205LA

How amino-acid insertions are allowed in an alpha-helix of t4 lysozyme
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
165
structure length
159
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTAAKSAAAELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title How amino-acid insertions are allowed in an alpha-helix of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 159
sequence length 165
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 205lA00
3C8RA 1L44A 175LA 236LA 2B6WA 196LA 2RBRA 1L54A 2A4TA 1G1WA 125LA 1G0GA 4IAPA 1L51A 1D2YA 1L49A 3FI5A 3DNAA 1L00A 173LA 4W53A 3HTFA 2QB0B 2OU8A 2F2QA 1P64A 2HUKA 1QT3A 3EMLA 2OEAX 1L60A 1G0KA 206LA 1G0MA 119LA 168LA 2OE9X 4W58A 1OWYA 1CTWA 3NY9A 1CU5A 205LA 2LCBA 1SWZA 4EPFA 1L03A 1C6LA 1P2RA 103LA 253LA 3CDQA 110LA 1CU0A 3DMZA 4LZMA 4OO9A 4I7TA 1L11A 1C6DA 1LI2A 1C6AA 1L85A 1C6QA 1L39A 2ANVA 1KNIA 1DYDA 1LGWA 1QT5A 2CUUA 4ARQA 3SBBC 199LA 3OE9A 1L86A 155LA 4AQNA 1L32A 1CX6A 3GULA 1L94A 1QTCA 4ARQB 2O79A 141LA 1L88A 3GUNA 4W57A 1L99A 2O4WA 195LA 4I7QA 224LA 4W52A 4YX7C 1P3NA 1QUGA 1QS5A 1L17A 1L16A 1L26A 1T8GA 1OVHA 1XEPA 238LA 225LA 1ZURA 1C6HA 187LA 3FA0A 4EJ4A 1C66A 172LA 152LA 176LA 1LYIA 3UONA 1DYCA 166LA 245LA 1PQIA 4S0WA 1CUPA 1L27A 1CV3A 3GUOA 231LA 1G0JA 1L96A 1CU3A 3C7WA 1P56A 250LA 138LA 1D9WA 108LA 1L31A 2RBNA 4EXMA 3C8QA 183LA 3DKEX 164LA 3CDVA 1L20A 1L81A 189LA 1L62A 139LA 165LA 257LA 3SN6R 192LA 244LA 2RAZX 1L98A 1L34A 1C69A 1C60A 142LA 130LA 1L10A 171LA 1OV5A 262LA 214LA 127LA 1L75A 3F9LA 1LI3A 1TLAA 1CV5A 1QUDA 221LA 2ANXA 2F47A 1CV4A 1L89A 1OV7A 1G06A 4LDOA 1P7SA 1PQMA 3NYAA 2B75A 1ZWNA 260LA 1C6MA 251LA 4DKLA 4I7PA 1L50A 1CVKA 1L73A 1C6FA 181LA 1QT4A 1L66A 1QT6A 3CDOA 1L91A 1L14A 1C63A 1L64A 4EKPA 3C81A 4W54A 4GRVA 1L15A 219LA 249LA 122LA 4DAJA 229LA 1L57A 234LA 3DN6A 180LA 237LA 3ODUA 2OE7X 3CDTA 156LA 1L02A 107LA 1L61A 1L90A 3GUJA 1L93A 3GUIA 129LA 3DN0A 3HTBA 209LA 2Z6BA 2HULA 1L13A 4EKRA 1L30A 3L64A 3G3VA 2RB0X 143LA 3HT9A 4W56A 1C6BA 1G0QA 178LA 1L47A 254LA 3HH5A 191LA 228LA 4YXCA 2B6ZA 1KW7A 3LZMA 1L06A 3G3XA 1LPYA 3OE0A 5I14A 2NTGA 197LA 1G0LA 3HWLA 3GUMA 4EKQA 1LGXA 