1QUHA

L99g/e108v mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAGINMVFQMGVTGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of a non-contiguous second-site revertant in T4 lysozyme shows that increasing the rigidity of a protein can enhance its stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1quhA00
1L53A 1L88A 2B6TA 219LA 3DN4A 1LI2A 1L35A 1LYFA 1LGUA 1L68A 129LA 1L98A 3OE8A 1C6KA 1T8GA 1OVHA 1LYEA 3HDEA 3SB5A 3HU9A 3V2YA 201LA 232LA 3G3VA 1L56A 4ARMA 1G0MA 206LA 4PK0A 3D4SA 1L18A 140LA 2L78A 2B75A 1L19A 120LA 104LA 2RAYX 213LA 169LA 4I7TA 3HH4A 1D3MA 157LA 2LC9A 2RB2X 131LA 1L96A 2RBSA 3GUOA 249LA 1T97A 1C6GA 229LA 1C6PA 3F9LA 1D2WA 3HT6A 174LA 197LA 1I6SA 212LA 245LA 2B74A 1G0QA 254LA 3OE9A 1L09A 230LA 236LA 1C6DA 2OU9A 158LA 259LA 1P36A 1L25A 1C6FA 4LZMA 1G0KA 3SB6A 1CVKA 4EPFA 1L32A 3OE0A 3C80A 1L61A 1L97A 2HUKA 1L51A 2B73A 3HT7A 4E97A 1L44A 1C6EA 242LA 4W51A 141LA 1C63A 218LA 110LA 3FADA 4I7SA 1L80A 1L13A 260LA 234LA 1L52A 3PBLA 1L92A 1B6IA 240LA 3K2RA 2OE7X 228LA 3CDTA 1D9WA 1CU3A 3CDVA 1CX6A 1QSQA 3G3XA 128LA 1L89A 109LA 167LA 1OV5A 1L65A 2OE4X 2RB1X 4W55A 2OU8A 3HUAA 1DYGA 3HH3A 171LA 3JR6A 178LA 2NTHA 111LA 4W57A 1QUHA 160LA 147LA 1L46A 1PQDA 2F2QA 1CU6A 2F47A 1C67A 3DN2A 1G1WA 2O79A 4DAJA 227LA 3HTBA 3NY8A 251LA 216LA 2OTZX 1L58A 4EKRA 146LA 3SBAA 1L62A 1C6MA 211LA 4I7KA 1L12A 3CDOA 1L87A 145LA 3HTDA 4YXCA 1C6HA 248LA 1CV1A 3FI5A 1LI6A 1L0KA 1TLAA 2IGCA 1L27A 162LA 1L22A 1G0LA 4IAPA 4I7RA 155LA 1QS9A 4EJ4A 1L31A 1KNIA 165LA 2LZMA 1P56A 168LA 1L38A 1OYUA 1L41A 1G0GA 103LA 1C62A 1L49A 247LA 2LCBA 1CUQA 183LA 1L71A 1WTHA 255LA 2B6ZA 3EMLA 4I7NA 209LA 253LA 3DN0A 3GUMA 1L74A 1C64A 1QTVA 3C81A 3VW7A 4ARLA 1OVJA 221LA 3SBBC 1T8AA 1L34A 1P3NA 143LA 119LA 1SX7A 4OO9A 114LA 1L70A 1L10A 1L30A 7LZMA 1CV6A 2ANVA 187LA 4W52A 238LA 3GUIA 151LA 4EXMA 123LA 3OE6A 1L77A 1L67A 1L40A 1C66A 1QS5A 1DYBA 4ARQB 1DYEA 1L48A 2B6XA 3C8RA 1L95A 4ARPA 1XEPA 2OE9X 3C82A 149LA 1P46A 1QUDA 3HT9A 3HWLA 1G07A 4ZPUA 1LPYA 252LA 4W54A 1D3JA 3DN6A 1L60A 1P2LA 4I7MA 108LA 1C60A 1XJUA 3HH6A 3HUKA 4YXAC 1L50A 1L47A 