1QT4A

T26q mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYQIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt4A00
155LA 1L98A 1L93A 178LA 4I7LA 3NYAA 128LA 187LA 2B6XA 2B6TA 4ZPUA 1PQJA 1L29A 1L48A 228LA 243LA 170LA 1CU3A 114LA 149LA 1QS9A 2CUUA 2Z6BA 247LA 4W58A 3DNAA 1C66A 1L61A 2IGCA 3HUKA 3ODUA 220LA 3HT6A 7LZMA 1LYFA 1T6HA 3SB7A 222LA 1L77A 3GUJA 1XJTA 1WTHA 1QT4A 1JQUA 1OWZA 167LA 225LA 4I7NA 1QTHA 1L42A 2O79A 4W51A 1L66A 1L35A 1LYEA 1L40A 4EKRA 180LA 4I7KA 1L24A 4I7OA 1PQDA 1C6NA 1P3NA 2OE7X 3DMVA 168LA 3C81A 109LA 3HU8A 1C6JA 1QTBA 1L55A 3PBLA 1LGWA 2F47A 3HT7A 250LA 102LA 213LA 3OE6A 4YXAC 4EKPA 1L03A 1P7SA 3GUOA 1L33A 1PQMA 1OV5A 1C62A 1G0GA 1G0KA 4S0WA 3FADA 254LA 1G0LA 4LDOA 1LYJA 256LA 3SBAA 3DKEX 1L73A 1NHBA 4W57A 1L62A 252LA 2RBSA 3UONA 4PK0A 1L34A 1L80A 2HUMA 186LA 1L95A 205LA 1P2LA 4OO9A 163LA 147LA 1KW7A 157LA 184LA 162LA 1L21A 1CVKA 4YX7C 3HTGA 3CDRA 3HH4A 1C6EA 131LA 3C80A 1D3MA 1D3JA 1L58A 1QT8A 1CUQA 3G3VA 1L88A 255LA 258LA 1PQIA 1L45A 1L74A 2OTZX 3K2RA 1L54A 1CTWA 156LA 3FA0A 1C6AA 232LA 164LA 2RB2X 2OU9A 3OE9A 2B73A 1OV7A 3CDVA 1L89A 1T8GA 1L71A 3SB9A 1L01A 1P46A 3GUMA 1L14A 4W55A 1CX6A 150LA 3HTBA 107LA 172LA 1LLHA 4EKSA 1L22A 219LA 1L43A 1L50A 4ARJA 2QARC 103LA 218LA 6LZMA 1KS3A 2RBPA 3SB5A 200LA 215LA 1QT7A 1L63A 3LZMA 181LA 165LA 138LA 201LA 3CDQA 3DN0A 4DAJA 188LA 2O4WA 4W56A 1QUOA 1DYCA 2F2QA 1L04A 233LA 2B7XA 1OWYA 169LA 251LA 4I7MA 4I7TA 1C6TA 1L97A 175LA 235LA 1L68A 1P5CA 2RBOA 113LA 145LA 227LA 120LA 1LWGA 2B75A 1DYEA 1SSWA 1CU2A 3HH5A 206LA 4YXCA 2ANXA 3RUNA 126LA 1DYAA 1LYDA 122LA 1CV6A 1L69A 2RAZX 1LGXA 1LPYA 110LA 4ARMB 1QTDA 246LA 244LA 1L12A 261LA 1DYFA 125LA 195LA 183LA 3HUAA 4ARMA 257LA 3DN2A 3SB6A 2RB1X 1C67A 3HT8A 3V2YA 1L92A 1CV5A 1L23A 2NTHA 197LA 1L90A 1L87A 1I6SA 1C6BA 214LA 1QUHA 1LGUA 1SX7A 1C6LA 1L13A 1OVJA 199LA 3C7WA 3DN4A 4DKLA 3HWLA 1KY1A 1T8FA 1L79A 3C82A 140LA 1QT6A 2RH1A 4K5YA 176LA 4E97A 4GBRB 1D2WA 1QT3A 1L27A 2RBQA 1C6HA 3C8QA 1CV3A 4W59A 4DJHA 104LA 177LA 4ARQA 1JTNA 1QSBA 210LA 1C63A 1LI2A 3SN6R 