1LSZA

Crystal structure of the mutant d52s hen egg white lysozyme with an oligosaccharide product
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTSYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
publication title Crystal structure of the mutant D52S hen egg white lysozyme with an oligosaccharide product.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lszA00
4ETDA 1IOCA 4H92A 3WMKA 4R6CA 4Z98A 5LAGA 5B1FA 4H8ZA 3A6BY 1LSDA 4W94A 4NGOA 1UACY 4NHQA 3TXIA 1LYYA 5LA5A 3E3DA 2I6ZA 4H9BA 1LSAA 1OUIA 5APEA 5FHWA 1YAMA 2ZILA 1CKGA 3WUNA 4G4CA 4NY5A 1WVUA 3WW5A 1C08C 1V7SA 5I5QA 5LVHA 1LJHA 4KL7A 1G7IC 1CKDA 1EQEA 1FDLY 2HTXA 3A90A 1IWVA 1LOZA 5D5CA 2BLYA 4FJRA 5L9JA 1QDRA 4HPEA 5KJ9A 1GAZA 1YILA 1B0DA 1GB3A 193LA 1NDMC 2DBTA 1LSCA 1REZA 1LSZA 2Q0MX 5KXKA 1IVMA 1LKRA 1LMCA 1OUEA 1YQVY 5DLAA 1GE4A 1W6ZA 4HPIA 4U3XB 4ETBA 3GXKA 5B59A 2MEEA 1C7PA 1G7JC 1GFTA 4XJDA 1IR7A 3W6EA 1GBOA 1LYOA 2LHMA 2YSSC 1H87A 2MEGA 1GHLA 1GF0A 2H5ZA 3AZ7A 3LHMA 2VB1A 4H93A 1IWZA 2BLXA 5APCA 3TXJA 1YKYX 1I1ZA 1LMQA 4XJFA 3WU7A 2NWDX 3IWRA 4NSGA 2BQKA 5KXZA 2MEAA 4NFVA 1GE1A 1CNSA 3EBAB 1HELA 3WPLA 2HEEA 1HNLA 4CJ2A 2C8PA 5DM9A 4NGZA 5LA8A 1OUCA 1SQ2L 4XENA 1IX0A 3A96A 1JUGA 3ULRA 1XGUC 5C6IA 1BB4A 1PS5A 1SLYA 5E9RA 4NGJA 2GV0A 1BB3A 1IWXA 3ATNA 4GLVA 1OUFA 5HMJA 1GAYA 2F4GA 2PC2A 3IJUA 3WUMA 5F9XA 2YBIA 1BWJA 3CSZA 4N9RA 4PHIA 1IP2A 5B05A 4WM5A 1UCOA 5L3HA 3A91A 3TXEA 1LZ6A 1NMMA 1OUBA 3CT0A 1LSPA 1A2YC 3TMXA 1YL0X 4GCEA 4DDAA 1EQ5A 1GE2A 1LJNA 5F81A 2EPEA 3LYZA 1LHMA 3W6AA 1A4VA 1LTMA 2BPUA 3AZ6A 4I0CA 1LSMA 132LA 3P68A 1GDWA 4NGLA 4M6DA 5IDDA 1UIGA 1HERA 1O23A 1B7PA 1ZVHL 1YAOA 1LSFA 1QUTA 3A6CY 1GF6A 1G7HC 4X3BA 1LJ3A 3TXHA 4ETEA 3D9AC 4H8YA 3AB6A 3AJNA 3W3EA 1LMTA 1GFUA 1GEZA 2W1XA 1E8LA 1N4FA 3AW7A 1J1OY 4GCDA 3TMWA 1GFAA 1HMLA 5KXLA 1XGRC 4E3UA 2H9KA 