1QT6A

E11h mutant of t4 lysozyme
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDHGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt6A00
143LA 3C82A 1G0KA 2B70A 4EPFA 4LZMA 1OV5A 248LA 3F8VA 1C6NA 1D9WA 3DN2A 4DKLA 1L82A 235LA 3C83A 1L10A 2RBQA 4LDOA 1L65A 4YXCA 1C66A 1L30A 1P7SA 3HH4A 1DYCA 1L92A 1D3NA 1C6HA 1CX7A 111LA 1G0GA 1L88A 243LA 3UONA 176LA 2O4WA 159LA 199LA 3SBAA 1G1WA 1L14A 3C8QA 1C6IA 1P56A 1PQMA 1QT3A 3C81A 3GUPA 1C6EA 1L37A 184LA 1QT7A 4I7QA 118LA 1L04A 3HDFA 254LA 130LA 246LA 1L32A 1KS3A 1C6LA 1LLHA 1QSBA 168LA 157LA 3FA0A 1LYJA 196LA 1ZYTA 2B6TA 1LI3A 2RBSA 1L23A 3PBLA 1L60A 2CUUA 212LA 190LA 122LA 128LA 1L57A 1L56A 1L77A 3GUKA 3PDSA 1QS9A 1L50A 1L28A 1G0MA 2B6WA 1C6DA 4W55A 186LA 1L76A 1L85A 3VW7A 1L02A 185LA 1L46A 1C6FA 238LA 2B75A 1L73A 4I7LA 1JQUA 258LA 3NY9A 4W56A 229LA 3OE6A 3DN4A 1OVKA 3HUAA 3GUJA 102LA 189LA 200LA 183LA 3ODUA 1L68A 3C80A 1PQKA 1ZURA 3DNAA 2RBOA 3DMZA 1T6HA 1L81A 4W52A 1KW7A 158LA 1L17A 3HDEA 175LA 1P6YA 1L55A 3RZEA 2RB1X 4ARQA 1CUQA 2RBNA 1L27A 1CU2A 2RAYX 3HU8A 226LA 2OE4X 1L11A 3CDRA 3NY8A 4EKSA 2B6ZA 167LA 1XJTA 4YXAC 2OU0X 152LA 1L75A 1L34A 191LA 251LA 4DAJA 256LA 1L67A 4ARMB 1CV1A 250LA 3SBBC 4S0WA 231LA 3F9LA 1QT6A 7LZMA 1SX2A 249LA 1L22A 126LA 1OWYA 4AQNA 1L12A 2OE7X 138LA 1LI2A 3RUNA 1NHBA 3GULA 3L64A 4W51A 1QTVA 4I7KA 1QUGA 241LA 3FI5A 4I7JA 142LA 1P2LA 1L38A 115LA 1DYBA 201LA 1L74A 1C6JA 1P3NA 261LA 131LA 1L91A 148LE 177LA 1L13A 3HH6A 1G06A 1KW5A 1C6BA 1G0QA 1PQDA 1P36A 125LA 3DN6A 3HT8A 2A4TA 4GRVA 188LA 219LA 1L29A 1L69A 1QT8A 2QARC 170LA 1L70A 103LA 4I7OA 1XJUA 3C8RA 166LA 3HUKA 4EJ4A 255LA 1T8AA 4W53A 1P5CA 3DMXA 1L45A 1L66A 3GUNA 2NTGA 1G1VA 3L2XA 217LA 1LYGA 1L53A 1L25A 233LA 4W54A 1SWZA 3HT7A 1QSQA 139LA 4ARQB 4I7PA 129LA 252LA 107LA 3DN3A 2O7AA 146LA 2ANXA 1L99A 173LA 240LA 3CDQA 1CVKA 4EKRA 1C6KA 1CUPA 1L20A 3GUIA 1D2YA 1PQIA 3LZMA 1L09A 4I7TA 3DN1A 247LA 1L64A 3OE0A 6LZMA 1C65A 211LA 4LDLA 1L95A 2ANVA 5LZMA 1QT5A 1P46A 1G0LA 1QT4A 198LA 4E97A 150LA 215LA 1L06A 4EKQA 2LCBA 1L97A 3V2WA 1CU5A 1CV3A 236LA 1L16A 