1LHIA

Role of proline residues in human lysozyme stability: a scanning calorimetric study combined with x-ray structure analysis of proline mutants
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTGGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
publication title Role of proline residues in human lysozyme stability: a scanning calorimetric study combined with X-ray structure analysis of proline mutants.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lhiA00
1B7QA 4W96A 2HEDA 2MECA 4NGKA 1ZVYB 5LVIA 1IR8A 1VEDA 2IFFY 1PZYA 3AZ4A 2DQEY 3TXDA 1IOTA 4KPMA 3WVXA 1ALCA 1FLYA 1LZYA 1UC0A 1F6RA 4UWUA 1HF4A 2MEHA 1DXJA 2LHMA 1IOQA 1LSZA 1VDPA 1GF8A 1IVMA 4BADA 2IHLA 5B59A 2VB1A 5KXYA 1GFJA 1Z55A 4XYYA 2BQKA 4KT3A 4LYZA 2EIZC 4NWEA 1A4VA 3B6LA 4WG7A 1CJ6A 133LA 5T3FA 4NG8A 3WUMA 5IELA 5L3IA 4J1BA 1ZVHL 1BVXA 4KXIA 4NGOA 1HMKA 4H93A 4NGZA 4TTDA 2DQIY 3TXJA 1YQVY 1VDSA 1GBXA 3MGWA 4WM2A 4NGYA 4OOTA 4XADA 4DWXA 1LPIA 1B7PA 1LZNA 3EXDA 4LT2A 1IP2A 3WPLA 4DT3A 5LVJA 2ZQ3A 5DLAA 4H1PA 4ETDA 1LZ4A 1B7RA 1HEMA 3LYZA 2X0AA 3A6BY 1HFZA 4NGLA 4TUNA 2F2NA 1AT6A 3ATOA 1HEQA 5C6LA 1BVKC 5B07A 1RI8B 1OUBA 2D4IA 3TMVA 1GE1A 2A7DA 4Z3MA 4DD0A 5KXNA 3WXUA 5A3ZA 3WYHA 1LKSA 1EQEA 1YL0X 3A92A 1GB8A 1A2YC 2G4NA 5D5FA 4DD7A 2BQEA 1GB9A 2XJWA 4YENA 1ZV5L 3TXKA 1CKCA 1REXA 4H8ZA 4LYTA 3OK0A 1REYA 1IR7A 1JTOL 1GPQC 1JTTL 3M3UA 4NHIA 2EPEA 1FLWA 1TBYA 2DBTA 2ZIKA 1V7TA 1C10A 1IWVA 2DQGY 5KXLA 1B5WA 1LZ8A 1E8LA 1UIGA 4M4OA 1QSAA 1JITA 5F9UA 1IY4A 3AB6A 3IJUA 4IASA 1WTNA 3AGIA 1GB7A 4HSFA 3TXEA 4ZIXA 2YBIA 1W6ZA 5M1YA 1NWGA 5C6JA 2BQAA 1JKCA 5DN4A 4B4JA 1BHZA 3B72A 4OWEA 4PJ2C 4WL7A 1IX0A 4B49A 1B5ZA 4N8ZA 3WU8A 4HP0A 1GAYA 4GN3A 4XJGA 5LXWA 1QDTA 1YILA 4FDYA 4U3XB 1BQLY 2XBRA 1UBZA 4MR1A 1B7SA 1JSEA 4YEMA 2HUBA 1RFPA 1QTKA 4ET9A 1YIKA 4DC4A 1C43A 1QUSA 3J4GA 4LT3A 1B7MA 1WQNA 3WPKA 1WVVA 1IOSA 5KY1A 2D6BA 5B1FA 2D4KA 1WQPA 1GDXA 3AZ6A 4NSHA 7LYZA 4HTKA 2LYOA 1HFXA 2C8PA 4GCDA 3AZ7A 2BAAA 6LYZA 5JENB 194LA 1IWYA 2W1LA 2H5ZA 4YOPA 1IWWA 1XGPC 4DD2A 3LYMA 1JHLA 1GFUA 5ILCA 1YKXX 3TXHA 1HNLA 