1O23A

Crystal structure of lactose synthase in the presence of udp-glucose
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
TELTKCKVSHAIKDIDGYQGISLLEWACVLFHTSGYDTQAVVNDNGSTEYGLFQISDRFWCKSSEFPESENICGISCDKLLDDELDDDIACAKKILAIKGIDYWKAYKPMCSEKLEQWRCEKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alpha-Lactalbumin (La) Stimulates Milk Beta-1,4-Galactosyltransferase I (Beta 4Gal-T1) to Transfer Glucose from Udp-Glucose to N-Acetylglucosamine. Crystal Structure of Beta 4Gal-T1 X La Complex with Udp-Glc.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
molecule tags Transferase activator/transferase
source organism Mus musculus
total genus 38
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1o23A00
1F10A 3TXHA 4KL7A 1NQIA 1CNSA 1B5YA 1KIPC 2MEHA 1IOQA 4LYCA 3WL2A 1LSBA 1LZAA 5B59A 1DPWA 4AGAA 1LJJA 5HNCA 1OUFA 3QY4A 4NGJA 5L9JA 4N1EI 5AMYA 1VATA 2ZWBA 3TXKA 5C6LA 4NGVA 4NIJA 3A6BY 2Z39A 3TMVA 3AZ7A 2FYDA 4NHPA 4GN4A 4IATA 4Z41A 2HEFA 4B0DA 1JITA 3D9AC 4NSHA 4OOTA 4R6CA 1A4VA 1LSPA 1LZ6A 2CGIA 3ATOA 4YEMA 3GXRA 1NMMA 2G4QA 4DC4A 2YBJA 1BB7A 1UIDA 1LOZA 2BQJA 3LZTA 1IC7Y 5FEKA 134LA 3TXIA 4ETCA 1EQ5A 3AB6A 3ZEKA 1LPIA 1HFXA 1LJEA 4WL6A 4OOOA 4LYTA 2XTHA 5APCA 3QE8A 4GLAA 1NHEA 1UIEA 2YBMA 3AZ5A 3CT1A 4NGYA 4XJGA 1C45A 5FELA 5A3EA 5LVHA 1RI8B 5B05A 1WTMA 3AJNA 3TXDA 1LZSA 2CJLA 3LYOA 4N5RA 1LMPA 4LT0A 5I4WA 2DQCY 1AZFA 2MEIA 1GFUA 3N9CA 1GF6A 1KXWA 2CDSA 4G4BA 1V7SA 2HU3A 1B5XA 5LYZA 3FE0A 1ZVHL 4DD0A 3TMXA 1WVUA 2G4NA 3WMKA 4ZFPA 1D9UA 2BQBA 2MEGA 1LHLA 4WM3A 4G4CA 1OUGA 5I5QA 1YKYX 2BLYA 3W6CA 1HFZA 1YL1X 1GFVA 1F6SA 3EO5A 3HBEX 1H6MA 3AYQA 2BPUA 1GEVA 3A3RX 1GWDA 1BB4A 2N5ZA 1G7JC 4ZEEA 1D0LA 5F9UA 3WW6A 1KXYA 4DD1A 1REMA 1IY4A 1OUIA 1LMQA 4BADA 3VWOA 1B5WA 3RU5A 2C8OA 1LMNA 1LJHA 1EQ4A 1E8LA 4DDCA 4NGKA 4YENA 3AGIA 5KXWA 5APFA 4IASA 4GCEA 1LJ4A 3KAMA 1XGRC 4ETDA 1D6PA 4KPMA 1OUAA 1JTPL 3TXEA 2LYOA 1Z55A 3EBAB 4LT3A 1GF9A 1IWWA 1GD6A 1GFGA 1LAAA 1BVKC 1YL0X 4UWUA 1DI4A 1ALCA 1FDLY 1HF4A 5F16A 1B5ZA 1UIGA 2DKVA 5F9XA 3RW8A 4NSGA 1CKFA 1OUDA 3P64A 1C08C 2IHLA 3AGGG 2EKSC 2CWIA 4D9ZA 1YKZX 4ZIXA 1HEQA 5DL9A 