1TAYA

Dissection of the functional role of structural elements of tyrosine-63 in the catalytic action of human lysozyme
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRAWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Homo sapiens
publication title Dissection of the functional role of structural elements of tyrosine-63 in the catalytic action of human lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1tayA00
2MEDA 3WUMA 1IR8A 1DKJA 4H92A 4PPOA 1YAQA 5FCPA 3TXGA 3MGWA 3P4ZA 4MR1A 4HV1A 2D91A 4NHSA 3TXDA 1XEJA 4GN4A 1HHLA 3A6CY 1DI3A 3HFMY 1VDPA 4DD7A 4DDCA 4Z46A 4ETBA 4CHXA 1WQPA 1LHIA 1YL1X 4UWNA 4U3XB 5F81A 3AGIA 1IC7Y 3AW7A 3QNGA 5F9UA 5FELA 3W6FA 4FJRA 4NGLA 4OWHA 2B5ZA 2ZYCA 3LZ2A 1LZCA 4ETDA 1BWIA 1CJ9A 1GB6A 1FLWA 1GB7A 1SLYA 2BPUA 4H8XA 2RSCA 3TXFA 4NIJA 1MELL 4QEQA 4DT3A 1LZ5A 1DPWA 5KXOA 1UCOA 2MEHA 2YSSC 4H9IA 4LYOA 2F30A 3VWOA 1IP7A 3W6EA 4YF2A 2DQJY 4XENA 2D4KA 2A7DA 1UIHA 1LJKA 1AT5A 3B0OA 2AUBA 2F4GA 3AZ7A 1XGPC 2XBSA 2BQJA 1LTMA 5LAGA 1RI8B 5FHWA 1RE2A 5A3EA 3TXBA 4AXTA 1REMA 1ZV5L 2G4PA 2C8OA 5M1YA 1HMKA 3QE8A 1XFPL 3WVYA 3A92A 4NGJA 5LYZA 1QUTA 1FBIX 3M3UA 4NHQA 3TXEA 4WOAA 5IDDA 1QQYA 1OUFA 1LMPA 2HTXA 4NG1A 1JSEA 4MSTA 1B9OA 1IY4A 1LSZA 5F9XA 2H9JA 1JTOL 1DI4A 1VAUA 3RU5A 4DYGA 2EIZC 1BB3A 1BWJA 1GBYA 1GFJA 2WARA 2EQLA 1LJNA 1QIOA 4GCEA 5LXWA 5KKJA 2F4AA 1WVVA 3B72A 1F0WA 5APEA 2LHMA 4WO9A 3W6DA 1SQ2L 1FKQA 1LMNA 2Y8PA 1DI5A 5I54A 4NHTA 4G49A 5DN5A 1I1ZA 4OW1A 3CSQA 4QDNA 4DDBA 3EBAB 3K3TA 1OUCA 1B5YA 1IR7A 1GF6A 2W1XA 3ZEKA 1QSAA 1FDLY 5KXLA 1GF8A 4XYYA 2YBJA 1LZBA 4HP0A 2LYMA 3FE0A 5F14A 1LYZA 1HENA 1GFUA 2DBTA 1F10A 1OUIA 2F2NA 2FBDA 4GLAA 1IORA 4LZTA 3WU9A 5HNCA 2Q0MX 3LZTA 1LPIA 4XJGA 1B7PA 4HJVA 4YOPA 3P64A 5B1FA 4LYMA 5I5QA 4M6DA 3RW8A 1RFPA 1B5ZA 3KAMA 4WM2A 4ETEA 4XJHA 1IP3A 1A4VA 1JTPL 5T3FA 5B59A 4TUNA 