1QUHA

L99g/e108v mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAGINMVFQMGVTGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of a non-contiguous second-site revertant in T4 lysozyme shows that increasing the rigidity of a protein can enhance its stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1quhA00
250LA 4GRVA 164LA 1CV3A 169LA 1B6IA 1CVKA 1L96A 4I7NA 1DYGA 2ANXA 4W58A 163LA 3SB6A 1CV4A 2NTHA 181LA 1L89A 114LA 1L60A 174LA 3DN4A 1L13A 1LWGA 1L02A 3G3WA 176LA 1L33A 157LA 257LA 1WTHA 1LI6A 152LA 3G3XA 1LYEA 1QSQA 4W56A 4EKPA 190LA 241LA 1P37A 2B6WA 3OE9A 156LA 4DKLA 1C6TA 3CDVA 186LA 1QUOA 3JR6A 6LZMA 2RB0X 1KW7A 1L88A 2RAZX 200LA 3HT6A 1OVHA 4W52A 3SB5A 1G0LA 220LA 1SWZA 1L32A 1C6IA 1OV5A 1L03A 226LA 4LDEA 142LA 1JQUA 1P64A 4YXCA 1QT5A 3SBBC 2OU9A 1C67A 1L68A 1P36A 2Q9EA 2RBRA 1L76A 4ARLA 1C6BA 2OE7X 144LA 1L04A 1L35A 1L49A 1L75A 1L29A 4E97A 150LA 1L61A 1QS9A 1CU0A 1L94A 149LA 4ARMA 229LA 246LA 1QT6A 247LA 1CU3A 243LA 2O7AA 1L19A 3GUIA 3K2RA 3C83A 2ANVA 1P6YA 3C8SA 1LYDA 2RB2X 2OE4X 170LA 206LA 1C60A 1K28A 1L42A 4ARPA 1QT7A 3SN6R 4IAPA 1PQKA 1G0KA 1C61A 2B6XA 1C64A 1L45A 1LGUA 1G06A 221LA 3C7YA 1L66A 1QUGA 184LA 262LA 3C81A 1LYGA 1NHBA 2HUKA 118LA 3NYAA 2Q9DA 1KY1A 1L23A 1L20A 4LZMA 1C6QA 223LA 3DN3A 2RBPA 1KS3A 216LA 242LA 3DMXA 1L84A 3HUKA 1G1WA 145LA 137LA 3OE6A 4EKRA 1L56A 1QUDA 201LA 258LA 3C7ZA 3DN0A 4K5YA 2F2QA 1T8AA 1L28A 4W55A 3DN2A 1C6JA 1L08A 1L87A 1D3MA 3DMVA 237LA 4W53A 1L83A 3GUNA 211LA 178LA 180LA 261LA 1L82A 1L98A 1LPYA 212LA 1P2RA 3CDQA 4GBRB 1QTHA 102LA 1C6KA 3HT8A 222LA 4EXMA 1L21A 4I7TA 1L51A 3V2YA 1L0KA 139LA 1L63A 185LA 1QS5A 1CU6A 3NY8A 4I7PA 238LA 2OEAX 2B7XA 1CV5A 1C68A 4DJHA 103LA 197LA 3F8VA 166LA 1L69A 253LA 1L07A 2OTZX 2RAYX 1EPYA 3DNAA 245LA 1L99A 1G0JA 1T97A 173LA 3HDEA 192LA 168LA 4S0WA 224LA 1LW9A 3FA0A 3HTFA 3LZMA 1L25A 3HT9A 1ZYTA 1CUQA 3CDRA 1G07A 3EMLA 4EJ4A 151LA 1G1VA 1L0JA 4EKSA 2IGCA 2RBQA 1LLHA 1PQMA 1L73A 3GUOA 3RUNA 1L31A 1QTZA 171LA 4W59A 110LA 138LA 239LA 1L92A 2LCBA 3HUQA 1L59A 4I7MA 1OVKA 4PK0A 3C8QA 1QSBA 4YX7C 161LA 3DN8A 3GUKA 236LA 1TLAA 