1LZNA

Neutron structure of hen egg-white lysozyme
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Quasi-Laue neutron-diffraction study of the water arrangement in crystals of triclinic hen egg-white lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lznA00
3OK0A 1B7OA 1BB7A 1D6QA 4ETDA 5KKIA 1JIYA 4BADA 1FDLY 2A7DA 5DN5A 1FKQA 5DLAA 2F4GA 4GCCA 5DN4A 5B59A 2HEDA 1LJHA 4GN5C 4IASA 1OUEA 1GWDA 3P68A 4ML7A 2LYZA 3WPJA 1LHKA 1JSFA 1I20A 1N4FA 5F16A 4D9ZA 4YM8A 3WUAA 4LYMA 1QUSA 4PRQA 4XJIA 6LYZA 1IOCA 2EKSC 3N9EA 5HLLA 4ET9A 1GDXA 1VATA 4G4HA 2LZTA 4IJ4A 2HU1A 3D3DA 5LVJA 5M1YA 2Q0MX 1GBZA 5B1GA 1CKDA 3EXDA 4DDBA 4HV1A 2ZQ3A 5KXLA 4NIJA 4WLXA 1B7MA 3RZ4A 1IWYA 1DXJA 3EMSA 2ZQ4A 4RLMA 1JSEA 5KXYA 5KY1A 1DPXA 4GN3A 2YBLA 5KXZA 2BQAA 4N1CC 1BWHA 1HFXA 5LINA 1JTOL 1TBYA 1BVXA 2EIZC 2HTXA 4WM4A 1BVKC 1GFRA 3P64A 4DD1A 1BB5A 5KKJA 1D0KA 5E9RA 3TMXA 1DI4A 4ETAA 1BWJA 2YBIA 3RW8A 132LA 4C5FA 3LYTA 1FLQA 5FDJA 4FDYA 2G4NA 2MEDA 4HPIA 5L3IA 2AUBA 4GCFA 5I4WA 4G49A 5KJ9A 5F81A 4HV2A 5HNCA 3TXJA 2LHMA 1H6MA 1GBOA 1O23A 1SLYA 1YQVY 1CKGA 1BHZA 1CJ7A 1YIKA 2I25L 1IY3A 4HP0A 1NBYC 1LMQA 1GF5A 1OUFA 1UIFA 4FJRA 3W6CA 1VDTA 1YKXX 3WYHA 4OWCA 4XYYA 1W6ZA 1OUDA 4KPMA 1C10A 3B0OA 1QQYA 1IOTA 4LYBA 4N5RA 133LA 4RLNA 5F14A 3GXRA 2Z19A 3OJPA 2Z39A 2D91A 4WG1A 1IWXA 3A91A 1XSFA 1AM7A 2DQGY 4A7DA 4LT3A 1NKHA 4GCBA 1GFTA 5LVGA 1LTMA 2FBDA 1WTMA 4NSGA 1GF4A 1ZV5L 4WM6A 2GV0A 2H9KA 1IOSA 2W1LA 1KIRC 1GF8A 2BAAA 4PHIA 4NSHA 5I4XA 1B5XA 1UUZC 1QUTA 1LZ9A 3CT5A 4U3XB 4GLVA 1LCNA 3WW5A 4ANRA 4Z46A 3CQLA 3LYZA 2MEHA 3TMVA 2D4IA 4DC4A 1JKCA 2MEGA 4UWVA 3G3AB 1LSFA 1JTTL 1B7SA 5JENB 1XEIA 3W6BA 1LHJA 1LZCA 1T6VL 1WTNA 2BLYA 2ZILA 4MCKA 5KXKA 1LYYA 1VDQA 3WU7A 1LJEA 1FN5A 1YILA 1IO5A 4WM1A 5LYTA 3J4GA 4LYCA 1D0MA 4P2EA 5LAGA 1AZFA 4HSFA 1OUAA 1B5WA 3ZVQB 2DQJY 4DT3A 4B1AA 1LJKA 1YAMA 4NFVA 4YF2A 4W94A 3A96A 1LSAA 4YOPA 4OWEA 4ETBA 4J1AA 2YBHA 4BAFA 3B72A 1JKAA 4AXTA 2DBTA 3F6ZA 2BLXA 1GFEA 4WO9A 2EPEA 1C45A 3VWOA 2I6ZA 2MECA 1TDYA 1HSWA 1IC4Y 3A8ZA 2MEFA 