5LVIA 4J7VA 1AM7A 2HEDA 2WARA 5KKIA 4WOAA 1JSEA 1LKRA 3HBHA 5LINA 1IWVA 1AT6A 4NG8A 4ETBA 1GHLA 1LYZA 2W1MA 2HEBA 2H9KA 1DKJA 1HMLA 5IELA 4Z98A 5LA5A 1WQPA 3A94A 1OUHA 1B7NA 3A93A 207LA 1GBYA 2HECA 5IDDA 1B5UA 1B7PA 1CKHA 3W6BA 4ET8A 1YILA 208LA 2I25L 5HNLA 1FLWA 2BAAA 1KXXA 1TDYA 1NF5A 4WM2A 1LSMA 4ML7A 2F4AA 1GFAA 4W96A 5FSTA 9LYZA 1OP9B 1CJ9A 1DKKA 3AZ6A 3CSZA 4OW1A 4XJIA 1UICA 2I26L 5I4YA 1J1PY 4DD3A 1LJGA 2Z2EA 3BKVA 1HFYA 4H9IA 1GB2A 2ZNWY 6LYTA 1GF5A 4LT1A 1YIKA 3TMUA 193LA 1QDTA 1GFKA 1YAQA 5FHWA 1GE0A 3IJVA 4H9HA 3WPKA 2A7DA 4XADA 5LVKA 4UWNA 1HC0A 1GF8A 1MELL 3WYHA 133LA 4CHXA 2D91A 4U3XB 1IP1A 4YF2A 3CB7A 1C46A 1F0WA 1LZ1A 1XGUC 1JPOA 3AW6A 1LSYA 4NGWA 1JWRA 4G4HA 2YBLA 3RT5X 4DD7A 5KXTA 5E9RA 1V7TA 4RLMA 5KXYA 1TAYA 2B5ZA 2BQEA 2XJWA 1HEPA 4X3BA 3SP3A 4HJZA 3EXDA 4LGKA 1JTOL 1HELA 4GN5C 3WULA 4LFXA 3WXTA 5FCPA 1B7RA 4WLTA 5LYMA 1NBZC 1YROA 1LZ5A 1JTTL 3G3BB 4II8A 2EQLA 1HEOA 2MEFA 3LYZA 4KXIA 4HV1A 4PRQA 4OWCA 1FKVA 4MR1A 1IP7A 1IOTA 3CT5A 2MECA 1FLYA 5IHGA 3LYMA 5II3A 2NWDX 1GF3A 2A7FA 1HSXA 3P4ZA 1JKBA 4LZTA 1UIHA 2YBNA 1JJ0A 1YAMA 4I0CA 4N9RA 4B49A 3OJPA 2BQOA 3G3AB 2D4IA 4J0LA 2BQCA 1JEFA 1FBIX 1GAZA 2LYMA 4H1PA 2RSCA 1F6RA 1GBOA 4NHQA 1UBZA 1GB5A 4ETEA 1YANA 1XEKA 4QEQA 1VAUA 1B5VA 1D6QA 1EL1A 5D5FA 1LZRA 4A7DA 1FLQA 1IIZA 2LYZA 4OWAA 4YM8A 5KXRA 1LMAA 3A92A 1B0DA 1UIFA 5B06A 1SLYA 1CJ8A 4GCDA 4OWBA 4HPIA 1LMCA 4PHIA 3WU8A 3IWRA 1CJ6A 1QUSA 5ILFA 1JSFA 1JJ3A 1IX0A 2BLXA 1UUZC 1YAPA 2DQEY 3LHMA 1ZMYL 1GEZA 2ZIJA 3WH1A 4LYBA 1GPQC 1VEDA 1WVVA 135LA 1OUCA 2I6ZA 4WM1A 5KXSA 4G9SA 4B1AA 2VB1A 1D0MA 4XYYA 3CQLA 1GXXA 1LZ9A 1XGPC 4NHIA 3BKHA 1GE3A 132LA 5HMVA 1B7SA 2BQMA 1LCNA 2BQIA 1AKIA 1LSCA 1EQEA 4GN3A 1LJFA 1UCOA 1HEMA 4NSJA 1LHMA 1B7QA 1G7IC 5HLLA 1BQLY 5APEA 4YOPA 2DQIY 2F30A 4HJYA 1GF4A 1LZGA 3D3DA 3TMWA 1OUBA 5D5CA 1QUTA 5I4XA 1HNLA 1FKQA 1G7LC 1LZBA 1WQQA 5KXZA 1QTKA 5EBHA 5KXPA 3W6DA 1XSFA 4NSIA 1NWGA 3WW5A 1B2KA 1GB6A 4YEOA 1XFPL 1XGQC 4HTNA 1GF0A 1GF7A 1LHIA 4CFOA 4GLVA 5M1YA 1REZA 1IVMA 5DN4A 1VDSA 1XEIA 2Q0MX 1J1OY 2HEEA 4HPEA 1JKDA 1GBZA 3M3UA 5KXKA 4DDBA 3ZVQA 2ZYCA 4DT3A 4TTDA 1LTMA 