207LA

Mutant human lysozyme c77a
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNAAHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A role of PDI in the reductive cleavage of mixed disulfides.
pubmed rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 207lA00
4B4JA 4ZEEA 1VDQA 1JKCA 1GF5A 1I20A 1HSXA 3LHMA 4NSIA 1LKRA 2DQHY 1F0WA 3A6CY 4LT2A 1F10A 1LZRA 1NBZC 2ZQ4A 1BQLY 1UICA 2D6BA 4NGZA 1FN5A 1LZ4A 1TDYA 4N0JA 5F14A 1GB6A 5B1GA 7LYZA 1UC0A 3AB6A 2H9KA 2Z39A 3A94A 1HEOA 5KXKA 4RW1A 5APEA 1JSEA 1NHEA 2XJWA 1LZAA 4H92A 2XBRA 5II3A 1IY4A 3EBAB 1YQVY 1QDTA 2PC2A 4NGIA 2HEBA 1UIDA 1XEKA 4G4BA 1IOCA 5KXTA 4DDBA 3WYHA 1LSCA 1HMKA 4D9ZA 3QNGA 1TBYA 3D9AC 5FHWA 5I53A 1LZYA 1C10A 4BAPA 1JKBA 1JKDA 1HMLA 3A34A 4QGZA 4H8YA 4ETAA 4IASA 1CNSA 1GBSA 1WQOA 4XN6A 5KXZA 1B0DA 4W94A 5KJ9A 2MEDA 2ZQ3A 4TTDA 1GB5A 5F16A 5F9XA 1GE4A 2Z12A 2NWDX 3RZ4A 4QDNA 4Z46A 1EQ5A 2DQDY 1B5WA 2F30A 1LJ4A 1LTMA 1QUTA 4NGYA 4LYOA 5B07A 4B4IA 3A6BY 4H9EA 4XADA 193LA 4AGAA 1LMPA 3G3AB 3A92A 4PRQA 5LYMA 1G7IC 1IP4A 1GHLA 1RFPA 2F4GA 1UUZC 5KXYA 1LMOA 1CJ7A 1LSDA 5KXOA 1C46A 1LPIA 2N5ZA 1HEPA 1YAPA 3QE8A 1OUIA 4OW1A 2HUBA 4OWHA 1HFZA 134LA 1LSNA 3W6AA 3LYMA 3ATOA 3J6KA 5KKJA 1FLWA 1LOZA 2DBTA 1LHIA 4GLVA 1DI4A 2FBBA 3GXKA 4HSFA 1W08A 1IOTA 1QTEA 4UWUA 1I1ZA 2I26L 4UWNA 1GB9A 1OUBA 3A95A 1GBXA 1NMMA 3W6EA 3TXDA 1HHLA 1RI8B 2A7FA 2MEIA 5J7CA 1GAZA 1KIRC 2G4QA 3VWOA 1IP2A 1LZ1A 3D3DA 4EMNA 2ZNWY 3TXGA 1EQ4A 5DL9A 5IHGA 2Q0MX 3A90A 5KXMA 1WQNA 2BQJA 4NGWA 5LVKA 3A91A 4MR1A 1C7PA 1J1PY 2ZYCA 1LSEA 1A4VA 1UACY 2LHMA 1IWTA 4IATA 5E9RA 5HMJA 1QTKA 3WUMA 2LYMA 4DD0A 5LXWA 1OUFA 2BLXA 3TXBA 4CFOA 4KPMA 3ULRA 1B7QA 4NG8A 1HEMA 1XGRC 2HEAA 1HC0A 3B72A 1MLCE 5LAFA 3AZ5A 1XEJA 1IO5A 1XFPL 4LFPA 3WU8A 1WTMA 1YAMA 1GF8A 1JITA 2YSSC 4CFPA 5L3IA 3WU9A 3IJUA 4WLXA 4XJBA 1VDPA 2W1LA 1B7RA 1IWWA 1VEDA 1WVUA 4FDYA 4HTKA 2MECA 4HJZA 4M6DA 2ZILA 4XJGA 1GFRA 4DWXA 4PHIA 1WQRA 1LMTA 1CKDA 1GBZA 3N9EA 4WLYA 2C8PA 3AJNA 1AZFA 1LJIA 3WVXA 2W1XA 5KXXA 1IWVA 1GFAA 1IEEA 1LSZA 4FJRA 