1TEWA

Structure of hexagonal turkey egg white lysozyme at 1.65 angstroms resolution
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
128
structure length
128
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Meleagris gallopavo
publication title Structure of hexagonal turkey egg-white lysozyme at 1.65A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TURKEY EGG WHITE LYSOZYME
total genus 51
structure length 128
sequence length 128
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1tewA00
3W6BA 1DPWA 1YAQA 4WL7A 3A96A 1LZ9A 3J4GA 4WG7A 4TWSA 1LMQA 2YBHA 1HFZA 1LOZA 4LGKA 2EKSC 2ZIKA 5F81A 1P2CC 3W6EA 1ZVYB 2CGIA 2ZQ3A 4I8SA 4LFXA 4RDSA 4M6DA 4B1AA 154LA 1D6QA 1LMOA 4G4BA 3ULRA 2FBBA 4MR1A 3WH1A 3AZ7A 4RW2A 1UICA 4LT1A 5KXLA 1GDWA 1B7SA 1LZSA 2YVBA 5KXKA 3T36A 1HEPA 1LHIA 2D6BA 3G3AB 2ZQ4A 2VB1A 4H9BA 3SP3A 1IVMA 1JKBA 1RCMA 4N9RA 3B0KA 4DC4A 2PC2A 3TMWA 1LAAA 1PS5A 4HJZA 4NGKA 4OW1A 4NIJA 2BQCA 4YF2A 2FYCA 5KXYA 3M3UA 4NSIA 1HFYA 4BADA 1WQMA 5J7CA 1IP5A 1HMKA 3EO5A 4MSTA 5KXZA 1E8LA 1XGRC 1GB5A 3IJVA 4LZTA 1DI3A 1G7JC 2ZNXY 2W1LA 4B0DA 4IJ4A 1JJ0A 1DQJC 1B5YA 1KXYA 1KIRC 1LZCA 2HEEA 3TXKA 5HMJA 3EBAB 4ANRA 1LYYA 3RW8A 2BQBA 3AYQA 1VFBC 1LZBA 1LSBA 2BQHA 4ET8A 4LT2A 1JUGA 1KIQC 2BQGA 1EQ5A 1JWRA 1ZMYL 1IOQA 1LJNA 193LA 1GFJA 1HEMA 2A7DA 1C7PA 3A94A 1GB9A 3E3DA 2XBRA 5HQ1A 1YILA 2H9JA 4PGJB 4DD1A 5IHGA 4TUNA 1B7QA 4CFPA 5FHWA 1OQMA 1QUTA 3ATOA 4NG8A 2X0AA 3WUMA 3CB7A 1WQOA 1HHLA 1LSYA 3LYMA 1HEOA 4H8ZA 1GBXA 4LYZA 4ET9A 3B0IA 3QE8A 1FLUA 4UWUA 1NF5A 3N9AA 1OUGA 2GV0A 1LKRA 3WVYA 3LZ2A 4H1PA 1GAYA 3P65A 3HBHA 3QY4A 1OUDA 5LINA 3TXBA 5KXNA 1DI5A 3WMKA 3WXUA 1IR8A 3AZ6A 1LSEA 1B5XA 1ZVHL 5F16A 4B49A 4XJDA 1IEEA 1OP9B 3WU9A 5I5QA 1GE3A 1LHMA 1D0LA 1VATA 2Z2FA 8LYZA 194LA 1IOCA 4B4JA 5APFA 1LSZA 1GFTA 3WPJA 2BLXA 1HNLA 1I56A 1OUAA 1PZYA 4CJ2A 1G7MC 2BQEA 1HSWA 5F14A 1G7LC 5M1YA 5JENB 4WM2A 1CKFA 1IC7Y 4HV2A 1T3PA 1CNSA 1WVUA 4ML7A 1WQRA 4WO9A 5K7OA 2FBDA 4PHIA 3WULA 1CKHA 1LJGA 1UCOA 2HEDA 3AJNA 1LMCA 4B4EA 5LA8A 3WL2A 2B5ZA 4XJBA 2ZNWY 4Z41A 1IORA 4WM4A 1B7NA 6LYTA 