  1HSW A;  1KIP C;  5KXP A;  4NSG A;  4QEQ A;  2ZYP A;  4LFP A;  3TMU A;  3A67 Y;  193L A;  2ZIL A;  1IIZ A;  2NWD X;  4EOF A;  1XGQ C;  2FBB A;  4B4J A;  4H94 A;  3EXD A;  2LYZ A;  1GBS A;  1HMK A;  3LN2 A;  1GFT A;  4DD1 A;  1UAC Y;  5L9J A;  2HED A;  1KIQ C;  1TCY A;  4NHP A;  4X3B A;  1IWY A;  1LSF A; 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 2EKS C;  2RSC A;  1LZ9 A;  1C7P A;  1GWD A;  4ZEE A;  1NMM A;  1XGU C;  1LYZ A;  3WW6 A;  4CHX A;  3RZ4 A;  5KXL A;  1DPW A;  2I26 L;  2ZNW Y;  3WXU A;  1JJ1 A;  3D9A C;  133L A;  1C46 A;  1LKR A;  2G4Q A;  1IP5 A;  3TXF A;  4BAF A;  5A3E A;  3A92 A;  3AZ5 A;  4HTN A;  4KT3 A;  1GB3 A;  5LYM A;  1CKH A;  4J1A A;  1G7H C;  2D6B A;  5KXM A;  4Z46 A;  4LT1 A;  1LSE A;  2MEC A;  1SQ2 L;  1LMA A;  4GLA A;  5KXW A;  1GAY A;  2BQJ A;  1RJC B;  1LYY A;  4B4I A;  2YVB A;  4HSF A;  4WLY A;  1T6V L;  3B0K A;  4DD0 A;  1UA6 Y;  1QQY A;  1QTK A;  4NHS A;  1GE0 A;  3A91 A;  132L A;  5KXO A;  5APC A;  4NFV A;  1GFA A;  4QY9 A;  1IWU A;  1IOQ A;  1GFR A;  4HV1 A;  134L A;  2Z39 A;  1BVX A;  4LYC A;  4HTK A;  5HLL A;  1GE2 A;  2YSS C;  4NHI A;  4XJF A;  2LHM A;  5LVI A;  4H93 A;  1CKG A;  1LMO A;  4ANR A;  1GE4 A;  1AZF A;  4LYT A;  1FDL Y;  4H9A A;  3WPL A;  3W6A A;  1WQP A;  2ZIK A;  2I25 L;  4NHQ A;  3WPJ A;  1B7Q A;  1GB2 A;  1GFG A;  4OWA A;  1VDP A;  2XBR A;  5APD A;  4WM1 A;  1YQV Y;  3AGI A;  3RW8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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