1WVVA

Crystal structure of chitinase c mutant e147q
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
GGNNGFVVSEAQFNQMFPNRNAFYTYKGLTDALSAYPAFAKTGSDEVKKREAAAFLANVSHQTGGLFYIKEVNEANYPHYCDTTQSYGCPAGQAAYYGRGPIQLSWNFNYKAAGDALGINLLANPYLVEQDPAVAWKTGLWYWNSQNGPGTMTPHNAIVNNAGFGETIRSINGALECNGGNPAQVQSRINKFTQFTQILGTTTGPNLSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Studies of a Two-domain Chitinase from Streptomyces griseus HUT6037
pubmed doi rcsb
molecule keywords chitinase C
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces griseus
total genus 74
structure length 209
sequence length 209
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
A PF02839 CBM_5_12 Carbohydrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1wvvA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 1wvvA02
4WM1A 1DI5A 3TXHA 1LSZA 2ZYCA 5KXRA 3FE0A 1INUA 1LZ4A 3WMKA 3WU7A 1FLQA 1IOSA 1FLYA 194LA 2HEBA 4H90A 4LYBA 1IY3A 4BAPA 5F16A 1G7MC 4B4JA 4CJ2A 3AYQA 1LHIA 1LKRA 4BADA 3KAMA 4M6DA 3QNGA 2FBBA 4II8A 3TXKA 3F6ZA 3K3TA 4YEMA 4ML7A 5KXTA 5KXZA 1CKFA 2HUBA 5KXKA 2DQEY 4H92A 1C46A 1GF6A 3B0KA 4NWHA 1YKXX 3J4GA 3CSQA 5LINA 1D0MA 4H9IA 4QGZA 1D6PA 4AGAA 1EL1A 3WL2A 4NGIA 3TXDA 1OUAA 3LZTA 1OP9B 4QY9A 3P66A 1LJFA 2F4AA 3A96A 3A91A 1EQ4A 1LYSA 1HERA 1JUGA 1O23A 1LZAA 1XEJA 1GE3A 1RI8B 4WLYA 3AZ7A 3TMVA 4G9SA 3FI7A 5LAGA 1JEFA 1IC7Y 2Z18A 1LZNA 1GEZA 4AXTA 1B9OA 1H6MA 4H8XA 2YBJA 1J1XY 3A95A 1Z55A 207LA 1HHLA 4L41A 5KXSA 1DPXA 1GF9A 1G7HC 1ALCA 1IY4A 1HMKA 5KXLA 2IFFY 2N5ZA 1IO5A 1QUSA 4WLTA 5F9XA 4NIJA 4WLXA 3LZ2A 4H9CA 3A3RX 2AUBA 3WUAA 2LYMA 5ILCA 1G7LC 1EQEA 2DQFC 4WM6A 4OWEA 1LJEA 1NBZC 4EMNA 4I8SA 2YBMA 3TXIA 2DQCY 3AZ6A 3WVYA 1VFBC 5FDJA 1OUCA 1LJJA 1LHMA 1EQ5A 1LZEA 1I56A 1LMAA 1GWDA 1IORA 1YAOA 2BQOA 1UC0A 1IC5Y 4RDSA 4UWVA 135LA 132LA 2Q0MX 4MSTA 5L3IA 2W1LA 1ZVHL 1ZMYL 1MLCE 4NGLA 2BQNA 5LXWA 1HSWA 4E3UA 4ZIXA 1TAYA 2BQGA 4HJYA 1IWTA 