1T3PA

Half-sandwich arene ruthenium(ii)-enzyme complex
Total Genus 50

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
publication title Half-sandwich arene ruthenium(II)-enzyme complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2004-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1t3pA00
3AZ4A 3TMUA 1B7QA 2DQHY 2BQEA 1LSNA 9LYZA 1IP3A 2EQLA 1JSEA 1YAQA 2Z39A 1IOSA 4NGWA 1C43A 5HNCA 1D6PA 4BAPA 3QNGA 3W6EA 1XEJA 1NDGC 4KL7A 5LVKA 5KXYA 2B5ZA 3WVXA 4WM1A 3A67Y 1C45A 1H6MA 4KXIA 3CQLA 1LZYA 2Z18A 2ZQ4A 3TMXA 1JEFA 3AW6A 4E3UA 1J1PY 1IOQA 1HMKA 5F81A 2LYMA 4NSGA 1LSYA 1KIPC 1LAAA 2ZNXY 3A93A 3B0IA 1KXYA 1GWDA 1LJNA 2BQBA 3ATNA 5HLLA 4H90A 1VDQA 4AXTA 2BPUA 4H8YA 3WU8A 1PS5A 2I25L 1JISA 3WUAA 2G4QA 5F14A 1XSFA 5LVJA 1HFZA 1BB3A 5FCPA 1HERA 1B5VA 3WPKA 1JTTL 1UIFA 1LJHA 2LZTA 7LYZA 153LA 3W6BA 4G9SA 2F4AA 2XTHA 3P65A 3WXTA 1WTMA 2ZYCA 3AZ7A 1IIZA 1Z55A 2Z37A 1JJ0A 3AB6A 1JKCA 4Z46A 4YF2A 3J6KA 208LA 4NG8A 1IWYA 5J7CA 1B7RA 1LZSA 4PGJB 1VDSA 3A34A 4FJRA 3ZEKA 5K7OA 4NHSA 4YM8A 4BAFA 3A8ZA 2BQLA 2Z12A 4RLMA 1B5ZA 3D3DA 5LYZA 4D9ZA 3AW7A 4GLAA 4I8SA 2MEFA 5C6IA 4RW2A 4QY9A 1LYYA 2ZIJA 2ZQ3A 1INUA 2W1LA 2YBMA 4KT3A 5DM9A 4ET8A 4OWAA 1LZDA 5C6LA 4HJYA 4LT1A 2BQKA 4CJ2A 1WQMA 3G3BB 1KXWA 4NHPA 1DI3A 1LZ5A 2Q0MX 3GXKA 1GHLA 1HEPA 2G4NA 1B7MA 134LA 1GB3A 1N4FA 1ZVHL 2HTXA 1HC0A 1I20A 1UIGA 4G4BA 5I5QA 8LYZA 1LJ3A 1F10A 3TMVA 1YKXX 3ZVQB 2EIZC 2H5ZA 4WLYA 4YEMA 1HELA 3P68A 1BB5A 5DN5A 3EO5A 2YBJA 4NWEA 4C3WA 5IDDA 2ZILA 1I1ZA 4XJIA 3WW6A 2YDGA 5LVGA 3IJVA 1XGQC 5M1YA 4QEQA 1JTOL 3LYTA 1DXJA 1GE3A 2HEAA 1GBOA 4HTKA 4LT0A 1QIOA 1VEDA 1QTKA 4J1BA 1GF9A 4X3BA 1CNSA 1GF5A 1HSWA 1LSZA 2FYDA 1P2CC 1TBYA 3AGGG 3EXDA 1VAUA 4TX7A 3W3EA 1T3PA 5I4XA 3WUMA 5LA5A 1LMTA 5LINA 3TXEA 5LVHA 1DKJA 1G7HC 1GE2A 3IJUA 4ZEEA 1OUBA 4ETEA 1IOCA 4PPOA 4WO9A 3A3QA 5FDJA 1AM7A 4H1PA 1HFXA 5F9XA 4GCCA 5KXXA 1JITA 3HBEX 4HP0A 3WU7A 4DD2A 4LYCA 4NY5A 1ZMYL 3HFMY 1HEMA 1LJEA 1GFKA 1CJ9A 1LMOA 1LZTA 4LYOA 1CKGA 4ANRA 3RZ4A 1REXA 3OJPA 2GV0A 1LHIA 1LSEA 1BVXA 