3HFMY 4IJ4A 4HV1A 4YM8A 3J4GA 1C08C 1KXYA 3OK0A 5LYZA 1UIEA 3W6FA 1GBWA 1LZCA 2DQEY 4OOOA 4RDSA 1O23A 1B9OA 3EO5A 1IY3A 208LA 5HLLA 1B5ZA 1GFKA 1UIGA 1BWHA 4LT3A 3A96A 3CQLA 1GPQC 3WH1A 2HU3A 5DM9A 1IORA 1IIZA 1DPWA 4XENA 5AMYA 1OUCA 2B5ZA 2ZIKA 2BQHA 4NGVA 4TSBA 4DYGA 1ALCA 1IC5Y 2BPUA 4NWHA 1HERA 1HEWA 5L3HA 2F2NA 1GF0A 1JJ3A 5I54A 1DQJC 1D0LA 3WVYA 2YDGA 4Z3MA 1OUDA 3AZ4A 4ETDA 3CT1A 1GE0A 1V7SA 1VDTA 1GF3A 4NSJA 4N9RA 1DZBX 1FDLY 1C45A 4H9BA 3ZEKA 1GD6A 4NFVA 3LYTA 4M4OA 2YVBA 1BGIA 1QSWA 4GCEA 3TXJA 1VFBC 1OUEA 4WO9A 4XJDA 5LA8A 4ZIXA 1JTOL 1D9UA 1QSAA 4HJYA 1A2YC 3WUAA 1UA6Y 1GWDA 1GB2A 1GXXA 5LAGA 1WQQA 1YAOA 3AW6A 1GFJA 5LVGA 1NQIA 1GE3A 1AT5A 1OUAA 1B2KA 1HF4A 4KL7A 1LJNA 1JEFA 4XYYA 2MEBA 2YBLA 4BADA 3HBEX 1LKSA 1JPOA 1LZBA 4XJFA 4RLMA 3WU7A 4G49A 2BAAA 1LMCA 4NIJA 3WXTA 1BHZA 1YL1X 1IC4Y 1UCOA 1LHMA 1UIBA 4WG7A 1LYYA 1WQPA 4YEOA 5FDJA 1GF6A 1GDXA 3WL2A 3W6BA 3CT5A 5D5FA 2BQOA 1OUJA 1LMQA 1IWUA 3AYQA 5E4PA 1ZVYB 2VB1A 1AT6A 3HBDA 1UIAA 1LCNA 2HECA 2WARA 1IWXA 1D6PA 2YBNA 3LZ2A 4H9HA 4NSGA 4PGJB 4BS7A 1DPXA 5KXRA 4J1AA 3TMVA 1NDMC 1LJHA 1D0MA 3FE0A 2BQDA 4H1PA 1LZTA 1LZ6A 3A3RX 3P4ZA 4E3UA 1IC7Y 1IWYA 1NDGC 1LJEA 4H9IA 4WM5A 4GN3A 207LA 1B7MA 1HELA 3CSZA 1LMNA 1T3PA 1TCYA 2DQGY 3TXFA 4R6CA 1IOSA 1LJ3A 4C3WA 2LYOA 1LAAA 2BQNA 3MGWA 4H94A 4H91A 3RT5X 1LZ8A 1VATA 1CKHA 2CGIA 4NGJA 5KXSA 4DT3A 4LYMA 5I4YA 1GEVA 3AW7A 1GAYA 3WPJA 2XBSA 1GXV2 4HV2A 4CJ2A 4QY9A 4YF2A 4H9FA 2DQIY 4G9SA 3M3UA 4TSCA 3TXIA 3ZVQA 5KXPA 3WULA 4B49A 1IR8A 5IDDA 1GFVA 1KXXA 1INUA 1V7TA 4WLDA 5A3ZA 3IWRA 1WQMA 5HNLA 2F4AA 5C6LA 6LYTA 1ZVHL 4WM3A 4Z98A 3WW6A 1HFYA 2EQLA 3WW5A 4WM6A 4C5FA 1GEZA 1DKJA 3CT0A 4NSHA 1JWRA 4NHSA 2Z2FA 3AGGG 4WL7A 1CJ6A 3T36A 3A3QA 3WMKA 5LA5A 4BAFA 3QY4A 3GXRA 5FELA 1IR7A 5FSTA 4O34A 5KKIA 4TUNA 4RW2A 1JTPL 2Z19A 4XJIA 1JIYA 3B6LA 3B0IA 4NGKA 153LA 2LZTA 1N4FA 4LT0A 4N1EI 2C8OA 154LA 1MELL 1IWZA 1GBOA 1B7OA 2ZIJA 2DQCY 1G7LC 5L9JA 1NKHA 4B4EA 1AM7A 4ET9A 1W6ZA 4WG1A 5KXLA 1REXA 1IOQA 1IR9A 1NBYC 4G4CA 1GFTA 1H87A 4G4HA 4ML7A 