1QUHA

L99g/e108v mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAGINMVFQMGVTGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of a non-contiguous second-site revertant in T4 lysozyme shows that increasing the rigidity of a protein can enhance its stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1quhA00
243LA 160LA 1L16A 4ARQB 3HT9A 1L45A 1P46A 130LA 1L77A 3SB7A 102LA 1P7SA 3C8SA 1G1WA 3HH4A 1L88A 170LA 3FI5A 149LA 1XJUA 1KW7A 128LA 126LA 4ARMB 206LA 131LA 189LA 4I7PA 1EPYA 1L09A 3HUQA 1L23A 1C6CA 3UONA 1LW9A 157LA 1L04A 1L03A 143LA 171LA 3SB6A 2Z6BA 2OU9A 3G3WA 3V2WA 1L10A 176LA 1L68A 123LA 4LZMA 3RZEA 1SSYA 1LYEA 226LA 2F47A 235LA 2RH1A 139LA 1OV5A 1LYFA 1C65A 3G3XA 1C6JA 1L07A 185LA 211LA 141LA 3SN6R 1DYCA 1L28A 167LA 114LA 2NTGA 1L65A 233LA 1C67A 1DYBA 1L87A 3DMZA 151LA 1P2LA 4IAPA 3HUKA 236LA 3GUIA 1B6IA 4PK0A 2B6XA 1CUQA 3DN3A 2OEAX 2RBOA 1L14A 247LA 227LA 1L35A 3FADA 118LA 1LI3A 1K28A 1LI2A 3NY9A 3CDQA 3C80A 254LA 1T8GA 3HWLA 178LA 244LA 4K5YA 1G0QA 215LA 1L13A 200LA 113LA 1JTNA 1CU6A 1G0LA 1L0JA 237LA 1L71A 159LA 1L43A 4GRVA 1L20A 4W57A 1C68A 3DN4A 4EPFA 1QT6A 1D2WA 3G3VA 4AQNA 1LPYA 1L42A 1TLAA 2OTZX 3SBBC 1QSBA 1D2YA 3LZMA 1L39A 1L11A 256LA 3DN6A 4I7OA 1LYGA 188LA 162LA 1CV4A 1L66A 4YX7C 1L00A 1OWZA 1DYGA 142LA 4W54A 3C81A 229LA 173LA 103LA 1C6FA 217LA 1LYJA 2B6ZA 4EJ4A 129LA 146LA 1C6GA 262LA 1L96A 3C7ZA 148LE 1DYFA 1L85A 1L21A 3VW7A 1QTDA 1L12A 104LA 242LA 1PQJA 1SSWA 4I7SA 2HULA 3HTGA 1P56A 1L67A 1L27A 1PQDA 1QSQA 2L78A 120LA 3HDFA 1L95A 3HTFA 1L06A 1L05A 1D3MA 1DYEA 1CV5A 1C6MA 1L31A 1CX6A 1LYHA 3DN2A 112LA 3SB8A 1C6NA 1L64A 1D3JA 1L49A 145LA 1L19A 1CU0A 4YXCA 156LA 5I14A 4ARPA 3DMVA 1L63A 1T6HA 1NHBA 1G1VA 216LA 1CU3A 205LA 169LA 1OYUA 4EKPA 1L62A 248LA 1QT5A 3DN8A 3HDEA 4PJZA 4GBRB 2B73A 255LA 1L81A 2B70A 1L46A 144LA 246LA 164LA 1PQIA 3GUMA 4I7MA 1L69A 1QT3A 4DJHA 1P36A 3PBLA 1SX7A 