1OWZA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 4-fluorophenethyl alcohol
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1owzA00
2CUUA 4I7MA 1LGUA 242LA 1L71A 3HH4A 1KS3A 2B75A 125LA 1L66A 4EXMA 1QT6A 219LA 1CX6A 243LA 1PQDA 235LA 209LA 1L23A 3C83A 3OE0A 4I7RA 245LA 1SX7A 1L59A 1L96A 1SWZA 1CV4A 1L77A 3V2YA 3C7WA 1SSYA 3OE8A 3FA0A 148LE 1CU0A 1ZYTA 2RAZX 1P2LA 113LA 1L80A 1L32A 187LA 1QT5A 174LA 1QTVA 216LA 1L26A 239LA 3C8SA 3DMXA 1C66A 230LA 1XJUA 4ARQB 1B6IA 177LA 246LA 1QT3A 1T8FA 3DN6A 3JR6A 2OE4X 3SN6R 206LA 1QTHA 4ARMA 4I7SA 253LA 2B6WA 3G3WA 247LA 3F8VA 1L18A 3CDOA 3DN8A 3HU9A 1L29A 1L16A 255LA 1QUHA 4W58A 7LZMA 178LA 1L56A 1XEPA 3SB9A 1OWZA 217LA 1WTHA 1G0LA 1L75A 167LA 215LA 107LA 1L70A 1L58A 1P37A 1C6MA 1QSBA 4IAPA 1OV5A 1L07A 4ARPA 161LA 212LA 1G0PA 3HUKA 1L57A 1P7SA 256LA 2RB1X 185LA 159LA 1L81A 3V2WA 127LA 211LA 2F32A 2LC9A 4I7QA 3SB6A 1L84A 4LDOA 1P46A 1C6BA 3CDRA 4PK0A 4E97A 1CU2A 4I7TA 1L90A 1LPYA 120LA 240LA 1QUDA 4I7OA 1L79A 1L72A 3GUPA 129LA 1CVKA 1C6DA 172LA 3HTFA 2ANVA 1L51A 2A4TA 3FADA 3HTBA 171LA 1SSWA 191LA 4YXAC 220LA 5I14A 4I7JA 2Q9DA 3RUNA 3PDSA 1L99A 3D4SA 1G0KA 1L93A 2OU0X 1L08A 1L88A 4LDEA 2QB0B 143LA 103LA 162LA 1K28A 226LA 3HH6A 147LA 199LA 3HTDA 1JTMA 1LYDA 2HUKA 145LA 3SBBC 1L01A 3OE6A 1L53A 214LA 192LA 1L54A 1L46A 2Q9EA 234LA 231LA 4ZPUA 1C6NA 4W57A 236LA 1L67A 1L19A 1PQOA 1EPYA 1L0JA 262LA 3HH3A 223LA 180LA 1SX2A 1KW7A 3C81A 4EKQA 3C80A 3GUIA 3HU8A 108LA 3LZMA 1QTCA 2RBOA 1D3NA 3L2XA 257LA 4AQNA 182LA 210LA 4I7NA 1C6LA 1G07A 1KY0A 119LA 1PQKA 1L61A 188LA 237LA 1D3FA 1L91A 3GUNA 1DYDA 3VW7A 146LA 4W52A 110LA 4DJHA 1L0KA 1LYFA 2OU9A 3UONA 3CDVA 1L55A 3K2RA 3SBAA 115LA 260LA 1C64A 227LA 152LA 3HH5A 3SB7A 1L36A 1P2RA 4GRVA 102LA 1QT4A 1LYJA 4PJZA 241LA 1T8GA 1CTWA 4ARQA 104LA 1KNIA 1QTDA 3C7YA 1L12A 2B6XA 1L69A 1L34A 2F47A 144LA 