104LA 258LA 2B74A 1L04A 1D3MA 3FADA 4PK0A 1L92A 4E97A 1C61A 1PQDA 215LA 1C6KA 1CX7A 3L2XA 2OTYX 3DMXA 1LWGA 1G1VA 2O7AA 1C6TA 149LA 3SB6A 3HTDA 1L36A 1QSBA 2OU9A 1C64A 3HU8A 3JR6A 1L42A 159LA 1L01A 167LA 163LA 1OVJA 188LA 1L25A 223LA 1L52A 240LA 4ARMA 4W51A 1L67A 1QTHA 1SX2A 222LA 1D3FA 7LZMA 150LA 1L97A 1C6CA 1KS3A 226LA 4YXAC 1P6YA 6LZMA 1L07A 1KY1A 1L71A 1SSWA 3VW7A 2B6TA 1C6JA 109LA 1I6SA 1SX7A 2B6YA 4EKSA 3NY8A 1LWKA 1D3JA 2OU0X 1DYEA 186LA 1PQKA 1C68A 140LA 3HT7A 1L95A 1C6PA 3CDRA 252LA 1LYJA 1L76A 259LA 1L82A 169LA 1T8FA 1K28A 3GUKA 4PJZA 4ARLA 1QUOA 3C8SA 1EPYA 4GBRB 4I7RA 1D2WA 1QT7A 3HH3A 2OTZX 1L0KA 1L33A 185LA 3SB5A 3DN2A 1L79A 1QT8A 1L87A 2Q9EA 1ZYTA 3D4SA 2B6XA 1L80A 1JQUA 1L83A 2RBOA 4EPIA 1L28A 232LA 1XJUA 3PBLA 4ARPA 2RB1X 2HUMA 1L23A 1QUHA 148LE 3SB9A 1L63A 1LYGA 1L40A 1CU2A 1L46A 1LGUA 4I7NA 1QTDA 233LA 3HUAA 243LA 1P36A 170LA 3C7ZA 3V2YA 2RBSA 161LA 1OWZA 1QSQA 1L45A 3HH6A 2F32A 5LZMA 1L53A 1L18A 242LA 1C62A 111LA 1OVKA 174LA 1L22A 145LA 1L58A 4I7MA 1PQJA 115LA 1JTNA 1LYFA 1C65A 4I7JA 4LDEA 3HTGA 2NTHA 4W59A 4DJHA 1T97A 3C83A 1C6GA 3DMVA 2RH1A 1P5CA 3SB7A 1L48A 1CUQA 151LA 1L0JA 210LA 227LA 1LW9A 3OE8A 126LA 112LA 241LA 1DYBA 256LA 2B70A 1L55A 230LA 1OYUA 3HUQA 1JTMA 2LC9A 1KW5A 1CV0A 255LA 4I7SA 4I7OA 1P2LA 1G07A 3HDEA 1NHBA 4K5YA 3HU9A 3C7YA 1L77A 1CV1A 1P37A 113LA 1L21A 1C6IA 147LA 1L65A 1L68A 1LYEA 3K2RA 2B7XA 190LA 1L24A 1L72A 217LA 2L78A 3F8VA 1L09A 3DN3A 1C6EA 3SBAA 3C80A 1DYFA 1DYGA 211LA 3QAKA 1PQOA 1C67A 158LA 2Q9DA 2RBPA 1L41A 4ARMB 118LA 137LA 4W55A 2B72A 1D3NA 1T8AA 4LDLA 4ZPUA 213LA 114LA 1L74A 3RUNA 1LLHA 1L37A 2B73A 102LA 246LA 3OE6A 3HUKA 1CV6A 157LA 1L35A 261LA 1L19A 3RZEA 182LA 248LA 3DN1A 200LA 1B6IA 218LA 1L69A 128LA 2IGCA 1L56A 3V2WA 3G3WA 3HH4A 4I7KA 1L59A 120LA 1QTZA 2QARC 3PDSA 247LA 3GUPA 198LA 212LA 1C6NA 1LYHA 1QS9A 144LA 1L43A 4ARJA 1DYAA 3HT6A 1L08A 1LI6A 3DN4A 177LA 1L12A 1L84A 1L29A 1L05A 3SB8A 1SSYA 235LA 1WTHA 1T6HA 3HT8A 1L70A 1KY0A 216LA 2OE4X 201LA 2RB2X 1LYDA 1P46A 131LA 160LA 184LA 1CU6A 220LA 2RAYX 3HDFA 1SWYA 1QTBA 2RBQA 1QTVA 1XJTA 162LA 239LA 146LA 123LA 2LZMA 3C82A 3DN8A 1G0PA 1L38A 