1L34A 2IGCA 1L50A 2B7XA 4EKRA 1L58A 1OV7A 1G0MA 1L90A 3GUKA 1L98A 1L83A 115LA 1L02A 257LA 1L51A 1L57A 140LA 1QT8A 1LYIA 1P37A 109LA 1P5CA 1CTWA 1C66A 1L32A 212LA 3QAKA 1L99A 2O79A 2OTYX 1L44A 234LA 3JR6A 1C64A 1QT7A 196LA 161LA 225LA 180LA 2ANXA 1L33A 3CDVA 198LA 219LA 3HH5A 3L64A 250LA 1L73A 137LA 3L2XA 1I6SA 1C63A 2RBPA 201LA 1OVKA 1G0JA 1P3NA 2HUKA 2RBNA 147LA 1CV0A 2RBQA 1LWGA 1QTCA 1QTVA 253LA 1L52A 2RBSA 108LA 4W59A 3OE0A 2OU8A 3CDTA 220LA 4I7QA 4ARLA 1L89A 1G0GA 1T8AA 1L97A 3GUOA 4I7RA 2B6YA 2CUUA 1C60A 1L74A 165LA 1C6QA 3NY8A 1C6LA 190LA 2A4TA 4ZPUA 2LC9A 4I7JA 1G06A 1L53A 3SB9A 3C8QA 107LA 1L92A 245LA 138LA 3SBAA 1KY0A 4ARQA 2RAZX 1C62A 2LCBA 1L76A 1LGXA 1ZYTA 260LA 175LA 4LDEA 231LA 3HTBA 1C61A 1L72A 2Q9DA 3ODUA 3SB5A 1CU2A 182LA 4ARMA 3C7YA 1L79A 186LA 1OVHA 4I7NA 1D9WA 2QARC 1QUOA 1CV3A 1L48A 1L94A 1L17A 1KW5A 2F2QA 221LA 192LA 258LA 1WTHA 1QT4A 2NTHA 3OE6A 1L18A 4EKSA 1T97A 1T8FA 1PQKA 125LA 223LA 1C6TA 249LA 2RBRA 181LA 1L40A 4W55A 1P6YA 3GUPA 3GUJA 1DYAA 1P64A 239LA 3RUNA 191LA 3HU8A 3HU9A 1L82A 3OE8A 1L91A 1CUPA 4W53A 2B6TA 1L47A 238LA 3HTDA 177LA 2B74A 1PQMA 4W58A 3GUNA 172LA 1D3FA 259LA 3DN0A 1C6BA 2ANVA 3K2RA 3D4SA 3HUAA 230LA 3DNAA 2RB1X 4S0WA 184LA 1C6HA 1C6EA 1L75A 3HH6A 127LA 1JQUA 3DN1A 1LWKA 3C8RA 4DAJA 1L60A 2OE7X 1L25A 3V2YA 1CX7A 214LA 1L29A 6LZMA 119LA 4LDLA 4LDOA 1L56A 1CV1A 4ARJA 1L61A 1C6DA 2O4WA 4YXAC 3NYAA 1OVJA 228LA 122LA 2OE9X 2RB2X 1XJTA 1KS3A 4W51A 3F8VA 3OE9A 1QTZA 4W52A 1LGUA 2B6WA 3DMXA 1L24A 1ZURA 1C6AA 110LA 240LA 152LA 3HH3A 168LA 1LGWA 1G07A 155LA 1L26A 1L80A 1CU5A 1LLHA 1SWYA 1QTHA 209LA 3CDRA 3C83A 1C6IA 1L86A 1L0KA 5LZMA 1L84A 222LA 1G0KA 111LA 4I7TA 1QUHA 1P2RA 1L01A 166LA 1L08A 195LA 3HT6A 2LZMA 1L54A 3CDOA 1QUDA 1PQOA 1OWYA 224LA 1L93A 3PDSA 3HT7A 3EMLA 1L59A 252LA 7LZMA 1ZWNA 183LA 1C6PA 1SWZA 1LYDA 3GULA 158LA 2OE4X 163LA 241LA 251LA 197LA 1C6KA 2QB0B 4W56A 1KY1A 