230LA

T4 lysozyme mutant m6l
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFELLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 230lA00
4EPFA 1L50A 4IAPA 167LA 1G07A 1L85A 1JTMA 3F8VA 192LA 239LA 119LA 4ARLA 1G0JA 1LYFA 1QTVA 246LA 4W51A 2HUKA 1B6IA 3C80A 172LA 195LA 1C6MA 3HH3A 3SB9A 107LA 3C83A 1XJUA 252LA 1L92A 3HWLA 199LA 3DMVA 1LYHA 1PQOA 2B6YA 2O7AA 1L55A 2OTYX 171LA 137LA 1CU6A 1CV5A 3C8SA 1L25A 118LA 127LA 4I7JA 3HTBA 3HDFA 4YXAC 1C64A 4W55A 140LA 3HTDA 1OV7A 181LA 3HU8A 1QT7A 4I7RA 3HU9A 209LA 1KW7A 1L69A 1QTZA 231LA 2LC9A 1WTHA 2RBNA 3GULA 1L13A 175LA 111LA 1C6IA 1OVKA 1L65A 1C68A 1P5CA 1L60A 1ZWNA 1D2WA 3GUIA 1OWZA 1C6PA 1L18A 2B7XA 232LA 1L90A 4GRVA 1L36A 1L43A 2RB2X 4I7KA 1L37A 3OE8A 1L26A 230LA 1L31A 1L66A 1LLHA 1L96A 104LA 4W58A 223LA 1PQDA 2B6WA 151LA 1QSQA 258LA 1QTCA 1T6HA 2B70A 4EKRA 1LI3A 2RBSA 115LA 1PQJA 1L03A 1L42A 1QT8A 4ZPUA 4K5YA 1C6AA 1D3NA 3SBAA 1K28A 241LA 1SWZA 249LA 1T8GA 242LA 1CTWA 1DYAA 1L24A 1QT4A 1L11A 255LA 4ARQA 256LA 3GUJA 5I14A 201LA 1KNIA 169LA 1LW9A 1C69A 2B73A 3GUNA 257LA 1L17A 1L15A 2ANVA 1CV4A 3DN0A 190LA 1L45A 1L20A 1L72A 1L84A 1L95A 2NTHA 3HUKA 3CDVA 1C6HA 166LA 1KW5A 1L28A 3RUNA 1C6CA 1SX2A 3DN1A 236LA 3SB8A 1L74A 3HUAA 2OE7X 1L63A 1QUDA 3G3WA 1QSBA 2RBPA 174LA 4EKPA 2RH1A 1L71A 145LA 3C81A 1DYCA 1P56A 1LGUA 1KY1A 2L78A 4YXCA 142LA 1L79A 1P6YA 1DYGA 1LI6A 1ZYTA 148LE 1KS3A 1L54A 259LA 1QS9A 3HT6A 3NY8A 1L06A 1P37A 2RAYX 197LA 3C82A 1C61A 3F9LA 1CU5A 1C66A 4AQNA 2NTGA 1L99A 1L89A 1QT3A 120LA 3D4SA 1QTHA 1QUOA 2B72A 1L68A 3FI5A 1L48A 229LA 1C63A 1L62A 125LA 1XEPA 1DYBA 3HH6A 251LA 184LA 1G0MA 4W57A 1L0JA 234LA 3C8QA 1L67A 1P36A 3DN8A 1I6SA 245LA 4ARPA 178LA 3LZMA 1L41A 1L16A 1KY0A 1CV1A 2Q9DA 4ARQB 186LA 1D3MA 162LA 1L70A 1L81A 3JR6A 4I7PA 205LA 1L57A 4W59A 2RAZX 222LA 4W56A 4I7SA 2F2QA 4S0WA 3GUMA 1L87A 143LA 131LA 1OVHA 