144LA 1L15A 3SB8A 3SB9A 4EXMA 2RH1A 227LA 1L05A 1C6GA 1OYUA 4I7RA 1L71A 1LGUA 2QB0B 1C61A 1LYEA 4PJZA 4EPIA 1CU3A 230LA 1LWGA 1LYFA 1L96A 2B7XA 218LA 216LA 165LA 1OVJA 1KY0A 1QS5A 1L58A 2OTZX 228LA 4EKPA 253LA 1C6CA 2NTHA 3GUOA 223LA 174LA 1OWZA 1T97A 123LA 178LA 1L63A 1L42A 171LA 3HU9A 155LA 242LA 192LA 187LA 3HH3A 1L0KA 1CU0A 3NYAA 1CV4A 1L44A 2OU9A 1L31A 1L33A 1QTBA 3EMLA 1D3JA 3D4SA 2RB2X 209LA 1L51A 1LGWA 1L83A 3SB7A 4LDEA 1DYGA 1L89A 3FADA 161LA 1LYHA 1C6QA 239LA 172LA 2LZMA 169LA 3C8SA 3CDVA 182LA 1L21A 220LA 2RBPA 3QAKA 2OEAX 1DYAA 1C63A 4I7MA 147LA 4I7NA 1L86A 1L36A 4GBRB 3SB6A 2B6YA 1L54A 3DKEX 1L80A 1L62A 1KY1A 2HUMA 3GUMA 5I14A 140LA 1C68A 1C6PA 163LA 4ARJA 2OTYX 149LA 112LA 259LA 1LYIA 2B72A 221LA 3CDTA 2O79A 4YX7C 1L35A 1LI6A 3K2RA 4ARLA 1I6SA 1EPYA 1LW9A 1C64A 4W59A 4W58A 3SN6R 262LA 1ZWNA 1CU6A 127LA 137LA 1CX6A 1LYDA 1L94A 2Z6BA 3C7WA 3HTDA 2F32A 1SSYA 1P2RA 3G3WA 1JTMA 4ARPA 3DMVA 3C7YA 1P64A 1C69A 1CV6A 1QUDA 1D2WA 214LA 195LA 1T8GA 3HT6A 1L40A 4ARMA 4DJHA 1PQJA 145LA 4W57A 234LA 1L08A 1WTHA 1L01A 2Q9EA 3G3VA 104LA 151LA 2F2QA 2HULA 1L00A 3CDOA 1G07A 2IGCA 4OO9A 1G0PA 1L03A 4ZPUA 141LA 1L72A 120LA 3G3XA 1K28A 1LWKA 1DYDA 257LA 260LA 1L59A 1LGXA 1C62A 1L39A 3HH5A 1D3MA 1QTHA 162LA 1L43A 110LA 1L24A 2B74A 245LA 1L79A 2LC9A 1C67A 1OV7A 4PK0A 1L48A 2OE9X 1D3FA 205LA 119LA 1T8FA 2OU8A 1OVHA 1SWYA 3OE8A 1JTNA 1C60A 1CV0A 164LA 3HWLA 1L18A 237LA 1B6IA 2Q9DA 1C6AA 1PQOA 3HTFA 1CTWA 108LA 1L61A 3DN0A 1L84A 1L52A 244LA 1L07A 213LA 2HUKA 3HT9A 3SB5A 1QTDA 1C6TA 1L49A 1XEPA 1TLAA 3HTBA 1SX7A 4I7SA 1L98A 1G0JA 1L90A 3HTGA 1SSWA 1C6MA 1DYEA 225LA 1KNIA 3C7ZA 3HUQA 160LA 3OE9A 2B6XA 1L26A 222LA 206LA 114LA 2RB0X 1CV5A 4IAPA 180LA 1L0JA 197LA 156LA 2F47A 3JR6A 4K5YA 3V2YA 2RAZX 1L41A 113LA 1QUOA 1P37A 1L47A 1LPYA 1L19A 224LA 1QTZA 2L78A 1DYFA 2RBRA 1L87A 232LA 1QTCA 1QUHA 1L93A 2B73A 3DN8A 181LA 210LA 109LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IOSA 1HFYA 1P2CC 1NBZC 2DQFC 1G0KA 4EPFA 3TMWA 4UWVA 1L82A 4NSHA 2LYZA 2RBQA 4LDOA 1CJ6A 1LHLA 3ZEKA 4J7VA 1JTTL 1D3NA 