1LZ4A

Enthalpic destabilization of a mutant human lysozyme lacking a disulfide bridge between cysteine-77 and cysteine-95
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNAAHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Enthalpic destabilization of a mutant human lysozyme lacking a disulfide bridge between cysteine-77 and cysteine-95.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Homo sapiens
total genus 49
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lz4A00
5E9RA 1LMQA 1DKJA 4XJHA 3M3UA 3WXTA 3WUAA 1IP7A 193LA 1GXV2 5B07A 1HHLA 4H8ZA 1GE1A 1RE2A 3GXKA 3WU7A 3AJNA 4G9SA 5B06A 1WVVA 3LHMA 1FDLY 1W6ZA 2BQMA 3AW6A 3G3BB 1GFRA 4NSHA 3TMUA 4OOTA 4J7VA 3A3QA 1UIFA 1WQMA 1GHLA 2RSCA 1LJGA 2HU3A 1BVKC 2H9JA 1IWXA 1VEDA 4WLXA 5DN4A 2YBJA 1YAPA 4WL7A 1H87A 1REXA 1G7HC 3CSQA 4GLVA 4H9FA 1IP1A 1Z55A 4B4IA 1FBIX 208LA 1IR8A 3A6BY 4IATA 1NBYC 4LT1A 3TMVA 3CQLA 1OUEA 5C6JA 1G7MC 2BAAA 4WG1A 4BS7A 3TMWA 2YSSC 6LYZA 1OP9B 5KXKA 4IASA 1UIHA 4W96A 4DDAA 4DD0A 1GFHA 135LA 2ZYPA 5LXWA 2AUBA 2F2NA 4GCEA 4H1PA 2EIZC 4HSFA 4OOOA 4CGEA 1LSBA 1OQMA 1YAMA 5LA8A 1GE0A 4IJ4A 3SP3A 1ZV5L 4DD1A 1I56A 1GE2A 3W3EA 4NGVA 3T6UA 4AGAA 1IWTA 2DQFC 3G3AB 5D5FA 1UIEA 2BQBA 1D9UA 5F9UA 5IDDA 1C08C 5I4WA 1IP4A 1V7SA 4FJRA 4PHIA 4XYYA 4ETEA 1T3PA 2DQDY 1JITA 3TXFA 3LZ2A 4YEOA 1J1XY 1GBYA 1TBYA 1QTEA 2LHMA 4H90A 4PJ2C 5LVIA 2PC2A 4NGZA 4NHQA 4WM5A 3TXJA 1O23A 2BQGA 1PZYA 1HMKA 1OUIA 2ZWBA 3N9CA 1GDXA 4N1CC 4EOFA 2BQOA 2F30A 3B0KA 3J4GA 4OWBA 4BADA 3RU5A 2ZIKA 1CJ9A 1YL0X 4OWEA 1I20A 1XGRC 2D4JA 2C8PA 3BKVA 5APEA 1IY4A 1GF0A 3QY4A 1GEZA 1HEMA 4LT2A 3LYTA 5KXOA 1V7TA 1UIBA 1JHLA 1OUFA 3N9EA 3ZEKA 1CKHA 1LJEA 3P4ZA 4Z98A 5IHGA 2LZTA 2YBMA 1JSEA 4B4EA 1B5VA 1LSEA 4YEMA 2ZQ3A 1HFYA 1I1ZA 5F81A 3AYQA 1A2YC 4HPIA 1UA6Y 4ZIXA 1LYZA 1QTKA 4NY5A 1VDTA 1LSZA 1QDTA 1YAOA 5ILFA 2YBNA 1B7QA 3LN2A 5HMVA 4H8XA 1LSYA 3EXDA 4N8ZA 4NSJA 4UWUA 1DPXA 1B5WA 3AB6A 3OK0A 1GF5A 4QGZA 2VB1A 3LYOA 4AXTA 5B1FA 1LZDA 4LYCA 4X3BA 1LZNA 4C3WA 1SLYA 1LHHA 4NGIA 1NWGA 4OW1A 2BPUA 2YVBA 1DKKA 1CJ7A 1LSAA 2A7FA 4XADA 