1OWZA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 4-fluorophenethyl alcohol
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1owzA00
1LI2A 1QSQA 2B7XA 3SB9A 1QTDA 1T8AA 1L83A 214LA 1L73A 4OO9A 4I7RA 4YX7C 1PQOA 4I7QA 1C63A 1L74A 1C6HA 1C6MA 1L88A 4LDOA 3K2RA 1L35A 2B6ZA 1L11A 1C61A 1C6FA 1JTMA 4I7TA 4I7KA 196LA 112LA 1L45A 1L39A 1L18A 1L77A 3FADA 104LA 1L12A 3CDTA 4PJZA 1C62A 159LA 1G0JA 1L84A 1L64A 1XEPA 3SB5A 2B6TA 3DMVA 3DN8A 3HTGA 1CV3A 1D3MA 3GUMA 1C67A 4I7MA 103LA 1CV0A 261LA 119LA 1L05A 1CU0A 4IAPA 236LA 177LA 219LA 1ZYTA 1SX7A 4W55A 1NHBA 1L21A 1D3JA 1QTBA 3CDOA 1P6YA 4E97A 4GBRB 4ARMA 1QT4A 181LA 3ODUA 1SSYA 123LA 1L69A 1L38A 1LWKA 156LA 158LA 1CX7A 1L95A 170LA 189LA 1CU3A 1G0PA 1L40A 4EPIA 152LA 1CU2A 1L43A 1LW9A 1L03A 1G0QA 147LA 1L27A 1QT3A 1CV4A 252LA 151LA 3C7ZA 3HH4A 3SB6A 4ARPA 1SWZA 1L52A 1L82A 3GUOA 3C80A 1C66A 1G06A 235LA 4ARQA 1L86A 1L87A 3HT9A 114LA 3HTFA 3HH6A 2O7AA 1C6AA 1L04A 3F9LA 188LA 1DYAA 125LA 4W58A 1LYIA 216LA 1ZWNA 256LA 223LA 1LYDA 1QS9A 3C7WA 1P37A 143LA 2ANXA 3C8RA 160LA 1LYHA 1D9WA 1L01A 1L02A 3DN3A 2B74A 180LA 210LA 1L49A 3QAKA 168LA 1L47A 228LA 3C8SA 4DKLA 1L42A 2F2QA 2Q9EA 2RBOA 3HDFA 1L96A 2RBSA 3G3VA 1SX2A 1L06A 2RBRA 199LA 237LA 258LA 1OVKA 175LA 3HWLA 255LA 1CV6A 1L67A 1L55A 1KY1A 1L09A 1L22A 4EKQA 1L10A 3PDSA 1G07A 1QS5A 1C6BA 1T6HA 1QTCA 251LA 4I7LA 1LYGA 3JR6A 1L23A 155LA 1L07A 1L00A 1L98A 1LGWA 4EKSA 146LA 239LA 185LA 3SBBC 1QUHA 1CUQA 1CV5A 137LA 229LA 1L92A 186LA 1KS3A 3C81A 245LA 183LA 4ARLA 3NYAA 3HT8A 4W59A 2RB0X 3OE6A 1TLAA 1QTHA 1KW5A 1L46A 1G0LA 1L14A 3FI5A 148LE 244LA 3DN2A 242LA 1L81A 1P7SA 3GUKA 4EJ4A 2QARC 1L13A 1QUDA 1L25A 1C6DA 1L72A 113LA 3SN6R 3D4SA 4LZMA 4S0WA 4GRVA 1D3FA 3EMLA 1LPYA 1L91A 1JQUA 171LA 1G0GA 141LA 3HUKA 4I7NA 1C6NA 1LWGA 4K5YA 1C6IA 111LA 3HH5A 1OVJA 1ZURA 110LA 1L57A 2OU8A 150LA 2L78A 1CX6A 205LA 190LA 3LZMA 2O79A 2OE4X 131LA 1DYDA 201LA 