208LA

Mutant human lysozyme c77a
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNAAHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A role of PDI in the reductive cleavage of mixed disulfides.
pubmed rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Complex (hydrolase (o-glycosyl)/cys)
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 208lA00
1MLCE 1NBYC 2YSSC 5C6IA 1W08A 4WM4A 4W94A 4NSIA 4TTDA 3LHMA 2I26L 1GD6A 3LN2A 3A96A 2D4IA 5FSTA 4PGJB 1JJ0A 4H9BA 4OWAA 2HEBA 4NSJA 3W6EA 1IR9A 1G7LC 2LZTA 2HEDA 4ET8A 1IWYA 4WM3A 3W6FA 4DT3A 3WU7A 2MEDA 4ETBA 1DKKA 1B7NA 4NGWA 1GB9A 1V7TA 4I8SA 8LYZA 4GCEA 3P66A 1IWXA 3WULA 1IO5A 1HEMA 3OK0A 1IWTA 5L3IA 2ZQ3A 1RCMA 3LYOA 3TMUA 1GFKA 4GCBA 2G4PA 5KXNA 2DQJY 3TMWA 1WQRA 1N4FA 1B7SA 4U3XB 4PPOA 4G9SA 3ULRA 1FLQA 2Z39A 5LVJA 1LSGA 1UIFA 1NBZC 1XGTC 4R6CA 5KXMA 5I53A 2CGIA 3EMSA 3AB6A 1HEOA 4LYOA 4YEMA 1IC7Y 1LMNA 4B0DA 1LSZA 1LSMA 1LMPA 5LIOA 3A6CY 2WARA 1HSWA 1DKJA 1OUDA 1LSDA 4LYBA 1CJ6A 2ZYCA 4GN4A 4DD2A 4ZIXA 1IOQA 1G7MC 5LVKA 133LA 1B7LA 4M6DA 5IDDA 2ZNXY 4X3BA 1KIQC 4LT1A 2ZIJA 2ZNWY 3N9EA 4ZEEA 1MELL 4XYYA 1QTKA 1J1OY 1XSFA 5LINA 1UICA 3AJNA 3OJPA 3W6BA 1AZFA 1LJHA 1OUGA 2YBMA 1LMCA 2LYZA 2F4GA 4QDNA 3FI7A 208LA 1JITA 1IC5Y 1C46A 2AUBA 2BQMA 2BQKA 4P2EA 4B4JA 1KIPC 3AW6A 1BB4A 1GAZA 1WTNA 2ZWBA 2DKVA 1DXJA 4PHIA 4WL6A 4YEOA 1YKYX 5KXYA 3F6ZA 2FYDA 1LSBA 3G3AB 3WUAA 1B7RA 3AGIA 2Z37A 1GBZA 4GLAA 3HBDA 1D6QA 1LJ4A 4MSTA 154LA 3BKHA 1PS5A 2BQIA 1QDTA 1NWGA 1QDRA 3P65A 1D9UA 2H9KA 5LYMA 5LYZA 4NHSA 2Z2EA 3WXUA 3A91A 4WG7A 1T6VL 4G49A 1IP7A 1LZ8A 1BB6A 4N1EI 4RLNA 4WM1A 1VDTA 1DI5A 2H9JA 4FDYA 1FKQA 4NY5A 4NSGA 4XADA 2I6ZA 2W1YA 5F9XA 4NHIA 1LZYA 4GN3A 4DD3A 4EMNA 1JPOA 1FKVA 3CT1A 3RU5A 3EO5A 1UIDA 2YBLA 1UCOA 1HELA 3KAMA 1LZDA 5HNCA 1RFPA 2ZQ4A 2FBBA 4NIJA 1XFPL 3EXDA 1C10A 1H6MA 1C43A 5D5CA 3RNXA 5II3A 4LFPA 5M1YA 1GE4A 4Z41A 1LOZA 4G4HA 1HF4A 1LMOA 2MEFA 2Z12A 1GE2A 2RSCA 4H9HA 1TAYA 1LKRA 2LHMA 4GCCA 1IX0A 2EIZC 4KPMA 4NG8A 4ETEA 1IY3A 1IVMA 1DQJC 1GB6A 3M18B 4L41A 2BPUA 1KXWA 4NEBA 