1XGUC

Structure for antibody hyhel-63 y33f mutant complexed with hen egg lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Magnitude of the hydrophobic effect at central versus peripheral sites in protein-protein interfaces
pubmed doi rcsb
molecule keywords antibody kappa light chain
molecule tags Immune system
source organism Mus musculus
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2004-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1xguC00
5IELA 1GB7A 1HERA 1GB2A 2MEAA 2EQLA 4CHXA 4DDCA 1HNLA 1JPOA 1UA6Y 1BB5A 3CT1A 1TAYA 1DI5A 4P2EA 3TXHA 1F6SA 4H9EA 3M3UA 1QTEA 4YF2A 1J1PY 1F0WA 3WVYA 1GFTA 1HEWA 1LHJA 1KXYA 4ANRA 1VDQA 4NSJA 1LYZA 2HUBA 1BB6A 1WVVA 1IWYA 1QDRA 4DWXA 2LYMA 2BAAA 4LYTA 1DKJA 4IATA 1QIOA 1HC0A 207LA 4GN3A 1VDPA 4RW1A 4MCKA 3W6FA 4RLNA 1LOZA 132LA 1PS5A 2GV0A 4LT0A 1UCOA 1F6RA 4AXTA 1FBIX 2ZQ3A 1W6ZA 1YQVY 2FBDA 4WM2A 5L3IA 1B7MA 1JUGA 1GF5A 3F6ZA 4NY5A 4XJFA 1GB9A 5L9JA 3ATOA 4OOTA 1GB5A 4NFVA 4KT3A 1LHIA 1BGIA 3EMSA 1VATA 4LT2A 4R6CA 1D6QA 4XJBA 2BLYA 5APDA 3W6CA 5APEA 3RNXA 5HNLA 1JISA 3E3DA 3EXDA 4B1AA 1YANA 3W6AA 4HPIA 4HTNA 4BAFA 1C10A 1OUEA 1YAPA 2A7FA 4H94A 3IJVA 1IP6A 4HV2A 3A92A 4PPOA 5LIOA 1B5WA 3N9CA 1C7PA 1BB7A 2BPUA 3TXDA 3A8ZA 1B5YA 4WM5A 3TXFA 1GF7A 1CNSA 2DQFC 4DT3A 1LKSA 1NKHA 4QEQA 4N1CC 1B7OA 4XADA 4DD7A 3CSZA 5KXSA 1UIAA 5B06A 1GF9A 3P68A 1GDWA 2G4PA 4WLXA 1AT6A 4NHIA 1LSBA 3AZ4A 3A90A 4EMNA 3LZ2A 5K7OA 2LYOA 3A93A 5M1YA 1G7MC 5IHGA 4O34A 1IP3A 2DQDY 2BLXA 3GXRA 4NEBA 1T3PA 1J1XY 1NMMA 2W1YA 2YBIA 5DN5A 5DN4A 4BAPA 4NHSA 3W3EA 1LZBA 1JTPL 1FN5A 1WVUA 1XGQC 4J1AA 3LN2A 4PHIA 4HJVA 4NIJA 4NSIA 1XGPC 3WVXA 1D9UA 1TCYA 5F9XA 1HEOA 1HF4A 2W1XA 4WMGA 1GE2A 3T36A 4XJIA 1IIZA 1YROA 3WXUA 1LJKA 1LZAA 1G7JC 1PZYA 2CWIA 3AB6A 1IX0A 1V7TA 4UWNA 5B07A 3ULRA 5KXTA 1LMAA 1ALCA 1LHLA 1T6VL 1DPXA 1GBXA 3WUAA 2H5ZA 2I6ZA 4GCFA 4LGKA 4NHQA 3A67Y 1LZGA 2D91A 3AGHA 3RW8A 4KXIA 1H6MA 1XEIA 1D6PA 4MR1A 1REZA 2C8OA 5KY1A 4WG7A 3CT5A 1LJ3A 1LTMA 5L3HA 3TXIA 4CJ2A 5FCPA 4GCEA 193LA 5HLLA 1REYA 1GAYA 1A2YC 2CJLA 1IC7Y 4HSFA 5APCA 2MEIA 