1OWYA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 2-propyl-aniline
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1owyA00
237LA 1L54A 2RBQA 155LA 3HDEA 1P5CA 2B6YA 1L79A 245LA 1LGWA 1LWKA 149LA 246LA 238LA 2RAYX 1CU0A 1CV6A 1L39A 1L69A 103LA 1G0LA 1DYDA 1JTNA 2B6ZA 1L76A 1CX6A 1L87A 4ARLA 2B7XA 4YX7C 181LA 239LA 247LA 2O7AA 214LA 4AQNA 1KNIA 4ARQA 137LA 1L31A 1D3MA 1C64A 1L73A 1P36A 1C6QA 1LGXA 1D2WA 2CUUA 1L51A 3CDVA 4W57A 114LA 2B73A 1PQMA 2RAZX 1L37A 1L98A 138LA 1KY1A 1CV1A 1L66A 229LA 3C7WA 3D4SA 1C6HA 1DYFA 1CX7A 1G1WA 1L92A 2ANXA 3SB7A 1SX2A 4OO9A 3HT8A 3CDTA 1CV0A 1L85A 2OTYX 1JTMA 1QTBA 1C68A 1L29A 3DMVA 3RZEA 169LA 4W54A 4I7PA 3ODUA 1L23A 3DN4A 3HDFA 7LZMA 1QTZA 3SB6A 2OE7X 173LA 1QTCA 1L42A 4EPIA 1L48A 3DN2A 4DKLA 4I7MA 2QB0B 2OE9X 4I7TA 1L16A 1D3FA 1G0PA 1LWGA 119LA 205LA 3DMXA 1D3NA 233LA 2OTZX 4W52A 1C63A 1C67A 2RB1X 192LA 1L36A 1QSBA 1QSQA 2Q9DA 2Q9EA 184LA 4I7SA 197LA 1QT7A 3GUIA 3DN3A 1L52A 3RUNA 1L89A 3GUNA 1P6YA 248LA 1C69A 128LA 211LA 4ZPUA 1P46A 1L35A 2OU8A 1PQDA 2NTGA 1L97A 1P7SA 2B75A 4PJZA 1G0JA 2RBNA 1OV5A 157LA 175LA 1L28A 1L15A 122LA 1CU6A 1L14A 228LA 2OU0X 4I7RA 1T6HA 1QT4A 1L95A 1QTDA 221LA 1PQIA 1L24A 1D3JA 1OV7A 3C83A 241LA 3GULA 107LA 213LA 2RBSA 1ZWNA 2IGCA 2LC9A 4I7QA 232LA 3HWLA 1SX7A 1L32A 1L59A 156LA 1C6EA 1P64A 1DYEA 1SSYA 3GUMA 1L34A 4I7NA 1L67A 1XEPA 4PK0A 3DNAA 2RB0X 1L91A 2F2QA 3DN8A 3LZMA 1G0QA 2OE4X 1L77A 1C6GA 1QS5A 1DYCA 195LA 1L0KA 3C8SA 4YXAC 1LYJA 1L70A 2Z6BA 4DJHA 3GUKA 1D2YA 4S0WA 1QT6A 1L72A 1L93A 236LA 261LA 1C60A 1QT3A 3OE8A 2B70A 3CDOA 1I6SA 1ZURA 143LA 110LA 2QARC 2LZMA 1OVHA 1L13A 1LI6A 140LA 4I7KA 4ARJA 1P2RA 4GRVA 1C6AA 1C6DA 2RB2X 102LA 5I14A 1L81A 3CDQA 1QUOA 201LA 2F32A 2RBPA 165LA 3F8VA 166LA 1L61A 3VW7A 4I7LA 252LA 2B72A 1LYEA 111LA 118LA 3C7YA 1T8GA 188LA 1L80A 4ARMB 1KW5A 3SBBC 1LI2A 1L74A 1L40A 3G3WA 196LA 1P3NA 3SBAA 108LA 1L33A 1QUGA 1L25A 206LA 1CU2A 3OE6A 3G3VA 183LA 1T8FA 4W59A 3C82A 1L12A 1L86A 145LA 1L04A 1L0JA 1XJTA 1L99A 2RBRA 3SN6R 109LA 3DN0A 1L06A 1L62A 1L68A 2B6TA 3HTGA 2L78A 1L17A 