261LA 1G0PA 1C69A 213LA 150LA 199LA 1QTBA 2B75A 1SX2A 4EXMA 3FA0A 4E97A 1CV6A 1L36A 2RB0X 1LI6A 1KNIA 210LA 1L38A 4DKLA 1DYDA 4I7LA 232LA 1L70A 1L15A 1L41A 2RAYX 1L37A 2F32A 3C82A 4EKQA 1QUGA 1CVKA 4I7KA 3DKEX 3F9LA 1XEPA 2O7AA 1D3NA 4EPIA 218LA 2OU0X 1L22A 174LA 187LA 2Q9EA 1QS9A 1QS5A 1JTMA 3HT8A 2HUMA 1L30A 2B72A 3C7WA 1L55A 4OO9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
243LA 2LYZA 1D0KA 1L45A 1P46A 1JEFA 3J4GA 4U3XB 2DQEY 1L88A 5KXRA 2HEAA 1ZVHL 1KW7A 4ARMB 4RDSA 5IDDA 1EPYA 3HUQA 134LA 1C6CA 3UONA 1L04A 2AUBA 2W1LA 5LINA 4DWXA 4LT2A 1LMNA 2MEHA 2RSCA 1I20A 2Z6BA 1YKZX 1IP2A 5I4YA 1L10A 123LA 3CT5A 3RZEA 5LVIA 1HENA 5FDJA 5KXLA 4N9RA 154LA 5KXZA 132LA 1LYFA 4IASA 3G3XA 1J1PY 1TCYA 1DYCA 3TXFA 1LJGA 2NTGA 3A3RX 1C67A 1LZAA 4IAPA 1T3PA 5LYTA 5KXYA 1QTEA 1YL1X 2XTHA 4PPOA 3WW6A 227LA 1L35A 1ZV5L 1LI2A 3NY9A 9LYZA 3AB6A 254LA 4QGZA 1LJ4A 178LA 244LA 3D9AC 215LA 3TMVA 200LA 4QEQA 1CU6A 1GE0A 237LA 1L71A 1L20A 4W57A 1C68A 2BQAA 4N8ZA 1BB4A 2BQJA 3LYTA 1WVVA 1NDMC 1FLWA 4H8YA 3SBBC 1LJHA 3LZMA 1NMMA 1L11A 2BQFA 2MEIA 1CV4A 2BQDA 1JSFA 1L00A 4ETCA 1JTTL 1DYGA 142LA 1XGUC 173LA 4B4IA 193LA 2B6ZA 1JWRA 1HF4A 5DLAA 262LA 3C7ZA 148LE 1NBZC 2MECA 1L21A 1QTDA 2XQOA 1QQYA 1L12A 2IHLA 104LA 1SSWA 1L67A 2Y8PA 1PQDA 3HDFA 1KXYA 3W3EA 4BS7A 2BQMA 5ILFA 3BKHA 3SB8A 3HBHA 1FLUA 1L49A 1GFKA 1L19A 4TTDA 1OUEA 2D4KA 1KXWA 3DMVA 169LA 1ZVYB 1TEWA 1LTMA 2DQFC 1TDYA 3HDEA 4GBRB 1GF7A 1L81A 1B5WA 5FEKA 3GUMA 5LVKA 2BQNA 4HP0A 3PBLA 1SX7A 1L34A 3CSZA 2B7XA 1L58A 194LA 3CT0A 1FLYA 1BB6A 1XGTC 5F16A 4NWEA 1XGPC 1LHMA 1YIKA 140LA 5B1GA 1GEVA 2EQLA 3WU9A 3QAKA 1AZFA 1UIDA 2BQHA 1L44A 1LZBA 3JR6A 5KKIA 1C64A 5D5FA 1L33A 3CDVA 1LSMA 1GFUA 3L64A 250LA 3L2XA 1WQMA 4LYCA 4E3UA 1QUSA 1OUAA 2YBLA 147LA 1CV0A 4FJRA 1REXA 1QTVA 253LA 1GB9A 108LA 3WPLA 4A7DA 1OUJA 4J1BA 4OWBA 4OWHA 4I7QA 1G0GA 1L97A 3AZ6A 5FELA 2BAAA 1B7MA 3LN2A 4NGWA 