228LA 250LA 1C6FA 4I7NA 1G1VA 1JQUA 2B75A 113LA 1P46A 1JTNA 1LGWA 4EPIA 221LA 183LA 3CDTA 1L93A 1G0PA 1L00A 4PJZA 1L21A 1DYFA 2F32A 1P7SA 1L94A 1DYEA 1LWKA 1G0GA 1L02A 2CUUA 4W54A 1L88A 218LA 2A4TA 1L22A 1T8FA 3HT8A 1QUGA 189LA 2LZMA 3HH5A 2O79A 2B6XA 4EXMA 1DYDA 1LYDA 1L97A 1L0KA 3HDEA 1G1WA 238LA 2Z6BA 3L2XA 130LA 4PK0A 2OU0X 110LA 3EMLA 1C6LA 1L39A 1PQKA 260LA 1QUHA 1C6TA 102LA 1C6EA 1QTBA 170LA 4GBRB 1G06A 1L80A 4LZMA 1L08A 1ZURA 1C6KA 1CU2A 3CDOA 2OEAX 211LA 237LA 1L33A 3GUOA 4LDLA 3HUQA 2QARC 1LI2A 235LA 2B74A 4W53A 160LA 2HUMA 3FA0A 176LA 4I7MA 4EJ4A 1NHBA 1L73A 123LA 1OWYA 1P2RA 1XJTA 248LA 2OTZX 187LA 2RBRA 2RB1X 1OVJA 1CUQA 1L59A 1SSYA 4EKSA 2OE9X 3DNAA 128LA 244LA 2HULA 5LZMA 165LA 261LA 1C62A 3C8RA 4I7OA 7LZMA 1P3NA 122LA 149LA 1L12A 3PBLA 4ARMA 4DAJA 4I7LA 1L98A 226LA 3V2YA 1C6JA 1LWGA 3OE9A 1L05A 2Q9EA 2RBOA 3UONA 1D2YA 1L14A 1D3FA 1CV0A 2OE4X 1L10A 157LA 164LA 3NY9A 1CU3A 1L34A 112LA 1D9WA 180LA 144LA 141LA 1L09A 1LPYA 2OU9A 3SN6R 1C6NA 158LA 1L58A 1L75A 1LYJA 2IGCA 163LA 1L47A 6LZMA 225LA 3G3VA 210LA 1CX7A 1CUPA 1OV5A 3C7WA 262LA 1P64A 224LA 1L35A 254LA 1QT5A 198LA 1C6GA 3C7ZA 227LA 4E97A 212LA 1P2LA 1L91A 3SB5A 3DMXA 3DN2A 1QTDA 4I7QA 1OYUA 1EPYA 2B6ZA 1L38A 3L64A 3OE0A 1L49A 1L23A 1L64A 177LA 3DKEX 1L07A 1L82A 3K2RA 243LA 1T97A 1L19A 3FADA 1L04A 233LA 253LA 1LYEA 1LGXA 4LDEA 3OE6A 3QAKA 152LA 1CVKA 159LA 1SWYA 3HT7A 2RBQA 1TLAA 1L53A 1QT6A 173LA 1L56A 3GUPA 109LA 1G0QA 3GUKA 3VW7A 3SBBC 3CDRA 1LYIA 3HH4A 150LA 4ARMB 126LA 185LA 1C6DA 1PQMA 4LDOA 4DKLA 3C7YA 3CDQA 3HT9A 1QS5A 1L77A 1L46A 220LA 4OO9A 1L52A 215LA 206LA 3HTGA 196LA 240LA 4I7TA 1L51A 217LA 1SX7A 1C67A 4YX7C 191LA 156LA 138LA 1CU0A 2F47A 3G3XA 3ODUA 188LA 1L29A 200LA 3DMZA 4ARJA 1CX6A 3DN4A 219LA 2O4WA 1L40A 1G0LA 1PQIA 2B6TA 1D3JA 1G0KA 1L86A 2RB0X 168LA 1L44A 2QB0B 1SSWA 1T8AA 1L32A 3V2WA 1C6BA 1C60A 