1GB3A 3WUAA 1IX0A 1XGUC 1LHJA 5C6IA 4IJ4A 4ZEEA 1UIGA 3AJNA 5LIOA 1LZEA 1IR9A 1LMCA 1HSXA 1LZTA 4GCFA 4OWAA 3WPKA 4TX7A 1HELA 1C08C 1ZVHL 5K7OA 4N5RA 1CJ8A 1OUGA 3WULA 4DD0A 1LZ6A 2ZWBA 5C6JA 4HSFA 1GAYA 1IWVA 3EMSA 9LYZA 3RZ4A 4ET8A 1LJFA 1HMLA 5LVJA 1EQEA 2HU3A 1W08A 4WM4A 2PC2A 4NSGA 5LVKA 2BQDA 5KXRA 1IOQA 4G4CA 1FKVA 4NGZA 1KIQC 194LA 4WM6A 1LKSA 2MEGA 1LKRA 1LSAA 3A91A 5I53A 4NGOA 5KXMA 3M18B 3OJPA 1NQIA 2XTHA 4KT3A 1UC0A 4OOOA 1VDTA 4XJBA 1KIRC 1LSBA 1G7HC 2X0AA 1QSWA 1C10A 2A7FA 3B0IA 3AZ4A 1WQQA 1UIDA 2Z12A 2H5ZA 8LYZA 1OUBA 3AGGG 4HJYA 3CT0A 4DD9A 2BQOA 3TXKA 1RJCB 1GFAA 4W96A 133LA 2HEEA 5L9JA 1WQNA 4M4OA 4N1EI 4BAFA 1GB8A 4OWCA 2HEAA 4MCKA 4DC4A 1GEVA 4CFOA 4XJDA 2H9KA 2CDSA 1NDGC 5I4XA 5LVHA 4TSCA 5A3ZA 2DQFC 1B5VA 4LT3A 1C7PA 1E8LA 2CJLA 1B7NA 4TWSA 1YL0X 4EMNA 1HFXA 1FN5A 4ML7A 2D4JA 4ETAA 2D6BA 1LZSA 4H8ZA 1B7OA 1LZ4A 1T6VL 1WTNA 5D5FA 1OUHA 4J1BA 1LSMA 4KXIA 5EBHA 5KXZA 2HEDA 2Z18A 4NEBA 1GWDA 4NHPA 1GFKA 1CJ6A 5D5CA 5B06A 1GB9A 2IFFY 3FI7A 4ET9A 4R6CA 1IP5A 1LMTA 2Z37A 2BQLA 1J1XY 1NF5A 2DQIY 3TMWA 3CT1A 1GB2A 1GE1A 1GFVA 1GXV2 3J4GA 3LHMA 5APCA 1B5XA 4HTNA 4NFVA 1KXWA 1FLYA 1CKDA 1XEKA 5FSTA 1QDTA 1O23A 1I56A 4BAPA 4DD3A 135LA 4NSIA 4B1AA 1WQRA 1PS5A 1YAMA 2XBRA 3T36A 5HMVA 1JTTL 1B7RA 3HBHA 1XSFA 4Z41A 1YILA 1HF4A 5HLLA 1G7IC 3ZVQA 4XJFA 1LZDA 1DZBX 1HEMA 4FDYA 4GCDA 4D9ZA 5LYMA 1HEPA 1IOCA 4TTDA 5LINA 3LYZA 2I6ZA 4H8YA 1BVXA 4PGJB 3A90A 4I8SA 1RCMA 4NWHA 4H93A 1BHZA 1P2CC 4UWUA 4NGYA 1OUEA 2DQHY 4OOTA 4RDSA 2MEFA 2YBMA 1IVMA 2FYDA 5E9RA 1G7LC 1AKIA 2HUBA 5KXXA 3IWRA 1YAOA 4I0CA 1H87A 2LZTA 2W1MA 4WG1A 1UIBA 4BS7A 3W3EA 5DM9A 1NHEA 1IWUA 4LFXA 4ANRA 4N0JA 1C46A 4WL7A 4WL6A 5KXYA 3HBEX 4HV2A 1GB0A 1T3PA 3WW5A 1LZGA 1GF7A 3A34A 3IJVA 4W94A 4B0DA 1KXXA 2Z38A 4HJZA 1HFYA 1IIZA 1GFRA 3WU8A 1JKAA 3LYOA 1KXYA 1CKCA 1VATA 1TBYA 1EQ4A 2BQAA 