1HFZA 4NGVA 1GE3A 1GB7A 3W3EA 8LYZA 2Z2FA 194LA 5LA8A 1LZYA 1QIOA 1DI5A 3B0IA 5EBHA 1XEKA 1GAYA 1NDMC 4UWNA 2LZ2A 2IFFY 3WH1A 1UIDA 3W6DA 1HC0A 1JJ1A 3ATNA 2BQHA 1LSMA 1I1ZA 1HEPA 1CKCA 1B7NA 1UA6Y 3WUMA 5K7OA 5C6LA 1JJ3A 2F4AA 5LVKA 5LYMA 1LSPA 154LA 5C6IA 1GFUA 3AZ4A 4TTDA 1H87A 1LKSA 2BQDA 1W08A 3D9AC 4DD7A 4Z3MA 4TSBA 4LT0A 4AGAA 1GPQC 1LJIA 4GLAA 4PPOA 6LYTA 4DYGA 1B5YA 4HJZA 1GE0A 4O34A 4YEMA 5KXOA 5KXSA 4G4BA 4J1BA 4NG8A 4H94A 1HF4A 3HBDA 4B4IA 1JWRA 4GCDA 4PJ2C 1HENA 2MEEA 5F9XA 1IEEA 2XJWA 1GBSA 3WXUA 1HELA 4CGEA 4WLDA 1HEOA 2HEFA 1GE4A 1XGQC 3AW6A 3HFMY 4H9FA 1IIZA 3LZ2A 3LZTA 4NGWA 1B2KA 1IR9A 4MR1A 1F0WA 1IWTA 1LJFA 1DZBX 3A93A 1GB8A 1QDRA 1J1OY 3CSQA 4YENA 1GF0A 4H9HA 4H8YA 4LGKA 1IP3A 2BQOA 1GHLA 1YKZX 1G7LC 1UC0A 1WQPA 4X3BA 3AJNA 3TXIA 1IP6A 4DD2A 3CT1A 4WLTA 1DI3A 4LFXA 2DQAA 5D5FA 2XTHA 1IVMA 1HERA 1UICA 2BQIA 4QGZA 4MSTA 1IC5Y 3EO5A 4TWSA 5L9JA 1VDSA 1BQLY 1JKDA 3AGGG 4NHIA 3A3QA 1LZ4A 1GFKA 4XADA 5FEKA 4BAPA 1JEFA 5IELA 1LZEA 2A7FA 1LMOA 3RU5A 1EL1A 1UCOA 1AT6A 4NWEA 1ALCA 3CSRA 3LYOA 1YAQA 4M4OA 1C08C 1UIHA 2ZYCA 4G9SA 134LA 1QTEA 4ETEA 1TAYA 5I4YA 4HTQA 4OW1A 3FE0A 1PZYA 1GF7A 1LMTA 1I56A 2HEBA 4LT1A 4CJ2A 1LZBA 2YBJA 7LYZA 2IHLA 1LSCA 3AW7A 4HJYA 1D0LA 1NWGA 208LA 2HEAA 1LYSA 1JPOA 1AKIA 1DKKA 2BQGA 4H9CA 1FLWA 1GB0A 1XGTC 3KAMA 1LYOA 3GXKA 2YDGA 1WQMA 5LA5A 1RCMA 1LZ1A 1KIPC 3TXGA 5B05A 5APFA 3J6KA 1RFPA 5DL9A 1OUHA 2CWIA 1C7PA 5HQ1A 1NMMA 1UIBA 1LZ6A 1UACY 3AZ5A 5B06A 4DDAA 1BWIA 1YROA 2LYOA 4GN4A 1NF5A 1LJJA 1LSEA 2DQHY 1WQOA 3IJVA 3MGWA 4NHQA 5HMVA 153LA 1OUCA 1TCYA 2HU3A 1B5ZA 2N5ZA 4H1PA 1IP1A 1HEQA 1GF6A 1KXXA 1LSDA 1FLYA 4NGYA 3QNGA 5II3A 5LXWA 1JKBA 2YBMA 5HMJA 1XGPC 2W1MA 1JISA 5I5QA 1GFHA 3N9AA 4I0CA 3TXHA 1INUA 3M3UA 1UBZA 4OOTA 4CFPA 2FBBA 2H9JA 4XN6A 1JHLA 1LJ4A 4LT2A 1LJNA 4NGZA 5E4PA 3WXTA 2BPUA 1FKVA 1FBIX 5FSTA 3TXDA 1IY4A 1CKFA 1C46A 1LSBA 1PS5A 3LYMA 1G7JC 1IR7A 3WULA 1REMA 1GD6A 4NSJA 4DWXA 1E8LA 1YL1X 2ZIKA 2DQDY 5D5CA 1IC7Y 2MEIA 2F2NA 4WG7A 5KXPA 5IDDA 3ZVQA 1ZVHL 2C8OA 3BKHA 1NDGC 