1QT3A

T26d mutant of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYDIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (T4 Lysozyme)
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt3A00
4GBRB 3DN4A 6LZMA 1LI2A 1C65A 1C67A 1L38A 3DN0A 156LA 2RB2X 1L25A 1P5CA 1L74A 157LA 3HU9A 1L45A 3GUJA 252LA 4I7PA 5I14A 1G0JA 1XEPA 1PQMA 256LA 190LA 1CU6A 2OE9X 108LA 1LGUA 168LA 3F9LA 3GUIA 214LA 1LWKA 1L96A 4I7KA 1L51A 115LA 2RH1A 1SSWA 3DN1A 1CV4A 172LA 1P6YA 211LA 2RAYX 2B6YA 147LA 1C68A 1CUQA 1P2LA 1SX7A 1L48A 4I7NA 1L40A 3CDVA 4EPIA 2B75A 3FI5A 1L06A 129LA 2Q9EA 1XJTA 250LA 3SN6R 235LA 2NTHA 4GRVA 173LA 131LA 1OVKA 1P3NA 201LA 2B6XA 1PQDA 4ARLA 2B72A 219LA 209LA 189LA 1QSBA 213LA 141LA 3HU8A 2OU8A 1QTBA 170LA 200LA 2QB0B 4LDLA 1OVHA 1LYDA 3G3XA 3GUOA 3OE9A 1C61A 3HTDA 1DYEA 1QT7A 3DN2A 1CV3A 4S0WA 1D2WA 2RB1X 1CU5A 3GUPA 253LA 243LA 2HULA 1DYGA 1G06A 110LA 123LA 174LA 158LA 1C6QA 3UONA 1LW9A 1L97A 1L69A 109LA 1L86A 199LA 1KY0A 4E97A 1C6MA 1L62A 262LA 1SWZA 2LZMA 2LCBA 2O7AA 1L61A 227LA 2F2QA 188LA 178LA 1L72A 1L18A 1ZYTA 181LA 176LA 4ZPUA 206LA 1C6LA 2RBPA 3PDSA 3SB8A 221LA 2B6TA 1KS3A 3NYAA 1L0JA 1NHBA 3VW7A 1CU2A 4W51A 1D3MA 215LA 240LA 4W56A 1KY1A 1L60A 1T97A 3L64A 2NTGA 1L16A 1QT6A 4EKSA 5LZMA 4ARQA 232LA 1OYUA 1KW5A 2OU0X 1L33A 1QTZA 4ARJA 3L2XA 1C69A 169LA 1L11A 3C82A 1CV0A 1L79A 2B7XA 177LA 160LA 1QS5A 258LA 3GUMA 145LA 171LA 1JQUA 1G1VA 1C60A 4W59A 1CTWA 220LA 1C6PA 125LA 1JTMA 4AQNA 138LA 3G3WA 1LLHA 127LA 144LA 3HUAA 4K5YA 1PQJA 130LA 137LA 230LA 3QAKA 1L05A 1B6IA 1OWZA 4I7SA 1P36A 1KNIA 1L99A 231LA 4OO9A 1G1WA 2OEAX 195LA 161LA 1L03A 3DNAA 1L24A 1L82A 196LA 1DYBA 1C6NA 191LA 1QTHA 1L50A 1L32A 4DKLA 1L20A 165LA 163LA 1G0GA 2RBRA 1L87A 2QARC 3FADA 4I7JA 2CUUA 1L85A 164LA 1K28A 3HH6A 2F47A 4LDOA 1C6DA 4ARPA 4PK0A 142LA 3SB9A 119LA 205LA 1OWYA 1T8FA 1OV5A 1L41A 1QTDA 237LA 3CDRA 1T8GA 166LA 1L27A 228LA 249LA 1QUOA 226LA 4YX7C 3NY9A 1D3JA 3CDOA 2B73A 238LA 1T6HA 4W57A 1L09A 1L34A 148LE 1L65A 1L12A 2O79A 1L43A 255LA 3HH3A 3C7WA 3EMLA 192LA 1C6CA 167LA 1CVKA 3OE6A 4I7LA 1L02A 3G3VA 