1NWGA

Beta-1,4-galactosyltransferase complex with alpha-lactalbumin and n-butanoyl-glucoamine
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
TELTKCKVSHAIKDIDGYQGISLLEWACVLFHTSGYDTQAVVNDNGSTEYGLFQISDRFWCKSSEFPESENICGISCDKLLDDELDDDIACAKKILAIKGIDYWKAYKPMCSEKLEQWRCEKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title ALPHA-LACTALBUMIN (LA) STIMULATES MILK BETA-1,4-GALACTOSYLTRANSFERASE I (BETA 4GAL-T1) TO TRANSFER GLUCOSE FROM UDP-GLUCOSE TO N-ACETYLGLUCOSAMINE. CRYSTAL STRUCTURE OF BETA 4GAL-T1 X LA COMPLEX WITH UDP-GLC.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase activator/transferase
source organism Mus musculus
molecule keywords Alpha-lactalbumin
total genus 38
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1nwgA00
3A90A 1GEZA 1LHKA 3LYZA 1GF4A 1BVXA 2D6BA 1GEVA 1IEEA 2EPEA 1WQNA 1EQEA 1D6PA 1JSFA 4XJDA 3W6FA 3BKVA 2I6ZA 1UICA 4YEMA 1TDYA 4NG1A 4B4JA 3IWRA 1IP2A 1XGTC 1FLUA 1LJJA 4TSCA 3G3AB 4B4IA 1E8LA 2Z39A 1NHEA 2G4PA 207LA 3TXEA 3A96A 2HEBA 2DBTA 1LSEA 1LHMA 2HEFA 3FE0A 1GE3A 1JSEA 4M4OA 4WM4A 4N1CC 1B7RA 4PRUA 2ZYCA 1HELA 5A3ZA 1LMAA 3TXHA 1T6VL 1GB9A 2D4KA 1B7MA 2W1YA 5LYZA 1VDPA 1XGQC 4WLDA 2DQFC 4X3BA 3AW6A 3CQLA 4FJRA 1TBYA 2FYCA 4PPOA 1NBZC 4LYMA 1GE4A 1GWDA 1GFVA 1WTNA 3W6DA 3P64A 2BAAA 2MEAA 5I54A 5KXSA 1OP9B 1CJ8A 1JTOL 4LYOA 1YKXX 1J1PY 3WUMA 2CJLA 1VDTA 5M1YA 4A7DA 2GV0A 1LZRA 3WULA 1GPQC 4CHXA 1P2CC 4OOOA 5ILCA 1B5WA 3LYMA 2I26L 4II8A 1JITA 4QY9A 4J1BA 2H9KA 1VAUA 3A3QA 3GXRA 4RLMA 2ZQ4A 4NY5A 4WLYA 1B9OA 1F6RA 7LYZA 1KIRC 3WU9A 1OQMA 1ZV5L 5DN5A 1B0DA 1GFEA 1CJ6A 1CKHA 1IWZA 2I25L 4NWHA 4XYYA 4CGEA 2BQAA 3WYHA 1OUFA 5DM9A 4PRQA 2BQNA 3TXBA 4PJ2C 1UCOA 1HFZA 1LSPA 5KXXA 1GE2A 2B5ZA 3LYTA 5LAFA 1IORA 1LSMA 2NWDX 1V7TA 4NSGA 1FN5A 3W6EA 4H92A 4ET8A 5F16A 1G7MC 3N9EA 1LKRA 4TWSA 2XBRA 2PC2A 3WVXA 1GFRA 3CT0A 1HEMA 5AMYA 4LT1A 1JTTL 1IWVA 4OWCA 1AT6A 1T3PA 1GFAA 4NHPA 