1OWYA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 2-propyl-aniline
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1owyA00
119LA 174LA 1C60A 3DN0A 1CUPA 1QT4A 1L22A 1L50A 3C7ZA 3CDTA 1LI2A 1EPYA 3C80A 4ARQB 1L25A 3GUKA 218LA 1QUOA 1LI3A 107LA 3HH3A 211LA 210LA 1C6FA 261LA 1CV0A 1L09A 3NYAA 1L80A 2RBSA 1L82A 1L84A 4W59A 1L34A 2ANXA 1ZWNA 1L44A 1QUDA 1L91A 1P6YA 1B6IA 1PQJA 4W58A 246LA 4EXMA 1QUHA 1C63A 2L78A 2F47A 1WTHA 118LA 189LA 3GUMA 2B6TA 1L39A 260LA 1QT5A 2OE7X 3OE6A 1LYEA 3GUOA 1LW9A 235LA 1QSBA 1CV3A 1D9WA 4W55A 1PQKA 4LDEA 4LDOA 2QB0B 228LA 1C6GA 3HH4A 234LA 125LA 1G0JA 1QS9A 3RZEA 3HUQA 1KY1A 1D3JA 1LPYA 251LA 1L11A 1C69A 1L21A 2Q9DA 3QAKA 3OE9A 196LA 1L35A 4I7TA 1DYGA 1P3NA 4I7PA 1L32A 227LA 3L64A 3OE8A 1LI6A 3VW7A 1L31A 1T6HA 220LA 1L29A 1SX2A 3DNAA 4I7NA 1CTWA 3GUJA 3GUPA 1JTMA 254LA 3C83A 108LA 1L18A 1TLAA 4ARPA 3SB5A 1C61A 1CU5A 1QT8A 1PQMA 4YXAC 4E97A 248LA 223LA 2F2QA 1L58A 3HUAA 1CV1A 4EKQA 120LA 2B7XA 141LA 3SBAA 2LC9A 4I7RA 1G07A 2HUMA 2LZMA 4ZPUA 2OU8A 1L89A 102LA 239LA 1L04A 1P7SA 1QTVA 1L41A 171LA 1P5CA 2QARC 1G0LA 1SWYA 1L00A 3DN3A 1L05A 1PQDA 1LGWA 149LA 1XEPA 1L10A 244LA 3C7YA 184LA 1P46A 241LA 3EMLA 1L72A 1T97A 2OU0X 3K2RA 3LZMA 1ZURA 3V2YA 1D3MA 222LA 1L02A 2RBRA 130LA 217LA 126LA 1D3NA 3DMZA 1QT7A 4OO9A 1C6IA 1OVKA 181LA 1L01A 1L28A 3SB8A 1L54A 4I7SA 1L99A 262LA 3HU8A 1QT6A 1C6KA 1L67A 231LA 4W52A 1L98A 1L66A 1LYFA 215LA 4W54A 3ODUA 1L79A 1L92A 3DN6A 165LA 1L26A 3FA0A 1JTNA 1KY0A 3SBBC 137LA 3HTBA 238LA 1L60A 1C67A 2RBOA 3DN1A 1C6EA 2OEAX 1D2YA 256LA 4ARMA 176LA 1L86A 1L74A 3CDVA 1QS5A 2O4WA 1L23A 229LA 2ANVA 2RB1X 1L40A 2B70A 4I7JA 1L13A 2B6YA 157LA 1SWZA 233LA 1CV4A 1L48A 142LA 1LYIA 1P2RA 1C6TA 1L0JA 114LA 3C8QA 224LA 1LYGA 3DN2A 3HWLA 3SN6R 172LA 1C6NA 1L30A 1LLHA 1C6LA 1L63A 4EPIA 236LA 187LA 113LA 1L20A 1I6SA 168LA 214LA 155LA 1CX7A 249LA 1L03A 230LA 163LA 252LA 173LA 4I7OA 3G3VA 253LA 4AQNA 1LYHA 201LA 2RB2X 1C6HA 148LE 129LA 159LA 2CUUA 4EPFA 4EKSA 2OU9A 250LA 164LA 3C8RA 197LA 3HH5A 3HDEA 158LA 1DYBA 3GULA 3GUNA 1QTBA 1SSYA 