1LSZA

Crystal structure of the mutant d52s hen egg white lysozyme with an oligosaccharide product
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTSYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the mutant D52S hen egg white lysozyme with an oligosaccharide product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Gallus gallus
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lszA00
2X0AA 4TSCA 3W6AA 4AGAA 1LMNA 2ZIKA 5M1YA 2FBBA 4HTKA 1B7PA 3A93A 1GFTA 4Z98A 4DYGA 3WW6A 135LA 4MSTA 5APFA 4CJ2A 194LA 1O23A 1REMA 1LZSA 2A7DA 2DQAA 5B1GA 1C7PA 1NBYC 4NGKA 1GAYA 2A7FA 1EL1A 4NSJA 4UWUA 1EQEA 4NSGA 5ILFA 4CFPA 3TXBA 7LYZA 4H8ZA 1IO5A 4NHIA 1LSPA 4XJDA 2BQGA 5FELA 1KXXA 4RW1A 1YL1X 4XJHA 5LVHA 4WLTA 4GCFA 4YOPA 5FEKA 2H9KA 5F9XA 5E4PA 1BHZA 5FHWA 4PJ2C 3FI7A 4J1BA 3GXRA 2BQFA 1GF9A 1GFGA 2HEDA 2Q0MX 2VB1A 3LZ2A 4H8YA 1XGQC 4MR1A 3N9CA 4HTNA 4NWEA 3WXTA 1LKSA 1BB7A 1GF8A 1NWGA 1SLYA 5I4XA 1F6SA 3LHMA 1UA6Y 2ZNXY 1IWXA 1JEFA 4Z41A 3B72A 1DI3A 1B7NA 1LSDA 1G7HC 1I56A 2IFFY 5LYTA 1LSCA 1XSFA 4ET8A 2C8PA 5KXKA 1KXWA 4WM1A 5E9RA 2DQCY 2F2NA 5KKJA 1HFZA 4PPOA 2DQFC 1HELA 4R6CA 3B0KA 5KXMA 2F4AA 4H94A 3ZEKA 4CFOA 2Z37A 1G7LC 1LMPA 5LVKA 4GN5C 1XGUC 1RI8B 1YILA 2YBIA 4DDAA 5KKIA 4G4HA 5C6LA 2ZNWY 3QE8A 1JIYA 4L41A 2N5ZA 1G7IC 1GFHA 5LAFA 3W6DA 1LSMA 1LZ5A 1WTMA 5A3ZA 2BQMA 1FLUA 1B2KA 4M4OA 4N9RA 1A2YC 1DPWA 2MECA 2Z2FA 4NHQA 1LZNA 3WYHA 3RZ4A 1LSGA 3A92A 3RW8A 1LSFA 1D0MA 1BB6A 1TBYA 3BKHA 1B5YA 1GBZA 3AZ5A 3LYZA 1LZGA 1I1ZA 1UIDA 3AGGG 3LYMA 3WU8A 1YKYX 4XADA 1LJ3A 4EOFA 2HTXA 3G3AB 2I25L 5KXSA 3A6BY 2MEEA 4N1EI 1JJ3A 2YBMA 1INUA 4FJRA 1BQLY 1LAAA 2MEBA 4H93A 1OUFA 3IJUA 4II8A 2HEFA 4OOOA 1LHIA 1GDXA 3AJNA 1BB4A 1GF0A 5B1FA 5KY1A 4DDBA 1LSYA 2B5ZA 4ETEA 4UWNA 2BQJA 1OUJA 4NHPA 4RLMA 4X3BA 2BQOA 3WPLA 4NSHA 1LTMA 1IWWA 4TWSA 4NG8A 2BQLA 