1LHKA 1WVUA 1B5ZA 1C08C 3BKVA 1OUFA 5B07A 4I7JA 4H93A 1E8LA 2G4NA 1B2KA 3SB9A 3C8QA 5HMVA 1L92A 1IP6A 2N5ZA 2RAZX 1LSFA 1L76A 1ZYTA 1NBYC 2ZQ4A 2NWDX 175LA 3AGHA 4NGZA 5B05A 3HTBA 4M4OA 135LA 5FCPA 3TXHA 4XJGA 1DZBX 1LYYA 186LA 4N1CC 3A67Y 1D9WA 5KJ9A 1CV3A 1L48A 1L94A 4NGJA 1NQIA 221LA 1JKBA 1I1ZA 4TX7A 1L18A 4EKSA 1T8FA 1PQKA 2RBRA 1C46A 4W55A 1P6YA 1GF6A 239LA 1REYA 1L82A 1HC0A 1L47A 1FKQA 5KY1A 2B74A 1D3FA 1GAZA 2RB1X 4XJHA 2BQIA 3CSQA 4DYGA 2F4AA 4NGYA 5LYMA 214LA 4HSFA 119LA 1IR7A 4LDOA 1L56A 2FBDA 1L61A 1GBSA 4W51A 1GFVA 1LZCA 4GCCA 3ZVQA 1J1OY 1VDTA 1LGUA 1BB3A 1C6AA 4WM5A 4Z41A 1GAYA 3QY4A 1LLHA 1CJ6A 2DKVA 1LHHA 4WLXA 2D91A 1VATA 5LZMA 1L0KA 4CGEA 4KPMA 2LHMA 3N9AA 1XFPL 1B5VA 4NGOA 2MEFA 1C10A 8LYZA 4YOPA 4NHPA 1LSZA 1ZWNA 2Z18A 1WQNA 4QY9A 4CJ2A 3WYHA 1SWZA 4WLDA 4LYTA 2OE4X 163LA 1GPQC 1LJEA 1BQLY 1C6KA 5LYZA 4BADA 261LA 213LA 4WM2A 199LA 1SX2A 5KXTA 4E97A 2YSSC 1LAAA 4H8ZA 1L38A 2EKSC 3TMXA 6LYTA 1HFXA 1H6MA 1L15A 1LYZA 2HEBA 5J7CA 2F32A 3HBEX 1HFZA 2BPUA 1UA6Y 1XEPA 1D3NA 5KXNA 1GF8A 3A8ZA 187LA 4LFXA 1QS9A 5A3EA 1JTMA 2HUMA 1LZSA 1LHIA 4PRUA 1GB6A 4H9HA 1LZ5A 1FLQA 3HT9A 4CFPA 2YBNA 2W1YA 1W08A 1IR9A 1P7SA 4NHTA 5KXSA 1GBWA 1LZRA 3TXGA 4OWEA 1G1WA 4XJDA 3HH4A 170LA 1JPOA 1XJUA 2BLXA 4MSTA 4ML7A 1BB7A 4DC4A 1UCOA 3AGGG 1GFTA 189LA 4I7PA 4IJ4A 1WQPA 1XEIA 5B06A 4RW2A 4KL7A 1CKCA 1JIYA 3ATOA 1LZ4A 5M1YA 1LOZA 1FDLY 5F81A 3G3WA 3V2WA 4H9IA 176LA 4LZMA 1SSYA 4DD9A 4DD2A 2RH1A 4EOFA 5DN4A 3A95A 2W1MA 4H9BA 1JJ0A 3HFMY 4H1PA 1D9UA 114LA 233LA 1LZ8A 1GDXA 208LA 3OK0A 1B6IA 5KXPA 2GV0A 1GE3A 2RBOA 247LA 4WLYA 1LI3A 1HSXA 2CDSA 5EBHA 1T8GA 3F6ZA 3ZVQB 113LA 1JTNA 1G0LA 3FI7A 1P2CC 4H9FA 1L43A 4GRVA 4BAFA 1LMTA 1QT6A 4HPIA 1D2WA 1UBZA 3A34A 1Z55A 3QE8A 1GFJA 1RI8B 4H91A 2OTZX 1QSBA 1BWHA 1D2YA 1L39A 256LA 1LYGA 2Z2EA 3LYZA 4YX7C 2HU1A 2Z2FA 4GCBA 217LA 1LYJA 1GFRA 129LA 4XN6A 1L96A 1SQ2L 4XENA 1YKXX 2H9JA 3WW5A 