1KS3A 192LA 3HH6A 1CUQA 225LA 1L83A 122LA 4GBRB 3DN8A 188LA 1L55A 2A4TA 4W56A 1L61A 1L76A 1L0KA 2RAZX 2B6ZA 1C6JA 1L27A 1L47A 110LA 1LWGA 4K5YA 4W53A 4EKRA 3OE0A 1G0MA 216LA 3C81A 1L53A 3SB7A 144LA 1CU0A 3SB9A 1L49A 3DKEX 109LA 1C6CA 115LA 3GUIA 1L88A 1L75A 191LA 4DKLA 237LA 2IGCA 1CU2A 2B6XA 2B6WA 1G0PA 1L77A 199LA 209LA 4EKPA 1DYCA 1OYUA 1PQIA 1P2LA 3CDOA 4W51A 1L81A 3DMVA 1L37A 213LA 1DYEA 232LA 104LA 1QTDA 2RB0X 1OV7A 4I7KA 4W57A 190LA 128LA 4EJ4A 1L46A 6LZMA 1KW7A 1P64A 147LA 1L42A 1LGUA 3G3WA 2RAYX 1P36A 1CU3A 212LA 161LA 170LA 1CV6A 1L90A 143LA 167LA 3CDQA 2B72A 1KNIA 5I14A 180LA 3C82A 4DJHA 2Q9EA 4ARJA 1L64A 111LA 2F32A 245LA 1T8AA 3C8SA 3NY9A 1G0QA 1C6AA 112LA 1T8GA 1G1VA 3HT7A 1LGXA 166LA 1L68A 3L2XA 3HT8A 185LA 103LA 139LA 4I7QA 1L52A 1L96A 152LA 2LCBA 3V2WA 123LA 138LA 259LA 1L51A 1LYJA 127LA 1L06A 2RBQA 4ARQA 257LA 1NHBA 1L97A 2RBNA 1SX7A 1L87A 1C6BA 169LA 2OE9X 1XJUA 3HT6A 3HTDA 219LA 1C6MA 1QTCA 5LZMA 1L19A 4YX7C 4I7MA 4IAPA 1L38A 1G0KA 1L45A 198LA 3FI5A 1C62A 3HUKA 2OTZX 3PBLA 2B73A 175LA 156LA 177LA 1L85A 200LA 1L36A 195LA 243LA 183LA 1G0GA 1OVHA 1C6DA 1QSQA 7LZMA 1KW5A 1L93A 4S0WA 1CU6A 3G3XA 1QTHA 1L14A 3JR6A 1OV5A 3HTGA 2B74A 3SB6A 2RH1A 1L16A 1L15A 4PK0A 1LWKA 1SSWA 2B75A 206LA 255LA 1P56A 3UONA 2O79A 3DMXA 1G1WA 145LA 1G06A 1L59A 1CVKA 1L24A 3HU9A 1C68A 1L43A 1JQUA 160LA 1DYAA 1CV5A 1C66A 3D4SA 1PQOA 1OWZA 131LA 247LA 3HDFA 3PDSA 4LZMA 1L57A 3NY8A 151LA 1L65A 1DYFA 1L69A 3FADA 1L71A 1XJTA 1OVJA 2NTHA 1DYDA 2OE4X 4LDLA 1L62A 1L12A 2O7AA 3HTFA 1L56A 4I7LA 1L70A 2RBPA 1L73A 242LA 182LA 1L33A 2HUKA 258LA 186LA 3F9LA 1P37A 1D3FA 3F8VA 3DN4A 1C6PA 1C64A 4ARLA 146LA 178LA 221LA 1T8FA 2HULA 140LA 1L94A 1QTZA 1ZYTA 3HT9A 3CDRA 1L07A 1C65A 205LA 1D2WA 240LA 3RUNA 2NTGA 4DAJA 162LA 1QUGA 1C6QA 1L17A 4GRVA 1K28A 1LYDA 226LA 3C7WA 4PJZA 1L08A 1L95A 1CX6A 150LA 2OTYX 2Z6BA 1OWYA 4ARMB 4YXCA 1QT3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P68A 1RCMA 1ZMYL 2G4PA 1HERA 2C8PA 3C7ZA 3CDTA 1LI2A 5F14A 1IC5Y 4DWXA 5F81A 5HNCA 3B6LA 211LA 4GCEA 4DD0A 2GV0A 4W59A 1LSPA 