1OV7A

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 2-allyl-6-methyl-phenol
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ov7A00
3OE0A 250LA 3VW7A 4K5YA 1LYDA 260LA 3CDTA 1LYFA 171LA 248LA 224LA 4YX7C 1L19A 4W52A 215LA 2O7AA 3HTBA 1JTNA 1C6PA 160LA 1KY0A 139LA 1LPYA 3C8SA 3C8RA 3HWLA 1C6AA 2RAZX 3RZEA 168LA 1QT5A 1L54A 1G1VA 1L32A 1SX2A 230LA 3DN6A 1C6IA 1L68A 128LA 3HDFA 251LA 1L25A 3GUIA 1QTHA 3NYAA 1C6EA 178LA 1QTZA 3HDEA 209LA 2OU9A 163LA 1D3MA 1C68A 7LZMA 120LA 166LA 1D9WA 3HH6A 239LA 2OE7X 3HH3A 1C6HA 1L28A 1L46A 1QTDA 258LA 1L41A 227LA 225LA 3SB9A 107LA 1LI6A 4W56A 1L48A 1LI3A 4OO9A 4I7NA 1LYHA 2OU8A 1L58A 1CTWA 1L07A 189LA 1L86A 1DYFA 180LA 1L65A 112LA 1LW9A 1L38A 4I7MA 226LA 4I7RA 1P37A 3HTDA 1C6GA 3FA0A 1QUGA 4PJZA 2RAYX 4I7OA 157LA 1OV7A 2B72A 3DMZA 1D3JA 2F47A 2B7XA 169LA 1LGXA 219LA 1L06A 1L20A 1TLAA 2Z6BA 4W51A 4GBRB 195LA 3GUPA 1C6QA 1CV6A 3HT7A 5I14A 216LA 152LA 1LWKA 1L64A 3GUKA 140LA 1G1WA 1L69A 1QT7A 3QAKA 1KS3A 3CDOA 2B6TA 3HTGA 1LGWA 2B70A 2B6XA 159LA 1L24A 1P6YA 3NY9A 1OWZA 170LA 4ARMA 1P46A 1KW5A 1L45A 2O4WA 1C65A 1CV5A 1L95A 174LA 1L87A 1L26A 4EPFA 175LA 1DYGA 3JR6A 237LA 236LA 1L51A 1PQKA 1T8GA 2B6WA 1QSQA 3HU9A 1D3FA 126LA 1L72A 1L79A 1L98A 2RBSA 241LA 3DNAA 1I6SA 1L31A 1CX7A 249LA 1ZURA 1C66A 2ANXA 1CU6A 2RBPA 1L59A 1L82A 1C69A 4I7KA 3GUMA 1L77A 2RBNA 1DYDA 1QTVA 3GULA 4ARPA 155LA 1OYUA 4ARQA 3HH4A 3C80A 1ZYTA 151LA 3HT8A 138LA 242LA 1PQIA 1L11A 2OE4X 4EKSA 1P7SA 1L92A 1NHBA 3V2YA 1CV3A 1LGUA 1OWYA 1L0KA 246LA 1G06A 1L00A 4W57A 1PQOA 2OTYX 231LA 3C8QA 1C6MA 256LA 1CU3A 1DYAA 3F9LA 190LA 198LA 1L71A 1L80A 3HT6A 2OU0X 1ZWNA 172LA 3HTFA 4S0WA 1L23A 1PQJA 1C6FA 1SX7A 244LA 1CUQA 201LA 4PK0A 238LA 254LA 1L09A 1L43A 114LA 127LA 104LA 188LA 3DN4A 110LA 1G0PA 2F32A 1L12A 1SSWA 131LA 3L2XA 1OVJA 4EKPA 3PDSA 1L42A 1L29A 1LI2A 245LA 3SN6R 243LA 4EPIA 1C6NA 123LA 1L0JA 4I7TA 1C6CA 1L81A 2IGCA 3HUKA 2HUKA 1L02A 1L01A 1L67A 4ARJA 3SB7A 1PQDA 1L18A 3G3XA 2B73A 3C7YA 3HH5A 1WTHA 4W58A 1L76A 1LYEA 211LA 1L13A 4LDLA 200LA 210LA 1L60A 1KW7A 