1NQIA

Crystal structure of lactose synthase, a 1:1 complex between beta1,4-galactosyltransferase and alpha-lactalbumin in the presence of glcnac
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
TELTKCKVSHAIKDIDGYQGISLLEWACVLFHTSGYDTQAVVNDNGSTEYGLFQISDRFWCKSSEFPESENICGISCDKLLDDELDDDIACAKKILAIKGIDYWKAYKPMCSEKLEQWRCEKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of lactose synthase reveals a large conformational change in its catalytic component, the beta-1,4-galactosyltransferase
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
molecule tags Transferase activator/transferase
source organism Mus musculus
total genus 40
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1nqiA00
4DDAA 4H92A 1N4FA 5A3EA 1IOCA 1BB6A 5ILCA 5C6JA 2F4AA 2XTHA 1JSFA 5FEKA 5B06A 3A92A 1IWVA 1FN5A 1KXWA 2Y8PA 5J7CA 1JIYA 1IC4Y 3AGGG 4E3UA 1LTMA 2VB1A 4M6DA 1G7MC 2FYDA 4IJ4A 4KL7A 4Z41A 2A7FA 2FBDA 4KT3A 3AZ7A 4B1AA 1LMAA 4RLMA 1DI4A 4IATA 3IJVA 2DKVA 5LINA 1LJGA 1UBZA 4HV2A 1LZSA 4XJGA 4NY5A 4NGIA 1LKRA 2BQDA 2BQKA 1OUHA 2ZIKA 2NWDX 4HPIA 3FE0A 2F30A 4WL7A 1HEOA 4DD9A 5HMVA 5KXNA 4LYBA 1AKIA 1LZDA 3A95A 1WQRA 3ULRA 1FDLY 3AGIA 5LA5A 1IP5A 1NBYC 1XSFA 4WO9A 2DQHY 1QSWA 4OOTA 4NIJA 1GB3A 3A90A 1REMA 1YAPA 2Z37A 4LYMA 1B5XA 4EMNA 1B7LA 4G4HA 4H9HA 1GF6A 4GCEA 1HHLA 1C10A 4BAPA 4NGOA 194LA 2C8PA 4D9ZA 1FBIX 1WTNA 4HTQA 1HMLA 2DQDY 1IP7A 1HEQA 2Z38A 5I4XA 1XGQC 5DM9A 1T6VL 1UIAA 4OWCA 5F16A 1D0LA 4XENA 5L3IA 4DDBA 3ZEKA 3ATOA 2YBNA 1BVXA 1OUJA 1LSNA 1BGIA 1GF9A 1LZCA 3AJNA 4N9RA 4QY9A 2MEAA 5KXMA 1GFVA 1LMCA 5II3A 4DD7A 2YVBA 1ZVHL 5KXPA 3WPJA 5FSTA 3BKHA 1YAMA 4NSGA 4NHSA 4UWVA 1OUAA 4LT2A 1LKSA 1B7PA 4HPEA 2EPEA 207LA 3CSQA 4H9AA 1IR7A 4G4CA 4GCBA 3EXDA 3WW6A 2YBMA 3B0KA 5APCA 1JSEA 2DQCY 1IOQA 4WM4A 4NHIA 3WXUA 4ET9A 4LYZA 5LVGA 4NG1A 4RW2A 1GE0A 1DXJA 1PZYA 3AGHA 4H93A 4RDSA 3W6DA 1NDMC 1WTMA 3A94A 1YQVY 1IX0A 2FYCA 