1C63A 3HTGA 1DYEA 160LA 1L09A 1SX7A 3DN6A 1LI2A 2A4TA 1P5CA 1L85A 1SSWA 2RBSA 3C8RA 2O4WA 119LA 1P2LA 213LA 4OO9A 122LA 3GUPA 1C6EA 230LA 2QB0B 1C66A 175LA 1OWZA 1CX6A 1OVJA 125LA 1L52A 2NTGA 5I14A 2F32A 2QARC 2OU0X 3DMZA 3HH4A 177LA 1T8GA 1LYHA 2O79A 3HU9A 1ZWNA 254LA 3HDFA 1G0MA 3HH5A 249LA 188LA 209LA 113LA 4LDLA 2CUUA 1D9WA 111LA 1L43A 1QTDA 123LA 112LA 2B75A 1QUHA 3RZEA 2B72A 3SB7A 182LA 255LA 140LA 1L14A 120LA 3OE0A 252LA 1C6DA 2B6TA 1DYBA 2RBNA 1L57A 4ZPUA 1L01A 187LA 1C6PA 1L90A 1L70A 3HH3A 2B73A 3V2WA 1C62A 3OE8A 1QTBA 172LA 1L34A 1CX7A 1L54A 1L72A 4W54A 1L22A 1L91A 3GUMA 1SX2A 1L62A 4ARQB 3C82A 1L53A 4AQNA 1CTWA 1G0GA 3F9LA 3GULA 1L17A 232LA 3HT7A 3DKEX 3PDSA 1QTVA 1L80A 3HTDA 1ZURA 109LA 1L37A 2OTYX 4EKQA 1L18A 1C6MA 1T8FA 3CDTA 3VW7A 219LA 1L48A 1C6AA 141LA 1D3NA 1L44A 3C7WA 2HULA 3QAKA 4PJZA 1D2WA 1L12A 2B6ZA 1PQJA 3L2XA 1LYIA 1D3JA 3CDOA 1T6HA 3FI5A 3HWLA 1P56A 1L81A 248LA 1QTCA 1L16A 1L95A 218LA 2Z6BA 1G0QA 1D2YA 251LA 1CUPA 196LA 1OYUA 1DYFA 3HH6A 1L71A 155LA 215LA 1L26A 1L46A 1C6NA 233LA 143LA 4I7OA 4W57A 158LA 4I7RA 1KY0A 127LA 130LA 3G3VA 1P7SA 1DYDA 1L58A 1LYFA 4I7KA 1C6GA 1OV7A 256LA 3D4SA 1L67A 228LA 148LE 1C6LA 1QT8A 225LA 244LA 1L55A 1L50A 1SWYA 146LA 1LYJA 2RBOA 128LA 2B70A 1CU5A 2F47A 1JTMA 1DYAA 5LZMA 1L00A 1L11A 1L77A 1C6FA 1SSYA 3PBLA 1I6SA 4ARJA 3UONA 1C69A 214LA 191LA 1L06A 1L93A 1L15A 1L74A 4EPFA 3L64A 1L38A 4W51A 260LA 107LA 1L86A 4ARMB 1L40A 167LA 159LA 259LA 1LWKA 1L24A 210LA 3DN1A 2B6YA 4I7QA 1PQOA 189LA 234LA 1C6CA 1P46A 3FADA 1DYCA 1P3NA 1L36A 126LA 3GUJA 1OWYA 4EPIA 1L10A 1KNIA 131LA 1QT4A 4I7LA 1LI3A 1L79A 1C65A 1L30A 2HUMA 2LC9A 4LDOA 1G0PA 1L41A 1KW5A 129LA 1JTNA 104LA 1L27A 1L64A 1LGXA 4YXAC 1C6HA 199LA 1L97A 231LA 3HTBA 4I7SA 198LA 108LA 3SB8A 3C80A 3NY9A 162LA 4ARQA 4DAJA 235LA 1CV0A 1L47A 1CU2A 3HUAA 1L39A 1D3FA 2OU8A 1XJTA 2B74A 165LA 2OE9X 4I7JA 2L78A 3SB9A 3SBAA 1CV1A 1QT3A 217LA 7LZMA 1XEPA 1L05A 1XJUA 1PQIA 3ODUA 147LA 1L65A 1PQDA 2RB1X 3HU8A 183LA 1LGWA 1CV6A 240LA 205LA 115LA 195LA 2LZMA 227LA 2RH1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
