1REZA

Human lysozyme-n-acetyllactosamine complex
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Origin of carbohydrate recognition specificity of human lysozyme revealed by affinity labeling.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
total genus 48
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1rezA00
1LJKA 3FE0A 3CT5A 1IWWA 1GB5A 4IATA 1UCOA 3WH1A 4DDCA 1D9UA 4XJFA 1JPOA 1J1XY 1LYYA 3WW5A 4LYTA 4XJHA 1OUGA 5HQ1A 2H9JA 3CT0A 2ZQ4A 4ML7A 1LAAA 1EL1A 4N1CC 4MCKA 1SQ2L 1ZVHL 2BQMA 1LZ8A 1OUEA 2D6BA 3AGGG 1DKKA 1IOTA 1FKVA 1QIOA 2BQGA 3AYQA 1IP1A 1Z55A 4H9EA 2Z39A 5C6LA 4NHTA 1C45A 2XBRA 4GLVA 1UBZA 3SP3A 2HU1A 3TMVA 2EPEA 2FYDA 1IWUA 1LSPA 2H5ZA 4HJVA 4YEOA 4DC4A 5C6IA 4ETDA 2D4IA 1SLYA 2C8OA 1BB4A 4IJ4A 1OUCA 2C8PA 5E4PA 4M6DA 1LZGA 4TUNA 4LZTA 3J6KA 4ETEA 1LZ9A 1JJ0A 2XJWA 5B07A 1VDQA 1B7NA 2BQOA 5B1GA 2ZQ3A 4BADA 1HEOA 3TXDA 3LYMA 5B59A 3LYZA 1OUHA 4CGEA 2LYOA 3WXTA 5HMVA 1IVMA 1YL1X 4ZEEA 2DBTA 1CJ6A 5APDA 1XGTC 1EQ5A 3EMSA 4OWEA 4IASA 3HBHA 1IOQA 5L3IA 3ATOA 2ZILA 4HSFA 1TCYA 4LYMA 1C7PA 3D9AC 4NWHA 1LZAA 4J0LA 3A6BY 2HEBA 1GBOA 4WMGA 4WG1A 3WUNA 2XBSA 4H9IA 1LOZA 2HEEA 5B1FA 1VAUA 3WVYA 4Z3MA 5C6JA 5T3FA 5IELA 1B7QA 4W96A 4NHPA 2XTHA 1VEDA 2MEFA 1LTMA 3ULRA 4DD1A 5KKJA 3F6ZA 4A7DA 1LZYA 1GB8A 4R0FA 1QQYA 2MEGA 4OWBA 1GFVA 1HEPA 1OUJA 3P4ZA 1YQVY 4GCBA 3LZTA 4PGJB 3RU5A 2DQDY 2YDGA 4WLYA 4HTKA 1LHHA 3N9CA 3LN2A 1LCNA 5FHWA 5KXYA 4DYGA 2W1YA 2Y8PA 4KXIA 3B0OA 1YAPA 4GCEA 1LZNA 3TXIA 1A4VA 1G7LC 2D91A 2I25L 4TX7A 3AZ6A 4MSTA 2MEAA 1G7MC 1B2KA 194LA 5FEKA 2BAAA 1IWXA 4H8ZA 1LMPA 1TDYA 5EBHA 1DI5A 2FBBA 1UIHA 3A34A 1LSBA 1T3PA 5KXZA 1GF9A 4HPIA 4LFPA 1YAOA 4ET9A 3J4GA 4WM5A 4WG7A 2B5ZA 2DQAA 3P68A 4NGJA 5KXWA 1CJ8A 1BWHA 1GE3A 1H6MA 1LZ4A 1RFPA 1ZVYB 1B7SA 1AT6A 1LSDA 4NEBA 1TBYA 1WQPA 4XJGA 1GE1A 4HTQA 2HTXA 2YBIA 4GN5C 2CJLA 5DL9A 5I4YA 5K7OA 1IP3A 4ETCA 4NGIA 4PRUA 3CB7A 1LJFA 3W6FA 3A8ZA 4B4JA 1B5VA 1NBYC 1UIFA 2A7DA 5AMYA 4BAFA 4GCCA 3B0KA 1GF0A 3G3BB 1LMQA 5KXNA 1LZ6A 2MEBA 1WQOA 3WXUA 1LHKA 4LT1A 3W6AA 1HFYA 