1OVHA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 2-chloro-6-methyl-aniline
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ovhA00
2OU0X 1G0PA 1L59A 1G0KA 3DMXA 168LA 4I7JA 212LA 1QTZA 3HU8A 188LA 1L14A 1L13A 1L62A 245LA 1DYCA 2LCBA 1LPYA 3OE0A 3EMLA 1DYBA 236LA 1CX6A 3FADA 3HDFA 4I7RA 4LDEA 144LA 1L84A 1L35A 213LA 4ARMB 1C6KA 148LE 3CDOA 1D3MA 2HULA 1C6NA 4W59A 4EKPA 1SSWA 4LZMA 1QT8A 1C6AA 1L28A 1P2RA 4YXCA 2B6TA 5I14A 1L66A 3GUMA 3GULA 1L76A 4GBRB 1L87A 177LA 108LA 186LA 262LA 1L99A 3NYAA 3SB5A 1ZWNA 1PQMA 147LA 4ARPA 130LA 161LA 1OVKA 1L71A 139LA 1L05A 3DN1A 3C83A 3G3VA 1L97A 162LA 3DN6A 254LA 2Z6BA 155LA 2L78A 3K2RA 1P3NA 2ANVA 123LA 138LA 3GUKA 1QSQA 3C8SA 2IGCA 1L20A 3GUPA 1CTWA 180LA 5LZMA 2HUKA 1CU5A 2B6YA 237LA 1L70A 1P7SA 3HTGA 1LGUA 3CDQA 4ARLA 221LA 1L17A 1L89A 1C62A 2OTYX 2RBOA 2CUUA 171LA 1ZURA 1L41A 2O7AA 1JTMA 185LA 195LA 149LA 2OU8A 1L51A 3HUQA 4PJZA 1G0JA 200LA 192LA 1L79A 3NY8A 1P46A 3DN4A 1L53A 4ARQB 1LYDA 1C67A 1KNIA 1LYIA 1LWKA 4I7MA 199LA 2B7XA 2O4WA 1L01A 3DN3A 164LA 2B6XA 4DKLA 1C6DA 2F32A 3JR6A 247LA 1L58A 170LA 2OTZX 3DN0A 3HT8A 1C6GA 250LA 140LA 1KW5A 1LGXA 3GUNA 232LA 1CX7A 1KS3A 4EKRA 1L47A 125LA 137LA 1L31A 181LA 1L80A 3CDRA 4LDOA 1G0GA 1C63A 1L16A 1QSBA 238LA 4I7KA 1CV3A 216LA 4PK0A 1T97A 1L81A 1L23A 258LA 172LA 1LYJA 1L64A 2F47A 2QARC 4DJHA 4EXMA 127LA 1C60A 1OV5A 3LZMA 1CV1A 2B72A 3DMVA 3G3WA 1PQJA 1QUHA 1C68A 4W53A 3C81A 215LA 3SB6A 1C6QA 1QTDA 201LA 2OEAX 1QS5A 239LA 2RBPA 1G0QA 146LA 2OE4X 1L04A 2OE9X 150LA 183LA 235LA 244LA 3FI5A 143LA 1P5CA 1G1VA 4W58A 1OWZA 3OE9A 1XEPA 4ARMA 1C6JA 1DYAA 3GUOA 3C80A 2Q9EA 1C6MA 3DN2A 1L10A 2B73A 249LA 1C66A 223LA 198LA 3L2XA 1C6BA 102LA 219LA 165LA 3DNAA 3GUIA 1CV5A 1L93A 3V2YA 3F9LA 128LA 3SB8A 1L00A 3D4SA 1CU6A 217LA 3C8QA 1C6HA 114LA 120LA 1L09A 1L12A 3RUNA 1CU3A 227LA 3CDVA 2O79A 209LA 107LA 1L34A 246LA 1LW9A 3SB9A 210LA 1C6PA 225LA 3PBLA 2OE7X 1L24A 3HWLA 184LA 152LA 1L56A 112LA 1L27A 1P37A 205LA 1DYGA 3QAKA 1LI2A 1L96A 1L0JA 196LA 4I7SA 1L88A 1CV6A 1CVKA 111LA 1L45A 1L63A 