4TX7A 3LYZA 1YKZX 3CSQA 2ZWBA 1JKAA 2DQAA 1CKFA 2BLYA 1JJ1A 2FYCA 1REMA 1AKIA 3AGHA 4J0LA 5FEKA 4NHIA 5APFA 1DXJA 3ATNA 4WM4A 1G7HC 1LSPA 2DQFC 5B06A 1GE1A 1LHJA 1JISA 1B5XA 4U3XB 3IJVA 5JENB 1BB7A 4J7VA 1FBIX 1LSGA 4NWEA 1TEWA 3EXDA 4OWAA 1YILA 1BVKC 2BQMA 1YAQA 2RSCA 4CGEA 1LSBA 2MEHA 3P64A 4GCBA 4LFXA 4LYBA 3A8ZA 3WXUA 1VAUA 2D4IA 5KY1A 3A93A 1HFXA 4NHQA 3BKVA 3WUNA 1YKXX 4UWVA 5HQ1A 5I5QA 3ZVQB 1J1OY 3TMWA 1BVXA 2CWIA 3LYOA 4NGOA 5HNCA 5K7OA 5M1YA 1GF4A 1B5UA 1T6VL 2YBMA 3CSRA 4HPEA 1EL1A 3W3EA 2IHLA 1HEQA 1IP3A 1LZ9A 1XGUC 2HEEA 1PS5A 4GCFA 2H9JA 1YIKA 3W6DA 3TMUA 4HP0A 1B7NA 3TXEA 1NF5A 1BB5A 1OUHA 1IP1A 2GV0A 5F9UA 3SP3A 1I56A 1QDRA 4LGKA 4GN4A 1TAYA 1P2CC 1XGTC 4I0CA 1LZ5A 1LSAA 1PZYA 5T3FA 5LVJA 1GFGA 1JTTL 1UBZA 4TWSA 1YKYX 1OUGA 4GLAA 4DDAA 1LZGA 4LZTA 5ILCA 1OQMA 4LYCA 2FYDA 2A7DA 2CJLA 2Y8PA 4HTNA 1RJCB 1GB8A 4LT1A 4PRUA 1JSFA 4NGLA 3RU5A 3WPKA 1KIPC 4W96A 2H5ZA 5APDA 4KT3A 4LYTA 1G7JC 1D0KA 4ZFPA 5C6JA 1BWIA 2G4NA 2MEAA 2HEDA 4RLNA 1EQEA 1J1XY 4H93A 4II8A 2CDSA 3AZ7A 4WM1A 1GF7A 1HNLA 1VDSA 1ZV5L 2DKVA 2BQGA 2DQJY 2Z18A 3P68A 4H9CA 9LYZA 3EMSA 1H6MA 1LZDA 4WL6A 133LA 4YEMA 4GN5C 1F6SA 5B1FA 5D5CA 4B1AA 2MEEA 4X3BA 3B0KA 5KXWA 1C43A 4HTQA 3TMXA 6LYZA 2BQBA 2EIZC 1BB4A 4DD2A 3RNXA 4OWCA 194LA 2EKSC 1QQYA 1XGPC 3RW8A 1JJ0A 4DDCA 3B0OA 1DI5A 2G4PA 4QEQA 4EOFA 3N9CA 1LSMA 1YROA 1ZMYL 2YBIA 4HJVA 1GFHA 4H8ZA 1CKCA 2LZ2A 1JHLA 3KAMA 1B5VA 1LYZA 3A67Y 4H9AA 1FLYA 4N8ZA 1GDWA 3WPLA 1KXWA 4H8XA 4YOPA 3TXKA 1CKGA 1LJGA 4WMGA 3E3DA 1IVMA 4ET8A 2Z2EA 2MEGA 1FLQA 2ZYPA 1Z55A 5DN4A 5LINA 4ETCA 1SQ2L 1IX0A 1B5YA 5KXNA 4Z41A 4WLTA 1GFEA 2W1YA 5DLAA 2BQLA 4CHXA 3AGIA 4GCDA 5EBHA 3P65A 4DD3A 3F6ZA 3G3BB 4PJ2C 8LYZA 2MEFA 1LHLA 5I4WA 5B59A 1G7MC 3LZTA 4OWBA 5FCPA 3AZ6A 1UIHA 2BQIA 1LHHA 1UIFA 4YENA 2Z37A 1GB0A 1LSFA 4NY5A 2IFFY 4DC4A 2BQFA 1B7LA 4GCCA 1FLUA 2EPEA 1DI3A 4ETEA 3BKHA 1LJKA 2D91A 5LVHA 1E8LA 1LZEA 4NHPA 1LZNA 5LVIA 4WOAA 4DD9A 1YL0X 4PPOA 4OOTA 135LA 4LYZA 1REYA 2BQAA 2YBHA 4KXIA 5LYTA 2HEFA 3W6CA 1B7PA 1NWGA 1F6RA 1YANA 