1Z55A 1KIQC 1AM7A 1EQ4A 4H9FA 5HMVA 1IVMA 1LJGA 2YBJA 1B7MA 1NF5A 2HEBA 1HEMA 1LYYA 4RW2A 2MEIA 1GEZA 2YBHA 4Z46A 1LZAA 2D4KA 1LZ6A 1LHHA 134LA 3WW5A 1UIFA 1J1PY 3G3BB 3OK0A 1NDMC 1YKZX 4KL7A 4LYBA 3T36A 2D6BA 1F0WA 2DQHY 1HFYA 4C5FA 2HECA 4YEOA 1LHMA 2HEAA 1F6RA 1LJ4A 4GN4A 4WLYA 1NHEA 1JTPL 1GWDA 2BLYA 3K3TA 3P64A 1QUTA 1TEWA 2CDSA 1LZ9A 1GF6A 4PHIA 5F81A 1IR9A 1DPXA 3T6UA 1QQYA 3MGWA 1FLQA 1V7TA 2F30A 4OWHA 2NWDX 3A95A 3IWRA 1GB5A 1HEWA 4U3XB 1IORA 1D0LA 3TXJA 1D9UA 4E3UA 3WUMA 4DT3A 1TAYA 1G7JC 1IOCA 1IWTA 1YAOA 1WQMA 4H8XA 4NWHA 4NGVA 4EMNA 2LYZA 3FE0A 4BS7A 2Z38A 1AT6A 1GHLA 193LA 2RSCA 4J7VA 3QY4A 1QSAA 5B07A 1GF5A 1LSZA 1QSWA 4WMGA 1JKCA 4B4JA 1OUIA 154LA 1VAUA 1CKGA 1MELL 5DM9A 1BB3A 3WMKA 1IR8A 3CSRA 1REYA 2HU1A 1GB6A 4W96A 1LYOA 4G4CA 5KXTA 4LT0A 4OWEA 4DWXA 2CJLA 5JENB 1GFEA 2Z12A 4DC4A 3WH1A 1AZFA 2EIZC 3LN2A 1JJ0A 1UC0A 208LA 3ATOA 2C8OA 4HV1A 5F16A 1RCMA 2BLXA 4NHTA 4HJYA 2W1XA 4H9BA 1HEOA 1AT5A 2BQKA 3BKVA 4XJBA 2XJWA 2BQBA 1PZYA 207LA 3EXDA 1FKVA 2DQDY 4LYZA 4WO9A 1WTNA 4J0LA 1J1OY 4H90A 4N5RA 3WPKA 1WQOA 1CNSA 1OUAA 5J7CA 1EQ5A 4IATA 1GE0A 1GFUA 4NIJA 4WG1A 2GV0A 2BQAA 1VDQA 1JKBA 2ZYCA 3CQLA 1KIPC 1ZV5L 4XYYA 2I6ZA 3D9AC 4AXTA 1GBWA 1HF4A 2H5ZA 1WQQA 2MEDA 4H92A 1GF3A 1QTEA 4N8ZA 4NSIA 1QUSA 1IWVA 1NQIA 2DQJY 1REXA 3HFMY 1B7RA 1GE4A 1XFPL 1YIKA 2BQEA 1LSBA 2I26L 5FCPA 1JISA 4NY5A 4RLNA 4DD0A 4G9SA 4ZFPA 1GB7A 4ETBA 5KXNA 5KXOA 2D91A 1LMCA 3A34A 1W6ZA 4XN6A 5D5CA 4WM6A 2HU3A 5LVGA 1LZ4A 1REZA 1OUDA 3B6LA 1GXXA 2MEFA 1HC0A 4DD1A 4WL7A 5I4YA 1GBXA 3AZ4A 2BQHA 3RU5A 1AKIA 1DKJA 1XGRC 1C46A 1OQMA 4HPIA 5KJ9A 1D6QA 5LVJA 1T6VL 4N0JA 4OOTA 5LA5A 4C3WA 2Z18A 2LYOA 3ZVQA 1KXYA 3W3EA 1GB9A 4QEQA 4DDCA 1HNLA 1LHKA 1H87A 1C45A 4NGZA 2DKVA 4WL6A 1VATA 2LHMA 4J1AA 4UWVA 3P65A 1HSXA 3LZTA 1GB2A 4Z3MA 1T3PA 5IELA 1IIZA 2HEEA 1IOSA 1B5WA 1BVXA 