1NHEA

Crystal structure of lactose synthase complex with udp
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
TELTKCKVSHAIKDIDGYQGISLLEWACVLFHTSGYDTQAVVNDNGSTEYGLFQISDRFWCKSSEFPESENICGISCDKLLDDELDDDIACAKKILAIKGIDYWKAYKPMCSEKLEQWRCEKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of lactose synthase reveals a large conformational change in its catalytic component, the beta-1,4-galactosyltransferase
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
molecule tags Transferase activator/transferase
source organism Mus musculus
total genus 41
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1nheA00
3AB6A 2CDSA 2Z12A 1GFVA 1VFBC 5B1GA 1GBOA 2BAAA 5LIOA 2FBBA 1BQLY 2LHMA 1QQYA 5T3FA 1LSNA 1LSEA 4N1EI 2LYOA 5LYZA 1HEWA 4LYTA 5HQ1A 5APFA 3P68A 4L41A 4BADA 4DD2A 4W96A 5KKJA 1TAYA 1B7LA 1LJFA 1LZCA 2CGIA 3QNGA 9LYZA 1G7LC 2G4PA 4HPEA 1QTEA 4LT2A 4WM4A 4XJIA 4B4IA 4NGIA 1GDWA 2MEAA 1GB5A 1JTPL 1LZ4A 6LYZA 1CKGA 1RJCB 4GN5C 4NGLA 2MEGA 3W6EA 4NFVA 4WLDA 3CSQA 4PHIA 1LJNA 4LYMA 1JITA 1VDTA 1LYSA 1HFYA 3WH1A 1JJ1A 1HNLA 1HMKA 1QSWA 1D6PA 1FLQA 4E3UA 1AZFA 1OQMA 4CFPA 2YBIA 1YILA 3MGWA 1DI5A 3AGGG 1UIBA 1I1ZA 1OUEA 1IP4A 2W1MA 4RW1A 1D0KA 1GB2A 1JPOA 4ETCA 1TBYA 1HHLA 4YEOA 1LHIA 2WARA 3M18B 5C6IA 1QDTA 2HU3A 3WU7A 1QTKA 5JENB 5HNCA 2ZNXY 5DL9A 3LYZA 4W94A 5B1FA 4XN6A 4UWVA 1IOQA 5LA8A 3RT5X 1LSMA 4LFXA 4Z41A 1GB3A 3SP3A 1KXXA 4NEBA 3TMWA 4CHXA 4HSFA 4RDSA 4MR1A 1IP6A 4AGAA 1D9UA 1YROA 4Z3MA 2BQGA 4YEMA 1T6VL 2BPUA 1KIPC 5FEKA 2BQEA 2XJWA 1GHLA 1REYA 1TDYA 1BVXA 1CKFA 5DN5A 1IX0A 2MEDA 1KIQC 4NGZA 3N9CA 1G7MC 1LJ3A 2BQFA 4GN4A 1J1XY 2D4IA 4G4CA 1JKAA 2YVBA 1BWHA 4TTDA 4WM3A 2ZIKA 1FBIX 1IWYA 4EMNA 1GWDA 1H6MA 1F0WA 5FSTA 2EKSC 3BKVA 1GB7A 4LT0A 2DQJY 1UBZA 1JISA 2D4JA 3N9AA 1OUHA 1A2YC 5FDJA 2LYZA 1LJKA 3P64A 4NGWA 5KXYA 1JIYA 1IR7A 1SQ2L 2D91A 132LA 1DPXA 1GE3A 3TXBA 2YBJA 3B72A 5I4WA 1IWWA 1LSYA 2Z18A 4YM8A 4OOTA 1XSFA 4DDAA 3W3EA 2W1XA 4WLTA 2MEHA 1V7SA 1NWGA 4GCFA 1Z55A 1IIZA 4NHIA 3FE0A 4FJRA 1IO5A 1GB8A 2BQLA 3CSZA 5HMJA 3LZ2A 1FDLY 4H8XA 4ETAA 4ETBA 1W6ZA 5KXZA 5LVJA 1GFTA 1OP9B 2DKVA 