1SSWA

Crystal structure of phage t4 lysozyme mutant y24a/y25a/t26a/i27a/c54t/c97a
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGAAAAGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alanine-scanning mutagenesis of the beta-sheet region of phage T4 lysozyme suggests that tertiary context has a dominant effect on beta-sheet formation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2004-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1sswA00
4LDOA 1LYIA 1P56A 1C63A 1L03A 2OU9A 182LA 4I7MA 1CX6A 1L00A 2B6ZA 129LA 3CDVA 1L44A 1CVKA 1QTHA 241LA 1L66A 159LA 240LA 181LA 190LA 1LI3A 2ANXA 1L98A 3SB6A 1XJTA 3HTGA 1L79A 1QT5A 1P5CA 1CTWA 1D3FA 1QUGA 3SBBC 149LA 4EKSA 1L22A 222LA 1K28A 1CV5A 219LA 1LYEA 3CDOA 3FA0A 1B6IA 1I6SA 1DYBA 3OE0A 2RBNA 141LA 1CV0A 2QB0B 138LA 4ARLA 1L87A 205LA 3DN1A 1L43A 112LA 199LA 1WTHA 184LA 1L97A 1G1WA 3HT9A 3C7YA 156LA 235LA 1L69A 3HH6A 3HTBA 1CUQA 1D9WA 260LA 1L30A 3EMLA 4W51A 1L75A 1L63A 1DYGA 249LA 1C6HA 3HU9A 2F2QA 1SX7A 115LA 1ZWNA 2LCBA 178LA 2RAYX 3PBLA 225LA 180LA 243LA 3F9LA 1KW7A 2B72A 4DKLA 1L95A 4ARQB 2Q9DA 1OV7A 160LA 1L73A 1L70A 123LA 1CU3A 1L56A 1D3MA 1LYJA 2OU8A 1P36A 4ARQA 2ANVA 4EXMA 157LA 1PQJA 3FADA 186LA 3HTDA 170LA 1LYFA 3SB8A 220LA 3HT8A 1L96A 125LA 2RB1X 2RBRA 3HH5A 168LA 1D2WA 1OVKA 1L26A 1ZURA 1L34A 4W54A 1JQUA 1KY1A 114LA 4GRVA 1L50A 161LA 2A4TA 1L21A 2B6WA 1L02A 4DJHA 1CU6A 4I7LA 3CDTA 3DN0A 3UONA 3DMZA 1P7SA 212LA 3VW7A 1C6BA 1KY0A 1C6DA 3GUNA 3HDEA 1L08A 1TLAA 3C82A 1DYDA 3HH4A 152LA 262LA 6LZMA 4AQNA 1L89A 165LA 2HUMA 2NTGA 1L84A 1OVHA 1SWYA 111LA 1L19A 1L51A 198LA 1CUPA 167LA 1LWKA 3HH3A 122LA 2B6TA 1L88A 110LA 234LA 3DNAA 3HWLA 4I7QA 1G07A 1L90A 1LGXA 1L57A 4IAPA 176LA 1LGWA 1L11A 1ZYTA 1C6KA 2IGCA 1L83A 1C6QA 1QS5A 1L45A 4I7TA 3RUNA 3DMXA 1G0PA 1LI2A 3DN3A 221LA 232LA 257LA 192LA 238LA 1PQKA 1T8FA 118LA 2HULA 3ODUA 1L60A 206LA 1CU2A 4DAJA 1L76A 1CV4A 1L48A 3C81A 4W59A 2B74A 3GUJA 1D3JA 226LA 3C83A 2OU0X 1L58A 3V2WA 3DN4A 1L68A 189LA 1C60A 2Q9EA 3L64A 1L77A 1G0JA 3C7WA 1L04A 2RB2X 175LA 239LA 143LA 3C8RA 3RZEA 155LA 1L80A 1XEPA 1KW5A 4YX7C 1L25A 1CU0A 171LA 130LA 3HT7A 