1C6PA 151LA 1OVKA 260LA 3C7ZA 1L56A 1L44A 3GUPA 4LDEA 148LE 1KW5A 1CU0A 1P6YA 1ZURA 3HH6A 141LA 139LA 1L06A 1L36A 2OE4X 192LA 3QAKA 185LA 1L83A 1OYUA 1L53A 3OE0A 240LA 2LC9A 1L65A 1L02A 3C8SA 1L99A 4AQNA 1L28A 3PDSA 1L38A 3DMZA 241LA 1L17A 2LZMA 1QTVA 1L59A 196LA 3HH3A 3EMLA 3RZEA 1CV4A 191LA 1SWYA 249LA 1L07A 2OU8A 262LA 1C68A 3CDOA 4EKQA 1L70A 1QUGA 1L09A 1LYIA 1CUPA 158LA 3GULA 3G3WA 2HUKA 4GRVA 1L08A 1DYDA 4IAPA 3JR6A 3HU9A 1C60A 1P2RA 229LA 1XEPA 1SSYA 3NY9A 1G1WA 1PQKA 1L26A 112LA 224LA 1L57A 238LA 4I7PA 1P36A 111LA 1L47A 2RAYX 2L78A 1CU6A 1G1VA 1P56A 1C6MA 1L91A 4EJ4A 2OE9X 2RBNA 1CV1A 1L20A 2QB0B 1CV0A 1JTMA 1C61A 160LA 216LA 2B6ZA 1CX7A 2O7AA 1C65A 1L94A 226LA 143LA 5I14A 230LA 5LZMA 1C6FA 1L30A 2NTGA 217LA 1C64A 1ZYTA 182LA 144LA 1LI3A 1L86A 142LA 190LA 2F32A 1T8AA 1TLAA 1L0JA 3DN8A 231LA 1C6QA 4EXMA 1D2YA 1KNIA 1QTZA 3NY8A 1L31A 130LA 3SBBC 4W53A 1L67A 3DN1A 1DYBA 1L19A 1SX2A 118LA 3G3XA 3HDEA 3VW7A 4LZMA 127LA 1L16A 159LA 209LA 4I7RA 115LA 1L52A 1G0PA 1C6KA 259LA 1C69A 1G0JA 239LA 1L82A 2B6WA 1L46A 3CDTA 1SWZA 2ANVA 1QS5A 237LA 4EPIA 1L85A 4ARQB 129LA 3L64A 3GUIA 166LA 1L32A 108LA 1D3NA 171LA 3GUKA 146LA 234LA 1XJUA 152LA 1L49A 1OVHA 4ARLA 1LI6A 1PQOA 1L05A 1QT5A 1L75A 2OEAX 1L39A 161LA 4I7JA 1L15A 3DMXA 3OE8A 1KY0A 1P37A 3L2XA 236LA 1L37A 2B74A 4I7SA 1QUDA 2OTYX 221LA 1QSQA 1L72A 123LA 173LA 2A4TA 3HTDA 2HULA 1T97A 1L18A 2RB0X 3C83A 3FI5A 1L11A 1L25A 1ZWNA 1K28A 3HTFA 4W54A 2B72A 4PJZA 1L00A 4LDLA 2LCBA 1L41A 1G07A 211LA 1LWKA 3D4SA 1L81A 212LA 3C8RA 189LA 4I7QA 174LA 242LA 1L0KA 1L64A 3DN6A 2B6YA 1C6GA 2Q9EA 4EPFA 1C6IA 1G0QA 4W52A 1LYHA 3HT9A 3C7YA 2OU0X 1B6IA 245LA 4ARPA 3V2WA 1C6CA 1D3FA 2Q9DA 198LA 137LA 1D9WA 119LA 1L76A 2B70A 1EPYA 3DN3A 1G0MA 1L60A 223LA 3HDFA 1C6DA 3HUQA 1G06A 2RBRA 3F9LA 1QTCA 3GUNA 1CU5A 248LA 1L84A 1P64A 253LA 1L51A 1DYGA 1LW9A 3SB8A 3F8VA 1L10A 1LYGA 1L96A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W3EA 155LA 1HEMA 5D5CA 4I7LA 1D6QA 2B6XA 5KXLA 1YAMA 2W1LA 1LSYA 5D5FA 4TUNA 2DQGY 5LYZA 1LSEA 114LA 149LA 2CUUA 2Z6BA 4W58A 3HUKA 