1QT5A

D20e mutant structure of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKETEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt5A00
1XJUA 1B6IA 255LA 2B75A 3GUJA 260LA 229LA 231LA 1CUPA 3V2WA 2B74A 123LA 1D3FA 4YXCA 1SX2A 218LA 1P37A 4EXMA 1CX6A 3C8SA 3GUIA 1OWZA 1D2WA 1G06A 236LA 254LA 239LA 3UONA 233LA 152LA 4EJ4A 178LA 1CV1A 3DN0A 230LA 2OU9A 1L40A 1L52A 1L27A 4I7PA 3GUNA 2OU8A 213LA 4I7NA 147LA 1C66A 3JR6A 190LA 138LA 4W58A 1QS9A 1L72A 2B6ZA 1L0JA 3C7ZA 150LA 1L17A 4W52A 1L68A 3LZMA 2RBSA 1G0MA 140LA 4DJHA 1KY0A 4EPFA 1QUGA 1CTWA 107LA 1T8GA 3DN6A 2RBOA 4I7MA 1L06A 212LA 206LA 1L67A 3SB5A 1DYGA 1L46A 1LPYA 3HDEA 4YX7C 1C6PA 1P2LA 1D3JA 173LA 176LA 4IAPA 1JQUA 1G0PA 1G0KA 1L63A 3HH6A 4LDLA 1LYEA 195LA 3PBLA 1CU3A 1P7SA 1L62A 3HU8A 1KNIA 259LA 2Q9DA 3NY8A 257LA 234LA 4LDEA 3HU9A 4ARJA 2F2QA 2F47A 4I7SA 4PK0A 3HTGA 3C8QA 4ARQA 1CU0A 1L94A 2RB0X 1L58A 2B6TA 144LA 243LA 1PQOA 3DNAA 4YXAC 1C6AA 1D2YA 3OE6A 223LA 1T8AA 246LA 125LA 1C62A 1L75A 198LA 2B73A 197LA 1QTBA 1D3MA 3SB7A 1CU5A 247LA 2NTGA 1CUQA 184LA 238LA 3HTFA 241LA 4ZPUA 1L85A 187LA 3CDRA 3GUPA 3HWLA 3HT6A 222LA 1L66A 4W59A 1L95A 251LA 180LA 1LGWA 1P64A 1SSYA 2OTZX 104LA 1L89A 139LA 1OV5A 1L69A 2LZMA 1QT3A 2ANXA 2O79A 1NHBA 1KS3A 1QUDA 1CV3A 1L42A 4DKLA 1L80A 3OE0A 1L96A 148LE 1L24A 1L97A 156LA 3V2YA 4LDOA 151LA 1L04A 1PQJA 118LA 181LA 3HUKA 2OEAX 3F8VA 162LA 167LA 3HTDA 256LA 1OVJA 3NY9A 1L39A 186LA 4ARPA 1L01A 1EPYA 126LA 160LA 242LA 2OE7X 1L61A 3GUMA 3SB9A 2QB0B 3VW7A 3DKEX 250LA 1LYDA 252LA 2RBQA 3CDVA 1L13A 1L91A 3DN4A 1L54A 2LC9A 192LA 2RAZX 1C65A 1P56A 1CV4A 1C68A 3DN1A 4I7QA 170LA 199LA 1LI6A 1K28A 127LA 1QT5A 1G0JA 1LYIA 211LA 4ARQB 1LLHA 228LA 1L19A 216LA 3G3VA 3HH5A 1SX7A 1L57A 1QTCA 1L51A 1C6TA 1L77A 4W53A 253LA 1L48A 215LA 4W55A 3FA0A 141LA 3DMXA 5LZMA 4W57A 1L45A 1WTHA 1C6EA 1LYJA 1D9WA 3G3WA 1TLAA 1G0GA 1G1VA 3C7WA 1L22A 1L84A 1C6NA 1KW5A 4OO9A 1L08A 1C6HA 4GRVA 4ARMB 4LZMA 1L56A 3CDOA 3HH3A 1CX7A 1OWYA 2B72A 3DN3A 1L93A 1DYFA 1L98A 1C6FA 3GUOA 1L41A 3SB6A 1JTNA 1T6HA 2OE9X 3GUKA 3CDQA 3OE8A 