5B1GA 5KXLA 4ANRA 2H9JA 3GXKA 1IWXA 1CKGA 1YQVY 2LZTA 194LA 2F2NA 2HU1A 1IOCA 1JISA 2BQLA 1BGIA 1GAYA 4WM4A 2YBHA 5LXWA 4GCFA 1VDQA 3A67Y 4MSTA 1TCYA 1LHKA 2IFFY 1LJKA 3A3QA 4NGIA 4WLXA 5F14A 1GXV2 1GB7A 1IO5A 4P2EA 5J7CA 1BWJA 1LYOA 3LYTA 1QIOA 4NG1A 1B9OA 3W6EA 3K3TA 4B4JA 1UACY 5APDA 4DD9A 1UIAA 3A34A 4XJDA 1JHLA 4CJ2A 4Z46A 1LHJA 3T36A 5B1FA 5KJ9A 2LHMA 2YVBA 3M18B 1CKDA 1T3PA 1UIBA 3T6UA 3WPJA 1KIQC 1JIYA 1IP6A 4LFPA 4N8ZA 1IWTA 2Y8PA 4NGZA 6LYZA 4WO9A 2DQFC 4HTKA 1P2CC 2FBDA 2YDGA 2DQDY 4J1AA 1REYA 1GBWA 3FI7A 154LA 3B6LA 1WTNA 4E3UA 1HSWA 1IP5A 4H9FA 1YAOA 1GFEA 2DQJY 3MGWA 1HMKA 2C8PA 1QDRA 4NWEA 1GB9A 4PPOA 4CGEA 3A91A 2FYCA 1LZYA 4L41A 1LJ3A 1JUGA 3WUAA 1AT5A 2LZ2A 3CT0A 4N1CC 1LZDA 1HEWA 4OWEA 4EOFA 2XBSA 1IWZA 5ILCA 1B7OA 2D4KA 2EIZC 4HTQA 5L3IA 1TEWA 4RW2A 1IC5Y 1IR9A 3J6KA 2Z37A 5KXNA 1LZ4A 4NY5A 1GBXA 4H9EA 4PGJB 4NWHA 5C6IA 1BWIA 2Z12A 1B7MA 3HFMY 4TSBA 1LSFA 2Z38A 1IEEA 3E3DA 1HERA 4XENA 4O34A 1B7LA 5KY1A 5LVJA 4KT3A 4QY9A 1REXA 1OQMA 1C43A 4NGLA 1FLUA 2ZQ4A 4H8YA 1RCMA 4IJ4A 3WU9A 2ZNXY 4J1BA 4DYGA 1BB6A 5B07A 3TXFA 1G7MC 3F6ZA 4OWHA 1LZTA 1IP2A 1NDGC 4B4EA 2Z2FA 1WQOA 2DQHY 3B0OA 2BQNA 4RLNA 1LJNA 1D0KA 4HSFA 1GFRA 3EMSA 1NKHA 5DM9A 4NGOA 1BB3A 2BQDA 4LYOA 3TXGA 3N9AA 5A3ZA 1A2YC 1PS5A 2ZYPA 3A95A 4H91A 2MEBA 1I20A 1BVXA 4CFPA 4G49A 8LYZA 1GB3A 1T6VL 1RFPA 5FDJA 3WVXA 1VDTA 3P68A 3RZ4A 4NEBA 2BQHA 4TWSA 4NFVA 4WM5A 5LVGA 4TUNA 3TXBA 2MEEA 2HUBA 2MEDA 1LZEA 2MEAA 3A90A 4H9CA 4QDNA 1LSZA 4R0FA 1LYSA 4M4OA 1HHLA 3J4GA 4NHTA 2W1LA 3A8ZA 1YKXX 5JENB 4M6DA 3W3EA 3QNGA 1QTEA 4XJFA 5HMJA 3W6FA 1LKSA 4LYZA 2BQGA 3P66A 4HJVA 4BS7A 4WO6A 1I56A 2BQFA 3IJUA 1O23A 3ATNA 4BAPA 1DQJC 3LZ2A 4DDAA 1N4FA 1UA6Y 1J1XY 1LSGA 2AUBA 1IP3A 2F4GA 4PJ2C 5K7OA 1RE2A 4MCKA 1LSAA 2HTXA 4TSCA 4N0JA 1GFJA 1IC4Y 2D4JA 4H9BA 1W08A 2D6BA 5F81A 2ZIKA 1IY3A 1GDXA 1GE4A 3B72A 1LZ8A 4RDSA 1CJ7A 1GFTA 3AGHA 4NHSA 3ULRA 3WVYA 4ET9A 1DI3A 3B0KA 1JJ1A 1LJIA 4H8XA 1ZV5L 2DQGY 1QSWA 4DD2A 1LSDA 1WQRA 4H9AA 4WL7A 4WLDA 1C7PA 3AW7A 3OK0A 1LZNA 3A96A 1ZVYB 1MLCE 5DLAA 2HEAA 1BWHA 3LN2A 5KXMA 4XJBA 1GB0A 1I1ZA 1GB8A 1CKCA 1GDWA 2BQAA 4QGZA 4LYMA 