1NWGA 220LA 3HT6A 2BQGA 4NG8A 1E8LA 1SLYA 1JSFA 1LYFA 1T6HA 1QDTA 1L77A 1FLWA 4ZIXA 1JQUA 1OUDA 2MEBA 1CNSA 4W51A 2YSSC 4LT0A 1VDSA 4EKRA 1UIHA 4I7KA 3IWRA 2OE7X 3DMVA 1P3NA 1NDGC 1C6JA 1QTBA 1L55A 1B7RA 1GFKA 1UICA 2H5ZA 250LA 4EKPA 4YXAC 1JJ1A 1GB9A 3GUOA 1L33A 4ETCA 1G0GA 3AGGG 1G0KA 1G0LA 4LDOA 4H9FA 1LYJA 3SBAA 3DKEX 1LZGA 1YANA 4PK0A 1B5XA 205LA 3WYHA 163LA 1B5ZA 1XGQC 3HTGA 3HH4A 4DDAA 5KXTA 131LA 3C80A 1GFUA 3G3BB 3B0OA 1D3JA 4NEBA 1CUQA 1GF8A 2HTXA 1LJNA 1GE0A 2H9KA 5LINA 4LFPA 2BQFA 1L74A 1L54A 1LSNA 2HU3A 1CTWA 3FA0A 9LYZA 1OQMA 1FBIX 1C6AA 232LA 3OE9A 2OU9A 4H9IA 1WQPA 4TX7A 1JEFA 1L89A 3AJNA 1L71A 4NFVA 1L01A 1P46A 1B2KA 4W55A 1JWRA 1IP3A 4NSHA 107LA 172LA 2BLXA 1L22A 1LCNA 2QARC 103LA 1QUTA 1YAQA 1B5WA 1IY4A 1GBOA 1HNLA 215LA 4N1CC 4GLVA 1L63A 1NQIA 1BB4A 138LA 1UIFA 5B07A 201LA 1YKXX 3DN0A 4DAJA 188LA 4W56A 1DYCA 1IOQA 1UA6Y 3B0KA 4I7TA 4J0LA 1L97A 235LA 4LGKA 2BQDA 2RBOA 4NG1A 145LA 227LA 3A34A 5DN4A 1DKJA 3CT1A 1JUGA 4YXCA 3RUNA 126LA 2BQMA 3WMKA 3WL2A 1L69A 2RAZX 4G4HA 5L3HA 4RDSA 1HC0A 1G7LC 1V7SA 3A92A 4J1BA 4NWEA 3HUAA 3V2YA 1L92A 4DD3A 1WQRA 1GWDA 5HLLA 2I6ZA 1OUJA 1C6BA 214LA 4DQJA 4H91A 1C6LA 1OVJA 5LYTA 3DN4A 2HU1A 3CSZA 1KY1A 1WQOA 3TMUA 1CJ6A 4PGJB 2HEAA 1IWWA 176LA 5KJ9A 2C8PA 1D2WA 1G7IC 3B72A 3W6EA 2RBQA 4HJZA 1C6HA 1DPWA 177LA 4N5RA 4ARQA 210LA 2BQCA 2YBHA 1OVKA 4YF2A 1L56A 2D6BA 5F16A 4LDEA 1IOCA 1QTEA 1CU0A 1GD6A 1L06A 3M18B 1LYYA 192LA 5I4XA 185LA 1LZCA 1L83A 1OYUA 207LA 1L53A 1HELA 3BKVA 4QEQA 1OP9B 3WPJA 1L65A 4RW1A 2A7DA 1GFAA 241LA 1G7JC 1L17A 1GE1A 1QTVA 5DL9A 2MEFA 1XFPL 4XJHA 1LMTA 4B0DA 249LA 262LA 1C68A 1QUGA 5K7OA 4CJ2A 1T6VL 4GRVA 4H9EA 4CFOA 1C60A 1P2RA 229LA 1CKHA 1GB2A 1SSYA 1YIKA 1G1WA 1H87A 238LA 4WO6A 1G1VA 1C6MA 1J1XY 1L91A 3A3QA 3A8ZA 3WPKA 1GFRA 2FYDA 216LA 1C7PA 1UIGA 226LA 5LAGA 1VATA 1YKZX 1VEDA 217LA 182LA 4NGVA 3A95A 3FI7A 190LA 2W1XA 4B4EA 4W96A 1L0JA 1LMOA 4EXMA 1IORA 1LAAA 1DYBA 4H9HA 2FYCA 2HECA 1JKAA 4LZMA 1DPXA 4DD9A 2YDGA 1LSFA 1GF4A 1DI5A 239LA 4UWVA 5KXRA 2B6WA 4G9SA 3CDTA 4DD1A 132LA 5FEKA 1B0DA 3L64A 3GUIA 