207LA 3CT0A 4DD3A 2DQCY 2WARA 1HSXA 1WQRA 2NWDX 3IJUA 2FYCA 4N1EI 4WM5A 4WMGA 5L3HA 1LHIA 1HEWA 4NHTA 1LZTA 4XJGA 5LVIA 3WL2A 3WU9A 4WOAA 3LN2A 3A6BY 5I53A 4Z98A 1OUBA 4BS7A 4CFOA 1B7PA 3BKVA 4LYZA 2BQJA 5KXXA 4WM2A 4QY9A 1CJ9A 1IP4A 2HEEA 1OQMA 4ET8A 4NGIA 1JUGA 4H90A 4HTKA 4NGKA 2ZNXY 4XJHA 5LAFA 3WUNA 4KT3A 1IOQA 1F10A 4G4CA 3WU8A 2ZYPA 3W6FA 1NBZC 4II8A 1A2YC 2BQEA 1D6PA 4NG1A 3EBAB 1IWVA 5J7CA 4J7VA 3W6EA 1OUIA 1VDPA 1B5UA 4HJVA 4EMNA 2CGIA 1LOZA 4NSIA 1NHEA 1LSZA 4XJFA 1WQNA 4EOFA 4ZIXA 1RJCB 3A3RX 1KXYA 2Z12A 5IHGA 1WVVA 2BQLA 3WVYA 5A3ZA 4KXIA 5I54A 4H8XA 4C3WA 1B7QA 5FHWA 1MELL 2LYMA 2D4JA 3B0KA 1GEZA 1GB2A 4OWAA 3AYQA 1QTKA 5AMYA 3WPLA 1V7TA 1LZSA 5F9UA 1NQIA 3T6UA 3QY4A 3QE8A 4RW2A 4DD0A 1HMLA 4NHPA 1EQ4A 2FYDA 2Z18A 3AGHA 3A67Y 5KXNA 3TMWA 3ZEKA 1VFBC 1P2CC 4NGLA 1JTPL 4LYTA 4NY5A 1DQJC 2HUBA 2MEAA 3TMUA 1DKJA 1IWZA 2C8PA 1TEWA 2HECA 2G4PA 4OWBA 4YEOA 2CDSA 4TUNA 1B7RA 2F30A 1IORA 1J1PY 1LKRA 3ATOA 1LSNA 2BQFA 1D9UA 4B0DA 2ZNWY 2YSSC 1XFPL 4PGJB 1CKHA 1GFVA 1DPWA 1LPIA 1SQ2L 1UIAA 2RSCA 1IR8A 1GE1A 1HEMA 2D4KA 2ZIJA 1B5VA 1UIEA 1A4VA 1GB6A 1BGIA 2YBNA 4RW1A 5LVHA 3G3BB 5FCPA 1YAOA 1VEDA 4R0FA 4HPEA 1LZNA 1BB4A 1ZMYL 3AZ7A 4WL6A 1AT5A 1LZAA 3P65A 1LZRA 1LZGA 3A90A 4GCEA 5T3FA 4WO6A 3A94A 4N0JA 2I26L 1YAPA 1JITA 1B0DA 1IP7A 1LJ3A 5LYZA 4DDCA 4ETCA 1OUJA 2Z37A 4WM3A 135LA 3M18B 3RT5X 4H93A 4LZTA 1HMKA 4NGJA 1XEJA 4J0LA 1LMCA 5C6JA 1GDWA 1GE2A 1YL0X 3CSZA 3HBHA 1LSYA 2BQBA 2EQLA 2VB1A 5KXWA 1F6SA 1HFYA 4R6CA 1FLUA 2BQCA 4B49A 1QSAA 3AZ6A 2DQFC 5LIOA 1RE2A 1LHLA 4OOOA 1IP2A 5ILCA 1GAZA 4NHSA 5DM9A 1EQEA 4NGOA 3A34A 4XENA 5KXRA 5ILFA 1LJGA 1GFJA 3TXBA 1WVUA 1GBXA 1WQQA 1GFGA 1LMNA 4IATA 3SP3A 3T36A 4WL7A 5B1FA 3TXKA 1QDTA 4N8ZA 1MLCE 4NEBA 1GEVA 3ULRA 4DD9A 4E3UA 2X0AA 4HTNA 1YKYX 2YVBA 2ZWBA 3TXFA 1LHHA 1OUGA 4ZFPA 1T3PA 1V7SA 5A3EA 3P4ZA 4UWUA 3TXEA 4M6DA 1HNLA 4TSCA 3HBEX 1B9OA 1LAAA 1LZ8A 4H8ZA 1LMAA 1GB3A 1C43A 4XJBA 1F6RA 1UIGA 4TX7A 1GBWA 1VAUA 1G7IC 1IWWA 1BB6A 1G7HC 1LZDA 3CB7A 4H9BA 4CHXA 1LSGA 4PRUA 4ZEEA 