1V7SA 4XJGA 1LSNA 4NGYA 5EBHA 1IP1A 1IP7A 1LZTA 1OUCA 2CWIA 4KT3A 1GEVA 5AMYA 1HHLA 4PGJB 3EO5A 4R0FA 4XJIA 1GE3A 1GFVA 1IY3A 1GPQC 3W6BA 4LT3A 2WARA 5LYMA 1LYSA 2G4PA 4WG7A 1FKQA 2YDGA 1IOTA 2YSSC 1LMOA 3WPJA 3WUAA 3WVXA 4ZIXA 3OJPA 1WVVA 1YROA 2BPUA 4H1PA 4LFPA 1D0KA 4WM2A 3TMUA 1IP3A 1LPIA 1YKXX 2BAAA 3A67Y 3CT5A 3ZVQB 2ZQ4A 1G7MC 1HEQA 1B7SA 1LZDA 4TUNA 5KXZA 5IHGA 4B49A 1FLYA 3M18B 1QDRA 1NDGC 5DN5A 1ZMYL 3A6CY 4HTQA 4ML7A 1GB3A 1GBYA 1LJJA 1YANA 2BQIA 2DQGY 4HV2A 4ETCA 5KXYA 5KXLA 1GFRA 3WULA 2W1MA 3RNXA 3P68A 1JHLA 3E3DA 2MEGA 1CKHA 2HUBA 4WLXA 1GBSA 5B05A 3HBHA 2AUBA 153LA 2LYMA 5F14A 5ILCA 1D6PA 1LKRA 1NKHA 3AYQA 4NGIA 4LT2A 3TXIA 4NG1A 1GE2A 1HSWA 1SQ2L 1YQVY 2G4QA 4LYTA 4DD2A 1RE2A 3TXEA 1B5XA 1LSAA 4ET9A 4HPEA 4B1AA 1DKKA 5DN4A 4DD9A 2FBDA 1VDSA 5I53A 1IP6A 1P2CC 2IHLA 6LYTA 1B5VA 3P4ZA 4H91A 1GDWA 2Z19A 2W1YA 4KXIA 4LT1A 1XGTC 3A90A 4I8SA 5I5QA 1B9OA 4H9HA 4IASA 3TMWA 3WU9A 4LZTA 1W08A 3TXFA 1IR7A 4HJVA 1IOQA 3B0IA 1JWRA 2BQDA 4OWBA 1XGPC 1UIGA 4B4IA 3A3RX 1UBZA 3A8ZA 4NEBA 3WXUA 2Z2EA 4ETDA 4LYOA 5I4WA 1OP9B 1LZ8A 5KXWA 3QNGA 5DLAA 1YAMA 1IEEA 4XJFA 3CSZA 5LA8A 1GBOA 2LZ2A 1J1XY 3WUNA 3IJVA 3LYTA 2ZWBA 1LHJA 6LYZA 2G4NA 2PC2A 3J4GA 5C6IA 4ETAA 1FBIX 1LSEA 2YBLA 4H9AA 4NGOA 5I54A 1UIHA 1DXJA 4NFVA 3GXKA 3W6FA 3HBEX 1JSFA 3P66A 1JTOL 2DQEY 1VDPA 1HENA 4WO6A 1CJ7A 1UIEA 3CSQA 4QGZA 5C6JA 1HMLA 4BAPA 1NBZC 5T3FA 1A4VA 1GF7A 1ZVHL 1WQPA 1GFKA 4N1CC 1BWIA 1UUZC 1GB8A 1OUEA 1XEKA 1IWUA 3AGIA 3EBAB 4GCCA 1B7LA 4NGJA 1H6MA 1GAZA 4GCBA 4W94A 5FSTA 4H9EA 5KXRA 4B0DA 1MLCE 4GCEA 4G4BA 4CHXA 4QY9A 1UICA 3M3UA 1C10A 1TCYA 4BAFA 1QDTA 4DD3A 2DBTA 2FYCA 5D5FA 1C08C 4YM8A 1PS5A 3A94A 5APCA 2XBRA 4HP0A 1FDLY 5KXXA 1BB5A 1IY4A 3RT5X 1JKAA 2EKSC 2F4GA 1WVUA 1BWJA 4ZEEA 3AW6A 3CT1A 2ZYPA 3D3DA 1LZRA 1LJIA 2Z39A 5L9JA 5DL9A 1JPOA 1LJNA 3TMXA 1HERA 4TSBA 