3BKVA 1W08A 1IOTA 1B7PA 3HBEX 2XBSA 4HTNA 2HEAA 2Q0MX 2BAAA 1GE2A 1LZ1A 1QDRA 1UIEA 4I0CA 4LYOA 1JPOA 2CDSA 1LJJA 3AW7A 9LYZA 1HFXA 4OWAA 1GF8A 4XJFA 1JEFA 2BLYA 4HPIA 2MEEA 1HEWA 1JTOL 1XEIA 3EXDA 4DD9A 1JKCA 1OUBA 4NHSA 3B0OA 1LZRA 1WQQA 1LTMA 3LYOA 2IHLA 4LYBA 4H93A 4N1EI 1SQ2L 1GAZA 4H9EA 1BVKC 1LSNA 2BQAA 1IIZA 4EOFA 3FE0A 1NHEA 4GN3A 5B06A 1RI8B 3TXFA 4NSGA 1IC5Y 1HMLA 3B6LA 5LAFA 2YBLA 135LA 1LMPA 2DQJY 2H9KA 1B7OA 4WM3A 1YKYX 1YKXX 4NHPA 5LYTA 1AT5A 2BPUA 3VWOA 3AB6A 3K3TA 4P2EA 1GBWA 4N1CC 1UC0A 3TXEA 4LYTA 2YBNA 5F9UA 1BB4A 1F6SA 2F4AA 2F4GA 1LJ3A 2BQJA 4WMGA 4YEMA 1ALCA 1HSXA 4Z3MA 1JJ1A 5FSTA 3M18B 3T6UA 1LJIA 2AUBA 5IDDA 5B59A 2HEBA 3IJUA 1AZFA 4NHQA 1UIGA 4GN4A 4DYGA 2Z2EA 2BQDA 1JKAA 3WYHA 5I4YA 1IY4A 1GFKA 2ZWBA 4H9CA 4A7DA 3LN2A 4X3BA 4GLAA 5KKIA 1JJ3A 3D3DA 3TXIA 2YSSC 2ZYPA 1GF7A 4J1AA 4NG1A 5KY1A 4GCFA 1HF4A 1GE4A 2F30A 2EIZC 1RFPA 1VAUA 4TX7A 1BWJA 4WL6A 1IWUA 2ZILA 1YAPA 4OOTA 4YOPA 3TXGA 5KXOA 2DQCY 1LSAA 3WU8A 1IWVA 1LHHA 3AGIA 4HV1A 4J0LA 4NWHA 4LFPA 5AMYA 1GFEA 2DQIY 3P4ZA 5L3HA 5ILFA 5KXXA 1B5VA 4M4OA 1GF6A 4QGZA 1IWZA 1LJ4A 4XJHA 5APCA 4ZFPA 2DBTA 2DQHY 1IP1A 4EMNA 1GE1A 1UUZC 2Z38A 2HEFA 1YKZX 4XADA 1GF9A 2A7FA 4WLTA 1B7RA 1JHLA 4XENA 3B72A 4DDCA 4OWEA 6LYZA 1NQIA 4PRQA 1B7MA 4HJYA 1GB8A 2BQNA 1UIBA 1GFRA 4WM1A 1FDLY 3N9CA 4DT3A 4AXTA 4H9FA 1TEWA 3A6BY 3RNXA 1IWYA 5B05A 2XTHA 5A3ZA 1JTTL 3P68A 1IWXA 3TXHA 3A8ZA 1G7IC 3KAMA 1LZDA 3CT1A 4FDYA 1HELA 1GF3A 1DKJA 1TCYA 5DLAA 1B9OA 1MLCE 5HNCA 1W6ZA 4PRUA 2MEGA 1I1ZA 3RT5X 1GFHA 1UBZA 4H92A 4BS7A 7LYZA 2C8PA 2YBJA 4NFVA 4OWHA 2BQLA 3EMSA 2FYDA 1A4VA 1YIKA 5I4WA 1ZV5L 4TSBA 5D5CA 2HTXA 5B1FA 1HERA 2CWIA 4J7VA 3CQLA 1RJCB 1FBIX 3CSZA 4LYMA 2LYOA 1LZTA 2F2NA 1GBSA 1GB3A 2MEBA 3GXRA 3TMUA 134LA 1GBZA 1LYSA 2LZ2A 1B7LA 2G4QA 4DD0A 4ETCA 4YENA 4HTKA 3A6CY 4O34A 2Z37A 3P66A 4NGVA 1GB0A 4ZEEA 1JISA 1LZEA 5L9JA 4ETAA 1CKCA 5APDA 4NGYA 1C43A 1LHLA 4L41A 4CGEA 4C3WA 4WLYA 1TBYA 4XJGA 4GN5C 4DD3A 1LMTA 2LZTA 4H9AA 5FELA 1O23A 5I4XA 1XGPC 2NWDX 3WXTA 4II8A 1V7SA 2I25L 1AM7A 1GF4A 4WLDA 1FN5A 4E3UA 3HBDA 1B0DA 1GXV2 