4ET8A 5C6LA 1IOCA 1GFGA 1UIBA 1GBZA 3A96A 1QQYA 5LVKA 3ZVQA 1LSAA 2ZYPA 3AZ7A 1QTKA 1GXV2 1HFZA 2DQJY 1ZMYL 2N5ZA 2ZIJA 3RU5A 2HU1A 1OUJA 3LYMA 3ZEKA 5FELA 1IY4A 3WU8A 1NHEA 4WM3A 1ZVYB 4J1BA 1QDTA 4OWBA 1BVKC 1UUZC 1HFXA 4NGVA 3B0KA 3B6LA 5D5FA 1IWZA 3WW5A 1E8LA 4H9AA 3A3QA 1GF0A 1HEQA 4DD3A 1GFHA 1AM7A 4RLMA 1CJ8A 1LYOA 3P66A 3AW7A 4X3BA 3WMKA 2I25L 1B2KA 1KIQC 2Z38A 3WPJA 3FI7A 1GE1A 1B7RA 1OUCA 4L41A 3AJNA 4J0LA 2Q0MX 4PJ2C 5LA8A 4WLDA 4J7VA 1JITA 1UIHA 4GLVA 4IJ4A 4TSCA 4NGKA 1RI8B 3B0IA 1IWUA 1F10A 1TEWA 2HECA 4NGOA 1VAUA 2HU3A 1LZNA 1B7PA 2YBJA 1N4FA 1IP7A 1IP4A 1QUTA 1WQRA 2BQJA 8LYZA 1C45A 1GDXA 4PGJB 5AMYA 1BHZA 1VDSA 2MEDA 1GB8A 1GFVA 3A3RX 5KXPA 3N9EA 1IR8A 2BQLA 1LPIA 1B7NA 5IDDA 2HEBA 1LKRA 1LZ4A 2XBSA 2YBHA 4QDNA 4TX7A 1GB0A 4H8XA 6LYTA 4H92A 1LJHA 2Z18A 4G4BA 1BB3A 3CQLA 1EQ5A 1IR9A 2FBBA 1FKVA 3WU7A 5DLAA 5E9RA 1BWJA 1OUGA 4H9CA 1NDGC 1UBZA 3M18B 2BQKA 1BVXA 3RT5X 1CJ7A 3ATNA 4DDAA 2D4KA 1C46A 2YVBA 4LYMA 4LYCA 3WUMA 1UIGA 1JKBA 4NG8A 3WUNA 5A3EA 1SLYA 2IFFY 4H8YA 1JKCA 5HMVA 4YEMA 5KKIA 2AUBA 4H9HA 1GD6A 4FDYA 4H90A 4XJDA 1WQOA 3HFMY 1LZSA 4OWCA 1REXA 4H9BA 5KXYA 4CGEA 2BQEA 3VWOA 1CKCA 1BQLY 1HSXA 1UIEA 3TMUA 4Z3MA 1LMTA 1YKZX 2IHLA 1LSZA 1LJ4A 3D9AC 1P2CC 1KXXA 1OQMA 4GCBA 1NWGA 1XEKA 2DKVA 1YILA 1YIKA 2F2NA 1REMA 3OK0A 154LA 1LSYA 2F30A 4R0FA 2NWDX 1JHLA 4WM1A 3LHMA 1JJ3A 5KXOA 4ETCA 5KKJA 1GE3A 3W6EA 1LZDA 2FYCA 4E3UA 2XJWA 3IJUA 1DI4A 1XFPL 4UWUA 4YEOA 5D5CA 9LYZA 4DD9A 1IWVA 1D0KA 1QUSA 4MSTA 3CT0A 1IOTA 1GFKA 1LJFA 4WL7A 5FEKA 4ET9A 5KJ9A 3WW6A 1HEPA 2Z12A 4HV1A 1D0MA 1KIRC 1UICA 4M4OA 4XN6A 1JIYA 4DDBA 1GE0A 4H9IA 1DPWA 4I0CA 5B59A 1GB6A 3HBEX 3WXTA 1LSPA 4WM6A 4XENA 5LAGA 4BADA 3D3DA 4XYYA 2BQMA 1YKYX 1LZ6A 5ILCA 4A7DA 1IOQA 5KXXA 1LSGA 2YSSC 3P64A 4H91A 1NF5A 4XJHA 2BQOA 1JTTL 4GCCA 3G3BB 5FSTA 1HENA 3WYHA 3RZ4A 2D6BA 1LMPA 3WPLA 1DI3A 4HJZA 5LVJA 2LHMA 3B0OA 1BWIA 4GN4A 4H8ZA 5J7CA 1IR7A 2BQIA 4H93A 4TUNA 4QY9A 1B0DA 4Z46A 2HEDA 4ML7A 4KPMA 1WQPA 3P65A 4UWVA 2Y8PA 5HQ1A 4HTQA 153LA 4OWHA 3HBDA 4U3XB 4DC4A 4TSBA 3LYZA 2HEEA 4NSGA 5E4PA 