1GPQC 4DYGA 4PRUA 4XJBA 1LMNA 1IR9A 1JPOA 2BQLA 3ATNA 4NGKA 1NHEA 4Z3MA 4WLDA 4XJFA 1LZBA 2B5ZA 2X0AA 1GB8A 4H92A 5LYZA 1GB0A 3CT5A 5KXNA 2Z38A 4ZFPA 1B5XA 1LJNA 1XEKA 3HBEX 1B7PA 1MELL 1JTPL 1MLCE 2MEIA 1UUZC 3HBHA 3WW5A 5I4XA 3RNXA 1GBOA 1ZVYB 3WPLA 4OWCA 1YILA 1BB6A 1GFJA 1JIYA 1D6PA 1LMPA 4LYMA 4DD3A 3QNGA 3B72A 1LKSA 4GN5C 1H6MA 4B4JA 1LJ4A 1JKCA 2MEEA 2Q0MX 1TCYA 5L3IA 4WM4A 2CWIA 2XBRA 2I25L 1LJIA 3IWRA 4H9AA 5LIOA 3WPJA 4H9IA 1KIQC 1C46A 1FLWA 5APDA 1EQEA 1BGIA 1BB7A 1IWYA 2XBSA 4H94A 4HPEA 1LSGA 2A7DA 1XSFA 4YOPA 1GF6A 1B2KA 1DI3A 4HP0A 1BWIA 1HERA 4Z41A 1WQRA 5E4PA 1IEEA 4KPMA 5C6LA 2BLXA 3LYMA 1B5YA 2YBIA 1QSAA 3P65A 4P2EA 4HV1A 1NKHA 1OUHA 1XEIA 4RLNA 4O34A 3A34A 4XJIA 5C6IA 4DWXA 1CJ8A 1JJ1A 1VDPA 5B05A 1DZBX 3IJUA 3P66A 1YL1X 4ETCA 4NSIA 3TXHA 1IOCA 2MEDA 4H9BA 3T36A 5KXXA 3A3RX 2Z2EA 4NFVA 4KXIA 3RT5X 1D0LA 1LYYA 1YQVY 1HEWA 2G4PA 2XTHA 4R0FA 4TX7A 1E8LA 2Y8PA 1LZTA 1LYSA 4DC4A 5FCPA 4LT3A 3BKHA 4LYOA 1A4VA 1LMOA 4C5FA 4Z46A 1LOZA 3WH1A 3TMXA 1IR7A 1QDRA 1REMA 3WULA 1F0WA 1LZ9A 2MEGA 5L3HA 4B1AA 2H5ZA 4GN3A 2Z19A 4RDSA 3EO5A 1IWVA 2Z37A 1IOQA 1NDGC 3TXKA 1LZ6A 2ZNXY 5KXPA 4LT0A 4QEQA 4WM2A 1LZ8A 2MEFA 5II3A 4GCBA 4ET8A 1QSWA 2Z12A 1REYA 1XGPC 1LAAA 1LSFA 1LZSA 1YROA 3P68A 4MCKA 3A95A 4N0JA 5HNLA 3WVYA 4DT3A 3HBDA 2ZYCA 207LA 3P64A 3AGHA 4H8YA 1LMAA 4UWNA 4TSBA 2BQNA 4MR1A 1GAYA 4RLMA 3J6KA 4ETAA 1AKIA 4NGOA 1LKRA 1DI5A 1GXXA 1XEJA 3OJPA 1GB9A 3W6BA 5KXZA 1JJ0A 1YANA 1LZEA 5B59A 5DM9A 3FE0A 1GFEA 1GF7A 2CGIA 1LZAA 1GBXA 4LYTA 4WO6A 1B7MA 5APFA 5FHWA 1GF3A 1KXWA 4CHXA 1HFXA 1HSWA 1LJKA 1LSDA 3WMKA 4NGJA 1UCOA 1HC0A 1LSMA 1LZ5A 1TAYA 5KKIA 4H9CA 1DI4A 1UIDA 3RZ4A 4TTDA 1LPIA 1C45A 1NF5A 4XJDA 2EKSC 2MEHA 4PPOA 1VAUA 1GFKA 2W1YA 4ML7A 4GCDA 2W1XA 3ULRA 2HU1A 4FDYA 1GFUA 3WU9A 1AZFA 1IP3A 1T6VL 2EPEA 1G7LC 4PRQA 1FLQA 1CKCA 3TXDA 2CDSA 4HJVA 4WG7A 1IVMA 1CKDA 4G4BA 1HF4A 4NG8A 2F4GA 5FSTA 5APCA 4NWHA 2W1LA 2FBDA 4DD7A 3A8ZA 1FKQA 1GB5A 5FEKA 1IX0A 4B49A 5FELA 1YKXX 2DKVA 1B5UA 3F6ZA 1GB6A 2ZQ4A 5LAFA 1IWWA 4WM1A 4W94A 5KXLA 1NDMC 2I6ZA 1WQNA 2LYZA 5I54A 1LZGA 3GXRA 