1L03A 130LA 122LA 1L00A 3C8RA 3C82A 1C6MA 1L50A 1QSQA 1C6IA 4W54A 1L71A 240LA 2RBNA 4EKPA 1L37A 2RAYX 1L73A 3D4SA 1T8FA 2O7AA 1CVKA 2QARC 189LA 1L81A 1QT4A 1LWGA 1L90A 114LA 1L0KA 2B7XA 1C6BA 1LGXA 1L36A 3HUAA 4GBRB 1OYUA 4EKQA 1L12A 3ODUA 4ARMA 3HDFA 102LA 145LA 191LA 131LA 146LA 196LA 1ZURA 249LA 1P46A 1P36A 209LA 1L86A 3DN8A 110LA 1C61A 1OVKA 2F32A 2RH1A 1L20A 1L74A 103LA 227LA 1L70A 3FADA 1L34A 174LA 157LA 3DMZA 142LA 177LA 120LA 3DN2A 2RB1X 4K5YA 1L47A 262LA 1L21A 155LA 1LWKA 4DAJA 1OV7A 149LA 1P2RA 3NYAA 1DYCA 4I7TA 128LA 1C69A 1QT6A 3K2RA 205LA 1XEPA 2B6XA 3L64A 1CV6A 4I7KA 1QUOA 2OE4X 1L07A 188LA 1SSWA 4PJZA 4EKRA 183LA 2B70A 5I14A 4I7OA 1LYGA 1LYHA 1SWZA 1G1WA 1C60A 237LA 2Z6BA 3C81A 3SBBC 221LA 3CDTA 161LA 3SBAA 2OTYX 1KY1A 1L18A 1PQIA 2HULA 3L2XA 6LZMA 2B6YA 1L05A 3SN6R 1LYFA 112LA 137LA 1L82A 159LA 4EPIA 1DYDA 1P5CA 1L25A 1L79A 1L92A 1L76A 1C6DA 3HH4A 4I7JA 3RUNA 168LA 1D3NA 1L44A 119LA 1L31A 2CUUA 4E97A 3HT9A 2A4TA 210LA 1QS5A 4W51A 1C6GA 261LA 219LA 1L32A 2RBRA 4ARLA 1L26A 1LGUA 1CV5A 1QTVA 4W56A 3F9LA 1L14A 1QSBA 3PDSA 1L43A 166LA 1L15A 2Q9EA 201LA 3SB8A 2LCBA 4AQNA 175LA 129LA 1P6YA 2IGCA 244LA 224LA 1C64A 1JTMA 1DYEA 1G0LA 3HT7A 2B6WA 185LA 1L09A 1LI2A 200LA 3GULA 1C6QA 1G0QA 1P3NA 2O4WA 182LA 1L02A 1C6JA 258LA 1L28A 108LA 1QTZA 1T97A 235LA 1L10A 1QTHA 1L33A 1L83A 1XJTA 2RB2X 163LA 2NTHA 1L88A 1KW7A 2OU0X 3OE9A 1L99A 1SWYA 214LA 4S0WA 1ZYTA 1L38A 1LI3A 1PQMA 217LA 3G3XA 1L59A 3DMVA 1C6LA 1L64A 171LA 3HT8A 2L78A 1ZWNA 1QUHA 1OVHA 1PQKA 225LA 232LA 113LA 172LA 1LW9A 164LA 109LA 1QTDA 1L29A 3HTBA 1DYAA 3C7YA 2HUMA 111LA 1I6SA 1CU6A 2ANVA 3C80A 4EKSA 1L53A 3FI5A 1L35A 3HUQA 1L55A 1L30A 1L87A 3RZEA 1QT8A 169LA 2HUKA 1C6CA 248LA 1L23A 4I7RA 165LA 1L49A 1L65A 3EMLA 3QAKA 245LA 1PQDA 143LA 115LA 1C63A 1C6KA 1CV0A 1L11A 220LA 1CU2A 3C83A 1G07A 1DYBA 226LA 7LZMA 2RBPA 1L60A 1L16A 158LA 1C67A 4I7LA 1QT7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IWRA 260LA 3WMKA 5I4WA 2BQHA 4HPEA 1LSEA 3LHMA 4H1PA 3AW6A 1LHKA 1XGRC 4KXIA 1P37A 4GN3A 1MLCE 4Z41A 4NHIA 3C8SA 4KPMA 