1IC4Y 1A4VA 5I4XA 3A34A 5F9UA 134LA 1IY3A 1GB3A 2DBTA 4B4JA 4AGAA 2EKSC 5LVIA 5I4WA 4HP0A 1ZV5L 4LFXA 1GFUA 1YKXX 3HBHA 4N9RA 1LSMA 4ETAA 1RCMA 2HEAA 2XBRA 1CKDA 5FDJA 5I53A 4NGYA 4WO6A 1LSDA 3J4GA 5LAFA 5KXWA 1LAAA 2LZTA 1G7HC 1GF3A 3W6BA 2F4GA 2LZ2A 2DQAA 1LYSA 3BKVA 3P4ZA 4BS7A 5DL9A 3W6DA 2BQHA 1H87A 1WQNA 2C8PA 1VDTA 3QY4A 1UIFA 2YBLA 2PC2A 3WH1A 1LMCA 4LYZA 5KXZA 1B5VA 135LA 3AW6A 4WLTA 1NBYC 2ZQ4A 1GFAA 1OUBA 4G9SA 2ZNXY 1B7SA 4NG1A 5HMJA 3TXJA 4ZFPA 1XEJA 208LA 3CSRA 4NGLA 2VB1A 1GAZA 1HMLA 4NSHA 2G4QA 5T3FA 4B0DA 5LYMA 1TDYA 2CGIA 4H1PA 4WM4A 1OUIA 1DZBX 3WULA 2A7DA 4DD1A 2DQHY 4WL6A 5KXRA 1INUA 1AT5A 1EQEA 1LZ9A 2G4NA 4GCDA 4HJYA 3ZVQB 3QNGA 5APFA 5II3A 2DQGY 1FLYA 4YOPA 1ZVHL 2BQFA 2ZWBA 1LSFA 4GN5C 1JKAA 1W08A 5LVGA 1I20A 2H9KA 2BQNA 5F16A 1AKIA 2BQBA 4G49A 1WQMA 2BQGA 4RDSA 1FLUA 1GEZA 4G4HA 4NGZA 4B4EA 5LYTA 4HPEA 4DYGA 1V7SA 5KXNA 4LT3A 5JENB 4G4CA 1IWWA 2EIZC 1DXJA 1LZRA 1JEFA 2YDGA 4WOAA 2DQIY 5I54A 1SQ2L 4ETEA 1IP5A 2BQAA 3OJPA 5KXLA 3A6BY 3TXGA 4WLYA 1KIPC 5C6JA 1XSFA 1LMQA 4NGWA 5FHWA 4TTDA 1LJGA 133LA 1BWHA 1GBYA 1YL1X 1XGRC 2W1LA 1FLWA 2DQCY 1HHLA 1C08C 2W1MA 4PRQA 4RW2A 4OWEA 1CJ6A 4YENA 1UC0A 1HEMA 3AZ6A 3B72A 1RE2A 4IASA 2Z2EA 1HMKA 3WL2A 1G7LC 4N8ZA 4NWHA 3FE0A 1HELA 1GPQC 2I26L 5B1GA 2Z37A 2DQEY 1B5UA 1NQIA 2EPEA 4LZTA 2D4IA 2HTXA 1LHMA 3AGGG 1TBYA 1IWXA 1JJ0A 4LYOA 4M6DA 3SP3A 4Z98A 1EL1A 1GFRA 4LYBA 3TMWA 1XGTC 4OWAA 2FYDA 4WG1A 1FDLY 1FKQA 1J1OY 5LYZA 2B5ZA 2Z39A 1BB4A 1GHLA 1LJNA 1HSWA 3EO5A 1IOSA 4NGIA 4LT1A 2MEEA 2BQCA 5EBHA 2LYZA 1JKDA 1UACY 4NHPA 3IWRA 3LYOA 4W94A 5LXWA 1LZ5A 1GBOA 1GBSA 5C6IA 3WU9A 4OW1A 2BQDA 4Z41A 1GWDA 1B9OA 1MLCE 1DQJC 1G7IC 1XGUC 3AYQA 4EOFA 1AZFA 1GFJA 2MEGA 2X0AA 1IEEA 1LZ1A 1LZYA 2MEFA 5I4YA 5ILFA 1LJEA 2HEFA 4KL7A 1LZ8A 1LYYA 1B7LA 1MELL 3GXKA 4HTKA 1OUFA 2D4JA 4NWEA 3TXEA 5KXKA 1JSFA 3TMVA 1JTOL 1LSNA 2YBMA 1I1ZA 4B49A 5LINA 2H9JA 1LCNA 4D9ZA 4XJGA 4DD2A 1QSAA 1LHHA 4NGJA 1VEDA 3TXKA 3K3TA 1LJIA 1GBWA 4II8A 1GF6A 5F14A 1GE4A 2Z19A 3A95A 1IORA 3J6KA 1NBZC 1KXWA 4TWSA 6LYZA 3A6CY 1D0LA 5KXMA 194LA 1C43A 