1C6HA 111LA 159LA 1L14A 3C8QA 1MLCE 3CB7A 1PQMA 3C81A 1L37A 4DQJA 1REYA 184LA 1GF7A 1QT7A 4I7QA 1GFTA 1L04A 3HDFA 1MELL 4WLXA 1L32A 1KS3A 1C08C 1XSFA 1EL1A 3A96A 168LA 1D6PA 3FA0A 2EQLA 1ZYTA 2B6TA 1L60A 2D4JA 4ZFPA 5APDA 2D6BA 4WLDA 2BAAA 2DQDY 1QS9A 1NF5A 4WMGA 186LA 1L76A 1L85A 5I53A 3VW7A 1L02A 1HF4A 2HEAA 185LA 1C6FA 1JSFA 4I7LA 4YF2A 1XGRC 3DN4A 1GF0A 4KT3A 4GCCA 2LYOA 4RDSA 102LA 200LA 2BQNA 3T6UA 1L68A 1OUIA 2G4PA 2HEFA 4XJFA 2RBOA 3TMVA 9LYZA 3VWOA 1IP5A 5DN4A 3ZVQB 1A4VA 2FYDA 1P6YA 3J6KA 3AYQA 4UWUA 1L27A 1BWIA 5I4XA 2RAYX 3HU8A 1NMMA 3QY4A 8LYZA 2MEDA 4GN5C 4YXAC 152LA 2I6ZA 1V7TA 1L75A 1LZNA 256LA 1L67A 1LZYA 250LA 3SBBC 5T3FA 3GXKA 1ZVYB 4WM4A 1YROA 1OWYA 3HFMY 207LA 1FN5A 4GN3A 3HBHA 4EOFA 1P2LA 4TSBA 1OUBA 4GN4A 4LFXA 1B7QA 3B0OA 2I26L 177LA 2MEHA 1L13A 1AT5A 1FBIX 3HH6A 5LAGA 1PQDA 2H9KA 3DN6A 2A4TA 4GRVA 188LA 3WULA 1GE1A 4I0CA 132LA 1BQLY 3GUNA 3W3EA 4LYOA 5B05A 2N5ZA 233LA 1YQVY 3TXKA 4WM5A 1SWZA 3HT7A 4ARQB 129LA 1KIPC 173LA 3CDQA 4G4CA 1VAUA 1L20A 3AGHA 3LZMA 4X3BA 4I7TA 3OE0A 1W6ZA 4LDLA 4NG8A 4NWHA 1GB6A 2ZWBA 5LZMA 1QT5A 1P46A 1DQJC 198LA 4E97A 150LA 4H9IA 1BGIA 1T6VL 2BQIA 2MEGA 4RLNA 236LA 2LHMA 144LA 2BQBA 4ZIXA 2DKVA 3BKVA 208LA 4EXMA 1QUTA 1OYUA 1LCNA 1L71A 1LGUA 2QB0B 4EPIA 4BS7A 1LYFA 218LA 4DC4A 1KY0A 1L58A 2OTZX 3A67Y 5HMJA 228LA 3TXHA 1E8LA 4H9AA 3GUOA 223LA 178LA 1IOTA 2D4KA 3NYAA 5ILFA 5I5QA 5KXWA 5E9RA 4NGZA 3SB7A 4LDEA 2HU3A 172LA 1UIFA 3CDVA 1DXJA 2W1XA 5IHGA 1L21A 220LA 2OEAX 1DYAA 1QTEA 4I7MA 1PS5A 4YEOA 3DKEX 4J1AA 2GV0A 1DI5A 2DQEY 1C68A 2FBBA 4DD3A 5A3ZA 4ARJA 5F14A 1LYYA 1LJ4A 2CGIA 4FDYA 1IWUA 2O79A 4IASA 3N9CA 2MEAA 4XENA 4HV1A 4NSJA 1LI6A 3K2RA 1LW9A 1C64A 4W59A 4W58A 262LA 5LVKA 1ZWNA 1CX6A 1F6RA 3G3WA 1OUCA 1QUDA 195LA 1T8GA 4LGKA 4DJHA 4MSTA 1VDSA 1FKVA 1GAZA 5F16A 1WTMA 3CDOA 5LYZA 1G07A 1G0PA 3P66A 3TXJA 1L72A 3LN2A 1YILA 3M3UA 1CJ9A 4NSGA 3AGGG 3ATNA 5HNCA 1VDQA 1C62A 1GF6A 162LA 2B74A 1WQNA 1LJGA 1GFUA 1IR9A 4H91A 2Y8PA 1T8FA 153LA 4AXTA 1C60A 1CV0A 164LA 3A91A 237LA 1XGPC 3HTFA 108LA 3DN0A 1L84A 1LZ6A 1L52A 1L07A 4W94A 213LA 