230LA

T4 lysozyme mutant m6l
Total Genus 57
204060801001201401600102030405060
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFELLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
3H1 (159-161)AH1 (3-11)EMPTYS1 (14-19)TI'1 (54-57)TI1 (20-23)AH9 (137-141)S2 (25-28)AH3 (60-80)S3 (31-34)AH2 (39-50)AH6 (108-112)AH5 (93-106)AH7 (115-123)TIV3 (112-115)AH8 (126-134)AH10 (143-155)AH4 (83-90)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 230lA00
1B6IA 163LA 167LA 1C6EA 4I7JA 252LA 1G1VA 1ZWNA 1T8GA 137LA 119LA 1L38A 2HUMA 1C6IA 3C7WA 3GUKA 3GUNA 1LW9A 1CU6A 1QTCA 238LA 1L03A 1L32A 2RBSA 192LA 3DNAA 1XEPA 216LA 211LA 172LA 1KY0A 3HUKA 4I7TA 3DMZA 1QS5A 1L46A 2OE9X 3HDEA 1LI2A 2IGCA 1P2LA 1L66A 2CUUA 1LGUA 1P5CA 1CTWA 1L85A 2RBNA 1L02A 3DN1A 1L51A 1QT4A 1G07A 3EMLA 1G0LA 1KW5A 1KS3A 3CDQA 1QT7A 4DAJA 1P7SA 3FADA 1L00A 253LA 1OYUA 127LA 190LA 1CUQA 1OV5A 1OWZA 5LZMA 1D3MA 3NYAA 1QTHA 188LA 1QUOA 3HU9A 221LA 168LA 3F8VA 1OVJA 1CVKA 3GUOA 1QT5A 3HTGA 243LA 3SN6R 164LA 3RZEA 1L30A 180LA 1CX7A 3DN3A 2B6ZA 230LA 125LA 143LA 1L89A 3C81A 1QTBA 3GUIA 1C6AA 1L31A 3G3VA 4ARMA 2B6TA 219LA 3G3XA 4I7MA 1L27A 1TLAA 3PBLA 4ARMB 4I7PA 1G0MA 1L94A 182LA 1CV6A 1D3NA 3HH3A 1QUGA 3CDVA 1I6SA 1OVHA 1ZURA 1L76A 1L63A 254LA 2B6WA 3HTBA 259LA 1C64A 3HH4A 2NTHA 1LYIA 1L34A 1QUDA 235LA 1L93A 3RUNA 4LDOA 1L33A 2F32A 1L40A 1L95A 109LA 1CV3A 104LA 3OE0A 1C6HA 1DYFA 3HTDA 1L17A 1L18A 1JTMA 4K5YA 159LA 1L43A 1L11A 199LA 1L07A 1SX2A 227LA 2LZMA 2LCBA 148LE 2RBRA 2F2QA 3VW7A 2OTZX 4W51A 4YX7C 178LA 1CX6A 1JTNA 1P6YA 231LA 1D2YA 1L65A 187LA 6LZMA 1LYEA 3C7YA 140LA 4EKPA 1L29A 4EPIA 2RH1A 1C62A 1C6PA 3DN4A 3C7ZA 2OU8A 138LA 1L70A 1L69A 4ARQA 1K28A 3JR6A 223LA 1DYCA 4ARQB 2Q9EA 1PQDA 1C60A 4EXMA 1XJTA 1T97A 102LA 3V2YA 3C8RA 1L67A 1L22A 262LA 3L2XA 1LI6A 1L81A 1PQIA 176LA 1LYJA 4EJ4A 3HDFA 112LA 217LA 3GUPA 118LA 248LA 1DYGA 1DYDA 1C6TA 1P2RA 206LA 2NTGA 2RAZX 3V2WA 1D2WA 1P56A 4W52A 149LA 1L77A 4IAPA 3SB6A 145LA 244LA 1T8AA 3OE6A 246LA 4AQNA 200LA 2F47A 1L68A 229LA 1C66A 1DYEA 4EKSA 191LA 3HTFA 165LA 1C6NA 3FI5A 1C6MA 1L48A 2OTYX 4I7OA 4EKRA 1DYAA 1G0QA 1L35A 1KW7A 1L28A 2ANVA 1D9WA 