3LYTA 4YM8A 1JWRA 4CFOA 3EBAB 5LVHA 4LFPA 7LYZA 1GFEA 2MECA 1B5XA 1IO5A 1LSEA 1Z55A 5A3ZA 2Z2FA 1GF8A 4N5RA 4GLAA 3QE8A 3A91A 1IVMA 1YAOA 4C5FA 1GF4A 1WTMA 1WQQA 1UIDA 1JSEA 1YAQA 1B5ZA 2YBNA 5DM9A 1LJJA 4FJRA 4QGZA 3AGIA 1B7QA 3WPKA 2F4AA 4ZEEA 1CKGA 2ZIKA 5HNCA 2RSCA 1NDMC 1YAMA 2WARA 1IP1A 1LMNA 4C3WA 1LZTA 1QSWA 1HFYA 4WO9A 2ZYCA 3CSQA 1YL0X 1CKHA 1LSCA 1LZEA 1LHKA 1LZCA 4DD0A 3MGWA 1RJCB 3BKHA 3G3AB 1FLQA 4I8SA 3N9AA 4W96A 4ETDA 3AZ5A 3KAMA 5F81A 5LA5A 2MEHA 3CB7A 1JJ1A 1CJ9A 1O23A 2ZILA 1LMOA 3TXBA 2ZNWY 3TMXA 1OUAA 3T6UA 4CFPA 1GXXA 1VFBC 1GEVA 1I56A 4ZIXA 1DKKA 1EQ4A 1RFPA 2MEBA 4H9FA 1IP2A 1OUDA 1CKFA 1WTNA 4N1EI 4OOOA 5B1FA 2XTHA 2CDSA 1IWTA 3LZTA 4NHTA 1OUHA 4ETBA 4N0JA 4B4IA 5I5QA 5B05A 4PRUA 3A94A 1IC5Y 1OP9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IELA 241LA 120LA 222LA 187LA 1HNLA 1UA6Y 3WVYA 1KXYA 4ANRA 1BB6A 1WVVA 2LYMA 236LA 4MCKA 3W6FA 1LOZA 1L84A 1PS5A 1UCOA 4AXTA 186LA 1W6ZA 2FBDA 1B7MA 3F6ZA 5L9JA 4XJFA 1GB5A 4NFVA 1L40A 1LHIA 4LT2A 1L12A 5APEA 5I14A 3HDFA 4YXAC 1OUEA 1YAPA 4HV2A 4PPOA 3N9CA 1L00A 3TXFA 2DQFC 4OO9A 4QEQA 4N1CC 4DD7A 3FA0A 4I7SA 1GDWA 1AT6A 5M1YA 1D3FA 2DQDY 4NEBA 5DN5A 1LZBA 4J1AA 1L47A 3LN2A 3SBBC 4NIJA 1HEOA 1HF4A 4GRVA 4WMGA 3WXUA 3ULRA 1LHLA 1L17A 3WUAA 1GBXA 4W59A 4GCFA 4ARLA 1D9WA 3AGHA 1G1WA 3C7WA 4MR1A 156LA 1P36A 4WG7A 1LJ3A 1LTMA 2LZMA 4GCEA 1L81A 4HSFA 1GAYA 159LA 3GUNA 1L71A 2DQJY 2B6TA 3C81A 1L01A 2RBOA 1CV0A 231LA 1NHEA 3B0KA 1IWZA 157LA 1HEQA 3HT7A 4EKRA 1PQJA 1OUCA 1B7RA 1QUGA 1L99A 5LA8A 4J7VA 2NTGA 1CU2A 1UIHA 4TSCA 4NGKA 1RI8B 4I7KA 1F10A 4NGOA 1B7PA 1IP7A 1QT4A 1QUTA 1WQRA 2BQJA 1C45A 1GDXA 213LA 3A3RX 1LPIA 2HEBA 2HUMA 1LKRA 4QDNA 2XBSA 6LYTA 4H92A 1LJHA 4G4BA 1IR9A 2FBBA 3QAKA 3M18B 2BQKA 1L89A 1L26A 1UIGA 4NG8A 2AUBA 1LZSA 225LA 4H9BA 4Z3MA 262LA 3D9AC 4PJZA 1LI2A 1C6JA 1OQMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5IEL A;  1GB7 A;  1HER A;  1GB2 A;  2MEA A;  2EQL A;  4CHX A;  4DDC A;  1HNL A;  1JPO A;  1UA6 Y;  1BB5 A;  3CT1 A;  1TAY A;  1DI5 A;  4P2E A;  3TXH A;  1F6S A;  4H9E A;  