1PQIA 3SN6R 1C69A 1SSYA 4I7LA 1L36A 1L82A 1L32A 1I6SA 1P64A 4K5YA 3HT9A 4YXAC 1L29A 4ARQA 1DYFA 1LYHA 3HUKA 1QT4A 3HT6A 3RZEA 2RB2X 7LZMA 4OO9A 1P36A 1L65A 2F2QA 1QTBA 1L22A 2RBNA 166LA 251LA 1PQDA 1QT5A 3HH6A 3HH4A 1T8AA 1LLHA 255LA 1KW7A 3UONA 240LA 1L83A 4W57A 174LA 1XJUA 3G3XA 1OWYA 3PDSA 1L39A 3HT7A 110LA 211LA 122LA 3OE8A 260LA 113LA 2B6ZA 3C8RA 4IAPA 4EPIA 189LA 197LA 1L25A 1SWZA 1XJTA 1L30A 4DAJA 1L40A 3VW7A 1C64A 1G0MA 1L75A 4EJ4A 1D2WA 1CV4A 126LA 4GRVA 103LA 1G1WA 1L90A 1QS9A 3OE6A 6LZMA 145LA 2RAZX 3C7WA 1D3FA 214LA 4I7NA 1LWGA 1L46A 1QUDA 4W51A 1OV7A 1SX2A 1L11A 1L48A 2RH1A 1T6HA 243LA 2RB0X 1NHBA 1L60A 1C6FA 175LA 1P56A 230LA 178LA 1DYEA 2Q9DA 182LA 1G0LA 257LA 2NTHA 3HTFA 1P6YA 1D9WA 1C6IA 3HUAA 1PQOA 1KY1A 4W54A 4AQNA 1B6IA 157LA 1L61A 1L49A 4ARJA 1G06A 4I7OA 1P2LA 141LA 1QT3A 3HDEA 104LA 1L21A 1LYFA 3HU9A 1QUOA 1L68A 231LA 2LC9A 2RB1X 1LI3A 163LA 1JQUA 1QTVA 3HH5A 3CDTA 169LA 1L72A 1C6TA 2B74A 1C6EA 234LA 1C65A 222LA 3DKEX 1L06A 4EKQA 3HTBA 187LA 2A4TA 259LA 2RAYX 3FA0A 1EPYA 1LYGA 1T8FA 1QTCA 1CU0A 4S0WA 241LA 167LA 2LZMA 142LA 226LA 1C6LA 1L38A 2QB0B 2RBQA 1L67A 3SB7A 156LA 252LA 4EKSA 1L03A 1TLAA 3C82A 1DYDA 1C6CA 1CUQA 3DMZA 1L85A 261LA 2B70A 1L57A 1G07A 3C7YA 1L77A 1LI6A 1OVHA 3L64A 1L15A 158LA 1L73A 1L69A 4W52A 1LGWA 191LA 2HUMA 160LA 248LA 1T8GA 173LA 1L54A 1L98A 1L94A 4ZPUA 3V2WA 1SX7A 2RBSA 129LA 3NY9A 3C7ZA 1L08A 1L74A 2OU9A 1L43A 176LA 1L0KA 1L37A 224LA 206LA 1WTHA 2NTGA 2B6WA 1L07A 1L52A 1L44A 1LYEA 1QUGA 4I7PA 1C61A 228LA 1K28A 242LA 1D3NA 4I7TA 256LA 3SBBC 1L02A 1L92A 1SWYA 4EPFA 253LA 1KY0A 4I7QA 1OYUA 1L33A 2B75A 4W56A 131LA 1L55A 1L18A 1CU2A 109LA 1CUPA 190LA 3F8VA 3DN8A 3HH3A 3HTDA 1L26A 151LA 1L95A 159LA 1L91A 1D2YA 4E97A 3GUJA 1L86A 1OVJA 233LA 119LA 4YX7C 4W55A 1PQKA 1JTNA 1L50A 1QT7A 3ODUA 2RBRA 1D3JA 1ZYTA 115LA 220LA 1L42A 1QT6A 3SBAA 1QTHA 4LDLA 1L19A 118LA 229LA 1CV0A 2ANXA 218LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NFVA 1JEFA 212LA 3HU8A 1L13A 245LA 1DYCA 1LPYA 3A3QA 3OE0A 1DYBA 236LA 2BQBA 5I4XA 1L35A 213LA 