3G3XA 1C6CA 1KW7A 1L48A 2B6YA 4W54A 187LA 1L20A 162LA 2OE7X 1QTZA 4AQNA 2B75A 3DMXA 1C6PA 1LLHA 1L58A 2OTZX 139LA 191LA 1L31A 1OV5A 226LA 4I7PA 1G0KA 1OYUA 1OV7A 1C65A 1L75A 2RAZX 2B6WA 4ARJA 1C6QA 3SB8A 222LA 4W53A 1QT6A 4I7JA 3DN0A 1LGXA 1L54A 2RBPA 3SBAA 4W57A 1L33A 243LA 212LA 1L56A 172LA 1L61A 3RZEA 1CU5A 4W56A 4EPFA 1C60A 1SSWA 231LA 2RH1A 3DN6A 2LZMA 4EKRA 3C8QA 1KY0A 1L79A 3HTDA 2B6XA 2OTYX 1PQIA 3C83A 118LA 1OVHA 1C6JA 234LA 3F8VA 4LDLA 218LA 224LA 4YXCA 1L36A 1L70A 3DNAA 1QT5A 1L66A 1QUOA 1L0JA 260LA 1L94A 1L08A 1L29A 1L85A 225LA 3HUQA 4DJHA 3HH3A 221LA 2OU9A 120LA 184LA 1P36A 1CVKA 166LA 129LA 1DYEA 128LA 2CUUA 1PQMA 1T8FA 3GUIA 250LA 2Z6BA 7LZMA 1G1VA 1OWZA 192LA 2HULA 1C64A 3CDVA 1G0MA 4I7SA 3SB7A 107LA 3L64A 247LA 1QT7A 4ZPUA 4LDEA 3HU8A 1DYCA 2LCBA 1D3NA 5LZMA 3GULA 164LA 1L59A 1L63A 2F47A 197LA 5I14A 2O4WA 195LA 1L19A 1T8GA 2RB2X 3C82A 253LA 2OEAX 3OE0A 1L89A 3VW7A 4ARQB 1D2YA 163LA 246LA 1LYEA 108LA 1DYGA 1PQKA 1L99A 174LA 2HUMA 1L97A 2RAYX 144LA 4PK0A 3CDRA 1C6KA 1B6IA 3L2XA 1L17A 126LA 1EPYA 1L24A 1CV1A 1L76A 2A4TA 1PQDA 3DN4A 169LA 1C68A 2IGCA 2LC9A 157LA 4DAJA 2QB0B 3HT7A 122LA 4YXAC 1DYFA 109LA 1LYFA 2Q9DA 2RBQA 200LA 1C6EA 161LA 1CTWA 1D2WA 1C6TA 1P3NA 1OWYA 1XJUA 2NTGA 2OE9X 1L80A 173LA 1C6GA 3DN1A 1L28A 1L30A 167LA 1P46A 1L16A 1LI6A 130LA 182LA 1L71A 232LA 1L53A 198LA 1L26A 1L0KA 2F32A 1PQJA 1C6LA 1JTNA 1QUGA 249LA 102LA 142LA 1K28A 1KNIA 2ANVA 3HDEA 1L51A 3FA0A 3NY8A 1L32A 1L50A 1T97A 211LA 1LI3A 4EKPA 138LA 1DYBA 1L93A 127LA 1LGUA 1G1WA 230LA 3HTBA 241LA 4W52A 213LA 1L41A 240LA 1P5CA 1QT8A 1I6SA 1L37A 1QSBA 215LA 3HUAA 1L34A 1L44A 3OE8A 1C69A 1LYJA 1WTHA 206LA 3CDQA 178LA 149LA 1CUPA 4I7OA 3GUPA 2NTHA 3GUNA 2B72A 140LA 3NY9A 257LA 3PBLA 2OU0X 3V2WA 248LA 262LA 3C7YA 3V2YA 3OE9A 1P56A 3DMZA 209LA 4ARMB 238LA 3HT6A 145LA 2B70A 220LA 233LA 4EXMA 3RUNA 2B73A 165LA 2HUKA 227LA 1XJTA 217LA 3G3WA 1P2LA 259LA 1P2RA 