1WTMA 3EXDA 1LKSA 2BLXA 1IWXA 1BGIA 1D2WA 1GB5A 2BQDA 1HF4A 1OP9B 2ZNXY 1CV1A 2BQNA 4NGIA 3DN0A 2AUBA 1L27A 1LOZA 1J1XY 4H8XA 190LA 3WYHA 3KAMA 1LMAA 4DDAA 1BQLY 1QS9A 3M3UA 2D4KA 2HU1A 3C7ZA 1CJ7A 4W52A 1L68A 1UIAA 4CHXA 1G0MA 1QUGA 1LSMA 1F0WA 1CTWA 1ZVHL 4CJ2A 1FLQA 3DN6A 2RBOA 5KXOA 4I7MA 1L06A 5FEKA 3SB5A 1GF3A 1L46A 4RDSA 3TXJA 1FN5A 5KXSA 1GE1A 1LYOA 4XN6A 173LA 3RT5X 1GFUA 1IWVA 1OUCA 4GCDA 4WM1A 3HH6A 3WUMA 1L62A 2N5ZA 1OUJA 1ZVYB 3NY8A 257LA 234LA 4ET9A 1B5UA 2F2QA 4NHSA 1KXXA 2BQOA 5LXWA 4NHPA 1L94A 2RB0X 1L58A 1NBZC 2B6TA 5IDDA 4ETDA 2XJWA 1KIRC 1C62A 1D3MA 3TXEA 5EBHA 3SB7A 1XEJA 5LIOA 1HSXA 2NTGA 4GCEA 238LA 4LFPA 1HFYA 187LA 4H9IA 3CDRA 2BQEA 3AYQA 1L66A 4W59A 2HEBA 4OWCA 1B5WA 4HSFA 2OTZX 5LYMA 4TWSA 1LZ6A 2MEBA 4GN5C 1LSZA 1LJEA 1QT3A 1KS3A 1CV3A 1L42A 1IIZA 1FLYA 1AKIA 1GF4A 5KXTA 148LE 4DQ7A 3CSZA 1L04A 2Z2FA 3F8VA 1VDPA 3NY9A 1L39A 1QIOA 3BKHA 4ARPA 2YBNA 5HMVA 2OE7X 1HSWA 1L61A 3GUMA 3SB9A 1GFRA 1HEWA 4N8ZA 3A8ZA 3DKEX 1GFJA 1LYDA 4BS7A 4OWEA 1L91A 3DN4A 2LC9A 3A3QA 1GB7A 1IOQA 1AM7A 5KXWA 2BQKA 1K28A 127LA 1HFZA 4QEQA 3A91A 1LYIA 4ARQB 4NSHA 5HLLA 216LA 1F6SA 3RZ4A 4DDCA 1LSNA 1B5ZA 1QTCA 4W53A 215LA 1XGUC 4PHIA 1F10A 1CJ8A 2HEEA 4W57A 1WQQA 1LJNA 1WTHA 1JTOL 1G0GA 1XEKA 1GAZA 3C7WA 3OK0A 1LZDA 1KW5A 4OO9A 1L08A 1C6HA 5T3FA 1LSGA 2BQLA 1L56A 3HH3A 1VDSA 3CSRA 3EMSA 2BPUA 3GUOA 1L41A 2XTHA 1AT5A 3SB6A 1T6HA 1LSBA 2D6BA 3CDQA 2DQDY 6LYTA 1B2KA 1T3PA 2H5ZA 2YBJA 4NHTA 1CKCA 1JWRA 1XSFA 1YANA 2Y8PA 4WLDA 2LZ2A 1GBYA 1L50A 134LA 2I25L 1RI8B 1L73A 4LYBA 3F6ZA 1LZ9A 4PJ2C 4WO9A 1LWGA 4WG1A 3HUAA 4GBRB 4EKQA 6LYZA 209LA 3FI7A 1OVKA 5K7OA 2F32A 1L20A 1JUGA 4ZEEA 5B07A 3M18B 5LAGA 3DMZA 1LJFA 177LA 120LA 1IWWA 2RB1X 1L21A 1IVMA 1LKRA 1C69A 1J1OY 1IR7A 2B6XA 4I7KA 4LYTA 1MELL 1SSWA 4OOOA 4PJZA 4EKRA 5I14A 4GCBA 4IATA 1JISA 4XJIA 1SWZA 1C60A 1GF0A 3C81A 4ETBA 3SN6R 3AGGG 1IWUA 137LA 1T6VL 3AZ6A 1LHMA 4YOPA 4H8YA 4HJVA 1L92A 1C6DA 1UBZA 1D3NA 4CFPA 4NG8A 5I4XA 1L31A 1QQYA 2CUUA 3D3DA 4D9ZA 4H94A 1LJIA 1C6GA 1GBSA 1LYYA 2YBMA 1CV5A 1QTVA 2D4JA 4H92A 1QSBA 4KL7A 166LA 3QNGA 