2ANXA 3DN6A 3PDSA 213LA 4W52A 3RZEA 1L27A 3NYAA 182LA 1C6QA 3SB7A 4EKQA 147LA 108LA 3SB6A 1CV3A 129LA 1L01A 4DJHA 216LA 1L76A 1L30A 214LA 1L83A 2OU8A 1L61A 1C65A 1LYGA 146LA 139LA 161LA 155LA 3HTFA 247LA 103LA 2LCBA 3DN3A 114LA 1CV6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EPFA 1L50A 4HPEA 3TXGA 5KXXA 3F8VA 239LA 119LA 4ARLA 4NG8A 4W51A 5T3FA 3C80A 1C6MA 3WL2A 1B5UA 252LA 3HWLA 1WQQA 4RLNA 1LYHA 1LJKA 1ZV5L 1F6SA 118LA 127LA 4I7JA 4NGOA 3TMUA 3HTDA 1QT7A 5I4WA 2RBNA 1NQIA 3CQLA 1C68A 1P5CA 2CWIA 1L60A 4R6CA 1ZWNA 2BQMA 3ATOA 1C6PA 1L18A 2B7XA 1L90A 9LYZA 2AUBA 133LA 2DQCY 1FLQA 1L43A 4I7KA 230LA 1L31A 1LLHA 4W58A 2B6WA 258LA 2B70A 4GN3A 1NF5A 1B7RA 1OUEA 4M6DA 5JENB 1L42A 3T36A 3RNXA 1OUDA 1XEIA 2HEFA 1B0DA 4X3BA 1LAAA 3B0OA 1DKKA 255LA 2RSCA 4NG1A 3TXBA 1GAZA 4UWUA 1XSFA 1AT5A 4H9CA 4LT2A 1L15A 1YILA 1CV4A 1UIBA 1L45A 2BQOA 1QIOA 1SX2A 236LA 3ULRA 1L74A 4O34A 1FLUA 4N9RA 1BB5A 1QSBA 2RH1A 1L71A 2YBIA 145LA 3C81A 2MEIA 1DYCA 4N8ZA 4NGVA 1L79A 1WVVA 5B1FA 1LZRA 1LZBA 1BVXA 148LE 1UACY 3NY8A 259LA 3EXDA 2GV0A 1AZFA 2RAYX 1TBYA 1JWRA 3W6EA 3CT0A 2NTGA 3WUMA 1L89A 2BQLA 1KIQC 120LA 4N0JA 1OUJA 2B72A 1IP2A 3CT5A 3ZEKA 3A94A 1GE0A 4OWHA 229LA 2YVBA 3HH6A 2F2NA 184LA 4NGLA 3TMVA 4A7DA 178LA 4LFXA 3AW6A 3KAMA 3M18B 1GF4A 186LA 1D3MA 3AYQA 3JR6A 4I7PA 205LA 1LJNA 4NY5A 1LJHA 3W6BA 1BHZA 1OQMA 1OVHA 250LA 2NWDX 4H8YA 4H92A 4I7NA 1HEPA 5J7CA 5LIOA 1JTNA 3A96A 1YKYX 5D5FA 221LA 1LHJA 1TAYA 5C6JA 1G0GA 1L02A 2CUUA 5LVKA 1LKSA 4H9IA 1NMMA 3LHMA 218LA 3A90A 3M3UA 4N1CC 1T8FA 1HENA 2LZMA 3HH5A 1VEDA 4NGZA 2B6XA 4AXTA 1L0KA 3L2XA 2D4JA 110LA 3EMLA 2ZQ4A 5IDDA 1C6TA 5L3IA 102LA 1OUIA 4ETBA 1G06A 4B4IA 2BQKA 1LSBA 2CJLA 4LDLA 4ETCA 1CKHA 1D0LA 4W53A 3FA0A 4LYCA 5A3EA 4U3XB 1IWZA 4WLYA 123LA 1C45A 187LA 1OVJA 1WQNA 5B1GA 4WMGA 1CUQA 1JJ1A 1VDSA 1LZCA 2OE9X 3DNAA 2C8PA 1GPQC 5C6IA 4GCFA 261LA 