1LZ4A

Enthalpic destabilization of a mutant human lysozyme lacking a disulfide bridge between cysteine-77 and cysteine-95
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNAAHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
publication title Enthalpic destabilization of a mutant human lysozyme lacking a disulfide bridge between cysteine-77 and cysteine-95.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 49
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lz4A00
1LYOA 1TEWA 1C45A 1GDXA 1HMKA 4NHQA 4J7VA 3W6EA 4WM6A 5B1GA 1VDSA 1LZ6A 1VDTA 1B7NA 1LOZA 1T6VL 2LZ2A 4MSTA 4XJGA 5KXYA 1HSWA 4PHIA 4TWSA 1GXV2 2ZYCA 4DD1A 3A96A 2HEAA 154LA 1WVUA 1B0DA 3T36A 2XJWA 5KXTA 1MELL 2BQBA 2DQCY 4FDYA 1HEQA 1SQ2L 1RCMA 5LVGA 1QQYA 4WO9A 2LYZA 1D0LA 3TXJA 1EQ5A 3BKVA 1LAAA 1VEDA 1B5VA 1LZ4A 4NGOA 1ALCA 1CJ9A 1D0MA 1RE2A 4B4IA 2DQDY 5KXMA 1WQQA 1GFJA 2C8PA 1GBYA 1I20A 4YF2A 1HEOA 3ZVQB 1NMMA 4WM5A 1DPXA 1LZSA 4RLNA 2BQNA 1W08A 5I54A 4EMNA 4CJ2A 1NDMC 1JTTL 1LPIA 4WM3A 1ZVYB 1IP5A 3P68A 2YVBA 1IY4A 1JKAA 4NSJA 1YAMA 1GBSA 3WULA 3QE8A 2G4NA 193LA 1G7LC 1BWHA 1LZDA 1F6SA 2FBDA 2WARA 1GWDA 1LJIA 1LMQA 3CT0A 2BLYA 3A93A 4XJDA 1GFAA 4DD9A 2FYCA 1KXWA 2I6ZA 1NDGC 2DQJY 3D3DA 4KPMA 1BB6A 5KXOA 3CT5A 3ZEKA 3WUAA 4NFVA 1B5ZA 4HP0A 4NG1A 1GDWA 2CJLA 5HMVA 4WL7A 1JHLA 4LT1A 2Z2FA 4ETEA 1YIKA 4GLVA 1DI4A 1OUEA 1TAYA 1LMNA 1IP2A 1JEFA 1GEZA 4TX7A 1LZNA 3N9EA 5FELA 2ZWBA 4CFPA 4DYGA 4ETBA 1G7IC 1UIHA 4GCCA 4HTKA 2MEHA 1GFVA 2CDSA 5APFA 5F9XA 1VAUA 3HBDA 4ETDA 2DQAA 1V7TA 3LYTA 5DN5A 2MEEA 2YBMA 4H9HA 2W1LA 5J7CA 4QGZA 2YSSC 2YBJA 1HHLA 4BAFA 2MEAA 1GPQC 2LHMA 5FEKA 5LA8A 1JJ1A 1IWWA 4LYTA 1G7MC 1WTNA 1GFGA 1EQEA 1YKZX 1H87A 1D0KA 2DQEY 1F0WA 5B07A 1BB3A 3N9AA 2BQAA 1NF5A 132LA 4R6CA 4WLTA 4DT3A 2F4GA 4NSGA 1EL1A 2YDGA 4UWNA 4H94A 4IASA 2X0AA 3B6LA 4OWBA 5E4PA 4ET9A 4N1CC 5KXKA 1FLYA 208LA 2HTXA 2FBBA 1IR9A 1WTMA 4M6DA 2HEEA 1CKDA 1NBZC 4AGAA 1QSAA 3A95A 3B0OA 194LA 153LA 2Z39A 1Z55A 1GF0A 2BQKA 2H5ZA 4WO6A 1BWJA 1P2CC 4YOPA 1UIEA 1YAQA 1XGUC 5IELA 3AW6A 2AUBA 3AGHA 3GXRA 1LHJA 2C8OA 