4H92A 3K3TA 5FELA 4QDNA 4XJDA 2B5ZA 4KL7A 1ZVYB 1GB9A 3W6AA 4LFPA 1GBYA 3A6CY 1REYA 2Y8PA 1GXV2 1EQ5A 1GF3A 1RI8B 1GXXA 4RDSA 1GFAA 5KXTA 1KXWA 1G7MC 3IWRA 2G4QA 1IX0A 2BQNA 3AGIA 3WW6A 4B4JA 3A92A 1IWUA 4QEQA 3P66A 2Z38A 4OWHA 4H9AA 2XBRA 1HHLA 3N9CA 1KIQC 2DKVA 193LA 3WMKA 3A95A 1OP9B 3E3DA 5B07A 1LZ5A 1REXA 3AB6A 1QSWA 4Z41A 1J1XY 1LHMA 4LYOA 5HNLA 1CJ6A 4NWHA 4B4EA 2DQIY 4WLYA 4H9IA 5APEA 2W1XA 1BB3A 3RNXA 4H91A 2XBSA 1XGRC 3WPKA 2D6BA 2Z2EA 1GB5A 2BQKA 1LYZA 2H5ZA 1XGUC 1REZA 2PC2A 1CNSA 3FI7A 4L41A 3B6LA 4H9EA 4W96A 1CJ8A 1JJ0A 1B7LA 2W1YA 2CJLA 2DQEY 2BQMA 1GF9A 3LHMA 4N9RA 1LMPA 5APDA 5KXMA 5APCA 3WVXA 1Z55A 9LYZA 4I8SA 2MEBA 1IP5A 1YANA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BB7A 217LA 1P5CA 1FKQA 4GCCA 4GN5C 1L11A 149LA 1KW5A 5F16A 1XJUA 4YM8A 140LA 1QUSA 6LYZA 1IOCA 2EKSC 1DYFA 4IJ4A 2LZTA 5LVJA 3CDTA 5M1YA 1GBZA 3EXDA 1P2LA 4DDBA 5KXYA 4RLMA 5KY1A 5LINA 1JTOL 1TBYA 3P64A 1DYEA 1BB5A 2OU9A 1D0KA 1L17A 1L25A 3RW8A 1ZWNA 1LWGA 2AUBA 1L35A 5I4WA 5F81A 4HV2A 5HNCA 4NSHA 1GBOA 1D9WA 1YIKA 1LYDA 1L31A 1LMQA 1OUFA 1C63A 1VDTA 1CX7A 4KPMA 192LA 1C10A 4N5RA 5F14A 4WG1A 114LA 4A7DA 1NKHA 4GCBA 1LTMA 4NSGA 4WM6A 2H9KA 1CU3A 1KIRC 2W1LA 3SBAA 1B5XA 5I4XA 4U3XB 4ANRA 1LCNA 1ZURA 155LA 4DC4A 1L08A 3EMLA 1L36A 1L29A 1LSFA 1B7SA 112LA 1LZCA 1T6VL 1SWZA 4WM1A 5LYTA 1OUAA 2DQJY 1L37A 196LA 4YF2A 1L47A 2B74A 3A96A 1CVKA 2ANXA 1C6GA 2EPEA 2I6ZA 145LA 1L58A 1HSWA 1LGWA 3A8ZA 104LA 8LYZA 172LA 1L13A 261LA 1QIOA 3CDRA 3WH1A 3W6DA 3HT6A 1JQUA 1CKCA 3G3WA 1LSPA 191LA 5C6IA 3AZ4A 4TTDA 2BQDA 4DD7A 168LA 1L28A 4AGAA 6LYTA 1QT7A 4YEMA 1L45A 1L62A 4G4BA 3HBDA 1JWRA 4GCDA 4PJ2C 1HENA 1HELA 4CGEA 3HFMY 219LA 159LA 3LZ2A 3LZTA 4NGWA 1F0WA 3A93A 1L79A 1GF0A 1L82A 4H9HA 1UC0A 3AJNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3OK0 A;  1B7O A;  1BB7 A;  1D6Q A;  4ETD A;  5KKI A;  1JIY A;  4BAD A;  1FDL Y;  2A7D A;  5DN5 A;  1FKQ A;  5DLA A;  2F4G A;  4GCC A;  5DN4 A;  5B59 A;  2HED A;  1LJH A;  4GN5 C;  4IAS A;  1OUE A;  1GWD A;  3P68 