3ULRA 5LXWA 2D4JA 4WM3A 4QDNA 2FYDA 3AB6A 1RFPA 1LMTA 3J6KA 1LHLA 1B5ZA 3SP3A 4OWAA 1LMQA 2ZIJA 1GF4A 2XTHA 4H9IA 1N4FA 1FLWA 1LOZA 4MCKA 3EMSA 1IP2A 3TXGA 4TTDA 1LYZA 1QIOA 1YAQA 5L3HA 5HQ1A 1IWZA 2D4IA 2CGIA 1UIAA 2YBNA 5B59A 2YVBA 4LGKA 4OW1A 1LZEA 4OWCA 1HEPA 1XEIA 1DI4A 4NGLA 4P2EA 3KAMA 4PRQA 3VWOA 1HFXA 1BWHA 4GCDA 4YENA 5LINA 4GLAA 1BGIA 1RJCB 4WM5A 1ALCA 4B4EA 4D9ZA 1JKDA 4XENA 8LYZA 1LJEA 3AZ6A 4NGWA 1ZVYB 4LYCA 1CJ6A 4LYMA 2BQNA 3WL2A 4LFXA 3N9AA 1LZBA 1GB0A 2ZQ3A 5FDJA 1JSEA 5HNCA 3W6EA 4HSFA 1C43A 132LA 133LA 1IWYA 1IP5A 5HNLA 1QTKA 2EQLA 3A96A 1B5UA 1OUHA 5APDA 3F6ZA 5IDDA 1F10A 1B7QA 1I20A 1WQRA 1IC7Y 9LYZA 1HMKA 5LYZA 1VFBC 2EPEA 1GXV2 4I0CA 4BADA 1E8LA 3TXKA 2XBSA 3AW7A 4DD7A 5F9UA 2W1LA 4YF2A 1JTTL 3WVYA 4TX7A 3B0OA 1TDYA 5HMJA 4HJZA 1B7OA 4ANRA 1CKDA 1GD6A 5LVIA 4NHSA 1LJFA 3WU7A 3CB7A 1CKCA 4GLVA 1LZCA 3N9EA 1DZBX 5KXPA 1LJKA 5HLLA 1CKFA 1LZ1A 1GFJA 1IP4A 4M6DA 3TXDA 5LIOA 1XEJA 1GE1A 2DQIY 1NMMA 5B06A 1GFAA 3CT0A 1IX0A 1LJHA 1YAPA 3ATNA 2MEHA 1LCNA 1VDTA 1LZYA 1WQNA 2BQCA 4GN3A 5II3A 3TMVA 1JUGA 3TXHA 4PRUA 4KPMA 1OUBA 1UIBA 5L3IA 5A3EA 4A7DA 1LMAA 1BVKC 1IC4Y 1UCOA 1IC5Y 4O34A 1FN5A 2Y8PA 4H9CA 1JJ1A 1JITA 1DI5A 1UACY 3A91A 1CJ8A 1B0DA 4FDYA 5K7OA 1YL0X 4WOAA 5APEA 3A3QA 1KIRC 4IJ4A 4YEMA 5LAGA 2H9JA 1CJ9A 3W6CA 4RDSA 4WM4A 1VEDA 1DQJC 4CGEA 1OUGA 2LZTA 2MEAA 4G49A 2ZILA 3AGHA 4WLDA 3AZ7A 3HBDA 3LYOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2X0AA 1LMNA 2ZIKA 5M1YA 4Z98A 3A93A 1GFTA 4MSTA 5APFA 4CJ2A 5B1GA 1C7PA 1NBYC 1C68A 1QSQA 1GAYA 1KW7A 1EQEA 155LA 7LYZA 174LA 3CDVA 1IO5A 1L96A 5LVHA 4WLTA 5FEKA 2H9KA 5E4PA 1L59A 4PJ2C 218LA 4J1BA 3GXRA 3GUJA 2BQFA 2VB1A 1GFGA 4ARPA 1L56A 1NWGA 1F6SA 1UA6Y 1JEFA 1IWXA 4DQ5A 4Z41A 142LA 1G1WA 1C6PA 2IFFY 4YXCA 191LA 4WM1A 5E9RA 4PPOA 3B0KA 4H94A 2Z37A 1LMPA 163LA 1YILA 4G4HA 