1SQ2L 3TXFA 4UWVA 5L9JA 4W96A 1C7PA 4TSCA 2H5ZA 3WL2A 4WG1A 1GB7A 1BWHA 1WVVA 2BQNA 3AYQA 1JKDA 3WPLA 1D0LA 1OUBA 4H9IA 3WMKA 4N1CC 2A7DA 3SP3A 5E4PA 3W6AA 194LA 3TXDA 1OUIA 2DQCY 1JKBA 1W6ZA 4RW1A 4B4IA 4KXIA 4H94A 1B7MA 5FELA 2BAAA 1YROA 5KKJA 1LJEA 4PJ2C 1CKDA 5FCPA 5I4YA 1BVXA 1B5UA 1GPQC 1LJJA 4OOOA 1GE3A 1XEJA 2D4JA 3D3DA 4NFVA 3WW6A 4Z46A 5A3EA 5KXTA 1TDYA 1FN5A 5ILFA 1UUZC 1CJ8A 1HFYA 4PRQA 5KXLA 3TXHA 1LYYA 3QY4A 5LAFA 1LTMA 1G7IC 1GB0A 1REXA 1CNSA 1B7PA 4AGAA 2MEAA 4OW1A 1HC0A 2XBSA 3A95A 3CT0A 1GB8A 1D6PA 4HTQA 1BB5A 1TBYA 2DQFC 1GBSA 5KXRA 1HEWA 4HTKA 4XJHA 4WMGA 5DLAA 1I56A 3WUMA 2MEBA 1Z55A 2F4AA 3A6BY 1INUA 2CDSA 3B6LA 1AM7A 1FDLY 2YBHA 4IATA 1VFBC 2MEHA 5L3HA 5DN4A 4GLVA 1GEVA 1UACY 2BLXA 2YBIA 3MGWA 4N5RA 5F9UA 5LVIA 3HBEX 4RDSA 1UBZA 4TUNA 1F10A 1JUGA 5LXWA 1B5YA 1REMA 2N5ZA 4H1PA 2F2NA 5EBHA 2PC2A 3TXGA 3IJVA 1GF5A 1ALCA 2LYOA 4NWEA 1A4VA 5HMVA 5I4XA 5JENB 1GB5A 1LZCA 1IY4A 1WQNA 2X0AA 1I1ZA 4H8XA 1GF7A 1I20A 4NGIA 4NWHA 1LSCA 2W1XA 4HJZA 1G7HC 2HU3A 6LYTA 1OUFA 1YIKA 1LZ9A 1CJ9A 2HU1A 1QUTA 5KXXA 1LYOA 1DZBX 1HSXA 1YL0X 1LJGA 1UA6Y 3A94A 4HP0A 3W6DA 4YENA 1GE1A 1LJ3A 1LSYA 3TXBA 1TEWA 5E9RA 1GFEA 4NSHA 1VAUA 4H90A 1IWZA 4LGKA 1WQQA 4DDAA 5LVHA 2GV0A 4WLXA 2A7FA 3AZ7A 4HV2A 3ZEKA 1F6SA 2LZ2A 4YF2A 3HFMY 5KXOA 1VDSA 1GFAA 1GFVA 1LJNA 3LZTA 4G4BA 4HPIA 3TMXA 4J1AA 1TCYA 6LYZA 1LHLA 3CB7A 4HPEA 4QEQA 5B06A 4H91A 2HUBA 1IEEA 3RT5X 5B1GA 1CKHA 3A34A 1NHEA 3ZVQB 5C6JA 1G7JC 4LT0A 5APDA 1VEDA 1B5XA 1DI4A 1GE0A 3RW8A 1IC4Y 5F14A 1ZV5L 1FLWA 2G4QA 5DM9A 2IFFY 2G4NA 4WLYA 4NGKA 1OUAA 1JTOL 4GN5C 4NGLA 4ETAA 4YM8A 3WPJA 2BQJA 1O23A 1OUJA 3GXKA 1CKGA 4H9CA 5B1FA 2HTXA 1LZBA 4GCFA 4H9FA 4QGZA 4XJGA 1GBWA 1H87A 1UIEA 2W1LA 4ETDA 4LT3A 4Z98A 1LHIA 3FE0A 1GF4A 4HJVA 4HTNA 1BQLY 3B0KA 3CSRA 4NG1A 2DQAA 1B7OA 1LZ4A 1QQYA 4Z3MA 1XGUC 1YAPA 1HHLA 4H92A 4IASA 4M4OA 4WL7A 1IORA 2MECA 1YKXX 1GDWA 4LZTA 3WYHA 4DYGA 1LPIA 3LYZA 4R0FA 1DI3A 1KIRC 1YANA 1XEIA 1V7SA 3A8ZA 1D0KA 1HMKA 4UWUA 1REZA 1LJIA 1ZMYL 4CHXA 2LYMA 1LHJA 1FLUA 4H8YA 1LZSA 1JKAA 4OOTA 