1L28A 1L42A 3G3XA 3NY8A 198LA 1L68A 1D3MA 1CU6A 128LA 1LYHA 225LA 1QT8A 2RBRA 1G1WA 1L37A 175LA 2NTGA 169LA 1LI6A 2O79A 2QARC 1D2WA 3C8RA 3SB8A 1L20A 163LA 221LA 2RBSA 118LA 1PQJA 1L97A 2RB0X 1LYIA 126LA 1L74A 3DN4A 1L64A 2B72A 4EKPA 1QTZA 1C63A 1L33A 1LYEA 1L52A 4DKLA 186LA 1DYCA 1LLHA 3FI5A 2RH1A 4YX7C 196LA 3PBLA 138LA 1C6KA 1CV3A 3GUOA 252LA 213LA 1I6SA 1D3JA 1L48A 181LA 2F2QA 111LA 1G1VA 1L04A 1L47A 201LA 3C82A 3DN2A 254LA 1L25A 4W59A 156LA 1TLAA 4ARLA 1P3NA 1T6HA 197LA 3GUMA 1L44A 1P64A 195LA 1CUQA 1QTBA 3CDTA 1XJTA 1C6EA 1L41A 3EMLA 3HT7A 5LZMA 3HT9A 183LA 1L76A 1KW5A 261LA 3HUQA 2O7AA 4EKSA 1L02A 3SB5A 1CUPA 3DMVA 1L24A 3GUJA 1L49A 1OWYA 3DN1A 3HT6A 1LGXA 4W53A 1L31A 1L94A 1QSQA 1C6IA 1C6JA 1L86A 2B70A 3GUKA 141LA 258LA 2B73A 142LA 3HT8A 3HDEA 1C67A 259LA 4EJ4A 1C69A 122LA 2B74A 1JQUA 2OEAX 4LDLA 3HUAA 250LA 1L39A 170LA 224LA 233LA 1KY1A 1L50A 4EPIA 3HDFA 4I7LA 1LWKA 3HTGA 1OVJA 1C60A 1L83A 1CV0A 1L22A 1C65A 1PQMA 137LA 200LA 2Z6BA 2L78A 4W56A 2NTHA 3C7ZA 1L62A 1C68A 2B6TA 4ARJA 112LA 1L17A 1SWYA 184LA 1L63A 3RZEA 1L00A 2B6ZA 2OE7X 1C6FA 4EPFA 1C6AA 166LA 1LW9A 1CV5A 123LA 1L95A 4OO9A 4W55A 1QT7A 4I7KA 155LA 1P6YA 1D2YA 1G0GA 4W51A 1DYGA 1L87A 205LA 189LA 238LA 190LA 2HUMA 1L30A 249LA 3QAKA 1L38A 1OYUA 1CU5A 248LA 1P56A 1L85A 1L14A 1L89A 149LA 2LZMA 4ARMB 140LA 2ANXA 1L43A 2OTYX 232LA 1L65A 2RBNA 4DAJA 4LZMA 3CDQA 1C61A 1OVHA 1G0JA 3GULA 3DN0A 1L05A 1CX7A 1OV7A 173LA 2IGCA 1DYAA 1T8AA 165LA 2HULA 1C6TA 1C62A 1L15A 1C6QA 1L82A 2OE9X 1P36A 1LI3A 160LA 1G0MA 1QS9A 1L11A 4S0WA 228LA 1LI2A 2OTZX 2OU8A 2LCBA 2B7XA 1NHBA 3ODUA 3NYAA 158LA 4W54A 6LZMA 1QUGA 218LA 1L13A 157LA 168LA 2B6YA 1L03A 3DKEX 1DYBA 2RBQA 3DNAA 176LA 4GBRB 4YXCA 114LA 1DYEA 1L21A 3HWLA 2RAYX 3OE9A 229LA 164LA 1C6CA 1ZWNA 1C6HA 1CV6A 3G3VA 3C8QA 4I7PA 3DN3A 4K5YA 1LWGA 1DYFA 1C6PA 1L98A 131LA 130LA 151LA 1L06A 