4TTDA 1BWIA 2HEBA 5F9UA 1UICA 5KXZA 4WLDA 1GE3A 1B7OA 1LJEA 3B0IA 1OP9B 1JTPL 2Z19A 3BKHA 3LYMA 4N9RA 4H9EA 3A92A 4PRQA 2F4AA 4DD0A 5APCA 4XJIA 1GB9A 1B7QA 1D6QA 4OOOA 3AW7A 4RW2A 1FDLY 1HNLA 1GB5A 4TSCA 1UACY 1B7LA 1LMCA 3TXKA 3J6KA 2D4JA 1LSFA 3TXHA 3K3TA 1BB5A 1LJKA 4OWAA 1LJJA 1UA6Y 5A3EA 2DKVA 1CJ8A 1GBWA 3D9AC 3WXTA 1CJ6A 1IEEA 1VFBC 1C46A 4A7DA 1TCYA 1LKSA 1OUHA 4XN6A 1A2YC 2MEBA 4OWEA 5AMYA 5B05A 1LMTA 3OJPA 4H92A 1LHKA 4N5RA 4CGEA 5KKIA 5IHGA 4X3BA 3WU7A 4H9CA 4LFXA 4XJHA 1QDTA 2CGIA 2F2NA 1QIOA 3A6CY 5T3FA 3TMXA 3W6DA 3M3UA 2Q0MX 4NHSA 2MEDA 4H8YA 1C43A 4ETAA 4NHIA 1BHZA 1UCOA 5LYMA 2A7DA 2MEIA 3RU5A 1NHEA 1HELA 1TBYA 4PPOA 2MEFA 5E9RA 3WW5A 1J1OY 4NGJA 1BVXA 1OUAA 2BQCA 3AYQA 1KIPC 2BQFA 5LYZA 2HU1A 5B1FA 1KIRC 1LJHA 1IR7A 3WPJA 2BQJA 4KXIA 3LZTA 2PC2A 3P4ZA 1FLQA 2EIZC 1BB7A 1AM7A 3A3RX 1GBOA 2G4PA 4N1EI 1GB3A 1LZRA 5DLAA 1REXA 1GB8A 1JSEA 3A34A 4LYMA 4LT0A 2DQGY 2GV0A 1UIAA 5F14A 1GD6A 1LJGA 1QSWA 4HTQA 4E3UA 1FKVA 5ILCA 4ANRA 5KXXA 1IP7A 1YAPA 1HFZA 3LHMA 5A3ZA 4OWCA 1UIBA 1XGRC 4HSFA 3LYOA 1YQVY 1IP4A 3A6BY 1QUTA 1IP3A 5KXSA 4RW1A 3VWOA 4WMGA 3E3DA 1B7SA 3AJNA 1J1XY 4N0JA 1WVVA 3MGWA 2EQLA 4GCDA 2BAAA 2BQLA 1OUJA 3WH1A 1JIYA 4HTNA 3RT5X 3WXUA 4G4HA 1O23A 1BVKC 3TXGA 1H6MA 3A91A 2F30A 4ZEEA 1IY3A 1UIDA 3AGIA 2BQIA 3CT1A 4NGVA 3SP3A 3WL2A 1C10A 4NGYA 2LZTA 1HERA 5LYTA 1IO5A 1B7RA 4XADA 1W6ZA 3IJUA 1F6RA 1LZ9A 1LSGA 1OUIA 1XGTC 5LAFA 1JISA 2MEGA 4H8XA 3TMWA 3A90A 4G9SA 1B5WA 2DQHY 4L41A 3WU9A 4YEMA 3QY4A 4HJZA 3WUMA 1LZCA 4LT2A 4ZIXA 4U3XB 3CSQA 4W96A 5HNLA 1LJNA 4WLYA 5C6JA 5KJ9A 1RI8B 4NG8A 1JUGA 4BAPA 2ZILA 5FSTA 1IOSA 3RZ4A 3AZ7A 1VDQA 1YANA 134LA 1DI3A 2BQEA 4NGKA 3W6CA 4NSHA 2BQDA 2Z38A 2YBLA 1AZFA 1KXXA 2I25L 1JWRA 2Z2EA 5B59A 2BQGA 1YKYX 1LZ5A 1B5UA 1LSZA 1DXJA 1JKCA 1GB0A 1BQLY 1IC4Y 1YL0X 1I56A 5M1YA 3WVXA 3AGGG 1DQJC 1OQMA 1REYA 2XBSA 2ZNWY 1LSAA 1B2KA 3T6UA 1LSNA 4IJ4A 1IOTA 4YM8A 2YBIA 4LZTA 1NBYC 3TXFA 4AXTA 5I4XA 4M4OA 4QEQA 2Z37A 1REMA 1HMLA 1IWYA 2XBRA 4KT3A 3AZ4A 3EXDA 5FCPA 3EMSA 5KXNA 1LYZA 4GN5C 4HPIA 1NKHA 4LFPA 4B1AA 5KKJA 1GBZA 1LZGA 