1QT6A

E11h mutant of t4 lysozyme
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDHGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
AH1 (3-11)AH5 (93-106)3H1 (159-161)EMPTYS1 (14-19)TI'1 (54-57)TI1 (20-23)AH9 (137-141)S2 (25-28)AH3 (60-80)S3 (31-34)AH2 (39-50)AH4 (83-90)AH6 (108-113)AH7 (115-123)AH8 (126-134)AH10 (143-155)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
total genus 60
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt6A00
1L35A 198LA 3CDVA 4LDOA 142LA 167LA 1C6TA 2A4TA 254LA 4W51A 1LGWA 1G0MA 1LW9A 1L28A 160LA 1CU5A 1L41A 4OO9A 1L59A 259LA 1LGUA 1G0LA 2B6TA 3HDEA 1C6PA 242LA 3EMLA 4E97A 1L73A 1T8AA 1CU0A 228LA 4I7PA 147LA 2B73A 1L79A 1JQUA 1OWYA 3HUAA 1L70A 187LA 173LA 1L69A 1PQDA 1LI6A 1L56A 1LI3A 1B6IA 1CU2A 189LA 1OVJA 1QT8A 1L01A 2B7XA 2F32A 4IAPA 1QTHA 4EXMA 2LC9A 1L42A 119LA 3OE0A 1L87A 236LA 212LA 1D2YA 1L15A 3DN0A 3DN2A 163LA 243LA 1QUGA 4ARMB 137LA 1C6BA 1CX6A 152LA 1C63A 3HT6A 4I7RA 4W58A 3DN6A 4W56A 148LE 1D3MA 1L96A 1C6JA 1DYDA 114LA 1L00A 131LA 1P2LA 3F8VA 1L39A 1D3NA 3G3VA 3HTBA 2LCBA 219LA 1L54A 1L74A 1EPYA 1CV1A 2RH1A 168LA 1C68A 4I7NA 1L29A 1ZWNA 223LA 3OE8A 250LA 3SN6R 2B6XA 1G0GA 1L86A 1P37A 222LA 1QTZA 218LA 3HU9A 4W54A 1L09A 1D9WA 2RB1X 4DAJA 199LA 1KW7A 3HU8A 1KNIA 1QUOA 1L76A 1L77A 225LA 2IGCA 1D2WA 2OTZX 1L11A 260LA 1JTMA 195LA 1ZYTA 1L30A 2B75A 172LA 1DYCA 103LA 209LA 4ARQB 1L93A 1L02A 1G0JA 1L92A 1G06A 1C6LA 1I6SA 1L08A 2B74A 3HH6A 104LA 1L63A 249LA 1L32A 201LA 102LA 165LA 2O7AA 1LPYA 1L97A 3CDTA 138LA 2HULA 232LA 241LA 2CUUA 2QARC 1P64A 1KW5A 4EKPA 143LA 1P3NA 171LA 4EKSA 251LA 1L31A 3D4SA 1XJUA 1C61A 1SWYA 1L81A 3FI5A 2OU0X 1L44A 150LA 1SX2A 118LA 176LA 156LA 140LA 1QT7A 227LA 1L46A 146LA 3GULA 182LA 1P5CA 1OYUA 1QTDA 4EPFA 1L38A 2F2QA 1L34A 2B6WA 113LA 4I7QA 3VW7A 1L83A 1SWZA 2OTYX 1QT6A 1PQMA 1L94A 257LA 2B6YA 2B70A 1L50A 1L37A 1ZURA 1C64A 1CV0A 1L67A 1OWZA 1CUPA 1L90A 1QT3A 1L91A 166LA 244LA 4ARLA 3FADA 262LA 2OE7X 3C83A 1L10A 3DKEX 4W55A 1L89A 2RBRA 111LA 1C6DA 1C6FA 4YXAC 4PK0A 112LA 188LA 1G0KA 1L07A 115LA 1OV7A 1C6AA 4ARMA 3OE6A 1L82A 1QS9A 3V2WA 4EPIA 4S0WA 1L17A 3DMXA 183LA 1C65A 