2ZIKA 4XENA 3ZVQB 4DYGA 5B59A 2BQKA 1IWZA 3IWRA 1KIRC 7LYZA 1JWRA 1SQ2L 1XEIA 1YAPA 1DZBX 3MGWA 1GFKA 3P64A 3CSZA 4HTQA 4RW2A 4U3XB 1BWIA 2DQGY 4GN4A 1LMOA 1VEDA 5APFA 4OWBA 4TUNA 3WU8A 1JSFA 1W6ZA 2YBLA 2YSSC 1WTNA 3A34A 1NHEA 1XGPC 2BLXA 3A94A 5I5QA 4BAFA 4WLDA 1GBWA 1NWGA 1KXWA 2ZNXY 1OUFA 1CJ8A 1QDTA 5F14A 1XEKA 1QIOA 4C5FA 2Y8PA 4KPMA 1A2YC 4P2EA 1JTPL 1LHHA 1WQOA 5E4PA 3AW6A 1D0LA 1LZCA 4GCCA 4LZTA 4MCKA 4OOTA 4XJHA 4YENA 1FLWA 1LZYA 4NSJA 1NMMA 4LFPA 3WPKA 5KXOA 1B7MA 1LMNA 4W96A 1HEOA 1QTKA 5B1FA 1LHJA 2C8PA 5LVHA 5KXMA 5E9RA 2FYCA 4PRUA 3N9EA 5KXPA 1I1ZA 1D0KA 2H9KA 4HP0A 1T6VL 1WQMA 4NHTA 1OUJA 1GBXA 5LIOA 4DDAA 153LA 1B7SA 1UACY 1IOQA 1IIZA 1UUZC 2RSCA 1CKDA 4XYYA 2LYZA 1GPQC 5DN5A 1BB5A 1GBOA 1MELL 2YBIA 3WPJA 1V7TA 2MEAA 1YAQA 5A3ZA 2BQJA 4NGVA 3HBDA 4WO9A 1LSGA 1TBYA 1GD6A 4HSFA 3M18B 3HBEX 2BQIA 3W6EA 4H1PA 5DL9A 4CFPA 8LYZA 1B5UA 2MEEA 1HEPA 1GE2A 1OUHA 5T3FA 3W6DA 5M1YA 5KKIA 1IR9A 3ULRA 1AZFA 1B7OA 4NGKA 5D5FA 1GHLA 5ILFA 1JTTL 5B1GA 2XBRA 3RU5A 1GFHA 1LZGA 1LSEA 4H9HA 1BWJA 3TXBA 4NG1A 1BB4A 1LAAA 4LYOA 2CJLA 3A90A 3WXTA 2BQEA 1LMPA 4DC4A 5JENB 1GXXA 5LA5A 4H8YA 1LYOA 1REMA 1BVKC 1IWXA 1CKGA 3RT5X 6LYTA 2EQLA 1HSXA 4IATA 2GV0A 3CT5A 1GFJA 1HNLA 1DKKA 3TMUA 1GE4A 2MECA 4PRQA 5HMJA 4CFOA 1DI4A 3AGGG 2D4KA 1GB8A 4GLAA 1GB2A 4A7DA 1JITA 1HF4A 1OUBA 1RJCB 4XJGA 1GFGA 5HNCA 2EKSC 5I4XA 5LYMA 3OK0A 1VAUA 4RW1A 2ZIJA 4YEOA 193LA 2Z2EA 1UIEA 3ZEKA 4GCFA 2EIZC 2ZNWY 5APEA 3WVXA 4ZFPA 2MEHA 2Z19A 1GXV2 4NFVA 1GB6A 1QSWA 1B7NA 3G3AB 4H93A 5EBHA 4ZEEA 3AB6A 3WU9A 1GF5A 4LFXA 4YF2A 1JKDA 1HC0A 1REYA 2ZWBA 5D5CA 1GDWA 1LZ8A 2BQCA 3AW7A 1JKCA 1CJ9A 1IOTA 1UCOA 5DN4A 4LYZA 4EOFA 3CQLA 2CWIA 1NDMC 1IOCA 4LGKA 2LZ2A 4PGJB 2FYDA 3TXJA 2C8OA 1LPIA 1IR7A 1CKHA 1GAYA 2Z39A 3G3BB 3HBHA 1J1PY 1LOZA 1BB7A 1LSMA 1LSCA 1WTMA 208LA 2PC2A 5I4YA 2G4NA 1GE1A 3IJVA 4HPIA 1UIGA 5DM9A 5KY1A 3AGIA 4HV2A 1WQQA 2BQLA 5F9UA 2XTHA 2MEBA 4B1AA 