7LZMA 3E3DA 122LA 2FYCA 2HUBA 3K3TA 4HTKA 1UICA 5L9JA 8LYZA 4H91A 3OE9A 2RBOA 4NEBA 5I53A 4ET8A 180LA 2OU9A 1L58A 1LYJA 163LA 3N9AA 225LA 1LMPA 1IWWA 3AJNA 4LT0A 4Z3MA 262LA 4RLMA 5F9XA 1IP6A 1QT5A 227LA 4Z41A 1P2LA 1GF0A 1OYUA 2ZIJA 4J1AA 4EMNA 1L38A 4LYZA 1XEJA 1L49A 1LMOA 4LT3A 1IOCA 5ILCA 1VAUA 3DKEX 1HSWA 1L82A 4HJZA 1LJ3A 1BQLY 1GF3A 1LZ6A 2XJWA 1L19A 3FADA 5DN4A 233LA 2Q0MX 1LMQA 3OE6A 1SLYA 1IP5A 3AZ5A 1YAOA 2RBQA 4ETAA 1L53A 1L56A 3OJPA 3GUPA 2ZNWY 4Z46A 3AGHA 1FKQA 2XTHA 1B2KA 2MEAA 3HH4A 5F9UA 126LA 185LA 1GB0A 4DKLA 3C7YA 1B7MA 5KXNA 1QS5A 3P66A 2HECA 4OO9A 240LA 5HLLA 1NDMC 1SX7A 138LA 1CU0A 1LHIA 2F47A 2DQDY 1CKCA 188LA 1LYZA 4DD9A 1L40A 3GXKA 1PQIA 2B6TA 2RB0X 1BB4A 3CB7A 4FDYA 5B06A 3N9CA 1ALCA 4LFPA 4LYTA 4NHSA 5LA8A 3DN6A 1G7IC 1WQOA 2HEDA 1C6QA 3SB7A 4EKQA 3SB6A 5DM9A 5KXTA 1PS5A 4CFOA 2H5ZA 1IWYA 5FSTA 1L61A 1A4VA 139LA 4DD2A 155LA 103LA 1EQEA 1WQMA 167LA 1L85A 4XJGA 1JTMA 1LYFA 1LMTA 1B6IA 3SB9A 1DZBX 3C83A 4NHIA 4J1BA 199LA 3DMVA 1GF8A 1IP7A 2O7AA 2OTYX 4DD3A 137LA 1CV5A 1L25A 3HDFA 1C64A 1OV7A 1REYA 4I7RA 1W08A 1QDTA 1KW7A 1LJ4A 1NDGC 1WTHA 4I0CA 4H9BA 111LA 5KXZA 1OVKA 1IIZA 1L65A 1REXA 1D2WA 5LAFA 4ETEA 4GRVA 1L36A 4WLTA 3OE8A 1LSYA 1GBSA 5LINA 3LYMA 1L96A 3WPLA 223LA 1D0MA 1PQDA 4DDCA 151LA 5HQ1A 1IWUA 1QTCA 1T6HA 4EKRA 2XBSA 4LYMA 5F81A 2RBSA 115LA 1ZVYB 2DQIY 1WTNA 1PQJA 1L03A 1QT8A 1B5XA 3B0KA 4K5YA 1D3NA 5B59A 4H9FA 1SWZA 249LA 2W1XA 4HTNA 1QUSA 1L24A 2LZTA 4ARQA 5I14A 201LA 1KNIA 3GUNA 1GF7A 257LA 1XEKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4EPF A;  1L50 A;  4HPE A;  3TXG A;  5KXX A;  3F8V A;  239L A;  119L A;  4ARL A;  4NG8 A;  4W51 A;  5T3F A;  3C80 A;  1C6M A;  3WL2 A;  1B5U A;  252L A;  3HWL A;  1WQQ A;  4RLN A;  1LYH A;  1LJK A;  1ZV5 L;  1F6S A;  118L A;  127L A;  4I7J A;  4NGO A;  3TMU A;  3HTD A;  1QT7 A;  5I4W A;  2RBN A;  1NQI