1L0KA 1C66A 2B70A 4YXAC 1DYFA 188LA 1L06A 1C6JA 1P2RA 7LZMA 2L78A 1L27A 1T6HA 1P46A 2B6XA 2O4WA 4ARPA 2RBOA 244LA 256LA 163LA 1LYGA 252LA 5LZMA 1C6CA 120LA 131LA 1LI6A 1L61A 1L39A 1L91A 2OE9X 1CX7A 230LA 4ZPUA 255LA 1KNIA 4W53A 1QT3A 2F32A 107LA 1L55A 1C68A 1XJUA 1JTNA 3JR6A 1OVJA 1C6GA 1L24A 1L67A 119LA 2RAZX 1L99A 245LA 1L72A 4YXCA 1L29A 1L09A 3HUQA 1C65A 1C6NA 2O79A 1G0KA 4K5YA 1L52A 4W58A 4LZMA 3CDQA 1G06A 1QSQA 224LA 1L14A 1C6AA 1CV6A 1D2YA 166LA 1L12A 3DMVA 4W56A 104LA 2Z6BA 113LA 1SSYA 3NY9A 1G0QA 1L28A 1PQDA 2RBPA 2OTZX 3K2RA 1QTVA 2OEAX 3DN2A 258LA 3FI5A 4I7OA 1OV5A 2RBSA 4OO9A 3GUMA 223LA 3GULA 4I7KA 3D4SA 4I7SA 1L36A 3CDRA 1QT4A 4GBRB 1L37A 242LA 4E97A 148LE 1L82A 4LDLA 1L05A 164LA 1QTDA 3HU8A 3GUIA 2LZMA 3G3VA 1C67A 1G1VA 1G0MA 236LA 3V2YA 1L94A 1QTZA 228LA 259LA 174LA 2F47A 2O7AA 3OE9A 1C6MA 215LA 4EJ4A 1L33A 1C6TA 147LA 185LA 3HT6A 1L86A 1CV1A 1PQMA 3NYAA 4S0WA 1L32A 150LA 1L13A 144LA 1L18A 1LYDA 1QSBA 233LA 1P64A 4EKRA 4I7PA 177LA 1QTCA 102LA 1NHBA 3OE8A 1EPYA 1L54A 3HTFA 3SBAA 1QT7A 1L85A 4PJZA 3G3WA 195LA 1C62A 1L81A 1L07A 1QUHA 3SB5A 3G3XA 254LA 3LZMA 3DKEX 2CUUA 3GUPA 3OE6A 4ARMB 1L93A 1SSWA 1D3NA 3C80A 3SB7A 127LA 187LA 172LA 4EPFA 1QT8A 1P6YA 1L10A 217LA 4ARMA 196LA 1PQOA 4W57A 227LA 4I7JA 109LA 3GUKA 2OE4X 200LA 1CV3A 261LA 139LA 4PK0A 4ARJA 1L38A 209LA 2B75A 2LC9A 1LGUA 1QS9A 1C6PA 1G0GA 1DYEA 214LA 2HUKA 145LA 1C6IA 218LA 1C64A 1L20A 250LA 2OE7X 253LA 1P2LA 1OYUA 169LA 1L49A 1QUDA 216LA 1LPYA 1C69A 248LA 1L31A 3F8VA 4EKQA 3PDSA 1L64A 237LA 231LA 1L17A 2RH1A 2OTYX 3HDFA 247LA 5I14A 3QAKA 1T8GA 1G0LA 4LDEA 4I7RA 1LYHA 1P37A 1L40A 1L15A 1L46A 1SX2A 1L42A 1L59A 162LA 1DYAA 1L47A 1T97A 246LA 4EPIA 1PQIA 1CU5A 1L92A 1C61A 3HUKA 3L2XA 1KS3A 201LA 3HUAA 3DN6A 2RBQA 2RB0X 1L65A 128LA 4W55A 1LW9A 103LA 151LA 3SB9A 1L62A 1P3NA 1QTBA 3GUOA 3DN8A 183LA 1C6LA 173LA 1OWZA 1C6FA 146LA 1L41A 210LA 140LA 1L71A 3NY8A 1OWYA 1QUOA 142LA 108LA 251LA 1L01A 1L74A 1LWGA 1JTMA 3C7ZA 1DYCA 191LA 1T8AA 1L53A 1SWZA 1LLHA 229LA 1QT6A 4W52A 3C8SA 2NTHA 2B7XA 3C8QA 1C6EA 1L0JA 211LA 1L35A 4EKPA 137LA 2B6YA 126LA 158LA 1L23A 2QARC 197LA 1L16A 4I7NA 3SN6R 