5I54A 1LHLA 1F0WA 2Z37A 3AZ5A 1JSEA 4LT0A 5KXWA 2CGIA 1YILA 2MEFA 4HV1A 1UIBA 3QY4A 3CSRA 5C6JA 1OUEA 3WXUA 4XN6A 1B5ZA 1LZ9A 3IJUA 1F6SA 5B05A 4FDYA 4M4OA 4DD0A 3TXGA 1UIAA 3EMSA 1QSAA 4NSHA 5KXNA 1IWYA 2HTXA 2BAAA 2W1XA 4GN3A 4H94A 1XGUC 4B0DA 4W94A 1RE2A 3A8ZA 4FJRA 3LYMA 1LKSA 1YQVY 134LA 1FN5A 1CNSA 1B5WA 1IR8A 1UIFA 1GB0A 1IP1A 1CJ6A 1V7SA 1JIYA 2HU1A 1JHLA 3B0OA 3N9CA 4HPEA 1BHZA 1BB3A 3B6LA 1LZDA 3AZ4A 3BKVA 5LVGA 2HECA 1D6QA 1LMTA 1UA6Y 1UICA 1FBIX 5KXYA 2WARA 4R6CA 5HNLA 4O34A 1IP4A 1GF0A 1YL0X 4C3WA 1JISA 2D4JA 1LCNA 1GB5A 1GBZA 4WO6A 5I53A 4H8ZA 1GDXA 3LYOA 3A6CY 4TSCA 1BQLY 3B72A 2MEIA 3WW5A 1LZRA 1DKJA 1LSPA 4H9BA 1HFZA 3TXEA 4ETEA 4NY5A 1NDGC 3WUNA 3WW6A 1UIHA 4WM5A 1LYZA 2YBHA 1LZTA 1NBYC 3GXRA 4WM2A 4G4CA 1JJ1A 1GF8A 1ZV5L 5LVJA 1RFPA 4B4IA 3GXKA 1LJKA 1VATA 1QQYA 1BVXA 4OWAA 4XJBA 3RNXA 2DQIY 3CT1A 1FLUA 4J7VA 3W6CA 1PZYA 1C08C 3EBAB 1LTMA 4OWHA 1LZ1A 2DQJY 1P2CC 1IP2A 4J1BA 1LSYA 1IWUA 1VDPA 2DBTA 3D9AC 4G49A 3W3EA 1WQRA 3HFMY 2F2NA 1GB9A 2HU3A 4WG1A 3TXFA 4UWUA 4CGEA 1TEWA 4NSGA 2G4QA 2ZYPA 1GAZA 5F81A 5II3A 1B5XA 1HMLA 4XADA 1XGQC 1H87A 4GCDA 5LYTA 1YROA 4GCBA 4H9EA 6LYZA 2HEEA 2NWDX 4DDBA 5LAFA 3A67Y 4NGYA 1GE0A 1XSFA 1BWHA 2BQAA 2HEFA 4TWSA 2BPUA 1AT6A 5B07A 2D4IA 4DD2A 3LHMA 1AM7A 5C6LA 4HTKA 3B0IA 3CT0A 5B06A 1G7IC 4ANRA 1GFAA 1IP3A 1FKQA 4J0LA 5KXXA 1GBSA 2Z2FA 1VDSA 5DLAA 5AMYA 2BQFA 4OW1A 4NGWA 5FELA 4ET8A 1LJIA 3WPLA 3P65A 1XFPL 1XGTC 1B7LA 5LVIA 5I4WA 2ZILA 1HFYA 1JTOL 2H5ZA 1F6RA 4RLMA 1GF7A 2HEDA 4NG8A 1FKVA 2LHMA 1G7JC 1I20A 3A3QA 5APCA 4DD3A 1IP7A 2Z38A 3T6UA 4LYMA 4YOPA 1DI3A 1J1OY 2ZQ3A 1QUTA 4NHIA 3RW8A 3LYTA 4G4BA 1PS5A 3BKHA 5HMVA 1SLYA 1LJ4A 1W08A 4N9RA 3WH1A 4WG7A 4DDCA 1C45A 1E8LA 1B7QA 2MEDA 1KXXA 2DKVA 2B5ZA 1C10A 4NSIA 1VDTA 3SP3A 4H9AA 4Z41A 2W1MA 4KT3A 3AGHA 1OQMA 4PPOA 5LVKA 3EO5A 3EXDA 4NGZA 4WM3A 1B7PA 5K7OA 2BLYA 4RLNA 1WQNA 4J1AA 1OUGA 1D9UA 2LYOA 4GLVA 1YKYX 4NHQA 1REZA 