250LA 194LA 4I7NA 1DYGA 4W58A 2IHLA 1J1PY 1LHIA 4P2EA 1SQ2L 4ETAA 4NSIA 1FDLY 3G3WA 6LYZA 5K7OA 1WTHA 2MEEA 3G3XA 1OUEA 3N9EA 190LA 241LA 1TCYA 3AW6A 1G7HC 2H9JA 4DKLA 3CSQA 3CDVA 1QUOA 5KXNA 1XSFA 4NGWA 2W1LA 4LYMA 1LMTA 1IP4A 2RAZX 1CKGA 1OVHA 4DDBA 4YOPA 1JJ1A 2HU1A 4XN6A 1YQVY 1OV5A 3TMWA 1CKFA 1JQUA 3B0KA 3A91A 4NGOA 1GXV2 2NWDX 2GV0A 2Y8PA 1IO5A 1D6QA 4H9BA 1L29A 4E97A 150LA 1CU0A 4W96A 1L94A 149LA 246LA 1QT6A 5I4YA 2BQOA 3GUIA 4XYYA 4LT2A 2OE4X 3WU9A 170LA 1OUJA 4ARPA 1OP9B 1LMQA 1PQKA 2B6XA 1IVMA 3C7YA 3B72A 3ZEKA 5DLAA 1KY1A 1L23A 4LZMA 5APCA 2RBPA 4CJ2A 3LYZA 4U3XB 2G4NA 1L84A 1G1WA 5B59A 5KXRA 1XFPL 258LA 5AMYA 1T8AA 4W55A 3TXBA 5F9XA 1LMPA 1C6JA 1IP7A 1L83A 5DM9A 4NWHA 178LA 180LA 1LSGA 1AZFA 4II8A 3T6UA 1QIOA 1NBYC 2I25L 4XJGA 2D4KA 3V2YA 1L0KA 1CU6A 238LA 1VFBC 3P64A 2B7XA 1CV5A 4DJHA 1L69A 1RFPA 4DYGA 4DDCA 1EPYA 3DNAA 2BQFA 1L99A 173LA 1GF8A 4H8YA 1OUGA 1ZYTA 1FLUA 1LSZA 1CUQA 3RU5A 3EMLA 4WM2A 1LZNA 1N4FA 1XGUC 2IGCA 4EKSA 1GD6A 4HPEA 3RUNA 3CQLA 2MEIA 171LA 4W59A 110LA 3AYQA 4LGKA 5E4PA 1GDWA 161LA 1WVUA 1JSEA 3DN6A 1P5CA 1L85A 1LYSA 2O4WA 4WM3A 1IOCA 4GCBA 5B1FA 1IWYA 1LHMA 5C6IA 3LZTA 1LZ5A 1NF5A 5FHWA 1C66A 2Z18A 4NSHA 5KXMA 1GWDA 1OVJA 4DDAA 2F2NA 2F32A 1EQEA 5APDA 3DMZA 3HH4A 4Z46A 1LYHA 1GF3A 3HU9A 1ZWNA 3HH5A 2XQOA 113LA 4ML7A 1BVKC 3SB7A 182LA 3CT5A 4DWXA 120LA 4LFPA 1LJFA 1C6DA 252LA 4RLMA 2W1XA 1TDYA 4TSBA 3CSRA 2CGIA 1L01A 3WVYA 1HFZA 2W1YA 1QTBA 1MLCE 1L72A 2Z37A 1HC0A 1L62A 2LZ2A 1D6PA 1L53A 4AQNA 1GB6A 1QUTA 2YSSC 2HU3A 4B0DA 2D91A 1BB5A 4NEBA 3HTDA 5L9JA 2RSCA 5KXTA 3AZ4A 4EKQA 4RW1A 1BGIA 4GCEA 1L48A 141LA 3C7WA 4ET9A 4PJZA 1BB4A 4H9HA 4G49A 1LZCA 2BAAA 3FI5A 3IWRA 1P56A 248LA 1QTCA 4DQ5A 5IHGA 5B1GA 4NHPA 1OUHA 4LYTA 1ZVYB 4WM4A 3WVXA 1BVXA 2XBSA 3TMXA 2EIZC 1C08C 3HH6A 4ET8A 1J1XY 155LA 1GE0A 143LA 2I6ZA 3WW5A 1HEMA 3B6LA 3QNGA 1QDRA 1KY0A 127LA 2FBDA 1CJ8A 3G3VA 1INUA 4WOAA 2BQIA 4LYZA 256LA 1IWWA 4WG7A 2MEHA 148LE 1EQ5A 1V7SA 244LA 1L50A 1FLWA 146LA 1LYJA 2A7FA 128LA 1XGRC 1LKRA 1CJ7A 2BQNA 3IJUA 1DKJA 1LZ9A 1VATA 214LA 4B4IA 191LA 1HEPA 2F30A 4CGEA 1DI5A 1L38A 2Z2FA 5KXPA 2HTXA 4YF2A 