176LA 1L90A 1L15A 1L65A 2RB1X 3UONA 6LZMA 4W51A 1L68A 115LA 1SWYA 254LA 3DKEX 3HU9A 1CU6A 1P64A 2RBNA 1QTVA 1L62A 3GUJA 1L60A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OO9A 4I7RA 1NMMA 1PQOA 4I7QA 3T6UA 4BAFA 1QUTA 193LA 1LYYA 1UA6Y 3A95A 4M6DA 1UUZC 3MGWA 1HC0A 1LSZA 2BQAA 1L77A 3FADA 5KXZA 1H87A 159LA 1IC5Y 4CGEA 5KXWA 4I0CA 1B7OA 4LFPA 4R6CA 103LA 4NSJA 119LA 1BWHA 1CU0A 1REYA 1YAQA 2RSCA 1LZTA 219LA 1AKIA 1SX7A 4W55A 3A34A 1B7SA 1WQPA 1IWXA 181LA 1IWYA 1LHKA 4WLYA 4OWEA 1GFTA 1LZYA 158LA 2A7FA 4OW1A 1JTPL 1L40A 3A67Y 2GV0A 3A3RX 1LW9A 3WUAA 1L27A 3C7ZA 151LA 133LA 3N9EA 1VFBC 1GBZA 3C80A 3GUOA 5LAGA 3A3QA 3G3AB 4HTQA 1YQVY 2VB1A 132LA 188LA 2BQIA 1C46A 3TXGA 3C7WA 1C45A 1QS9A 1P37A 1HHLA 143LA 2DQCY 4TUNA 3C8RA 4NSIA 1LYHA 1HSWA 2BQFA 3J6KA 1IP3A 2YBLA 168LA 3TXKA 1LTMA 3RNXA 2Q9EA 2HECA 1YL1X 4QEQA 4WM5A 2RBRA 1IP6A 2MEBA 2ZWBA 1IC7Y 3HWLA 255LA 4ETAA 4GCCA 1NKHA 4Z46A 5LXWA 1XFPL 1IR9A 1L10A 2BQGA 3CSZA 1HEPA 1C6BA 1B5YA 5K7OA 4ETDA 1L98A 1L00A 185LA 4HTNA 1QUHA 3TXBA 1CUQA 208LA 4GCDA 1YIKA 2FYDA 186LA 3FI7A 4PGJB 1FKQA 2EIZC 4LT1A 1FLQA 1KW5A 148LE 1VAUA 2QARC 1GBWA 1JJ3A 3D4SA 4KPMA 4S0WA 5A3EA 5IELA 3HUKA 1QIOA 4NGLA 2HEDA 3TXJA 110LA 4LYBA 1GB8A 190LA 2W1MA 2OE4X 1DYDA 2DKVA 1T6VL 4W54A 1QTEA 2B6YA 3W6AA 187LA 2Q0MX 2MEFA 4AQNA 4LT0A 2F2NA 1YKZX 1GBOA 1LSFA 139LA 4A7DA 4DQJA 1HNLA 1OYUA 1GFEA 4ET9A 1C65A 1WQNA 2RAZX 4OWHA 3SB8A 4J7VA 4W53A 1H6MA 4DD2A 1XGPC 1C08C 1B5UA 1LGXA 2RBPA 3A94A 3W6EA 4NY5A 172LA 3WW6A 1B7MA 1SSWA 3AGHA 4W96A 2HU3A 1KXWA 1PQIA 118LA 2PC2A 234LA 1IP2A 1GXXA 4NHPA 1WQRA 218LA 3DNAA 2BLXA 1QT5A 4D9ZA 260LA 1GF3A 1L29A 225LA 4U3XB 1CKHA 3TXDA 1IP5A 1B5XA 4HJYA 3ATOA 1CVKA 166LA 4DD7A 2CUUA 3A96A 5I4XA 1INUA 4ANRA 1JKDA 1LSBA 4DD9A 1OWZA 192LA 2HULA 1JITA 1G0MA 3T36A 2MEGA 2HEAA 1F6SA 3HU8A 4PHIA 4LYCA 3GULA 1KXYA 5I14A 1GF0A 1YILA 195LA 1L19A 2ZNXY 4WO6A 4HJZA 1GFHA 1YKXX 3VW7A 4ARQB 163LA 