4WLXA 3WVYA 5IELA 1DI5A 5C6JA 2HECA 4PHIA 1IY4A 4H9EA 3TMWA 3TXDA 1MELL 2HU3A 4H9IA 4DD1A 3A90A 2ZNWY 3N9EA 2XBRA 1LSDA 1E8LA 5KXTA 4BADA 5I4YA 1LTMA 1C7PA 1JKAA 3A3RX 1LZ9A 4YENA 1LJJA 1DPXA 1YQVY 1HEWA 4NSJA 4WL6A 4NG1A 1JJ1A 1HENA 5KXKA 3KAMA 1GFJA 1UCOA 1ZVYB 1FLQA 1LYZA 4DDCA 2BQCA 1B5YA 1LHMA 5KJ9A 1TEWA 4II8A 5KKIA 4G4CA 5FEKA 1GE4A 1GFUA 4OOTA 4XJDA 5DLAA 5A3EA 4XENA 4DDAA 4CGEA 4R6CA 2Z38A 3TXGA 1HMLA 1WQRA 5DL9A 2XJWA 5KXPA 4CFPA 1HFYA 2WARA 1GB0A 4HSFA 4YOPA 1VATA 2HUBA 2X0AA 4IATA 5APCA 4GN4A 4NGIA 1UIBA 135LA 2D4KA 1GEVA 3B6LA 2YBIA 4RDSA 4H9FA 1FKVA 1IP4A 4DYGA 3WUNA 3WMKA 5FELA 4N1EI 4Z98A 4OWHA 2LHMA 4LT3A 3TXIA 3EBAB 1GF7A 1C10A 4G4HA 3N9AA 1FKQA 4DD3A 5ILFA 2YBNA 4KPMA 2DQDY 4ET9A 3CB7A 5L3IA 3LN2A 5KKJA 4A7DA 1LMAA 4XJGA 4OW1A 1LYOA 4UWNA 5LA8A 1GD6A 2LYZA 1B7LA 3LYMA 4O34A 5A3ZA 1UIDA 4MSTA 1IEEA 1GXV2 2F2NA 1LZBA 3M3UA 4HV2A 5KXZA 2DQJY 1QDRA 2RSCA 2CGIA 3W6DA 1OUHA 3SP3A 1B0DA 2IFFY 3FI7A 1JKDA 4HTNA 4XJHA 1B7NA 1IOTA 4CHXA 1RE2A 4NHQA 4WM2A 1B7PA 1GPQC 1YIKA 1BWIA 1D0MA 2A7FA 1LJIA 5KXRA 2BLYA 1QQYA 1W08A 4NHIA 4B4IA 1BQLY 1GDWA 1UIHA 3WYHA 1LMQA 1BB6A 2BQHA 2H9KA 1O23A 4TSBA 3P4ZA 1GE1A 2D4JA 4B4JA 1GXXA 1CJ8A 1HEOA 2BQFA 4HTQA 1LHLA 1BVKC 3CSZA 1YROA 1GF6A 5B05A 4LT2A 3TXFA 4N8ZA 4ETDA 1LSCA 1TAYA 1TCYA 1XGUC 2G4PA 1J1OY 2YBHA 2Z2FA 1YKZX 2C8PA 3J4GA 5LAFA 1EL1A 1IC4Y 3G3AB 1GE0A 4ZFPA 154LA 1IC5Y 4Z3MA 3K3TA 1GAZA 1NDMC 3CSRA 5APEA 2HEBA 2Z2EA 4LYBA 2DQGY 1F6SA 1IR8A 3N9CA 1JHLA 3ZVQA 4NGOA 2CDSA 2HEDA 4GCFA 1B2KA 4GN3A 2BAAA 2BQMA 1D0LA 2D4IA 3TXHA 4NGKA 4BS7A 1OUFA 1LZ1A 1DQJC 5EBHA 2MEIA 3RT5X 1XEKA 4W96A 4DC4A 4GN5C 5DN4A 1CJ7A 5KXLA 1KIQC 1GAYA 3ULRA 1LZAA 4J1AA 1AKIA 2H9JA 4YEOA 1UICA 1LJKA 1VDTA 4WL7A 1UC0A 2HEEA 4H91A 1YILA 4H94A 1GF4A 4MCKA 1OP9B 3BKVA 1IP6A 1F6RA 4HPEA 4R0FA 1LMPA 2CWIA 3LYOA 2NWDX 4H9AA 1BB4A 1I56A 1QSAA 3AZ6A 5D5FA 2Z19A 4GLVA 1FBIX 4P2EA 1GFVA 4RW1A 1LSGA 1YL1X 4QDNA 1ALCA 5IHGA 2I6ZA 5E9RA 1UBZA 1GFHA 1LHKA 3HBDA 1IP7A 1GF8A 1LJFA 1YAOA 2ZWBA 1CKHA 4H92A 5HNLA 5APDA 5L9JA 1QDTA 