1ZWNA 2XJWA 2Q0MX 1B6IA 1DI3A 3CT5A 1PQJA 4W58A 1D0LA 246LA 1GFGA 1SQ2L 2L78A 1T6VL 2F47A 4ET8A 1GBZA 1EL1A 260LA 1QT5A 4OWAA 3TMVA 6LYTA 1LZTA 1C45A 3N9EA 3WMKA 5AMYA 5HLLA 1B9OA 4XYYA 4DD2A 4ZFPA 234LA 4XN6A 5J7CA 1W6ZA 125LA 3P65A 3RZEA 3BKHA 1OUCA 1RI8B 4W96A 3CB7A 2BQDA 2Q9DA 196LA 3F6ZA 227LA 1T6HA 1HHLA 220LA 1L29A 2W1XA 3GUJA 1JTMA 5LIOA 254LA 1L18A 4WO9A 4I0CA 1TLAA 1YIKA 2BQIA 2ZIKA 1LSFA 5L3HA 2C8OA 4YXAC 1NHEA 1DKKA 2Z18A 1CV1A 4J7VA 4EKQA 120LA 4LZTA 4RLMA 3B0KA 4ZPUA 239LA 1L04A 1BWIA 1L41A 4DDAA 1G0LA 3W6CA 1SWYA 2MEIA 2Z38A 4D9ZA 3K3TA 1UBZA 1IOSA 4HTKA 3C7YA 3WH1A 2H5ZA 1IY3A 1P46A 2HEEA 1ZURA 222LA 1L02A 1KXWA 1TEWA 126LA 1GF7A 3DMZA 4OO9A 1C6IA 1OVKA 2I26L 5LVHA 3WW6A 4L41A 1YQVY 1L66A 5KXPA 5FHWA 1LYFA 3ODUA 1OUBA 165LA 1L26A 3FA0A 1JTNA 3CSQA 4QDNA 137LA 4LT2A 238LA 1HMKA 4XJFA 1C67A 1BHZA 2RBOA 4PHIA 1B7NA 2OEAX 1B7RA 4BS7A 2ZNWY 4OWHA 1B7QA 229LA 5FEKA 2RB1X 2B70A 1GFUA 5B05A 142LA 1P2RA 1C6TA 1LSDA 2Z19A 2G4QA 1GFKA 5I4WA 3B0OA 1OUFA 3IJVA 1LLHA 5C6IA 1C10A 1JUGA 1UC0A 214LA 1IWWA 1TDYA 5L3IA 155LA 4BAPA 1I20A 230LA 163LA 4RDSA 5DN4A 252LA 173LA 4AQNA 201LA 1QDTA 1UIAA 3EBAB 1ALCA 1LSYA 4EKSA 1LMQA 197LA 1BGIA 3HDEA 158LA 3TXBA 3GUNA 1SSYA 192LA 1XEKA 3HH6A 1GE0A 5DL9A 4N0JA 1L83A 1GFEA 3DN8A 5IHGA 4Z46A 1XGPC 1L55A 4LYOA 2ZQ4A 1JITA 4NSGA 1YROA 1L47A 4WM4A 2EPEA 1L49A 3DKEX 5II3A 1C6CA 1DPXA 1L88A 191LA 2IGCA 2BQLA 2B6XA 4WM5A 2Z12A 1GB5A 5LXWA 3DMVA 2RB0X 5KXZA 2I6ZA 1LYSA 1L46A 3WU9A 1Z55A 3RZ4A 2F2NA 1L42A 3G3WA 2BAAA 212LA 3WPLA 170LA 4XJIA 1IWXA 143LA 1NF5A 1KNIA 1GF5A 4Z3MA 2BPUA 2A7DA 3AZ6A 1JHLA 3LYOA 5F9UA 1UICA 2BQNA 1MELL 245LA 1T8AA 1FN5A 4W94A 5HMVA 1C6AA 3MGWA 3A6BY 4WO6A 2LHMA 4KT3A 166LA 5APDA 3TMXA 1LJ3A 4GCBA 103LA 4J1AA 2YBMA 4FJRA 2A7FA 5FELA 1OUJA 1E8LA 7LYZA 4G4CA 4H9AA 5B1GA 5KXTA 1LCNA 4G49A 5T3FA 1NHBA 2RBNA 1ZVHL 4M4OA 169LA 2OE9X 1XJUA 3HT6A 2HEBA 1QTCA 4ETAA 4YX7C 4Z41A 4H9FA 1JTOL 1L38A 1G0KA 3W6BA 3FI5A 1C46A 3HUKA 5KKIA 1B2KA 3PBLA 2B73A 175LA 177LA 4PRQA 3A3RX 3N9AA 4QY9A 5I5QA 1LOZA 1G0GA 1IP2A 1C6DA 1DPWA 1D6PA 1KW5A 