4KPMA 4D9ZA 4NGVA 1B5UA 1UC0A 1GBWA 2DQCY 4H9HA 153LA 4H9CA 4B49A 1F10A 1GB3A 1GXXA 2YSSC 1B5YA 1GF5A 1HHLA 1UIDA 4W94A 1V7TA 1XFPL 3D3DA 3IJVA 3TXHA 4QDNA 1BB5A 4HP0A 4TWSA 1HSWA 1GE2A 1OUFA 1UACY 1OP9B 1JIYA 1HMKA 1FKQA 1IOCA 3LHMA 1V7SA 4NGOA 4HV1A 4I0CA 2D4JA 1JSEA 4WM1A 3WU9A 4RW2A 1J1OY 2CDSA 1GEVA 1VDSA 1GEZA 4DD0A 154LA 4UWNA 5L3HA 1GWDA 4RLMA 1IR8A 3WPJA 3A3RX 2MECA 207LA 1REXA 3TXKA 5KXKA 3A90A 4DWXA 1I1ZA 2YVBA 4DT3A 5KXRA 4NGKA 2MEHA 3P66A 1REZA 3A67Y 1NQIA 1QUSA 4ET8A 4NG1A 1FN5A 4NFVA 1GBSA 4X3BA 5IHGA 2BQNA 2LZTA 4H90A 3OJPA 5F9XA 3IWRA 3RT5X 1NHEA 4WM6A 4RLNA 1BB7A 2F2NA 1HC0A 1ZV5L 1JITA 3A96A 4OOOA 1LJJA 1HMLA 1GFAA 4GN3A 4QY9A 1UIGA 4NY5A 4OWCA 1B7OA 1I56A 1REMA 1YILA 3WPKA 1HEMA 1XGQC 3EBAB 3WW6A 4ETBA 1BGIA 1GB7A 1OUAA 5APCA 3B72A 4H1PA 1JEFA 4KT3A 1EQ4A 1KIRC 4XADA 3W6CA 4EOFA 1INUA 5LAGA 2Z18A 1YKZX 2Z2EA 1IWVA 1GPQC 1NF5A 1ALCA 1RCMA 1BVKC 1GB0A 2Z38A 4G4CA 4G4HA 4LT3A 5DN4A 1GFHA 1O23A 1IORA 1WVVA 5I4XA 4YEMA 1B0DA 1ZMYL 2FBDA 2DQHY 5FSTA 3T6UA 2X0AA 1MELL 1F6RA 1W6ZA 3KAMA 5F81A 1JSFA 1DPWA 1LZRA 3HBDA 3A92A 2LZ2A 1KIQC 1LSEA 4CFPA 2LYMA 1C10A 1IR9A 4LYCA 4N1EI 2W1MA 1KXWA 1C46A 3IJUA 1QSWA 1RI8B 1EQEA 1D0KA 4CFOA 2BQDA 1RE2A 2G4PA 4PHIA 1DZBX 1PZYA 4TSBA 3QNGA 1NMMA 1DI3A 3WYHA 1LZDA 2ZNWY 1B5WA 1H87A 4HTNA 9LYZA 5LXWA 4QGZA 1CJ7A 1LHLA 1YL0X 3A95A 1HENA 5LVGA 3T36A 5FCPA 2F4GA 4QEQA 1LSNA 5ILCA 2A7FA 1JJ1A 1DPXA 1LZTA 1GFRA 1F0WA 2BQAA 1LKRA 2HU3A 4G4BA 4N0JA 4WLTA 5LA8A 4N5RA 208LA 3EXDA 2BQKA 1TEWA 2ZYPA 5LA5A 5IDDA 3CSZA 5ILFA 4OWHA 2Z2FA 4H9AA 4Z98A 1VDPA 1HFXA 4XYYA 4CJ2A 4RW1A 4YOPA 1I20A 1HF4A 4I8SA 2W1XA 1QTKA 4EMNA 1NBZC 3HFMY 2NWDX 1YKYX 3WULA 3M3UA 1LZEA 1GF8A 1XGPC 3WMKA 2MEEA 3MGWA 2ZWBA 4H8YA 1LMNA 1KXYA 2BQIA 3P64A 2IFFY 5APFA 2WARA 4U3XB 1B5ZA 1GE0A 5FELA 5F14A 1N4FA 1XEIA 1RJCB 1GE4A 1LKSA 3B0IA 3AJNA 1GF3A 3AW6A 2YBMA 1UIBA 1NDMC 1GB6A 3B6LA 1LPIA 1LSFA 1IP4A 1JKAA 1FLYA 1UIAA 1CKGA 4XJBA 1FDLY 4GCDA 4LT0A 5KXPA 4NHSA 1LHJA 4NSIA 5LIOA 1WVUA 4WLDA 1E8LA 1VATA 1JUGA 3HBEX 4WL6A 4DDBA 4NSGA 2HEDA 