2MEIA 4NGIA 5KXMA 1F10A 1IO5A 1NKHA 3LZ2A 1LSYA 1G7LC 4DD1A 2BQEA 3OJPA 2BQOA 3QNGA 1LZ5A 4LT3A 1IC7Y 1QSWA 4NIJA 3MGWA 3TMVA 5LINA 5C6LA 4LT1A 3G3AB 1KXXA 4NGWA 4DD7A 5HQ1A 4TTDA 1IIZA 1WQNA 2FBBA 1C45A 3B6LA 4GN3A 1GBWA 2HEBA 1UIFA 1LZCA 4TX7A 1GBZA 1LJKA 1D0KA 3A8ZA 1LYZA 4HTKA 3W6CA 1NWGA 4O34A 1VAUA 3A3RX 2BQAA 4RW2A 4WLDA 4LZTA 153LA 4N0JA 4LT2A 1FN5A 5DN5A 1HHLA 5LYZA 3LN2A 3N9EA 4WM6A 1Z55A 4HJYA 1B7NA 1LZ9A 1JWRA 1NBYC 4I8SA 1JJ1A 1I56A 2YDGA 2ZQ3A 2Z38A 1PZYA 3BKHA 4GCFA 4H90A 5FDJA 2LZ2A 3QE8A 4EMNA 2DQFC 5IHGA 1C46A 1LMPA 2FYCA 5KXPA 134LA 3WH1A 1UIHA 2YVBA 4PRUA 4ET9A 4TSCA 1IP5A 4DD9A 2D4KA 9LYZA 4YENA 1TEWA 1I20A 2HEDA 1LHHA 3QY4A 2MEBA 5A3ZA 1ZMYL 1DI5A 1LSNA 4DD2A 4WMGA 2B5ZA 1JKBA 4NSJA 4DT3A 1GF5A 4DD3A 6LYTA 4PGJB 133LA 2MEHA 1JISA 1DPWA 1F0WA 1EL1A 1B5ZA 1BWIA 4NWEA 4P2EA 4UWUA 4WM2A 3VWOA 4AXTA 5I54A 1F6RA 3ZVQA 3TXKA 2YBMA 3WVYA 4H8XA 1OP9B 1MLCE 1IWUA 3KAMA 4XJGA 5IELA 4HTQA 2X0AA 4Z41A 1B5XA 1VDQA 1HF4A 4OWAA 2C8OA 5ILFA 2G4QA 2LYZA 1KIRC 4TUNA 1YANA 2HEFA 2BQNA 3AGHA 4NG8A 2Z2FA 1IY4A 1UICA 4H9IA 4WL6A 1WTMA 4ET8A 1AT6A 3AGIA 4LFPA 1EQ4A 1VDTA 1P2CC 1NDGC 1JSFA 1GDXA 4NSIA 4UWVA 1OUJA 3WUAA 1QIOA 4YOPA 1OUAA 2ZQ4A 2A7FA 1TDYA 3N9AA 1LHLA 5II3A 1NHEA 2CDSA 2XJWA 4QGZA 4XJBA 1AT5A 1REYA 1GF8A 1JTOL 4H9AA 4OWBA 4W96A 3TXDA 2DQJY 4LYTA 4G49A 4N5RA 3WYHA 4HP0A 4XJIA 5LIOA 1LJEA 2BQGA 3WVXA 2I25L 3ZEKA 5LVKA 4NHTA 2EKSC 5KXOA 3EMSA 3B72A 1FLQA 1DPXA 3M3UA 1UBZA 1IORA 1YAQA 1JJ0A 2LYOA 3AZ5A 1JITA 1JEFA 1GF7A 3TXBA 2MECA 3A95A 5DL9A 1GF9A 1HEQA 1B5UA 1BGIA 1XEIA 1HC0A 1LHJA 3RU5A 1LZTA 3HBHA 1IOTA 4FDYA 1JKCA 2BQJA 3TMUA 1LZDA 2WARA 1BWHA 1W08A 4C5FA 3LYMA 1XGTC 5HNLA 1V7TA 1XGPC 6LYZA 1DXJA 1LJFA 208LA 4BAFA 1GB2A 4NHPA 1GEVA 5KXWA 4WG7A 1J1XY 1VFBC 1FLYA 1WQRA 5M1YA 3RZ4A 194LA 1UUZC 5KXSA 1XSFA 4TWSA 1LZ1A 3P4ZA 2DQGY 