3CB7A 1HENA 1LYSA 2YBJA 3K3TA 1CJ9A 1KIQC 4MCKA 5C6IA 4L41A 1D6QA 3T6UA 5APCA 2XTHA 1SLYA 4HPIA 2FBDA 2X0AA 4H90A 1QUSA 2D4KA 4R0FA 4N5RA 5HMVA 5I4XA 5ILFA 5B05A 4A7DA 2I6ZA 3FI7A 2HU1A 4AXTA 1XGQC 2BQEA 1LJJA 3HBHA 3P66A 2AUBA 1BWJA 1FKQA 1WVVA 2HTXA 2Z38A 3OJPA 2LYZA 2I25L 4NEBA 1IP6A 4ANRA 1GB3A 5F81A 1B7SA 1IP5A 5IELA 132LA 1LZSA 4WO6A 1XEIA 3N9AA 4XJHA 1GB7A 4P2EA 3M18B 4B0DA 2W1MA 1FKVA 4OWEA 1GFUA 1QIOA 1RE2A 2ZNXY 1JUGA 1LSYA 1WTNA 1RCMA 2D4JA 3TXHA 4DD7A 5A3EA 1DKKA 1BB3A 4N1CC 4DD1A 1LMAA 1GE2A 4WM2A 4NHTA 4MSTA 4J1BA 1HSWA 1GF9A 5DN5A 1REZA 1OP9B 1LYOA 1XSFA 1LHKA 2BQCA 4I8SA 1BB6A 4ETBA 4NG1A 1CJ8A 3LN2A 1LJFA 2BQKA 1IP7A 1GBYA 5LIOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZEEA 1I20A 1HSXA 1LPYA 3LHMA 4NSIA 1LWGA 2D6BA 4W53A 1L06A 123LA 1UC0A 2Z39A 4ARPA 1JSEA 3HT8A 2PC2A 1UIDA 1D9WA 5KXTA 1IOCA 1C6NA 3V2WA 5I53A 1LZYA 4EKQA 1K28A 4BAPA 1JKBA 3A34A 257LA 5KJ9A 1LGUA 173LA 2MEDA 3F8VA 1GB5A 197LA 2F30A 1LJ4A 5B07A 183LA 4H9EA 4I7NA 1LMPA 3A92A 2QARC 5LYMA 1CUQA 1L28A 2N5ZA 2HUBA 134LA 3W6AA 3LYMA 3ATOA 144LA 3J6KA 1SX7A 1LHIA 4HSFA 1IOTA 1QTEA 4UWUA 1OUBA 3A95A 1OWZA 1CV3A 3DMVA 2A7FA 5J7CA 1GAZA 1KIRC 2ZNWY 3HH4A 1EQ4A 3PDSA 2Q0MX 3A90A 2BQJA 5LVKA 1C7PA 2ZYCA 176LA 1UACY 5HMJA 1L26A 1QTKA 2LYMA 2BLXA 1C6LA 1B7QA 3AZ5A 1XFPL 3WU8A 185LA 1WTMA 1GF8A 1OV5A 3WU9A 4WLXA 1ZYTA 1B7RA 3SB6A 3OE0A 4W56A 4FDYA 2MECA 1L54A 4DWXA 1GFRA 1CV5A 1WQRA 1CKDA 1GBZA 3N9EA 1L94A 5LYZA 4RDSA 1O23A 255LA 1B9OA 1B5ZA 1P6YA 5DM9A 1DPWA 1T8FA 3LZMA 103LA 1L47A 1DQJC 1D0LA 3WVYA 2RB2X 4W51A 1GE0A 3C7ZA 1DZBX 1C45A 4H9BA 3SB5A 3DN3A 2YVBA 1L79A 1VFBC 5LA8A 4XJDA 3RUNA 1GFJA 5LVGA 3HDEA 1SX2A 1HF4A 2HULA 4KL7A 1L89A 1JEFA 4XYYA 1LZBA 1DYBA 2OE4X 3WU7A 3GUNA 1LMCA 1YL1X 1WQPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4B4J A;  4ZEE A;  1VDQ A;  1JKC A;  1GF5 A;  1I20 A;  1HSX A;  3LHM A;  4NSI A;  1LKR A;  2DQH Y;  1F0W A;  3A6C Y;  4LT2 A;  1F10 A;  1LZR A;  1NBZ C;  2ZQ4 A;  1BQL Y;  1UIC A;  2D6B A;  4NGZ A;  1FN5 A;  