2EKSC 1L86A 1L40A 1GPQC 1L24A 4WLDA 4OWEA 1C6CA 5LVIA 4J0LA 2FYDA 1QTEA 3GUJA 3LHMA 4NWEA 1GB8A 4WM6A 5KXKA 1L10A 4I7LA 1LI3A 1NWGA 5LYMA 5JENB 1IORA 1HNLA 1G0PA 3AZ7A 1KW5A 1NKHA 1L27A 1DXJA 1PS5A 4G4HA 1L97A 4HPIA 1F6RA 3C80A 4ARQA 4R0FA 4G4CA 1KXWA 1D3FA 1LSBA 2XTHA 1XJTA 1B5UA 3SB9A 217LA 1JKBA 2DQDY 3ODUA 147LA 3W6EA 1CV6A 2YBMA 1B7NA 5HNLA 3AJNA 5II3A 5B07A 2RH1A 1GFHA 164LA 1CV3A 5KY1A 1EL1A 1WTNA 163LA 4HV2A 3SB6A 4UWUA 1L89A 5KJ9A 1LZRA 3DN4A 1G7LC 4N8ZA 4LT1A 1QSQA 4EKPA 1FKVA 5DN5A 1B5VA 2ZNWY 2CWIA 5A3EA 186LA 1REMA 3JR6A 6LZMA 1GFTA 4NGJA 134LA 4QDNA 3B0IA 200LA 3D3DA 2DQCY 2BQDA 4Z41A 220LA 1FLYA 3LYMA 4DQJA 142LA 1LZ4A 3SBBC 1BB6A 1HERA 4I0CA 2RBRA 3LYOA 1JITA 1L04A 1L35A 4MSTA 1DI4A 2C8OA 1QS9A 5KXXA 4ARMA 1HEOA 3HBEX 243LA 2BQLA 3D9AC 3TXHA 1IIZA 3C8SA 2HEDA 1C60A 1LZAA 3SN6R 1G0KA 4BADA 4WL6A 1L45A 1LGUA 1G06A 1IC7Y 1JUGA 1L66A 184LA 1T3PA 1NHBA 2HUKA 118LA 3NYAA 2Q9DA 1JWRA 4H1PA 3AGHA 4QY9A 3FI7A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 250L A;  194L A;  4I7N A;  1DYG A;  4W58 A;  2IHL A;  1J1P Y;  1LHI A;  4P2E A;  1SQ2 L;  4ETA A;  4NSI A;  1FDL Y;  3G3W A;  6LYZ A;  5K7O A;  1WTH A;  2MEE A;  3G3X A;  1OUE A;  3N9E A;  190L A;  241L A;  1TCY A;  3AW6 A;  1G7H C;  2H9J A;  4DKL A;  3CSQ A;  3CDV A;  1QUO A;  5KXN A;  1XSF A;  4NGW A;  2W1L A;  4LYM A;  1LMT A;  1IP4 A;  2RAZ X;  1CKG A;  1OVH A;  4DDB A;  4YOP A;  1JJ1 A;  2HU1 A;  4XN6 A;  1YQV Y;  1OV5 A;  3TMW A;  1CKF A;  1JQU A;  3B0K A;  3A91 A;  4NGO A;  1GXV 2;  2NWD X;  2GV0 A;  2Y8P A;  1IO5 A;  1D6Q A;  4H9B A;  1L29 A;  4E97 A;  150L A;  1CU0 A;  4W96 A;  1L94 A;  149L A;  246L A;  1QT6 A;  5I4Y A;  2BQO A;  3GUI A;  4XYY A;  4LT2 A;  2OE4 X;  3WU9 A;  170L A;  1OUJ A;  4ARP A;  1OP9 B;  1LMQ A;  1PQK A;  2B6X A;  1IVM A;  3C7Y A;  3B72 A;  3ZEK A;  5DLA A;  1KY1 A;  1L23 A;  4LZM A;  5APC A;  2RBP A;  4CJ2 A;  3LYZ A;  4U3X B;  2G4N A;  1L84 A;  1G1W A;  5B59 A;  5KXR A;  1XFP L;  258L A;  5AMY A;  1T8A A;  4W55 A;  3TXB A;  5F9X A;  1LMP A;  1C6J A;  1IP7 A; 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