2D91A 1LSFA 4TUNA 1IX0A 4N0JA 4DWXA 1QUSA 1JIYA 2FBDA 1IORA 4NSIA 1FLUA 1IWTA 4I0CA 4LGKA 1GB2A 1HHLA 1CKFA 1FLWA 1LHJA 2F30A 3A6CY 1LKRA 3A92A 3ATOA 4GCBA 2ZYPA 1LSMA 4PJ2C 1AZFA 1LZEA 1V7TA 3E3DA 3M18B 4LFPA 1HF4A 1GF3A 207LA 1EQEA 2HEFA 1B7SA 1YANA 4DDBA 2D6BA 133LA 2VB1A 4DT3A 1CJ6A 4UWVA 4NGYA 4IJ4A 3WU9A 1LJ4A 1OUAA 4HJVA 5F16A 3B0KA 1GB5A 1D6QA 1NMMA 4LYTA 1WTNA 1GEZA 4WG1A 1RI8B 2PC2A 3CT5A 4MR1A 3VWOA 1OUEA 4CFOA 1YKYX 1YAPA 5II3A 5LYTA 1RJCB 4ZIXA 4WG7A 4M4OA 1F0WA 2MECA 2C8OA 1IR9A 1LCNA 4GCEA 4WM3A 1C46A 4RLNA 2BQAA 2A7DA 4B0DA 1GFAA 1GFTA 3AJNA 5T3FA 4FDYA 3BKHA 4NWHA 3MGWA 1LZ4A 2DQFC 1BGIA 4XJFA 5LYMA 1QSWA 4HPIA 4LZTA 3LHMA 4TWSA 2ZIKA 4WM4A 1IO5A 4XADA 5B07A 194LA 3F6ZA 1YL0X 1WQPA 3TXKA 5HQ1A 1PZYA 3TXBA 4NGLA 6LYZA 1GBZA 4OWEA 4XJBA 3RW8A 3GXRA 1IP5A 1LKSA 1IVMA 1BHZA 4ETCA 1IWWA 1UUZC 5KXSA 1GB6A 4N1CC 1NHEA 3WULA 5LVIA 1B5XA 1LZCA 1GBWA 1JKBA 5KXMA 4OWCA 3A94A 3T6UA 1DI4A 2BQGA 1YAMA 4NFVA 1HSXA 1C08C 1A2YC 1OUDA 1UIAA 1LHHA 5HMJA 1BWHA 3LZ2A 5B59A 2AUBA 4WO6A 3WXUA 1UIEA 4WM6A 2LZ2A 3W6FA 3WL2A 4NGZA 3D9AC 1B9OA 4LYZA 1BWJA 3W6AA 4WLDA 1GBYA 2DBTA 1IC7Y 2MEBA 4AGAA 1KXXA 1XFPL 1IP1A 1NBYC 3A96A 3HBHA 6LYTA 1DPWA 4OWBA 1GFEA 1B5UA 1AT5A 1LZNA 2YSSC 4WMGA 2DQIY 1OUJA 2N5ZA 1FDLY 1JTPL 1AT6A 4J0LA 1BB7A 4NSHA 4U3XB 1FLYA 5FSTA 1GB9A 1LSPA 5E4PA 3AGHA 2EKSC 5APFA 2BQDA 3P66A 4TTDA 2YBLA 1JJ3A 5F9UA 5HMVA 2FYCA 1IWXA 1QUTA 5KXOA 1WVVA 2CJLA 1SQ2L 193LA 1IY3A 4B4EA 1HNLA 4NHTA 4L41A 1VFBC 1WVUA 2BQOA 1IR7A 2MEDA 1GB8A 3WH1A 2W1XA 3T36A 1GF0A 3A95A 4J7VA 1GFGA 3RU5A 1LZ6A 2IHLA 3EMSA 1IP2A 3AGIA 5KXWA 1WQNA 1XGTC 1LOZA 1DZBX 1LSBA 1WQQA 4H93A 2MEEA 4NEBA 5ILCA 1GBSA 4DD9A 5LXWA 1GFRA 1JSFA 4H9CA 3WPLA 1T6VL 2XBSA 2BQNA 1IWUA 1LMCA 1LYSA 3IWRA 4H8ZA 4XN6A 4B49A 1LZRA 4G49A 4N9RA 5D5CA 5B06A 5LAGA 1OUCA 4NGJA 4OOOA 3WW5A 4C5FA 1CKDA 4ML7A 1B7OA 1GBXA 1JWRA 1XGRC 1JPOA 2F4GA 4W94A 1REMA 5B1GA 4Z41A 1CKCA 1OQMA 4ETAA 1G7MC 1QTEA 4HJZA 2LYOA 4H9BA 2MEAA 1SLYA 5B1FA 1HEQA 4EOFA 4PRUA 1A4VA 1IWVA 1IWZA 3OK0A 4WLTA 1NBZC 1NWGA 