220LA 1P64A 1T8AA 1L94A 1L30A 3DMXA 1G0MA 111LA 1L10A 2Q9EA 3C7ZA 103LA 4I7SA 1L75A 232LA 2LCBA 4AQNA 1QUHA 1L97A 1L36A 3RUNA 164LA 1QTCA 4I7QA 1CU0A 113LA 1KNIA 142LA 1QT4A 1L22A 4EXMA 1L53A 2NTGA 1D2WA 1QSBA 3DN0A 1G0LA 3DN3A 1L57A 181LA 261LA 2LZMA 4IAPA 3SBBC 2CUUA 247LA 1QT8A 1L83A 3DKEX 1CUPA 122LA 3L64A 1QT6A 1L56A 5LZMA 3HUAA 3SBAA 1P2RA 217LA 2RB0X 257LA 1JTMA 1CV0A 1XEPA 143LA 3CDVA 1L33A 3HU8A 1QT3A 3K2RA 3OE9A 2B6ZA 115LA 4EKRA 2RB1X 3DN1A 1L61A 1C6TA 1L52A 6LZMA 144LA 235LA 1C6BA 1EPYA 102LA 3UONA 214LA 2LC9A 141LA 1C60A 3OE6A 1XJUA 1L40A 3GUOA 1L91A 240LA 4GRVA 3SB6A 1D2YA 1C6JA 1L84A 1L66A 1C6LA 3SB5A 1C62A 1L35A 4ARLA 1L50A 1QS9A 2L78A 4DKLA 4I7PA 173LA 1PQMA 3DN2A 176LA 3G3VA 4LDOA 212LA 2HUMA 1L63A 187LA 1DYCA 4W54A 1T6HA 1L16A 1L99A 149LA 1C63A 1C6KA 1L17A 3HT9A 2RBRA 145LA 1P5CA 1LYGA 3HUQA 4W55A 4ARMB 1L96A 3DN8A 205LA 146LA 1D3NA 233LA 4YXCA 1QTBA 1CU5A 4YXAC 148LE 253LA 2B75A 125LA 1L62A 1P2LA 3C83A 1LLHA 162LA 222LA 1L27A 229LA 109LA 1QUOA 150LA 3C82A 1P36A 2B74A 4LZMA 2B6YA 177LA 1L89A 1SSYA 1T8FA 1CVKA 1DYBA 1T97A 2ANVA 199LA 1L39A 130LA 2F2QA 1K28A 4LDEA 118LA 206LA 4ARQB 1L49A 1LYJA 184LA 1OVHA 191LA 4I7LA 1QS5A 221LA 1L47A 167LA 129LA 1G07A 3CDQA 3V2WA 3D4SA 2RB2X 228LA 165LA 1L37A 1XJTA 2A4TA 3CDRA 234LA 3NY8A 156LA 213LA 2OTZX 137LA 1G0JA 1CX6A 1QUDA 3ODUA 2RH1A 119LA 1OVKA 2RBQA 197LA 1L74A 1SWYA 4W53A 4EKQA 2QB0B 1L08A 1L34A 147LA 1C61A 259LA 2O79A 4DAJA 1OV5A 4W59A 1C6DA 1C64A 108LA 4EJ4A 3FI5A 1L05A 2Q9DA 3EMLA 158LA 1G0GA 1L55A 4ZPUA 2OE9X 1LWGA 255LA 3C7WA 185LA 1L03A 2QARC 252LA 3PBLA 218LA 1DYEA 1L93A 1L70A 1L85A 2OEAX 1L88A 183LA 2HULA 1L90A 186LA 1L21A 1SWZA 3OE8A 2RBOA 1B6IA 4DJHA 1G0QA 1L73A 1P3NA 1LYIA 1G0KA 2NTHA 3GUNA 1L44A 1CV4A 1CU2A 1C67A 3DMVA 3GUJA 1KY1A 3FADA 4E97A 1L14A 1CV1A 192LA 3F8VA 1L04A 223LA 1JQUA 1P56A 3LZMA 3G3WA 161LA 4I7JA 196LA 3C81A 182LA 3SB8A 262LA 1L15A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4K5YA 1YROA 1LYFA 248LA 1UIDA 2PC2A 1LMQA 215LA 2O7AA 1JEFA 4NGYA 132LA 1IP7A 4WM3A 2I26L 1LPYA 