2B73A 213LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LYIA 2I6ZA 5KXLA 1V7SA 1L03A 5II3A 1LSDA 4KL7A 4I7MA 1B5XA 129LA 2Z39A 4OWBA 2Z19A 5ILFA 4N9RA 3HTGA 4J0LA 4WO9A 1L79A 1HFZA 1P5CA 5HNCA 149LA 3G3BB 1L22A 222LA 2LYMA 1UIBA 3CDOA 3EMSA 1F10A 3TXGA 1B6IA 4BAFA 1DYBA 3OE0A 2RBNA 3D9AC 2QB0B 138LA 4H93A 5LAGA 4ETBA 4WLXA 3DN1A 1LZ8A 3N9EA 4GCDA 4WMGA 199LA 1WTHA 184LA 1JKCA 1WQNA 235LA 4H9AA 1LSCA 3HTBA 1GB5A 4NGKA 1L30A 3EMLA 4DQ5A 1D6PA 4NGJA 249LA 4WL6A 1SX7A 1LJKA 2DQJY 4H94A 4L41A 3G3AB 5KXOA 2B72A 5KXSA 4H9CA 1DPXA 1HERA 2LHMA 4CHXA 1CKGA 1OV7A 160LA 1WTNA 1QTEA 4YENA 2OU8A 3WU8A 1HEMA 1IP7A 2FYDA 2BQHA 2BQDA 5APDA 3FADA 3HTDA 4B4IA 3AGGG 4PGJB 2DQDY 1XGPC 3A90A 3SB8A 220LA 4ETCA 1L96A 5B1FA 3ATOA 1IC7Y 5LYZA 1OVKA 1DPWA 1ZURA 4BS7A 1W6ZA 5D5FA 1GBOA 114LA 1AKIA 1B5UA 1L50A 161LA 1OUJA 1L21A 4NHSA 3IJUA 2HEAA 4C3WA 2MEBA 3CDTA 2ZQ3A 3LYTA 1TLAA 4HPEA 1IIZA 2HUMA 2NTGA 2ZYPA 3AGIA 1GE3A 2XJWA 1SWYA 1GBWA 198LA 2MEDA 3LYOA 4H9HA 167LA 1LHKA 2Z37A 2LYZA 4W94A 1B5WA 2DQGY 5KXKA 1JKDA 1IP6A 1C08C 1UCOA 1G07A 1LGXA 1L57A 1XGQC 5C6JA 1BB6A 1HF4A 1C6QA 1G7IC 3AZ4A 3B6LA 4N8ZA 1GEZA 5KKJA 2DBTA 2XBRA 1B7LA 3DN3A 4NHTA 1IY3A 238LA 4QEQA 1PQKA 1T8FA 3K3TA 3AZ5A 3ODUA 1LJJA 5KXYA 1RFPA 1DI3A 2H5ZA 3W6AA 1IX0A 3GUJA 4DDAA 189LA 1C60A 2Q9EA 1ALCA 3RT5X 3L64A 1L77A 1AM7A 175LA 1D6QA 3C8RA 3RZEA 1LYOA 5DN4A 2HEBA 171LA 1J1OY 1RE2A 2HEDA 6LYZA 2BQJA 1XEKA 7LZMA 4YF2A 1LZ1A 1T6HA 4LYZA 1LJ3A 2O4WA 4ARPA 2RBOA 1LPIA 3EXDA 1LYGA 252LA 5LZMA 131LA 5LINA 1BWHA 1PS5A 4GCCA 1JHLA 2YBLA 4Z3MA 1OUGA 2OE9X 230LA 1GF3A 1IOSA 3TXKA 1QT3A 107LA 4CGEA 1JTNA 1NBZC 1OVJA 1L99A 1B7SA 5APEA 3OK0A 1L09A 1C65A 1L52A 1WVVA 4UWUA 1QSQA 224LA 3AB6A 2GV0A 1XGUC 1C6AA 1CV6A 3CSQA 1VDTA 5B06A 1TCYA 1L12A 3DMVA 104LA 2A7FA 1BWIA 2BQNA 2D4JA 1TEWA 4I0CA 1UIFA 1GBSA 1CJ8A 2MEEA 1L28A 1CJ9A 4TWSA 2RSCA 4RLNA 1B7OA 1YIKA 1FLUA 1GFEA 1IEEA 1YKXX 4I7OA 1OV5A 4N1CC 223LA 3GULA 1LMAA 1GB3A 3CT1A 1ZVYB 1L36A 3CDRA 1GAZA 1L37A 2DQEY 3E3DA 4GN4A 4H8XA 4LDLA 1L05A 2MECA 1KIQC 1QTDA 3W3EA 3G3VA 1C67A 4J7VA 3CT5A 259LA 2F47A 2O7AA 1C6MA 2YVBA 2YBNA 4EJ4A 1C6TA 185LA 1IORA 2ZQ4A 150LA 