A;  3CQL A;  1C68 A;  1P5C A;  2CWI A;  1L60 A;  4R6C A;  1ZWN A;  2BQM A;  3ATO A;  1C6P A;  1L18 A;  2B7X A;  1L90 A;  9LYZ A;  2AUB A;  133L A;  2DQC Y;  1FLQ A;  1L43 A;  4I7K A;  230L A;  1L31 A;  1LLH A;  4W58 A;  2B6W A;  258L A;  2B70 A;  4GN3 A;  1NF5 A;  1B7R A;  1OUE A;  4M6D A;  5JEN B;  1L42 A;  3T36 A;  3RNX A;  1OUD A;  1XEI A;  2HEF A;  1B0D A;  4X3B A;  1LAA A;  3B0O A;  1DKK A;  255L A;  2RSC A;  4NG1 A;  3TXB A;  1GAZ A;  4UWU A;  1XSF A;  1AT5 A;  4H9C A;  4LT2 A;  1L15 A;  1YIL A;  1CV4 A;  1UIB A;  1L45 A;  2BQO A;  1QIO A;  1SX2 A;  236L A;  3ULR A;  1L74 A;  4O34 A;  1FLU A;  4N9R A;  1BB5 A;  1QSB A;  2RH1 A;  1L71 A;  2YBI A;  145L A;  3C81 A;  2MEI A;  1DYC A;  4N8Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4EPF A;  1L50 A;  4HPE A;  3TXG A;  5KXX A;  3F8V A;  239L A;  119L A;  4ARL A;  4NG8 A;  4W51 A;  5T3F A;  3C80 A;  1C6M A;  3WL2 A;  1B5U A;  252L A;  3HWL A;  1WQQ A;  4RLN A;  1LYH A;  1LJK A;  1ZV5 L;  1F6S A;  118L A;  127L A;  4I7J A;  4NGO A;  3TMU A;  3HTD A;  1QT7 A;  5I4W A;  2RBN A;  1NQI A;  3CQL A;  1C68 A;  1P5C A;  2CWI A;  1L60 A;  4R6C A;  1ZWN A;  2BQM A;  3ATO A;  1C6P A;  1L18 A;  2B7X A;  1L90 A;  9LYZ A;  2AUB A;  133L A;  2DQC Y;  1FLQ A;  1L43 A;  4I7K A;  230L A;  1L31 A;  1LLH A;  4W58 A;  2B6W A;  258L A;  2B70 A;  4GN3 A;  1NF5 A;  1B7R A;  1OUE A;  4M6D A;  5JEN B;  1L42 A;  3T36 A;  3RNX A;  1OUD A;  1XEI A;  2HEF A;  1B0D A;  4X3B A;  1LAA A;  3B0O A;  1DKK A;  255L A;  2RSC A;  4NG1 A;  3TXB A;  1GAZ A;  4UWU A;  1XSF A;  1AT5 A;  4H9C A;  4LT2 A;  1L15 A;  1YIL A;  1CV4 A;  1UIB A;  1L45 A;  2BQO A;  1QIO A;  1SX2 A;  236L A;  3ULR A;  1L74 A;  4O34 A;  1FLU A;  4N9R A;  1BB5 A;  1QSB A;  2RH1 A;  1L71 A;  2YBI A;  145L A;  3C81 A;  2MEI A;  1DYC A;  4N8Z A; 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