3HT9A 1WTNA 3ULRA 3SB5A 1QTDA 1EQ4A 4NSIA 1BVKC 4I7SA 1G0JA 1L90A 3HTGA 1IWXA 1SSWA 5LVHA 1DYEA 225LA 3C7ZA 1CKGA 1L26A 3CSRA 4DQ5A 5FHWA 2F47A 3CSQA 3V2YA 1LZSA 113LA 5C6LA 1QTZA 1DYFA 1O23A 5B1FA 232LA 1QTCA 2IHLA 1HERA 210LA 3C82A 248LA 1C6NA 1D9UA 2W1MA 4HTNA 3ZVQA 4YXCA 3RW8A 2W1LA 4TUNA 4XJDA 1L30A 1JIYA 1YAQA 2XQOA 4R6CA 1DYCA 1QSAA 4BAFA 3IWRA 2YBHA 243LA 1AT6A 1L88A 1G0GA 5LIOA 176LA 2O4WA 1JJ3A 4NFVA 4PPOA 2BQHA 1I1ZA 1GDWA 1QT3A 1LSNA 1C6EA 2YSSC 1UICA 4ET9A 3WH1A 1LZEA 254LA 130LA 246LA 1B0DA 1UIGA 1IWTA 212LA 1LHJA 5KXZA 122LA 1L57A 3PDSA 4NGVA 2MEFA 6LYTA 2W1YA 1C6DA 3TXIA 1QQYA 5B06A 1TEWA 1CKCA 3WPJA 5LA8A 1JQUA 4W56A 3OE6A 1LJFA 3AW7A 4DDBA 2H5ZA 3DNAA 1ZURA 1KXXA 1T6HA 4W52A 3HDEA 175LA 5LVIA 2CDSA 1GBSA 3RZEA 3A3QA 4ARQA 1CUQA 2MEBA 5FEKA 2RBNA 2EIZC 1FLYA 4LYMA 3CDRA 4EKSA 1L11A 3TXEA 2FBDA 167LA 1XJTA 2OU0X 5F9XA 5KXMA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IOS A;  1HFY A;  1P2C C;  1NBZ C;  2DQF C;  1G0K A;  4EPF A;  3TMW A;  4UWV A;  1L82 A;  4NSH A;  2LYZ A;  2RBQ A;  4LDO A;  1CJ6 A;  1LHL A;  3ZEK A;  4J7V A;  1JTT L;  1D3N A;  1C6H A;  111L A;  159L A;  1L14 A;  3C8Q A;  1MLC E;  3CB7 A;  1PQM A;  3C81 A;  1L37 A;  4DQJ A;  1REY A;  184L A;  1GF7 A;  1QT7 A;  4I7Q A;  1GFT A;  1L04 A;  3HDF A;  1MEL L;  4WLX A;  1L32 A;  1KS3 A;  1C08 C;  1XSF A;  1EL1 A;  3A96 A;  168L A;  1D6P A;  3FA0 A;  2EQL A;  1ZYT A;  2B6T A;  1L60 A;  2D4J A;  4ZFP A;  5APD A;  2D6B A;  4WLD A;  2BAA A;  2DQD Y;  1QS9 A;  1NF5 A;  4WMG A;  186L A;  1L76 A;  1L85 A;  5I53 A;  3VW7 A;  1L02 A;  1HF4 A;  2HEA A;  185L A;  1C6F A;  1JSF A;  4I7L A;  4YF2 A;  1XGR C;  3DN4 A;  1GF0 A;  4KT3 A;  4GCC A;  2LYO A;  4RDS A;  102L A;  200L A;  2BQN A;  3T6U A;  1L68 A;  1OUI A;  2G4P A;  2HEF A;  4XJF A;  2RBO A;  3TMV A;  9LYZ A;  3VWO A;  1IP5 A;  5DN4 A;  3ZVQ B;  1A4V A;  2FYD A;  1P6Y A;  3J6K A;  3AYQ A;  4UWU A;  1L27 A;  1BWI A;  5I4X A;  2RAY X;  3HU8 A;  1NMM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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