1OQMA 1LZYA 3F6ZA 4LT0A 5DN4A 4MCKA 3T36A 3RW8A 4DDBA 4B4JA 3N9CA 3ZVQB 5K7OA 4ZFPA 5B07A 2BQCA 3J6KA 3WXUA 1B7OA 1RCMA 4B4IA 4BADA 5LVJA 1B5YA 1DQJC 2Z12A 1KXYA 3AGGG 1BB6A 2DQEY 1LSGA 1VEDA 4MSTA 4UWNA 4J0LA 4M4OA 5A3EA 3FI7A 1OUDA 3P64A 4HV2A 4ETAA 4YF2A 5LYMA 1H6MA 1JSEA 5HNCA 2IFFY 1CKCA 1TBYA 1JTTL 3CSQA 4OOTA 5LVGA 4PPOA 2D4JA 4LYCA 5FELA 4HTNA 1LZRA 5FSTA 3B0OA 1OUGA 1HSXA 1LZ8A 1LZNA 4R0FA 4CGEA 1LSEA 1HFZA 1XEJA 4J1BA 4RLMA 1BB7A 5JENB 4ZEEA 1TCYA 4OW1A 2W1LA 1LAAA 4H9EA 2ZWBA 1FLWA 1IR8A 3BKVA 4NEBA 4NWHA 4LYMA 5F16A 2CJLA 4H9CA 1YAPA 1IOSA 1FKQA 1WQMA 2BQHA 1JKDA 1GB9A 1D6PA 1BVKC 1LZAA 4N8ZA 1DZBX 3CT1A 2DQDY 5B06A 1T6VL 2DQHY 3P65A 4G9SA 1KIQC 4N1EI 4OWEA 1GFRA 4HSFA 2HU3A 4B0DA 3GXRA 1BQLY 1XFPL 1HEMA 1LMOA 3P66A 3WPKA 5KXXA 4B4EA 1RI8B 207LA 4NHIA 4WLTA 4IATA 4XN6A 1HMKA 3AW6A 1LMAA 1INUA 4ANRA 1NF5A 135LA 1B5VA 1GBYA 1QTEA 1CJ6A 4NSHA 1RFPA 1REMA 4QY9A 3TXFA 1LJJA 4GN5C 4J1AA 5LYTA 1KIPC 2YBNA 2IHLA 2W1YA 5ILCA 1KXWA 3B0IA 1DKJA 1QDTA 2D91A 1UA6Y 2BAAA 7LYZA 5APFA 4QEQA 4WL7A 2G4NA 2I26L 1REXA 2BQLA 4CFPA 4GN4A 4BAPA 1LZ4A 1GBXA 4Z46A 5I4WA 3A67Y 5AMYA 4H1PA 5APDA 3AYQA 1B7RA 2CWIA 4LFXA 3LYTA 4GCBA 4KXIA 4RLNA 5HLLA 1T3PA 1IP4A 1YKXX 1WTNA 4RW1A 1JTPL 1D0LA 4NGKA 5KY1A 2N5ZA 5KKIA 1D0MA 1BVXA 4B49A 4KT3A 1GB0A 1GXXA 1AZFA 1ZVYB 2D4IA 5KXRA 1LZGA 3B0KA 2CGIA 5C6JA 2HECA 3ATOA 5F14A 4WLXA 1WQQA 2DQIY 2ZNWY 3K3TA 2BQIA 3G3BB 2ZIKA 3A94A 1TAYA 1XGQC 2YBLA 2Z39A 1DKKA 2ZNXY 4XYYA 4YM8A 4A7DA 1NQIA 4LGKA 1JKAA 4DD0A 1DI3A 1GB6A 2HU1A 3CSRA 3M18B 4QDNA 4WLYA 5KXNA 4BS7A 1CJ7A 1YIKA 1B5WA 1HEPA 2DQCY 1HEOA 1B9OA 2H9JA 4LYOA 1AM7A 1LCNA 2BQMA 1WQPA 1B2KA 3W6BA 1IEEA 1LZBA 3IJVA 4PRQA 2D6BA 1HFYA 1LYSA 2F2NA 2HUBA 3CT5A 4YEOA 3W6DA 2FYDA 3HBEX 1QTKA 4NGYA 5HMVA 4RDSA 1JPOA 3EO5A 4HV1A 1LJGA 1WVVA 4XADA 4HJZA 4WM1A 2LYMA 5L3IA 5LXWA 