1E8LA

Nmr solution structure of hen lysozyme
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A refined solution structure of hen lysozyme determined using residual dipolar coupling data.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
molecule keywords LYSOZYME
total genus 24
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1e8lA00
4UWUA 3AB6A 1OUEA 3LYOA 1NDGC 3ULRA 3A92A 2BQMA 5EBHA 1FLUA 1B7NA 1B2KA 1F0WA 1GDWA 5KXPA 3T6UA 4HTKA 3TXIA 1GAYA 2B5ZA 5FEKA 2DQIY 2NWDX 2DQCY 1G7LC 1G7JC 1GFVA 5LYZA 5I4YA 1IP3A 1IP2A 1VAUA 1CJ6A 4NHPA 4BAFA 5C6LA 1G7MC 1DPWA 4H8ZA 4XADA 2IHLA 4Z46A 1XEJA 4DD9A 3QNGA 1YKXX 4WM6A 4XJDA 1DKJA 5C6JA 5LA5A 2FYCA 5I53A 4TUNA 1LMCA 135LA 1HHLA 1VEDA 5IELA 2HEDA 4G4CA 4XJBA 4J0LA 2C8PA 1TCYA 4I0CA 3W6DA 4WLDA 1LZ1A 1LMTA 4NHTA 1GB5A 3W3EA 4DDCA 3P65A 3A93A 2ZNXY 4H9FA 1NBYC 4L41A 1I1ZA 4HSFA 4NSHA 5KXMA 5F16A 1N4FA 1HNLA 2MEFA 1FLQA 1C10A 1MLCE 4P2EA 4LT3A 4WG1A 1OUCA 3K3TA 1HMLA 4GN4A 4XN6A 3TMWA 1KIPC 2BLYA 5KY1A 1GFKA 1GF5A 1GPQC 7LYZA 4ETCA 1GFRA 4NGIA 5A3EA 3J4GA 134LA 2XBRA 2YSSC 1QUTA 1CKGA 3WXUA 3WVYA 1QQYA 1GF3A 2LYZA 1TEWA 3N9CA 1QDTA 1LZ8A 5LVKA 2I26L 3A95A 3CQLA 1GD6A 3WULA 1ZV5L 2BQIA 1J1OY 1GF7A 2A7DA 1LTMA 1LSYA 2D4JA 1PZYA 1AZFA 2HUBA 3P68A 4H9AA 1LSFA 5E4PA 1CKFA 1NQIA 3AZ7A 1IR8A 4TTDA 2EPEA 2G4PA 1B7RA 1B7LA 1REMA 1WTNA 3MGWA 4U3XB 2H5ZA 4DD2A 3WMKA 5KXKA 1EQ5A 1LJEA 4H9CA 4NG8A 3A3QA 1GAZA 2YBLA 1IY3A 4NHQA 3WPLA 1TBYA 3TMVA 2DQFC 1REXA 2ZILA 1BQLY 4HJYA 4YEOA 5DN4A 1GF8A 1NBZC 4H9EA 1KIRC 1AT5A 1LZ5A 4ETDA 4TX7A 3W6EA 5KXOA 1GEVA 3AJNA 2DQAA 2ZQ4A 4CJ2A 3E3DA 2Z2EA 2G4NA 2FYDA 1JSEA 5DN5A 1JISA 3CT5A 1IWXA 1CKDA 5LAFA 1IOSA 1QIOA 3TMUA 1FBIX 1DQJC 3T36A 4AGAA 4N1CC 5KXZA 1VDPA 5APDA 1PS5A 4RW1A 4LT1A 4OWAA 1QTKA 1UIDA 133LA 1AM7A 5K7OA 3LYTA 1NF5A 1IWVA 4O34A 3W6FA 4YM8A 4HJVA 4WM5A 4H92A 1DKKA 4WM4A 4II8A 5D5FA 3LN2A 1WQOA 1JJ3A 4BAPA 1BWHA 5D5CA 3D9AC 2C8OA 1LMQA 1KXXA 1YIKA 2AUBA 1OP9B 2YDGA 1D0MA 1ZMYL 1GB6A 1JSFA 4PHIA 3G3AB 4RLNA 1GEZA 2LZ2A 5APCA 4G9SA 4H9HA 1JKBA 1BB5A 3TXJA 