1NQIA 2BQDA 1CNSA 1HMLA 1RE2A 3LZ2A 2DQCY 3TXBA 5I5QA 2LYMA 1LZBA 4WLDA 1SLYA 3N9EA 1UIAA 4RW2A 4LZTA 4G4BA 1LSCA 3AYQA 4GN4A 4H91A 1XEJA 3ATNA 1NKHA 1IC5Y 2WARA 3EMSA 1LJIA 3HBHA 3VWOA 6LYTA 1FLQA 1IWUA 5DM9A 1JWRA 1OUIA 4I0CA 2YSSC 2HU1A 1IC7Y 3EO5A 1JKDA 1LHLA 2XBSA 3T6UA 3WULA 2ZQ4A 4LT0A 2G4QA 1GF5A 3CT0A 4NY5A 153LA 4B1AA 1HENA 3AZ5A 4CFPA 5LIOA 1HSXA 1GE2A 1OUHA 4NHTA 5LYZA 5APFA 4RW1A 3ZVQA 1B5XA 1LSMA 1LSNA 4GCFA 1OUAA 1GXXA 4H9BA 5LA8A 4FJRA 4XN6A 1IIZA 1YL1X 1KXXA 1FDLY 4WM6A 3A8ZA 1D0KA 1LAAA 2AUBA 1D6QA 1DPXA 1XGRC 4ANRA 4AXTA 1HERA 3E3DA 4Z41A 4HV1A 4ZFPA 5A3EA 1GBYA 1GHLA 3P65A 4HPEA 4TWSA 1LMTA 4RLMA 4GCEA 1LMCA 2ZIJA 4H8YA 4N5RA 5IDDA 4B0DA 4QY9A 1B7OA 1LHMA 3W6EA 4ETBA 4NGJA 2HTXA 4GCCA 1AKIA 3CT1A 1GF3A 1LHJA 1HHLA 2F30A 4WLTA 1UICA 3A67Y 4LFXA 3W6AA 2BLYA 2BQCA 1LZSA 1GFHA 2HEFA 1BWIA 4RLNA 1IR9A 3CT5A 2YBMA 1MLCE 1LYSA 2MEBA 1GB0A 1GBSA 4WO6A 4DDAA 5K7OA 4HPIA 4CHXA 2Z39A 1QUTA 5KXKA 1EQ5A 1XEIA 2BQJA 4GLAA 1XSFA 2Q0MX 4OWHA 1GB2A 2YDGA 1YAPA 1UUZC 4G9SA 2HEEA 2LZ2A 1GFRA 4BAPA 4XJIA 3OJPA 1LTMA 3A95A 1LZCA 1YANA 4CJ2A 4NSJA 135LA 5LVKA 1BWHA 4HJZA 4N1EI 1IEEA 2I6ZA 4WL6A 4NHPA 4NGVA 2BQIA 4E3UA 1LSPA 3P68A 1DI5A 1YAMA 3N9CA 1LZGA 3WVYA 1CKFA 2FYDA 1AZFA 1JISA 1NDMC 2CDSA 3LYTA 4PRUA 3ULRA 5FELA 3WXTA 1N4FA 2D91A 1D9UA 5D5CA 1LJGA 1LSEA 1V7SA 4LGKA 2BQOA 1DI4A 3D3DA 5AMYA 1IO5A 1JJ1A 3D9AC 1XGQC 4TX7A 5KXSA 1NF5A 5KXOA 2Z18A 5LA5A 2HEBA 5I4XA 5I4WA 2FBBA 1IWZA 3TMXA 1ZMYL 3A90A 4C3WA 1JSFA 4UWVA 3J6KA 3ZVQB 3CQLA 5FCPA 1OUGA 1PS5A 1GAZA 1HSWA 2H9KA 3LN2A 4HJVA 4NHSA 3B0KA 2BQHA 3BKHA 2G4PA 1YAQA 4YEOA 3SP3A 5LVGA 1NHEA 4ZEEA 4G4CA 5HNLA 5IHGA 4LYOA 1DQJC 1G7MC 1UIDA 4NHQA 1LJEA 1LZEA 4W94A 3W6FA 1GB5A 1GBOA 3A94A 1UIHA 1RCMA 3LZTA 9LYZA 2BQGA 1H6MA 4AGAA 5DN5A 4LYBA 3A3RX 1B5YA 1WTMA 1LMNA 2C8OA 4ML7A 208LA 5C6IA 3CSQA 2DQDY 2YBNA 1LZ5A 1LZ9A 3CB7A 1CJ7A 1KIPC 1GF4A 1VAUA 2N5ZA 3A3QA 1IP3A 1D0MA 4TSCA 5LAFA 5I53A 2GV0A 4BS7A 1LSGA 1UACY 1LZRA 4H9HA 1O23A 1B9OA 1G7HC 1LZTA 2CJLA 4HTQA 5KXTA 1KXWA 3P66A 5LYMA 2EKSC 4J1AA 2MEDA 4ET8A 2XTHA 3QY4A 5KJ9A 