2CJLA 1C6KA 1BVKC 3CSQA 5LA8A 1FLQA 2H9KA 1HFZA 5KXTA 2F30A 1D0LA 4YXCA 2B6TA 1CJ7A 1L66A 3GUMA 1I56A 3GULA 4GBRB 4XJDA 2I6ZA 1BWHA 1RCMA 153LA 4WO9A 1XEKA 4LT0A 4J7VA 1GF5A 2Z19A 1L97A 3ULRA 5KXYA 4B49A 1AKIA 1JPOA 3K2RA 1P3NA 2ANVA 4H9FA 1UACY 4H9IA 3EXDA 5E4PA 3LZTA 1L20A 3GUPA 5LZMA 2MEBA 1D9UA 221LA 1L17A 4KT3A 171LA 3G3AB 1GE1A 1JTMA 1LZEA 1L51A 1JTOL 200LA 1LSFA 192LA 1KIPC 3NY8A 1L53A 3LYOA 1LYDA 5KXPA 1KNIA 2MEIA 4J1AA 4I7MA 2B7XA 2CGIA 1V7SA 3DN3A 1C6DA 1LMNA 3JR6A 3VWOA 4XYYA 1HSWA 4YEOA 170LA 1D6QA 3HT8A 1LZ6A 1C6GA 3WVXA 1YROA 2H9JA 3WPKA 1L47A 4AGAA 5F9UA 137LA 1L31A 1UICA 4LDOA 1L16A 1D0KA 4PK0A 1T97A 5ILFA 1B5VA 5LVKA 1L23A 1IR7A 2F47A 4NGIA 2F4AA 2QARC 1GFRA 1JKBA 4DJHA 1LJKA 3LZMA 1CV1A 3G3WA 1FDLY 5B59A 1C68A 4NGWA 1XGTC 4DT3A 5ILCA 1QTDA 201LA 1UA6Y 1QS5A 2OEAX 4TWSA 239LA 4B1AA 3OJPA 1G0QA 1YL0X 2FYDA 3J4GA 4DD9A 1YAPA 150LA 1YQVY 1P5CA 1NDGC 3A93A 1UC0A 2MEFA 3DN2A 1T3PA 3WL2A 2DQCY 1VATA 4Z98A 198LA 1YKZX 1C6BA 102LA 2BQDA 3WXUA 3V2YA 1IIZA 5KKIA 4GLVA 3M18B 3C8QA 4NHPA 1G7LC 120LA 1G7IC 1L09A 3WUAA 3N9AA 5LAGA 2O79A 107LA 1JJ0A 1LW9A 3SB9A 1C45A 1BWJA 1NQIA 4H8ZA 3PBLA 1UIAA 1L24A 4UWUA 1SLYA 3HWLA 1L56A 1LI2A 1L88A 1CVKA 1JTPL 111LA 4H9BA 4NIJA 1GF6A 4LYOA 3SN6R 1C69A 1QIOA 1SSYA 3A6BY 1LJGA 1WVVA 2D6BA 3A96A 4ARQA 1LCNA 4HSFA 1BB5A 1LTMA 1LSNA 1TCYA 4XJBA 3RZEA 1P36A 3TXEA 4LYBA 1UIBA 5HMJA 251LA 1PQDA 2WARA 3P64A 1B7QA 1KW7A 1VDQA 240LA 174LA 1XJUA 4CHXA 1L39A 3HT7A 1YIKA 2YBLA 3AGIA 113LA 4LYZA 3A95A 1L25A 1XJTA 3TMUA 1L30A 4DAJA 5I5QA 1L75A 5B1FA 2PC2A 5LYZA 5KY1A 4J1BA 5DM9A 4NSGA 3AZ5A 4GRVA 103LA 1QS9A 4HJVA 1IC5Y 2BQOA 3C7WA 4I7NA 1B0DA 5A3EA 1L46A 1REXA 2RH1A 1T6HA 3OK0A 3AYQA 4OWCA 3QNGA 1G0LA 1HHLA 1C6IA 3HUAA 1UIGA 5LVGA 1PQOA 1KY1A 4AQNA 1L61A 1JKCA 1L49A 1GF4A 104LA 5EBHA 2ZQ3A 4H8YA 2RB1X 163LA 1L72A 1C6EA 1OUAA 1C65A 2MEHA 1GFTA 1LJNA 3TXGA 3FA0A 4H93A 3WUNA 1IWXA 1KXWA 4WMGA 1LZGA 1BHZA 4MCKA 1QTCA 4S0WA 241LA 226LA 1L38A 2QB0B 3SP3A 1I1ZA 1MLCE 1HFXA 4EKSA 1L03A 3C82A 1LSPA 4N5RA 1QSWA 1L77A 3A67Y 1E8LA 1GPQC 1L73A 4ETEA 4CFPA 