1GB3A 1HENA 4NGOA 4GN5C 2D91A 4DT3A 133LA 1GFVA 4QEQA 5IDDA 4N5RA 5L9JA 9LYZA 5IHGA 154LA 4Z98A 1YIKA 2CDSA 2I6ZA 1KIQC 1REXA 4ETDA 4B4EA 1GFUA 1LJGA 4TSBA 4XJFA 4PHIA 1B7RA 2BQHA 2LZTA 1JKBA 1GEVA 1BB6A 1TCYA 2DQDY 4N0JA 1B2KA 3A92A 3E3DA 4DD9A 4ETAA 5KKJA 3W6AA 1C7PA 1TDYA 1LYYA 1FDLY 1YAMA 4H91A 1JKAA 4WL7A 5C6IA 3A6BY 4ETBA 1WVUA 2A7FA 1KXYA 1OUDA 4NEBA 5FCPA 1LZ5A 1HFXA 5LA8A 5L3HA 1IX0A 2Z12A 1KIPC 4XJDA 4X3BA 1DXJA 4N8ZA 2ZQ4A 3TMXA 4IJ4A 1GF3A 4TX7A 2IHLA 1N4FA 1T3PA 3D3DA 1DPWA 1A4VA 3VWOA 4TTDA 4LYCA 4HJZA 1QTEA 1F10A 1BGIA 3W6BA 4UWNA 4CHXA 4DD1A 1JPOA 4BS7A 3M3UA 4D9ZA 1UBZA 1LZSA 1VDQA 2A7DA 3ZVQA 2H9JA 3P4ZA 1OUIA 5IELA 3P68A 1GFTA 4Z46A 3WULA 3W6FA 1ZVYB 4NHSA 1XGRC 2G4PA 2XBSA 4QDNA 4LYTA 4WMGA 5HLLA 1AT5A 3RZ4A 1LZ6A 3LN2A 2DQHY 4DD7A 2FBDA 3ATOA 5KJ9A 1UIDA 3CB7A 1QDRA 4NWEA 4ET9A 2BQBA 1IWVA 1GF4A 3WYHA 1B0DA 1GBYA 1NQIA 3N9AA 1HELA 1LJNA 2BQMA 2W1YA 1LHKA 4PJ2C 1IC4Y 4XJIA 2XJWA 4WM4A 2DQAA 4N1EI 2BQDA 1LSBA 2EPEA 3OJPA 4H9FA 4DWXA 1LMCA 3WUMA 4GCEA 1LJHA 1GB7A 1IEEA 4HTNA 4R0FA 2YDGA 1DQJC 1WQPA 4IASA 2X0AA 3TMWA 1IWWA 1YKZX 2VB1A 1LZBA 4NGJA 1RCMA 5A3EA 4YM8A 3A93A 4MR1A 4G4HA 4I0CA 1YL1X 2D6BA 1LJ3A 1LSDA 2F4GA 1C43A 4KL7A 4N1CC 4WOAA 4OWCA 5FHWA 4HJVA 5HQ1A 1IVMA 1NKHA 3QE8A 1HEWA 1AKIA 1B5YA 5FEKA 2YVBA 1B5VA 4LT1A 4NHPA 5LYZA 4LT3A 4B49A 4Z3MA 2I26L 4KXIA 2I25L 1GFEA 1JJ3A 1LSFA 1NF5A 1CKCA 2MEGA 4LT2A 1LMQA 1IP5A 1GFRA 2F30A 3ATNA 3LYZA 1WVVA 2YBNA 1IP6A 1JJ0A 1LSNA 4ETCA 1HEMA 4OOOA 5APDA 1HEQA 2HEAA 3AJNA 4WL6A 1CJ7A 3T36A 5FSTA 5J7CA 3J6KA 1LSAA 1YANA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QUDA 5KXRA 1INUA 3DN3A 3WU7A 4LYBA 194LA 1IY3A 3HUQA 3NY8A 1LKRA 4M6DA 5KXKA 1C46A 3HDFA 3J4GA 4H9IA 4QGZA 4AGAA 3WL2A 4NGIA 2F4AA 174LA 1XEJA 164LA 1RI8B 1C64A 3G3VA 4WLYA 4G9SA 3FI7A 3NY9A 1L08A 1LZNA 4AXTA 1B9OA 3A95A 1Z55A 1GF9A 2IFFY 1IO5A 3DMXA 4EKPA 3A3RX 2LYMA 1EQEA 2OEAX 1G06A 3DN0A 185LA 