4TX7A 4WMGA 3WU7A 2XBRA 1NBYC 2G4PA 1C10A 1XGTC 4HP0A 1GBSA 3A6CY 1JKCA 1VFBC 5I53A 1NDMC 2X0AA 1RJCB 1TBYA 5DN5A 5E4PA 2Z18A 4I8SA 1IOSA 1W6ZA 3WPLA 1IWUA 1BB5A 1JKAA 3CSRA 4H93A 4EMNA 1WQNA 3CSQA 4B4IA 5KKJA 1OUEA 4BAFA 7LYZA 2DQAA 4C5FA 153LA 1IP4A 1LZCA 1HENA 3WXUA 4C3WA 4W94A 5C6JA 3N9EA 4H8ZA 4GCBA 5HQ1A 1LSEA 4RW1A 2BQKA 2Z19A 1GE1A 3HBDA 4LT2A 1DI5A 1VDPA 4WG1A 4WLYA 5LIOA 1IORA 2EPEA 3B0IA 3W6AA 3WUMA 1GE2A 1G7HC 1QSAA 1SQ2L 4AXTA 2DBTA 2H5ZA 1OUJA 4WM6A 1LMTA 5KXOA 1H87A 2W1YA 1KIRC 5T3FA 3ZVQB 2ZILA 5LAGA 5LA8A 1LMOA 4FJRA 4H94A 2GV0A 3WUNA 1LHHA 1BHZA 5L3HA 3TXJA 2PC2A 1DZBX 2YBIA 4GCCA 1GFHA 1DXJA 5LYTA 1FN5A 1XEJA 4WG7A 4UWVA 4H92A 5KXXA 4XN6A 4Z3MA 4ETAA 4FDYA 3RNXA 1INUA 1IWYA 2ZQ3A 4DWXA 1LYYA 2FBBA 1PZYA 5I54A 1IR7A 1UC0A 2W1XA 1DPXA 1WQMA 1IR8A 4XJHA 2YSSC 4PRUA 3AZ4A 5LAFA 3P65A 1LSNA 4H90A 4HV2A 1QQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RBNA 4KL7A 3TXHA 3WL2A 3RUNA 3QY4A 5AMYA 3TXKA 1VATA 1I6SA 2ZWBA 3C7YA 3AZ7A 2HEFA 3D9AC 4R6CA 1QT5A 1A4VA 1NMMA 2YBJA 2BQJA 4ETCA 3TXIA 250LA 1EQ5A 1KW7A 249LA 4LYTA 159LA 4GLAA 1QS9A 3CT1A 2O7AA 5FELA 5LVHA 5I4WA 1PQMA 1C6QA 3SB7A 1KXWA 1ZVHL 1CV0A 2G4NA 3WMKA 1D9UA 2BQBA 3SB6A 1LHLA 4G4CA 1C6DA 1H6MA 3HBEX 3A3RX 2N5ZA 1BB4A 3G3VA 1D0LA 3WW6A 188LA 1IY4A 1OUIA 4BADA 1EPYA 1LJHA 1EQ4A 1L19A 4YENA 4IASA 1KS3A 1LJ4A 1OUAA 1JTPL 3SBBC 1CX6A 4LT3A 1GF9A 1GD6A 1L17A 1GFGA 1L30A 4UWUA 164LA 4I7SA 1UIGA 2DKVA 157LA 5LVIA 123LA 1C6TA 1P3NA 1JSEA 1LKRA 5LINA 1IWVA 1LYZA 3A94A 3HUAA 2OTZX 2HECA 4W54A 3F8VA 1LPYA 2BAAA 1TDYA 224LA 1GFAA 4W96A 5FSTA 1OP9B 1DYBA 3AZ6A 3CSZA 4OW1A 2OU8A 2F2QA 2Z2EA 1QT3A 3HH4A 3PDSA 2XQOA 1YIKA 227LA 1QDTA 1GFKA 1YAQA 1GE0A 4H9HA 1GF8A 4U3XB 1G0KA 1XGUC 3AW6A 4NGWA 5KXTA 4G4HA 1LYDA 4RLMA 1G0QA 1C6KA 1TAYA 2BQEA 4X3BA 1B7RA 1LZ5A 4II8A 145LA 1L40A 4KXIA 4OWCA 1FKVA 1IOTA 2MECA 3LYMA 5II3A 2NWDX 1CVKA 3DN8A 1HSXA 239LA 1L0JA 1UIHA 231LA 2D4IA 2BQCA 4H1PA 1GAZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1F10 A;  3TXH A;  4KL7 A;  1NQI A;  1CNS A;  1B5Y A;  1KIP C;  2MEH A;  1IOQ A;  4LYC A;  3WL2 A;  1LSB A;  1LZA A;  5B59 