A;  4ML7 A;  2LYZ A;  3WPJ A;  1LHK A;  1JSF A;  1I20 A;  1N4F A;  5F16 A;  4D9Z A;  4YM8 A;  3WUA A;  4LYM A;  1QUS A;  4PRQ A;  4XJI A;  6LYZ A;  1IOC A;  2EKS C;  3N9E A;  5HLL A;  4ET9 A;  1GDX A;  1VAT A;  4G4H A;  2LZT A;  4IJ4 A;  2HU1 A;  3D3D A;  5LVJ A;  5M1Y A;  2Q0M X;  1GBZ A;  5B1G A;  1CKD A;  3EXD A;  4DDB A;  4HV1 A;  2ZQ3 A;  5KXL A;  4NIJ A;  4WLX A;  1B7M A;  3RZ4 A;  1IWY A;  1DXJ A;  3EMS A;  2ZQ4 A;  4RLM A;  1JSE A;  5KXY A;  5KY1 A;  1DPX A;  4GN3 A;  2YBL A;  5KXZ A;  2BQA A;  4N1C C;  1BWH A;  1HFX A;  5LIN A;  1JTO L;  1TBY A;  1BVX A;  2EIZ C;  2HTX A;  4WM4 A;  1BVK C;  1GFR A;  3P64 A;  4DD1 A;  1BB5 A;  5KKJ A;  1D0K A;  5E9R A;  3TMX A;  1DI4 A;  4ETA A;  1BWJ A;  2YBI A;  3RW8 A;  132L A;  4C5F A;  3LYT A;  1FLQ A;  5FDJ A;  4FDY A;  2G4N A;  2MED A; 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 2ZWB A;  3TXF A;  1LHH A;  1OUG A;  4ZFP A;  1T3P A;  1V7S A;  5A3E A;  3P4Z A;  4UWU A;  3TXE A;  4M6D A;  1HNL A;  4TSC A;  3HBE X;  1B9O A;  1LAA A;  1LZ8 A;  4H8Z A;  1LMA A;  1GB3 A;  1C43 A;  4XJB A;  1F6R A;  1UIG A;  4TX7 A;  1GBW A;  1VAU A;  1G7I C;  1IWW A;  1BB6 A;  1G7H C;  1LZD A;  3CB7 A;  4H9B A;  4CHX A;  1LSG A;  4PRU A;  4ZEE A;  4H92 A;  3K3T A;  5FEL A;  4QDN A;  4XJD A;  2B5Z A;  4KL7 A;  1ZVY B;  1GB9 A;  3W6A A;  4LFP A;  1GBY A;  3A6C Y;  1REY A;  2Y8P A;  1GXV 2;  1EQ5 A;  1GF3 A;  1RI8 B;  1GXX A;  4RDS A;  1GFA A;  5KXT A;  1KXW A;  1G7M C;  3IWR A;  2G4Q A;  1IX0 A;  2BQN A;  3AGI A;  3WW6 A;  4B4J A;  3A92 A;  1IWU A;  4QEQ A;  3P66 A;  2Z38 A;  4OWH A;  4H9A A;  2XBR A;  1HHL A;  3N9C A;  1KIQ C;  2DKV A;  193L A;  3WMK A;  3A95 A;  1OP9 B;  3E3D A;  5B07 A;  1LZ5 A;  1REX A;  3AB6 A;  1QSW A;  4Z41 A;  1J1X Y;  1LHM A;  4LYO A;  5HNL A;  1CJ6 A;  4NWH A;  4B4E A;  2DQI Y;  4WLY A;  4H9I A;  5APE A;  2W1X A;  1BB3 A;  3RNX A;  4H91 A;  2XBS A;  1XGR C;  3WPK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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