1LYZA 3HFMY 4PJ2C 5KXPA 3W6FA 3WU7A 1IOSA 1GFVA 1BB7A 3ZVQA 1LJHA 4TSCA 2RSCA 2DKVA 4KPMA 1NDGC 1VEDA 4U3XB 4DDAA 1QSWA 1G7HC 1REZA 1C08C 4XN6A 3P64A 3A93A 1RE2A 5KXRA 4WM5A 4BAFA 1OUHA 2D4KA 3A3QA 1F0WA 1QDTA 4N8ZA 1DZBX 3N9EA 3LYZA 1IR9A 1UIHA 1IC4Y 4KT3A 1GBOA 3WVXA 133LA 2HU1A 3TMXA 1JKDA 1VDQA 1WQNA 5LAGA 5LVKA 2D4IA 1YROA 4QDNA 3FI7A 2Z19A 3WW6A 1YAOA 1VDTA 1OUFA 1LZYA 4N0JA 2DQAA 3ATNA 5KXWA 1YL0X 1FLQA 1IX0A 2DQFC 4OWBA 1LKSA 1LSGA 1B5UA 1LYOA 4KXIA 1A2YC 1C45A 4NHTA 3TMVA 4CHXA 1IP2A 1NKHA 2G4PA 5II3A 5LA5A 4GCEA 1NBYC 3TXJA 1B5ZA 4NY5A 4WG1A 5C6JA 4WOAA 4ETEA 2LYZA 1GE0A 4HTQA 4YEOA 3WUAA 3WUNA 2N5ZA 5C6LA 5DN4A 1LSPA 1D0KA 153LA 1HEQA 2YDGA 1XGTC 2DQDY 1DKKA 3LZTA 3QNGA 1FKVA 2HU3A 1EL1A 2BQOA 5DM9A 4IATA 1LZ4A 3W6DA 4ETDA 1F6RA 1GB2A 5IELA 1DPXA 2ZIJA 5FEKA 4NSJA 1LMAA 1T6VL 2BQMA 4NGZA 5E4PA 5I53A 1XEKA 3MGWA 4G4HA 3A91A 3A95A 5KXMA 3OJPA 2I26L 3A92A 4GCCA 1JIYA 3AW6A 4RW1A 5KXTA 3TXDA 3W6AA 5A3EA 1KXXA 5KKJA 1CJ9A 4NGWA 1XGQC 5C6IA 1DI4A 1FLYA 1LJEA 4DD2A 2Z12A 4BAPA 1YANA 1IWWA 2BQKA 3GXKA 1INUA 4GCDA 1IWTA 4KL7A 1VDSA 2YBIA 4OWCA 4UWNA 3CT5A 4H90A 5EBHA 1BVXA 4ETBA 5L3IA 1JSEA 4FJRA 4HSFA 4IASA 4H9HA 4C5FA 1FKQA 1LZ8A 2ZYCA 3AZ4A 1C46A 5D5FA 2MEDA 1BQLY 3WPKA 2I6ZA 1JSFA 4RLMA 1SLYA 1JITA 1D9UA 2YBMA 1XFPL 2IFFY 2D91A 2W1YA 4ZIXA 2MEFA 5T3FA 1LHKA 4XJIA 4NGLA 1TAYA 1LJKA 4DDBA 4RLNA 1BB3A 1CKDA 207LA 3A3RX 5E9RA 5LIOA 5LVJA 1QIOA 5HNLA 2W1MA 1LSDA 1GEVA 5LXWA 4R6CA 1GFAA 1QTKA 3WPLA 1LZAA 4H9IA 4MCKA 4Z98A 1QQYA 1YAMA 5DL9A 1IP3A 1GBYA 4NSHA 1GFGA 5B1GA 1BWIA 1B2KA 3OK0A 5DN5A 3ZEKA 2G4NA 4DWXA 1UIFA 3ZVQB 2Y8PA 1GF0A 208LA 1FLWA 1IY3A 3CSRA 1REXA 1IR7A 1BB5A 1H87A 1QSAA 4B4IA 4XYYA 2D4JA 3AGGG 1VDPA 1UIDA 4Z46A 4HJVA 4YM8A 1HC0A 1C10A 4OOOA 4W96A 1IP7A 3IWRA 1F10A 1CJ6A 1GPQC 1OUIA 1WTMA 5I54A 4G49A 4QY9A 1EQEA 1J1PY 132LA 2MEHA 4H8YA 1AKIA 4CFOA 1LJFA 1GWDA 2W1XA 1BHZA 2LYMA 2C8OA 4WO6A 5F9XA 5LYZA 1OUEA 3BKHA 1JTPL 1BB6A 1LPIA 1NWGA 2EQLA 2LHMA 3G3BB 5HLLA 2WARA 5LYMA 4G4CA 2H5ZA 4H91A 5ILCA 1GD6A 1HENA 2CJLA 1GDXA 1D0MA 1GHLA 4HP0A 4HPEA 1REYA 4GCBA 