3VWOA 4EOFA 5KXWA 4WO9A 3A92A 5LVGA 2W1MA 1LJFA 2Z18A 3CSQA 3P4ZA 4FJRA 3A3QA 3EBAB 1EQ4A 5B05A 1LMTA 2EQLA 1RE2A 4UWNA 3WW5A 1YILA 1B9OA 1AT5A 1GBOA 1JSFA 4ET9A 4CGEA 1LZAA 5HQ1A 1BGIA 1RI8B 3GXRA 1LKSA 2ZYPA 1B5WA 5C6LA 4J0LA 4C5FA 1YL1X 3WUNA 2BQBA 3J6KA 2YVBA 4OWBA 2EPEA 1RJCB 2BQGA 1XGPC 1GB2A 4WM5A 4A7DA 1JJ3A 1LSNA 3ATOA 2NWDX 5J7CA 1OQMA 1LZ6A 4BAFA 1NDMC 3A93A 4MR1A 4NGJA 3AZ5A 1CJ7A 3ZVQA 4XN6A 5I5QA 1GFJA 3A67Y 4NHQA 1BVKC 2DQGY 1OUCA 4RLMA 1LAAA 2HEFA 2MEEA 1BHZA 1LCNA 4I0CA 3TXJA 1LZRA 1GDXA 4DD7A 1GWDA 4DWXA 1C45A 1F6RA 1AT6A 4IJ4A 4TX7A 1WQOA 2DQHY 3ATNA 1LHHA 2BQAA 2I25L 3P68A 1GF9A 5KXKA 3A90A 1HENA 1UIHA 3E3DA 3LYMA 1GFRA 193LA 2Y8PA 4HV1A 2DQIY 4HSFA 1GFUA 4LYCA 5FHWA 1WQPA 2BQHA 3QE8A 5APFA 1XGQC 4DD9A 2FYCA 1DPXA 5A3ZA 1GEZA 1HFXA 4WM2A 1B5VA 1LSAA 1YAQA 1GB3A 3WVYA 4B49A 4DC4A 4DD1A 1IP6A 2DQEY 1WQMA 1AKIA 1GXV2 5K7OA 4YOPA 4RW2A 4KL7A 1A2YC 2YBJA 4CFPA 1ZVHL 2YDGA 4OWCA 3P64A 3LYTA 2F30A 2Z38A 4B4EA 3TMVA 5DL9A 4WO6A 1JSEA 3N9AA 4WLTA 1JJ1A 1OUEA 3WU9A 1LSFA 4NGOA 4N0JA 3B0IA 1LZTA 1GFGA 1NKHA 153LA 3WU8A 1LZ5A 1WTMA 1SLYA 4G4CA 4ETCA 4E3UA 5DN5A 1LHKA 1YAOA 5AMYA 2D4KA 4DDCA 3T36A 1JWRA 1JISA 1JKCA 1C08C 1LSPA 3D9AC 2MEGA 4J1BA 1VDQA 4B1AA 3W6CA 4DDBA 4XJDA 1OP9B 2CWIA 4QY9A 1QIOA 1ZVYB 1BWJA 2C8OA 2XTHA 3M3UA 1B0DA 1CKFA 3WXTA 1D0MA 5LA5A 4J7VA 1YQVY 1NDGC 1IIZA 3N9CA 1REYA 4NHPA 1KXYA 1LHMA 1IOCA 4CJ2A 5T3FA 5KKIA 5LAGA 3TXIA 1F0WA 4XJFA 3TXEA 3RZ4A 5ILCA 4H8ZA 3WH1A 4N9RA 4LYZA 4OWEA 2YBNA 3G3BB 4TSBA 5B59A 2XBRA 132LA 4NGZA 1JHLA 4O34A 3CQLA 5HLLA 5I4WA 1BB3A 1IOSA 1LYZA 1QSAA 1UC0A 1GF6A 2DQDY 3AGGG 3B0OA 3IJUA 1HEPA 4ML7A 3T6UA 4XJIA 1FBIX 1IWWA 3AZ6A 135LA 5KY1A 4NGVA 4BS7A 1GBYA 4GCDA 2IHLA 1IWUA 1HERA 4H9AA 1IP4A 4HJYA 4ZFPA 1J1XY 1WVUA 4TWSA 5F16A 2B5ZA 134LA 1NMMA 1JTPL 1QUSA 5FEKA 1VATA 2C8PA 1IWVA 5HNLA 3IWRA 5KJ9A 2BLYA 3HBHA 2VB1A 4LFXA 5APEA 1JIYA 4N8ZA 1BWIA 1XGRC 1BB7A 4BAPA 3CSZA 4PRUA 1YAMA 4C3WA 1E8LA 4WLDA 1IR7A 1IP1A 5LYTA 1LMQA 5D5FA 1T3PA 4AXTA 1FLYA 1JTTL 1NF5A 4WM6A 2BQCA 3AZ4A 4DD0A 1GBXA 1IP3A 