1LYHA 1CU3A 242LA 258LA 3L2XA 1D9WA 4YXCA 1L43A 3HH5A 1KS3A 148LE 200LA 3UONA 1QT5A 182LA 249LA 1LYDA 1L01A 1XJUA 253LA 2F47A 3HH3A 3SB9A 4EJ4A 129LA 2OEAX 1JQUA 1L07A 234LA 1L57A 1PQOA 1C6TA 1L83A 1C6FA 1LYIA 3GUOA 142LA 1SWZA 3C81A 3SB5A 164LA 1L56A 170LA 3FA0A 1L22A 3HT7A 126LA 1QUHA 1L44A 144LA 2A4TA 2OU9A 3SB8A 1OVJA 4K5YA 4E97A 1C6IA 4W55A 1L05A 1G1VA 259LA 244LA 172LA 1C6NA 222LA 1OYUA 4LZMA 1L03A 1P2LA 1L94A 168LA 1L71A 3OE0A 1CTWA 254LA 3DN1A 1QT8A 1G0MA 1P37A 1C6JA 1QUDA 160LA 1C6LA 3FADA 3GUJA 1KW7A 1LPYA 3HUQA 1TLAA 178LA 150LA 3NY8A 1L50A 4EXMA 3HTFA 2HULA 1C62A 210LA 4EKPA 240LA 3HUKA 1CUQA 1L84A 3QAKA 4EKSA 1L49A 1L27A 3EMLA 4ARMA 3HT9A 1L30A 217LA 255LA 3V2YA 1L11A 227LA 1L45A 215LA 1G06A 243LA 3NYAA 1LI3A 163LA 1SWYA 3HH4A 147LA 1T8AA 1NHBA 3HTBA 1L26A 2HUMA 262LA 3PBLA 4LDLA 1L41A 159LA 230LA 3HTDA 146LA 1CV5A 1DYAA 1P56A 251LA 1G0GA 2ANVA 4IAPA 127LA 1QTHA 3CDRA 224LA 209LA 1L63A 1CV4A 3FI5A 1QTVA 1OWYA 4W53A 4I7JA 4W51A 112LA 4EKQA 198LA 1L64A 223LA 120LA 2LCBA 1L90A 1DYBA 141LA 1LYGA 4I7OA 4W56A 1T97A 1L58A 191LA 1L53A 3OE9A 3C7ZA 6LZMA 4ARQB 3HH6A 167LA 3GUPA 171LA 260LA 1C6MA 1CU5A 3F9LA 139LA 1OVKA 104LA 1CVKA 189LA 1L10A 1C61A 1G0KA 152LA 4ARPA 2O79A 3L64A 1EPYA 4EPFA 4LDEA 1L08A 1L00A 250LA 1L88A 1ZYTA 125LA 2NTHA 4DAJA 219LA 218LA 1L65A 1QS9A 3C8QA 131LA 3HUAA 3HT6A 162LA 185LA 1L46A 216LA 1CUPA 2B6WA 1L75A 3DKEX 3DMZA 4LDOA 4W58A 1CV3A 1LLHA 180LA 220LA 225LA 226LA 1PQKA 2HUKA 1G07A 123LA 1L20A 1L47A 1KY0A 2O4WA 158LA 1LW9A 5LZMA 212LA 1C65A 3C8RA 1L60A 1C66A 1L96A 1C6PA 130LA 161LA 3HU8A 257LA 4EKRA 1B6IA 3V2WA 186LA 1PQJA 1L38A 2B6XA 3G3XA 231LA 256LA 3PDSA 1L02A 3JR6A 3C80A 3DN6A 199LA 1L82A 176LA 3HU9A 1K28A 177LA 3NY9A 3K2RA 174LA 1OWZA 1LYFA 1C6CA 1DYGA 1SSWA 1LGUA 1WTHA 187LA 115LA 1L19A 190LA 4GBRB 1L09A 235LA 1C6BA 113LA 1L55A 151LA 2RH1A 1L18A 1C6KA 1L21A 2B74A 2RBOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F14A 4HTQA 1WQMA 3HDEA 1LWKA 1YILA 2DQGY 2MEAA 1GFUA 4CHXA 3EMSA 238LA 2RAYX 1QTKA 1CU0A 1GB8A 1L39A 1L69A 3A96A 103LA 1JTPL 