3GUJA 196LA 1L21A 1L48A 4W57A 1L95A 3GUNA 2F47A 1SSYA 3GUMA 4YXCA 4K5YA 4I7OA 126LA 184LA 200LA 1L0JA 239LA 3HH3A 5LZMA 190LA 3G3WA 1LLHA 3GUPA 180LA 2ANXA 237LA 3SB5A 4EJ4A 1G1VA 2RBSA 1PQKA 2Q9DA 3SBBC 1C66A 1L65A 3C7WA 247LA 3OE9A 240LA 1LYFA 1LWGA 4DJHA 252LA 2RB2X 1LYGA 1G07A 1L85A 1LI2A 158LA 1CV4A 226LA 1L0KA 1QTCA 3FA0A 1L18A 1CU3A 2RBPA 3NYAA 159LA 1QT4A 1QTVA 2O4WA 5I14A 1OVHA 1XJTA 197LA 261LA 4EKRA 1L26A 2LZMA 1L49A 3HDFA 1L80A 1QUDA 233LA 3DNAA 3C7ZA 3DMZA 3CDOA 1L71A 4I7TA 110LA 1CVKA 4PJZA 192LA 120LA 1L51A 1D3JA 1DYEA 211LA 1DYBA 2QB0B 155LA 1G0PA 3GUOA 220LA 2RB0X 217LA 1LGXA 1C60A 231LA 3UONA 1KY0A 1CTWA 4DKLA 3C7YA 256LA 7LZMA 1L64A 1C6NA 1NHBA 1TLAA 186LA 4I7JA 3HT8A 224LA 1C6MA 2OE4X 1L03A 1L66A 2RBNA 1C6IA 1L47A 2OE9X 157LA 3K2RA 128LA 144LA 130LA 1PQIA 1L22A 2HUMA 1L20A 3HTDA 4LDLA 248LA 2RBQA 3HT9A 174LA 1C6EA 3DMVA 1CV6A 3C8RA 1L61A 3HT7A 1P7SA 1T97A 1LYDA 1L04A 1L88A 2Q9EA 3V2YA 4AQNA 4EKQA 3SB9A 229LA 3SB7A 1L27A 3LZMA 4GRVA 164LA 1T8FA 1DYGA 1LYJA 2B6ZA 3DN8A 3SBAA 127LA 234LA 4YX7C 3HH5A 177LA 230LA 3HTGA 2RAZX 1L24A 246LA 2ANVA 1L33A 1T6HA 141LA 258LA 1SSWA 1L72A 210LA 1L13A 1L40A 185LA 1C6GA 1L52A 1T8GA 1L75A 2OU9A 3F9LA 178LA 3CDRA 3RZEA 161LA 1C6HA 4ARPA 1L05A 122LA 2L78A 4W59A 1QTBA 1CV3A 107LA 1LWKA 4ARJA 1KS3A 1L36A 3CDQA 1QT5A 4W53A 1C67A 4LZMA 4W52A 253LA 1L99A 1JTNA 3HUKA 1LYHA 1L53A 1QSBA 1C69A 1C6CA 3C82A 221LA 3HTFA 1C62A 206LA 1WTHA 2Z6BA 2B72A 4GBRB 1L14A 1L43A 1LYIA 1XEPA 129LA 4ZPUA 3C81A 3RUNA 3HWLA 4LDEA 1L57A 1OV5A 3GUIA 3SB8A 214LA 3PBLA 2RAYX 1G0QA 108LA 1G1WA 1KY1A 2OU8A 213LA 235LA 1QS5A 125LA 4ARQA 1DYAA 216LA 4I7LA 1P46A 1QSQA 1L84A 191LA 1P36A 3ODUA 3DN4A 4I7KA 245LA 149LA 1L45A 1L62A 3PDSA 1L98A 205LA 169LA 1D3FA 1CV5A 3G3XA 1LYEA 2RBOA 1L12A 3C8SA 1OVKA 3C80A 1SX7A 3HUQA 3SB6A 145LA 2HUKA 1C6QA 170LA 1P56A 151LA 3GUKA 181LA 3L2XA 1CUQA 1K28A 4I7SA 1L68A 1L16A 175LA 6LZMA 4I7MA 1L58A 3DN1A 1PQJA 1CU6A 2O79A 1L60A 109LA 2NTHA 255LA 3NY9A 139LA 3DN3A 1L55A 1PQOA 123LA 162LA 1P6YA 3C8QA 2OEAX 1C6KA 1L19A 215LA 3NY8A 3HH4A 3QAKA 1QUHA 2NTGA 1L23A 1L06A 1L25A 1P2RA 3JR6A 238LA 1DYFA 1CX7A 