4OOOA 4WM4A 1CJ9A 1G7MC 4H94A 2Z18A 2ZYCA 4CFOA 4ZIXA 1FLUA 3A92A 1GF4A 1D9UA 1LHIA 1GB7A 2BQBA 1RE2A 2ZIJA 1GFKA 1HEWA 1IP3A 4OWCA 1YROA 3W6FA 5KXTA 4WO6A 4NG1A 3WULA 2MEFA 5F9UA 1D6QA 4AGAA 4XJHA 1RJCB 1YL1X 3HBDA 1GPQC 1DI4A 3RT5X 1GBSA 3EXDA 1HFXA 3J4GA 4H91A 4D9ZA 4PJ2C 3WPJA 1CKFA 4MR1A 1C10A 3WXTA 1C43A 1XEKA 2EIZC 1B7MA 2A7DA 1WQOA 2BQDA 5FEKA 1AKIA 1IR9A 1LMNA 1GB5A 5I53A 2RSCA 1MELL 1FBIX 2DKVA 3LZTA 5EBHA 4LYBA 3CB7A 4DDCA 1BB5A 5D5FA 1IP6A 5J7CA 2LZTA 4N1CC 5I4XA 3RNXA 4DYGA 2W1MA 4J7VA 1LZSA 1IWWA 3WU8A 4EOFA 4G4BA 1GD6A 3LYOA 1QQYA 2DQAA 1IC5Y 4H9FA 5B1GA 2Z37A 4NGVA 2FBDA 4DC4A 2G4PA 2XBRA 1IY3A 1IWYA 1LHKA 1GB8A 4ETCA 2AUBA 1LSBA 1LJ4A 3SP3A 1GWDA 3TXGA 1HSWA 3WW6A 4CHXA 2BQFA 3A34A 1IP7A 4TSBA 2MEDA 2F30A 4IASA 1ALCA 2XBSA 2Z19A 5E4PA 1YKZX 1IWTA 1B7SA 1BHZA 4IJ4A 5FCPA 1GFHA 4LYZA 2F4AA 1NBZC 1VATA 3AZ4A 5LAFA 3A3QA 4WO9A 4OWHA 1CJ8A 4H9HA 1JHLA 1QUSA 1LZEA 1UIEA 4YEMA 1IOQA 1GE3A 1HENA 4NHSA 5I4YA 2XTHA 154LA 4Z3MA 5LVIA 1FKVA 1UIBA 1ZV5L 1UC0A 2YBJA 1LPIA 4G4HA 4WG1A 1LJIA 3WL2A 8LYZA 5KKJA 1QSAA 1GFJA 4GCCA 2HEAA 1GFVA 3T6UA 3OK0A 1J1PY 1F6SA 1B7QA 3D3DA 4DWXA 3A93A 1UIAA 1CKHA 4C3WA 1UIDA 2EQLA 2YBHA 1JJ3A 1GE0A 2Z2EA 2ZYPA 3WU9A 1GF3A 5T3FA 1GXV2 1LKSA 1B7LA 4HJVA 4II8A 4WM3A 3CQLA 1GFGA 2Y8PA 1JIYA 1IC4Y 3HFMY 4KPMA 3FE0A 4WOAA 5KXYA 4L41A 1IP1A 1GFEA 4ML7A 4B1AA 1VDPA 1VDSA 4GLAA 1OUHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
219LA 1CU6A 1LYGA 1OUIA 3WW5A 1C08C 1V7SA 1C67A 5LVHA 2HTXA 3L2XA 140LA 1XEPA 1LOZA 1QT4A 2BLYA 5D5CA 3F8VA 1YILA 1L01A 1LSZA 1L10A 5KXKA 1OUEA 4U3XB 3GXKA 1C7PA 4XJDA 2YSSC 1H87A 3AZ7A 3LHMA 255LA 3TXJA 1I1ZA 118LA 3IWRA 5KXZA 252LA 2MEAA 4NFVA 3EBAB 3WPLA 1HNLA 1T8FA 1L33A 3A96A 1JUGA 1XGUC 5C6IA 4DQJA 1G0JA 3SBAA 4NGJA 1IWXA 3ATNA 2F4GA 2RBSA 1BWJA 2OE7X 1DYDA 1UCOA 1SSYA 4IAPA 