1LZ4 A;  1TDY A;  4N0J A;  5F14 A;  1GB6 A;  5B1G A;  7LYZ A;  1UC0 A;  3AB6 A;  2H9K A;  2Z39 A;  3A94 A;  1HEO A;  5KXK A;  4RW1 A;  5APE A;  1JSE A;  1NHE A;  2XJW A;  1LZA A;  4H92 A;  2XBR A;  5II3 A;  1IY4 A;  3EBA B;  1YQV Y;  1QDT A;  2PC2 A;  4NGI A;  2HEB A;  1UID A;  1XEK A;  4G4B A;  1IOC A;  5KXT A;  4DDB A;  3WYH A;  1LSC A;  1HMK A;  4D9Z A;  3QNG A;  1TBY A;  3D9A C;  5FHW A;  5I53 A;  1LZY A;  1C10 A;  4BAP A;  1JKB A;  1JKD A;  1HML A;  3A34 A;  4QGZ A;  4H8Y A;  4ETA A;  4IAS A;  1CNS A;  1GBS A;  1WQO A;  4XN6 A;  5KXZ A;  1B0D A;  4W94 A;  5KJ9 A;  2MED A;  2ZQ3 A;  4TTD A;  1GB5 A;  5F16 A;  5F9X A;  1GE4 A;  2Z12 A;  2NWD X;  3RZ4 A;  4QDN A;  4Z46 A;  1EQ5 A;  2DQD Y;  1B5W A;  2F30 A;  1LJ4 A;  1LTM A;  1QUT A;  4NGY A;  4LYO A;  5B07 A;  4B4I A;  3A6B Y;  4H9E A; 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 1GB0 A;  1LSF A;  4NY5 A;  2IFF Y;  4DC4 A;  2BQF A;  1B7L A;  4GCC A;  1FLU A;  2EPE A;  1DI3 A;  4ETE A;  3BKH A;  1LJK A;  2D91 A;  5LVH A;  1E8L A;  1LZE A;  4NHP A;  1LZN A;  5LVI A;  4WOA A;  4DD9 A;  1YL0 X;  4PPO A;  4OOT A;  135L A;  4LYZ A;  1REY A;  2BQA A;  2YBH A;  4KXI A;  5LYT A;  2HEF A;  3W6C A;  1B7P A;  1NWG A;  1F6R A;  1YAN A;  3CB7 A;  1HEN A;  1LYS A;  2YBJ A;  3K3T A;  1CJ9 A;  1KIQ C;  4MCK A;  5C6I A;  4L41 A;  1D6Q A;  3T6U A;  5APC A;  2XTH A;  1SLY A;  4HPI A;  2FBD A;  2X0A A;  4H90 A;  1QUS A;  2D4K A;  4R0F A;  4N5R A;  5HMV A;  5I4X A;  5ILF A;  5B05 A;  4A7D A;  2I6Z A;  3FI7 A;  2HU1 A;  4AXT A;  1XGQ C;  2BQE A;  1LJJ A;  3HBH A;  3P66 A;  2AUB A;  1BWJ A;  1FKQ A;  1WVV A;  2HTX A;  2Z38 A;  3OJP A;  2LYZ A;  2I25 L;  4NEB A;  1IP6 A;  4ANR A;  1GB3 A;  5F81 A;  1B7S A;  1IP5 A;  5IEL A;  132L A;  1LZS A;  4WO6 A;  1XEI A;  3N9A A;  4XJH A;  1GB7 A;  4P2E A;  3M18 B;  4B0D A;  2W1M A;  1FKV A;  4OWE A;  1GFU A;  1QIO A;  1RE2 A;  2ZNX Y;  1JUG A;  1LSY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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