1L53A 1C6FA 3JR6A 247LA 1L54A 1L56A 155LA 3D4SA 1D3NA 1D2YA 3CDQA 1CU0A 2B74A 2HUMA 1LI3A 1LYFA 3NY8A 4I7MA 246LA 120LA 2OU9A 3C80A 2A4TA 1DYCA 1C6AA 1KW7A 1CUPA 4W53A 1ZURA 3HUKA 113LA 3HT6A 128LA 1C6EA 1L28A 2Z6BA 183LA 3OE0A 3HUQA 152LA 1L91A 4EKQA 3HTBA 216LA 2LC9A 103LA 223LA 218LA 1EPYA 1L67A 4W52A 3SB6A 1DYDA 146LA 1LYJA 111LA 1DYFA 1D3FA 182LA 3C8SA 1XJUA 185LA 149LA 1L90A 3OE8A 2RB0X 3DMZA 4YXAC 1PQIA 1L81A 1L21A 244LA 4IAPA 217LA 3HH4A 1QSQA 3HDEA 2OE4X 1L30A 4I7OA 2HUKA 4W58A 122LA 2Q9DA 1L15A 3C81A 2RBQA 1OVJA 1C6JA 1G0PA 159LA 212LA 4EXMA 1C6TA 3K2RA 2OTYX 261LA 1L55A 4EKPA 254LA 1LI6A 3RUNA 1ZWNA 151LA 1L73A 1C63A 1SX2A 1QT8A 1L68A 4I7TA 1L29A 2IGCA 112LA 257LA 3GULA 248LA 3GUNA 1P7SA 104LA 1P2RA 1L58A 1CU3A 4W55A 3SB5A 1C6IA 197LA 3DMVA 1L47A 3LZMA 239LA 1L13A 4EPFA 1CV5A 3GUKA 1L89A 1L44A 4YXCA 236LA 139LA 2ANVA 2RBSA 1LPYA 1C66A 1L0KA 1LYHA 1L08A 1T8AA 4EKRA 4LZMA 4DAJA 1L98A 2RAZX 1L04A 1L01A 1L71A 1L37A 1LWGA 3C83A 3HTGA 4I7QA 1QS9A 3SB7A 1SWYA 1L26A 1L39A 3HWLA 1L52A 198LA 210LA 3C7ZA 1L49A 1L63A 107LA 1C6KA 241LA 1DYAA 3DMXA 234LA 1G07A 1L07A 1QT5A 1PQKA 222LA 1L36A 1L92A 175LA 3HT8A 126LA 1C6BA 1L84A 143LA 1L94A 1CV6A 1L19A 186LA 3SBAA 1I6SA 114LA 180LA 2ANXA 1TLAA 1JTNA 3C7YA 1L22A 225LA 1L57A 1P46A 1LYGA 3DKEX 1L75A 1L59A 1D9WA 3HH5A 3FA0A 3HDFA 1L80A 1PQOA 3RZEA 1OV7A 3DN6A 1CX6A 1C6GA 2OE7X 1L46A 2OTZX 1L64A 3C8QA 3DN3A 3SBBC 229LA 4I7RA 1LGXA 3HT9A 1C64A 1CV1A 4W54A 1LGWA 259LA 1L95A 3HTFA 233LA 1C62A 1L70A 1QUDA 1CX7A 224LA 1L66A 1QT3A 2F32A 3F8VA 1QTCA 3PBLA 4PJZA 3CDTA 2RBOA 1L10A 1L93A 2O4WA 2B6WA 1L76A 1LYIA 1L77A 150LA 3DN8A 2B6ZA 1P64A 1L23A 1G0LA 4EJ4A 140LA 1QTVA 3ODUA 1G0MA 1QUGA 7LZMA 4ARMB 4ARMA 2B70A 4ARQB 162LA 1C6HA 1L31A 2L78A 102LA 184LA 1L42A 1P37A 1L83A 1LYEA 1QT4A 1L17A 3HT7A 1WTHA 1G0KA 1SSYA 118LA 3C8RA 3V2WA 1L14A 251LA 1QUHA 1L35A 3V2YA 1L00A 4LDEA 245LA 260LA 187LA 4DJHA 2RBNA 1P56A 1L88A 242LA 1G0QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OUEA 4GBRB 3DN4A 4NSHA 1LHMA 1GBXA 5KXYA 1L38A 156LA 1IR7A 1JPOA 3TXFA 4CJ2A 252LA 5I14A 