5L9JA 1IWWA 1UIGA 3M3UA 4WG1A 1HFYA 1BHZA 1G7JC 5E9RA 3J4GA 4DDCA 1JWRA 4PRUA 4XJIA 3OJPA 5KXYA 3A6CY 1MLCE 2EIZC 4W96A 5LAGA 1UCOA 1YAOA 3AW7A 1GBSA 2BLYA 4PRQA 5JENB 2ZQ4A 4DT3A 4WLDA 1HSWA 1AM7A 1RJCB 4N1EI 1LZ1A 1WQPA 5KXRA 3G3AB 1JISA 4O34A 3M18B 1NDGC 1QSAA 7LYZA 2ZYPA 1GBYA 3W6FA 1LSYA 1UIBA 1BB3A 3HFMY 1UICA 5KXTA 4H1PA 1INUA 4ET8A 1JTTL 1TCYA 3WUMA 4LFXA 4MR1A 2CWIA 1BWHA 2DBTA 4P2EA 1HSXA 4B4IA 3B72A 4G49A 1IOTA 1DKKA 5LYZA 1B5ZA 3LZTA 4H9IA 3ATNA 3TXJA 1J1PY 4C3WA 1REYA 2HU1A 1DQJC 3K3TA 4NHPA 2YBLA 1B7OA 3A96A 1V7TA 1GFHA 1TAYA 4HTNA 1G7LC 1UACY 2BQCA 5B1GA 5LYTA 1LHLA 1LMQA 5KKIA 4J7VA 1GBXA 1ALCA 1GF5A 1LJEA 4LYOA 4NG8A 2G4NA 5I5QA 3D9AC 4ETCA 1B7SA 1LYYA 1LHHA 1BQLY 4YEOA 4LYTA 1B5VA 3WU9A 1GD6A 1XFPL 2I6ZA 1AT5A 5APDA 1DI5A 2BQIA 3CSRA 1OP9B 4UWUA 1W08A 2ZNWY 3ZVQA 1FLQA 5B05A 1YAQA 4QDNA 1LSFA 2YBJA 4ETEA 4B49A 1GBZA 2X0AA 3BKVA 2D91A 4EOFA 1GAZA 2I25L 5I4YA 2Z39A 1OUBA 9LYZA 1IP6A 4I8SA 1FLYA 4TSBA 154LA 1IC5Y 1IEEA 1HEWA 1LZBA 1XEKA 1JUGA 4ZFPA 1F10A 4H9BA 1QIOA 4N5RA 4QGZA 1LHKA 3GXKA 2RSCA 2ZWBA 3AZ5A 2N5ZA 5T3FA 1LMPA 1JKDA 1JTOL 2BQAA 4HJVA 1GFAA 2CJLA 4HTKA 1WVVA 1HFZA 4Z98A 2G4QA 2I26L 153LA 1GF7A 4KXIA 5KXWA 4NEBA 4ZEEA 1HFXA 2MEEA 1IO5A 3QY4A 3T6UA 5LYMA 2XBSA 4HSFA 1D6PA 1BB4A 4DD0A 3WVYA 3TMXA 1LSDA 1FLUA 1TEWA 5KJ9A 5FELA 4WM1A 2W1XA 1HC0A 1B0DA 1GXV2 2DQGY 1GBOA 2HEDA 4OWEA 4I0CA 1GE2A 3TXHA 3B6LA 1UIEA 3ZVQB 3LYMA 4OW1A 4WOAA 5F14A 1IP1A 2W1YA 3KAMA 2YBHA 5L3HA 5I54A 6LYZA 5M1YA 2ZIJA 5LAFA 1IP3A 3WPKA 2BQGA 3B0IA 2MEIA 5KXLA 1CKHA 3TXEA 4NSIA 4NSJA 1C46A 3P68A 5KXSA 2BQOA 1LJFA 1B2KA 4HP0A 4N1CC 1VDTA 1SLYA 1IWYA 1BWJA 1GB7A 4NGZA 1IORA 1C43A 3TXKA 1RCMA 6LYTA 1DKJA 3LZ2A 3WYHA 4CHXA 1HEMA 3RU5A 4DD3A 3P66A 1JHLA 1C7PA 4WM2A 1I20A 2BQLA 4XADA 3RNXA 8LYZA 5B59A 1A4VA 1DPXA 4YM8A 1XEIA 2MEGA 4J1BA 2HEAA 4BS7A 1JKAA 2C8OA 1NBZC 1LZYA 1HMKA 3A3QA 4H94A 3LYZA 1LHIA 3RT5X 