1GFUA 3F6ZA 5LVIA 4LT3A 1GB6A 1IP6A 1BWHA 1WVVA 2Z39A 4UWVA 1N4FA 5APEA 1TDYA 1H6MA 4LYCA 1UIAA 2MECA 2EPEA 1XGUC 1LCNA 1YL1X 4NEBA 1QUSA 1WQPA 4DD7A 1GF5A 1GXXA 4NGIA 3RU5A 1LHJA 3D9AC 1XEJA 4NWEA 4QEQA 4WLXA 4D9ZA 4NGJA 4LT0A 3J6KA 1UA6Y 5FCPA 5KXSA 3RZ4A 1J1OY 3W3EA 3A90A 4N5RA 1CJ8A 1LSFA 1IP4A 1CKGA 5B07A 1MELL 1GB7A 4H94A 4PPOA 1LZ6A 3CSQA 3LHMA 5LVHA 5LVGA 1XSFA 1Z55A 4AGAA 1YQVY 4WM6A 2BQFA 5FDJA 2Z18A 4GLVA 1LZ5A 1LSMA 3A67Y 1NMMA 4H8XA 3AZ5A 1NBZC 2MEIA 4W94A 1NDMC 1LMNA 4G9SA 1D6PA 2HUBA 3AGHA 1EQ4A 1OUJA 5HMVA 2DQEY 1J1XY 1QTEA 1BGIA 1V7TA 1I20A 1KXWA 2BQIA 2MEAA 4J1BA 3CT0A 1B5WA 1LZGA 1UACY 1OUCA 1REMA 2HECA 2DQGY 1LSCA 4R0FA 1CJ7A 1IO5A 1GEZA 4NGOA 1KIPC 5KJ9A 3WW5A 4NHIA 4TTDA 3LYTA 1DXJA 3A34A 1LZNA 2XJWA 1WTNA 1AT6A 3W6CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DPWA 1YAQA 3A96A 2B7XA 2YBHA 3L2XA 1LOZA 4LGKA 2EKSC 1L15A 165LA 1L94A 249LA 1L48A 3W6EA 2CGIA 192LA 4LFXA 4MR1A 3AZ7A 1B7SA 2YVBA 1C6BA 216LA 3G3VA 2B74A 3T36A 1L42A 2B70A 131LA 2ZQ4A 1L50A 4EKQA 4N9RA 2PC2A 1PS5A 1L90A 1LWGA 1IP5A 4I7SA 1GB5A 1L80A 1JJ0A 4IJ4A 4ANRA 3RW8A 1LZBA 2BQGA 1ZMYL 177LA 5HQ1A 1QUTA 4NG8A 1L04A 3CB7A 1LSYA 3HH5A 4LYZA 1ZURA 1FLUA 1LKRA 3QY4A 1QTCA 3WMKA 1JTMA 4W55A 1LSEA 1B5XA 4XJDA 1IEEA 1OP9B 3WU9A 5I5QA 1LYHA 2NTGA 2Z2FA 1VATA 194LA 1IOCA 4OO9A 1GFTA 1HNLA 1I56A 1OUAA 5F14A 5M1YA 222LA 1L27A 1IC7Y 2Q9DA 4ML7A 2ANVA 236LA 5K7OA 3WULA 3HUAA 128LA 184LA 191LA 4XJBA 1KS3A 1KY1A 1IORA 261LA 2B6ZA 1L13A 3HBEX 4HTNA 2XBSA 2CDSA 3AW7A 1QSBA 205LA 1TLAA 1LZRA 1L83A 4H93A 4N1EI 1GAZA 2BQAA 1L10A 1RI8B 4NSGA 1HMLA 3B6LA 5LAFA 1CX6A 2DQJY 1YKYX 1L62A 5LYTA 4N1CC 3TXEA 4LYTA 3GULA 1F6SA 2F4AA 2BQJA 4YEMA 1ALCA 201LA 1JJ1A 5FSTA 3T6UA 1SX7A 1CV3A 1AZFA 4GN4A 1L81A 127LA 3WYHA 3LN2A 2ZYPA 4J1AA 4GCFA 1GE4A 2EIZC 4WL6A 1IWUA 1YAPA 3TXGA 251LA 1L92A 3WU8A 1LSAA 259LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3W6B A;  1DPW A;  1YAQ A;  4WL7 A;  3A96 A;  1LZ9 A;  3J4G A;  4WG7 A;  4TWS A;  1LMQ A;  2YBH A;  1HFZ A;  1LOZ A;  4LGK A;  2EKS C;  2ZIK A;  5F81 A;  1P2C C;  