5KXNA 3QY4A 4LFXA 1LSAA 1LZ8A 2W1MA 3LYZA 1JUGA 1EQ4A 2I26L 5AMYA 2DKVA 4DD0A 2EPEA 132LA 1UACY 4LYMA 1LJGA 4UWUA 1VDPA 4H9HA 2DQCY 1LMNA 3CT1A 4IASA 2BQJA 4NIJA 2MEHA 1XEIA 5L3HA 3B0OA 1REZA 2DQAA 2DQEY 4DD7A 2BLXA 1REYA 1UA6Y 1J1XY 1KIRC 2BQIA 1GDXA 1NF5A 2YVBA 3AYQA 4PRQA 4QGZA 5FHWA 3WPJA 1NQIA 4M6DA 1MLCE 1D0KA 3AZ5A 4XYYA 1FN5A 1W6ZA 3A6BY 1EQ5A 1B5WA 1RCMA 4NGVA 3RNXA 3W6CA 5JENB 3CT0A 1H87A 3TXJA 1RFPA 1LZGA 5I4WA 1WQOA 1XGPC 3B72A 3FE0A 3LZTA 3CSQA 2HU1A 5I54A 1ZV5L 4GCDA 1TDYA 4B1AA 1NKHA 4EMNA 4HV1A 4N5RA 1V7SA 1G7LC 1OUIA 4WM5A 1OUGA 2W1YA 5KY1A 4TSCA 3QE8A 4H8XA 2Y8PA 5LIOA 1D9UA 1G7JC 1GB7A 2FBBA 1LPIA 3A91A 4ETBA 5I53A 1DKKA 4WOAA 2MEGA 3P64A 1G7IC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AZ4A 3VW7A 9LYZA 1IP3A 1L20A 1JSEA 2Z39A 4NGWA 3QNGA 2B5ZA 1H6MA 4KXIA 2ZQ4A 3TMXA 1G1WA 1L19A 240LA 2B6XA 3A93A 3B0IA 3GUKA 1LLHA 4H90A 1VDQA 2I25L 3WUAA 1BB3A 104LA 1B5VA 252LA 4ARMA 4G9SA 2F4AA 2XTHA 2ZYCA 1IIZA 2L78A 3AB6A 3G3XA 4NG8A 3C82A 1IWYA 5J7CA 1B7RA 4PGJB 131LA 1LYFA 1VDSA 4FJRA 5K7OA 1C6GA 1L92A 4NHSA 3A8ZA 4RLMA 3D3DA 4GLAA 4I8SA 4EKPA 3RUNA 1T6HA 1C67A 3HH4A 1OWYA 2YBMA 1LZDA 3HUQA 5C6LA 2BQKA 3ODUA 1WQMA 1GHLA 2B74A 2G4NA 1GB3A 1N4FA 1YKXX 3ZVQB 4YEMA 1HELA 1BB5A 4C3WA 1L75A 4EJ4A 1L98A 2YDGA 3HH6A 4LT0A 1G0JA 1QIOA 3GUMA 3DN3A 1GF9A 1L61A 1L60A 4X3BA 1GF5A 1TBYA 3AGGG 3W3EA 2LZMA 1T3PA 5LA5A 4ZEEA 4WO9A 4H1PA 1HFXA 5KXXA 1C6BA 4HP0A 3WU7A 4DJHA 3HFMY 171LA 1LHIA 1LSEA 1BVXA 1ZYTA 3WVYA 3DN8A 4H9EA 3NYAA 1KW5A 2ZNWY 4I7PA 1LTMA 1C7PA 1JKAA 3GUIA 3HDEA 1LJJA 1DPXA 195LA 3SB9A 1GFJA 1UCOA 1LYZA 4DDCA 3FADA 2BQCA 5KJ9A 1TEWA 4II8A 4OOTA 5A3EA 1L21A 5DLAA 3DNAA 2Z38A 1HMLA 5DL9A 4CFPA 1QTVA 1L59A 1HFYA 2X0AA 5APCA 135LA 2D4KA 3B6LA 123LA 1IP4A 4OWHA 256LA 3TXIA 187LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AZ4 A;  3TMU A;  1B7Q A;  2DQH Y;  2BQE A;  1LSN A;  9LYZ A;  1IP3 A;  2EQL A;  1JSE A;  1YAQ A;  2Z39 A;  1IOS A;  4NGW A;  1C43 A;  5HNC A;  1D6P A;  4BAP A;  3QNG A;  3W6E A;  1XEJ A;  1NDG C;  4KL7 