2LHMA 1G7IC 2DQJY 4GN3A 5LIOA 3P65A 1GDXA 2HEBA 4XJDA 4M4OA 1GWDA 2D6BA 1LYZA 4B4JA 1VDPA 3N9CA 2BQEA 2F4GA 1TDYA 1JEFA 4NSHA 1NQIA 5APFA 1OUIA 4QEQA 5LVIA 1LMTA 134LA 1EQ5A 1H6MA 1QDRA 5IELA 1D0MA 1LZ9A 1IC7Y 5D5FA 1AT6A 1LZEA 1LJ3A 4WM6A 2LZ2A 1REXA 4KPMA 2IHLA 4XJBA 3EBAB 1XGPC 3P64A 1J1OY 3WVXA 1B5WA 1LJNA 4ETDA 2GV0A 1HELA 4U3XB 1LSEA 1ZV5L 5FCPA 1B7NA 2HEFA 4MCKA 4WG7A 1CKCA 1QUSA 1I1ZA 1LZ8A 3W6AA 1NMMA 3RZ4A 1JITA 1CJ6A 1YROA 1LYOA 1WQNA 4GN4A 4YEMA 3AYQA 4XYYA 1HEPA 4OWAA 4H91A 2XBRA 4WM5A 3WH1A 3W6CA 1D6QA 1CJ8A 4Z3MA 1VEDA 2DQAA 4A7DA 4II8A 3LHMA 4IASA 4WLXA 3WW5A 1C45A 3CT0A 1KIRC 1Z55A 1XGRC 1GE3A 1LPIA 1GXXA 1MELL 1EQEA 1OUFA 1QDTA 4L41A 4PJ2C 4CFOA 1AZFA 1UC0A 3IJUA 3WULA 1RE2A 4NWEA 4YOPA 2DQIY 1J1XY 1GB0A 1RI8B 1YKZX 1IOSA 4YENA 1OUEA 4G9SA 4ETAA 1VATA 1CKFA 4WLTA 1EL1A 1LSZA 4H8XA 2LYZA 1IVMA 2G4PA 3W6BA 4C5FA 5B07A 1KXXA 1DI3A 1GB5A 5F9UA 3TXGA 5LVJA 1KIPC 1YILA 2D4IA 1IIZA 3AZ4A 3GXRA 4NGYA 4WL6A 2HEEA 5EBHA 2BLXA 1CKDA 1VFBC 1IWXA 2MEFA 3LN2A 1GFGA 1IP2A 4NGLA 2DQEY 3QNGA 3WUNA 4LFPA 1T3PA 4RLNA 3A8ZA 5D5CA 5FDJA 5HMJA 3EMSA 3CSZA 4OWHA 1SQ2L 3A93A 1BWIA 1LSPA 4NGJA 1JPOA 4NGVA 4HJYA 4NHTA 4HJZA 3TXIA 1GEZA 2CDSA 4R0FA 1GE1A 2ZYCA 2BPUA 4FDYA 2MEDA 5HNCA 1LSCA 3A34A 1ZVYB 1YANA 1ZMYL 1XEJA 4LT1A 132LA 1BVKC 2LYMA 1LSGA 1D9UA 5FHWA 4LT0A 193LA 1LOZA 3CQLA 5I53A 3RW8A 3WU8A 3WXTA 1F6RA 1LJ4A 1GF8A 3HBDA 3LYOA 1LJJA 2Z2EA 1GEVA 2BAAA 4H9EA 3SP3A 1LSMA 3W6EA 4ZIXA 1UUZC 4GLVA 5DN5A 1LZGA 1B7MA 2AUBA 2BQBA 5AMYA 1FLWA 1GDWA 5ILFA 1EQ4A 2MEHA 1YL0X 2PC2A 5LVHA 4H8ZA 2HECA 1LZTA 3LYTA 2LYOA 1O23A 3P4ZA 1WVUA 4TWSA 2B5ZA 2EKSC 4NGKA 1GFJA 3CT1A 4CFPA 3AB6A 3J6KA 4NGWA 3AW6A 2MEBA 1GF4A 2IFFY 4GCFA 1GB2A 1OQMA 208LA 3W3EA 1KXYA 2YSSC 4AXTA 3N9EA 1IR9A 2A7DA 4WM3A 1P2CC 1D0KA 1WQQA 2EQLA 4LGKA 4TSCA 4NFVA 5IDDA 5KXXA 2YDGA 3A6BY 4PPOA 2W1LA 4DD1A 4GLAA 1XGTC 1GPQC 1WQOA 1CNSA 1LAAA 3A67Y 1OUDA 