3BKVA 1A2YC 3HBDA 1JKDA 2DKVA 2MEHA 4NGWA 3WH1A 1HEWA 3TXDA 4DD1A 2Q0MX 4QDNA 4CHXA 1GBOA 1OUDA 1XFPL 4B4JA 2Z38A 1XGPC 3AZ4A 4GCBA 5M1YA 1AT6A 3W6AA 5F9XA 2F4AA 4LYMA 1UACY 4R6CA 4RW2A 4WLXA 4N5RA 5B1GA 4H9BA 1MELL 1B7MA 1UIBA 2D6BA 1VDSA 3A8ZA 2HECA 5II3A 1HELA 3RW8A 1WQMA 5DLAA 1IP1A 3EO5A 4XYYA 1LZRA 3VWOA 1HC0A 1BWJA 1F6RA 1GBYA 3A6CY 4W94A 1GBXA 5LXWA 4J7VA 4LT0A 1WQRA 1IEEA 4OWHA 4WL6A 2Y8PA 3AGIA 1GFTA 4G4BA 3ZVQA 4BS7A 3M3UA 1LZEA 4IASA 1GDXA 4KXIA 2DQHY 4PGJB 1W6ZA 3LYMA 3HBHA 1Z55A 4N1EI 1T6VL 2XJWA 4NGLA 5LVJA 2BQBA 2HU3A 3AYQA 1IC5Y 3WW5A 5HLLA 3RNXA 3ATOA 2BPUA 1BB4A 1GFUA 1LMOA 3KAMA 3P4ZA 1WVUA 1GBZA 2YBJA 1GBSA 4LYOA 1RJCB 5L3IA 1UC0A 3IWRA 5L9JA 5FELA 1LZGA 1UBZA 3B0OA 1GE3A 1YILA 1EL1A 2HEBA 153LA 1JHLA 4WOAA 1IWZA 1WQPA 1INUA 5I4WA 2D4IA 2XBSA 4LYZA 4B49A 2DQDY 2YBHA 1CKCA 4TWSA 2BQEA 4XENA 1REZA 4WO6A 4PJ2C 3IJUA 3AZ5A 4WLTA 5AMYA 3SP3A 4NSGA 3FE0A 2RSCA 5KKIA 2W1XA 5KXNA 4HV2A 4PRUA 1FKVA 3A6BY 1LSCA 4J1BA 5APEA 4TSCA 1IC4Y 2HEFA 1CJ9A 4QGZA 1J1PY 1YANA 4IJ4A 5FCPA 5LINA 1C7PA 4B1AA 2X0AA 3WPKA 1LCNA 5LVIA 1ZVYB 5B05A 1B5YA 4Z3MA 5B59A 1B5VA 5ILFA 1YL0X 1JJ1A 2CDSA 3A96A 4ML7A 5B1FA 4EOFA 1E8LA 208LA 1GFGA 1BB3A 4NGKA 1IIZA 1I20A 4IATA 1XEIA 2BQHA 4N8ZA 1NHEA 3EXDA 2DBTA 3RZ4A 1A4VA 4GN5C 4EMNA 1YQVY 5KXXA 1P2CC 2FBDA 4ZFPA 2ZYPA 1GB3A 1IWUA 1IO5A 3GXKA 154LA 4H90A 1FKQA 1GB0A 4NG1A 4ANRA 5HMVA 1BB7A 1LYSA 1IR7A 1UA6Y 1JEFA 4N0JA 1LMNA 1SLYA 5F14A 4MR1A 5I4XA 1JJ0A 1JPOA 2WARA 1LPIA 4XJGA 1WVVA 2HEEA 1ZVHL 4NGVA 4LGKA 1LZBA 2BQGA 3HFMY 1OUJA 2IFFY 3CT1A 1LSBA 5LVGA 1DXJA 4DD0A 1GE2A 1BGIA 2MEAA 1B5WA 3WU9A 4ET9A 2CJLA 2Z39A 3A67Y 3ZVQB 2CWIA 1LSAA 1REYA 1IWYA 1NMMA 4OWBA 4G4HA 1IVMA 3OJPA 3WUMA 5A3ZA 4N9RA 4AXTA 3AGGG 3HBEX 3P64A 9LYZA 1IR9A 1JTOL 1QTEA 1F6SA 5IHGA 2DQJY 1LJGA 4XJIA 1LZAA 1GE0A 4A7DA 5LAGA 3WW6A 1LSEA 5FDJA 2LZTA 4B4EA 2BQLA 1LZSA 2I25L 4GN3A 4WM1A 1QSAA 1XGTC 3AW7A 5DL9A 1ALCA 1J1XY 1WTMA 5LYTA 1FN5A 1AKIA 4HPIA 5APFA 1LJ3A 3WL2A 1GBWA 194LA 3AGHA 3WVXA 1C43A 1LZCA 2MEEA 1LJKA 1LYYA 1CNSA 4GLAA 4GLVA 