3DMVA 1LZ6A 1PQMA 142LA 4ARPA 3GUKA 2QB0B 1EQ5A 2EPEA 3LYZA 1A4VA 2BPUA 4I0CA 132LA 176LA 4NGLA 1C6LA 1L57A 157LA 1O23A 1ZVHL 3A6CY 1GF6A 1G7HC 1G0LA 1OVJA 1LJ3A 3AJNA 1GEZA 3GUNA 2MEIA 1L31A 1NKHA 2BQOA 1LZ5A 4NIJA 5LINA 1L27A 4DD7A 4NGWA 2RB2X 180LA 4TTDA 1DYFA 4GN3A 3G3WA 1GBWA 1TLAA 222LA 1LYZA 149LA 4WLDA 4O34A 4RW2A 4N0JA 4LT2A 3N9EA 4WM6A 1LZ9A 1JWRA 1NBYC 4I8SA 1JJ1A 1I56A 2ZQ3A 1L81A 4H90A 3BKHA 1K28A 108LA 250LA 4EMNA 2DQFC 5IHGA 1CVKA 5KXPA 242LA 4I7SA 1G06A 2YVBA 3WH1A 2Q9EA 1C6CA 1I20A 2XQOA 5A3ZA 1DYBA 1LSNA 4WMGA 2B5ZA 1JKBA 6LYTA 1QUHA 1P56A 198LA 1JISA 1L40A 1BWIA 4NWEA 4UWUA 1F6RA 3ZVQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4ETD A;  1IOC A;  4H92 A;  3WMK A;  4R6C A;  4Z98 A;  5LAG A;  5B1F A;  4H8Z A;  3A6B Y;  1LSD A;  4W94 A;  4NGO A;  1UAC Y;  4NHQ A;  3TXI A;  1LYY A;  5LA5 A;  3E3D A;  2I6Z A;  4H9B A;  1LSA A;  1OUI A;  5APE A;  5FHW A;  1YAM A;  2ZIL A;  1CKG A;  3WUN A;  4G4C A;  4NY5 A;  1WVU A;  3WW5 A;  1C08 C;  1V7S A;  5I5Q A;  5LVH A;  1LJH A;  4KL7 A;  1G7I C;  1CKD A;  1EQE A;  1FDL Y;  2HTX A;  3A90 A;  1IWV A;  1LOZ A;  5D5C A;  2BLY A;  4FJR A;  5L9J A;  1QDR A;  4HPE A;  5KJ9 A;  1GAZ A;  1YIL A;  1B0D A;  1GB3 A;  193L A;  1NDM C;  2DBT A;  1LSC A;  1REZ A;  1LSZ A;  2Q0M X;  5KXK A;  1IVM A;  1LKR A;  1LMC A;  1OUE A;  1YQV Y;  5DLA A;  1GE4 A;  1W6Z A;  4HPI A;  4U3X B;  4ETB A;  3GXK A;  5B59 A;  2MEE A;  1C7P A;  1G7J C;  1GFT A;  4XJD A;  1IR7 A;  3W6E A;  1GBO A;  1LYO A;  2LHM A;  2YSS C;  1H87 A;  2MEG A;  1GHL A;  1GF0 A;  2H5Z A;  3AZ7 A;  3LHM A;  2VB1 A;  4H93 A;  1IWZ A;  2BLX A;  5APC A;  3TXJ A;  1YKY X;  1I1Z A;  1LMQ A;  4XJF A;  3WU7 A;  2NWD X;  3IWR A;  4NSG A;  2BQK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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