4XJGA 1MELL 4QGZA 1LZ5A 1FKQA 1DI4A 1QSAA 3AGGG 5APDA 1QTKA 1JWRA 1HSWA 4MSTA 1IIZA 2MEBA 4P2EA 1RFPA 4BAPA 5LXWA 2Z2EA 4WG7A 2LZTA 1CJ9A 1LZYA 5LA8A 1UIEA 1WQQA 4WO6A 1GB3A 1IC4Y 4HV2A 2Z37A 1GDXA 3W6BA 1GBXA 5J7CA 2DQDY 4XJFA 3CT1A 1NQIA 1D0MA 2ZIJA 1FKVA 2YBMA 4DT3A 1IOTA 1F0WA 1LYOA 3P4ZA 4NSIA 5DL9A 4IATA 4N9RA 3TMVA 1QUTA 3M18B 4D9ZA 1XSFA 4ML7A 1J1OY 2HU1A 3TXFA 5L3IA 3IJUA 3WW5A 2DKVA 5KXOA 3LN2A 4WLXA 3WXUA 3EXDA 1A4VA 1B5UA 3A6CY 1ZVYB 1DZBX 1FLQA 3AJNA 1LSDA 4GCCA 3WXTA 3AB6A 2LYZA 4WG1A 3CSRA 1UIHA 1LAAA 4HSFA 5KXMA 3TMXA 208LA 1HMLA 4WM5A 1D0KA 5C6LA 1GXV2 5KXKA 4OWBA 4C5FA 2EQLA 5II3A 4H8YA 5APEA 1ZVHL 3AZ7A 5D5FA 1HEQA 1DI5A 4BAFA 3T36A 1C08C 1OUAA 4N8ZA 3TXIA 3RT5X 3TXJA 3E3DA 4GCBA 2BQIA 2HEDA 1J1XY 4W94A 2BQMA 4L41A 1OUDA 4ANRA 1LJHA 4RW2A 1YAPA 1GB6A 1QSWA 1DXJA 2G4QA 4IJ4A 2W1LA 2DQEY 1JJ1A 4NGOA 3WVYA 4H9HA 1MLCE 4WO9A 5KXTA 3EO5A 3B6LA 1IO5A 1INUA 1B7OA 1KIPC 1BQLY 1LZ8A 1Z55A 4IASA 1W08A 1AZFA 4H91A 3RU5A 2D4JA 5HMVA 1REYA 2YBHA 3QE8A 5EBHA 1LSYA 3QY4A 4HV1A 5K7OA 1LSFA 1LZCA 4R0FA 1IP6A 1GB7A 4QEQA 2MEGA 2ZYPA 5FDJA 3B0KA 3LYOA 4H9FA 3ZVQB 4QDNA 1GFKA 4RLNA 1EQ4A 2F4GA 2ZNWY 4HPEA 4MR1A 1YROA 1WQMA 4GLAA 4C3WA 1UIBA 1KXWA 5KY1A 1GF0A 2BQDA 1LSAA 1DKKA 1CKGA 1JJ3A 1YL0X 2DQGY 2DQJY 3HFMY 2MEIA 1JHLA 2HUBA 1LMNA 134LA 3HBDA 4WM2A 5F81A 2BQCA 3SP3A 4TSBA 1FLYA 1LJEA 4YEOA 4AXTA 3W6CA 3F6ZA 5C6IA 4NSJA 3WPLA 3P68A 133LA 1N4FA 4OOTA 4DC4A 4H94A 1TCYA 2FBDA 1GFJA 1KXYA 1LHHA 1RCMA 1H6MA 153LA 1C46A 5JENB 3MGWA 4M6DA 2MEEA 1O23A 1GB8A 3WW6A 5DLAA 4ETAA 1IP4A 1DKJA 4WMGA 3W3EA 4CJ2A 1LSZA 1UIAA 4NGLA 2EIZC 3A67Y 3A34A 4G4HA 4PHIA 5KXZA 5F9XA 5KXYA 4UWVA 5HNCA 1H87A 1A2YC 1NKHA 4WL6A 1BWIA 1GBWA 4DDBA 3ZVQA 1IX0A 1GBSA 4DDCA 4HTNA 1LMQA 5LVJA 2BQOA 4ZEEA 5APFA 1UIGA 4H9AA 4DD9A 1OUHA 1DPWA 3ULRA 1LZBA 4G9SA 3WMKA 1G7IC 1LZGA 1YKZX 1IVMA 3T6UA 1LZAA 4O34A 4XN6A 4Z41A 4B1AA 1SLYA 3N9AA 4H93A 1NF5A 2LZ2A 