5KKIA 1G0JA 1F6SA 1PQMA 1XEPA 1CU6A 2OE9X 5B05A 2X0AA 4B0DA 115LA 4NGLA 5II3A 5KXXA 147LA 1GB5A 4NGYA 4WO6A 3CDVA 4LYZA 1XEJA 2B75A 2Z38A 129LA 1XJTA 2NTHA 2MEEA 4W94A 4Z3MA 1QSBA 213LA 141LA 1GAYA 2BQEA 2W1LA 1P2CC 1IOSA 4LGKA 4MR1A 1YANA 2ZNXY 3A95A 1LSCA 4S0WA 1GBYA 2RB1X 2B5ZA 2YVBA 1DYGA 2BQLA 4LT2A 110LA 2MEAA 1C6QA 4GLAA 4BAPA 1L62A 262LA 1IP2A 1SWZA 1V7SA 1XGTC 1WTNA 3ATNA 2F2QA 2WARA 1LJFA 1L18A 1GF6A 3A67Y 2H5ZA 1C46A 3SB8A 1E8LA 2D91A 3VW7A 2C8OA 1UACY 4II8A 2XBRA 3ULRA 5LVHA 1GF0A 1WQRA 4NHPA 5D5CA 4GCDA 5KXTA 1QT6A 1W6ZA 1XGRC 5LZMA 1OYUA 1JWRA 3L2XA 1C69A 4AXTA 3C82A 1L79A 3AZ6A 1UIEA 4NGVA 145LA 1XGUC 1YAOA 3AGHA 3EO5A 1JIYA 1LJ3A 4PHIA 1GPQC 1UIHA 1CTWA 1C6PA 4UWVA 125LA 1JTMA 4AQNA 138LA 3G3WA 1HEWA 1B7RA 1LMPA 127LA 3QAKA 130LA 1PQJA 5KXZA 2G4PA 4CFOA 1LZ8A 1OWZA 4I7SA 1BWHA 1P36A 1KNIA 4Z41A 3A3RX 5LVGA 5APDA 4B1AA 1G7MC 3DNAA 1GF9A 5APFA 1C43A 3AZ4A 191LA 4DKLA 1L20A 1G7LC 1XGPC 1IWTA 1LAAA 3W6AA 5FHWA 2F47A 5IELA 1YL0X 1C6DA 3KAMA 2D4JA 1C45A 119LA 1CKGA 1T8FA 1L41A 1LSNA 4HSFA 1GF3A 5FCPA 226LA 3G3AB 2W1MA 3A93A 3CDOA 4PJ2C 4W57A 1LZ5A 4NHQA 1RCMA 1L12A 2EQLA 2O79A 2BQJA 1DKJA 3EMLA 1BGIA 167LA 1BVXA 1IOQA 2BLXA 1L53A 1C6FA 2N5ZA 5JENB 1L54A 1TDYA 5B1FA 155LA 1D3NA 1VDQA 4ZIXA 3TXJA 2OU9A 3WW5A 1DYCA 1BWIA 1ZURA 3D3DA 5L3HA 3HUKA 4W96A 1IO5A 1C6EA 2CGIA 3WPKA 3HUQA 1QSWA 152LA 2DBTA 2ZYCA 4CFPA 3HTBA 1LMNA 4GLVA 103LA 223LA 1IP3A 2HU1A 4QGZA 1CJ7A 4HTQA 3C8SA 1DPWA 1PS5A 1OUHA 185LA 149LA 2LYOA 3DMZA 1NDGC 1L81A 1L21A 1QSQA 1L30A 3B0KA 4BAFA 2Q9DA 3C81A 4HPIA 1G0PA 1IWUA 2NWDX 1GB0A 1C6TA 1AT5A 2EKSC 1REXA 4U3XB 3CT5A 4J7VA 3RUNA 1FBIX 3K3TA 1QSAA 4KT3A 151LA 5C6JA 1B5ZA 2DQDY 1QT8A 3WULA 1L68A 112LA 257LA 3GUNA 4B49A 1P7SA 1B7MA 1L58A 197LA 4G49A 1J1OY 1B5UA 1L13A 4EPFA 1T3PA 3GUKA 1EQ5A 2YSSC 1LPYA 1C66A 4QY9A 1GF4A 4EMNA 4GN4A 5LYMA 2RAZX 4P2EA 1L71A 3C83A 3HTGA 2BAAA 1QS9A 5KXOA 2CWIA 1SWYA 4BS7A 1YROA 3HWLA 1IWWA 1L52A 4H90A 1OUBA 1QQYA 1G07A 4XJBA 2BLYA 1JKBA 175LA 4GN3A 5F9XA 1GF7A 1C6BA 3ZVQB 5HLLA 1L94A 1YAPA 3N9EA 1L19A 3A94A 3FI7A 5LA8A 3C7YA 4NHSA 4NY5A 5IDDA 