A;  1DPW A;  4AGA A;  1LJJ A;  5HNC A;  1OUF A;  3QY4 A;  4NGJ A;  5L9J A;  4N1E I;  5AMY A;  1VAT A;  2ZWB A;  3TXK A;  5C6L A;  4NGV A;  4NIJ A;  3A6B Y;  2Z39 A;  3TMV A;  3AZ7 A;  2FYD A;  4NHP A;  4GN4 A;  4IAT A;  4Z41 A;  2HEF A;  4B0D A;  1JIT A;  3D9A C;  4NSH A;  4OOT A;  4R6C A;  1A4V A;  1LSP A;  1LZ6 A;  2CGI A;  3ATO A;  4YEM A;  3GXR A;  1NMM A;  2G4Q A;  4DC4 A;  2YBJ A;  1BB7 A;  1UID A;  1LOZ A;  2BQJ A;  3LZT A;  1IC7 Y;  5FEK A;  134L A;  3TXI A;  4ETC A;  1EQ5 A;  3AB6 A;  3ZEK A;  1LPI A;  1HFX A;  1LJE A;  4WL6 A;  4OOO A;  4LYT A;  2XTH A;  5APC A;  3QE8 A;  4GLA A;  1NHE A;  1UIE A;  2YBM A;  3AZ5 A;  3CT1 A;  4NGY A;  4XJG A;  1C45 A;  5FEL A;  5A3E A;  5LVH A;  1RI8 B;  5B05 A;  1WTM A;  3AJN A;  3TXD A;  1LZS A;  2CJL A;  3LYO A;  4N5R A;  1LMP A;  4LT0 A;  5I4W A;  2DQC Y;  1AZF A;  2MEI A;  1GFU A;  3N9C A;  1GF6 A;  1KXW A;  2CDS A;  4G4B A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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 4OW1 A;  2OU8 A;  2F2Q A;  2Z2E A;  1QT3 A;  3HH4 A;  3PDS A;  2XQO A;  1YIK A;  227L A;  1QDT A;  1GFK A;  1YAQ A;  1GE0 A;  4H9H A;  1GF8 A;  4U3X B;  1G0K A;  1XGU C;  3AW6 A;  4NGW A;  5KXT A;  4G4H A;  1LYD A;  4RLM A;  1G0Q A;  1C6K A;  1TAY A;  2BQE A;  4X3B A;  1B7R A;  1LZ5 A;  4II8 A;  145L A;  1L40 A;  4KXI A;  4OWC A;  1FKV A;  1IOT A;  2MEC A;  3LYM A;  5II3 A;  2NWD X;  1CVK A;  3DN8 A;  1HSX A;  239L A;  1L0J A;  1UIH A;  231L A;  2D4I A;  2BQC A;  4H1P A;  1GAZ A;  2LYM A;  2RSC A;  1UBZ A;  1XEK A;  4QEQ A;  1B5V A;  4A7D A;  2LYZ A;  1PQJ A;  1C6L A;  4I7O A;  5B06 A;  1SLY A;  1T97 A;  226L A;  3DN1 A;  2Q9D A;  1C69 A;  4OWB A;  205L A;  3WU8 A;  1QUS A;  5ILF A;  1IX0 A;  2BLX A;  1YAP A;  1ZMY L;  1L92 A;  255L A;  1D0M A;  3CQL A;  1LZ9 A;  1XGP C;  3HH3 A;  1LCN A;  1ZWN A;  4GN3 A;  1L14 A;  1UCO A;  1QSB A;  1LHM A;  1B7Q A;  1OV5 A;  1BQL Y;  2DQI Y;  4W51 A;  5I4X A;  137L A;  5EBH A;  5KXP A;  4NSI A;  4YEO A;  1XFP L;  1LHI A;  4GLV A;  1L10 A;  1IVM A;  3HDF A; 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