122LA 3C8QA 3HT7A 1L53A 4I7QA 107LA 147LA 1L19A 201LA 1L54A 3DN0A 150LA 1XJUA 1D3JA 1L74A 1QT8A 3DN8A 1L50A 173LA 240LA 215LA 2RB1X 4DJHA 3G3WA 3NY9A 1C68A 1L80A 1C6JA 214LA 1NHBA 1G06A 1EPYA 1L86A 170LA 258LA 1CV1A 1SX7A 1LLHA 4ARPA 256LA 4I7NA 1L20A 1L42A 115LA 1G0KA 2ANXA 1L64A 1LWKA 3C83A 161LA 3HUAA 1OWYA 3UONA 1L56A 1CU5A 1L04A 2O4WA 3SB8A 1L61A 1QS9A 226LA 2OU9A 3C8SA 1DYBA 1L98A 3SB7A 184LA 177LA 1L41A 7LZMA 2RBQA 1L82A 4EKQA 130LA 1QSQA 1C6LA 3HH6A 2OE7X 1L79A 3HT8A 1LI3A 1L59A 2RB2X 1PQOA 157LA 3HT6A 232LA 1L12A 1L72A 1LYHA 3CDTA 260LA 1L44A 146LA 1L23A 144LA 1L99A 1L37A 2B75A 1L57A 3D4SA 1CUPA 3C80A 1CU3A 2O7AA 195LA 126LA 1L75A 1SSYA 1LGXA 1CU2A 1C6FA 3K2RA 4LDLA 1PQKA 171LA 1CU0A 1L49A 3ODUA 1L21A 3OE9A 1L71A 2RAYX 120LA 3CDRA 213LA 1OV7A 1CV4A 247LA 220LA 1KNIA 2B74A 111LA 3GULA 236LA 3GUJA 1C67A 1L97A 1SWYA 212LA 189LA 1QTZA 196LA 257LA 1T8FA 2Z6BA 1L55A 110LA 1SSWA 142LA 234LA 1KY1A 1C6GA 1C6CA 255LA 3OE8A 3CDOA 4LZMA 1P3NA 175LA 155LA 1L06A 4W56A 4W54A 1QTVA 4GBRB 3DN2A 1T6HA 4I7LA 151LA 1LYGA 1L10A 1C6DA 261LA 113LA 1C6QA 2RBPA 4W57A 2L78A 139LA 3FA0A 3QAKA 1L62A 1QT6A 3DMXA 2B6YA 197LA 228LA 3F9LA 250LA 242LA 185LA 1L36A 1L84A 1C63A 4PK0A 114LA 2B73A 2OE4X 103LA 4YXCA 4E97A 3PDSA 210LA 1LWGA 4W59A 218LA 4DKLA 1P37A 123LA 251LA 1L73A 1LPYA 2B72A 162LA 1L01A 4W55A 2A4TA 4S0WA 198LA 3LZMA 1G0JA 156LA 174LA 1L0JA 1L47A 1L0KA 3DMVA 131LA 205LA 1L87A 1P36A 3SB5A 1ZYTA 237LA 2QB0B 1L09A 152LA 1L05A 108LA 1L88A 2HULA 1L08A 1L52A 1CV0A 3C82A 3HH5A 239LA 1C6KA 3HU8A 4PJZA 224LA 4EPFA 249LA 1QTDA 4ARLA 3DKEX 1QT3A 3SBAA 4GRVA 1C69A 1L16A 1L25A 4ARJA 1QUHA 1G1WA 3SB9A 4W58A 1L24A 4OO9A 181LA 158LA 1L26A 166LA 1JQUA 209LA 2QARC 233LA 129LA 3HUQA 2LC9A 2OEAX 1L90A 4I7KA 1L13A 4ZPUA 2RB0X 241LA 141LA 1G0GA 3L64A 1L60A 2HUKA 1L83A 4I7RA 1PQMA 1L58A 1QSBA 169LA 1SWZA 3HT9A 1LGWA 1D3FA 4I7SA 4YXAC 222LA 1LYFA 1CV5A 2OU0X 128LA 1L91A 1C61A 1P46A 2B70A 2B7XA 1L96A 2RBOA 3DN6A 186LA 1WTHA 2Q9DA 1OVKA 1L15A 2O79A 160LA 1L14A 1L45A 1L92A 1LYDA 225LA 4LDEA 245LA 3NY8A 1L39A 3GUMA 1PQJA 3SBBC 1G0PA 183LA 5I14A 3HWLA 1C65A 4W53A 1P64A 1C6BA 