1REZA 2BQIA 1JHLA 3AYQA 4EOFA 4H9AA 2HEBA 1JIYA 3W6BA 1XGTC 4BADA 1GXXA 1G7MC 1CKHA 1WVUA 4H9CA 1KIPC 5J7CA 1QTKA 2G4QA 3AB6A 5II3A 1LZ9A 1UIFA 3A3RX 4N1CC 1F6RA 3BKHA 2BQFA 1CJ7A 1XGQC 4CJ2A 1VFBC 3N9CA 4G4BA 4LT1A 1HERA 1OP9B 2ZNXY 2ZQ3A 1D0KA 3AZ6A 4XJIA 1LSGA 2IHLA 1LJ4A 4A7DA 2BLYA 5L3IA 2DQDY 1YKYX 1UBZA 5KXNA 5LYTA 1IC5Y 2DQAA 1D0LA 1WQMA 3GXRA 4RLNA 4RW1A 4PJ2C 2Z2FA 4Z98A 5APFA 1CKGA 1UIEA 5FEKA 3LYMA 5DL9A 4B49A 1A2YC 3ATNA 2VB1A 4LYBA 1IWYA 1WTMA 3EXDA 4NGIA 1IP4A 1OUAA 207LA 2MEAA 1AM7A 4WG7A 1QDRA 4YEMA 5KXWA 1LHLA 2MEIA 3BKVA 3E3DA 1DQJC 2ZIJA 4RLMA 1JITA 1VDQA 2EPEA 2Z19A 1BWHA 1C43A 3A67Y 1LSCA 1IWWA 5LA5A 4NHIA 3TXJA 4NWEA 2HECA 1IEEA 2EKSC 3CSRA 2BQMA 6LYZA 5IHGA 1JJ3A 4B4IA 3TMXA 4WM3A 3A94A 1J1OY 5L3HA 4IASA 2GV0A 4YEOA 1GF3A 5KJ9A 1BGIA 4WO6A 1LYOA 1GDXA 1EL1A 4CFPA 1JPOA 2FBBA 5JENB 4ZIXA 1DKKA 5ILCA 1GBSA 2ZIKA 4E3UA 1YROA 2YVBA 4OWEA 1YANA 1YKXX 1UUZC 1GPQC 2DQCY 4Z3MA 4LFPA 3W6CA 1HNLA 3ATOA 4WLDA 4G4HA 4DDAA 4WLTA 5KXKA 1LCNA 5AMYA 1W6ZA 1H6MA 1LZAA 1LZYA 1VEDA 1TAYA 1B7SA 1F6SA 1LYYA 1ZMYL 2HU1A 4J7VA 4DD1A 154LA 4H91A 3AW6A 1JKCA 1LOZA 4B4EA 5C6LA 2DKVA 1EQ5A 4N8ZA 4R0FA 1AZFA 1UIAA 4RW2A 4YENA 2BQHA 2NWDX 1ZVYB 4L41A 1D6QA 3F6ZA 5KXPA 1YIKA 2BQGA 5F16A 1JJ1A 1IWTA 4LYZA 1B5WA 3N9EA 1FLQA 2Z2EA 5B05A 4CGEA 2W1YA 3W6AA 1LSFA 4HPIA 1LZNA 3WVXA 5DLAA 1OQMA 2C8PA 134LA 1HEWA 3CSZA 1LMOA 3J6KA 4GLVA 4PRQA 1LSYA 1LHHA 2DQEY 3CQLA 4IATA 2CGIA 2YBIA 3IJUA 3RT5X 4H9BA 4PRUA 5B1GA 1IOTA 2I25L 1QUSA 1BB4A 1GDWA 1QTEA 1GFTA 2BQCA 3RNXA 1LSNA 1C45A 1HEOA 4WLXA 1NKHA 3WMKA 2BQBA 2N5ZA 4PHIA 3LN2A 1OUDA 2MEEA 4C3WA 1IWXA 1LJ3A 1FLUA 1JISA 2BQNA 5APDA 1GFHA 1BB6A 2BQKA 4DD2A 2BAAA 4HPEA 2LYZA 3HBDA 1JSFA 1JUGA 1D6PA 1LMQA 4G9SA 1LZRA 3WL2A 4B4JA 4AGAA 1IC4Y 4NY5A 3D3DA 1GEZA 1LJJA 3B0KA 2LYOA 4XADA 5KXTA 2DQGY 4H9HA 5I4WA 3T6UA 4H90A 1YQVY 