4WO9A 4NSIA 3WU7A 4BADA 1OUFA 4LFPA 2D4KA 2DQEY 2W1YA 1BVXA 1LYZA 1D6QA 2DQGY 4UWVA 3G3BB 3TXKA 1FLYA 1NWGA 1LKRA 4HTQA 1D0KA 2CGIA 1LZ6A 5HNLA 5KXYA 3WYHA 4LZTA 1GF9A 4B0DA 4CFOA 1YAOA 4WLYA 3RU5A 3B72A 3TXEA 1DI5A 2Z37A 1C45A 1JKAA 1KXWA 4DD3A 3ZEKA 5KJ9A 2HEAA 1YL1X 5JENB 2BQJA 4WM2A 4YEMA 5FSTA 1D6PA 4X3BA 1IY4A 1LJNA 4LFXA 1OUGA 2F30A 3ATNA 4R0FA 2MECA 1V7TA 1LSPA 3RT5X 5LYMA 1DZBX 3N9AA 4C5FA 2MEBA 1GF4A 2BQNA 4NGJA 4H8XA 2D91A 4DDBA 1JUGA 3D3DA 1GXV2 1LZTA 1H6MA 3FI7A 4PRQA 4HP0A 4NFVA 4QY9A 1HFZA 2W1MA 2LYOA 4RDSA 1B5ZA 1JWRA 1GXXA 1GB9A 1VFBC 1YKZX 4CGEA 1LHHA 1LHKA 1GHLA 1B7PA 3CSZA 4WM3A 1LJ4A 1B5XA 2BQCA 3CT0A 1C08C 4YENA 1NKHA 3TXHA 4HTNA 5HMJA 4YOPA 1IP4A 1C46A 2Z19A 4KL7A 5C6IA 1BWIA 1B7QA 4FJRA 2ZWBA 4MSTA 4OWCA 4ET8A 2HU1A 1TAYA 1B5UA 1JIYA 3WU8A 2BQDA 4DT3A 2BQAA 1IWTA 1GF6A 2ZYCA 1BB6A 1LSDA 4KT3A 1XSFA 1LSNA 2HTXA 193LA 4UWNA 1BVKC 8LYZA 6LYZA 2Z2FA 4C3WA 2BLXA 1UIHA 5KXRA 1LKSA 2LYMA 4J1AA 1VATA 1UIAA 2PC2A 1LJIA 1GFAA 4GCEA 4YF2A 4CFPA 2F2NA 2ZQ3A 3LZTA 4NEBA 4WL7A 5E9RA 5L3HA 1G7IC 4ETAA 1LZNA 1KXYA 3B0KA 3N9EA 3A3RX 4LYCA 4NIJA 3TXFA 1NDMC 1HSXA 5DM9A 1LJFA 3P66A 1KIQC 2G4QA 3A91A 1JTPL 4NGOA 1FLWA 3W6BA 1UIEA 4G49A 5KXTA 3B0IA 3IJVA 5HQ1A 1GB7A 1LYOA 1OQMA 3CSQA 4M4OA 1IOQA 2H9KA 1VDQA 5I5QA 4Z98A 1T3PA 1QDRA 4M6DA 2YVBA 3WPJA 2ZIKA 4NGYA 1CJ7A 1HEOA 1EQEA 5LVHA 3EMSA 1LAAA 5HNCA 4HJZA 4NGZA 1YKYX 1HFYA 1SQ2L 3W6CA 1GE4A 4XJFA 4NSJA 1UIFA 1HSWA 5ILCA 4HV1A 1IOTA 4XJHA 4B4IA 3TXBA 4DDAA 4E3UA 1DI3A 1HEMA 1W08A 1XGQC 2BQFA 1OUAA 1YAPA 2W1LA 3J6KA 3OK0A 4LYBA 4QEQA 1UUZC 4TSBA 1UICA 5J7CA 1XGUC 1RCMA 2YBMA 1QUSA 3TMXA 1YAMA 1GB8A 1VDTA 1F10A 2MEGA 3LZ2A 4GCCA 5B06A 5KKJA 4H9IA 2LHMA 1RE2A 3B6LA 3LYZA 1HEQA 1OUHA 3AZ6A 1GFEA 1GB2A 4NHSA 1V7SA 1WQQA 1HENA 1LHLA 1EQ4A 4OOTA 4DD7A 5KXLA 4WMGA 1LMPA 2MEDA 1YAQA 3EBAB 5KXWA 4I8SA 1IP6A 2N5ZA 4NY5A 1HMKA 207LA 1CJ8A 4H93A 4ZEEA 3A34A 1GWDA 1D9UA 2GV0A 4FDYA 2YBNA 3QY4A 1QSWA 1LZ4A 4NWEA 3CSRA 4HPEA 1OUBA 4MCKA 1B7SA 1H87A 1UCOA 1XGRC 5LIOA 3A94A 2ZNWY 1HERA 2F4GA 4GCDA 4DYGA 3F6ZA 