4WM3A 1CX6A 1H6MA 4ARLA 4LYTA 2Z12A 247LA 4FDYA 1KIRC 4NSHA 2ZIKA 4DD1A 2LYMA 4ETEA 4Z98A 1D2WA 1NWGA 1IWVA 1ALCA 3WYHA 5J7CA 1L98A 3TXKA 1FDLY 1CV1A 1L66A 1REZA 2DQAA 2F4GA 1QSAA 1DYFA 1CX7A 2ANXA 1SX2A 1GF5A 1G7JC 5FCPA 4NWHA 5D5CA 3RZEA 1LHJA 169LA 5LVKA 4I7PA 1LJKA 3HDFA 3OK0A 2MEBA 3DN2A 4DKLA 4I7TA 1EQ5A 2BQGA 4X3BA 3AGHA 1G0PA 4G49A 3TXDA 1C63A 192LA 1CKFA 3EO5A 1QSQA 2Q9DA 184LA 1GAZA 4CJ2A 1L52A 4ETDA 1L89A 1P6YA 128LA 4RDSA 2MEDA 1P46A 2OU8A 1PQDA 1L97A 3AJNA 2B75A 3GXRA 1LSFA 5KKIA 157LA 175LA 1GE0A 5HNCA 1G7LC 5LVJA 1LMAA 2DQIY 1O23A 2OU0X 1YL0X 4QGZA 3A6BY 3GULA 5I53A 3T6UA 3F6ZA 2Z2EA 1DI4A 1UC0A 2IGCA 1NBYC 3HWLA 4AGAA 3CSQA 2BQLA 2NWDX 1SSYA 1B7OA 4PK0A 193LA 1WTMA 1WQRA 2RB0X 4N1CC 1B5UA 133LA 1L77A 1DYCA 1IOCA 1ZVYB 1B7RA 1LYZA 1L72A 5FSTA 4DQ5A 2EPEA 3A93A 1OUBA 1IWWA 1I6SA 4WL6A 143LA 110LA 2QARC 2LZMA 4H90A 4BAFA 1BQLY 4KT3A 2RB2X 3CDQA 1ZVHL 3N9CA 1BWIA 1L61A 1JJ3A 2ZWBA 4M4OA 1GFVA 1LSMA 4WM2A 4ZIXA 4DQJA 1D0KA 188LA 5DM9A 1KW5A 1LJNA 2BQMA 4NSGA 1NBZC 3W6DA 1A4VA 1FLQA 5B59A 1F10A 5LINA 3SBAA 3A6CY 1QUGA 206LA 4BADA 3OE6A 1J1OY 1LZ8A 4DD7A 1GDXA 3LZ2A 4R6CA 3C82A 4LGKA 2LZ2A 1L0JA 1XJTA 1XGTC 2XBSA 5APEA 1L99A 1NHEA 2RBRA 5FHWA 4CGEA 4EMNA 1LPIA 3HTGA 4B49A 3D9AC 1GEZA 1I20A 3L2XA 1LZ4A 1L43A 129LA 2G4PA 1YANA 1JQUA 1L07A 5HNLA 3TMWA 1OUEA 164LA 4DWXA 4L41A 2A4TA 2OU9A 4TSBA 5LA5A 4DD2A 1JHLA 1IORA 1GFEA 259LA 5KJ9A 172LA 1IP5A 2CJLA 1L03A 1GF0A 1HF4A 1QDRA 2ZNWY 1L71A 3B0KA 5I4YA 254LA 3DN1A 3EBAB 1G0MA 3W6EA 1LYSA 1QQYA 4DQ7A 1IP2A 160LA 3FADA 2BQCA 4TSCA 150LA 1LZAA 2DQCY 4EXMA 3HTFA 2HULA 1LSDA 1ZV5L 2DQDY 1LZRA 1GBYA 1CUQA 3QAKA 4N1EI 1YKYX 3HT9A 5KY1A 4MCKA 4B4EA 1L11A 3N9EA 1GE4A 1L45A 215LA 3NYAA 5B07A 3HTBA 2HUMA 262LA 5F9UA 5FDJA 1P56A 2ANVA 3CDRA 1GB0A 4TWSA 1IOQA 1QTVA 3CT0A 4I7JA 4WL7A 4GN4A 4BS7A 4A7DA 198LA 120LA 1L90A 4I7OA 3B6LA 5A3EA 1L53A 4P2EA 3C7ZA 6LZMA 5LVHA 1LTMA 3QY4A 4KPMA 3QE8A 1C6MA 1KIPC 1CU5A 3F9LA 1LSBA 3LN2A 1GF4A 1L10A 3T36A 2Z38A 1LSNA 1LJHA 1GF3A 4MR1A 1ZYTA 3HFMY 2NTHA 1LAAA 4QDNA 2BQNA 162LA 1CUPA 1LZSA 2YBIA 1LLHA 3WU8A 