1JJ1A 4MSTA 4R6CA 1GAYA 2F2NA 1LHJA 4XJHA 4B4EA 3WUAA 135LA 4XJFA 4PHIA 5B1FA 4H90A 2MECA 1LZNA 1UIHA 1YIKA 3HBEX 2Q0MX 1RFPA 4H8YA 3TXFA 5HQ1A 3TMUA 3N9AA 4NHQA 5HLLA 4J1AA 1PS5A 1TBYA 4W94A 2D4KA 1E8LA 4LYCA 2HU3A 1WQMA 2LZTA 4H9FA 5F9XA 3TMWA 3WL2A 4DWXA 2Z19A 5KY1A 1GFUA 4BAFA 1OUGA 1QUTA 4PGJB 4BADA 5KXOA 4DYGA 3AZ6A 1FKQA 1GFRA 4DD2A 5KXKA 1GFEA 1JKBA 2BQNA 3WPLA 1GHLA 4LZTA 4TTDA 3EO5A 1A2YC 3WU7A 4GN5C 1V7SA 1IWTA 4B0DA 1LZ5A 3CB7A 4J0LA 4NWHA 1F0WA 1LSAA 5IHGA 1LZ4A 1BB7A 1LHMA 1LMOA 1REZA 1IP4A 2BQFA 1VDSA 5LXWA 4TUNA 5F81A 4LT3A 3VWOA 5E4PA 1IY3A 5LA8A 4N8ZA 1B7RA 1DZBX 3TMVA 1HENA 4AGAA 1IWUA 1OUCA 2CGIA 1QQYA 2H5ZA 1GB6A 1GBWA 1LMNA 1LCNA 1LZAA 5C6LA 3TXBA 2D4JA 4HV1A 1B9OA 2ZNXY 1FKVA 3QE8A 1GF3A 1JTPL 1UA6Y 1LZ6A 1YL1X 3E3DA 2BQJA 1I56A 4RW1A 1LJHA 5HNLA 1UIFA 3A3RX 3A91A 1GF0A 4TX7A 4YF2A 5K7OA 1GFTA 4G4BA 5LVKA 2ZILA 3D3DA 4UWNA 1CJ9A 2DQFC 2Z12A 1HERA 1LZRA 1JJ0A 2FBBA 1KIQC 3OK0A 1JKCA 1W6ZA 1LSBA 1C08C 4FJRA 3TXDA 1B5UA 133LA 1JJ3A 1CJ7A 2WARA 1DPWA 3CT5A 5KXZA 1HNLA 4CGEA 1IWZA 1BB5A 4ANRA 1CKGA 1XGUC 4N0JA 1QTKA 5C6IA 1IY4A 3F6ZA 1YKXX 4XN6A 1LJKA 2ZQ3A 3WMKA 3HBHA 4CJ2A 1LJIA 1GB8A 1VDQA 1YKYX 4WLYA 1NHEA 1QTEA 1B7QA 1VAUA 4X3BA 5DN4A 5I4WA 3G3BB 1IR8A 4H9CA 1B5YA 2BQMA 1NWGA 2BQHA 5DL9A 5KKJA 2HTXA 3B0OA 1G7HC 3MGWA 5DLAA 2W1MA 3FI7A 4ML7A 1H87A 2XJWA 5APEA 2HUBA 4DC4A 1GFKA 1HF4A 2Z2FA 2YBIA 4ETBA 4WMGA 1F6SA 5A3ZA 1UIDA 1GB9A 4WO6A 2H9JA 2Z18A 4Z46A 3IWRA 1LYSA 1NKHA 4GCCA 4OWBA 2H9KA 1NF5A 4GCDA 1GE4A 4OOOA 3T36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H92A 1OV7A 5A3EA 4I7NA 1XJUA 1L04A 1L57A 3QAKA 1JSFA 5FEKA 1IWVA 1DYAA 2Y8PA 247LA 1DYGA 1IC4Y 3AGGG 262LA 4ARQB 1G7MC 4IJ4A 4KL7A 4KT3A 220LA 1L60A 1P36A 2BQKA 185LA 2NWDX 3FE0A 4WL7A 1L27A 1ZYTA 4WO9A 4NIJA 1L76A 1REMA 4EMNA 4GCEA 194LA 1D2WA 4HTQA 1HMLA 1XGQC 1T6VL 4OWCA 1BVXA 1OUJA 3AJNA 1LZCA 4N9RA 2MEAA 5KXMA 3DN2A 