107LA 1P5CA 2B6YA 164LA 176LA 2ANXA 6LZMA 181LA 1P2RA 192LA 4I7LA 205LA 1DYAA 185LA 5I14A 142LA 3HH5A 2OTYX 2NTGA 2B72A 1QT5A 1L59A 2QARC 3GUJA 3CDQA 2RB0X 1T6HA 237LA 166LA 1G06A 1QTZA 239LA 4DJHA 243LA 2RBQA 3HTFA 3DN8A 1C6CA 1QT3A 2OU0X 233LA 4EKQA 1ZWNA 4W58A 4I7PA 257LA 1L45A 1L91A 246LA 4I7QA 1C65A 2Z6BA 4AQNA 1L03A 4W59A 3QAKA 1CU5A 175LA 3PDSA 4ARQA 223LA 1L37A 1PQOA 1CV5A 4YX7C 1JTNA 3ODUA 1LGWA 148LE 1CV0A 1KW7A 3RZEA 1C6NA 231LA 4GRVA 2Q9DA 3C7ZA 170LA 1SSYA 1P64A 1DYDA 1L21A 180LA 3L64A 125LA 1P37A 2CUUA 1OWZA 214LA 1G0JA 3HU8A 1SSWA 3CDRA 191LA 1QT6A 3GUKA 1CU2A 1T8FA 1C6JA 3SN6R 3FA0A 112LA 1L00A 1KW5A 2RBPA 3HT8A 163LA 189LA 3GUNA 2RBOA 262LA 2RBNA 1L11A 2O7AA 224LA 1QTBA 2QB0B 3DMVA 3SB7A 3LZMA 1CV3A 1P7SA 1OWYA 1CX7A 1L94A 1OVKA 1C61A 3DKEX 4S0WA 122LA 1L39A 235LA 1KY0A 1PQMA 2B70A 4PJZA 1L54A 1L69A 4DKLA 1L08A 182LA 1L0JA 1LYIA 1L85A 1DYCA 1L79A 1LW9A 1L99A 1XJTA 258LA 1C69A 3C7YA 1JQUA 1L26A 261LA 3V2WA 1OV7A 1D2YA 1KS3A 1L14A 1C6QA 3G3WA 1C68A 1L42A 3RUNA 1C6TA 4I7JA 210LA 4W53A 1L04A 256LA 3DN3A 1L16A 1LI3A 161LA 3L2XA 1L73A 1LWGA 3C8QA 1PQKA 3SB8A 1QTCA 1L05A 1K28A 215LA 1QT4A 1L76A 217LA 1L64A 130LA 1QT8A 3SB9A 225LA 4LDEA 4K5YA 1C6LA 5LZMA 1L84A 1D3FA 1L17A 2B6WA 3DMXA 1KY1A 177LA 190LA 1L33A 4LDOA 113LA 4W56A 1L63A 1SWZA 220LA 138LA 200LA 1QSBA 1QTHA 126LA 1L55A 3DNAA 188LA 1L83A 2RBRA 2O4WA 152LA 1ZURA 2OEAX 198LA 1QUOA 1SWYA 1CV4A 1L23A 2A4TA 1L75A 1LLHA 2Q9EA 4EKPA 150LA 156LA 1QUGA 2F32A 3UONA 1L90A 3GULA 1L28A 1L20A 1DYFA 1G0PA 1LYDA 1QTDA 4ARMB 244LA 3NY9A 1L93A 1L24A 1C6BA 1PQIA 1D3NA 1L66A 3F8VA 250LA 4EPIA 144LA 1L07A 3HUQA 1G1VA 1NHBA 3HDFA 1LWKA 2B7XA 137LA 1LYJA 1L82A 1C6AA 1L29A 2RH1A 199LA 3C7WA 195LA 4LDLA 3NYAA 3C8SA 186LA 139LA 1L81A 241LA 226LA 3HTGA 1L15A 115LA 4GBRB 1ZYTA 1CU0A 172LA 1LYGA 1C6IA 1L06A 1SX2A 1L36A 1LGXA 159LA 4I7OA 4EKSA 1LYHA 2RAZX 222LA 1CUPA 1L72A 1JTMA 1P6YA 1EPYA 102LA 1L43A 1L86A 4ARJA 1PQJA 1CTWA 196LA 2HUMA 118LA 127LA 1QT7A 1L57A 184LA 3DMZA 2HULA 3GUPA 173LA 3C83A 1L01A 3DN1A 1L02A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P66A 