1LMTA 2MEFA 3CSQA 4HJZA 1YAMA 5KKIA 2YSSC 4EOFA 1HC0A 2YBIA 1I20A 1IOQA 1WQOA 1JEFA 4GCDA 3IJVA 2ZIKA 4H9EA 2Y8PA 1AM7A 1SQ2L 1YAQA 4H8ZA 4HJVA 154LA 3WPKA 1GE0A 5HQ1A 5KXRA 1UIDA 1IR9A 5HLLA 1C45A 3AZ5A 1GBYA 4I0CA 1DQJC 2FBBA 1XGRC 3A8ZA 4N5RA 3WPJA 2BLXA 2BQJA 5F9UA 1OUGA 1BGIA 4WM6A 5IDDA 3TXDA 5F14A 1UA6Y 1BWHA 4NGZA 2DQHY 4NEBA 5L3HA 1XEKA 2HU3A 4YM8A 4KT3A 2BQGA 1D9UA 1QQYA 4DYGA 1AT5A 3EBAB 1RJCB 1IY3A 1G7JC 1GAZA 5B1FA 4NGIA 5I5QA 4MCKA 4BS7A 5B07A 2BQLA 1WTMA 2ZILA 5I4XA 1RI8B 1CKFA 1F10A 1LJNA 4OWEA 1B5YA 5KXWA 4R6CA 3QNGA 5KXLA 2BQKA 1KIQC 1HF4A 2C8PA 3A92A 4U3XB 4XJHA 2VB1A 3A91A 1YL1X 4YENA 2BLYA 3TMWA 8LYZA 1JKBA 3OK0A 1LZEA 2Z19A 1VDQA 4LFPA 4OWAA 3WUAA 1ZMYL 2W1MA 1JKDA 2CDSA 1EL1A 4WOAA 1VDSA 3W6AA 1I56A 1JKCA 2BPUA 4G4CA 1IP3A 1BVKC 5T3FA 2YBJA 1XFPL 4LT3A 4OW1A 2YDGA 2DQCY 5KKJA 2ZWBA 1C10A 5FSTA 4DD2A 1XGUC 2Z18A 3AZ4A 4NFVA 1GAYA 3A93A 1FDLY 4HJYA 4Z3MA 1VATA 1GB0A 1VEDA 1LJFA 1LPIA 1VFBC 4NG8A 4NWEA 4XJIA 3HBEX 1HEWA 2ZQ3A 4WLTA 2BQFA 1LCNA 1D6QA 2BQEA 1IOCA 1GF8A 1HSXA 1FBIX 1YKYX 2D4IA 1LJ3A 3CSZA 2HTXA 1LJIA 1GF9A 3LZTA 5E9RA 4TX7A 1TEWA 4TTDA 1GE1A 1W6ZA 3AGHA 5LYMA 1BB7A 2MEHA 4DD0A 3RNXA 1LMCA 4ZIXA 1LZDA 1JTPL 1OUJA 3EMSA 5HMJA 5I53A 4EMNA 1IP5A 3AW7A 1JUGA 5LVHA 1BB5A 1LSCA 2G4NA 1IC5Y 1HEPA 2N5ZA 4N1EI 1V7SA 1OUCA 3WUNA 132LA 2H9JA 1TAYA 2IHLA 1B7SA 1IOSA 1LSGA 2XTHA 3ATNA 2X0AA 4NGWA 3WH1A 1DPXA 2XBSA 1C43A 1UBZA 1XEJA 3LHMA 1CKDA 3P65A 3FI7A 4OWHA 1IP7A 1HHLA 1LHLA 4G49A 1YANA 4CFPA 3A94A 1JISA 1LZSA 2HECA 3HBHA 1UIFA 1GFHA 3M3UA 4GCFA 4PGJB 5ILFA 3B0OA 4DD3A 4YF2A 1C7PA 4NHQA 4CFOA 1LYZA 5LA5A 3B72A 2HEAA 5DN4A 1LZNA 6LYZA 4H9IA 3ZEKA 4G4BA 1OUEA 1BB3A 1LYSA 4LFXA 1WVVA 1QDRA 1BB4A 4FDYA 1LOZA 4LYCA 2D91A 3G3BB 4GN5C 1PS5A 1IY4A 4W96A 1LJ4A 1BB6A 4DWXA 1GDWA 1JKAA 1GF7A 1QDTA 4ETCA 1NWGA 4XJBA 1NMMA 1LHJA 4UWUA 1HENA 3AZ6A 4H9BA 1KXXA 1LJKA 1WQRA 3OJPA 1B5XA 4B4EA 1WQPA 1ALCA 