1REXA 3B0OA 1C46A 5HMVA 2CGIA 1GE1A 2FYDA 2O4WA 2BPUA 1C65A 4H91A 1DI3A 2CWIA 1IP6A 1LZEA 257LA 4GN3A 4KXIA 1PQJA 3G3XA 3PDSA 177LA 3NY9A 1WVVA 2ZYPA 4LYBA 174LA 1C6CA 1C08C 1SSWA 1XEJA 3LZTA 5DLAA 1L19A 1L09A 235LA 5KXKA 2DBTA 1L21A 2RBOA 1CJ9A 2YBLA 3LYMA 1L54A 1IWTA 3RU5A 2RBQA 155LA 4FJRA 1L79A 245LA 5L9JA 2Q0MX 4XJDA 4C3WA 1C10A 1HFXA 1YAOA 1JIYA 1CV6A 2MEHA 4MSTA 1BGIA 5AMYA 1G0LA 4NEBA 1C45A 5KXTA 2DQJY 1DYDA 1YAMA 1HELA 1L76A 1L87A 2BQDA 181LA 4GLAA 239LA 2ZILA 2D4JA 1D9UA 137LA 1JJ0A 1D3MA 1L73A 4Z3MA 1P36A 2HEBA 2CUUA 1L51A 1LSYA 5HQ1A 5LXWA 1B5VA 1PQMA 3KAMA 138LA 1GHLA 5L3HA 229LA 2HEDA 1UICA 1C6HA 2GV0A 3CDTA 1CV0A 4H94A 1C68A 3DMVA 4UWVA 4W54A 2EIZC 1GBWA 2D6BA 3SB6A 2OE7X 1L48A 4I7MA 2QB0B 2FBBA 1IIZA 1HEQA 1D3NA 2OTZX 4W52A 4LFXA 2RB1X 1QSBA 5B05A 4NGWA 3GXKA 6LYZA 4I7SA 5LYTA 3W3EA 1QT7A 3GUIA 3DN3A 4WMGA 1BVKC 1KXYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5F14 A;  4HTQ A;  1WQM A;  3HDE A;  1LWK A;  1YIL A;  2DQG Y;  2MEA A;  1GFU A;  4CHX A;  3EMS A;  238L A;  2RAY X;  1QTK A;  1CU0 A;  1GB8 A;  1L39 A;  1L69 A;  3A96 A;  103L A;  1JTP L;  4WM3 A;  1CX6 A;  1H6M A;  4ARL A;  4LYT A;  2Z12 A;  247L A;  4FDY A;  1KIR C;  4NSH A;  2ZIK A;  4DD1 A;  2LYM A;  4ETE A;  4Z98 A;  1D2W A;  1NWG A;  1IWV A;  1ALC A;  3WYH A;  5J7C A;  1L98 A;  3TXK A;  1FDL Y;  1CV1 A;  1L66 A;  1REZ A;  2DQA A;  2F4G A;  1QSA A;  1DYF A;  1CX7 A;  2ANX A;  1SX2 A;  1GF5 A;  1G7J C;  5FCP A;  4NWH A;  5D5C A;  3RZE A;  1LHJ A;  169L A;  5LVK A;  4I7P A;  1LJK A;  3HDF A;  3OK0 A;  2MEB A;  3DN2 A;  4DKL A;  4I7T A;  1EQ5 A;  2BQG A;  4X3B A;  3AGH A;  1G0P A;  4G49 A;  3TXD A;  1C63 A;  192L A;  1CKF A;  3EO5 A;  1QSQ A;  2Q9D A;  184L A;  1GAZ A;  4CJ2 A;  1L52 A;  4ETD A;  1L89 A;  1P6Y A;  128L A;  4RDS A;  2MED A;  1P46 A;  2OU8 A;  1PQD A;  1L97 A;  3AJN A;  2B75 A;  3GXR A;  1LSF A;  5KKI A;  157L A;  175L A;  1GE0 A;  5HNC A;  1G7L C;  5LVJ A;  1LMA A;  2DQI Y; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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