2DQCY 3AZ6A 3GUKA 1OUCA 1L99A 219LA 1YAOA 1IORA 2BQOA 4UWVA 2W1LA 1ZMYL 1MLCE 4NGLA 4E3UA 1IWTA 1L18A 4DYGA 1JWRA 1XEIA 3P64A 1GFKA 231LA 1T97A 5APFA 1LMOA 1G0JA 3HU8A 1L30A 1WTNA 1NHEA 1QTZA 4BAFA 4WLDA 1NWGA 113LA 5F14A 1QIOA 4KPMA 1A2YC 152LA 2RB2X 1T8AA 1LHHA 5E4PA 3AW6A 4XJHA 4MCKA 4LFPA 3WPKA 5KXOA 1LHJA 161LA 5LVHA 5KXPA 1I1ZA 1T6VL 2RBRA 1GBXA 4YX7C 1P64A 153LA 1B7SA 1IOQA 2Q9EA 1G0KA 4XYYA 2LYZA 3DMZA 2LC9A 102LA 3OE9A 5DL9A 1B5UA 1LYHA 1HEPA 1OUHA 227LA 3W6DA 1L05A 5KKIA 199LA 2B6XA 1GHLA 1JTTL 5B1GA 1LSEA 1BWJA 4NG1A 5I14A 5JENB 4DC4A 1LMPA 4DKLA 6LZMA 2GV0A 4CFOA 1HNLA 3TMUA 1GE4A 143LA 1DI4A 1GB8A 1XJUA 1HF4A 1L42A 5I4XA 5LYMA 3OK0A 4RW1A 3ZEKA 3DNAA 4W52A 4NFVA 2ANVA 1B7NA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WM1 A;  1DI5 A;  3TXH A;  1LSZ A;  2ZYC A;  5KXR A;  3FE0 A;  1INU A;  1LZ4 A;  3WMK A;  3WU7 A;  1FLQ A;  1IOS A;  1FLY A;  194L A;  2HEB A;  4H90 A;  4LYB A;  1IY3 A;  4BAP A;  5F16 A;  1G7M C;  4B4J A;  4CJ2 A;  3AYQ A;  1LHI A;  1LKR A;  4BAD A;  3KAM A;  4M6D A;  3QNG A;  2FBB A;  4II8 A;  3TXK A;  3F6Z A;  3K3T A;  4YEM A;  4ML7 A;  5KXT A;  5KXZ A;  1CKF A;  2HUB A;  5KXK A;  2DQE Y;  4H92 A;  1C46 A;  1GF6 A;  3B0K A;  4NWH A;  1YKX X;  3J4G A;  3CSQ A;  5LIN A;  1D0M A;  4H9I A;  4QGZ A;  1D6P A;  4AGA A;  1EL1 A;  3WL2 A;  4NGI A;  3TXD A;  1OUA A;  3LZT A;  1OP9 B;  4QY9 A;  3P66 A;  1LJF A;  2F4A A;  3A96 A;  3A91 A;  1EQ4 A;  1LYS A;  1HER A;  1JUG A;  1O23 A;  1LZA A;  1XEJ A;  1GE3 A;  1RI8 B;  4WLY A;  3AZ7 A;  3TMV A;  4G9S A;  3FI7 A;  5LAG A;  1JEF A;  1IC7 Y;  2Z18 A;  1LZN A;  1GEZ A;  4AXT A;  1B9O A;  1H6M A;  4H8X A;  2YBJ A;  1J1X Y;  3A95 A;  1Z55 A;  207L A;  1HHL A;  4L41 A;  5KXS A;  1DPX A;  1GF9 A;  1G7H C;  1ALC A;  1IY4 A;  1HMK A;  5KXL A;  2IFF Y;  2N5Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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