1L25A 2YVBA 1ZVHL 2LZMA 1YAMA 1C65A 1G0QA 4UWVA 1L33A 1B7PA 4I7RA 4G4CA 4W56A 4DQJA 111LA 3HTDA 5APCA 3WXUA 4LYZA 169LA 1DXJA 4RDSA 3W6DA 251LA 1L99A 1P2LA 1IX0A 200LA 2FYCA 4LDLA 1QT7A 2QARC 1JWRA 2OE4X 1MLCE 108LA 1YAOA 1GBSA 1QT5A 4DT3A 1HSWA 1RJCB 1WQPA 160LA 7LYZA 1GBYA 3W6FA 1LSYA 1UIBA 1BB3A 3HFMY 5KXTA 1C6EA 1QTDA 1KY0A 4LFXA 1DYCA 1BWHA 210LA 2DBTA 151LA 4G49A 138LA 4H9IA 3TXJA 4C3WA 234LA 1B7OA 3A96A 1P46A 3OE0A 1G0PA 1TAYA 1LYFA 170LA 4LYOA 1B7SA 1LYYA 3G3VA 4PK0A 3SB6A 3C81A 164LA 1DI5A 2BQIA 3CSRA 1L32A 1CV5A 4UWUA 1LYHA 2X0AA 1L26A 230LA 9LYZA 1FLYA 3DN3A 1XEKA 1K28A 4W55A 1JKDA 1CU5A 4HJVA 1WVVA 2G4QA 1GF7A 4NEBA 3QY4A 1CV4A 1LYJA 4I7JA 5KJ9A 5FELA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4DDA A;  4H92 A;  1N4F A;  5A3E A;  1IOC A;  1BB6 A;  5ILC A;  5C6J A;  2F4A A;  2XTH A;  1JSF A;  5FEK A;  5B06 A;  3A92 A;  1IWV A;  1FN5 A;  1KXW A;  2Y8P A;  5J7C A;  1JIY A;  1IC4 Y;  3AGG G;  4E3U A;  1LTM A;  2VB1 A;  4M6D A;  1G7M C;  2FYD A;  4IJ4 A;  4KL7 A;  4Z41 A;  2A7F A;  2FBD A;  4KT3 A;  3AZ7 A;  4B1A A;  1LMA A;  4RLM A;  1DI4 A;  4IAT A;  3IJV A;  2DKV A;  5LIN A;  1LJG A;  1UBZ A;  4HV2 A;  1LZS A;  4XJG A;  4NY5 A;  4NGI A;  1LKR A;  2BQD A;  2BQK A;  1OUH A;  2ZIK A;  2NWD X;  4HPI A;  3FE0 A;  2F30 A;  4WL7 A;  1HEO A;  4DD9 A;  5HMV A;  5KXN A;  4LYB A;  1AKI A;  1LZD A;  3A95 A;  1WQR A;  3ULR A;  1FDL Y;  3AGI A;  5LA5 A;  1IP5 A;  1NBY C;  1XSF A;  4WO9 A;  2DQH Y;  1QSW A;  4OOT A;  4NIJ A;  1GB3 A;  3A90 A;  1REM A;  1YAP A;  2Z37 A;  4LYM A;  1B5X A;  4EMN A;  1B7L A;  4G4H A;  4H9H A;  1GF6 A;  4GCE A;  1HHL A;  1C10 A;  4BAP A;  4NGO A;  194L A;  2C8P A;  4D9Z A;  1FBI X;  1WTN A;  4HTQ A;  1HML A;  2DQD Y;  1IP7 A;  1HEQ A;  2Z38 A;  5I4X A;  1XGQ C;  5DM9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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