108LA 1DYGA 1L99A 1KIPC 1LYEA 3A8ZA 1GFGA 1LMAA 4NWHA 1W6ZA 1BHZA 2HUMA 144LA 5I4WA 3CDRA 2ZIKA 4WLXA 3L2XA 1QDTA 4GN4A 1L17A 4H8YA 2MEDA 4XJBA 4PJ2C 2XQOA 1L76A 1LOZA 1LSGA 2A4TA 169LA 2Z38A 122LA 1GFKA 1UBZA 1DYFA 1LYFA 200LA 4GN5C 3W6DA 1JTTL 3WW5A 1FLWA 5FEKA 4LFXA 1D0LA 1PZYA 1J1XY 1C6GA 2ZQ4A 5APDA 2AUBA 2D4KA 2XTHA 1XSFA 2F32A 4NEBA 2ANVA 1B7NA 1L51A 1OUFA 3NY8A 1T97A 1REZA 211LA 4XYYA 153LA 138LA 1LGUA 230LA 1NBYC 2YBMA 3LZTA 1LZ4A 1HFYA 1LMPA 1P5CA 4H9IA 1LZ8A 1L37A 3D3DA 3P64A 1OUCA 1CJ6A 135LA 1IP1A 1FKVA 1IY3A 1HF4A 5DLAA 1C69A 1LYJA 5LINA 1WTHA 3CDQA 3WXUA 149LA 2CDSA 2YSSC 1GB7A 3GUNA 4TTDA 140LA 3NY9A 257LA 4NHIA 4N9RA 4N8ZA 2D4IA 2OU0X 3B0KA 248LA 2CJLA 5KXMA 209LA 4DWXA 7LYZA 3HT6A 1DPWA 1XGUC 3RUNA 4H9CA 1GB2A 3G3WA 3LYOA 259LA 1NWGA 2Z19A 2Z37A 1J1PY 4H8ZA 115LA 3IWRA 4LZTA 1IO5A 1QTVA 1D6PA 3WXTA 4G9SA 2BQDA 1OUGA 2B7XA 3WUNA 1GFAA 1T8AA 3P66A 4YX7C 2BQOA 4OOOA 1C63A 2I6ZA 1C6MA 1L88A 3K2RA 1L11A 4HSFA 2BAAA 4I7KA 4C3WA 104LA 1L12A 3P4ZA 2HU1A 4WM3A 1L84A 1FLUA 1L64A 1XEPA 1OUDA 3DN8A 5LVKA 3GUMA 4E3UA 4GCEA 1C67A 4NGZA 5LIOA 2Z2EA 261LA 1L05A 4LYMA 1QQYA 1YAMA 1E8LA 4LT2A 5F81A 1NHBA 3TMXA 1L21A 1QTBA 4FJRA 3LYZA 2XBRA 4NGJA 3ODUA 3EO5A 1B5ZA 1L69A 3K3TA 5B59A 1LZCA 3AGGG 1LWKA 5E4PA 1L95A 1CU3A 4G4CA 4N5RA 2DQDY 1G7HC 154LA 152LA 1CU2A 2HEEA 1L03A 1CV4A 252LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1SWZ A;  1L52 A;  1L82 A;  3GUO A;  3C80 A;  1C66 A;  1G06 A;  235L A;  4ARQ A;  1L86 A;  1L87 A;  3HT9 A;  114L A;  3HTF A;  3HH6 A;  2O7A A;  1C6A A;  1L04 A;  3F9L A;  188L A;  1DYA A;  125L A;  4W58 A;  1LYI A;  216L A;  1ZWN A;  256L A;  223L A;  1LYD A;  1QS9 A;  3C7W A;  1P37 A;  143L A;  2ANX A;  3C8R A;  160L A;  1LYH A;  1D9W A;  1L01 A;  1L02 A;  3DN3 A;  2B74 A;  180L A;  210L A;  1L49 A;  3QAK A;  168L A;  1L47 A;  228L A;  3C8S A;  4DKL A;  1L42 A;  2F2Q A;  2Q9E A;  2RBO A;  3HDF A;  1L96 