3W6E A;  1ZVY B;  2CGI A;  2ZQ3 A;  4I8S A;  4LFX A;  4RDS A;  4M6D A;  4B1A A;  154L A;  1D6Q A;  1LMO A;  4G4B A;  3ULR A;  2FBB A;  4MR1 A;  3WH1 A;  3AZ7 A;  4RW2 A;  1UIC A;  4LT1 A;  5KXL A;  1GDW A;  1B7S A;  1LZS A;  2YVB A;  5KXK A;  3T36 A;  1HEP A;  1LHI A;  2D6B A;  3G3A B;  2ZQ4 A;  2VB1 A;  4H9B A;  3SP3 A;  1IVM A;  1JKB A;  1RCM A;  4N9R A;  3B0K A;  4DC4 A;  2PC2 A;  3TMW A;  1LAA A;  1PS5 A;  4HJZ A;  4NGK A;  4OW1 A;  4NIJ A;  2BQC A;  4YF2 A;  2FYC A;  5KXY A;  3M3U A;  4NSI A;  1HFY A;  4BAD A;  1WQM A;  5J7C A;  1IP5 A;  1HMK A;  3EO5 A;  4MST A;  5KXZ A;  1E8L A;  1XGR C;  1GB5 A;  3IJV A;  4LZT A;  1DI3 A;  1G7J C;  2ZNX Y;  2W1L A;  4B0D A;  4IJ4 A;  1JJ0 A;  1DQJ C;  1B5Y A;  1KXY A;  1KIR C;  1LZC A;  2HEE A;  3TXK A;  5HMJ A;  3EBA B;  4ANR A;  1LYY A;  3RW8 A;  2BQB A;  3AYQ A;  1VFB C;  1LZB A;  1LSB A; 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 1BB6 A;  1LPI A;  1NWG A;  2EQL A;  2LHM A;  3G3B B;  5HLL A;  2WAR A;  5LYM A;  4G4C A;  2H5Z A;  4H91 A;  5ILC A;  1GD6 A;  1HEN A;  2CJL A;  1GDX A;  1D0M A;  1GHL A;  4HP0 A;  4HPE A;  1REY A;  4GCB A;  1GFU A;  3F6Z A;  5LVI A;  4LT3 A;  1GB6 A;  1IP6 A;  1BWH A;  1WVV A;  2Z39 A;  4UWV A;  1N4F A;  5APE A;  1TDY A;  1H6M A;  4LYC A;  1UIA A;  2MEC A;  2EPE A;  1XGU C;  1LCN A;  1YL1 X;  4NEB A;  1QUS A;  1WQP A;  4DD7 A;  1GF5 A;  1GXX A;  4NGI A;  3RU5 A;  1LHJ A;  3D9A C;  1XEJ A;  4NWE A;  4QEQ A;  4WLX A;  4D9Z A;  4NGJ A;  4LT0 A;  3J6K A;  1UA6 Y;  5FCP A;  5KXS A;  3RZ4 A;  1J1O Y;  3W3E A;  3A90 A;  4N5R A;  1CJ8 A;  1LSF A;  1IP4 A;  1CKG A;  5B07 A;  1MEL L;  1GB7 A;  4H94 A;  4PPO A;  1LZ6 A;  3CSQ A;  3LHM A;  5LVH A;  5LVG A;  1XSF A;  1Z55 A;  4AGA A;  1YQV Y;  4WM6 A;  2BQF A;  5FDJ A;  2Z18 A;  4GLV A;  1LZ5 A;  1LSM A;  3A67 Y;  1NMM A;  4H8X A;  3AZ5 A;  1NBZ C;  2MEI A;  4W94 A;  1NDM C;  1LMN A;  4G9S A;  1D6P A;  2HUB A;  3AGH A;  1EQ4 A;  1OUJ A;  5HMV A;  2DQE Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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