3QE8A 1G7IC 1OVKA 5LAFA 3OE8A 1LSMA 1LZ5A 5A3ZA 3RZ4A 3A92A 3RW8A 3DMXA 2QB0B 3AZ5A 1CU5A 1I1ZA 1UIDA 1SSYA 2I25L 4N1EI 1JJ3A 4FJRA 4OOOA 1BB4A 1GF0A 5B1FA 178LA 2BQJA 4NSHA 1KIQC 1AM7A 2NTGA 4H9FA 5HMVA 1IVMA 1B7MA 1HEMA 1L73A 189LA 2D4KA 1LZ6A 4ARQA 134LA 3WW5A 131LA 3WL2A 1YKZX 3T36A 2D6BA 4C5FA 4YEOA 2HEAA 1LJ4A 1L89A 1NHEA 1GWDA 1QUTA 1TEWA 1L81A 1L28A 3MGWA 2F30A 3C8RA 2NWDX 4E3UA 223LA 1TAYA 3C82A 4NWHA 4ARQB 143LA 4NGVA 216LA 3FE0A 4BS7A 2Z38A 1GHLA 4J7VA 3HU9A 4WMGA 154LA 1L00A 1BB3A 1D3MA 222LA 1LYOA 4OWEA 1SX7A 2Z12A 199LA 102LA 1L20A 4DC4A 3WH1A 3LN2A 1UC0A 1QS5A 1L06A 3ATOA 4I7TA 4NHTA 2W1XA 1AT5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2X0A A;  4TSC A;  3W6A A;  4AGA A;  1LMN A;  2ZIK A;  5M1Y A;  2FBB A;  4HTK A;  1B7P A;  3A93 A;  1GFT A;  4Z98 A;  4DYG A;  3WW6 A;  135L A;  4MST A;  5APF A;  4CJ2 A;  194L A;  1O23 A;  1REM A;  1LZS A;  2A7D A;  2DQA A;  5B1G A;  1C7P A;  1NBY C;  4NGK A;  1GAY A;  2A7F A;  1EL1 A;  4NSJ A;  4UWU A;  1EQE A;  4NSG A;  5ILF A;  4CFP A;  3TXB A;  7LYZ A;  4H8Z A;  1IO5 A;  4NHI A;  1LSP A;  4XJD A;  2BQG A;  5FEL A;  1KXX A;  4RW1 A;  1YL1 X;  4XJH A;  5LVH A;  4WLT A;  4GCF A;  4YOP A;  5FEK A;  2H9K A;  5F9X A;  5E4P A;  1BHZ A;  5FHW A;  4PJ2 C;  3FI7 A;  4J1B A;  3GXR A;  2BQF A;  1GF9 A;  1GFG A;  2HED A;  2Q0M X;  2VB1 A;  3LZ2 A;  4H8Y A;  1XGQ C;  4MR1 A;  3N9C A;  4HTN A;  4NWE A;  3WXT A;  1LKS A;  1BB7 A;  1GF8 A;  1NWG A;  1SLY A;  5I4X A;  1F6S A;  3LHM A;  1UA6 Y;  2ZNX Y;  1IWX A;  1JEF A;  4Z41 A;  3B72 A;  1DI3 A;  1B7N A;  1LSD A;  1G7H C;  1I56 A;  2IFF Y;  5LYT A;  1LSC A;  1XSF A;  4ET8 A;  2C8P A;  5KXK A;  1KXW A;  4WM1 A;  5E9R A;  2DQC Y;  2F2N A;  5KKJ A;  1HFZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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