1LSFA 5LYTA 1DI3A 2F4GA 1NHEA 2BQAA 2N5ZA 4DYGA 1HERA 1HFZA 3TXEA 1HELA 4ANRA 3ULRA 1IY4A 1C7PA 1KXYA 4OWAA 4XENA 2H9JA 5FELA 1A4VA 1JHLA 1IC7Y 4XJFA 1UIEA 1I56A 1CKHA 4M6DA 1CJ8A 1BB4A 1UIGA 3TXDA 4DWXA 1XEIA 2W1YA 4IATA 1AT5A 1LYZA 2XBRA 3A90A 1AM7A 5LVGA 1JKCA 1LZGA 3WU9A 4NGVA 1UA6Y 194LA 5I4YA 2I6ZA 2DQFC 1JKDA 5APCA 3WUAA 5LVHA 1JTOL 1OUBA 1DI4A 1QUSA 4ML7A 4KPMA 1XGUC 1GFJA 1LMCA 1YANA 5D5CA 2FBDA 3K3TA 4DD0A 5F9UA 4UWUA 1DKKA 2MECA 3G3BB 1WQPA 1REXA 1BB3A 5DN4A 1GEZA 1QIOA 1CJ9A 1FKQA 2YBNA 3AZ5A 3HBDA 1GE1A 5HNLA 4NHQA 1GF7A 5I53A 4BAFA 4ZIXA 4NSIA 4YOPA 1BB5A 1UC0A 4OWHA 8LYZA 5FCPA 1YKXX 2XTHA 2HEBA 1NBYC 1GB9A 2C8PA 4NG1A 4DT3A 3IJUA 4H9IA 1VAUA 1ZV5L 5LVKA 3A91A 3W6CA 3AW6A 4ETDA 1C10A 1IR8A 4J0LA 1B5WA 1UUZC 1OUDA 3LYTA 2ZILA 5C6LA 1LHKA 1OUGA 1BB7A 5KXSA 1WVVA 1B7SA 5I5QA 5M1YA 5E4PA 1JJ0A 4B49A 4NG8A 5J7CA 1H87A 1GB6A 3TXFA 2LZ2A 4Z98A 1CKCA 1YKYX 2LYMA 4G9SA 2IFFY 2Y8PA 4HJYA 5KJ9A 1UIFA 1UIDA 4MCKA 1VDPA 4N0JA 1N4FA 5KXNA 1UCOA 3W6AA 3AJNA 3T36A 4N1CC 5ILCA 3CSRA 1MLCE 1F10A 3E3DA 1LMTA 4H9FA 1B5UA 4P2EA 3WW6A 2BQHA 4LYZA 4XJHA 4HV2A 4DD1A 1GF0A 4NSJA 3KAMA 4NSHA 5KY1A 2MEEA 5A3ZA 2DQHY 1O23A 1LHHA 4U3XB 3TMUA 2BLXA 4OWBA 1LZBA 3CT5A 4R0FA 4H90A 1LMOA 4XYYA 1LHMA 4KXIA 1WQOA 1GF4A 2ZQ3A 2DQEY 3AZ7A 5KXMA 4HJVA 5LXWA 3VWOA 2H5ZA 2Z38A 1LSGA 3HBEX 1XGPC 1FN5A 1LZ1A 4TWSA 4HJZA 3WVXA 2HTXA 4LFPA 1D0LA 1HEOA 3P66A 1IP7A 1JJ3A 2EIZC 2ZIJA 4H92A 135LA 5DM9A 1INUA 1B5ZA 4GCDA 4LYBA 1LMNA 4WG1A 3TMVA 4H1PA 1J1PY 2HU1A 4H9EA 1HENA 4R6CA 4X3BA 4CGEA 2H9KA 4RW2A 1G7JC 1WQRA 3W6FA 5LYMA 4G49A 1WTMA 1LJEA 4O34A 1BB6A 1GE4A 1C45A 4IASA 4NGYA 4LYCA 1LTMA 1LYYA 1W08A 4WM2A 4DC4A 3TXIA 1GBSA 1REZA 4EOFA 6LYTA 3F6ZA 5II3A 4RLNA 1NDMC 4NSGA 4M4OA 3CQLA 4DD3A 3A67Y 2BQJA 4H93A 1XGQC 208LA 4D9ZA 1E8LA 4TX7A 2BQBA 3ATOA 4ET9A 5KXKA 3LYOA 1KXWA 1QSAA 1RE2A 3WUNA 3GXKA 4QEQA 5IDDA 1DPWA 1IR9A 1I20A 1B5XA 1LYOA 1LSZA 1T3PA 1GF8A 4RLMA 1OUIA 4J1BA 1XFPL 2GV0A 4GCBA 1D0MA 2HECA 1XGTC 2BQMA 5FHWA 4NHTA 1TEWA 2FYCA 3AZ4A 4OOOA 5IELA 3EMSA 1B5YA 2YBHA 1ALCA 1IP3A 1UIHA 2DQIY 2G4NA 4WL7A 1EQEA 5A3EA 5EBHA 3RNXA 