3L64A 3NY9A 3F9LA 1JTNA 109LA 1ZURA 2RB2X 1C6GA 1OVKA 1LYGA 251LA 1L73A 1PQIA 1CU3A 1CV1A 1D9WA 1G0QA 1L09A 2O4WA 1QUOA 1L45A 1QS5A 1L60A 3DMZA 1G06A 150LA 1L10A 1L27A 1L92A 2RBPA 1P5CA 1T97A 1LGWA 1L40A 139LA 1L35A 244LA 4EKRA 222LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BQEA 1LGUA 2LYOA 4H9AA 1GB9A 1XGPC 2LZ2A 2YBHA 1EL1A 1JTOL 1QT6A 1D6PA 219LA 2HEDA 1XGUC 1PQDA 235LA 2DQEY 1IR9A 3OE0A 1LSDA 245LA 1SX7A 1LHHA 3BKHA 1IP5A 1L96A 1SWZA 5LINA 3WVXA 1LMNA 3W6BA 4DQ5A 4N0JA 5F9XA 1XGRC 3J6KA 1ZMYL 3D3DA 4HJZA 1CU0A 4YOPA 1UIHA 2ZIKA 4J1AA 113LA 5E9RA 4DC4A 1LSCA 1D0MA 1QTVA 1L26A 5LA8A 4B4IA 1GXXA 1C66A 6LYTA 1ZV5L 2ZNWY 246LA 1QT3A 1T8FA 1JWRA 1IX0A 2OE4X 3SN6R 4DT3A 4H9HA 206LA 4I7SA 2B6WA 4NHPA 3G3WA 1B5YA 2W1YA 3CDOA 3HBHA 3HU9A 6LYZA 5FDJA 255LA 4W58A 7LZMA 1XEPA 5B1FA 4G9SA 1AM7A 217LA 3KAMA 3B0OA 167LA 1L70A 4DQJA 1QDRA 1L58A 1GFTA 4IAPA 3WPKA 4ET8A 2BQBA 1CNSA 159LA 1L81A 2MEDA 1RE2A 1JJ1A 1G7JC 1FN5A 1HNLA 4LDOA 1GB8A 3J4GA 1IOSA 4I7TA 3TXGA 1UIEA 3A90A 2ZNXY 2G4PA 2BQAA 240LA 1QUDA 1IWXA 1WVVA 1YKZX 1L79A 3LYMA 1CVKA 1MELL 172LA 4DD0A 3B72A 4WM6A 1XEIA 191LA 4YXAC 220LA 132LA 1JJ3A 1L99A 5HNLA 2OU0X 1F6SA 2QB0B 3TXIA 103LA 1OUEA 3OJPA 1GB7A 3HH6A 4PRQA 5DN5A 4GN5C 4PJ2C 1IEEA 3SBBC 1WTNA 2XBRA 1XGTC 3A95A 1F6RA 1NDMC 214LA 1L46A 3N9CA 1W08A 1IORA 2Q9EA 3EXDA 2EIZC 5KXPA 3W6FA 1BVXA 2BQOA 3WVYA 4I8SA 3GUIA 4GN3A 3RT5X 4TUNA 1CJ8A 1IWVA 1GF3A 3A96A 237LA 1L91A 3GUNA 146LA 2IHLA 4OWCA 1L0KA 1WTMA 1L55A 3SBAA 1UIFA 2C8PA 115LA 4H8YA 1LMOA 1LMTA 227LA 1LZSA 1BWHA 3SB7A 1AT5A 1L36A 4GRVA 1QT4A 4WM1A 5F16A 1T8GA 1KNIA 4GN4A 135LA 2F47A 1L42A 1B7LA 1F0WA 2EKSC 4TX7A 1GBOA 1D2WA 2W1LA 5B06A 221LA 1HSXA 5I4WA 2BQIA 1L97A 1YQVY 126LA 5L3IA 3DN4A 4BAPA 1JKCA 1MLCE 3LYTA 9LYZA 1L52A 3WXUA 4PRUA 186LA 1DYCA 3FI5A 3PBLA 5FCPA 1CV3A 1I6SA 1WQNA 1L48A 4QY9A 2F2QA 4E3UA 1G1VA 