A;  5LVK A;  5KXY A;  2B5Z A;  3WVX A;  4WM1 A;  3A67 Y;  1C45 A;  1H6M A;  4KXI A;  3CQL A;  1LZY A;  2Z18 A;  2ZQ4 A;  3TMX A;  1JEF A;  3AW6 A;  4E3U A;  1J1P Y;  1IOQ A;  1HMK A;  5F81 A;  2LYM A;  4NSG A;  1LSY A;  1KIP C;  1LAA A;  2ZNX Y;  3A93 A;  3B0I A;  1KXY A;  1GWD A;  1LJN A;  2BQB A;  3ATN A;  5HLL A;  4H90 A;  1VDQ A;  4AXT A;  2BPU A;  4H8Y A;  3WU8 A;  1PS5 A;  2I25 L;  1JIS A;  3WUA A;  2G4Q A;  5F14 A;  1XSF A;  5LVJ A;  1HFZ A;  1BB3 A;  5FCP A;  1HER A;  1B5V A;  3WPK A;  1JTT L;  1UIF A;  1LJH A;  2LZT A;  7LYZ A;  153L A;  3W6B A;  4G9S A;  2F4A A;  2XTH A;  3P65 A;  3WXT A;  1WTM A;  2ZYC A;  3AZ7 A;  1IIZ A;  1Z55 A;  2Z37 A;  1JJ0 A;  3AB6 A;  1JKC A;  4Z46 A;  4YF2 A;  3J6K A;  208L A;  4NG8 A;  1IWY A;  5J7C A;  1B7R A;  1LZS A;  4PGJ B;  1VDS A;  3A34 A;  4FJR A; 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 4OOO A;  3WW5 A;  4C5F A;  1CKD A;  4ML7 A;  1B7O A;  1GBX A;  1JWR A;  1XGR C;  1JPO A;  2F4G A;  4W94 A;  1REM A;  5B1G A;  4Z41 A;  1CKC A;  1OQM A;  4ETA A;  1G7M C;  1QTE A;  4HJZ A;  2LYO A;  4H9B A;  2MEA A;  1SLY A;  5B1F A;  1HEQ A;  4EOF A;  4PRU A;  1A4V A;  1IWV A;  1IWZ A;  3OK0 A;  4WLT A;  1NBZ C;  1NWG A;  5KXN A;  3QY4 A;  4LFX A;  1LSA A;  1LZ8 A;  2W1M A;  3LYZ A;  1JUG A;  1EQ4 A;  2I26 L;  5AMY A;  2DKV A;  4DD0 A;  2EPE A;  132L A;  1UAC Y;  4LYM A;  1LJG A;  4UWU A;  1VDP A;  4H9H A;  2DQC Y;  1LMN A;  3CT1 A;  4IAS A;  2BQJ A;  4NIJ A;  2MEH A;  1XEI A;  5L3H A;  3B0O A;  1REZ A;  2DQA A;  2DQE Y;  4DD7 A;  2BLX A;  1REY A;  1UA6 Y;  1J1X Y;  1KIR C;  2BQI A;  1GDX A;  1NF5 A;  2YVB A;  3AYQ A;  4PRQ A;  4QGZ A;  5FHW A;  3WPJ A;  1NQI A;  4M6D A;  1MLC E;  1D0K A;  3AZ5 A;  4XYY A;  1FN5 A;  1W6Z A;  3A6B Y;  1EQ5 A;  1B5W A;  1RCM A;  4NGV A;  3RNX A;  3W6C A;  5JEN B;  3CT0 A;  1H87 A;  3TXJ A;  1RFP A;  1LZG A;  5I4W A;  1WQO A;  1XGP C;  3B72 A;  3FE0 A;  3LZT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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