4NGVA 1CJ8A 5C6JA 3C8SA 3C8RA 1IWZA 168LA 1QT5A 1L54A 1G1VA 230LA 2W1LA 3A67Y 1YAOA 1C6IA 3CSZA 251LA 1KIQC 3WVXA 1QTHA 1HEOA 2YBMA 209LA 1LAAA 2CDSA 1G7IC 1NBYC 1C68A 1B9OA 3HH6A 239LA 2OE7X 5LA5A 1L28A 3GXRA 258LA 1NQIA 1GDXA 1ZVYB 225LA 2CWIA 107LA 1L48A 1LI3A 4OO9A 3LYMA 1L58A 1CTWA 1YAMA 4GLAA 4H1PA 1GFHA 112LA 1LW9A 3HFMY 226LA 4I7RA 4ZEEA 1C6GA 4PJZA 4QY9A 2D6BA 3DMZA 3B0OA 4QGZA 2ZILA 1D3JA 219LA 5DN5A 4D9ZA 4GBRB 4LYTA 3IJUA 1GFAA 2GV0A 4H8ZA 152LA 5ILCA 3QAKA 1WQPA 4N8ZA 4NY5A 2B6XA 4TTDA 1LHKA 1P6YA 3NY9A 3OJPA 170LA 2HU3A 4ZIXA 1DZBX 1P46A 1KW5A 4IATA 4CHXA 2YBNA 1CV5A 3AZ4A 2G4QA 174LA 175LA 1XEKA 2BQNA 1PQKA 1T8GA 2B6WA 1HFZA 1L98A 3TMWA 4H91A 7LYZA 4GN4A 5KXPA 1JUGA 249LA 1SQ2L 4PRQA 3F6ZA 4BS7A 3WUAA 2BQDA 1DYDA 1LHIA 1LMNA 2HECA 4ET8A 151LA 3W6DA 4G4BA 4PRUA 1CV3A 1OWYA 2DQHY 3RT5X 2Z19A 2YBJA 5F9XA 1IVMA 1PQOA 4LZTA 3C8QA 2EQLA 4GCDA 1CU3A 3FE0A 198LA 1LMOA 5HLLA 4M4OA 1GE2A 1L80A 2OU0X 5B1GA 1GBXA 1L23A 1PQJA 5HMVA 254LA 1UUZC 3WW5A 4OWAA 5F14A 1SLYA 110LA 4WG1A 5HQ1A 1L12A 4KPMA 2EKSC 3W6CA 2G4NA 2DQAA 4E3UA 1LKSA 4OWBA 1LI2A 243LA 4EPIA 1C6NA 3J6KA 1L0JA 4I7TA 5I4YA 2HUKA 4NHQA 1L67A 1YIKA 1L18A 1TAYA 3G3XA 4NGWA 4C3WA 1IC4Y 1WTHA 1B7LA 3CT0A 1O23A 4W58A 1LYEA 1KIRC 1B7NA 1LJ4A 1LSEA 1FN5A 200LA 1MELL 2HUBA 210LA 220LA 2XJWA 4KXIA 1T8AA 3DMXA 5KXOA 4HP0A 1L10A 2Q9EA 1L75A 4I0CA 4J0LA 3AGIA 1QUHA 5EBHA 3WPJA 1L97A 3A6CY 1GAZA 1DI5A 4I7QA 5IHGA 1DKKA 113LA 4RDSA 3OK0A 2NTGA 1D2WA 2VB1A 3DN0A 1GXV2 2Q0MX 2LYOA 4FDYA 4IJ4A 1L57A 3IJVA 2CUUA 5LIOA 5DL9A 1CUPA 3L64A 3QNGA 3SBAA 1BQLY 217LA 1CV0A 3LN2A 2XBRA 1GAYA 1L33A 3K2RA 1QT3A 1OUDA 1G7JC 2B6ZA 1XGUC 2W1YA 1W08A 4OW1A 1C6TA 2DKVA 235LA 1EPYA 1HEWA 2LC9A 141LA 2LYZA 1C60A 1QSWA 4WL6A 5F16A 240LA 2MEFA 4H90A 1L66A 1C6LA 5LYZA 1C62A 3ULRA 3WYHA 4WLDA 1GE4A 1J1OY 4DC4A 2YBIA 4I7PA 5I5QA 2ZNXY 3DN2A 212LA 2HUMA 1H87A 4P2EA 187LA 4NGIA 1GF8A 4W54A 1YAQA 1L16A 1L99A 1JTOL 2BQEA 1REMA 1B5UA 1C6KA 3HT9A 2RBRA 2Z39A 1IP4A 5HNCA 4DDCA 1HMLA 3T36A 1GB3A 4GCCA 1LZ5A 4TX7A 146LA 1QTBA 4XJDA 1CU5A 4CJ2A 4NHIA 5KKIA 