2Z12A 5B06A 5A3EA 1B7QA 1LSBA 1NBYC 5FELA 4B49A 4NGJA 1OUBA 1YQVY 3RW8A 135LA 2DQAA 1FLWA 4HTQA 4J1AA 4RW1A 1NDMC 2YBLA 3WL2A 1LJGA 3VWOA 4ETDA 1HERA 1GHLA 194LA 2F30A 2F4AA 5HNLA 3A3RX 3BKHA 1HFYA 5B59A 1UUZC 5B05A 4LYTA 4NHSA 1NDGC 2BQBA 2CGIA 3A95A 1UACY 3J6KA 4XENA 4Z46A 4BADA 4NHTA 5D5CA 1IWWA 1RE2A 2MECA 1B5VA 1B2KA 3CT5A 4I8SA 2ZNXY 1F6SA 4GCEA 1G7LC 5FHWA 1B7LA 4NHIA 5LINA 3CB7A 5FEKA 1YAOA 2LYMA 3A6BY 1B5ZA 4ET9A 1WVUA 3AGIA 2DQIY 2RSCA 1LZTA 5FCPA 2IFFY 1JIYA 2EKSC 5IELA 2A7FA 4DD7A 1UC0A 2XJWA 1IR7A 1GBZA 1I1ZA 1JJ0A 1LMOA 4E3UA 1GB2A 2W1XA 5B1GA 1LZ1A 5L9JA 4B0DA 1IWUA 1AKIA 1B7NA 4DDAA 4LYZA 3TXGA 1LMPA 1G7HC 1BWJA 1CJ7A 4LYBA 4KPMA 2FYDA 2C8OA 3TMUA 1B7PA 3ATOA 1GFGA 1GF6A 1GFTA 3K3TA 4NIJA 4WM1A 9LYZA 6LYTA 1IWTA 2Z2FA 1QIOA 5LAGA 2Q0MX 3P66A 3KAMA 3RZ4A 2WARA 4H8XA 1HMKA 1JPOA 4N0JA 1YILA 4NGKA 4H1PA 1CKCA 1HEOA 1REZA 4NGYA 1REXA 4RDSA 2BQHA 4UWNA 2YBNA 1GF5A 1DI3A 2A7DA 1GD6A 1LZ4A 4HP0A 1IC7Y 5I4YA 1HFXA 4J0LA 4KL7A 3AYQA 4NGVA 2LHMA 1PZYA 1GBOA 5LYTA 1GB5A 4LT2A 1CNSA 1XGPC 5LIOA 1XEIA 3TXKA 1IWXA 1OUIA 2H5ZA 4WM3A 1GXXA 4TUNA 4ETEA 4YOPA 5LVGA 3J4GA 2YVBA 1LSNA 4GN4A 1LHIA 4H9CA 5KJ9A 4Z98A 4LT0A 3B0IA 5KXPA 4LZTA 4LGKA 1EQ5A 1LZ6A 1D0LA 193LA 3GXKA 5C6JA 2F2NA 2HEEA 2MEDA 4H90A 5APCA 3N9CA 1LTMA 1LZ9A 1QUSA 3LZ2A 4HPIA 4WL7A 4ETBA 1GF3A 3D3DA 5LVKA 1IWYA 4KXIA 1GFUA 3WU8A 4DD1A 1BHZA 1IR8A 1REMA 4GN3A 4HTKA 5E4PA 4J7VA 5IHGA 1HNLA 3D9AC 4ZFPA 1QTEA 4GLVA 5I4WA 4AGAA 1LYYA 3WU7A 1YIKA 1IP1A 4NSHA 2AUBA 1LKSA 2CWIA 4XADA 2Z38A 5LVIA 5KXNA 2LYOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ANVA 3LYZA 2D6BA 1GEVA 1QUGA 1D6PA 1JSFA 4XJDA 3BKVA 1UICA 3IWRA 1L66A 1FLUA 3A96A 4M4OA 4N1CC 2ZYCA 2OEAX 3CQLA 171LA 1LYGA 4PPOA 1LYIA 5I54A 2MEAA 176LA 4W54A 5KXSA 1CJ8A 1J1PY 2CJLA 2HUKA 3QAKA 3SB6A 251LA 102LA 1JITA 155LA 225LA 2ZQ4A 2OU8A 1B9OA 4WLYA 1B0DA 1GFEA 1CKHA 108LA 2BQAA 4I7LA 1OUFA 1HFZA 1SSWA 