1PS5A 1WTMA 2RSCA 4NSHA 5DN5A 1BHZA 5KXLA 1OUBA 1JTTL 2D4KA 2IHLA 1FBIX 4LYOA 3EO5A 3A6CY 4HV2A 4N9RA 5HNLA 1HEWA 3RNXA 2EQLA 1HEQA 3VWOA 1JWRA 4KL7A 4E3UA 134LA 3BKHA 1XEKA 1UUZC 2BQBA 2DQJY 5II3A 1DXJA 4J1AA 2F30A 1LJHA 1BWIA 1UIEA 3ATNA 3CSQA 4LYBA 1DI4A 4DDAA 5KXMA 4P2EA 1NWGA 5DM9A 1LSAA 5I5QA 2DQGY 2BQJA 3AGIA 1JTOL 4YENA 1VDTA 1IWZA 3ZVQA 2GV0A 3FI7A 3WVXA 1GXV2 1JHLA 4TSCA 2VB1A 4XJIA 1JKDA 1JTPL 4OWAA 2Z12A 1LZSA 5KJ9A 1HNLA 3A94A 1CKHA 5LVKA 1JKBA 3AW7A 1GHLA 1LYOA 1QUTA 193LA 1GFUA 2BQLA 4H9FA 4NWEA 4G9SA 3CSRA 1LMCA 1YKXX 1BVXA 4UWUA 5LVIA 3ZEKA 5B05A 3OK0A 1B7RA 132LA 1HELA 1IX0A 5D5FA 5LAFA 7LYZA 5KXTA 4L41A 1B7LA 1T6VL 1D0MA 4LT2A 3TMUA 5J7CA 2I26L 1F6SA 1G7HC 1IP5A 1B9OA 4NIJA 1B7PA 2H9KA 1D6PA 3WU8A 2FYCA 4ZFPA 1OQMA 3QY4A 4NHQA 2YBNA 4WO6A 4H9BA 5LYTA 5F9UA 2G4NA 5I54A 1D0LA 1GFEA 1LJ3A 2BQCA 1G7JC 1CJ9A 1UA6Y 2BLXA 4DD3A 2ZIJA 1WQMA 1OUDA 1IC5Y 2PC2A 1LJEA 4H93A 1YROA 1LSGA 2N5ZA 1GDWA 4PJ2C 3WUAA 4O34A 4AXTA 3WPLA 1C08C 1IEEA 1QDTA 1GDXA 1GF6A 1QTEA 2DQFC 2ZIKA 2G4QA 5HMJA 3TMWA 1AM7A 1XGUC 2CWIA 3LZ2A 1JJ3A 2Z37A 3BKVA 2YBJA 1LMOA 3TXFA 5I4WA 4NGLA 3GXKA 1AKIA 4TTDA 1HERA 4WM2A 1VFBC 4WO9A 2EKSC 1IR7A 3WL2A 4WLXA 2DQEY 6LYTA 1LYZA 2HEFA 133LA 3AZ7A 4G49A 1IWYA 3A91A 1QSAA 5LVHA 4NHIA 1TAYA 2BQHA 4R6CA 4B4EA 1IIZA 1A2YC 1GD6A 4XN6A 4C5FA 5E9RA 2LYZA 5I53A 1GAZA 1DQJC 4H92A 5KXXA 1GBZA 5FDJA 5HLLA 4BS7A 1J1PY 3G3AB 2YBHA 3K3TA 4WOAA 1WQQA 1AT5A 5F16A 1IY4A 2ZNXY 1LHMA 4PPOA 1LJNA 5L9JA 3RW8A 4OOTA 4NSJA 1GBYA 1XEJA 3AB6A 2EIZC 1YIKA 3W6EA 4FJRA 1LHIA 4B4IA 4NGWA 1XGRC 4BAPA 1KIPC 3TXBA 2LHMA 4OW1A 1OUIA 2BQFA 2AUBA 3A93A 2BPUA 1JISA 4WM4A 1LJ4A 1BQLY 5A3EA 5D5CA 1GBXA 1WQNA 4M4OA 4WM3A 1IP7A 1CKDA 4DD7A 1NDGC 1LZCA 4HJZA 4LYZA 2F4AA 1CNSA 4Z46A 1REYA 5LINA 4HJYA 1XSFA 5DLAA 1GAYA 1HSXA 3CQLA 3AZ4A 1IY3A 2YBLA 3WUMA 3GXRA 4ANRA 1QDRA 3AZ5A 1LSYA 4H94A 1LSZA 4H8XA 1W08A 1IC4Y 1B7MA 3AGHA 3P65A 1GF7A 2Z19A 4YM8A 1FLWA 5M1YA 3W6DA 4C3WA 1LZ5A 5KKIA 1GFJA 5LVJA 3RZ4A 1D6QA 4NGZA 1LMAA 5LYZA 6LYZA 3QE8A 5JENB 4DD2A 1AZFA 