3CT0A 201LA 4AGAA 3SB8A 2LCBA 129LA 1AZFA 1P6YA 2MEEA 1JTMA 1IC7Y 5I5QA 1P3NA 1UIHA 1IO5A 2O4WA 4QDNA 1GF9A 1C6JA 1LHLA 1GPQC 1YQVY 1JEFA 4N1EI 2FYCA 4R6CA 3QE8A 2XQOA 3OE9A 4H9HA 9LYZA 4IASA 1CKFA 1L38A 5LVHA 1C46A 1REZA 1IP2A 1BVXA 1LMPA 3GXRA 2HEDA 4ETCA 1LZBA 1HEOA 1C6LA 1LSDA 171LA 5B06A 1ZWNA 4ZIXA 3ZVQA 4I8SA 4YEOA 3TXFA 1GE3A 4DWXA 1GE2A 1OQMA 4LYOA 1G7JC 3TMWA 5HMJA 1YAPA 111LA 1IP5A 3WUNA 1L35A 5FHWA 3W6EA 1YAOA 1L87A 2HUKA 1C6CA 1BHZA 1L23A 4I7RA 1CV0A 1L11A 220LA 4HPIA 1G07A 5AMYA 1GFTA 3A90A 3A6BY 226LA 5DN4A 3W6AA 4BAPA 4H91A 1UIGA 2IHLA 1LZGA 5FELA 3V2WA 5D5FA 4GLAA 1EQEA 4WOAA 1LMCA 2HEFA 4DD0A 1CX6A 1BB7A 1OWZA 5M1YA 1G06A 1LZYA 4EJ4A 178LA 4OW1A 4DDBA 1L40A 1L52A 1LAAA 213LA 4H9CA 147LA 2DQEY 5FSTA 3W6FA 2B6ZA 1JJ3A 1REXA 1KIQC 1XEIA 1L17A 1I1ZA 1KY0A 2BQAA 1LSFA 2MECA 5KXYA 107LA 1T8GA 1LZ4A 212LA 1L67A 1DYGA 3HDEA 1LPYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IWR A;  260L A;  3WMK A;  5I4W A;  2BQH A;  4HPE A;  1LSE A;  3LHM A;  4H1P A;  3AW6 A;  1LHK A;  1XGR C;  4KXI A;  1P37 A;  4GN3 A;  1MLC E;  4Z41 A;  4NHI A;  3C8S A;  4KPM A;  1WTM A;  3EXD A;  1LKS A;  2BLX A;  1IWX A;  1BGI A;  1D2W A;  1GB5 A;  2BQD A;  1HF4 A;  1OP9 B;  2ZNX Y;  1CV1 A;  2BQN A;  4NGI A;  3DN0 A;  2AUB A;  1L27 A;  1LOZ A;  1J1X Y;  4H8X A;  190L A;  3WYH A;  3KAM A;  1LMA A;  4DDA A;  1BQL Y;  1QS9 A;  3M3U A;  2D4K A;  2HU1 A;  3C7Z A;  1CJ7 A;  4W52 A;  1L68 A;  1UIA A;  4CHX A;  1G0M A;  1QUG A;  1LSM A;  1F0W A;  1CTW A;  1ZVH L;  4CJ2 A;  1FLQ A;  3DN6 A;  2RBO A;  5KXO A;  4I7M A;  1L06 A;  5FEK A;  3SB5 A;  1GF3 A;  1L46 A;  4RDS A;  3TXJ A;  1FN5 A;  5KXS A;  1GE1 A;  1LYO A;  4XN6 A;  173L A;  3RT5 X;  1GFU A;  1IWV A;  1OUC A;  4GCD A;  4WM1 A;  3HH6 A;  3WUM A;  1L62 A;  2N5Z A;  1OUJ A;  1ZVY B;  3NY8 A;  257L A;  234L A;  4ET9 A;  1B5U A;  2F2Q A;  4NHS A;  1KXX A;  2BQO A;  5LXW A;  4NHP A;  1L94 A;  2RB0 X;  1L58 A;  1NBZ C;  2B6T A;  5IDD A;  4ETD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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