207LA 4DD1A 1B5UA 3P68A 1LZYA 1JJ1A 1P2CC 4H1PA 1LZTA 2RSCA 1L94A 5LAFA 4ZFPA 5FHWA 3C7ZA 1LZRA 1L08A 1B7MA 1L74A 2OU9A 1L43A 1NKHA 3F6ZA 4XENA 4TX7A 3CB7A 206LA 1WTHA 3A90A 2B6WA 1L52A 1L44A 2B5ZA 2LZ2A 3CSZA 1L92A 4EPFA 2DQIY 3GXRA 4I7QA 4WLTA 3A8ZA 2B75A 4RLNA 1LHJA 1L55A 1L18A 1CKFA 1GEZA 1B7OA 1LHLA 3DN8A 3HTDA 4OWAA 4EOFA 1BB7A 1NBYC 4E97A 1OVJA 4HJZA 3AGHA 1L50A 3E3DA 1D3JA 1LSYA 2ZQ4A 3B0OA 1LSEA 1VFBC 1JJ3A 1QT6A 229LA 1AT6A 2OU0X 1G0PA 5DL9A 4WOAA 168LA 188LA 1L14A 1L62A 1LZSA 2LCBA 5AMYA 4KL7A 1CX6A 2DKVA 4HTNA 1LSAA 1IP3A 2VB1A 2W1XA 1LZ5A 1OUJA 3CDOA 1D3MA 2HULA 5LYMA 1IWZA 4W59A 4LZMA 4NSIA 4DWXA 1GBZA 1P2RA 1WVUA 1L87A 4ANRA 108LA 2DBTA 1CKHA 3SB5A 4ARPA 1UIEA 2LHMA 130LA 4NY5A 1GFKA 1LYSA 1IO5A 4ZIXA 1OVKA 2XBSA 1DKKA 1LJEA 139LA 1IC4Y 3CT5A 5I4WA 1ZVYB 3RZ4A 2HEAA 162LA 5KJ9A 5KXLA 3MGWA 2Z6BA 2L78A 3C8SA 5B06A 2DQDY 1XFPL 1CU5A 1IP5A 3CDQA 4ARLA 1QUSA 5HNLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4NFV A;  1JEF A;  212L A;  3HU8 A;  1L13 A;  245L A;  1DYC A;  1LPY A;  3A3Q A;  3OE0 A;  1DYB A;  236L A;  2BQB A;  5I4X A;  1L35 A;  213L A;  2CJL A;  1C6K A;  1BVK C;  3CSQ A;  5LA8 A;  1FLQ A;  2H9K A;  1HFZ A;  5KXT A;  2F30 A;  1D0L A;  4YXC A;  2B6T A;  1CJ7 A;  1L66 A;  3GUM A;  1I56 A;  3GUL A;  4GBR B;  4XJD A;  2I6Z A;  1BWH A;  1RCM A;  153L A;  4WO9 A;  1XEK A;  4LT0 A;  4J7V A;  1GF5 A;  2Z19 A;  1L97 A;  3ULR A;  5KXY A;  4B49 A;  1AKI A;  1JPO A;  3K2R A;  1P3N A;  2ANV A;  4H9F A;  1UAC Y;  4H9I A;  3EXD A;  5E4P A;  3LZT A;  1L20 A;  3GUP A;  5LZM A;  2MEB A;  1D9U A;  221L A;  1L17 A;  4KT3 A;  171L A;  3G3A B;  1GE1 A;  1JTM A;  1LZE A;  1L51 A;  1JTO L;  200L A;  1LSF A;  192L A;  1KIP C;  3NY8 A;  1L53 A;  3LYO A;  1LYD A;  5KXP A;  1KNI A;  2MEI A;  4J1A A;  4I7M A;  2B7X A;  2CGI A;  1V7S A;  3DN3 A;  1C6D A;  1LMN A;  3JR6 A;  3VWO A;  4XYY A;  1HSW A;  4YEO A;  170L A;  1D6Q A;  3HT8 A;  1LZ6 A;  1C6G A;  3WVX A;  1YRO A;  2H9J A;  3WPK A;  1L47 A;  4AGA A;  5F9U A; 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