1L93A 5KXXA 1KW5A 1G0PA 4ET8A 3HUAA 1L75A 3HH4A 4OWCA 3DN6A 1C6BA 3AGGG 1LYDA 1HSWA 1IIZA 184LA 1OVJA 2MEBA 1L01A 2Z2EA 4WG7A 3DMVA 4WO6A 1L12A 1GDXA 5J7CA 4XJFA 1QT4A 1F0WA 3P4ZA 3GUNA 1QUTA 212LA 3HDFA 2QB0B 3GUIA 3TXFA 3IJUA 2DKVA 1G1WA 4W55A 1B5UA 3A6CY 1LSDA 4GCCA 3WXTA 103LA 4WG1A 1C6CA 3CSRA 1UIHA 1D3NA 3TMXA 1HMLA 1D0KA 229LA 5C6LA 4C5FA 1HEQA 4BAFA 3T36A 1C62A 2BQIA 3C8QA 4L41A 4ANRA 7LZMA 1QTCA 3V2YA 1YAPA 1QSWA 2G4QA 2W1LA 2DQEY 1JJ1A 1CU0A 3EO5A 1IO5A 1LW9A 1B7OA 1BQLY 1Z55A 1AZFA 4H91A 3QE8A 3PBLA 4QEQA 2ZYPA 5FDJA 1QTVA 3LYOA 259LA 4QDNA 1GFKA 4RLNA 1EQ4A 1L29A 2F4GA 4HPEA 1LYHA 166LA 1DKKA 1LSAA 2DQGY 2MEIA 243LA 4ZPUA 3HBDA 1C6IA 3SP3A 4DQ5A 4NSJA 3WPLA 133LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A90 A;  1GEZ A;  1LHK A;  3LYZ A;  1GF4 A;  1BVX A;  2D6B A;  1GEV A;  1IEE A;  2EPE A;  1WQN A;  1EQE A;  1D6P A;  1JSF A;  4XJD A;  3W6F A;  3BKV A;  2I6Z A;  1UIC A;  4YEM A;  1TDY A;  4NG1 A;  4B4J A;  3IWR A;  1IP2 A;  1XGT C;  1FLU A;  1LJJ A;  4TSC A;  3G3A B;  4B4I A;  1E8L A;  2Z39 A;  1NHE A;  2G4P A;  207L A;  3TXE A;  3A96 A;  2HEB A;  2DBT A;  1LSE A;  1LHM A;  2HEF A;  3FE0 A;  1GE3 A;  1JSE A;  4M4O A;  4WM4 A;  4N1C C;  1B7R A;  4PRU A;  2ZYC A;  1HEL A;  5A3Z A;  1LMA A;  3TXH A;  1T6V L;  1GB9 A;  2D4K A;  1B7M A;  2W1Y A;  5LYZ A;  1VDP A;  1XGQ C;  4WLD A;  2DQF C;  4X3B A;  3AW6 A;  3CQL A;  4FJR A;  1TBY A;  2FYC A;  4PPO A;  1NBZ C;  4LYM A;  1GE4 A;  1GWD A;  1GFV A;  1WTN A;  3W6D A;  3P64 A;  2BAA A;  2MEA A;  5I54 A;  5KXS A;  1OP9 B;  1CJ8 A;  1JTO L;  4LYO A;  1YKX X;  1J1P Y;  3WUM A;  2CJL A;  1VDT A;  5M1Y A;  4A7D A;  2GV0 A;  1LZR A;  3WUL A;  1GPQ C;  4CHX A;  1P2C C;  4OOO A;  5ILC A;  1B5W A;  3LYM A;  2I26 L;  4II8 A;  1JIT A;  4QY9 A;  4J1B A;  2H9K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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