3WPLA 1C46A 1IY3A 3WUMA 4ETEA 1CNSA 1QDRA 1F6SA 1LKRA 4XJBA 3GXRA 2A7FA 4WM5A 4DD7A 1GB0A 2YDGA 4GCEA 4B4JA 2DQGY 2DQCY 2Z39A 3QY4A 4WM6A 1IVMA 1RI8B 1GFAA 5E9RA 2ZYPA 5C6JA 2HEDA 1BGIA 1IOTA 1LZ6A 1GBZA 2EQLA 1NKHA 1UIAA 154LA 5B07A 1UICA 1GD6A 1DXJA 4IJ4A 5HMVA 1IOCA 2Z2FA 3LZTA 1YAMA 3W6BA 4B4EA 1VDQA 1REMA 3HFMY 1BVKC 1CJ7A 3EO5A 3TMXA 1SLYA 3WW5A 1JKBA 1HSXA 3ZVQA 5F16A 1BHZA 5L3IA 4TSCA 3IJVA 1GDXA 1IOSA 2HEEA 4OWEA 1B2KA 1XEKA 4DDCA 4DD9A 1V7TA 1IWUA 1LZYA 5F9XA 1P2CC 4GLVA 1GE2A 1NBZC 4NHSA 5K7OA 1LJIA 1LZSA 1RFPA 4G4BA 3WMKA 4DDBA 5B06A 1FLUA 1LSAA 5ILFA 1EQ5A 1FKVA 1D6QA 1LHLA 4PJ2C 4N8ZA 1B7RA 4XJDA 3RU5A 1LJGA 1WTNA 1LOZA 2HUBA 4UWNA 4C5FA 3B0OA 1HFXA 2ZNWY 1VATA 1LMAA 3A8ZA 2XBSA 3CB7A 1PZYA 4QGZA 5I4XA 1IP1A 4LZTA 4HTQA 1LPIA 1LZTA 2DBTA 1OUJA 2LZTA 1IWZA 2ZWBA 5HLLA 4WL6A 4ZEEA 4B0DA 2YBMA 4BAPA 1YL1X 4J7VA 3IWRA 4N5RA 1JWRA 1NDGC 1GAYA 1JUGA 4XADA 5LAFA 1GXXA 2Q0MX 3WPJA 1VEDA 1LZRA 4LT1A 3OJPA 2PC2A 4PPOA 4H8YA 4NGJA 4NWEA 1LZNA 2FYDA 1JSEA 1HEQA 5APDA 1LZ9A 3OK0A 4MSTA 5IHGA 1PS5A 2DQAA 1IWVA 5F14A 1ZVYB 2VB1A 3AYQA 3CT0A 3HBHA 1NF5A 1GFEA 3BKHA 1LZ5A 4BS7A 1IWXA 4AXTA 1LZ8A 3D3DA 1IORA 4WLXA 1LKSA 1BWIA 1LAAA 1B7QA 3A95A 3FI7A 3WU8A 4QY9A 3AZ6A 2D6BA 1AKIA 4NHPA 4OWCA 4C3WA 1DZBX 1LSCA 1IP5A 2F2NA 4H91A 2HEFA 1C08C 3J6KA 3RZ4A 1UACY 3TXKA 2MEIA 1NMMA 1FLYA 7LYZA 3M3UA 1HEMA 4H9BA 4Z46A 2F4AA 3D9AC 3LYMA 2BQKA 4GLAA 1HC0A 1B7NA 1IWTA 2Z19A 1GBYA 1HF4A 1FLWA 1OUFA 2W1LA 5KXOA 2BQOA 1CKDA 4TSBA 1NQIA 4H9AA 1GBWA 4NIJA 5KXPA 1IC5Y 4NGOA 5D5FA 4OW1A 5KKIA 5APEA 1OUCA 1HMLA 2AUBA 3W6DA 1GAZA 1OUAA 1LSBA 1WVUA 4WOAA 1CJ6A 4II8A 4ET8A 2MEFA 2ZQ4A 3A94A 3A96A 4LYOA 4LT3A 4N9RA 5LA5A 1GFRA 3WULA 4H9CA 2HEAA 4HP0A 1LJHA 3ZEKA 4FDYA 2CWIA 3P4ZA 3A6BY 4QDNA 1GFGA 2I26L 1HSWA 4XJGA 1B9OA 4H9HA 1JEFA 1WQNA 4I0CA 2IHLA 4CFOA 4WO9A 3A92A 134LA 1LZEA 2I25L 4WM1A 207LA 3EXDA 2G4QA 4H8ZA 1VDSA 2A7DA 4PRQA 3WL2A 4LGKA 4J1AA 3WXUA 5B05A 1LHJA 1LMPA 2BQCA 133LA 1XGRC 4TUNA 5L3HA 3A3QA 3G3AB 1BWJA 3ZVQB 1J1OY 3T6UA 1GFUA 1GFHA 2CJLA 3N9EA 4CJ2A 1GE0A 4HPIA 3CT1A 1YAQA 1LJ4A 1JSFA 2EPEA 2ZYCA 1QUTA 