9LYZA 4N9RA 1GF8A 1B0DA 1NBZC 4M6DA 5T3FA 3VWOA 3CT0A 1CJ6A 2GV0A 1LTMA 2BQAA 5KXRA 5M1YA 5F16A 4EMNA 4TWSA 1ALCA 1NMMA 1GDWA 2BQDA 4R6CA 1VFBC 1WTNA 1D0MA 1OUDA 4TSCA 1RCMA 4YF2A 5J7CA 1HSXA 5LYMA 4NHPA 4J1BA 4A7DA 2D4IA 2F4AA 4NEBA 3AGIA 4B0DA 1B7OA 2D6BA 3LZTA 4NGWA 5KY1A 1GBWA 3W6DA 1F6SA 1XGUC 1LHIA 1KIRC 1P2CC 4NWEA 1GFAA 2HEBA 1F6RA 1IOTA 2HUBA 1JKBA 2IFFY 2MEBA 4XN6A 1OUBA 1GE4A 1VDSA 3W6AA 4I8SA 4HJYA 1SQ2L 1HEOA 2BQFA 4YENA 2BQIA 4J0LA 4ANRA 1UBZA 2DQGY 1DXJA 2G4NA 1RI8B 2N5ZA 1JKAA 1G7IC 4NGYA 3ZVQA 1OUJA 2C8OA 2W1MA 1RFPA 1GBZA 1BB3A 3ZVQB 2BQEA 5HNCA 1NQIA 2ZILA 2FYDA 5LVKA 1UIGA 5AMYA 4BAFA 5KXMA 4WM3A 3WL2A 4H93A 4CJ2A 1OUAA 3A90A 1JWRA 1HELA 1GFGA 1JISA 3MGWA 1IP5A 3N9AA 153LA 4ZEEA 3W6FA 3B0OA 5LAGA 1BVXA 1KXYA 2DQHY 4DD9A 194LA 1XFPL 3QE8A 4MSTA 1YKZX 1WTMA 3WPKA 1XGQC 4CFOA 1GF4A 1EQ5A 1LJJA 3HFMY 4J1AA 1UIAA 4KL7A 3A91A 3W6CA 4PGJB 1GE3A 5I5QA 3RW8A 1AT5A 2H9KA 1GB7A 2MEAA 4L41A 4H9EA 5A3ZA 3AW7A 1OUGA 4GN4A 4HTQA 1QUSA 4LYBA 4RW2A 5LVHA 2BLYA 1UICA 1BHZA 3AZ7A 1FN5A 1LSNA 2Z39A 1FLUA 1OUCA 3D9AC 5B1GA 4UWVA 3TXBA 4GCFA 4BAPA 1IORA 2HEAA 2YDGA 1D0KA 3M18B 1C10A 2MECA 1B9OA 4ET9A 5KJ9A 1LHLA 1B5ZA 1QQYA 1GB3A 1UACY 2HEFA 5LINA 133LA 1LZYA 2G4QA 1BQLY 4WL6A 4QDNA 1GB2A 1IO5A 4WLTA 5KXYA 4NIJA 1YIKA 3WYHA 1IP2A 2EQLA 1KIPC 1CKGA 1LJHA 1LSCA 4LFXA 4GCCA 5I4YA 3FI7A 4M4OA 1B7SA 2HEDA 4NHTA 1GWDA 1WQOA 5D5CA 1IP6A 1VDQA 2HECA 3WW6A 4XJGA 5JENB 4NSGA 1W08A 1EQ4A 4OWAA 2FYCA 1QUTA 1LJFA 8LYZA 1INUA 1HEQA 4WMGA 5KXTA 5LYTA 1IC5Y 1HEPA 1DQJC 2FBBA 5ILCA 3A96A 1LYOA 2DBTA 1IIZA 4HV2A 5HQ1A 4G4CA 4CFPA 1QIOA 2XJWA 4N1EI 3AGGG 1C7PA 1IC4Y 3CB7A 2D91A 3AZ4A 4I0CA 1JSFA 4NG1A 4II8A 2YBLA 2DQAA 3A6CY 2HTXA 4TUNA 4LYZA 1AM7A 1TEWA 1VATA 4KT3A 4DD2A 4ETDA 1WQQA 5IELA 2BQJA 5A3EA 3K3TA 4HJZA 3TXGA 5L9JA 1YAQA 4WM6A 1BWJA 4WOAA 1B7LA 2LZ2A 3TXEA 5I53A 4LFPA 3WUNA 1B7NA 1D6QA 1IC7Y 1JUGA 4OWHA 1J1OY 1LZ4A 1LSPA 4G4HA 4NGLA 1LMCA 5DLAA 3B0IA 2DQCY 2D4KA 3WUMA 1IWZA 5HMJA 1WVUA 2ZIJA 3KAMA 1JKDA 4NHIA 3AZ5A 3WXUA 3WVXA 3D3DA 3EBAB 1DPWA 1LHJA 1LHKA 3TXIA 1CNSA 1LCNA 2YBHA 