166LA 5LA8A 4EOFA 4DD2A 1LZ8A 1XEJA 5IDDA 4AXTA 152LA 3RU5A 1QT5A 1LJJA 4I7JA 1L15A 3DMXA 3J6KA 3OE8A 5DLAA 1GXXA 1LKRA 1QUDA 1LHKA 4II8A 5FDJA 5T3FA 3A90A 1QSQA 1GAYA 1L72A 2WARA 3HTDA 4H90A 1T97A 2DQJY 1B7QA 1LMAA 2HUBA 1TEWA 1L41A 3EO5A 1LWKA 208LA 1L81A 4OWBA 3AZ7A 174LA 2H9JA 1I20A 1DQJC 1G0QA 2CJLA 3HT9A 1GBYA 4GCEA 4GCCA 1GFVA 1D3FA 2Q9DA 1HFZA 1L76A 1OUAA 1GF0A 4NGOA 4XENA 1JJ3A 1L60A 2MEEA 3AYQA 4H8ZA 2RBRA 3GUNA 1CU5A 3WH1A 1P64A 253LA 1DYGA 1LW9A 4RLNA 4ARJA 1L96A 1L93A 1CJ9A 1LZ6A 1BWJA 3HFMY 4ZPUA 1PQJA 1IWXA 1L29A 1L48A 5APDA 1GF3A 243LA 1IWUA 1HMLA 4HSFA 1LJ3A 1QS9A 2D91A 3DNAA 3W6BA 1L61A 2IGCA 2I25L 4GN4A 1OUIA 1GEVA 1GF7A 6LYTA 5FSTA 1HEQA 1LSZA 3AZ4A 1HEOA 3SB7A 3A93A 1B5UA 5LVGA 1LJIA 1QT4A 1QUSA 1WTHA 4MCKA 1JTOL 1GFJA 167LA 4H9AA 2MEDA 1KIQC 1GE2A 1L42A 2O79A 3WUAA 1L40A 4GCFA 4ETBA 168LA 109LA 3TXFA 1GE3A 3HU8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3W3E A;  155L A;  1HEM A;  5D5C A;  4I7L A;  1D6Q A;  2B6X A;  5KXL A;  1YAM A;  2W1L A;  1LSY A;  5D5F A;  4TUN A;  2DQG Y;  5LYZ A;  1LSE A;  114L A;  149L A;  2CUU A;  2Z6B A;  4W58 A;  3HUK A;  1NWG A;  220L A;  3HT6 A;  2BQG A;  4NG8 A;  1E8L A;  1SLY A;  1JSF A;  1LYF A;  1T6H A;  1QDT A;  1L77 A;  1FLW A;  4ZIX A;  1JQU A;  1OUD A;  2MEB A;  1CNS A;  4W51 A;  2YSS C;  4LT0 A;  1VDS A;  4EKR A;  1UIH A;  4I7K A;  3IWR A;  2OE7 X;  3DMV A;  1P3N A;  1NDG C;  1C6J A;  1QTB A;  1L55 A;  1B7R A;  1GFK A;  1UIC A;  2H5Z A;  250L A;  4EKP A;  4YXA C;  1JJ1 A;  1GB9 A;  3GUO A;  1L33 A;  4ETC A;  1G0G A;  3AGG G;  1G0K A;  1G0L A;  4LDO A;  4H9F A;  1LYJ A;  3SBA A;  3DKE X;  1LZG A;  1YAN A;  4PK0 A;  1B5X A;  205L A;  3WYH A;  163L A;  1B5Z A;  1XGQ C;  3HTG A;  3HH4 A;  4DDA A;  5KXT A;  131L A;  3C80 A;  1GFU A;  3G3B B;  3B0O A;  1D3J A;  4NEB A;  1CUQ A;  1GF8 A;  2HTX A;  1LJN A;  1GE0 A;  2H9K A;  5LIN A;  4LFP A;  2BQF A;  1L74 A;  1L54 A;  1LSN A;  2HU3 A;  1CTW A;  3FA0 A;  9LYZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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