3WVYA 5LVJA 5K7OA 4RLMA 4BS7A 6LYTA 4DD2A 1N4FA 5FDJA 1LSBA 4NHPA 4XYYA 4FJRA 5KY1A 5KXLA 6LYZA 1DPWA 1LSYA 4PRUA 1OUBA 3KAMA 4H91A 1GE4A 2FYDA 1LKRA 1GAYA 4J1AA 1YL1X 1PS5A 4HPEA 4NGIA 1B5XA 3WPKA 4DD7A 3WU8A 3ZVQA 1LHMA 4ET8A 3IWRA 1GBXA 3LZ2A 2NWDX 1A4VA 4WM4A 5DL9A 2D6BA 3CSRA 2Z12A 4ZFPA 4GN4A 4NHTA 3TXDA 4DDAA 1VDPA 5L9JA 1LCNA 8LYZA 4QY9A 1FN5A 1JJ0A 2W1XA 2ZIJA 3TXIA 4IATA 1HSXA 4II8A 1JKDA 3OK0A 1B5YA 3IJVA 5LAGA 1LYYA 4NWEA 1CKHA 4G4BA 2ZYPA 2B5ZA 4H9AA 1LYSA 1GFRA 1HEMA 3CB7A 1IWTA 5IDDA 1IWZA 5HNCA 5F81A 3G3BB 4LYOA 1GF5A 2BQHA 1IP6A 4G49A 4LT3A 3A67Y 1GE1A 4HJYA 4HV2A 4WG7A 5KXWA 1UIFA 4C3WA 1QDRA 1HEPA 3A3QA 1YILA 2I26L 3EO5A 3HBHA 3WYHA 5I4YA 5ILFA 1E8LA 1FBIX 5L3IA 4OOTA 1LMAA 5II3A 3WMKA 1LZ8A 2YBNA 3HFMY 5B06A 4KL7A 3TXEA 3WUNA 7LYZA 2HEFA 1JITA 1C7PA 4NGWA 1LZBA 1OUGA 4XJFA 4O34A 2CWIA 2EPEA 4MCKA 1OUCA 3F6ZA 4GLAA 1GE2A 1GB7A 1KIQC 3B72A 4DDBA 1LZ1A 2Y8PA 2ZNXY 2ZQ3A 5JENB 1OUDA 133LA 4WG1A 5C6IA 1GXXA 1GF3A 1LZTA 1RJCB 1TDYA 3CQLA 1YAOA 5L3HA 1G7JC 4H93A 4J0LA 2BLXA 1XEJA 4PJ2C 4P2EA 4YENA 1IX0A 1WQPA 4Z41A 1HFYA 2BQOA 4LYCA 1IOQA 4DWXA 1RFPA 1GF9A 1GF7A 1PZYA 3AB6A 1GFKA 2MECA 1GEVA 1D6PA 4B49A 1IC5Y 4WM1A 1INUA 5D5FA 4EOFA 1UUZC 1NQIA 4NEBA 3A8ZA 4WL6A 1UBZA 3WW6A 5LXWA 1ZV5L 2DQFC 3G3AB 1B9OA 1BGIA 1WQNA 1REZA 4GCEA 4W94A 1IR8A 3A94A 1LMOA 2D4KA 4N8ZA 1HF4A 1JKBA 1IWXA 4ML7A 4NWHA 2ZIKA 4OWHA 3FE0A 5HMJA 1GF8A 4BADA 4D9ZA 1LTMA 3P64A 1QTKA 5D5CA 4G4CA 5EBHA 4DC4A 2HEDA 1GE0A 4XJBA 1LZYA 3AZ5A 1DI5A 3LYZA 4B4EA 4Z3MA 1GB6A 2IHLA 2YBHA 3TXBA 4OW1A 4B0DA 1XSFA 4GCBA 5LVIA 1IC7Y 1WQOA 4WM2A 1LHIA 1IIZA 1AT5A 1JSFA 5LIOA 5DN4A 5LINA 1LMPA 2BQMA 1LJ3A 1HFXA 1SLYA 2H9KA 4J1BA 2D91A 5I53A 1DKJA 1CKCA 1CJ7A 1GFEA 1LSPA 4RDSA 2HECA 3P65A 1WQMA 4PGJB 4Z46A 4TUNA 1IVMA 4DDCA 1ZVHL 1FLWA 1YROA 2D4IA 3W3EA 3ATOA 4I8SA 1FKQA 1QUSA 1GF4A 4HJVA 1B7PA 9LYZA 4H1PA 1V7SA 4LGKA 1GFHA 3TMVA 1G7HC 1GB2A 2W1MA 3CSZA 4XENA 135LA 1DZBX 2RSCA 1KXYA 1CNSA 2XTHA 4LYZA 4NGLA 1VATA 2DBTA 1J1PY 1CKGA 4UWUA 3TMUA 1GHLA 4LYBA 2IFFY 5KXRA 1DKKA 3ULRA 2BPUA 3LN2A 1MLCE 1LZAA 5LA5A 