4HTKA 1FLYA 1UC0A 4N5RA 4WLYA 1J1PY 5DL9A 3A93A 4U3XB 1BB5A 1PS5A 1F10A 1WQPA 3WU8A 1C43A 2Z2FA 3AZ6A 1GEVA 1LZCA 4LGKA 2Z18A 3A94A 2WARA 3ATOA 3E3DA 5EBHA 5KXSA 5K7OA 2DQEY 1TDYA 1HFZA 5LA5A 1G7JC 4LZTA 1GBSA 1B7RA 4YM8A 5F14A 5LVGA 1JEFA 3IJVA 4WO9A 4DDCA 1LHMA 5F9XA 1FKVA 1IWUA 1HMLA 1ZVHL 4H91A 4H9HA 1JTTL 1BB4A 4E3UA 1CKFA 4NHSA 1YKYX 5HLLA 154LA 1LMTA 1HENA 1XGTC 2CJLA 4GLAA 5DN5A 3CSZA 3A67Y 5KKJA 2HEEA 1GFVA 4D9ZA 3CT1A 1KXXA 2LYOA 1JJ3A 2BQCA 1LJ3A 2ZNWY 3B6LA 4RW1A 3LYZA 5LVJA 1EL1A 134LA 2IHLA 4DDBA 2LYMA 5KXWA 1GFTA 2NWDX 3EMSA 1GF9A 4QY9A 3W6EA 1IOSA 7LYZA 1BWHA 1JTOL 2DQIY 1HNLA 2I26L 5FDJA 6LYTA 1N4FA 1RJCB 1REZA 4HTNA 3A92A 1LZRA 4ETBA 1LZ1A 1ZMYL 2BQKA 2BQHA 1GAZA 132LA 2DQJY 1IY3A 4G49A 3CSRA 4XENA 1AT6A 1GD6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5E9RA 1LMQA 1DKJA 4XJHA 1IP7A 3GXKA 3AJNA 3LHMA 1FDLY 1W6ZA 1GFRA 3TMUA 4J7VA 1LJGA 2F32A 4WLXA 1LYEA 2YBJA 4WL7A 1IP1A 1IR8A 3A6BY 1G7MC 125LA 114LA 1CTWA 2YSSC 5KXKA 1OP9B 4IASA 1UIHA 1GFHA 2AUBA 4GCEA 2EIZC 230LA 3L2XA 178LA 1GE0A 2RAZX 2OTZX 1L10A 3SP3A 4ARQA 4ARQB 1IP4A 4PHIA 1T8GA 1QTEA 3TXJA 4PJ2C 236LA 4NHQA 2BQGA 1PZYA 4N1CC 2ZWBA 2BQOA 4BADA 1YL0X 249LA 1I20A 3BKVA 1L72A 4W58A 1GEZA 1HEMA 3LYTA 1P6YA 1UIBA 1V7TA 3ZEKA 3CDQA 4Z98A 3C83A 4EPIA 3LZMA 1C6QA 252LA 145LA 161LA 4HPIA 1QTKA 2O7AA 1PQIA 1LLHA 5HMVA 3EXDA 1B5WA 3AB6A 2VB1A 3DNAA 1QTCA 4X3BA 4C3WA 3DMVA 4OW1A 2BPUA 2A7FA 4XADA 4DYGA 4XJBA 1IR9A 4DKLA 2BQLA 3ATNA 4NGKA 1NHEA 4Z3MA 1LZBA 5LYZA 1GB0A 4IAPA 1UUZC 180LA 4OWCA 1BB6A 1LMPA 4LDEA 3QNGA 3B72A 1QTVA 1TCYA 219LA 2XBRA 1C6TA 1C6DA 1SX7A 4H94A 1LSGA 1QS5A 1GF6A 1HERA 1WQRA 2YBIA 1OWYA 173LA 1QSAA 1DYFA 3HU9A 1JJ1A 1DZBX 1CV5A 3IJUA 1L83A 3T36A 160LA 1D0LA 4TX7A 2XTHA 2HUMA 5FCPA 4LYOA 1A4VA 1LOZA 3WH1A 3HTGA 183LA 3WULA 1LZ9A 1L28A 5L3HA 2Q9EA 1OVKA 3NYAA 1C6NA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5E9R A;  1LMQ A;  1DKJ A;  4XJH A;  3M3U A;  3WXT A;  3WUA A;  1IP7 A;  193L A;  1GXV 2;  5B07 A;  1HHL A;  4H8Z A;  1GE1 A;  1RE2 A;  3GXK A;  3WU7 A;  3AJN A;  4G9S