4I7LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHXA 4A7DA 1IO5A 1NBZC 2VB1A 5HMJA 196LA 3WXTA 4TWSA 3G3BB 1L54A 1G7HC 3CQLA 1YL1X 1ZMYL 1GB3A 125LA 3AZ7A 1G0GA 1B7OA 2ZNWY 2IFFY 2BQNA 3FI5A 1LYOA 2DQGY 4W53A 2QB0B 133LA 1L60A 1D9UA 3MGWA 2OE9X 4QGZA 5KXWA 3NY9A 1FN5A 205LA 4NGOA 4EPFA 3CDQA 2PC2A 1C6DA 3ZEKA 1L39A 1RE2A 4MCKA 3LYOA 1LYSA 3A3QA 2CUUA 4GCEA 1LPIA 4ARQA 1GB6A 2BQOA 4NHSA 4DDBA 4H9AA 4AQNA 1CJ8A 4R6CA 1ZVYB 4N9RA 1AKIA 3WULA 4ARQB 1WQRA 141LA 4HJVA 5LVHA 1L99A 2O4WA 1DI3A 1QUGA 5A3EA 1LZAA 1L26A 1INUA 1FKVA 1YKZX 4XYYA 1ZURA 3FA0A 172LA 3UONA 1DYCA 1IWXA 4S0WA 4I8SA 231LA 4DD2A 1D9WA 1XFPL 1L62A 2HTXA 1OUAA 257LA 244LA 1C69A 4NHIA 1OV5A 3BKHA 3F9LA 1OV7A 2W1MA 2BLYA 1GB0A 5LAGA 1P7SA 5FELA 3NYAA 5F9UA 1B7NA 1CKDA 4GLAA 1G7LC 4I7PA 1L50A 1CVKA 2BQIA 4Z46A 1L66A 3AGGG 1GFVA 4IATA 4EKPA 2D4JA 3C81A 4J1BA 1L15A 2CJLA 219LA 1L57A 180LA 237LA 3ODUA 4NWEA 5JENB 1GEVA 2F2NA 3CDTA 1WQPA 3W6DA 1L61A 5DM9A 3GUJA 2BQAA 3TMXA 129LA 3HTBA 1HF4A 2Z6BA 4HJYA 1XGUC 5LYZA 5B59A 1L47A 191LA 4HP0A 2B6ZA 2HU1A 5KXPA 5I14A 4XJDA 197LA 1G0LA 3TMVA 3GUMA 4EKQA 3AJNA 104LA 1JEFA 2B74A 1D3MA 4MR1A 4BAFA 1LZSA 4GN4A 1G7IC 4WOAA 1FDLY 4BAPA 2HEFA 1C6TA 1NHEA 149LA 1B5XA 4OWCA 1QSBA 1C64A 3HU8A 159LA 2BAAA 1JKAA 223LA 2ZIKA 1L52A 4ARMA 1L67A 1YL0X 3WVYA 2ZIJA 150LA 4BS7A 1GFKA 4GCFA 4H91A 226LA 6LZMA 3LHMA 2B5ZA 5C6LA 1C6JA 2EKSC 2MEDA 1IVMA 1LHMA 207LA 1SX7A 3NY8A 1D3JA 3P64A 1LMNA 1LZ8A 1BVKC 1HFYA 5B05A 5KXTA 3TXEA 3HT7A 1L95A 1C6PA 4H9EA 169LA 1T8FA 4CJ2A 4H92A 1UIBA 2LZ2A 4HPIA 4ARLA 3IJVA 5I54A 1IWZA 1GFRA 4H93A 3HH3A 1HEPA 2OTZX 5ILCA 1UACY 1L33A 4NEBA 3SB5A 1D0MA 3A90A 4H9IA 2DQFC 5LVGA 3D4SA 2B6XA 1LHKA 1LSCA 4G4BA 4ARPA 3PBLA 2RB1X 3SB9A 148LE 1LYGA 1XGRC 1LGUA 2AUBA 4H8YA 3N9AA 1LSEA 2I26L 1LMQA 1WTNA 3A91A 1HC0A 4WO6A 4KT3A 2Y8PA 1YQVY 2RSCA 1L53A 1L18A 2FYCA 111LA 174LA 1B9OA 145LA 2DQEY 3W6CA 2W1XA 115LA 4LYTA 1LYFA 4H9HA 2NTHA 2ZNXY 1GF6A 5I4XA 4DJHA 5B1GA 5E9RA 1OQMA 1LZYA 1P5CA 3SB7A 2LYZA 1Z55A 210LA 4LT0A 3WL2A 4XJFA 1CJ9A 126LA 1BVXA 1LYZA 5KKJA 2LC9A 1G07A 1JIYA 1NHBA 3WU8A 1GE2A 3OJPA 1GPQC 1C6IA 1XSFA 3A95A 1UIFA 1LZ1A 5KXXA 4GCBA 5LXWA 1GD6A 190LA 1LHIA 