1IO5A 1QTHA 1FLUA 3JR6A 5M1YA 3WULA 3HTGA 1GFHA 2HECA 4PK0A 4IJ4A 4NGJA 1OUIA 1LWKA 1LTMA 206LA 2O79A 3DMXA 1L24A 3LN2A 2EIZC 3TXJA 1WQNA 4YM8A 5LINA 131LA 247LA 3HDFA 4RW2A 1LJNA 1LZ8A 1IC4Y 3NY8A 1L69A 1L71A 3G3BB 2DQHY 2DQCY 4M6DA 1L62A 4HJVA 3HTFA 1GB3A 1HMLA 4I7LA 1CJ9A 5LA8A 2DQIY 1L33A 3A3QA 1D3FA 3DN4A 5FDJA 1C6PA 1LZNA 4ARLA 1VEDA 4LYZA 4QGZA 1JJ1A 4XJDA 1JSFA 1HEPA 1D2WA 1HFXA 3AW7A 2F4AA 1QUGA 1UA6Y 3E3DA 1L08A 2DQGY 1CX6A 3A67Y 2Z6BA 1OWYA 4YXCA 4NHSA 3RT5X 174LA 1LHMA 1LYOA 5FCPA 5B59A 1EPYA 1IR8A 4ARQB 3GUKA 4WLTA 1C6FA 1L09A 4UWVA 1L34A 2ANXA 1QUDA 1L91A 2DQFC 3W6FA 1F10A 135LA 1SLYA 4AGAA 1HENA 3GUMA 2B6TA 1L39A 1G7LC 1QIOA 3A92A 4G4BA 2CWIA 2H9JA 1LZEA 1BB4A 1DZBX 1F6RA 4W55A 1XGTC 3SP3A 3HH4A 1G0JA 4NG8A 1IWYA 4OOOA 2WARA 1QUTA 4HPIA 4IASA 5KXKA 4NGWA 1C69A 1CKHA 4N1CC 1B5XA 3OE9A 2MECA 3L64A 1L31A 132LA 1SX2A 3DNAA 1CTWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P68 A;  1RCM A;  1ZMY L;  2G4P A;  1HER A;  2C8P A;  3C7Z A;  3CDT A;  1LI2 A;  5F14 A;  1IC5 Y;  4DWX A;  5F81 A;  5HNC A;  3B6L A;  211L A;  4GCE A;  4DD0 A;  2GV0 A;  4W59 A;  1LSP A;  1ZWN A;  2XJW A;  2Q0M X;  1B6I A;  1DI3 A;  3CT5 A;  1PQJ A;  4W58 A;  1D0L A;  246L A;  1GFG A;  1SQ2 L;  2L78 A;  1T6V L;  2F47 A;  4ET8 A;  1GBZ A;  1EL1 A;  260L A;  1QT5 A;  4OWA A;  3TMV A;  6LYT A;  1LZT A;  1C45 A;  3N9E A;  3WMK A;  5AMY A;  5HLL A;  1B9O A;  4XYY A;  4DD2 A;  4ZFP A;  234L A;  4XN6 A;  5J7C A;  1W6Z A;  125L A;  3P65 A;  3RZE A;  3BKH A;  1OUC A;  1RI8 B;  4W96 A;  3CB7 A;  2BQD A;  2Q9D A;  196L A;  3F6Z A;  227L A;  1T6H A;  1HHL A;  220L A;  1L29 A;  2W1X A;  3GUJ A;  1JTM A;  5LIO A;  254L A;  1L18 A;  4WO9 A;  4I0C A;  1TLA A;  1YIK A;  2BQI A;  2ZIK A;  1LSF A;  5L3H A;  2C8O A;  4YXA C;  1NHE A;  1DKK A;  2Z18 A;  1CV1 A;  4J7V A;  4EKQ A;  120L A;  4LZT A;  4RLM A;  3B0K A;  4ZPU A;  239L A;  1L04 A;  1BWI A;  1L41 A;  4DDA A;  1G0L A;  3W6C A;  1SWY A;  2MEI A;  2Z38 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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