2B6TA 1L35A 2Z19A 1L98A 1LSGA 1LYEA 5F9XA 3SB5A 3WYHA 4NGLA 4Z41A 1Z55A 4PK0A 4PPOA 3HBDA 4DD2A 3TMXA 120LA 1FLUA 1GHLA 2DQFC 169LA 2DKVA 4I7TA 3HH4A 2YSSC 131LA 3LZ2A 2BQJA 2RBSA 249LA 1IORA 4N1CC 1ZV5L 3W6CA 1D2WA 197LA 1IOCA 212LA 4BAFA 2MEBA 3HBHA 5I4XA 4LZTA 236LA 1P36A 4GN5C 1C6FA 1YKXX 1LZBA 1G0KA 1JWRA 4EPFA 1L61A 3OK0A 1L97A 4LYCA 2HUKA 3HT7A 4BS7A 1C6EA 1JJ3A 242LA 4NHPA 2N5ZA 5APFA 1L13A 1L52A 3PBLA 3AZ6A 4LFXA 1J1PY 1NDGC 1CU3A 1CX6A 3W6FA 1DYGA 1NQIA 1ZVHL 111LA 1JTOL 160LA 4G49A 1GE1A 1CJ7A 1CU6A 4KL7A 2F47A 1WQOA 3P65A 2O79A 3HTBA 1YAQA 3NY8A 2WARA 3E3DA 4CHXA 1L58A 4FDYA 1LZRA 4EKRA 4D9ZA 1L62A 1C6MA 5F14A 1LSDA 4NEBA 3TXEA 1TEWA 1ALCA 1C6HA 4NG8A 1RI8B 1LI6A 1DKKA 4NSHA 1IWYA 2G4PA 4EJ4A 2BQKA 3CSQA 1JJ1A 1UCOA 5ILCA 1L41A 103LA 1C62A 1L49A 1YQVY 2Z2EA 1G7MC 4I7NA 3DN0A 5ILFA 1L74A 1C64A 3C81A 1IIZA 4ARLA 1OVJA 221LA 3SBBC 5E4PA 4XJIA 1T8AA 1JTPL 4DD1A 1REMA 1SX7A 114LA 4LYBA 4TSBA 4NHQA 1YIKA 1B7LA 1SLYA 2ANVA 187LA 3GXRA 1IP1A 238LA 4CGEA 1GFAA 3CSRA 1L77A 1L67A 4M6DA 4DD0A 1GF3A 1DYBA 1OUCA 1C43A 1L48A 2VB1A 4ARPA 149LA 1P46A 4Z46A 1QUDA 4EMNA 2F4GA 2D4KA 4YF2A 4ZPUA 1IR7A 2BQMA 1WQNA 4X3BA 4YXAC 5KXXA 2B6YA 1JSEA 4XJFA 2A7FA 3WVXA 5KXLA 192LA 4I7LA 205LA 1DQJC 1HEOA 2BLXA 3HH5A 2BQGA 4DDAA 4RLMA 1UA6Y 4DQJA 3A8ZA 4HTNA 1T6HA 1LJHA 5L3HA 1G06A 1HSXA 2EIZC 3HTFA 4FJRA 1OQMA 3M18B 2BQAA 1OUFA 4I7PA 5IHGA 4W94A 1LJNA 2A7DA 4AQNA 175LA 1YILA 1HEQA 4ARQA 4HP0A 1JTNA 1TCYA 1B5VA 3CB7A 154LA 3D3DA 3RZEA 1B5YA 2I25L 4ETAA 1DYDA 3P68A 2BQDA 3L64A 1JJ0A 1DPWA 1LZDA 3WXTA 4A7DA 1VEDA 1GAZA 191LA 3GUKA 1CU2A 3SN6R 4OWHA 4H9FA 1KW5A 1LZTA 2RBPA 3HT8A 163LA 2RBOA 2D4JA 3N9EA 5KXMA 5LXWA 1CV3A 1L94A 1C61A 1I1ZA 3EMSA 4S0WA 4NHIA 3G3BB 1L39A 4HPIA 1D0KA 1PQMA 1OUGA 1LJGA 1D6PA 2MEFA 4DKLA 1GBXA 1BVXA 7LYZA 1LW9A 1L99A 1XJTA 1C69A 1JQUA 3WL2A 1REZA 1BB7A 3V2WA 2DQCY 3G3WA 3BKHA 210LA 4I7JA 1L04A 3DN3A 1LI3A 3N9CA 1XEJA 5FHWA 3EXDA 1QTCA 1QTEA 3F6ZA 4CJ2A 1KIQC 3J6KA 4BADA 1QT4A 1L76A 1CKGA 1L64A 3SB9A 4J1AA 1C6LA 5LZMA 2B6WA 1L33A 4UWNA 1L63A 4MR1A 138LA 200LA 1QTHA 4H9HA 188LA 1CNSA 5LYMA 4N9RA 2OEAX 3CT1A 