3L64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DI5A 1RFPA 2W1MA 3CDVA 4IATA 1B7MA 1G7MC 1LW9A 4WM6A 1JIYA 5I4XA 1C10A 1OUBA 4CHXA 4OO9A 1LZDA 1LGUA 1G0LA 1LMPA 1CJ6A 1LHIA 4HTQA 1L79A 4P2EA 1LZTA 1L69A 1ZV5L 5FSTA 1HNLA 189LA 2XBSA 1OVJA 5E9RA 3AGHA 4IAPA 4N9RA 2LC9A 5IELA 3HBDA 5HQ1A 1L15A 1LJ3A 3A92A 4GCEA 137LA 3HT6A 4W58A 1L96A 1B5ZA 1C6JA 1JEFA 1DYDA 4NGYA 2CGIA 1QQYA 3F8VA 2ZNXY 2FYDA 1LSAA 5L3HA 4HJYA 1L54A 1L74A 4NSHA 4E3UA 1CV1A 2RH1A 1GXXA 4GLAA 2B6XA 3A6CY 4H9EA 5AMYA 218LA 3AYQA 199LA 1KW7A 2A7DA 1OUGA 1GF8A 1LTMA 2IGCA 1GE2A 3WU8A 2OTZX 2X0AA 1L11A 1GHLA 1ZYTA 1W08A 5APCA 172LA 1QSWA 1L02A 1G0JA 1L92A 1LZSA 1C6LA 4NHSA 3W6BA 1QTKA 4CFOA 1LSEA 1YANA 249LA 1LJIA 4MSTA 165LA 1LPYA 1L97A 2HULA 3WULA 3CSQA 171LA 5LYMA 2DKVA 3D4SA 1YKZX 1NF5A 1C61A 1SWYA 3AZ6A 1L81A 4I0CA 4BADA 5JENB 4X3BA 150LA 1LYZA 176LA 1WQPA 3K3TA 1OYUA 1DPXA 1L38A 1PQMA 2B70A 4NSIA 1L37A 1ZURA 4OWBA 1C64A 1IC4Y 1CV0A 5B05A 1IOCA 3WPLA 1CUPA 1L90A 1GAZA 3T36A 4C5FA 4XJDA 1IWWA 2OE7X 5LYTA 1L10A 1H87A 1C6DA 1JISA 1G0KA 5M1YA 1OV7A 3HFMY 1LZ5A 1HC0A 1GE4A 1GFEA 3WYHA 1L21A 1L95A 1FN5A 3EO5A 4YXCA 4M6DA 1L0JA 2BQAA 5IHGA 3GUPA 1IWUA 4B0DA 4EJ4A 5B1GA 4GN3A 1B7LA 1L65A 2BQEA 4LZTA 3VWOA 1IWTA 3RW8A 2HEEA 2LHMA 1GFTA 1LWGA 4HJVA 4DJHA 5I54A 1LYGA 2HEBA 1LMNA 226LA 1L0KA 4CJ2A 1QTCA 4ZIXA 4ETCA 1CJ7A 3TMXA 1GFAA 2LZMA 1C08C 3LYOA 5LVKA 154LA 3HDFA 1LJ4A 1LZBA 1YKYX 3IWRA 1C7PA 4H91A 192LA 4IASA 4DDCA 3WXTA 3ZVQA 155LA 4H9HA 1NDMC 2RB0X 1KY0A 5KXRA 5HNLA 1B5UA 4Z98A 4NHTA 1JKDA 2F4GA 1IO5A 1AT5A 4XJIA 1L66A 1C6IA 4RW1A 157LA 128LA 3TMVA 130LA 1PQIA 1L20A 1LSPA 1OQMA 248LA 4LDLA 1NHEA 1GAYA 1TAYA 2VB1A 3DMVA 3HT7A 2BQOA 4ZFPA 1L88A 4WL6A 3V2YA 4AQNA 4XJBA 4GRVA 5ILFA 1OUCA 3SBAA 234LA 1LSDA 4Z46A 4LT0A 1B7OA 246LA 4RW2A 1CJ8A 1T6HA 1LMQA 258LA 2ZYPA 4LYMA 1HEOA 210LA 3HBEX 1L13A 1L40A 3AZ7A 1L75A 2OU9A 1GFUA 161LA 1QDRA 1DI3A 107LA 3LN2A 3TXKA 4ET9A 3CDQA 1C67A 4LZMA 5LVGA 4W52A 253LA 4ZEEA 1LYHA 2BQDA 1L53A 3A3QA 1CKFA 1REYA 5KXLA 1HFXA 2Z39A 1IR9A 3AGIA 4N1EI 3C81A 4DDBA 1C45A 1NKHA 213LA 1QS5A 125LA 4ARQA 5LINA 5I53A 1P46A 1IOTA 4NHQA 4WM1A 1BWHA 4B4IA 191LA 3ODUA 3DN4A 1LSBA 4I7KA 3LZ2A 