3CB7A 4QGZA 3A6BY 2MECA 3AGHA 5IELA 1TEWA 4H9EA 4OWBA 1NBYC 3P68A 5I4YA 5KXSA 1PZYA 1BVKC 2ZILA 2YBHA 1NWGA 4H9FA 1VDSA 1GF5A 2YBNA 1JKBA 4P2EA 4HTKA 4NGVA 1GBOA 1GB5A 4XN6A 5HNLA 4LYTA 2I26L 1HC0A 3SP3A 1Z55A 3GXKA 1HSWA 4UWVA 3WXTA 1LHMA 4C5FA 4O34A 2BLXA 1GFGA 1LJIA 2HEFA 3G3AB 3P65A 4NG8A 3WXUA 5KY1A 3WW6A 4ETCA 3TMUA 1LSPA 3OK0A 4J1AA 5KKIA 4GN3A 5DN4A 1BQLY 5LVGA 1NMMA 1B0DA 1GF0A 2W1LA 5FDJA 1LJEA 4LGKA 2FYCA 1IO5A 1D9UA 1HFZA 1JEFA 1BB5A 1I20A 3P66A 4N9RA 4X3BA 3WU7A 1REXA 1GE2A 4WMGA 2G4NA 3A95A 7LYZA 3CT5A 1B7LA 1WQOA 1YKZX 2LZ2A 4J0LA 3EO5A 3WPLA 1UACY 3TXHA 4GCCA 5B07A 1REYA 2BQEA 1INUA 1JJ0A 1GF4A 1LAAA 4YM8A 5LVIA 4GCBA 1LMAA 1LHKA 1B7MA 1NBZC 1GAZA 1HEQA 1LJGA 3QY4A 4LT2A 1B7QA 208LA 3WUNA 1GBWA 1D0MA 3WPJA 2D4IA 3A93A 5E4PA 1B5UA 3A96A 3ULRA 1ALCA 4WM1A 1AT6A 1OUJA 1XEIA 1IP1A 4H1PA 4WLYA 4WM5A 3TMVA 5HQ1A 1NDMC 193LA 1UA6Y 1GFEA 1V7SA 4KL7A 4NSHA 4NSJA 4NGKA 5ILFA 1GF9A 4QY9A 1UICA 2ZNWY 4DWXA 1IOSA 1XGRC 4H94A 1J1PY 1IP6A 6LYTA 4ZFPA 2YDGA 1GBXA 3A8ZA 1TDYA 3N9AA 3AZ5A 1BB7A 1GE0A 3D9AC 4GN5C 3TXIA 1LSDA 1LZ1A 1N4FA 2MEBA 4KPMA 4LT0A 2ZQ4A 5LAFA 3WH1A 3A3QA 2CWIA 1DXJA 5LA8A 1IWZA 1LSEA 1GD6A 1GE3A 1IP2A 1LJHA 1MLCE 1TCYA 4HTQA 1DPXA 1G7JC 3G3BB 3LYTA 1GE4A 1JWRA 1V7TA 3B6LA 132LA 1GHLA 2YBLA 1LYSA 3WYHA 1CNSA 3ZVQB 4NGWA 1LZ8A 1JKDA 153LA 1B2KA 2ZYPA 1CKFA 5HMJA 2XJWA 4TSBA 1YAPA 4II8A 2Z39A 1GBZA 4LYCA 1IY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
164LA 3WUMA 3C7ZA 1DKJA 4H92A 5FCPA 4MR1A 1QUHA 2NTHA 4NHSA 3A6CY 1YL1X 1QT7A 5FELA 4FJRA 143LA 4W53A 4DKLA 1P6YA 1LZCA 154LA 1L93A 1L20A 1L18A 4QEQA 1LZ5A 1DPWA 5KXOA 2MEHA 4LYOA 2DQJY 4XENA 2B6TA 2BQJA 1L59A 1RE2A 3HUKA 5A3EA 4AXTA 2G4PA 2C8OA 1HMKA 1L03A 3WVYA 4LDLA 1T97A 1L22A 3SB7A 1QUTA 1L0JA 2L78A 3HTGA 2HTXA 1JSEA 1LSZA 5F9XA 1JTOL 1DI4A 3RU5A 1LJNA 1QIOA 4GCEA 1B6IA 