2B6XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B6IA 3BKVA 1JHLA 4I7JA 4LT2A 1XSFA 1ZWNA 1JKCA 137LA 1BGIA 3TXKA 2Q0MX 1C6IA 1MLCE 4HJYA 1QTCA 1LMOA 4N8ZA 2FYDA 3LZTA 1L03A 2RBSA 3WVYA 4NHSA 211LA 1KY0A 1LZCA 2VB1A 2BQEA 4J7VA 4PHIA 1INUA 4ETBA 1XEKA 1WQQA 5LVGA 2OE9X 2W1YA 1P2LA 1L66A 1OUFA 2D4IA 1IP6A 1HELA 1CTWA 1P5CA 1L85A 2RBNA 1L51A 3P4ZA 1KS3A 2DQIY 1BWHA 1PZYA 154LA 1P7SA 3FADA 1HFXA 2HEAA 2DKVA 1OYUA 5A3EA 127LA 190LA 1OWZA 1QTHA 4NGVA 4OW1A 5B05A 3F8VA 4NGZA 1GF5A 1OUCA 1QT5A 1KXXA 3HTGA 4HPIA 4ML7A 164LA 1A2YC 1CX7A 4NG1A 3DN3A 1NBYC 4H1PA 3J6KA 1LHMA 2DBTA 3GUIA 1L31A 5KXTA 3LZ2A 4ARMA 219LA 3VWOA 1TLAA 5HLLA 1IWTA 5L3IA 2D6BA 3TMXA 1CV6A 1DKJA 1JKBA 3A6CY 1ZURA 5I54A 1L63A 259LA 4XJFA 5KXRA 1BB7A 1LYIA 2BQKA 1LSDA 2DQCY 1L34A 1GB3A 4ZEEA 1UA6Y 235LA 4WM3A 3ZVQB 1L93A 1GBYA 2F32A 1NDGC 2YDGA 1GB8A 5B1FA 5KXOA 1L17A 4K5YA 1LPIA 1L43A 4WLXA 2XQOA 3P65A 2G4PA 2F2QA 2OTZX 178LA 1LSEA 231LA 2BQOA 1OUBA 1L65A 1LJGA 1LYEA 140LA 4YENA 5B07A 1L29A 4EPIA 4IATA 2HEDA 3DN4A 1YIKA 2OU8A 138LA 1GBWA 4ARQA 1NQIA 4EMNA 3W6AA 2YBJA 1TEWA 3C8RA 262LA 4U3XB 2LHMA 1L81A 3HDFA 112LA 3GUPA 1VDTA 1C6TA 1P2RA 1JSFA 3TMWA 149LA 3SB6A 244LA 1SQ2L 1AM7A 246LA 200LA 5APFA 229LA 1C66A 1WQMA 2CDSA 4B4IA 191LA 2HEFA 1BB3A 1C45A 2LYZA 3HT7A 1L53A 4I7QA 1T3PA 147LA 3A95A 150LA 1D3JA 1HFZA 5FELA 1VEDA 133LA 3DN8A 2ZQ4A 2ZNWY 3E3DA 3WW5A 1IOQA 215LA 1RFPA 1OP9B 4DJHA 3G3WA 3WPJA 3BKHA 1C68A 4DT3A 5I5QA 4NGIA 170LA 4G9SA 256LA 1L20A 1L42A 115LA 1G0KA 5II3A 1L64A 1GBSA 2Z37A 161LA 3C83A 5LINA 3UONA 1L56A 5KKJA 2O4WA 1XGTC 4ETCA 3ATOA 1L98A 1JISA 184LA 4NHTA 4L41A 4YM8A 4WO9A 7LZMA 1QSQA 3HH6A 1LZ6A 232LA 1TDYA 1LYHA 1L44A 1B5XA 146LA 1LZRA 2BQNA 3G3AB 1IC7Y 1GF9A 1L37A 5ILFA 3D4SA 1CJ6A 1GF8A 1YROA 2EKSC 3SP3A 2MEFA 1B5VA 1L75A 1SSYA 1JIYA 1CU2A 3B0OA 171LA 1CU0A 1LKRA 1L21A 1JUGA 1L71A 3CDRA 213LA 4DD2A 1CV4A 1KNIA 111LA 2W1MA 2ZWBA 1C67A 1L97A 212LA 2ZYCA 4J1BA 4TSBA 4H8XA 3AGIA 234LA 1CKCA 1GE3A 2YBIA 2B5ZA 2FYCA 1FKQA 1C43A 4NGLA 3ULRA 4OWAA 7LYZA 1LHIA 155LA 1CJ9A 1L06A 4GBRB 1JSEA 1KXYA 1IOSA 1AKIA 3M18B 3AW6A 151LA 2DQFC 5A3ZA 1B7RA 261LA 4W57A 2ZILA 2L78A 2XBRA 5HNCA 3QAKA 4NHIA 3DMXA 