A;  2RBS A;  3G3V A;  1SX2 A;  1L06 A;  2RBR A;  199L A;  237L A;  258L A;  1OVK A;  175L A;  3HWL A;  255L A;  1CV6 A;  1L67 A;  1L55 A;  1KY1 A;  1L09 A;  1L22 A;  4EKQ A;  1L10 A;  3PDS A;  1G07 A;  1QS5 A;  1C6B A;  1T6H A;  1QTC A;  251L A;  4I7L A;  1LYG A;  3JR6 A;  1L23 A;  155L A;  1L07 A;  1L00 A;  1L98 A;  1LGW A;  4EKS A;  146L A;  239L A;  185L A;  3SBB C;  1QUH A;  1CUQ A;  1CV5 A;  137L A;  229L A;  1L92 A;  186L A;  1KS3 A;  3C81 A;  245L A;  183L A;  4ARL A;  3NYA A;  3HT8 A; 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 144L A;  4PK0 A;  3CDR A;  1C6K A;  1B6I A;  3L2X A;  1L17 A;  126L A;  1EPY A;  1L24 A;  1CV1 A;  1L76 A;  2A4T A;  1PQD A;  3DN4 A;  169L A;  1C68 A;  2IGC A;  2LC9 A;  157L A;  4DAJ A;  2QB0 B;  3HT7 A;  122L A;  4YXA C;  1DYF A;  109L A;  1LYF A;  2Q9D A;  2RBQ A;  200L A;  1C6E A;  161L A;  1CTW A;  1D2W A;  1C6T A;  1P3N A;  1OWY A;  1XJU A;  2NTG A;  2OE9 X;  1L80 A;  173L A;  1C6G A;  3DN1 A;  1L28 A;  1L30 A;  167L A;  1P46 A;  1L16 A;  1LI6 A;  130L A;  182L A;  1L71 A;  232L A;  1L53 A;  198L A;  1L26 A;  1L0K A;  2F32 A;  1PQJ A;  1C6L A;  1JTN A;  1QUG A;  249L A;  102L A;  142L A;  1K28 A;  1KNI A;  2ANV A;  3HDE A;  1L51 A;  3FA0 A;  3NY8 A;  1L32 A;  1L50 A;  1T97 A;  211L A;  1LI3 A;  4EKP A;  138L A;  1DYB A;  1L93 A;  127L A;  1LGU A;  1G1W A;  230L A;  3HTB A;  241L A;  4W52 A;  213L A;  1L41 A;  240L A;  1P5C A;  1QT8 A;  1I6S A;  1L37 A;  1QSB A;  215L A;  3HUA A;  1L34 A;  1L44 A;  3OE8 A;  1C69 A;  1LYJ A;  1WTH A;  206L A;  3CDQ A;  178L A;  149L A;  1CUP A;  4I7O A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4OO9 A;  4I7R A;  1NMM A;  1PQO A;  4I7Q A;  3T6U A;  4BAF A;  1QUT A;  193L A;  1LYY A;  1UA6 Y;  3A95 A;  4M6D A;  1UUZ C;  3MGW A;  1HC0 A;  1LSZ A;  2BQA A;  1L77 A;  3FAD A;  5KXZ A;  1H87 A;  159L A;  1IC5 Y;  4CGE A;  5KXW A;  4I0C A;  1B7O A;  