1LZ1A 1GB3A 1DI3A 4L41A 5EBHA 4NGIA 1C08C 3TMUA 1LJ3A 4EMNA 1HFYA 1XEKA 1KIQC 4XJFA 3A6CY 4G49A 1JKBA 1DPWA 4WM1A 134LA 1LMQA 5I54A 1B0DA 1NBZC 4R0FA 4A7DA 3W6DA 1LJKA 1H87A 2Z38A 1OUFA 3K3TA 4X3BA 4XJHA 4NEBA 4DDBA 5LVHA 1BB6A 2Z12A 3T36A 1IWXA 1UCOA 4R6CA 1FKVA 2YBJA 1LYOA 4EOFA 2LZTA 3AW7A 1C45A 1TDYA 4WOAA 2CWIA 1LJ4A 3WPJA 1OQMA 1LCNA 3RU5A 5LAGA 1I20A 3G3BB 1VATA 1GF9A 1HEWA 1OUDA 3GXKA 1AM7A 4GN5C 1BGIA 1FBIX 4NFVA 4G4HA 1HEPA 1LHHA 1F0WA 4QDNA 1GDWA 4NSIA 3WW5A 4H90A 5LINA 1WQRA 1B7LA 3WU7A 1QQYA 1LSBA 3WU9A 2F4AA 2YBLA 1IP5A 2RSCA 2Z19A 1CKDA 3A96A 3ZEKA 3WUNA 2BQLA 1BB3A 3M18B 3N9AA 4DD9A 5FDJA 4XJDA 4WLXA 1TEWA 4OWCA 1LJNA 3P64A 1LJFA 3P4ZA 5L9JA 1CJ9A 3G3AB 5B1GA 3HFMY 3BKVA 2DQJY 4I8SA 4WMGA 4M6DA 1KXYA 5KXWA 4RDSA 1QTEA 1J1XY 1LJHA 5L3HA 1LSFA 1GBWA 1CKHA 1EL1A 1UIFA 3RZ4A 3AGGG 2BQFA 4DD3A 1HELA 1RJCB 2DQHY 3AW6A 3LHMA 2W1XA 4NWHA 5HLLA 1GEVA 1OUCA 1LKRA 4QEQA 4N1CC 3W6CA 5FSTA 1LOZA 1UA6Y 1WQQA 5I4YA 4WO9A 4LFPA 1SQ2L 1LSYA 4WM5A 1JTPL 3WMKA 5F16A 1LYYA 1GWDA 2W1MA 3QE8A 1NBYC 1IC4Y 1IP7A 1F6SA 2Z37A 4WLYA 3B0OA 1GE0A 4H9FA 4DD1A 5J7CA 3RW8A 4DDCA 154LA 1IY3A 1EQ4A 1INUA 4WG1A 5KXZA 1HEOA 4P2EA 5F14A 2BQNA 1JPOA 3GXRA 1GXV2 3HBDA 4WM3A 2HECA 1GD6A 1GFKA 4LT1A 5HQ1A 1LSAA 3HBEX 4MSTA 5FEKA 4H8XA 3A91A 4OOOA 207LA 1UIEA 4TSBA 1D0LA 1IP4A 4BAFA 4H9AA 1J1OY 4XJBA 1QIOA 4GLVA 1LHIA 1NMMA 1XGUC 5APEA 1GE3A 2DQFC 4H9IA 2EQLA 4OWAA 5E9RA 2HEAA 2ZILA 2FYCA 3F6ZA 3WH1A 1WQMA 4CGEA 1G7JC 1JUGA 4J0LA 5B05A 1FN5A 4XENA 3RT5X 1JIYA 1HC0A 1GFVA 4DYGA 1JJ0A 5F81A 1B5VA 2Z2FA 1TCYA 4H92A 4H94A 1REMA 1P2CC 5ILFA 4QGZA 1LYZA 3AJNA 4GCBA 4Z46A 3WUAA 2D4JA 3FE0A 4KL7A 1NDGC 5FHWA 5APDA 4ETEA 1LMOA 3AGHA 1VDQA 2NWDX 3WW6A 1IWTA 1OP9B 5B06A 4LYMA 4YF2A 3A93A 4NG1A 4J7VA 1XGTC 1BB4A 1F10A 2ZNWY 1CKGA 2B5ZA 1YKZX 1OUEA 2PC2A 4HJYA 4IATA 4B4EA 1DKKA 1B7NA 4PGJB 1J1PY 2MEEA 2DQAA 1YAOA 5KXMA 2YBHA 4H9CA 1LZAA 3B0IA 1GE4A 1GFEA 4NSGA 1GBZA 2ZWBA 1KIRC 5F9XA 2ZNXY 1CJ8A 1T6VL 1VDTA 1IP6A 1W08A 4WM4A 1GF6A 3FI7A 4D9ZA 2A7FA 1BB7A 2ZYCA 5II3A 4N0JA 1QDRA 2HU3A 4OW1A 3RNXA 1FLUA 