1L23A 1IY3A 3D9AC 1LLHA 1YROA 3W6BA 5LVJA 1G0PA 3EO5A 2LYZA 1QTDA 1L93A 1L24A 1F6RA 1C6BA 2ZNWY 3ATOA 1GWDA 3RU5A 1XSFA 144LA 2MEHA 1L07A 3AGIA 3WUAA 4XENA 1LHKA 1NHBA 3HDFA 1QSWA 2B7XA 1H6MA 137LA 5I4WA 1CJ8A 199LA 195LA 5DM9A 1B7RA 3NYAA 2D4IA 5B05A 2ZQ4A 1YKYX 3QNGA 2YBJA 1LJIA 1ZYTA 4WO9A 172LA 1LKSA 1L06A 1SX2A 4DQ7A 3AZ4A 2RAZX 4NSIA 1GFJA 1L86A 1LYYA 196LA 118LA 5K7OA 1IVMA 127LA 5AMYA 1QT7A 184LA 3C83A 4DD9A 1GB9A 2Q0MX 1L53A 1NHEA 219LA 2CWIA 1IO5A 1DPXA 5KJ9A 1HENA 1LCNA 5LA5A 1LGUA 4B4IA 4M4OA 1GPQC 1HEMA 2LZTA 3V2YA 1CJ6A 232LA 1L56A 1LMOA 1LYOA 1G0MA 5HMJA 4DDCA 4IATA 1L18A 140LA 2F30A 5A3ZA 2B75A 1BB6A 1L19A 213LA 1DI3A 4H93A 3WW6A 2BQBA 1OUBA 1D3MA 157LA 1LJEA 1L96A 207LA 229LA 3F9LA 4DD7A 3WUNA 174LA 2DQJY 3A94A 4QY9A 4LFPA 4PRUA 1AT5A 1LSNA 3CT5A 4DQ5A 1JTTL 2HUBA 5IELA 5KKJA 230LA 2OU9A 3FE0A 158LA 4PRQA 259LA 4NGYA 1L25A 3LYMA 3SB6A 4WLXA 1GAYA 2B73A 2YVBA 1L44A 4DWXA 4W51A 141LA 1XGQC 110LA 218LA 1W6ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P66 A;  2B6T A;  1L35 A;  2Z19 A;  1L98 A;  1LSG A;  1LYE A;  5F9X A;  3SB5 A;  3WYH A;  4NGL A;  4Z41 A;  1Z55 A;  4PK0 A;  4PPO A;  3HBD A;  4DD2 A;  3TMX A;  120L A;  1FLU A;  1GHL A;  2DQF C;  169L A;  2DKV A;  4I7T A;  3HH4 A;  2YSS C;  131L A;  3LZ2 A;  2BQJ A;  2RBS A;  249L A;  1IOR A;  4N1C C;  1ZV5 L;  3W6C A;  1D2W A;  197L A;  1IOC A;  212L A;  4BAF A;  2MEB A;  3HBH A;  5I4X A;  4LZT A;  236L A;  1P36 A;  4GN5 C;  1C6F A;  1YKX X;  1LZB A;  1G0K A;  1JWR A;  4EPF A;  1L61 A;  3OK0 A;  1L97 A;  4LYC A;  2HUK A;  3HT7 A;  4BS7 A;  1C6E A;  1JJ3 A;  242L A;  4NHP A;  2N5Z A;  5APF A;  1L13 A;  1L52 A;  3PBL A;  3AZ6 A;  4LFX A;  1J1P Y;  1NDG C;  1CU3 A;  1CX6 A;  3W6F A;  1DYG A;  1NQI A;  1ZVH L;  111L A;  1JTO L;  160L A;  4G49 A;  1GE1 A;  1CJ7 A;  1CU6 A;  4KL7 A;  2F47 A;  1WQO A;  3P65 A;  2O79 A;  3HTB A;  1YAQ A;  3NY8 A;  2WAR A;  3E3D A;  4CHX A;  1L58 A;  4FDY A;  1LZR A;  4EKR A;  4D9Z A;  1L62 A;  1C6M A;  5F14 A;  1LSD A;  4NEB A;  3TXE A;  1TEW A;  1ALC A;  1C6H A; 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