4LFP A;  4R6C A;  103L A;  4NSJ A;  119L A;  1BWH A;  1CU0 A;  1REY A;  1YAQ A;  2RSC A;  1LZT A;  219L A;  1AKI A;  1SX7 A;  4W55 A;  3A34 A;  1B7S A;  1WQP A;  1IWX A;  181L A;  1IWY A;  1LHK A;  4WLY A;  4OWE A;  1GFT A;  1LZY A;  158L A;  2A7F A;  4OW1 A;  1JTP L;  1L40 A;  3A67 Y;  2GV0 A;  3A3R X;  1LW9 A;  3WUA A;  1L27 A;  3C7Z A;  151L A;  133L A;  3N9E A;  1VFB C;  1GBZ A;  3C80 A;  3GUO A;  5LAG A;  3A3Q A;  3G3A B;  4HTQ A;  1YQV Y;  2VB1 A;  132L A;  188L A;  2BQI A;  1C46 A;  3TXG A;  3C7W A;  1C45 A;  1QS9 A;  1P37 A;  1HHL A;  143L A;  2DQC Y;  4TUN A;  3C8R A;  4NSI A;  1LYH A;  1HSW A;  2BQF A;  3J6K A;  1IP3 A;  2YBL A;  168L A;  3TXK A;  1LTM A;  3RNX A;  2Q9E A;  2HEC A;  1YL1 X;  4QEQ A;  4WM5 A;  2RBR A;  1IP6 A;  2MEB A;  2ZWB A;  1IC7 Y;  3HWL A;  255L A;  4ETA A;  4GCC A;  1NKH A;  4Z46 A;  5LXW A;  1XFP L;  1IR9 A;  1L10 A;  2BQG A;  3CSZ A;  1HEP A;  1C6B A;  1B5Y A;  5K7O A;  4ETD A;  1L98 A;  1L00 A;  185L A;  4HTN A;  1QUH A;  3TXB A;  1CUQ A;  208L A;  4GCD A;  1YIK A;  2FYD A;  186L A;  3FI7 A;  4PGJ B;  1FKQ A;  2EIZ C;  4LT1 A;  1FLQ A;  1KW5 A;  148L E;  1VAU A;  2QAR C;  1GBW A;  1JJ3 A;  3D4S A;  4KPM A;  4S0W A;  5A3E A;  5IEL A;  3HUK A;  1QIO A;  4NGL A;  2HED A;  3TXJ A;  110L A;  4LYB A;  1GB8 A;  190L A;  2W1M A;  2OE4 X;  1DYD A;  2DKV A;  1T6V L;  4W54 A;  1QTE A;  2B6Y A;  3W6A A;  187L A;  2Q0M X;  2MEF A;  4AQN A;  4LT0 A;  2F2N A;  1YKZ X;  1GBO A;  1LSF A;  139L A;  4A7D A;  4DQJ A;  1HNL A;  1OYU A;  1GFE A;  4ET9 A;  1C65 A;  1WQN A;  2RAZ X;  4OWH A;  3SB8 A;  4J7V A;  4W53 A;  1H6M A;  4DD2 A;  1XGP C;  1C08 C;  1B5U A;  1LGX A;  2RBP A;  3A94 A;  3W6E A;  4NY5 A;  172L A;  3WW6 A;  1B7M A;  1SSW A;  3AGH A;  4W96 A;  2HU3 A;  1KXW A;  1PQI A;  118L A;  2PC2 A;  234L A;  1IP2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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