1UCOA 3PDSA 1IX0A 1G7LC 1WQQA 3G3XA 3TXGA 3C8SA 3C80A 1LJGA 1SX7A 3HUQA 2HU3A 4AXTA 3SB6A 2BQBA 145LA 2HUKA 151LA 1CUQA 3FI7A 6LZMA 1BB4A 1WQMA 2H9JA 4I7MA 2I26L 109LA 2NTHA 255LA 5APEA 4OW1A 3CSZA 4B4EA 5LVJA 3B0KA 1IOSA 3C8QA 1C6KA 2CJLA 1GE3A 2NTGA 1L06A 1GE0A 3JR6A 238LA 5HMVA 1WVVA 4LDOA 2MECA 1OUDA 1GF7A 160LA 1XGQC 1L41A 2G4QA 4DD9A 1GB6A 4CGEA 259LA 4N0JA 3HDEA 3EMLA 4E97A 1LZGA 1L73A 2B73A 2GV0A 2D4IA 1NDGC 1L70A 187LA 1LHLA 1PQDA 2FBBA 2Z2EA 4G9SA 4XYYA 1B6IA 3J6KA 4MR1A 3GXKA 2F32A 5F9UA 2F2NA 4LFXA 119LA 5L3IA 4UWUA 2Z18A 1D2YA 4L41A 3DN2A 163LA 1QUGA 4ARMB 1REXA 1XEJA 1WVUA 4NGZA 114LA 1NBYC 131LA 4H9CA 2MEFA 1AKIA 1D3NA 1RJCB 2LCBA 4OWCA 4NGWA 3WW5A 1F6RA 4HPEA 1A4VA 223LA 1VDPA 4H1PA 1QTZA 2LZTA 1IY4A 2RB1X 4DAJA 1B7SA 1QUOA 1L77A 1D2WA 1UIAA 260LA 1VATA 2B75A 1KXXA 1MLCE 209LA 1LZ8A 2D4KA 1B2KA 3QE8A 4HP0A 1L08A 1RE2A 4UWVA 3HH6A 1G7JC 1XGPC 104LA 1L63A 4NIJA 4WLDA 102LA 1GB2A 2O7AA 1XGRC 1CKGA 1GF4A 241LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DI5 A;  1RFP A;  2W1M A;  3CDV A;  4IAT A;  1B7M A;  1G7M C;  1LW9 A;  4WM6 A;  1JIY A;  5I4X A;  1C10 A;  1OUB A;  4CHX A;  4OO9 A;  1LZD A;  1LGU A;  1G0L A;  1LMP A;  1CJ6 A;  1LHI A;  4HTQ A;  1L79 A;  4P2E A;  1LZT A;  1L69 A;  1ZV5 L;  5FST A;  1HNL A;  189L A;  2XBS A;  1OVJ A;  5E9R A;  3AGH A;  4IAP A;  4N9R A;  2LC9 A;  5IEL A;  3HBD A;  5HQ1 A;  1L15 A;  1LJ3 A;  3A92 A;  4GCE A;  137L A;  3HT6 A;  4W58 A;  1L96 A;  1B5Z A;  1C6J A;  1JEF A;  1DYD A;  4NGY A;  2CGI A;  1QQY A;  3F8V A;  2ZNX Y;  2FYD A;  1LSA A;  5L3H A;  4HJY A;  1L54 A;  1L74 A;  4NSH A;  4E3U A;  1CV1 A;  2RH1 A;  1GXX A;  4GLA A;  2B6X A;  3A6C Y;  4H9E A;  5AMY A;  218L A;  3AYQ A;  199L A;  1KW7 A;  2A7D A;  1OUG A;  1GF8 A;  1LTM A;  2IGC A;  1GE2 A;  3WU8 A;  2OTZ X;  2X0A A;  1L11 A;  1GHL A;  1ZYT A;  1W08 A;  5APC A;  172L A;  1QSW A;  1L02 A;  1G0J A;  1L92 A;  1LZS A;  1C6L A;  4NHS A;  3W6B A;  1QTK A;  4CFO A;  1LSE A;  1YAN A;  249L A;  1LJI A;  4MST A;  165L A;  1LPY A;  1L97 A;  2HUL A;  3WUL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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