4NGZA 1XGPC 2G4QA 3M18B 5HQ1A 4TSBA 1XEIA 1IORA 4GN3A 1LZEA 2A7FA 2H9JA 4YEOA 3RNXA 1IP1A 3FI7A 1IWUA 3B0KA 1B7MA 1CKFA 1JTOL 1UC0A 3AZ6A 3N9CA 5APEA 2LYMA 1C08C 1JJ3A 1LSCA 2EKSC 4QDNA 4C5FA 2VB1A 3W6FA 4GCFA 1GF6A 4CHXA 4WOAA 4H9FA 2DQIY 3GXKA 4CFOA 5C6LA 5I5QA 1GFUA 1JPOA 4B4JA 4R0FA 1HENA 1FLUA 1ZMYL 1XGQC 1LHHA 2W1YA 2HU3A 1LSMA 4MR1A 4NSIA 5KXPA 5LVKA 2ZQ4A 5LVHA 1HEWA 3J4GA 5F16A 1XEKA 1EQ4A 4H8ZA 3W6BA 1QTEA 2Z18A 1T3PA 3WPLA 1D9UA 1I1ZA 1OUFA 4H9IA 3RW8A 4DD3A 207LA 1WQRA 3EBAB 1AKIA 4ETCA 1UIGA 4NIJA 4I0CA 4H90A 5DM9A 4WLXA 3ATNA 1LSEA 1F10A 1LJFA 1IWVA 1LJ4A 2N5ZA 5FHWA 5I4WA 4Z98A 3QNGA 4H9BA 4HV1A 1HC0A 1GAZA 1YKXX 3HBEX 2LYOA 3P66A 1XFPL 4NY5A 2HUBA 5APDA 3W6AA 1AT6A 1GFTA 1LHLA 5HLLA 1BB4A 1NWGA 4UWVA 1LSDA 1IOCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G07A 1LYOA 1TEWA 1C45A 218LA 4LDOA 4NHQA 1P56A 5B1GA 4XJGA 1LZ6A 2LZ2A 1T6VL 1HSWA 1C6BA 1G0JA 1P2RA 1QTCA 2HEAA 243LA 5KXTA 2BQBA 2DQCY 104LA 1RCMA 167LA 3BKVA 1VEDA 1B5VA 1CUPA 1ALCA 1RE2A 5KXMA 1WQQA 1LLHA 1DPXA 241LA 4RLNA 4GRVA 1W08A 5I54A 4CJ2A 146LA 1L04A 1ZVYB 1WTHA 1IP5A 107LA 1JKAA 1YAMA 1GBSA 3WULA 3QE8A 1L26A 1BWHA 3A93A 4XJDA 4DD9A 1C66A 1BB6A 3HH6A 4HP0A 4S0WA 1JHLA 4ETEA 1YIKA 4GLVA 1OUEA 2B70A 2ZWBA 4CFPA 1P6YA 1UIHA 3G3WA 4HTKA 7LZMA 1V7TA 4H9HA 1L15A 4BAFA 1KY0A 5FEKA 2O4WA 3HUKA 1GFGA 1JQUA 1D0KA 132LA 4R6CA 4DT3A 1L29A 1L66A 2X0AA 3CDRA 4OWBA 5E4PA 240LA 1CV6A 4ET9A 1FLYA 1CKDA 2RBNA 3A95A 3B0OA 229LA 2Z39A 1P2CC 1QT3A 3SB8A 1UIEA 1YAQA 2B74A 2C8OA 2HEBA 5F9UA 1P7SA 1B7OA 3B0IA 4PRQA 1JTPL 1L84A 1GB9A 4TSCA 3TXKA 3J6KA 1LSFA 3K3TA 4OWAA 1SX2A 1UA6Y 1G0MA 1L27A 3D9AC 3JR6A 1C6TA 4A7DA 1A2YC 2MEBA 3SB7A 1QUGA 1LHKA 3OE6A 5IHGA 4W58A 3WU7A 1QDTA 3W6DA 1QTVA 214LA 3M3UA 4EPIA 2MEDA 1PQOA 186LA 1L10A 4ETAA 1C6DA 1UCOA 2MEIA 4ARPA 4NGJA 260LA 3RUNA 3AYQA 108LA 257LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LYO A;  1TEW A;  1C45 A;  1GDX A;  1HMK A;  4NHQ A;  4J7V A;  3W6E A;  4WM6 A;  5B1G A;  1VDS A;  1LZ6 A;  1VDT A;  1B7N A;  1LOZ A;  1T6V L;  2LZ2 A;  4MST A;  4XJG