4II8A 4GLAA 2BLYA 3A3QA 4RDSA 1FLUA 1LYSA 3TXEA 1GFTA 4ETAA 2HEAA 4UWVA 4XJDA 1BB3A 5B06A 4LFXA 1LJIA 3N9EA 4GCFA 4ZIXA 4XENA 4AGAA 1IP6A 1LMTA 3LYOA 1NKHA 2HECA 3W3EA 1LZBA 5KXSA 4B1AA 5A3ZA 1BB6A 1IC7Y 1DKJA 1MLCE 4LGKA 3TXGA 4B0DA 8LYZA 4HPEA 1GFKA 1IO5A 2DQIY 2I6ZA 4YF2A 3TMXA 2HUBA 1GFGA 4J1BA 1YANA 5KY1A 2Q0MX 2W1LA 1GF4A 3ZVQB 4CHXA 2DKVA 2CGIA 1G7IC 4DD9A 1CKFA 3CT1A 4NGYA 2MEIA 3TXJA 1LZ1A 1YAQA 4WL7A 5HNCA 4NG8A 1GB9A 1GB2A 1HFZA 4PRQA 135LA 1YAMA 3LYTA 5KXOA 4H91A 1IOSA 1B5XA 5LYMA 1IP2A 1LSCA 1UICA 2BQEA 1C43A 1FLQA 3WU7A 1LSMA 1WTNA 1CKCA 3W6BA 1JKCA 2MEDA 4GN4A 4N8ZA 1KXXA 1LJGA 5APEA 2ZYCA 4FDYA 1BWJA 1P2CC 3M18B 1WQRA 4MR1A 1IWTA 3N9AA 4Z41A 4J7VA 3E3DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HDEA 1L01A 1GB5A 3HTBA 4XJFA 3WW5A 4LYTA 4LDLA 4XJHA 1LAAA 2D6BA 1DKKA 3AYQA 1C68A 1LYHA 3L2XA 2XBRA 1P5CA 2EPEA 4HJVA 2H5ZA 1LSPA 4DC4A 6LZMA 5C6IA 3DN2A 1L19A 4IJ4A 2C8OA 1OUCA 1QUHA 4TUNA 151LA 4BADA 226LA 5B59A 3LYZA 1YL1X 2DBTA 1L0KA 5APDA 3EMSA 1IOQA 1QSBA 138LA 4LYMA 1C7PA 4J0LA 2HEBA 1P46A 4WMGA 3RZEA 161LA 4WG1A 5T3FA 2XTHA 1L57A 3ULRA 1L60A 5KKJA 2MEGA 1L35A 1HEPA 3P4ZA 1YQVY 2DQDY 177LA 1LHHA 2Y8PA 4KXIA 3B0OA 1L90A 3CDTA 3SB5A 4MSTA 2MEAA 1L62A 5FEKA 4DKLA 2B6YA 3A34A 245LA 5KXZA 119LA 3J4GA 2B5ZA 1RFPA 1LZ4A 1TBYA 155LA 3FA0A 1IP3A 4ETCA 1QSQA 3A8ZA 1L15A 1P56A 1L18A 1CU3A 3G3BB 1L70A 156LA 1WQOA 258LA 1LHKA 4KPMA 1QUGA 4B49A 1L37A 1KY0A 1F10A 1L41A 1L71A 115LA 1HHLA 1UIDA 220LA 2LZMA 4TWSA 1UACY 1OP9B 4I7LA 1IOCA 2B6TA 2D4JA 3C81A 1JSEA 1LYJA 4WM1A 3HH6A 1VDSA 1GEZA 4DD0A 2OEAX 1L40A 3A90A 4DWXA 1I1ZA 1L11A 2MEHA 1REZA 1QUSA 4ET8A 4NG1A 1C6MA 2BQNA 4H90A 125LA 3NY9A 1HC0A 2F2NA 216LA 1LJJA 1HMLA 1GFAA 4QY9A 3HU8A 3WW6A 1BGIA 3B72A 4XADA 1EQ4A 1QT3A 1YKZX 1GPQC 1ALCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LJK A;  3FE0 A;  3CT5 A;  1IWW A;  1GB5 A;  4IAT A;  1UCO A;  3WH1 A;  4DDC A;  1D9U A;  4XJF A;  1JPO A;  1J1X Y;  1LYY A;  3WW5 A;  4LYT A;  4XJH A;  1OUG A;  5HQ1 A;  2H9J A;  3CT0 A;  2ZQ4 A;  