1REZA 1YROA 5KXRA 1LJJA 1AT5A 4YM8A 5KKIA 1IOCA 1GB6A 2LYZA 4PPOA 1I1ZA 2MEGA 3CSRA 5HMJA 5KKJA 4B4IA 4O34A 1LMAA 1WQOA 4MCKA 193LA 3W3EA 1JEFA 4HTNA 4CFOA 3TXFA 3LYOA 4II8A 2MEFA 4NIJA 1GFGA 2W1YA 1B2KA 2MEAA 3TXIA 4H9EA 4OWBA 1BB5A 2F4GA 3TXGA 1DKJA 1OUJA 1D6PA 1GF7A 2Z2EA 4ETCA 4ETAA 3A34A 1B5UA 1XFPL 3KAMA 5DL9A 3WL2A 8LYZA 1T3PA 1TAYA 2BPUA 4HV2A 4IJ4A 1GFTA 5HNCA 1G7LC 1LZ6A 2I26L 3CSZA 1YKYX 5LYTA 3TMWA 2DKVA 3IWRA 1GEZA 1C7PA 1MELL 2FBDA 5KXXA 1C46A 2CGIA 3W6BA 1UIBA 1JKAA 1FKQA 4N9RA 4LYCA 132LA 2H9JA 3EBAB 2I25L 1LHKA 1LMPA 4Z98A 2BQBA 2BLXA 5E4PA 2MEIA 3QNGA 4C5FA 1IORA 1G7IC 1IP1A 1DZBX 4NGWA 2YVBA 1I56A 1VFBC 1QSWA 2Y8PA 1GF0A 4PRQA 1WVUA 2BQMA 2ZYPA 1LSDA 1BWJA 4PHIA 1GFAA 5APCA 3IJVA 5KXPA 4UWNA 5HMVA 1LZDA 1JJ3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HEDA 1L06A 2DQEY 3NYAA 1IOTA 1UC0A 3C81A 4UWUA 1C66A 1IVMA 4BADA 2IHLA 1L90A 4LDOA 3WUMA 234LA 4ZIXA 1ZVHL 1BVXA 3TXJA 1G1WA 109LA 1LPIA 1KW7A 5DLAA 4ETDA 1HFZA 1CV1A 2F2NA 5C6LA 1G06A 199LA 5B07A 2Q9DA 3TMVA 5KXNA 1LKSA 3A92A 2B6ZA 1ZV5L 1L77A 1REXA 4LYTA 1IR7A 4K5YA 1FLWA 1TBYA 2ZIKA 4ARJA 1V7TA 5KXLA 3D4SA 1C64A 5F9UA 3IJUA 146LA 2YBIA 1NWGA 1L62A 137LA 5DN4A 3B72A 5KKJA 4B49A 1L95A 1QDTA 2B74A 2B6XA 1BQLY 1JSEA 4YEMA 2OE4X 160LA 1YIKA 1QUSA 3J4GA 1WQNA 5B1FA 4I7MA 1DYFA 2LYOA 5JENB 6LYZA 3AZ7A 4ARPA 3F9LA 1LWKA 4YOPA 1IWWA 3QAKA 1L58A 1RE2A 3TXBA 6LZMA 5I5QA 2LYMA 1CU6A 1C61A 4G4BA 1QUDA 1L31A 4H91A 1LYGA 3HH5A 1NKHA 2WARA 3EMSA 3HBHA 6LYTA 1T6HA 130LA 1JWRA 3WULA 2G4QA 4B1AA 4CFPA 1C6BA 1OUHA 4NHTA 2RBRA 110LA 5APFA 1LGXA 1L56A 1LSNA 1L0JA 1P37A 5LA8A 1YL1X 1CV5A 111LA 1D3MA 1QTHA 3CDQA 4HV1A 5A3EA 1GBYA 4RLMA 123LA 4GCEA 4H8YA 4ETBA 1C6KA 2HTXA 1HHLA 1T8FA 3A67Y 4LFXA 1ZWNA 1SWZA 1JQUA 1LZSA 1GFHA 7LZMA 3CT5A 4DDAA 2YBMA 1MLCE 5K7OA 5KXRA 1GBSA 5KXKA 2BQJA 4OWHA 1KY0A 1XSFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B7Q A;  4W96 A;  2HED A;  2MEC A;  4NGK A;  1ZVY B;  5LVI A;  1IR8 A;  1VED A;  2IFF Y;  1PZY A;  3AZ4 A;  2DQE Y;  3TXD A;  1IOT A;  4KPM A;  3WVX A;  1ALC A;  1FLY A;  