1L43A 5LXWA 2LHMA 4WO9A 1SQ2L 1LMNA 2LC9A 5DN5A 1I1ZA 4QDNA 4DDBA 3EMLA 4LZMA 1C60A 3OE6A 4ZPUA 1P64A 2LYMA 1C6NA 2F2NA 2FBDA 4GLAA 3SB6A 1G1WA 3HT9A 251LA 4XJGA 4YOPA 3P64A 4M6DA 1RFPA 1B5ZA 238LA 1K28A 1IP3A 1GB3A 1UIGA 1QTHA 3DN3A 1HSXA 3WPKA 1CJ8A 1LZ6A 1L42A 3EMSA 3RZ4A 4ET8A 1KS3A 1LYDA 5LVJA 4GBRB 5LVKA 2BQDA 225LA 182LA 5KXRA 1KIQC 1L45A 2MEGA 1LKRA 1LSAA 3A91A 3F9LA 5KXMA 3OJPA 4KT3A 1VDTA 2X0AA 1L72A 191LA 1WQQA 2H5ZA 223LA 4HJYA 2BQOA 166LA 1KNIA 3TXKA 1RJCB 2O7AA 4M4OA 1GB8A 1LI3A 2H9KA 2QARC 1L74A 1XJUA 1LYHA 4TSCA 5A3ZA 2DQFC 256LA 1E8LA 1P2RA 4H8ZA 1T6VL 1LSMA 3DN2A 2Z18A 1QT8A 1LWKA 5D5CA 4R6CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2MED A;  3WUM A;  1IR8 A;  1DKJ A;  4H92 A;  4PPO A;  1YAQ A;  5FCP A;  3TXG A;  3MGW A;  3P4Z A;  4MR1 A;  4HV1 A;  2D91 A;  4NHS A;  3TXD A;  1XEJ A;  4GN4 A;  1HHL A;  3A6C Y;  1DI3 A;  3HFM Y;  1VDP A;  4DD7 A;  4DDC A;  4Z46 A;  4ETB A;  4CHX A;  1WQP A;  1LHI A;  1YL1 X;  4UWN A;  4U3X B;  5F81 A;  3AGI A;  1IC7 Y;  3AW7 A;  3QNG A;  5F9U A;  5FEL A;  3W6F A;  4FJR A;  4NGL A;  4OWH A;  2B5Z A;  2ZYC A;  3LZ2 A;  1LZC A;  4ETD A;  1BWI A;  1CJ9 A;  1GB6 A;  1FLW A;  1GB7 A;  1SLY A;  2BPU A;  4H8X A;  2RSC A;  3TXF A;  4NIJ A;  1MEL L;  4QEQ A;  4DT3 A;  1LZ5 A;  1DPW A;  5KXO A;  1UCO A;  2MEH A;  2YSS C;  4H9I A;  4LYO A;  2F30 A;  3VWO A;  1IP7 A;  3W6E A;  4YF2 A;  2DQJ Y;  4XEN A;  2D4K A;  2A7D A;  1UIH A;  1LJK A;  1AT5 A;  3B0O A;  2AUB A;  2F4G A;  3AZ7 A;  1XGP C;  2XBS A;  2BQJ A;  1LTM A;  5LAG A;  1RI8 B;  5FHW A;  1RE2 A;  5A3E A;  3TXB A;  4AXT A;  1REM A;  1ZV5 L;  2G4P A;  2C8O A;  5M1Y A;  1HMK A;  3QE8 A;  1XFP L;  3WVY A;  3A92 A;  4NGJ A;  5LYZ A;  1QUT A;  1FBI X; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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