4ML7 A;  1LAA A;  1EL1 A;  4N1C C;  4MCK A;  1SQ2 L;  1ZVH L;  2BQM A;  1LZ8 A;  1OUE A;  2D6B A;  3AGG G;  1DKK A;  1IOT A;  1FKV A;  1QIO A;  2BQG A;  3AYQ A;  1IP1 A;  1Z55 A;  4H9E A;  2Z39 A;  5C6L A;  4NHT A;  1C45 A;  2XBR A;  4GLV A;  1UBZ A;  3SP3 A;  2HU1 A;  3TMV A;  2EPE A;  2FYD A;  1IWU A;  1LSP A;  2H5Z A;  4HJV A;  4YEO A;  4DC4 A;  5C6I A;  4ETD A;  2D4I A;  1SLY A;  2C8O A;  1BB4 A;  4IJ4 A;  1OUC A;  2C8P A;  5E4P A;  4M6D A;  1LZG A;  4TUN A;  4LZT A;  3J6K A;  4ETE A;  1LZ9 A;  1JJ0 A;  2XJW A;  5B07 A;  1VDQ A;  1B7N A;  2BQO A;  5B1G A;  2ZQ3 A;  4BAD A;  1HEO A;  3TXD A;  3LYM A;  5B59 A;  3LYZ A;  1OUH A;  4CGE A;  2LYO A;  3WXT A;  5HMV A;  1IVM A;  1YL1 X;  4ZEE A;  2DBT A;  1CJ6 A;  5APD A;  1XGT C;  1EQ5 A;  3EMS A;  4OWE A;  4IAS A;  3HBH A;  1IOQ A;  5L3I A;  3ATO A; 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 3WUM A;  3GXR A;  4ANR A;  1QDR A;  3AZ5 A;  1LSY A;  4H94 A;  1LSZ A;  4H8X A;  1W08 A;  1IC4 Y;  1B7M A;  3AGH A;  3P65 A;  1GF7 A;  2Z19 A;  4YM8 A;  1FLW A;  5M1Y A;  3W6D A;  4C3W A;  1LZ5 A;  5KKI A;  1GFJ A;  5LVJ A;  3RZ4 A;  1D6Q A;  4NGZ A;  1LMA A;  5LYZ A;  6LYZ A;  3QE8 A;  5JEN B;  4DD2 A;  1AZF A;  4II8 A;  4GLA A;  2BLY A;  3A3Q A;  4RDS A;  1FLU A;  1LYS A;  3TXE A;  1GFT A;  4ETA A;  2HEA A;  4UWV A;  4XJD A;  1BB3 A;  5B06 A;  4LFX A;  1LJI A;  3N9E A;  4GCF A;  4ZIX A;  4XEN A;  4AGA A;  1IP6 A;  1LMT A;  3LYO A;  1NKH A;  2HEC A;  3W3E A;  1LZB A;  5KXS A;  4B1A A;  5A3Z A;  1BB6 A;  1IC7 Y;  1DKJ A;  1MLC E;  4LGK A;  3TXG A;  4B0D A;  8LYZ A;  4HPE A;  1GFK A;  1IO5 A;  2DQI Y;  2I6Z A;  4YF2 A;  3TMX A;  2HUB A;  1GFG A;  4J1B A;  1YAN A;  5KY1 A;  2Q0M X;  2W1L A;  1GF4 A;  3ZVQ B;  4CHX A;  2DKV A;  2CGI A;  1G7I C;  4DD9 A;  1CKF A;  3CT1 A;  4NGY A;  2MEI A;  3TXJ A;  1LZ1 A;  1YAQ A;  4WL7 A;  5HNC A;  4NG8 A;  1GB9 A;  1GB2 A;  1HFZ A;  4PRQ A;  135L A;  1YAM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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