3WYHA 5KXWA 1YAOA 1JTTL 1MELL 1YQVY 1DQJC 2BQIA 2D4KA 5KXLA 2MEBA 2Z37A 3TXHA 3A93A 4WO6A 1LJJA 1WQMA 3LN2A 4PGJB 1WQQA 1LZAA 1B7OA 5F81A 3TXJA 1GEVA 2YBLA 1LSPA 3B0IA 3QE8A 4YF2A 1ZVHL 2YSSC 1B7PA 1LMQA 3B0KA 5AMYA 1F6RA 4YENA 5B59A 1B5VA 4WMGA 3AGIA 2X0AA 3ATNA 1XEJA 1GPQC 3AW7A 2F30A 2Z2EA 1IEEA 1GBXA 4HTNA 2RSCA 2BQDA 1IP2A 1G7IC 1YAPA 4KL7A 4WLYA 1TCYA 1LCNA 1YL0X 3P65A 4PRUA 5LINA 193LA 1GXV2 2NWDX 3LHMA 5KXXA 1GFKA 4HV1A 4I8SA 3WVYA 1EQ4A 2DQDY 5DLAA 1LZDA 5LVIA 5KXRA 4G4HA 4NGKA 3A6CY 3B6LA 4WG7A 1RCMA 1LSDA 5KXTA 3AGHA 4HTKA 1AT6A 1GF3A 1KIRC 5LAGA 3WXTA 1B7MA 1YKZX 2BLYA 1DKJA 4GN3A 1YIKA 1IC4Y 3EBAB 4GCCA 1GF9A 2B5ZA 4NWHA 1EL1A 3A34A 3RW8A 4NY5A 5L9JA 3TXGA 1GF5A 1B0DA 3A3RX 1ZMYL 4ZFPA 4B1AA 3J4GA 2C8OA 1C43A 1G7HC 1GF6A 5I54A 153LA 4KT3A 4A7DA 2BQNA 1HEPA 4H94A 3WPKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HTBA 1VFBC 2BAAA 1LI3A 1QQYA 1L67A 173LA 2HUMA 139LA 5LYZA 4BADA 1TAYA 1LZCA 1G7LC 1QTEA 4WM4A 4XJIA 1GDWA 1JTPL 2LC9A 2RAZX 1JITA 1P46A 1L74A 3HDEA 1L55A 1AZFA 1OQMA 1CV0A 1CU0A 3MGWA 1YILA 4RW1A 1JPOA 1T8GA 212LA 126LA 1TLAA 2WARA 3M18B 4DJHA 1QDTA 1CV4A 2ZNXY 3LYZA 4XN6A 107LA 160LA 4NEBA 4PJZA 1L73A 222LA 1IP6A 255LA 1D9UA 4AGAA 4Z3MA 1T6VL 2BPUA 2BQEA 2XJWA 1REYA 5DN5A 4NGZA 3N9CA 1LJ3A 4GN4A 1JKAA 2YVBA 1BWHA 4TTDA 2ZIKA 1CTWA 1QUHA 1CVKA 2EKSC 4LT0A 2NTHA 1GE3A 4YM8A 1L40A 1V7SA 1NWGA 3FE0A 5HMJA 1L84A 1L98A 5LYTA 2BQAA 1HERA 1HFZA 4ANRA 206LA 3ULRA 1KXYA 4XENA 3JR6A 161LA 2H9JA 246LA 4YXAC 4M6DA 1BB4A 1UIGA 241LA 1XEIA 2W1YA 1AT5A 1LYZA 1AM7A 3C80A 1LZGA 1UA6Y 194LA 1JKDA 5LVHA 1JTOL 4ARJA 242LA 1P2RA 1XGUC 1LMCA 1YANA 104LA 3C7YA 1WQPA 5DN4A 1QIOA 1CJ9A 1FKQA 4ZIXA 5HNLA 4NHQA 1GF7A 4BAFA 4LZMA 4YOPA 1BB5A 1OWZA 1UC0A 258LA 4OWHA 5FCPA 2HEBA 4H9IA 183LA 3W6CA 3AW6A 5LZMA 1C10A 4J0LA 1CX6A 1L97A 164LA 216LA 1BB7A 1L29A 1WVVA 1JJ0A 1QT3A 1L59A 2LZ2A 182LA 1YKYX 5KJ9A 3G3XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AB6 A;  2CDS A;  2Z12 A;  1GFV A;  1VFB C;  5B1G A;  1GBO A;  2BAA A;  5LIO A;  2FBB A;  1BQL Y;  2LHM A;  1QQY A;  5T3F A;  1LSN A;  1LSE