1LZY A;  1UC0 A;  1F6R A;  4UWU A;  1HF4 A;  2MEH A;  1DXJ A;  2LHM A;  1IOQ A;  1LSZ A;  1VDP A;  1GF8 A;  1IVM A;  4BAD A;  2IHL A;  5B59 A;  2VB1 A;  5KXY A;  1GFJ A;  1Z55 A;  4XYY A;  2BQK A;  4KT3 A;  4LYZ A;  2EIZ C;  4NWE A;  1A4V A;  3B6L A;  4WG7 A;  1CJ6 A;  133L A;  5T3F A;  4NG8 A;  3WUM A;  5IEL A;  5L3I A;  4J1B A;  1ZVH L;  1BVX A;  4KXI A;  4NGO A;  1HMK A;  4H93 A;  4NGZ A;  4TTD A;  2DQI Y;  3TXJ A;  1YQV Y;  1VDS A;  1GBX A;  3MGW A;  4WM2 A;  4NGY A;  4OOT A;  4XAD A;  4DWX A;  1LPI A;  1B7P A;  1LZN A;  3EXD A;  4LT2 A;  1IP2 A;  3WPL A;  4DT3 A;  5LVJ A;  2ZQ3 A;  5DLA A;  4H1P A;  4ETD A;  1LZ4 A;  1B7R A;  1HEM A;  3LYZ A;  2X0A A;  3A6B Y;  1HFZ A;  4NGL A;  4TUN A;  2F2N A;  1AT6 A;  3ATO A;  1HEQ A;  5C6L A;  1BVK C;  5B07 A;  1RI8 B;  1OUB A;  2D4I A;  3TMV A;  1GE1 A;  2A7D A;  4Z3M A;  4DD0 A; 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 4NSG A;  1GBZ A;  2ZWB A;  1KIR C;  5F9X A;  2ZNX Y;  1CJ8 A;  1T6V L;  1VDT A;  1IP6 A;  1W08 A;  4WM4 A;  1GF6 A;  3FI7 A;  4D9Z A;  2A7F A;  1BB7 A;  2ZYC A;  5II3 A;  4N0J A;  1QDR A;  2HU3 A;  4OW1 A;  3RNX A;  1FLU A;  1REZ A;  1YRO A;  5KXR A;  1LJJ A;  1AT5 A;  4YM8 A;  5KKI A;  1IOC A;  1GB6 A;  2LYZ A;  4PPO A;  1I1Z A;  2MEG A;  3CSR A;  5HMJ A;  5KKJ A;  4B4I A;  4O34 A;  1LMA A;  1WQO A;  4MCK A;  193L A;  3W3E A;  1JEF A;  4HTN A;  4CFO A;  3TXF A;  3LYO A;  4II8 A;  2MEF A;  4NIJ A;  1GFG A;  2W1Y A;  1B2K A;  2MEA A;  3TXI A;  4H9E A;  4OWB A;  1BB5 A;  2F4G A;  3TXG A;  1DKJ A;  1OUJ A;  1D6P A;  1GF7 A;  2Z2E A;  4ETC A;  4ETA A;  3A34 A;  1B5U A;  1XFP L;  3KAM A;  5DL9 A;  3WL2 A;  8LYZ A;  1T3P A;  1TAY A;  2BPU A;  4HV2 A;  4IJ4 A;  1GFT A;  5HNC A;  1G7L C;  1LZ6 A;  2I26 L;  3CSZ A;  1YKY X;  5LYT A;  3TMW A;  2DKV A;  3IWR A;  1GEZ A;  1C7P A;  1MEL L;  2FBD A;  5KXX A;  1C46 A;  2CGI A;  3W6B A;  1UIB A;  1JKA A;  1FKQ A;  4N9R A;  4LYC A;  132L A;  2H9J A;  3EBA B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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