3VWOA 4G4HA 5APDA 3C83A 229LA 3A90A 4LFXA 1QUOA 3J4GA 1LSGA 4NGLA 1CVKA 1JWRA 1T97A 1WQOA 4LDEA 1VDTA 206LA 184LA 4WMGA 4EOFA 4J1BA 4MCKA 3HBDA 129LA 3V2WA 3AZ5A 5E4PA 3A95A 1LJKA 165LA 1XJTA 1DKJA 2LHMA 1QTEA 156LA 1CKGA 1CX6A 1W6ZA 3ODUA 3HBEX 2IHLA 1IOSA 5LYMA 4H9IA 4WM1A 1FKVA 1SWYA 1JKCA 1L08A 4UWUA 1P2CC 3MGWA 108LA 4ETCA 1GHLA 4NGJA 4YEOA 3A93A 4HTKA 1UC0A 5LVJA 218LA 1NWGA 1GFTA 1RFPA 2OEAX 4OWEA 4N9RA 4XJFA 2HULA 1D0KA 1GFVA 1L21A 1QDTA 2RBOA 4L41A 4DQ5A 1G0QA 1L73A 1LZDA 1C67A 1B2KA 4DYGA 4YF2A 3LZTA 4E97A 3WMKA 3F8VA 1L04A 3A6BY 1LCNA 1P56A 2BQIA 4PGJB 1YILA 161LA 5LYTA 1LYSA 196LA 4B4IA 1JISA 3C81A 3SB8A 1LSNA 3N9EA 250LA 1GBOA 171LA 2HEDA 1UIFA 1JTNA 3P64A 1KY0A 3WXUA 3WU7A 5II3A 2ZIKA 2RAZX 2BQKA 2F4GA 1GFUA 1I1ZA 1VAUA 4H8YA 1B5YA 1F6RA 1L25A 4GN5C 3NYAA 1D6QA 3AJNA 1FLQA 2OU9A 4ANRA 3TMXA 1UIEA 1XGQC 120LA 166LA 4WM5A 1GDWA 1WVUA 1IOQA 3HH3A 1QTDA 2B5ZA 4RW1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4K5Y A;  1YRO A;  1LYF A;  248L A;  1UID A;  2PC2 A;  1LMQ A;  215L A;  2O7A A;  1JEF A;  4NGY A;  132L A;  1IP7 A;  4WM3 A;  2I26 L;  1LPY A;  4NGV A;  1CJ8 A;  5C6J A;  3C8S A;  3C8R A;  1IWZ A;  168L A;  1QT5 A;  1L54 A;  1G1V A;  230L A;  2W1L A;  3A67 Y;  1YAO A;  1C6I A;  3CSZ A;  251L A;  1KIQ C;  3WVX A;  1QTH A;  1HEO A;  2YBM A;  209L A;  1LAA A;  2CDS A;  1G7I C;  1NBY C;  1C68 A;  1B9O A;  3HH6 A;  239L A;  2OE7 X;  5LA5 A;  1L28 A;  3GXR A;  258L A;  1NQI A;  1GDX A;  1ZVY B;  225L A;  2CWI A;  107L A;  1L48 A;  1LI3 A;  4OO9 A;  3LYM A;  1L58 A;  1CTW A;  1YAM A;  4GLA A;  4H1P A;  1GFH A;  112L A;  1LW9 A;  3HFM Y;  226L A;  4I7R A;  4ZEE A;  1C6G A;  4PJZ A;  4QY9 A;  2D6B A;  3DMZ A;  3B0O A;  4QGZ A;  2ZIL A;  1D3J A;  219L A;  5DN5 A;  4D9Z A;  4GBR B;  4LYT A;  3IJU A;  1GFA A;  2GV0 A;  4H8Z A;  152L A;  5ILC A;  3QAK A;  1WQP A;  4N8Z A;  4NY5 A;  2B6X A;  4TTD A;  1LHK A;  1P6Y A;  3NY9 A;  3OJP A;  170L A;  2HU3 A;  4ZIX A;  1DZB X;  1P46 A;  1KW5 A;  4IAT A;  4CHX A; 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