A;  4N1E I;  2LYO A;  5LYZ A;  1HEW A;  4LYT A;  5HQ1 A;  5APF A;  3P68 A;  4L41 A;  4BAD A;  4DD2 A;  4W96 A;  5KKJ A;  1TAY A;  1B7L A;  1LJF A;  1LZC A;  2CGI A;  3QNG A;  9LYZ A;  1G7L C;  2G4P A;  4HPE A;  1QTE A;  4LT2 A;  4WM4 A;  4XJI A;  4B4I A;  4NGI A;  1GDW A;  2MEA A;  1GB5 A;  1JTP L;  1LZ4 A;  6LYZ A;  1CKG A;  1RJC B;  4GN5 C;  4NGL A;  2MEG A;  3W6E A;  4NFV A;  4WLD A;  3CSQ A;  4PHI A;  1LJN A;  4LYM A;  1JIT A;  1VDT A;  1LYS A;  1HFY A;  3WH1 A;  1JJ1 A;  1HNL A;  1HMK A;  1QSW A;  1D6P A;  1FLQ A;  4E3U A;  1AZF A;  1OQM A;  4CFP A;  2YBI A;  1YIL A;  3MGW A;  1DI5 A;  3AGG G;  1UIB A;  1I1Z A;  1OUE A;  1IP4 A;  2W1M A;  4RW1 A;  1D0K A;  1GB2 A;  1JPO A;  4ETC A;  1TBY A;  1HHL A;  4YEO A;  1LHI A;  2WAR A;  3M18 B;  5C6I A;  1QDT A;  2HU3 A;  3WU7 A;  1QTK A;  5JEN B;  5HNC A;  2ZNX Y;  5DL9 A;  3LYZ A;  4W94 A;  5B1F A;  4XN6 A; 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 1J1O Y;  3T6U A;  1GFU A;  1GFH A;  2CJL A;  3N9E A;  4CJ2 A;  1GE0 A;  4HPI A;  3CT1 A;  1YAQ A;  1LJ4 A;  1JSF A;  2EPE A;  2ZYC A;  1QUT A;  3WYH A;  5KXW A;  1YAO A;  1JTT L;  1MEL L;  1YQV Y;  1DQJ C;  2BQI A;  2D4K A;  5KXL A;  2MEB A;  2Z37 A;  3TXH A;  3A93 A;  4WO6 A;  1LJJ A;  1WQM A;  3LN2 A;  4PGJ B;  1WQQ A;  1LZA A;  1B7O A;  5F81 A;  3TXJ A;  1GEV A;  2YBL A;  1LSP A;  3B0I A;  3QE8 A;  4YF2 A;  1ZVH L;  2YSS C;  1B7P A;  1LMQ A;  3B0K A;  5AMY A;  1F6R A;  4YEN A;  5B59 A;  1B5V A;  4WMG A;  3AGI A;  2X0A A;  3ATN A;  1XEJ A;  1GPQ C;  3AW7 A;  2F30 A;  2Z2E A;  1IEE A;  1GBX A;  4HTN A;  2RSC A;  2BQD A;  1IP2 A;  1G7I C;  1YAP A;  4KL7 A;  4WLY A;  1TCY A;  1LCN A;  1YL0 X;  3P65 A;  4PRU A;  5LIN A;  193L A;  1GXV 2;  2NWD X;  3LHM A;  5KXX A;  1GFK A;  4HV1 A;  4I8S A;  3WVY A;  1EQ4 A;  2DQD Y;  5DLA A;  1LZD A;  5LVI A;  5KXR A;  4G4H A;  4NGK A;  3A6C Y;  3B6L A;  4WG7 A;  1RCM A;  1LSD A;  5KXT A;  3AGH A;  4HTK A;  1AT6 A;  1GF3 A;  1KIR C;  5LAG A;  3WXT A;  1B7M A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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