1GF9A 1YQVY 2ZYCA 3WULA 1LMNA 7LYZA 4I7PA 177LA 1LSZA 1QTCA 1NHBA 1NDMC 3OE8A 1EPYA 3G3WA 5L3IA 1FLQA 3G3XA 2CUUA 1LAAA 1LJGA 1SSWA 3C80A 1EQ5A 127LA 2CGIA 187LA 4EPFA 1DQJC 4BADA 227LA 1DKKA 1UBZA 139LA 1L38A 2B75A 3P4ZA 4ZIXA 1DYEA 1WVUA 1L49A 1QUDA 4PHIA 1LPYA 1C69A 3F8VA 3A3RX 231LA 3LHMA 1BVXA 3HDFA 4J1AA 4E3UA 2ZILA 1IP5A 1WQRA 1GBYA 1NWGA 3GXKA 1PQIA 4NGOA 4H9FA 1CU5A 3L2XA 2Q0MX 3HUAA 2BPUA 2RBQA 4W55A 4H91A 3DN8A 3TMWA 1LMOA 146LA 4NWEA 4PPOA 5F14A 1IP2A 1REMA 251LA 1L01A 4NIJA 1JTMA 1QQYA 5LIOA 191LA 1L53A 1SWZA 1QT6A 4M4OA 2B7XA 1JTOL 1HFXA 1LZEA 4EKPA 2Z2EA 2B6YA 4II8A 1JTTL 1LZ6A 4KT3A 3SN6R 1F0WA 4G4BA 2BQLA 1C63A 2LZTA 1BQLY 2HUBA 1LJNA 1LSEA 1UIEA 4G9SA 3WUMA 2H9JA 1L44A 1A4VA 1L66A 159LA 181LA 1HFYA 3SB6A 4EOFA 4WL7A 5LXWA 4I8SA 1MLCE 219LA 4IASA 1JEFA 4Z41A 1CV0A 4B4EA 112LA 1IWVA 3B72A 2CJLA 1W08A 3HT9A 156LA 3GXRA 1FLWA 2ZNWY 3HH6A 260LA 4W51A 1YKYX 1LZRA 1L75A 3AZ6A 1DYGA 2BLYA 2ZWBA 3ATNA 1ZWNA 1IO5A 4ETAA 1GB6A 3PBLA 1LCNA 1REZA 4H9IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LYI A;  2I6Z A;  5KXL A;  1V7S A;  1L03 A;  5II3 A;  1LSD A;  4KL7 A;  4I7M A;  1B5X A;  129L A;  2Z39 A;  4OWB A;  2Z19 A;  5ILF A;  4N9R A;  3HTG A;  4J0L A;  4WO9 A;  1L79 A;  1HFZ A;  1P5C A;  5HNC A;  149L A;  3G3B B;  1L22 A;  222L A;  2LYM A;  1UIB A;  3CDO A;  3EMS A;  1F10 A;  3TXG A;  1B6I A;  4BAF A;  1DYB A;  3OE0 A;  2RBN A;  3D9A C;  2QB0 B;  138L A;  4H93 A;  5LAG A;  4ETB A;  4WLX A;  3DN1 A;  1LZ8 A;  3N9E A;  4GCD A;  4WMG A;  199L A;  1WTH A;  184L A;  1JKC A;  1WQN A;  235L A;  4H9A A;  1LSC A;  3HTB A;  1GB5 A;  4NGK A;  1L30 A;  3EML A;  4DQ5 A;  1D6P A;  4NGJ A;  249L A;  4WL6 A;  1SX7 A;  1LJK A;  2DQJ Y;  4H94 A;  4L41 A;  3G3A B;  5KXO A;  2B72 A;  5KXS A;  4H9C A;  1DPX A;  1HER A;  2LHM A;  4CHX A;  1CKG A;  1OV7 A;  160L A;  1WTN A;  1QTE A;  4YEN A;  2OU8 A;  3WU8 A;  1HEM A;  1IP7 A;  2FYD A;  2BQH A;  2BQD A;  5APD A;  3FAD A;  3HTD A;  4B4I A;  3AGG G;  4PGJ B;  2DQD Y;  1XGP C;  3A90 A;  3SB8 A;  220L A;  4ETC A;  1L96 A;  5B1F A;  3ATO A;  1IC7 Y;  5LYZ A; 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