A;  5B06 A;  1WVV A;  3LHM A;  1FDL Y;  1W6Z A;  2BQM A;  3AW6 A;  3G3B B;  1GFR A;  4NSH A;  3TMU A;  4OOT A;  4J7V A;  3A3Q A;  1UIF A;  1WQM A;  1GHL A;  2RSC A;  1LJG A;  2HU3 A;  1BVK C;  2H9J A;  1IWX A;  1VED A;  4WLX A;  5DN4 A;  2YBJ A;  1YAP A;  4WL7 A;  1H87 A;  1REX A;  1G7H C;  3CSQ A;  4GLV A;  4H9F A;  1IP1 A;  1Z55 A;  4B4I A;  1FBI X;  208L A;  1IR8 A;  3A6B Y;  4IAT A;  1NBY C;  4LT1 A;  3TMV A;  3CQL A;  1OUE A;  5C6J A;  1G7M C;  2BAA A;  4WG1 A;  4BS7 A;  3TMW A;  2YSS C;  6LYZ A;  1OP9 B;  5KXK A;  4IAS A;  1UIH A;  4W96 A;  4DDA A;  4DD0 A;  1GFH A;  135L A;  2ZYP A;  5LXW A;  2AUB A;  2F2N A;  4GCE A;  4H1P A;  2EIZ C;  4HSF A;  4OOO A;  4CGE A;  1LSB A;  1OQM A;  1YAM A;  5LA8 A;  1GE0 A;  4IJ4 A;  3SP3 A;  1ZV5 L;  4DD1 A;  1I56 A;  1GE2 A;  3W3E A;  4NGV A;  3T6U A;  4AGA A;  1IWT A;  2DQF C;  3G3A B; 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 1LMC A;  5DLA A;  3B0I A;  2DQC Y;  2D4K A;  3WUM A;  1IWZ A;  5HMJ A;  1WVU A;  2ZIJ A;  3KAM A;  1JKD A;  4NHI A;  3AZ5 A;  3WXU A;  3WVX A;  3D3D A;  3EBA B;  1DPW A;  1LHJ A;  1LHK A;  3TXI A;  1CNS A;  1LCN A;  2YBH A;  4HTK A;  1FLY A;  1UC0 A;  4N5R A;  4WLY A;  1J1P Y;  5DL9 A;  3A93 A;  4U3X B;  1BB5 A;  1PS5 A;  1F10 A;  1WQP A;  3WU8 A;  1C43 A;  2Z2F A;  3AZ6 A;  1GEV A;  1LZC A;  4LGK A;  2Z18 A;  3A94 A;  2WAR A;  3ATO A;  3E3D A;  5EBH A;  5KXS A;  5K7O A;  2DQE Y;  1TDY A;  1HFZ A;  5LA5 A;  1G7J C;  4LZT A;  1GBS A;  1B7R A;  4YM8 A;  5F14 A;  5LVG A;  1JEF A;  3IJV A;  4WO9 A;  4DDC A;  1LHM A;  5F9X A;  1FKV A;  1IWU A;  1HML A;  1ZVH L;  4H91 A;  4H9H A;  1JTT L;  1BB4 A;  4E3U A;  1CKF A;  4NHS A;  1YKY X;  5HLL A;  154L A;  1LMT A;  1HEN A;  1XGT C;  2CJL A;  4GLA A;  5DN5 A;  3CSZ A;  3A67 Y;  5KKJ A;  2HEE A;  1GFV A;  4D9Z A;  3CT1 A;  1KXX A;  2LYO A;  1JJ3 A;  2BQC A;  1LJ3 A;  2ZNW Y;  3B6L A;  4RW1 A;  3LYZ A;  5LVJ A;  1EL1 A;  134L A;  2IHL A;  4DDB A;  2LYM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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