3M3U A;  1QTE A;  4YF2 A;  1J1P Y;  1F0W A;  3WVY A;  1GFT A;  1HEW A;  1LHJ A;  1KXY A;  4ANR A;  1VDQ A;  4NSJ A;  1LYZ A;  2HUB A;  1BB6 A;  1WVV A;  1IWY A;  1QDR A;  4DWX A;  2LYM A;  2BAA A;  4LYT A;  1DKJ A;  4IAT A;  1QIO A;  1HC0 A;  207L A;  4GN3 A;  1VDP A;  4RW1 A;  4MCK A;  3W6F A;  4RLN A;  1LOZ A;  132L A;  1PS5 A;  2GV0 A;  4LT0 A;  1UCO A;  1F6R A;  4AXT A;  1FBI X;  2ZQ3 A;  1W6Z A;  1YQV Y;  2FBD A;  4WM2 A;  5L3I A;  1B7M A;  1JUG A;  1GF5 A;  3F6Z A;  4NY5 A;  4XJF A;  1GB9 A;  5L9J A;  3ATO A;  4OOT A;  1GB5 A;  4NFV A;  4KT3 A;  1LHI A;  1BGI A;  3EMS A;  1VAT A;  4LT2 A;  4R6C A;  1D6Q A;  4XJB A;  2BLY A;  5APD A;  3W6C A;  5APE A;  3RNX A;  5HNL A;  1JIS A;  3E3D A;  3EXD A;  4B1A A;  1YAN A;  3W6A A;  4HPI A;  4HTN A;  4BAF A;  1C10 A;  1OUE A;  1YAP A;  2A7F A;  4H94 A;  3IJV A;  1IP6 A;  4HV2 A; 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 4DD2 A;  1QSA A;  1LHH A;  4NGJ A;  1VED A;  3TXK A;  3K3T A;  1LJI A;  1GBW A;  4II8 A;  1GF6 A;  5F14 A;  1GE4 A;  2Z19 A;  3A95 A;  1IOR A;  3J6K A;  1NBZ C;  1KXW A;  4TWS A;  6LYZ A;  3A6C Y;  1D0L A;  5KXM A;  194L A;  1C43 A;  3LYT A;  4YM8 A;  1JWR A;  4CFO A;  3EBA B;  5LVH A;  4LFP A;  7LYZ A;  1GFE A;  2MEC A;  1B5X A;  1IO5 A;  1LSE A;  1Z55 A;  5A3Z A;  2Z2F A;  1GF8 A;  4N5R A;  4GLA A;  3QE8 A;  3A91 A;  1IVM A;  1YAO A;  4C5F A;  1GF4 A;  1WTM A;  1WQQ A;  1UID A;  1JSE A;  1YAQ A;  1B5Z A;  2YBN A;  5DM9 A;  1LJJ A;  4FJR A;  4QGZ A;  3AGI A;  1B7Q A;  3WPK A;  2F4A A;  4ZEE A;  1CKG A;  2ZIK A;  5HNC A;  2RSC A;  1NDM C;  1YAM A;  2WAR A;  1IP1 A;  1LMN A;  4C3W A;  1LZT A;  1QSW A;  1HFY A;  4WO9 A;  2ZYC A;  3CSQ A;  1YL0 X;  1CKH A;  1LSC A;  1LZE A;  1LHK A;  1LZC A;  4DD0 A;  3MGW A;  1RJC B;  3BKH A;  3G3A B;  1FLQ A;  4I8S A;  3N9A A;  4W96 A;  4ETD A;  3AZ5 A;  3KAM A;  5F81 A;  5LA5 A;  2MEH A;  3CB7 A;  1JJ1 A;  1CJ9 A;  1O23 A;  2ZIL A;  1LMO A;  3TXB A;  2ZNW Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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