5KXZA 3QNGA 2HEEA 3WPKA 2FBDA 1B5ZA 1EQEA 4OWHA 2XJWA 1LZ1A 1P2CC 1DPWA 1OUHA 1UIBA 2HEAA 3BKVA 2MEIA 4H9EA 1B2KA 4NGYA 2D6BA 1UIGA 3K3TA 1KXXA 2Z19A 4LYMA 2BQEA 9LYZA 1GHLA 4CFOA 4NHTA 1IR8A 2ZILA 1LMAA 7LYZA 2D91A 1GAYA 3LZ2A 5F81A 5FDJA 5I54A 1LZNA 1QTEA 5LA8A 1B7QA 3J4GA 3AGHA 4MCKA 1GF8A 3CT5A 1GF3A 4XENA 1EQ5A 1LZEA 1GFHA 2DBTA 4BADA 1LJKA 1IP5A 1GF0A 4LT2A 1YKZX 5KXPA 2BQFA 2Z2FA 5APCA 1LZGA 1J1PY 1GXXA 4XJBA 2BQLA 5IELA 1PZYA 3WVXA 4II8A 1JEFA 1HEQA 5HMJA 1VDPA 1NQIA 1EL1A 1UIAA 207LA 1HFZA 4KT3A 4LYTA 5B07A 1IP2A 3TXKA 4D9ZA 2BQDA 1LYSA 1QSWA 2Q0MX 1CKCA 3W3EA 3B72A 2BQOA 2CJLA 2HECA 4WOAA 5IHGA 2EKSC 3A3RX 5KXSA 2ZIKA 4ANRA 4H93A 1GFTA 1HMLA 1HNLA 3AW7A 1XEKA 1IOTA 1LSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YSSC 5C6IA 1C6EA 172LA 4WM4A 2I26L 4PGJB 2HEBA 4NSJA 3W6EA 2LZTA 1L87A 1DKKA 219LA 1C6BA 3DN0A 226LA 4I8SA 4GCEA 1IWXA 2ZQ3A 1L47A 1B7SA 122LA 1L11A 1SSYA 3ULRA 227LA 1ZYTA 2Z39A 5LVJA 1UIFA 5KXMA 146LA 2ANXA 3DN6A 3EMSA 1HEOA 1L34A 2O4WA 1D2YA 4ZIXA 1OUDA 1LSDA 1IOQA 1G7MC 205LA 1KIQC 4LT1A 184LA 1MELL 1UICA 3AJNA 3OJPA 1AZFA 1LJHA 1LMCA 4QDNA 4B4JA 1KIPC 1WTNA 2DKVA 2B70A 2FYDA 3AGIA 1GBZA 4GLAA 1D6QA 3HH3A 4MSTA 1PS5A 3P65A 1L92A 1L02A 1T6VL 4G49A 1L90A 1L22A 1LZ8A 1BB6A 1CV5A 4N1EI 2LC9A 4RLNA 4WM1A 4FDYA 4XADA 4NHIA 1L88A 4GN3A 1JPOA 1FKVA 1L99A 4EXMA 3KAMA 1LZDA 1L29A 1P37A 2FBBA 125LA 3RNXA 1C43A 4LFPA 206LA 239LA 4G4HA 1LMOA 2MEFA 3LZMA 1TAYA 2LHMA 4ETEA 4KPMA 3HUKA 229LA 1IVMA 3GUNA 1GB6A 3M18B 2BPUA 4W96A 2H5ZA 1QT6A 1L93A 3DMVA 137LA 2BQNA 4I7RA 1QUDA 1QTVA 2A7DA 4W58A 4H94A 1B7MA 212LA 2BAAA 1L05A 1L49A 4PJ2C 1BVXA 3WW6A 2D4JA 3D3DA 4Z46A 5KXTA 5ILFA 1UUZC 5KXLA 5LAFA 1LTMA 3C7WA 1HC0A 111LA 1KNIA 4ARQB 2DQFC 1GBSA 2LZMA 5DLAA 2F4AA 3A6BY 2CDSA 1FDLY 232LA 1VFBC 3HT7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1MLC E;  1NBY C;  2YSS C;  5C6I A;  1W08 A;  4WM4 A;  4W94 A;  4NSI A;  4TTD A;  3LHM A;  2I26 L;  1GD6 A;  3LN2 A;  3A96 A;  2D4I A;  5FST A;  4PGJ B;  1JJ0 A;  4H9B A;  4OWA A;  2HEB A;  