4H91A 1GE1A 4Z41A 1LSMA 1LJHA 4DC4A 4LYTA 3QE8A 4NWHA 1IP7A 3WXTA 1IWWA 2MEIA 3M18B 2BQKA 1B9OA 4OWEA 1B0DA 4OW1A 1IORA 5F81A 1GFHA 1DI4A 5FHWA 1DPXA 1B7OA 6LYTA 2BQOA 1G7HC 4DWXA 2EQLA 4H8YA 1IOCA 4H1PA 1LJJA 4H94A 2XTHA 1LHJA 3LHMA 4PPOA 4D9ZA 1LMAA 1IX0A 5T3FA 4LT2A 1LOZA 1TDYA 1JKCA 2Z12A 1LHMA 2H9JA 4W96A 1LSGA 4ETBA 1JTTL 1BHZA 2Z18A 2YBIA 2BAAA 2I6ZA 3TXGA 3GXRA 4GCFA 1LZYA 1HEPA 1OUIA 5KXSA 1GFJA 3WUNA 3BKHA 3CB7A 2FBBA 2EIZC 4ZIXA 1LHIA 132LA 1LZ9A 4RLMA 4NHIA 1UIGA 4KPMA 3AW6A 1CKHA 4OOOA 1WQNA 1IC7Y 1YROA 1LSZA 1IP5A 1XEKA 5B07A 2VB1A 1HFXA 2ZIJA 1D0LA 2A7FA 4ETEA 1FDLY 1RI8B 3WUAA 5I54A 1RFPA 1O23A 5LA8A 1GF0A 4WG7A 1I56A 5IDDA 5F9UA 1JITA 1HF4A 1LZDA 2EKSC 3A90A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6LA 4UWUA 3AB6A 5EBHA 1KW7A 2DQCY 1GFVA 3GUPA 1CJ6A 5C6LA 1L77A 4H8ZA 4XADA 176LA 4W56A 4TUNA 135LA 5IELA 1L26A 2O4WA 1LMTA 3W3EA 3P65A 3A93A 2ZNXY 4H9FA 5F16A 1HNLA 2MEFA 1C10A 1L11A 2OTZX 1L88A 1PQMA 4EKSA 4ETCA 134LA 1GF3A 2LYZA 3A95A 3WULA 1J1OY 1C6KA 1QS9A 1LYFA 1L87A 2EPEA 3C82A 256LA 1B7RA 174LA 141LA 1LJEA 4I7LA 2NTGA 1GAZA 1IY3A 3DMZA 1TBYA 3TMVA 1REXA 2ZILA 4HJYA 113LA 1LYHA 2Z2EA 5DN5A 1CV5A 233LA 3CT5A 177LA 231LA 1L76A 1CKDA 2B6XA 1IOSA 3TMUA 1DQJC 247LA 230LA 4N1CC 4DKLA 4OWAA 1QTKA 1QT8A 1UIDA 3CDTA 2RBRA 3LYTA 3W6FA 1IWVA 4WM5A 4H92A 4WM4A 4II8A 3LN2A 1WQOA 1C62A 1JJ3A 1LMQA 2AUBA 185LA 1D0MA 3G3AB 5APCA 1DYBA 252LA 1JKBA 1L44A 166LA 1HEWA 4CHXA 1GBOA 1OV7A 1XFPL 4GCBA 1AT6A 1L38A 5F9XA 2F4AA 1UACY 3D4SA 4N5RA 1D3NA 5B1GA 4H9BA 1MELL 1B7MA 3HWLA 1LLHA 5II3A 1HELA 1WQMA 1HC0A 1L80A 1BWJA 131LA 1GBXA 4LT0A 4OWHA 2Y8PA 1L58A 3ZVQA 1GDXA 120LA 2DQHY 1L70A 4LDLA 4PGJB 3HBHA 1Z55A 4N1EI 165LA 3AYQA 3RNXA 2BPUA 2RBQA 1C6HA 1UC0A 5L9JA 3B0OA 3OE9A 1L31A 1C6CA 1WQPA 4LYZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UWU A;  3AB6 A;  1OUE A;  3LYO A;  1NDG C;  3ULR A;  3A92 A;  2BQM A;  5EBH A;  1FLU A;  1B7N A;  1B2K A;  1F0W A;  1GDW A;  5KXP A;  3T6U A;  4HTK A;  3TXI A;  1GAY A;  2B5Z A;  5FEK A;  2DQI