5L3IA 1L22A 4ZFPA 2BQMA 225LA 1L57A 4GCFA 3DKEX 4A7DA 4WLTA 1L80A 2Z12A 1C6GA 1RE2A 5FSTA 1L46A 4H9BA 3WUMA 4LYBA 4I7RA 4WLYA 2F2NA 3HT9A 3P68A 4B4JA 1CV1A 4W54A 233LA 1C62A 1L70A 1CX7A 224LA 1QT3A 2F32A 1QTCA 2MEFA 5LAFA 4PJZA 4C5FA 3CDTA 3RT5X 1GFKA 1L77A 1DZBX 1GE0A 1QTVA 4J1AA 2ZILA 3IJUA 2ZWBA 4ARMB 4NHIA 5I5QA 4ET8A 4ARQB 2ZNWY 2F4AA 2DQFC 1QT4A 2DQGY 3P4ZA 4L41A 1G0KA 1BQLY 4FJRA 4YEMA 251LA 1L35A 3V2YA 135LA 2Z18A 2RBNA 2Z2FA 3QY4A 1P56A 1L88A 1B2KA 1D0KA 3DN0A 1LZGA 1TEWA 1L25A 1P5CA 3HU9A 4NWHA 4H91A 1L45A 3W6FA 1UICA 2ZQ3A 256LA 4H9HA 3GUIA 2IHLA 214LA 1L96A 1L51A 1B0DA 3LYZA 1CV4A 172LA 211LA 1LZCA 1GB2A 4E3UA 4NWEA 4PGJB 3W6EA 4I7NA 4EPIA 1GFEA 1TCYA 2H9KA 4GN5C 6LYTA 4LYCA 4GRVA 209LA 4LT0A 1GFVA 3WPJA 1B5WA 170LA 200LA 1OVHA 3OE9A 1XEIA 3HTDA 1DYEA 1PZYA 1CV3A 1D2WA 1CU5A 1GFGA 1LJIA 1HFYA 3A92A 2BQNA 3G3BB 1GB3A 2YDGA 4DD2A 1OUDA 3B72A 3WYHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OUE A;  4GBR B;  3DN4 A;  4NSH A;  1LHM A;  1GBX A;  5KXY A;  1L38 A;  156L A;  1IR7 A;  1JPO A;  3TXF A;  4CJ2 A;  252L A;  5I14 A;  5KKI A;  1G0J A;  1F6S A;  1PQM A;  1XEP A;  1CU6 A;  2OE9 X;  5B05 A;  2X0A A;  4B0D A;  115L A;  4NGL A;  5II3 A;  5KXX A;  147L A;  1GB5 A;  4NGY A;  4WO6 A;  3CDV A;  4LYZ A;  1XEJ A;  2B75 A;  2Z38 A;  129L A;  1XJT A;  2NTH A;  2MEE A;  4W94 A;  4Z3M A;  1QSB A;  213L A;  141L A;  1GAY A;  2BQE A;  2W1L A;  1P2C C;  1IOS A;  4LGK A;  4MR1 A;  1YAN A;  2ZNX Y;  3A95 A;  1LSC A;  4S0W A;  1GBY A;  2RB1 X;  2B5Z A;  2YVB A;  1DYG A;  2BQL A;  4LT2 A;  110L A;  2MEA A;  1C6Q A;  4GLA A;  4BAP A;  1L62 A;  262L A;  1IP2 A;  1SWZ A;  1V7S A;  1XGT C;  1WTN A;  3ATN A;  2F2Q A;  2WAR A;  1LJF A;  1L18 A;  1GF6 A;  3A67 Y;  2H5Z A;  1C46 A;  3SB8 A;  1E8L A;  2D91 A;  3VW7 A;  2C8O A;  1UAC Y;  4II8 A;  2XBR A;  3ULR A;  5LVH A;  1GF0 A;  1WQR A;  4NHP A;  5D5C A;  4GCD A;  5KXT A;  1QT6 A;  1W6Z A;  1XGR C;  5LZM A;  1OYU A;  1JWR A;  3L2X A;  1C69 A;  4AXT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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