4H9FA 1OUAA 228LA 3F9LA 1XGQC 1L36A 1WVVA 6LYTA 3A3QA 4PK0A 114LA 103LA 4YXCA 1LWGA 5IDDA 218LA 5KXLA 2GV0A 4DKLA 1NF5A 4G4HA 2HU3A 4W55A 4S0WA 1B9OA 1G0JA 1BB6A 1KIQC 1HSWA 205LA 4TWSA 1ZYTA 237LA 2HTXA 2QB0B 4DD9A 2ZIJA 4PRUA 152LA 1BVXA 1LSCA 1CV0A 3HU8A 3WXUA 2EQLA 249LA 1QT3A 4LFPA 3TXFA 1L16A 1QUHA 1XGRC 3A96A 4ANRA 3RW8A 5LYZA 158LA 166LA 129LA 4I7KA 2RB0X 1GE4A 5D5FA 1QSBA 169LA 4XJIA 1LGWA 2F4AA 222LA 1RE2A 2CWIA 1IR9A 1CV5A 1LJIA 3TMVA 1YKXX 1LZ4A 1WTHA 1IX0A 1REYA 4BS7A 1L39A 3GUMA 4DD3A 3W6CA 4Z46A 1B5ZA 1LZGA 3P68A 5I14A 4HV1A 1LMAA 3HBDA 4W53A 1LCNA 4CJ2A 1LZDA 1P64A 1GFTA 163LA 167LA 1C6EA 4CGEA 2YSSC 1IORA 4I8SA 2MEAA 1L38A 5E4PA 4OWHA 1G7LC 1OUDA 1LW9A 1LYOA 1CU6A 1IR8A 4LYTA 5KXPA 2LYOA 4WM5A 192LA 3DNAA 1P2CC 1E8LA 3TXBA 216LA 1GFRA 3W6DA 3HUKA 4I7TA 3DMZA 1L46A 2IGCA 3KAMA 1LGUA 4CFPA 1L02A 3CDQA 5KY1A 4DAJA 3GXKA 4LYBA 3OJPA 1EL1A 1CUQA 1OV5A 1D3MA 1QIOA 1QUOA 4OOTA 1CVKA 243LA 3SN6R 4OWBA 2BQFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1B6I A;  3BKV A;  1JHL A;  4I7J A;  4LT2 A;  1XSF A;  1ZWN A;  1JKC A;  137L A;  1BGI A;  3TXK A;  2Q0M X;  1C6I A;  1MLC E;  4HJY A;  1QTC A;  1LMO A;  4N8Z A;  2FYD A;  3LZT A;  1L03 A;  2RBS A;  3WVY A;  4NHS A;  211L A;  1KY0 A;  1LZC A;  2VB1 A;  2BQE A;  4J7V A;  4PHI A;  1INU A;  4ETB A;  1XEK A;  1WQQ A;  5LVG A;  2OE9 X;  2W1Y A;  1P2L A;  1L66 A;  1OUF A;  2D4I A;  1IP6 A;  1HEL A;  1CTW A;  1P5C A;  1L85 A;  2RBN A;  1L51 A;  3P4Z A;  1KS3 A;  2DQI Y;  1BWH A;  1PZY A;  154L A;  1P7S A;  3FAD A;  1HFX A;  2HEA A;  2DKV A;  1OYU A;  5A3E A;  127L A;  190L A;  1OWZ A;  1QTH A;  4NGV A;  4OW1 A;  5B05 A;  3F8V A;  4NGZ A;  1GF5 A;  1OUC A;  1QT5 A;  1KXX A;  3HTG A;  4HPI A;  4ML7 A;  164L A;  1A2Y C;  1CX7 A;  4NG1 A;  3DN3 A;  1NBY C;  4H1P A;  3J6K A;  1LHM A;  2DBT A;  3GUI A;  1L31 A;  5KXT A;  3LZ2 A;  4ARM A;  219L A;  3VWO A;  1TLA A;  5HLL A;  1IWT A;  5L3I A;  2D6B A;  3TMX A;  1CV6 A;  1DKJ A;  1JKB A;  3A6C Y;  1ZUR A;  5I54 A;  1L63 A;  259L A;  4XJF A;  5KXR A;  1BB7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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