Y;  2NWD X;  2DQC Y;  1G7L C;  1G7J C;  1GFV A;  5LYZ A;  5I4Y A;  1IP3 A;  1IP2 A;  1VAU A;  1CJ6 A;  4NHP A;  4BAF A;  5C6L A;  1G7M C;  1DPW A;  4H8Z A;  4XAD A;  2IHL A;  4Z46 A;  1XEJ A;  4DD9 A;  3QNG A;  1YKX X;  4WM6 A;  4XJD A;  1DKJ A;  5C6J A;  5LA5 A;  2FYC A;  5I53 A;  4TUN A;  1LMC A;  135L A;  1HHL A;  1VED A;  5IEL A;  2HED A;  4G4C A;  4XJB A;  4J0L A;  2C8P A;  1TCY A;  4I0C A;  3W6D A;  4WLD A;  1LZ1 A;  1LMT A;  4NHT A;  1GB5 A;  3W3E A;  4DDC A;  3P65 A;  3A93 A;  2ZNX Y;  4H9F A;  1NBY C;  4L41 A;  1I1Z A;  4HSF A;  4NSH A;  5KXM A;  5F16 A;  1N4F A;  1HNL A;  2MEF A;  1FLQ A;  1C10 A;  1MLC E;  4P2E A;  4LT3 A;  4WG1 A;  1OUC A;  3K3T A;  1HML A;  4GN4 A;  4XN6 A;  3TMW A;  1KIP C;  2BLY A;  5KY1 A;  1GFK A;  1GF5 A;  1GPQ C;  7LYZ A;  4ETC A;  1GFR A;  4NGI A;  5A3E A;  3J4G A; 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 1IP6 A;  2N5Z A;  4NY5 A;  1HMK A;  207L A;  1CJ8 A;  4H93 A;  4ZEE A;  3A34 A;  1GWD A;  1D9U A;  2GV0 A;  4FDY A;  2YBN A;  3QY4 A;  1QSW A;  1LZ4 A;  4NWE A;  3CSR A;  4HPE A;  1OUB A;  4MCK A;  1B7S A;  1H87 A;  1UCO A;  1XGR C;  5LIO A;  3A94 A;  2ZNW Y;  1HER A;  2F4G A;  4GCD A;  4DYG A;  3F6Z A;  4H91 A;  1GE1 A;  4Z41 A;  1LSM A;  1LJH A;  4DC4 A;  4LYT A;  3QE8 A;  4NWH A;  1IP7 A;  3WXT A;  1IWW A;  2MEI A;  3M18 B;  2BQK A;  1B9O A;  4OWE A;  1B0D A;  4OW1 A;  1IOR A;  5F81 A;  1GFH A;  1DI4 A;  5FHW A;  1DPX A;  1B7O A;  6LYT A;  2BQO A;  1G7H C;  4DWX A;  2EQL A;  4H8Y A;  1IOC A;  4H1P A;  1LJJ A;  4H94 A;  2XTH A;  1LHJ A;  3LHM A;  4PPO A;  4D9Z A;  1LMA A;  1IX0 A;  5T3F A;  4LT2 A;  1LOZ A;  1TDY A;  1JKC A;  2Z12 A;  1LHM A;  2H9J A;  4W96 A;  1LSG A;  4ETB A;  1JTT L;  1BHZ A;  2Z18 A;  2YBI A;  2BAA A;  2I6Z A;  3TXG A;  3GXR A;  4GCF A;  1LZY A;  1HEP A;  1OUI A;  5KXS A;  1GFJ A;  3WUN A;  3BKH A;  3CB7 A;  2FBB A;  2EIZ C;  4ZIX A;  1LHI A;  132L A;  1LZ9 A;  4RLM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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