4NSJ A;  3W6E A;  1IR9 A;  1G7L C;  2LZT A;  2HED A;  4ET8 A;  1IWY A;  4WM3 A;  3W6F A;  4DT3 A;  3WU7 A;  2MED A;  4ETB A;  1DKK A;  1B7N A;  4NGW A;  1GB9 A;  1V7T A;  4I8S A;  8LYZ A;  4GCE A;  3P66 A;  1IWX A;  3WUL A;  1IO5 A;  1HEM A;  3OK0 A;  1IWT A;  5L3I A;  2ZQ3 A;  1RCM A;  3LYO A;  3TMU A;  1GFK A;  4GCB A;  2G4P A;  5KXN A;  2DQJ Y;  3TMW A;  1WQR A;  1N4F A;  1B7S A;  4U3X B;  4PPO A;  4G9S A;  3ULR A;  1FLQ A;  2Z39 A;  5LVJ A;  1LSG A;  1UIF A;  1NBZ C;  1XGT C;  4R6C A;  5KXM A;  5I53 A;  2CGI A;  3EMS A;  3AB6 A;  1HEO A;  4LYO A;  4YEM A;  1IC7 Y;  1LMN A;  4B0D A;  1LSZ A;  1LSM A;  1LMP A;  5LIO A;  3A6C Y;  2WAR A;  1HSW A;  1DKJ A;  1OUD A;  1LSD A;  4LYB A;  1CJ6 A;  2ZYC A;  4GN4 A;  4DD2 A;  4ZIX A;  1IOQ A;  1G7M C;  5LVK A;  133L A;  1B7L A;  4M6D A;  5IDD A;  2ZNX Y;  4X3B A; 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 2BLY A;  3HBH A;  2VB1 A;  4LFX A;  5APE A;  1JIY A;  4N8Z A;  1BWI A;  1XGR C;  1BB7 A;  4BAP A;  3CSZ A;  4PRU A;  1YAM A;  4C3W A;  1E8L A;  4WLD A;  1IR7 A;  1IP1 A;  5LYT A;  1LMQ A;  5D5F A;  1T3P A;  4AXT A;  1FLY A;  1JTT L;  1NF5 A;  4WM6 A;  2BQC A;  3AZ4 A;  4DD0 A;  1GBX A;  1IP3 A;  5KXZ A;  3QNG A;  2HEE A;  3WPK A;  2FBD A;  1B5Z A;  1EQE A;  4OWH A;  2XJW A;  1LZ1 A;  1P2C C;  1DPW A;  1OUH A;  1UIB A;  2HEA A;  3BKV A;  2MEI A;  4H9E A;  1B2K A;  4NGY A;  2D6B A;  1UIG A;  3K3T A;  1KXX A;  2Z19 A;  4LYM A;  2BQE A;  9LYZ A;  1GHL A;  4CFO A;  4NHT A;  1IR8 A;  2ZIL A;  1LMA A;  7LYZ A;  2D91 A;  1GAY A;  3LZ2 A;  5F81 A;  5FDJ A;  5I54 A;  1LZN A;  1QTE A;  5LA8 A;  1B7Q A;  3J4G A;  3AGH A;  4MCK A;  1GF8 A;  3CT5 A;  1GF3 A;  4XEN A;  1EQ5 A;  1LZE A;  1GFH A;  2DBT A;  4BAD A;  1LJK A;  1IP5 A;  1GF0 A;  4LT2 A;  1YKZ X;  5KXP A;  2BQF A;  2Z2F A;  5APC A;  1LZG A;  1J1P Y;  1GXX A;  4XJB A;  2BQL A;  5IEL A;  1PZY A;  3WVX A;  4II8 A;  1JEF A;  1HEQ A;  5HMJ A;  1VDP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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