2HULA 4B0DA 4WM4A 1P56A 1L95A 1D3MA 1BWJA 1CV5A 1CX6A 1LYHA 3DN2A 1GD6A 1CKDA 1UACY 4II8A 2HTXA 1D3JA 1UIHA 4YXCA 4ARPA 1L63A 1LJFA 1NHBA 216LA 1CU3A 1WTNA 1IP4A 4H8XA 248LA 5DM9A 2DQAA 2YBMA 1LSNA 2B70A 4LT1A 246LA 3WU8A 1VAUA 1LMAA 3P4ZA 4I7MA 1L69A 3P66A 4NSHA 153LA 4H94A 1IOSA 1GB0A 1OV7A 1G0MA 4WM3A 3GUKA 4WOAA 5IELA 1L98A 3WL2A 1IWWA 257LA 1QT8A 1LYIA 1P37A 1P5CA 4B1AA 1GB5A 3WXTA 3CSRA 2O79A 5LA8A 2WARA 1V7SA 4XYYA 5APEA 3CQLA 1N4FA 1L73A 137LA 3LZTA 4GLAA 1C63A 3WUMA 1DI3A 2RBPA 1OVKA 1GB2A 2LYMA 1HMLA 1L52A 4W59A 4TSBA 4H9EA 1LJ3A 4MR1A 3CDTA 4ARLA 3A90A 1LZEA 3WVYA 1GF0A 1L74A 5LA5A 3TXIA 1C6LA 1LSCA 5HMJA 4HTQA 1L53A 107LA 245LA 5KXOA 4DD1A 2LCBA 2ZNWY 1L72A 2Q9DA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 243L A;  2LYZ A;  1D0K A;  1L45 A;  1P46 A;  1JEF A;  3J4G A;  4U3X B;  2DQE Y;  1L88 A;  5KXR A;  2HEA A;  1ZVH L;  1KW7 A;  4ARM B;  4RDS A;  5IDD A;  1EPY A;  3HUQ A;  134L A;  1C6C A;  3UON A;  1L04 A;  2AUB A;  2W1L A;  5LIN A;  4DWX A;  4LT2 A;  1LMN A;  2MEH A;  2RSC A;  1I20 A;  2Z6B A;  1YKZ X;  1IP2 A;  5I4Y A;  1L10 A;  123L A;  3CT5 A;  3RZE A;  5LVI A;  1HEN A;  5FDJ A;  5KXL A;  4N9R A;  154L A;  5KXZ A;  132L A;  1LYF A;  4IAS A;  3G3X A;  1J1P Y;  1TCY A;  1DYC A;  3TXF A;  1LJG A;  2NTG A;  3A3R X;  1C67 A;  1LZA A;  4IAP A;  1T3P A;  5LYT A;  5KXY A;  1QTE A;  1YL1 X;  2XTH A;  4PPO A;  3WW6 A;  227L A;  1L35 A;  1ZV5 L;  1LI2 A;  3NY9 A;  9LYZ A;  3AB6 A;  254L A;  4QGZ A;  1LJ4 A;  178L A;  244L A;  3D9A C;  215L A;  3TMV A;  200L A;  4QEQ A;  1CU6 A;  1GE0 A;  237L A;  1L71 A;  1L20 A;  4W57 A;  1C68 A;  2BQA A;  4N8Z A;  1BB4 A;  2BQJ A;  3LYT A;  1WVV A;  1NDM C;  1FLW A;  4H8Y A;  3SBB C;  1LJH A;  3LZM A;  1NMM A;  1L11 A;  2BQF A;  2MEI A;  1CV4 A;  2BQD A;  1JSF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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