1L04A 201LA 4XENA 1GFGA 156LA 2BQLA 1UACY 1L44A 1CUQA 1V7SA 5KXYA 2A7FA 4HSFA 3A93A 1C6EA 3HT7A 5LZMA 1HFZA 4WM3A 3HT9A 4HJYA 1DI4A 1IOQA 2YBLA 1LZ1A 2XJWA 1JITA 2YSSC 1L49A 3DN1A 2YBNA 1LGXA 2FYDA 1RFPA 3P68A 1C6JA 1L86A 5I53A 1LJHA 142LA 1OUFA 259LA 1IY4A 1T6VL 1I20A 4W94A 4CJ2A 2CWIA 3HUAA 2D91A 1GF9A 224LA 1LJNA 5KXLA 1OVJA 5I4XA 3RZ4A 4NGLA 2NTHA 1B0DA 1C68A 2B6TA 3K3TA 1KIRC 3WXTA 4YENA 1YILA 4IASA 4EPFA 1OUBA 4WG7A 1CV5A 1LZEA 123LA 1G7HC 4W55A 4I7KA 155LA 2FBBA 5B1GA 2YBMA 1GFAA 3TMVA 205LA 189LA 5K7OA 1LZBA 248LA 1GBSA 3WW5A 4WOAA 5KXWA 1JEFA 4ANRA 1GBYA 1J1XY 4NGZA 2D4JA 4NIJA 1C7PA 3TXHA 4YM8A 4WO9A 2RBNA 1GBZA 1HF4A 1L05A 5LYZA 2IGCA 1DYAA 5I5QA 1OUCA 4NGWA 4XJGA 1C6TA 2BQMA 1C6QA 1L82A 5LIOA 2OE9X 1LI3A 4G4HA 1NBYC 1QS9A 1BQLY 2OTZX 2B7XA 1NHBA 4X3BA 2F4GA 3W6EA 4W54A 6LZMA 1IIZA 1QUGA 1L13A 4EOFA 1RJCB 1UIBA 1L03A 2RBQA 1B7RA 1L21A 1D0KA 4NY5A 3OE9A 2F2NA 1C6HA 2DKVA 3G3VA 3C8QA 4I7PA 1DYFA 1C6PA 2DBTA 1GB6A 1L06A 3L64A 3LN2A 1GF7A 109LA 1OVKA 251LA 1TEWA 3AGGG 1LZ4A 1QS5A 4Z41A 1AKIA 1FLUA 5LVJA 1ZVHL 1IC7Y 4LFPA 2YBIA 1ALCA 4LYBA 1LJIA 4WO6A 5HQ1A 5HMJA 3ULRA 4I7MA 242LA 1WQQA 3W6CA 4NGYA 1GWDA 3RU5A 4GCEA 1GXV2 4EMNA 4EXMA 2PC2A 1LZ5A 1QSAA 4NGOA 5LVHA 1CX6A 4WLDA 4B1AA 1L23A 4I7RA 4TWSA 1CV4A 4N1EI 3V2YA 1JJ0A 4DD3A 148LE 5HMVA 5F9UA 4KXIA 2CJLA 2RAZX 4HV1A 5HNCA 1LSNA 187LA 1GE0A 1EQ4A 216LA 5KXRA 1UBZA 1IWTA 1C45A 1OUIA 3P64A 4NGIA 3WU9A 1GEZA 1DI3A 5D5CA 3EBAB 2DQFC 4ARQB 177LA 2BQJA 5ILFA 3CT1A 1LSPA 4LGKA 3M3UA 3F8VA 1E8LA 2RSCA 3DN8A 1GF6A 1L29A 1L16A 4UWUA 7LYZA 5KXMA 4RDSA 178LA 2LZTA 2BLXA 1GDWA 4IJ4A 2DQIY 5KXTA 3GXRA 1GAYA 1LZNA 1WQPA 3WPJA 5JENB 2DQCY 1OUJA 2YDGA 1L07A 4ARPA 161LA 2HEBA 1P7SA 5IELA 3BKVA 3V2WA 127LA 2LC9A 3SB6A 2XTHA 1IWUA 4DYGA 1P46A 3FI7A 3CDRA 4MSTA 4PK0A 2ZWBA 2HU1A 1LJ4A 1BHZA 3WUNA 4I7OA 129LA 1C6DA 2ANVA 4A7DA 5L3HA 2A4TA 3FADA 