2L78A 3B0IA 5FEKA 1C6EA 1IIZA 4LYOA 1G7MC 3IJUA 1B5UA 1DYGA 1C67A 158LA 1GFJA 1LSAA 2B72A 1T8AA 4LDLA 1B0DA 114LA 1LLHA 1TCYA 2B73A 1LZRA 2F4GA 1IP3A 261LA 4ETEA 1NBYC 248LA 1REMA 3TXKA 1L69A 4NGVA 4CFPA 1LJ4A 3HH4A 4I7KA 1L59A 120LA 247LA 3AW7A 212LA 2Z12A 3RZ4A 4ARJA 3HT6A 4ANRA 3W6AA 1L29A 1OUGA 2A7FA 1SSYA 1WTHA 1B2KA 216LA 4Z41A 184LA 3A6CY 146LA 1GF5A 4H8ZA 2LZMA 1UIGA 4GN3A 3DN8A 5APFA 1LSFA 1L38A 3C8RA 2LYOA 2Z37A 4IASA 1HELA 236LA 1DQJC 4E3UA 1J1OY 7LYZA 2RBRA 4IAPA 1L51A 1L49A 3WU7A 3DNAA 5HLLA 1GBZA 2OEAX 1G0KA 206LA 5LA8A 3EO5A 1G0MA 5DN5A 119LA 1WVVA 4W58A 4ETCA 5DN4A 1CTWA 1CU5A 2LCBA 5I5QA 4N0JA 4OWHA 253LA 4DYGA 4YEOA 4OO9A 1TDYA 1LSDA 1C6AA 2ZILA 4H9CA 3TMWA 5FCPA 2C8PA 2ANVA 3HBHA 1DYDA 1QT5A 1C10A 5KXKA 4II8A 1LJFA 1JTOL 3P65A 1GDXA 5L3HA 1L32A 4N1EI 4G9SA 3P68A 2O79A 1QTKA 2FBBA 4W57A 4KL7A 1BWIA 1YANA 4I7QA 3CT5A 4YX7C 1P3NA 2YBIA 1QS5A 1L17A 1AZFA 5D5FA 2DQIY 1HHLA 5FHWA 4DC4A 225LA 1C6HA 4IJ4A 187LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CHX A;  4A7D A;  1IO5 A;  1NBZ C;  2VB1 A;  5HMJ A;  196L A;  3WXT A;  4TWS A;  3G3B B;  1L54 A;  1G7H C;  3CQL A;  1YL1 X;  1ZMY L;  1GB3 A;  125L A;  3AZ7 A;  1G0G A;  1B7O A;  2ZNW Y;  2IFF Y;  2BQN A;  3FI5 A;  1LYO A;  2DQG Y;  4W53 A;  2QB0 B;  133L A;  1L60 A;  1D9U A;  3MGW A;  2OE9 X;  4QGZ A;  5KXW A;  3NY9 A;  1FN5 A;  205L A;  4NGO A;  4EPF A;  3CDQ A;  2PC2 A;  1C6D A;  3ZEK A;  1L39 A;  1RE2 A;  4MCK A;  3LYO A;  1LYS A;  3A3Q A;  2CUU A;  4GCE A;  1LPI A;  4ARQ A;  1GB6 A;  2BQO A;  4NHS A;  4DDB A;  4H9A A;  4AQN A;  1CJ8 A;  4R6C A;  1ZVY B;  4N9R A;  1AKI A;  3WUL A;  4ARQ B;  1WQR A;  141L A;  4HJV A;  5LVH A;  1L99 A;  2O4W A;  1DI3 A;  1QUG A;  5A3E A;  1LZA A;  1L26 A;  1INU A;  1FKV A;  1YKZ X;  4XYY A;  1ZUR A;  3FA0 A;  172L A;  3UON A;  1DYC A;  1IWX A;  4S0W A;  4I8S A;  231L A;  4DD2 A;  1D9W A;  1XFP L;  1L62 A;  2HTX A;  1OUA A;  257L A;  244L A;  1C69 A;  4NHI A;  1OV5 A;  3BKH A;  3F9L A;  1OV7 A;  2W1M A;  2BLY A;  1GB0 A;  5LAG A;  1P7S A;  5FEL A;  3NYA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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