A;  5KXY A;  1HSW A;  4PHI A;  4TWS A;  1GXV 2;  2ZYC A;  4DD1 A;  3A96 A;  2HEA A;  154L A;  1WVU A;  1B0D A;  3T36 A;  2XJW A;  5KXT A;  1MEL L;  2BQB A;  2DQC Y;  4FDY A;  1HEQ A;  1SQ2 L;  1RCM A;  5LVG A;  1QQY A;  4WO9 A;  2LYZ A;  1D0L A;  3TXJ A;  1EQ5 A;  3BKV A;  1LAA A;  1VED A;  1B5V A;  1LZ4 A;  4NGO A;  1ALC A;  1CJ9 A;  1D0M A;  1RE2 A;  4B4I A;  2DQD Y;  5KXM A;  1WQQ A;  1GFJ A;  2C8P A;  1GBY A;  1I20 A;  4YF2 A;  1HEO A;  3ZVQ B;  1NMM A;  4WM5 A;  1DPX A;  1LZS A;  4RLN A;  2BQN A;  1W08 A;  5I54 A;  4EMN A;  4CJ2 A;  1NDM C;  1JTT L;  1LPI A;  4WM3 A;  1ZVY B;  1IP5 A;  3P68 A;  2YVB A;  1IY4 A;  1JKA A;  4NSJ A;  1YAM A;  1GBS A;  3WUL A;  3QE8 A;  2G4N A;  193L A;  1G7L C;  1BWH A;  1LZD A;  1F6S A;  2FBD A;  2WAR A;  1GWD A;  1LJI A;  1LMQ A;  3CT0 A;  2BLY A;  3A93 A;  4XJD A;  1GFA A;  4DD9 A;  2FYC A; 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 135L A;  1DZB X;  2RSC A;  1KXY A;  1CNS A;  2XTH A;  4LYZ A;  4NGL A;  1VAT A;  2DBT A;  1J1P Y;  1CKG A;  4UWU A;  3TMU A;  1GHL A;  4LYB A;  2IFF Y;  5KXR A;  1DKK A;  3ULR A;  2BPU A;  3LN2 A;  1MLC E;  1LZA A;  5LA5 A;  4NGZ A;  1XGP C;  2G4Q A;  3M18 B;  5HQ1 A;  4TSB A;  1XEI A;  1IOR A;  4GN3 A;  1LZE A;  2A7F A;  2H9J A;  4YEO A;  3RNX A;  1IP1 A;  3FI7 A;  1IWU A;  3B0K A;  1B7M A;  1CKF A;  1JTO L;  1UC0 A;  3AZ6 A;  3N9C A;  5APE A;  2LYM A;  1C08 C;  1JJ3 A;  1LSC A;  2EKS C;  4QDN A;  4C5F A;  2VB1 A;  3W6F A;  4GCF A;  1GF6 A;  4CHX A;  4WOA A;  4H9F A;  2DQI Y;  3GXK A;  4CFO A;  5C6L A;  5I5Q A;  1GFU A;  1JPO A;  4B4J A;  4R0F A;  1HEN A;  1FLU A;  1ZMY L;  1XGQ C;  1LHH A;  2W1Y A;  2HU3 A;  1LSM A;  4MR1 A;  4NSI A;  5KXP A;  5LVK A;  2ZQ4 A;  5LVH A;  1HEW A;  3J4G A;  5F16 A;  1XEK A;  1EQ4 A;  4H8Z A;  3W6B A;  1QTE A;  2Z18 A;  1T3P A;  3WPL A;  1D9U A;  1I1Z A;  1OUF A;  4H9I A;  3RW8 A;  4DD3 A;  207L A;  1WQR A;  3EBA B;  1AKI A;  4ETC A;  1UIG A;  4NIJ A;  4I0C A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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