1A2YC 2D4IA 1SSWA 3LYZA 3RUNA 1UIDA 4LYMA 1L08A 1L88A 1C10A 1K28A 3MGWA 1LJGA 2NWDX 147LA 1LYDA 4XN6A 2HUKA 1IR7A 3A92A 1GB5A 5APDA 1L53A 5IHGA 1DPWA 3B6LA 1L54A 4GCDA 4WG1A 1GBWA 231LA 3CQLA 1L67A 1XFPL 1LYSA 1BGIA 4H91A 1L0JA 3HH3A 223LA 4HTQA 1SX2A 1KW7A 4H9IA 108LA 2RBOA 1HFYA 1D3NA 3AGHA 3EO5A 4I7NA 1C6LA 1VATA 1G07A 4R0FA 188LA 1CKFA 2EPEA 1IWYA 1H87A 4GCBA 4H9BA 4DJHA 2ZIJA 2OU9A 1LHJA 1BB4A 4N9RA 5KJ9A 1YAMA 1LZ6A 1I56A 1P2CC 1G7IC 1YAOA 1GE2A 2BQHA 1D9UA 1REYA 1CTWA 241LA 104LA 4LT0A 3C7YA 1L69A 4KPMA 1L28A 1VDQA 198LA 128LA 1LYHA 4OWAA 2RBRA 1LKSA 1L37A 3TMWA 1IR8A 169LA 4XJHA 2O79A 2QARC 3C8RA 5DL9A 1XGQC 2Z37A 118LA 1PQJA 2RB0X 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BQE A;  1LGU A;  2LYO A;  4H9A A;  1GB9 A;  1XGP C;  2LZ2 A;  2YBH A;  1EL1 A;  1JTO L;  1QT6 A;  1D6P A;  219L A;  2HED A;  1XGU C;  1PQD A;  235L A;  2DQE Y;  1IR9 A;  3OE0 A;  1LSD A;  245L A;  1SX7 A;  1LHH A;  3BKH A;  1IP5 A;  1L96 A;  1SWZ A;  5LIN A;  3WVX A;  1LMN A;  3W6B A;  4DQ5 A;  4N0J A;  5F9X A;  1XGR C;  3J6K A;  1ZMY L;  3D3D A;  4HJZ A;  1CU0 A;  4YOP A;  1UIH A;  2ZIK A;  4J1A A;  113L A;  5E9R A;  4DC4 A;  1LSC A;  1D0M A;  1QTV A;  1L26 A;  5LA8 A;  4B4I A;  1GXX A;  1C66 A;  6LYT A;  1ZV5 L;  2ZNW Y;  246L A;  1QT3 A;  1T8F A;  1JWR A;  1IX0 A;  2OE4 X;  3SN6 R;  4DT3 A;  4H9H A;  206L A;  4I7S A;  2B6W A;  4NHP A;  3G3W A;  1B5Y A;  2W1Y A;  3CDO A;  3HBH A;  3HU9 A;  6LYZ A;  5FDJ A;  255L A;  4W58 A;  7LZM A;  1XEP A;  5B1F A;  4G9S A;  1AM7 A;  217L A;  3KAM A;  3B0O A;  167L A;  1L70 A;  4DQJ A;  1QDR A;  1L58 A;  1GFT A;  4IAP A;  3WPK A;  4ET8 A;  2BQB A;  1CNS A;  159L A;  1L81 A;  2MED A;  1RE2 A;  1JJ1 A;  1G7J C;  1FN5 A;  1HNL A;  4LDO A;  1GB8 A;  3J4G A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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